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Domenico Ripolo
Dove avviene
Come vedremo, il processo comincia nel nucleo (negli eucarioti) e termina nel citoplasma o nel reticolo endoplasmatico ruvido
LRNA messaggero
lRNA messaggero (mRNA) una singola catena lineare di RNA che fa da tramite tra il nucleo e il citoplasma. Contiene una copia in negativo del gene.
LRNA ribosomale
LRNA ribosomale (rRNA) costituente principale (insieme ad alcune proteine) dei ribosomi, da cui il nome.
LRNA transfer
LRNA transfer (tRNA) una particolare catena di RNA che viene rappresentato bidimensionalmente come un trifoglio...
Gly
Ala
Met
Val
Tyr
un polipeptide. Le proteine sono polipeptidi generalmente molto lunghi e con un organizzazione anche molto complessa.
La trascrizione
Nella fase di trascrizione la doppia elica di una porzione di DNA viene dapprima svolta ad opera di un enzima detto RNA-Polimerasi
La trascrizione
Lo stesso enzima apre la doppia elica
e inizia, utilizzando uno dei due filamenti come stampo, a costruire una molecola complementare di mRNA.
La trascrizione
Ecco un modello tridimensionale dellRNAPolimerasi
La trascrizione
C G A G T T G G A C A T G C T C A A C C T G T A
La trascrizione
C G A G T T G G A C A T G C T C A A C C T G T A
La trascrizione
C G A G T T G G A C A T G C T C A A C C T G T A
La trascrizione
C G A G T T G G A C A T G C T C A A C C T G T A
La trascrizione
C G A G T T G G A C A T G C T C A A C C T G T A
Dopo la separazione dei due filamenti, lRNA polimerasi comincia ad assemblare la catena complementare di mRNA
La trascrizione
C G A G T T G G A C A T G C U C A A C C U G U A
utilizzando come stampo uno dei filamenti e secondo la complementariet delle basi.
La trascrizione
G C U C A A C C U G U A
La trascrizione
La catena di RNA messaggero cos formata...
G C U C A A C C U G U A
La trascrizione
sar una sorta di impronta in negativo del gene da cui si originato
A U G U C C A A C U C G
RNA messagero
e migrer verso i ribosomi liberi nel citoplasma o verso quelli attaccati al reticolo endoplasmatico rugoso, portando le istruzioni per la sintesi della proteina.
Il codice genetico
Ma come si fa a passare dal linguaggio degli acidi nucleici (che utilizza 4 lettere)
Il codice genetico
Certo non pu esserci una corrispondenza 1:1
Infatti le possibili coppie di basi sono 42 = 16 (AA, UU, CC, GG, AU, AC, AG, UA, UC, UG, CA, CG, CU, GA, GU, GC) troppo poche per poter codificare i 20 amminoacidi
Il codice genetico
Appare evidente, quindi, che il codice utilizzato si basa su triplette di basi infatti 43 = 64 combinazioni sono pi che sufficienti per codificare i 20 amminoacidi
Il codice genetico
Ed ecco quindi il codice genetico:
Ovviamente ridondante: ci sono cio pi triplette che codificano per lo stesso amminoacido Ci sono anche le triplette di inizio (AUG) e di stop (UAA, UAG e UGA) che determinano linizio e la fine di una sequenza polipeptidica
Il codice genetico
Il codice genetico universale: praticamente tutti gli organismi viventi utilizzano questo stesso codice per tradurre una sequenza di basi azotate (il DNA e poi lRNA) in una sequenza di amminoacidi (la proteina)
La traduzione
Successivamente su ogni codone si attaccher il tRNA con La fase di traduzione ha inizio quando lRNA messaggero si lanticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. attacca al ribosoma.
Gln Ala Val Gly
anticodone codone
G C U C A A C C U G U A
La traduzione
Successivamente su ogni codone si attaccher il tRNA con La fase di traduzione ha inizio quando lRNA messaggero si lanticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. attacca al ribosoma.
Gln Ala Val Gly
La traduzione
Successivamente su ogni codone si attaccher il tRNA con La fase di traduzione ha inizio quando lRNA messaggero si lanticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. attacca al ribosoma.
Gln Ala Val Gly
U C G A
La traduzione
Successivamente su ogni codone si attaccher il tRNA con La fase di traduzione ha inizio quando lRNA messaggero si lanticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. attacca al ribosoma.
Gln Val Gly
Ala
G U U C A U G G A
C G
G C
A U C A A C C U G U A
La traduzione
Successivamente su ogni codone si attaccher il tRNA con La fase di traduzione ha inizio quando lRNA messaggero si lanticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. attacca al ribosoma.
Gln Val Gly
Ala
G U U C A U G G A
C G
G C
A U C A A C C U G U A
La traduzione
Successivamente su ogni codone si attaccher il tRNA con La fase di traduzione ha inizio quando lRNA messaggero si lanticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. attacca al ribosoma.
Gln Val Gly
Ala
G U U C A U G G A
C G
G C
A U C A A C C U G U A
La traduzione
Successivamente su ogni codone si attaccher il tRNA con La fase di traduzione ha inizio quando lRNA messaggero si lanticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. attacca al ribosoma.
Val Gln Ala
C G C G U G C U A U C A A C C U G U A A U G G A
Gly
La traduzione
Successivamente su ogni codone si attaccher il tRNA con La fase di traduzione ha inizio quando lRNA messaggero si lanticodone complementare, portandosi dietro un amminoacido. attacca al ribosoma.
Val Gly
Ala
Gln
C A U G G A
C G
G C
A U
G C
U A
U A C C U G U A
La traduzione
Lamminoacido del primo tRNA si lega poi a quello del secondo
Val Gly
Ala
Gln
C A U G G A
C G
G C
A U
G C
U A
U A C C U G U A
La traduzione
Lamminoacido del primo tRNA si lega poi a quello del secondo
Val Ala Gln
C A U G G A
Gly
C G
G C
A U
G C
U A
U A C C U G U A
La traduzione
Lamminoacido del primo tRNA si lega poi a quello del secondo
Val Ala Gln
C A U G G A
Gly
C G
G C
A U
G C
U A
U A C C U G U A
La traduzione
il primo tRNA si allontana
Val Ala Gln
C C G A G G C U C U A U A C C U G U A A U G G A
Gly
La traduzione
il primo tRNA si allontana
Val Ala Gln
C G A C A U G G A
Gly
G G C U C
U A
U A C C U G U A
La traduzione
il primo tRNA si allontana
Val Ala Gln
C G A C A U G G A
Gly
G G C U C
U A
U A C C U G U A
La traduzione
e un nuovo tRNA si attacca allRNA messaggero
Val Ala Gln
C G A C A U G G A
Gly
G G C U C
U A
U A C C U G U A
La traduzione
e un nuovo tRNA si attacca allRNA messaggero
Val Ala Gln
C A U G G A
Gly
G G C U C
U A
U A C C U G U A
La traduzione
e un nuovo tRNA si attacca allRNA messaggero
Val Ala Gln
C G G G C U C U A U A C C U G U A
Gly
A G
U A
La traduzione
e cos via.
Val Ala Gln
Gly
C A U
G G C U C
U A
U A
G C
G C
A U G U A
La traduzione
e cos via.
Val Ala Gln Gly
C A U
G G C U C
U A
U A
G C
G C
A U G U A
La traduzione
e cos via.
Val Ala Gln Gly
C G U U G G C U C A A C G C A U G U A A U
La traduzione
e cos via.
Val Ala Gln Gly
G U U C A U
G G C U C A A C
G C
A U G U A
La traduzione
e cos via.
Val Ala Gln Gly
C A U
G G C U C A A C
G C
A U G U A
La traduzione
e cos via.
Val Ala Gln Gly
C A U
G G C U C A A C
G C
A U G U A
La traduzione
e cos via.
Val
C G G C U C A A C G C A U G U
La traduzione
e cos via.
Val
G G C U C A A C
G C
A U
C G
A U
U A
La traduzione
e cos via.
Val
G G C U C A A C
G C
A U
C G
A U
U A
La traduzione
e cos via.
Ala Gln Gly Val
G G C U C A A C
G C
A U
C G
A U
U A
La traduzione
In questo modo si viene a costruire un polipeptide sempre pi grande finch non si arriva ad un codone di stop e la sintesi si interrompe.
Immagini e dati utilizzati per la realizzazione di questa presentazione provengono da alcuni siti, fra i quali: http://www.psico.unitn.it/didattica/corsi/50042/ http://it.wikipedia.org/wiki/Sintesi_proteica http://ogm.greenpeace.it/new/dogmacentrale.php http://xoomer.virgilio.it/cyrano2510/flusso3.htm Un interessante filmato che riassume la sintesi proteica disponibile sul sito www.molecularlab.it nella sezione Multimedia.