MATURAZIONE DEL DNA processo

trascritto primario o pre-mRNA, fa 3 modifiche

1. proteggere mRNA
2. regolazione della espressione
3. traduzione, (mRNA viene usato come stampo per la produzione delle proteine)

nei procarioti , non richiede nessuna modifica.

nei eucarioti , pre-mRNA deve diventare maturo , con dei processi.

● CAPPING(cappuccio): aggiunta in posizione 5' 7 metilguanosina (nucleotide, ossia

una guanina con un gruppo metile CH3, in posizione
7 del azoto), 7 metilguanosina viene aggiunta in
posizione 5’, posizione un po strana perché viene 5’
legato 5’, non come sempre 5’ legato 3’.
Aggiunta del nucleotide serve per evitare
ESONUCLEASI sono dei enzimi compiano in
degradare del RNA.
Capping serve per proteggere il RNA.
Le esonucleasi sono come placam, che mangiano o
smangiucchiano i legami fosfodiestere e degradano il RNA,
trovano sia sulla estremità 5’ e 3’
● AGGIUNTE DI CODE POLI (A): viene aggiunta una coda di poli adenina a 3’. le
adenina sono 200/250 circa.
le adenine non cercano niente non la traduzione RNA MESSAGGERO, sono legami
fosfodiestere normali, esonucleasi le riconoscono e lavorano, finché degatano le
adenine m-RNA non ci importa nulla.
Si forma una lunga catena di adenina , stabilisce la vita del messaggiero, più è lunga
la coda di adenina più è stabile il messaggero nella cellula.
● SPLICING: ci sono nelle seguenze sul il trascritto primario, che devono essere
eliminate , perché non servo per la
produzione delle proteine e solo nel
RNA MESSAGGERO.
INTRONI:eliminazione non serve per
la produzione delle proteine
ESONI:rimangono e si uniscono
Ci sono nelle particelle
RIBONUCLEOPROTEICHE snRP
(sono formate da RNA e
PROTEINE). Ribonucleoproteiche,
sono coinvolti riconoscono i punti di
giunzioni esone-introne si
associamo e permetto eliminazione delle introne (si trova tra gli esoni) e esoni di
unirsi
Gli esoni e introni non sono altro delle sequenze nucleotide
TRASMITTO PRIMARIO PORTA ALLA FORMAZIONE RNA MATURO con solo: esoni,
poli a e capping.
Nella cellula fa fatica a trascrivere perché un ruolo nei eucarioti superiori abbiamo lo
SPLICING ALTERNATIVO, alcuni dei introni con il fenome splicing alternativo sono
riconosciuti come se fossero esoni, essere mantenuti nel RNA MATURO.
Con lo splicing alternativo abbiamo un aumento dell'evoluzione solo in organismi più
complessi.
esoni: corisponde dei domini di proteine, domini sono nelle regioni che funzione diverse.
es: RNA POLIMERASI, un dominio per riconoscimento del promotore , un dominio per la
formazione del legame fosfodiestere, corrispondono due esoni diversi , con evoluzione due
esoni erano due geni diversi di due proteine che comunicano insieme avviene la trascrivere.

ABBIAMO PORTATO AllA MATURAZIONE RNA MESSAGGIO

mRNA viene trasportato attraverso dei pori nucleari nel citoplasma.
Capping e polia A , serve per stabilizzare la molecola e anche per trasportare nel citoplasma
nei eucarioti.
Nel citoplasma mRNA deve funzionare lo stampo per le produzione proteine, SINTESI
PROTEICA O TRADUZIONE (avviene nel rna transfer).
Traduzione passo da un linguaggio all'altro , in questi caso acidi nucleici a proteine
IL CODICE GENETICO
Il passaggio dai sequenza nucleotide agli sequenza amminoacidi si ha con il codice
genetico, l'insieme di regole che connettono gli amminoacidi con i nucleotidi.
Poiché le basi azotate dei nucleotidi sono 4 e gli amminoacidi sono 20 è necessario leggere
le basi in triplette o codoni. In questo modo sono possibili 64 (4*3) combinazioni più che
sufficienti per 20 amminoacidi. Infatti, con le basi singole si codificano solo 4 aminoacidi
(4*1) e con coppie sono 16 (4*2), ancora
insufficienti.
64 codoni corrispondono più amminoacidi
Il codice genetico presenta le seguenti
caratteristiche;
● DEGENERATO à più codoni
codificano per un amminoacido
● UNIVERSALE à la maggior
parte dei microrganismi
utilizzano lo stesso codice
● CODONI DI STOP a tre codoni,
non codificano nessun
amminoacido.
● CODONE DI INIZIO (AUG)
codifica per la metionina, è il
primo amminoacido deve essere
inserito nella catena, viene
tradotto, quindi tutte le proteine inizio con la metionina AUG
● CAMBIA ULTIMA LETTERA : le prime due nucleoide non cambiano servo per
il riconoscimento dell'amminoacido.
es: mutazione del dna per agenti chimiche , agenti atmosferici, ecc , spesso
mutazione dell'ultima lettura di nucleoide in alcuni casi.
SINTESI DELLE PROTEINE O TRADUZIONE
tRNA ha la funzione di traduzione , è in grado di legarsi sia con gli amminoacidi e con
mRNA. tRNA ha una una tripletta chiamata ANTICODE la funzione di apachiare con il
CODONE complementare attraverso legami idrogeno.
esistono tRNA quanti sono i codoni
es: codone AUG (metionina) - anticode (tRNA) UAC
UGG(triptofano) - CCA
ANTICODE E’ COMPLEMENTARE AL CODONE E VICE VERSA
Gli amminoacidi vengono caricati grazie agli enzimi AMMINOACIDI-RNA SINTETASI ,
insieme grazie all'aiuto del ATP(energia) , riescono a legarsi a tRNA e amminoacido
specifico.
Esistono tante amminoacidi-rna-sintetasi . quanti sono RNA in natura.
Per fare la sintesi proteine abbiamo bisogno:
● mRNA
● tRNA, cariche dei amminoacidi
● ribosomi
Ribosomi costituiti da 2 subunità:
subunità maggiore : 60s
subunità minore : 40s
le subunità maggiore si lega alla subita
minore quando c è il messaggero viene
tradotto (come un sandwich), si formano 3
sito o cavità, siti hanno ampiezza e la
lunghezza di un codone,quindi ogni sito
corrisponde a un codone (amminoacidi).
SITO A (attacco o accesso)
SITO P (peptidico)
SITO E (uscita)
come avviene la traduzione
arriva mRNA nel citoplasma, con AUG(inizio)il primo codone, non so trova all'inizio della
catena la in mezzo mRNA , la subunità minore scivola tra i nucleotide finché non trova il
primo codone AUG , si lega tRNA (anticode), inizia traduzione, arriva la subunità maggiore
e si lega e si forma i 3 siti.
il primo tRNA porta l'amminoacido (metionina) si trova il sito P
il secondo tRNA porta amminoacido(fenilalanina) e si trova nel sito A e così via …..
Tra i due amminoacidi (metionina e fenilalanina) vicini avvengono legami peptidici, in questo
caso viene accelerato da RNA ribosomi funge da enzimi, funziona
catalitica. inizio della catena
A questo punto il ribosoma si sposta di un codone, il tRNA della metionina si sposta nel sito
E(uscita), in sito A è di nuovo libero per accogliere un altro tRNA e così via… finché il
ribosoma non incontra il codone di stop (3 codoni) il ribosoma si ferma e va in stallo , finché
non arriva una proteina di rilascio che si lega al loro a posto del tRNA il loro legame fa
staccare le due subunità dal mRNA , la proteina e sintetizzata e pronta all'uso.
Proteine si subunità un ripiegamento della struttura secondaria o terziaria , può essere
modificata e vera usata ,quando non serviva più viene degradata da dei enzimi proteasi.

L’avanzamento di ogni tRNA attraverso il ribosoma può essere così schematizzato:

citoplasma → sito A → sito P → sito E → citoplasma
(ad eccezione del tRNA iniziatore, che si attacca direttamente al sito P e non transita mai in
A)

questa sequenza: AUG si lega la subunità maggiore , si sposa di 3 (triplette o codone) ,

finché non trova un codone di stop (UAG-UAA-UGA), finisce la traduzione. in questo cosa
consiste in 4 amminoacidi.
Varia sia nei eucarioti che nei procarioti.
mRNA viene tradotto contemporaneamente da più ribosomi insieme detto POLISOMA

nei eucarioti la traduzione puo avvenire nel citoplasma o nel reticolo endoplasmatico rugoso
(ricco di ribosomi , che sistenssinano tutte le proteine che devo entrare dal reticolo
endoplasmatico liscio) , proteine deve andare nel nucleo vengono sintetizzate, libere nei
ribosomi che si trovano nel citoplasma, la traduzione avviene anche nel mitocondri e nei
cloroplasti .

quindi formazione della proteina: nucleo

● prima pre-mRNA o trascritto primario
● maturazione : capping, poli A e splicing
● esporto RNA maturo nel citoplasma o verrà utilizzato utilizzo delle proteine o verrà
degradato
Tutti questi passaggi vengono regolati dalla cellula ,manipolati della cellula la cellula può
decidere se fermare o no il processo. sia trascrizione fino alla formazione della proteina.

Tutti questi meccanismi di regolazione , costituiscono la regolazione espressione genica,

con vari livelli.

● Alcuni geni non devono essere trascritti ,ci sono proteine

che funzionano da repressori , ci possono essere delle
modifiche del dna stesso es: mutazione, o la modifica
metilazione del dna impediscono dna si essere trascritto .
es: il corpo di barr , che uno dei cromosomi xx nelle cellule
femminale , xy nelle cellule maschili . in cromosomi x
ricche di geni , causa di malattie. Nella donna viene
inattivato un dei due cromosomi x attraverso la
metilazione , per completamente in dosaggio tra uomini e
 donni ,lo stesso numero di molecole prodotte dal cromosoma x. un tipo di
regolazione della cromatina.
● un altro tipo di regolazione legata degli istoni,nei eucarioti tutto con condensato
perché deve entrare delle cellula , il primo livello di condensato nucleosomi , il dna si
allonge, trascrivere un gene libera il dna, devo allontanare le proteine istoniche, nel
tratto dove il gene viene trascritto succede allontanano gli istoni grazie a un proteine
acetilasi fanno (dna acido, istoni basici) il gruppi acilici che vengono trasferiti e
coprono le cariche positive degli istoni, quindi gli istoni non sono gli a tratti dal dna
che carico negativamente quindi si staccano dal dna , libera quella regione avviene
la trascrizione. un altro sistema di regolazione espressione genica , a livello epico
genetico nella cromatina (il dna è la legato agli istoni alle proteine de la codenzano ),
si libera un parte di gene avviene la trascrizione , questo sistema può essere
regolato proteine che metto il gruppo acetilici e
che tolgono i gruppi acetilici il bilanciamento delle
proteine interazione con proteine attivatrici , può
promuovere allungamento degli istoni.
● lo SPLICING ALTERNATIVO un altro sistema di
regolazione espressione genica.
● un altro sistema di regolazione espressione
genica, rna arriva nel citoplasma, cellule eucarioti
ricche di rna non codificanti , conditi sulla
regolazione espressione genica e data da
microrna(solo 20 nucleotidi), i geni che lo
producono preoccuparsi poi vengo maturati in
queste piccole molecole di rna. microma hanno
delle sequenze complementari al rna che devo
targettare, nella loro sequenza ci sono almeno 8
nucleotidi sono complementari (come anticodone
e il codone) si legano al mRNA, e spingono
mRNA alla degradazione, non avviene la
traduzione, sono importati per la regolazione
espressione genica, la presenza o meno
stabilisce se il messaggio deve produrre una
proteina o meno , anche utilizzati per la teatra
genica es: herpes quella crema (contiene un
microrna, va da degradare il messaggio virale ,
inibisce la produzione del virus non vengono prodotte le proteine del embolo ), anche
per i tumori per terapia genica livello delle traduzionale
● rna della ferrandina (proteina), viene prodotta solo se
c è il ferro delle nostre cellule, se il ferro non è
presente nel nostro corpo o in quantità
ridotte(anemico) , la rna delle ferrandina , il gene è
attivo e viene prodotto mrna ma vengono tenuti stand
by, c è una proteina repressore che si lega al monde
del AUG, legarsi non permettere la subunità minore si
scivolare a andare UAG, perché ci sta proteina non lo
permette, non c è la produzione della ferrandina ma
mrna è pronto per essere prodotto. aumento di
 ferrandina nelle nostre cellule , il ferro si lega al repressore e fa cambiare la
conformazione, il represso si stacca dal mRMA la ferradina può essere prodotta. Si
produce una molecola di ferro solo se c'è un po di ferro. Le proteine prodotte
possono essere degradate , la degradazione viene all'opera proteasoma. per decide
se una proteina deve essere degradata o no , fa parte post traduzionale.

regolazione della cromatina, epica genetica stabilisce se gli istoni devo essere allontanati il
dna è metilato o meno , regolazione trascriterale e stabile se un gene viene trascritto o
meno ,regolazione post trascrizionale con lo SPLICING ALTERNATIVO, regolazione
traduzionale, abbiamo tanti step per produzione di una proteina.
Geni espressione genetica molto minore, i geni oblipitali devo produrre rna servo alla cellula
tipo geni ribosomali, subisco dopo il controllo del espressione