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Introducción:
- ¿Qué es la bioquímica? Es la ciencia que explica la vida utilizando el lenguaje de la
química y que estudia a los seres vivos a nivel molecular.
-Un enlace químico es un conjunto de fuerzas que mantienen unidos los átomos cuando
forman moléculas.
Célula: es la unidad fundamental básica de todo ser vivo
Funciones vitales: 1. Nutrición 2. Crecimiento 3. Reproducción.
Tiene componentes moleculares
• Proteínas
Ribosomas
Microtúbulos
Mitocondria
Membrana plasmática
• Carbohidratos
Membrana plasmática
• Lípidos
Capa lipídica
• Ácidos nucleicos
Núcleo
Tienen la habilidad de sensar y responder a los cambios del medio quelos rodea
Membrana plasmática; una superficie deintercambio y comunicación celular
• Barrera física
• Transporte transmembranal
• Receptores y cascadas de señalizacion
Tienen una forma determinada por un citoesqueleto que las habiliatpara el movimiento
Citoesqueleto; microfilamentos,microtubulos y filamentos intermedios.
• Forma y organización celular
• Transporte intracelular de vesiculas
• Movimiento y división celular
TEMAS DE QUÍMICA ORGÁNICA: Átomos, elementos, isótopos y iones
Átomo
• El átomo es eléctricamente neutro
• Unidad más pequeña de la materia inerte. Lo compone:
• En el núcleo del átomo esta: neutrones y protones.
Proton: Carga positiva
Neutron: Carga neutra
• En los Orbitales del átomo están los electrones.
Electron: Carga negativa
Elementos
• escenciales y traza
Isótopos:
• radioisótopos (marcadoresmoleculares)
Iones
• cationes (+) y aniones (-)
Electrones
• Forman enlaces covalentes
• Forman iones
• Generan radicales libres
Átomo:
-El átomo es la unidad más pequeña que constituye la materia.
-La molécula es una agrupación definida y ordenada de átomos que constituye la
porción más pequeña de una sustancia.
-Un elemento es la forma fundamental de la materia que se presenta como átomos
de un mismo tipo.
-Un compuesto es una sustancia química formada por la unión de dos o más
elementos diferentes.
La Distribución electrónica determina la posición de los elementosen la tabla periódica.
• Grupo: electrones en el ultimo nivel de energía
• Período: ultimo nivel de energía
• Valencia: orbitales (electrones) desapareados en el ultimo nivel deenergía, igual al
numero de enlaces químicos que puede hacer elátomo
TIPOS DE ENLACES:
• Iónico: Metal + No metal.
• Metálico: Metal + Metal.
• Covalente: No metal + No metal.
Los ácidos grasos esenciales son los poliinsaturados con todos sus dobles enlaces en
posición cis, el linoleico (Ω6) y el linolénico (Ω3).
Ácidos grasos
• Ácidos carboxílicos.
• La mayoría de los ácidos grasos naturales tienen un numero par de carbonos y son
no ramificados
• Saturados
• Monoinsaturados
• Poliinsaturados
Empaquetamiento de los ácidos grasos
• Los ácidos grasos saturados e insaturados trans se empaquetan de manera ordenada,
favoreciendo las interacciones hidrofóbicas
• Los ácidos grasos insaturados cis se empaquetan de una forma menos regular,
promoviendo menos interacciones favorables
Ácidos grasos trans
• Se forman por la deshidrogenación parcial de los ácidos grasos saturados
• Los dobles enlaces trans promueven conformaciones extendidas y
empaquetamientos regulares
Triglicéridos
• Se forman por esterificación entre los ácidos grasos y el glicerol
• Los triglicéridos sólidos son llamados grasas y los líquidos, aceites
• Son el principal almacenamiento de ácidos grasos en el cuerpo (grasa parda y
abdominal)
Las grasas como almacén de combustible
• Los ácidos grasos aportan mayor energía por carbono, debido a que están más
reducidos,
• Los ácidos grasos guardan menos agua esto les permite empaquetarse eficientemente
• Las grasas aportan energía a largo plazo, se liberan lentamente
• La Glucosa y el glucógeno aportan energía a corto plazo. Se liberan rápidamente.
LÍPIDOS DE MEMBRANA
Clasificación de los Lípidos
• Lípidos que NO contienen ácidos grasos:
• colesterol, terpenos, …
• Lípidos que contienen ácidos grasos:
• Lípidos de almacenamiento y Lípidos de membrana
Fosfolípidos:
Principales constituyentes de las membranas celulares
Esfingolípidos
• La estructura central NO es glicerol, es un amino-alcohol de cadena larga, llamado
Esfingosina
o Por ejemplo la ceramida
Glucolípidos
Responsables de los grupos sanguineos
Colesterol
• Lípido de membrana,
o Nucleo esteroideo: cuatro anillos fusionados, de estructura planar
• Los mamíferos obtienen el colesterol de los alimentos y lo sintetizan de nuevo en
el hígado
• Se une a proteínas y es transportado a los tejidos a través de los vasos sanguíneos en
forma de lipoparticulas “lipoproteínas”.
o El Colesterol unido a lipoproteínas de baja densidad “LDL” tiende a
depositarse y obstruir las arterias
LÍPIDOS DE SEÑALIZACIÓN
Hormonas Eicosanoides
• Son mediadores parácrinos
• Se producen por la oxidación enzimática del ácido araquidónico:
• Prostaglandinas: Median la fiebre y la inflamación
• Tromboxanos: participan en la coagulación y agregación plaquetaria
• Leucotrienos: regulan la contracción del músculo liso en los pulmones
Hormonas esteroideas
Las hormonas esteroideas son derivados oxidados del colesterol y se sintetizan en las
gónadas y las glándulas adrenales. Tienen una habilidad endócrina.
Estriadol, cortisol, progesterona, aldosterona
VITAMINAS LIPIDICAS
Las vitaminas son un grupo de sustancias que son necesarias para el funcionamiento
celular, el crecimiento y el desarrollo.
• Las vitaminas hidrosolubles no se almacenan el cuerpo. Los excedentes deestas
vitaminas salen del cuerpo a través de la orina. Deben consumirse regularmente para
evitar carencias o deficiencias en el organismo.
o La vitamina B12 es una excepción, puede almacenarse en el hígado durante
muchos años.
o Vitamina C
o Vitamina B1 (tiamina)
o Vitamina B2 (riboflavina)
o Vitamina B3 (niacina)
o Vitamina B6 (piridoxina)
o Vitamina B12 (cianocobalamina)
• Vitaminas liposolubles que se almacenan en el hígado, el tejido graso y los músculos
del cuerpo.
o Vitamina A
o Vitamina D
o Vitamina E
o Vitamina K
o
ÁCIDOS NUCLEICOS:
Existen 3 tipos de ARN los cuales son:
-ARN mensajero (ARNm): Copia la información del ADN nuclear y la transporta hasta los
ribosomas.
-ARN ribosómico (ARNr): Se asocia a proteínas y forma ribosomas, donde se sintetizan
las proteínas.
-ARN transferente (ARNt): Se une a aminoácidos y los transporta hasta el ribosoma para
formar las proteínas.
Funciones
• Nucleótidos:
• Precursores de ácidos nucleicos
• Intermediarios del metabolismo energético (ATP)
• Cofactores enzimáticos (NAD+ )
• Transducción de señales (cAMP)
• Ácidos nucleicos:
• Almacenamiento de la información genética (DNA)
• Transmisión de la información genética (entre generaciones)
• Procesamiento de la información genética (ribozimas)
• Síntesis de proteínas (ARNr y ARNt)
BASES NITROGENADAS
Bases púricas y pirimidínicas de los ácidos nucleicos. Las bases nitrogenadas que forman
parte del DNA y el RNA se forman a partir de la purina y de la pirimidina. Se resaltan las
modificaciones particulares de cada base.
NUCLEÓSIDOS Y NUCLEÓTIDOS
Formación de un nucleósido (base nitrogenada + azúcar) mediante un enlace N-glucosídico
y de un nucleótido (base nitrogenada + azúcar + grupo fosfato) mediante un enlace éster
fosfórico.
RIBONUCLEÓTIDOS Y DESOXIRRIBONUCLEÓTIDOS
Los nucleótidos que forman parte de los ácidos nucleicos se encuentran en forma
monofosfato.
LOS POLIMEROS DE DNA Y EL RNA, enlaces fosfodiester Edición
La dirección de síntesis va de 5´a 3
• A-T (2 puentes de H)
• G-C (3 puentes de H)
TIPOS DE HÉLICES DE DNA:
Formas A, B y Z del DNA. Las tres estructuras que se presentan tienen 36 pares de bases.
• Estructura Primaria: secuencia lineal de bases complementadas llamadas pares de
Bases (PB)
• Estructura Secundaria: plegamiento en estructuras estables
• Hélices a la derecha:
Forma A: alta humedad, ADN cromosómico
Forma B: baja humedad, ADN/ARN (nucleicos híbridos)
• Hélices a la izquierda:
Forma Z
Típico de bacterias
TITULACIÓN DE AMINOÁCIDOS
• A pH ácido, el grupo carboxilo está protonado, el aminoácido esta en forma catiónica.
• A pH neutro, el carboxilo está desprotonado y el amino está protonado.
• A pH alcalino, el amino está neutro –NH2 y el aminoácido esta en forma aniónica.
El cambio en la cantidad de carga de un aminoácido, en relación al pH, se aprecia en una
curva de titulación.
AMINOACIDOS AROMITICOS
Absorben luz
AMINOACIDOS PROTEICOS MODIFICADOS
Son incorporados por el ribosoma en forma de aminoácido estándar y posteriormente
sufren modificaciones post-traduccionales en las proteínas.
• Fosforilaciones
• Hidroxilaciones
• Carboxilaciones
• Glucosilaciones
o hidrociprolina
AMINOACIDOS NO ESTÁNDAR
• Neurotransmisores
• Hormonas
• Precursores e intermediarios metabólicos
o Serotonina
POLIMERIZACIÓN DE AMINOÁCIDOS
Durante la síntesis proteica, los ribosomas polimerizan aminoácidos a través de enlaces
peptídicos, formando péptidos o polipéptidos, según la instrucción del ARNm.
Proteínas:
Las proteínas están hechas de aminoácidos unidos mediante enlaces peptídicos.
Las funciones de las proteínas son las de estructuras tisulares como músculos y órganos,
transportan oxígeno en la sangre y músculos e incluso pueden ser fuente de energía.
ESTRUCTURA TERCIARA
• Arreglo espacial de la cadena polipeptídica, representado por el plegado de las
secuencias con estructuras secundarias.
• Cuando ocurren plegamientos específicos de pocos aminoácidos, con una función
particular, se les llama motivos proteicos
• Si el plegado de las estructuras secundarias es por regiones de cientos de aminoácidos,
se les llama dominios
ESTRUCTURA CUATERNARIA
CONSTITUCIÓN ENZIMÁTICA
Algunas enzimas necesitan una porción no proteica para desempeñar su función: si es un
catión metálico se denomina cofactor; y si es una molécula orgánica, coenzima. La
porción proteica se denomina apoenzima, y la enzima completa, holoenzima.
COENZIMAS
Estructura química de algunas coenzimas. Se indica la forma de unión de la coenzima a la
apoenzima y la reacción catalizada. Muchos precursores de las coenzimas son vitaminas
hidrosolubles.
CLASIFICACION DE ENZIMAS
• Oxidoreductasas
• Transferasas
• Hidrolasas
• Liasas
• Isomerasas
• Ligasas
INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
Los inhibidores son compuestos que disminuyen la actividad enzimática
• Los inhibidores Irreversibles (inactivadores) reaccionan con la enzima
• Los inhibidores Reversibles pueden unirse a la enzima libre y evitar su unión al
sustrato o al complejo ES y evitar la reacción
INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
• Los inhibidores competitivos se unen al sitio activo de la enzima
• Los inhibidores No-competitivos se unen en sitios diferentes al sitio catalítico, y se
pueden unir a la E o al complejo ES.
• Los inhibidores acompetitivos se unen a un sitio separado del catalítico, pero solo se
unen al complejo ES.
BIOENERGÉTICA Y METABOLISMO DE MACRONUTRIENTES.
Bioenergética:
Describe cómo los organismos obtienen, canalizan y usan la energía, para mantener su
orden interno
Fuente de carbono de los organismos:
A. Autótrofos: utilizan como fuente de carbono el CO2 y como fuente de energía del
sol.
B. Heterótrofos: utilizan como fuente de carbono las moléculas orgánicas y como
fuente de energía el sol.
C. Quimiótrófos: utilizan como fuente de carbono y energía, los combustibles
Calor en una reacción:
Proceso exotérmico, con liberación de calor del sistema al entorno, ΔH < 0
Proceso endotérmico, donde los reactivos del sistema deben absorber calor del
entorno para convertirse en producto, ΔH > 0
Variación de la energía libre durante una reacción química.
Proceso exergónico, donde los reactores presentan mayor contenido energético que
los productos.
Proceso endergónico, donde los productos contienen mayor energía libre.
GLUCÓLISIS
Vía principal de obtención de ATP en condiciones anaeróbias, en cerebro y músculo.
La glucosa es convertida a piruvato y parte de la energía libre de algunas reacciones de
oxidación, es aprovechada para la síntesis de ATP y NADH.
El piruvato puede ser oxidado totalmente a CO2 de manera aeróbia en la mitocondria o
participar como precursor en la biosíntesis.
Ésta es anaerobia y se lleva a cabo en el citoplasma celular, una vez que se obtiene el
piruvato se vuelve aerobia,
Al final de esta ruta se obtiene una ganancia neta de: 2 ATP Y 2 NADH + H+.
Siempre se parte de una molécula de glucosa y se termina con dos moléculas de piruvato.
GLUCONEOGÉNESIS
• Tiene lugar en el hígado, en menor proporción ocurre en la corteza renal y en las
células epiteliales que recubren el intestino delgado.
• Se lleva acabo en citosol.
• Esta regulada, activada por el glucagón.
• Se le puede considerar una ruta inversa a la glucólisis, sin embargo difiere en los 3
puntos de control donde es irreversible la vía.
• Síntesis de nueva glucosa a partir de compuestos simples (glicerol, lactato y
oxaloacetato)
• Ruta metabólica anaerobia y citosólica
• Se indican los pasos de la gluconeogénesis enfrentados a los de la glucólisis, con
flechas rojas las reacciones en los que se diferencian ambas vías “Reacciones de
rodeo”
PAPEL CATABOLICO
Lo que produce cuando es catabólico produce dióxido de carbono, energía química GTP
y moléculas de poder reductor
3-NADH 1-FAD 1-GTP 2-CO2
PAPEL ANABOLICO
Proporciona precursores/intermediarios para rutas biosintéticas:
Monosacáridos
Ácidos grasos
Aminoácidos
REACCIONES DEL CICLO DE KREBS
Las reacciones del ciclo de krebs se realiza en la matriz mitocondrial
Reacción 1: Condensación / Incorporación de Acetil-CoA:
la Acetil-CoA se une a una molecua de oxalacetato a traves de la enzima citrato sintasa,
formando citrato
se libera agua
Reacción 2: Deshidratacion: sale agua
El citrato se convierte en cis-aconiato, mediante la encima aconitasa,
Reaccion 2: Hidratacion: entra agua
El cis-aconiato, mediante la aconitasa, se convierte en isocitrato
Reacción 3: Descarboxilacion oxidativa: se libera NADH y una molecula de CO2
El isocitrato se convierte en Alfa cetoglutarato, mediante la enzima isocitrato
deshidrogenasa.
Reacción 4: Descarboxilacion oxidativa: se libera NADH/ entra una molecula de Acetil
CoA y sale CO2
El alfa ketoglutarato se convierte en Succinil CoA, mediante la enzima alfa cetoglutarato
deshidrogenasa
Reacción 5: Fosforilación a nivel de sustrato: se libera un GTP y un CoA
La Succinil- CoA se convierte en Succinato, mediante la enzima Succinil- CoA sintetasa
Reacción 6: Deshidrogenacion: se libera FADH2
El Succinato se convierte en Fumarato, mediante la enzima deshidrogenasa
Reacción 7: Hidratación: ingresa agua
El Fumarato se convierte en L-Malato, mediante la enzima fumarasa
Reacción 8: Deshidrogenación: se libera un NADH
El L-Malato se convierte en oxalacetato y un tercer NADH, mediante la enzima malato
deshidrogenasa
RENDIMIIENTO DEL CICLO DE KREBS:
Se obtiene por cada uno: 12 ATP en total por ciclo
2 CO2
3 NADH
1 FADH2
1 GTP
Entran 2 CoA
REGULACION COORDINADA
Los productos finales, ATP y NADH + H+ son los reguladores de las dos rutas; asísólo se
degradará la glucosa necesaria para abastecer al ciclo y cubrir lasnecesidades energéticas
de la célula.
REACCIONES ANAPLERÓTICAS
Regeneran los intermediarios
Reponer al Oxalacetato, partir de glucosa, apartir del piruvato o aminoácidos.
FOSFORILACION OXIDATIVA:
• Los carbohidratos, lípidos, y aminoácidos son el principal combustible celular
• Los electrónes de los combustibles se utilizan para reducir NAD y NADP a NADH,
NADPH o FAD a FADH2
• En la fosforilación oxidativa:
- Los electrónes de los cofactores reducidos NADH y FADH2 son transferidos a
una serie de proteínas en la cadena respiratoria
- En los eucariotas, el oxígeno es el ultimo aceptor de estos electrones
- La energía de la oxidación es utilizada para fosforilar el ADP
Hipótesis quimiosmótica.
La síntesis de ATP (fosforilación oxidativa) se lleva a cabo por la ATP sintasa, utilizando
la fuerza protón motriz que se genera en la cadena transportadora de electrones. Todo
esto ocurre en la matriz mitocondrial.
Enzimas antioxidantes
Las células cuentan con enzimas para minimizar el daño promovido por las especies
reactivas de oxígeno, éstas enzimas se encargan de transformar los intermediarios
reactivos en agua.
Las principales enzimas y complejos enzimáticos son:
El complejo Glutatión reductasa
Las isoenzimas de Superóxido Dismutasa (SOD)
Las isoenzimas de Catalasa (CTT)