IL CODICE GENETICO

Dipartimento di Scienze Agronomiche e Genetica Vegetale Agraria Giovanna Attene

Codice genetico

Il DNA contiene linformazione genetica per produrre proteine Il linguaggio con cui espressa tale informazione definito codice genetico Tale informazione non pu essere specificata dalla sequenza degli zuccheri ma da quella delle basi azotate

Ipotesi di Gamow sul codice genetico

Codice a lettere singole (4 parole) Codice a due lettere (42 = 16 parole) Codice a tre lettere (43 = 64 parole)
AAA AAG AGA AGG ACA A G C T AA GA CA TA AG GG CG TG AC GC CC TC AT GT CT TT ATA GAA GGA GCA GTA CAA CGA CCA CTA TAA TGA TCA TTA ACG ATG GAG GGG GCG GTG CAG CGG CCG CTG TAG TGG TCG TTG AAC AGC ACC AAT AGT ACT

ATC ATT GAC GAT GGC GGT GCC GCT GTC GTT CAC CAT CGC CGT CCC CCT CTC CTT TAC TAT TGC TGT TCC TCT TTC TTT

Produzione di RNA artificiali

Ochoa e Manago (1959) scoprono lenzima Polinucleotide Fosforilasi Questo enzima in grado di sintetizzare molecole di RNA senza utilizzare DNA come stampo, catalizzando la polimerizzazione di ribonucleotidi in direzione 5 3

Possono cos essere prodotti in vitro mRNA artificiali con composizione nucleotidica nota

Esperimento di Nirenberg e Matthaei (1961) (1)

Sintesi di Poli-U o ac. poliuridilico 5 UUUUUUUUUUUUUU 3

20 sistemi acellulari con ac. poliuridilico, attivati con ATP, ciascuno contenente una miscela dei 20 amminoacidi e un amminoacido sempre differente marcato con 14C

Ala Glu Leu Ser

Arg Gln Lys Thr

Asp Gly Met Try

Asn His Phe Tyr

Cys Ile Pro Val

Sintesi di proteina radioattiva solo nel sistema acellulare contenente fenilalanina (Phe)

Esperimento di Nirenberg e Matthaei (1961) (2)

Esperimento di Nirenberg e Matthaei (1961) (3)

Lesperimento dimostra inequivocabilmente lesistenza di un codice genetico ma non precisa il numero di nucleotidi che, in sequenza lineare, costituiscono lunit di informazione in grado di codificare un aminoacido

Esperimento di Crick e coll. (1961)

Quanti nucleotidi codificano per un singolo amminoacido?

Locus rII fago T4

Uso della PROFLAVINA che induce inserzioni e delezioni di singoli nucleotidi (singole coppie di nucleotidi)

Esperimento di Crick e coll. (1961) (1)

CAT CAT CAT CAT CAT CAT CAT CAT CAT

Con laggiunta di un nucleotide, ad esempio G, si ha: CAT CGA TCA TCA TCA TCA TCA TCA TCA T

Con laggiunta di secondo nucleotide si ha: CAT CGA TCA TCA TGC ATC ATC ATC ATC AT

Con laggiunta di terzo nucleotide si ha: CAT CGA TCA TCA TGC ATG CAT CAT CAT CAT

Esperimento di Crick e coll. (1961) (2)

I risultati dimostrano quindi che il codice genetico basato su triplette ma quali triplette codificano per i singoli aminoacidi?

Saggio dei copolimeri casuali

Sintesi proteica attraverso mRNA artificiali prodotti con miscele di nucleotidi diversi

(Nirenberg, Khorana e Ochoa, 1966)

Sistema acellulare + mRNA (art) + ATP + amminoacidi

Sintesi proteica

60% U

40% C

60% U

40% C

60% U 36% UU 24% CU 40% C 24% UC 16% CC

36% UU 21,6% UUU 14,4% UUC 24% UC 14,4% UCU 9,6% UCC 24% CU 14,4% CUU 9,6% CUC 16% CC 9,6% CCU 6,4% CCC

21,6% UUU 14,4% UUC 14,4% UCU 9,6% UCC

Fenilalanina 36% Serina 24%

14,4% CUU 9,6% CUC 9,6% CCU 6,4% CCC

Leucina 24%

Prolina 16%

Tabella del codice genetico

(Phe, P) (Ser, S) (Leu, L)

(Tyr, Y) STOP

(Cys, C) STOP (Try, W)

(His, H) (Leu, L) (Pro, P) (Gln, Q) (Arg, R)

(Ile, I) (Thr, T) (Met, M)

(Asn, N)

(Ser, S)

(Lys, K)

(Arg, R)

(Asp, D) (Val, V) (Ala, A) (Glu, E) (Gly, G)

Caratteristiche fondamentali del codice genetico

Il codice genetico : universale (pressoch) ridondante (non ambiguo!) degenerato non intervallato non sovrapposto (AA. adiacenti)

Vacillamento dellanticodone

Base allestremit 5 dellanticodone G C A U I

Base allestremit 3 del codone UoC G U AoG A, U o C

Relazioni tra acidi nucleici

Anticodoni Codoni Codogeni

T A C G C C T A T T T T