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L'informazione genetica segue la direzione

DNA >RNA>Proteine
•  Vocabolario  4  parole  >>>  20  parole;  
•  Replicazione  del  DNA,  Trascrizione  
•  Traduzione  
•  RNA  dal  nucleo  al  citoplasma  
•  Regolazione  dell’espressione  genica  
–  Trascrizionale  
–  Post  trascrizionale  
–  Traduzionale  
–  Post  traduzionale  
•  Watson  e  Crick  modello  della  doppia  elica  del  
DNA  
•  Ipotesi  sulla  replicazione  che  fosse  
compaIbile  con  l’eredità  dei  caraKeri  
1958 Meselson e Stahl
•  Replicazione  del  DNA  ProcarioI  /  Enzimi:  
•  Elicasi  
•  topoisomerasi  I  e  II  
•  Primasi  (RNA  polimerasi>>innesco  10  nt)  
•  DNA  polimerasi  III,  I  e  II  
•  DNA  ligasi  
•  Proteine  che  destabilizzano  
•  ARvità  esonucleasiche  (5’>>3’  e  3’>>5’)  
Forcella di replicazione
Effetti topologici
Effetti topologici
Attivita esonucleasica della DNA polimerasi I
Attività esonucleasica 3-5
Duplicazione delle estremità del DNA. Telomeri
Duplicazione delle estremità del DNA. Telomeri
Replicazione della cromatina
•  Danni  al  DNA  
•  Depurinazione.  sito  apurinico  AP  
•  modificazione  chimica  delle  basi  del  DNA.  deaminazione.  
Adenina>>ipoxanIna  che  si  appaia  con  la  citosina.  La  
deaminazione  della  5-­‐meIl-­‐citosina  è  parIcolarmente  grave  
poiché  la  trasforma  in  Timina.  
•  Alchilazione  
•  MeIlazione  
•  AgenI  intercalanI  
•  Radiazioni  ionizzanI  (roKure  a  singolo  e  doppio  filamento)  o  
formazione  di  legami  crociaI  tra  i  filamenI  di  dna.  Oppure  si  
formano  radicali  liberi.  
•  Radiazioni  non  ionizzanI  sono  poco  penetranI.  Causano  la  
formazione  di  legami  covalenI  tra  basi  adiacenI  del  DNA    
Danni al DNA
Trascrizione

Rna polimerasi
Oloenzima (2alfa, beta e
beta’)
+ sub sigma
Terminazione della trascrizione
Complesso di inizio della trascrizione
Modifiche post trascrizionali

CAP
poliA
splicing
Editing
SPLICING
Maturazione RNA ribosomali (batteri)
Maturazione dei tRNA (batteri)
Taglio
Aggiunta CCA al 3’
Editing delle basi
L’apparato di traduzione: i ribosomi
Procarioti
30S 16S
50S 23S-5S

Eucarioti
40S 18S
60S 28S-5,8S-5S

Le proteine S e L
L’apparato di traduzione: i ribosomi
•  17  gennaio  2014  
Struttura a trifoglio

Lega l’aminoacido

Interazione con rRNA 5S e

sub. major

Riconoscimento del mRNA

Il codice genetico

4nt
20(22)aa

triplette

Non sovrapposto
Continuo
Ordinato
Degenerazione
Inizio e fine
Quasi universale

Il caso di
selenocisteina
(UGA) e
Pirrolisina (UAG)
Ipotesi del vacillamento della terza base
  Traduzione  
•  Fase  ATP  dipendente  
•  Fase  GTP  dipendente  
–  Inizio  
–  Allungamento  
–  Terminazione  
Traduzione 1° fase….è richiesto ATP

Produzione dell’aa_tRNA
Traduzione 1° fase….è richiesto ATP
Traduzione 2° fase….è richiesto GTP
Inizio

Il primo aa è la formil-metionina, codone AUG (qualche volta GUG)

Fattori di inizio IF1, IF3, IF2
Si deve “innescare” il ribosoma con il tRNA e il messagero
Gli IF servono per dissociare mantenere dissociati le subunità dei ribosomi
Sequenza di Shine-Dalgarno
La fase di inizio si conclude con la formazione del ribosoma completo e carico
 Traduzione fase di allungamento (GTP dipendente)

Fattori di allungamento
Siti E, P e A
EF-Ts-Tu
EF-G

EF-Tu lega aa-tRNA e lo

trasferisce al sito A.
Quando scarica il aatRNA si lega
a EF-Ts prima di ricominciare il
ciclo

EF-G fa scorrere il ribosoma sul

mRNA portandolo sulla tripletta
successiva.

Dal sito E escono i tRNA scarichi

 Traduzione fase di terminazione (GTP dipendente)

Fattori di rilascio
RF1, RF2 e RF3

EF-G coopera con i RF

Il RRF ribosome releasing factor

dissocia le due subunita del
ribosoma per ricominciare.
Traduzione negli eucarioti

Il primo aa è la metionina ma esistono

2 tRNA per la metionina
10 fattori di inizio IF

Non esiste una Shine-Dalgarno

sequence
Ruolo del Cap
Regola del primo AUG…
Kozak

Su queste differenze si basano la

tossicità selettiva di molti antibiotici (ad
es. streptomicina e neomicina che
legano la subunità 30S, nel 16S,
impedendo il legame del primo fMet-
tRNA)
FOLDING delle proteine
Targeting delle proteine
3 min 20’ min 2 ore