Lezione 7

Codice genetico, traduzione, sintesi

proteica

1
 TRADUZIONE:
sintesi di un polipeptide sulla
base dell’informazione genetica
contenuta in una molecola di mRNA

Si attua un cambio
di linguaggio:
da polinucleotidico
a polipeptidico

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 Traduzione:
Apparato di traduzione

Gly

GGG

3
 Codice genetico 1

Il codice genetico fa corrispondere a una sequenza di nucleotidi negli acidi nucleici una
sequenza di aminoacidi nelle proteine. Non va confuso con il contenuto dell’informazione
genetica della cellula (genoma).

4 basi (A,C,G,U) 20 aa

Dobbiamo passare da un “alfabeto” a 4 lettere a uno a 20 lettere

Codice a 1 lettera (41 combinazioni) 4 aa

Codice a 2 lettere (42 combinazioni) 16 aa

Codice a 3 lettere (43 combinazioni) 64 aa

Cattivi esempi 1…

Il termine «codice genetico»

non va confuso con il termine
«genoma»*

*totalità del DNA (informazione

genetica) contenuto in una
cellula.
 Cattivi esempi 2…
Il nostro codice genetico è danneggiato dalle mutazioni!?!?!??!

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 Codice genetico 2

mRNA
codone

Il codice è a triplette: 3 nucleotidi traduzione 1 aminoacido

1 tripletta = 1 codone

Met Val Arg Tyr

7
 Codice genetico 3
1961 Marshall Niremberg decodifica la prima tripletta
UUU = Phe (fenilalanina) (traduzione in vitro di un poli U mRNA)
1966 la decodificazione è completata

43 possibili combinazioni:

64 codoni, di cui
61 sono codificanti e
3 sono codoni di STOP

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 Aminoacidi e codoni 1

61 sono le triplette o “codoni” codificanti del codice genetico

universale

20 sono gli aminoacidi che formano le proteine

il codice genetico è “degenerato” (ridondante): più triplette

codificano per uno stesso aa
ma non è mai ambiguo (una tripletta codifica per un solo aa)

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Degenerazione: UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG codifica Leu
NON ambiguità: UUA è solo Leu, AAA è solo Lys
 Il codice non è ambiguo

Conoscendo la sequenza dell’ mRNA posso dedurre la sequenza del

polipeptide (il codice non è ambiguo, ad un codone corrisponde un solo aa)

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 Il codice è degenerato

Conoscendo la sequenza del polipeptide NON posso risalire alla

sequenza nucleotidica che l’ha codificato (il codice è degenerato, ad un
aa possono corrispondere più codoni!)

? ? ? ? ? ? ? ?

A Met corrisponde un solo codone (AUG), ma Pro potrebbe essere

codificata da CCU, CCC, CCA, CCG….
 Il codice genetico è universale

Il codice di traduzione è lo stesso per tutti gli organismi viventi

AAA

Lys

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Conseguenza dell’universalità del codice

Un gene umano (privo di

introni)

trasferito in E. coli

viene tradotto correttamente

(modificazioni post-
traduzionali della proteina
escluse)

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 Nel processo di TRADUZIONE sono coinvolti:

mRNA (RNA messaggero)

ribosomi (rRNA + proteine)

tRNA (RNA di trasferimento)

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 mRNA (RNA messaggero)

5’ UTR (c.a. 200nt) 3’ UTR

(c.a. 800nt)

Funzione UTR (UnTranslated Region):

regolazione espressione genica post-trascrizionale
-Trasporto mRNA nucleo-citoplasma
-Efficienza traduzione
-Stabilità messaggero
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 I ribosomi

Sono complessi
ribonucleoproteici (rRNA
+proteine) in cui avviene la
sintesi proteica e sono
strutturati in due subunità

Tra le due subunità si

inseriscono gli RNA
messaggeri (mRNA) per
essere tradotti
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La lettura del codone su mRNA è affidata al tRNA, che funge da adattatore

Ala

18
Struttura tridimensionale del tRNA

19
La aminoacil-tRNA sintetasi lega l’aminoacido al corrispondente
tRNA

Le cellule contengono 20 differenti aminoacil-tRNA sintetasi, una per ogni aa

5’ 3’
Phe
Phe

AAA

AAA

Phe
Phe

AAA
20

A un tRNA che ha un particolare anticodone viene associato un aa specifico

Specificità della aminoacil tRNA sintetasi

GUG

Sito attivo dell’enzima

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 Aminoacidi e codoni 2
20 sono gli aminoacidi che formano le proteine
61 sono le triplette o “codoni” del codice genetico universale
Esistono tanti tRNA quanti sono i codoni?
* Se ciascuna molecola di tRNA si appaiasse con il codone
dell’mRNA utilizzando le regole dell’appaiamento canonico
tra basi complementari, sarebbero necessari 61 tipi di tRNA.
* Poiché la maggior parte degli organismi ha < 45 tipi di tRNA
(48 nell’uomo, 31 nei batteri), questo significa che alcuni
tRNA sono in grado di appaiarsi con più di un codone.
22
 Esempio: tRNA Ala

5’-GCA-3’
5’-GCC-3’ codoni Alanina
5’-GCU-3’
5’-GCG-3’

Esistono 4 tRNA con anticodoni diversi per Ala?

codoni
5’-GCA-3’ 5’-GCC-3’ 5’-GCU-3’ 5’GCG-3’
3’-CGU-5’ 3’-CGG-5’ 3’-CGA-5’ 3’CGC-5’
anticodoni
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 I tRNA per Ala sono solo 2

* Uno stesso tRNA (anticodone IGC) legge tre codoni differenti (GCU, GCC e
GCA).
* Inosina (modificazione di adenina dopo sintesi di tRNA) è molto tollerante e può
appaiarsi con U, C o A.
* L’ultimo codone (GCG) sarà letto da un tRNA diverso
 Teria del vacillamento (wobbling)

Nel 1966 Crick propose l’ipotesi del vacillamento, per cui la base in
5’ dell’anticodone (la prima), che si appaia con quella in 3’ del codone
(la terza) non è sottoposta alle strette regole della complementarietà.
Ciò permette un appaiamento meno preciso, vacillante (G-U oltre che
I-U, I-A, I-C).
L’anticodone GGA può
Ser leggere sia il codone
UCC che UCU

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 Aminoacidi e codoni 3

61 codoni 48 tRNA 20 aa
Wobbling tRNA
isoaccettori
1 tRNA legge
codoni diversi Uno stesso aa
può legarsi a
tRNA diversi

* Il wobbling spiega perché i codoni sono 61 e i tRNA 48.

* L’esistenza dei tRNA isoaccettori spiega perché i tRNA sono 48 e gli aa 20 (lo
stesso aa può legare diversi tRNA).
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 tRNA isoaccettori

5’ 3’ 5’ 3’
L’aminoacil-
Phe tRNA-sintetasi
per Phe può
GAA AAA legare due tRNA
diversi nel sito
catalitico
La fenilalanina
può venire
legata a due
tRNA diversi Phe

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 Codoni di STOP

I codoni: UAA, UAG, UGA

sono detti codoni di terminazione o codoni nonsenso
perché non vengono riconosciuti da nessun
anticodone complementare:

Sono segnali di terminazione della traduzione

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 Traduzione 1. Inizio

La subunità minore riconosce l’estremità 5’ del mRNA (per mezzo di

rRNA) e trova AUG = codone di inizio.
Richiama quindi met-tRNA + subunità
29
maggiore
 Traduzione 2. Allungamento
5’ 3’ 5’
P
A

3’
5’

3’

Il ribosoma scorre in direzione 5’3’, i codoni vengono decifrati via via nel
sito A, mentre al sito P il nuovo polipeptide cresce
L’attività peptidil transferasica della subunità maggiore

del ribosoma è dovuta all’ rRNA 23S, e non alla

componente proteica del ribosoma!

Ribozima: RNA con attività catalitica

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 Traduzione 3. Terminazione
P A
Fattore di Rilascio
Si lega al codone di STOP
idrolizza il legame tra il
polipeptide e il tRNA
e promuove la dissociazione
delle subunità del ribosoma

Quando il ribosoma incontra un codone UAA o UAG o UGA non vi è

nessun tRNA (anticodone) capace di decifrarlo: il polipeptide nascente si
stacca dal sito P 32
Traduzione animazione

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 Poliribosomi
Molti ribosomi possono tradurre una stessa molecola di mRNA
contemporaneamente formando un poliribosoma (o polisoma). In questo modo è
possibile produrre molti polipeptidi in contemporanea a partire da una molecola di
mRNA

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Nei procarioti TRASCRIZIONE e TRADUZIONE
avvengono contemporaneamente

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 polisoma
Nella cellula eucariotica
gli mRNA maturi che
escono dal nucleo
possono essere B A

A) tradotti da ribosomi
liberi nel citoplasma 
proteine per uso interno

B) da ribosomi
inizialmente liberi ma che
poi si associano al RER
(reticolo endoplasmatico
rugoso)
proteine che verranno
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secrete
Modificazioni post-traduzionali delle proteine

Alcune proteine raggiungono la loro conformazione

biologicamente attiva solo dopo aver subito una o più

modificazioni post-traduzionali

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 Esempio di modificazioni post-traduzionali

Es: l’insulina viene sintetizzata sul RER

Dopo traduzione subisce modificazioni nel RER e nel Golgi

SH SH

SH SH

proteolisi proteolisi
Ponti disolfuro 38
 Esempio di modificazioni post-traduzionali

Aggiunta di catena di zuccheri comune e di zuccheri specifici per gli antigeni AB

(glicosilazione di proteine in apparato di Golgi)

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