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Rev. ott-06
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alessandro.bagno@unipd.it
1
Alessandro Bagno – Chimica degli alimenti (Dietistica): Elementi di chimica organica
Rev. ott-06
Indice
Chimica organica ............................................................................................................................................... 4
Struttura elettronica dell’atomo.......................................................................................................................... 5
Forma degli orbitali s e p ................................................................................................................................... 6
Ibridizzazione sp3: il metano.............................................................................................................................. 7
Ibridizzazione sp2: l’etilene ................................................................................................................................ 8
Ibridizzazione sp: l’acetilene.............................................................................................................................. 9
Ibridizzazione con altri atomi ........................................................................................................................... 10
Isomeri. Formule di struttura............................................................................................................................ 11
Gli alcani .......................................................................................................................................................... 12
Interazioni intermolecolari................................................................................................................................ 13
Reazioni degli alcani........................................................................................................................................ 14
Isomeria conformazionale: etano .................................................................................................................... 15
Cicloalcani ....................................................................................................................................................... 16
Isomeria geometrica nei cicloalcani ................................................................................................................ 17
Conformazioni del cicloesano ......................................................................................................................... 18
Gruppi funzionali.............................................................................................................................................. 19
Gruppi funzionali con eteroatomi..................................................................................................................... 20
Nomenclatura IUPAC. 1 .................................................................................................................................. 21
Nomenclatura IUPAC. 2 .................................................................................................................................. 22
Gli alcheni ........................................................................................................................................................ 23
Nomenclatura degli alcheni ............................................................................................................................. 24
Polimerizzazione degli alcheni ........................................................................................................................ 26
Intermedi reattivi .............................................................................................................................................. 27
Gli alchini e i dieni (polieni).............................................................................................................................. 28
Benzene e composti aromatici ........................................................................................................................ 29
Nomenclatura di alchini, polieni e derivati del benzene .................................................................................. 30
Stereoisomeria................................................................................................................................................. 57
Polarizzazione della luce ed origine dell’attività ottica .................................................................................... 58
Polarimetria e misura dell’attività ottica ........................................................................................................... 59
Origine della stereoisomeria............................................................................................................................ 60
Stereoisomeria................................................................................................................................................. 61
Proiezioni di Fischer ........................................................................................................................................ 62
Il postulato di Fischer....................................................................................................................................... 63
La convenzione D/L......................................................................................................................................... 64
Diastereoisomeria. 1........................................................................................................................................ 65
Diastereoisomeria. 2........................................................................................................................................ 66
Diastereoisomeria da isomeria geometrica ..................................................................................................... 67
Modi sempre più precisi per descrivere le molecole ............................... Errore. Il segnalibro non è definito.
Alogenuri alchilici, vinilici e arilici ..................................................................................................................... 31
Nomenclatura degli alogenuri.......................................................................................................................... 32
Alcoli e fenoli.................................................................................................................................................... 33
Eteri.................................................................................................................................................................. 34
Nomenclatura di alcoli, fenoli ed eteri ............................................................................................................. 35
Epossidi ........................................................................................................................................................... 36
Ammine............................................................................................................................................................ 37
Nomenclatura delle ammine............................................................................................................................ 38
Aldeidi e chetoni .............................................................................................................................................. 39
Nomenclatura di aldeidi e chetoni ................................................................................................................... 40
Reazioni di aldeidi e chetoni. 1........................................................................................................................ 41
Reazioni di aldeidi e chetoni. 2........................................................................................................................ 42
Tautomeria cheto-enolica ................................................................................................................................ 43
Acidi carbossilici .............................................................................................................................................. 44
Nomenclatura degli acidi carbossilici .............................................................................................................. 45
Preparazione e reazioni degli acidi carbossilici............................................................................................... 46
Derivati degli acidi carbossilici......................................................................................................................... 47
Nomenclatura dei derivati degli acidi carbossilici............................................................................................ 48
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Alessandro Bagno – Chimica degli alimenti (Dietistica): Elementi di chimica organica
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Chimica organica
La branca della chimica che studiava le sostanze
trovate negli organismi viventi…
• Wöhler: NH4CNO (ammonio cianato) Æ CO(NH2)2 (urea)
C C C
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px py pz py
2 2 px pz py pz
2 px
s s s
1
1 1
s s s
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H
H
H Angoli HCH = 109.5º
• La configurazione elettronica ha solo 2 elettroni spaiati!
Ci si attendono solo 2 legami
• Da un punto di vista energetico, è molto più conveniente
formare 4 legami
• Per giustifcare queste proprietà: l’orbitale s e i 3 orbitali p
dello stesso guscio si combinano a dare 4 orbitali ibridi sp3,
disposti lungo i vertici di un tetraedro
H
H
H
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sp2 2pz
legame σ C-C
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2s 2px 2 sp
2py
2pz
sp
legame σ C-C
Gli elettroni π danno luogo ad una densità cilindrica attorno all’asse C–C
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H
N
C N N N
H
H
H H H
sp3 sp2 sp
H
O C O
H H
H
sp3 sp2
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H C C C C H CH3CH2CH(OH)CH3
OH
H H H H
H H H
OH
H C C C O H
(CH3)2CHCH2OH
H C H
H
H
H
H
H O H
H C C C H
OH
H C H (CH3)3COH
H
H
H
H H H H
O
H C C O C C H
(CH3CH2)2O
H H H H
(C2H5)2O
H H H H O
H C C C O C H
CH3(CH2)2OCH3
H H H H
H H H O
H C C O C H
(CH3)2CHOCH3
H C H
H
H
H
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Gli alcani
Formula generale: CnH2n+2. C ibridizzato sp3
• Il capostipite è il metano, CH4
• Idrocarburi saturi
• Gli alcani a catena lineare vengono chiamati n-alcani
• C1-C4 sono gas; gli altri liquidi o solidi a temperatura e
pressione ambiente
Butano Cicloalcani
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Interazioni intermolecolari
Le interazioni tra molecole neutre sono di vario tipo:
• Interazioni dipolo-dipolo
Richiedono legami tra atomi di diversa elettronegatività, ad es. C–Cl
δ+ δ- δ+ δ-
C X C X
• Legami a idrogeno
Richiedono un legame X–H fortemente polarizzato, ad es. O–H, N–H
(donatore) e un atomo elettronegativo (accettore)
H
C
O
δ-
δ+
H
δ-
C O
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Addizione radicalica di O2
hν
C H + O2 C OOH
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H H H H
H formule a cavalletto
H H
H H
H
60°
HH H
H H
H Proiezioni di Newman
H H H H
H H
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Cicloalcani
Formula generale: CnH2n. C ibridizzato sp3
Tensione di anello
• Ciclopropano
Una sola conformazione planare, idrogeni completamente eclissati
Angoli interni < 109.5° Æ minore sovrapposizione degli orbitali sp3 Æ legami
più deboli, altamente reattivi
60°
108°
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X X
X
X X X
X X
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Conformazione a sedia
Priva di tensione angolare; ciascun idrogeno è in conformazione sfalsata
H H
H
H H
H H conformazione a sedia
H H
H
H
H
Tutti gli angoli sono tetraedrici Æ conformazione più stabile
• Atomi di idrogeno: assiali ed equatoriali
Assiali: perpendicolari al piano medio; equatoriali: sul piano medio
Isomeri cis-trans
H H
trans-1,2-disostiuito cis-1,2-disostiuito
2 equatoriali 1 assiale, 1 equatoriale
X X
X H
H X
• I sostituenti sono più stabili se in posizione equatoriale
Conformazione a barca
Tutti gli idrogeni sono eclissati – meno stabile
H H
conformazione a barca
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Gruppi funzionali
Idrocarburi: Molecole organiche composte solo da C, H
Altri atomi Æ eteroatomi; normalmente sono i centri di
reattività delle molecole organiche e formano i gruppi
funzionali
• Si comportano in modo analogo indipendentemente dallo
scheletro idrocarburico che viene indicato con un R (che sta per
Radicale alchilico) qualsiasi
• Idrocarburi: vengono considerati gruppi funzionali i doppi e i
tripli legami carbonio-carbonio
• Saturi od insaturi, alifatici, ciclici ed aromatici
CH3 CH3
idrocarburo idrocarburo
saturo insaturo
alifatico alifatico
idrocarburo idrocarburo
saturo aromatico
ciclico
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R H R R R R
R OH R Cl R O R
O O
R C N
R OR R NH2
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Nomenclatura IUPAC. 1
Per dare un nome univoco ad ogni composto
• Il nome di un composto viene costruito seguendo uno
schema a blocchi:
H3C
CH3CH2CH2CH2– Butile
CH3CH2CH2CH2CH2– Pentile
Fenile
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Nomenclatura IUPAC. 2
Regole che permettono di scrivere un nome partendo
da una formula (o viceversa):
• Scegliere la catena più lunga che contenga, se possibile,
tutti i gruppi funzionali
• Scegliere la radice corrispondente, premettendo se è il caso
il prefisso ciclo-
• Individuare il suffisso primario
• Numerare la catena dando ai gruppi CHO, COOH, COOR,
COCl il numero 1; se questi non sono presenti si numera la
catena in modo da ottenere il numero minimo
• Aggiungere i suffissi e gli eventuali prefissi appropriati con i
loro rispettivi numeri
I
1 4 3
2
5
2 2 1
3 1 4
6 Br
7 5
8
4-bromo-3-iodo-ciclopentene
5-etil-3-ottene
OH OH OH
4 2
6 5 1
2 4 6 7
3 1 3 5
NO2
2-metil-5-nitro-esan-2-olo 4,6-dimetil-2-epten-4,6-diolo
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Gli alcheni
Idrocarburi con un doppio legame C=C
• Il capostipite è l’etilene, C2H4
H H
C C
H H distanza CC = 1.33 Å
• Più forte e più corto del legame singolo ma molto più
reattivo
• Il doppio legame C=C è considerato un gruppo funzionale
• Il legame π è una fonte di elettroni disponibile
si trova sopra e sotto il piano σ
cis trans
X
X X X
23
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3 4 CH3
H 2 CH2CH3 H3C CH CH2CH2CH=CH-CH2CH3
1 C C
H H 8 7 6 5 4 3 2 1
NON 1 2 3 4 5 6 7 8
1-butene
7-metil-3-ottene
24
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X Y
H H
H H H H
H H H H
H H
25
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n
monomero polimero
• I polimeri più noti:
n H2C CH2 H2C CH2 n
Etilene Polietilene
Cl
n H2C CHCl H2C CH n
n H2C CH H2C CH n
Stirene Polistirene
• La polimerizzazione avviene tramite reazioni di addizione
elettrofila o radicalica
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Intermedi reattivi
Un gran numero di reazioni organiche passano attraverso la formazione di
intermedi instabili, che hanno generalmente vita molto breve
C C C
C H C H
27
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C C C
28
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Antiossidanti, contaminanti
29
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5 3
CH3
4 CH3
OH OH NH2 Cl
F
CH3 NO2
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I I tiroxina
O H
N Br
Br N
H O porpora di Tiro
31
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clorometano 2-bromobutano
(metile cloruro)
H Cl
H H
cloroetilene
(vinile cloruro)
F Cl
Cl
fluorobenzene orto-diclorobenzene
(1,2-diclorobenzene)
32
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Alcoli e fenoli
Formula generale: R–OH, Ar–OH
• Alcoli: R = gruppo alchilico
• Fenoli: Ar = gruppo arilico
Formalmente derivati dell’acqua
O O
H H R H
R
OH
R C R
R CH2OH R CH R
OH
R
O
R H O
H
O
R H
Carboidrati
Antiossidanti
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Eteri
Formula generale: R–O–R
• R un qualsiasi gruppo alchilico o arilico
O O
H H R R
δ O δ
C δ C
Punti di ebollizione:
• Etanolo: 78 °C
• Etere etilico: 35 °C
34
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CH3
OH CH3
H3C OH
H3C CH2 CH2 CH2 OH H3C CH CH2CH3 H3C CH CH2OH
CH3
1-butanolo 2-butanolo 2-metil-1-butanolo 2-metil-2-butanolo
1 OH OH
6 2
5 3
4 CH3
35
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Epossidi
Eteri ciclici in cui l’ossigeno è uno degli atomi di un
anello a tre termini
• Sono trattati a parte a causa della loro eccezionale reattività
Nomenclatura: di ossido dell’alchene corrispondente; ossirani
CH2 CH2
Ossirano, etilene ossido
1 H
H H
H3C CH3 O
O 2 H
cis-2,3-dimetilossirano 1,2-epossicicloesano
cis-2-butene ossido cicloesene ossido
H2O
O HO
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Ammine
Derivati organici dell’ammoniaca
NH3
R
R NH2 R NH R R N R
37
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NH2
H
H3C N CH3 H3C N CH2CH3
CH3
etil metil ammina amminobenzene
trimetilammina
benzenammina
(anilina)
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Aldeidi e chetoni
Gruppo funzionale: doppio legame C=O
R R
C O C O
H R
aldeide chetone
39
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metanale etanale
formaldeide acetaldeide benzaldeide
2-propanone 3-pentanone
acetone dietil chetone
dimetil chetone
O CH3
O
H3C CH3C(O)-
acetile
40
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gem-diolo
Addizione di alcoli
O OH OR'
H
C R'OH R H R'OH
R H R H
OR' OR'
emiacetale acetale
O OH
OR'
H
C R'OH R R R'OH
R R R R
OR'
OR'
emichetale chetale
NH R
immina
Reazione di Maillard
41
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addotto bisolfitico
C O2 C
R H R O O H
• Reazione radicalica
42
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Tautomeria cheto-enolica
Le aldeidi e i chetoni con almeno un atomo di H in α al
carbonile possono esistere in due forme (tautomeri) in
equilibrio tra loro
H
O O
Kt
C H C
C C
α
chetone enolo
CH2OH
H C OH
O O
43
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Acidi carbossilici
Composti aventi la funzione
O
C
R OH
O O
H
R R
OH O
Ka = 10-5
Regolazione dell'acidità
Degradazione dell’aroma
44
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COOH
acido benzoico
45
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O O
KMnO4
C C
R H R OH
aldeide
O H O
R CH3OH R H2O
OH OCH3
46
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reattività
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COOCH3
metile benzoato
O O
CH3 CH3
H3C C N H3C C N
H CH3
N-metilacetammide N,N-dimetilacetammide
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C C
R O R
H 2O NH3
ROH
O O
C O C
R OH R NH2
C
R OR
49
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C
R OR
H2O NH3
R1OH
O O
C O C
R OH R NH2
C
R OR1
O O
+ NaOH + ROH
C C
R OR R ONa
O
CH2O C R1
CH2OH
O
CH-OH
CH-O C R2 + eccesso OH- (NaOH)
CH2OH
O
CH2O C R3 Glicerolo
Trigliceride
50
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51
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O O
R C OH H NR'2 R C NR'2
O N OH H NR'2 O N NR'2
nitrosammide
acido nitroso (nitrosammina)
O O
R S OH H NR'2 R S NR'2
O O
acido solfonico solfonammide
Contaminanti (nitrosammine)
Edulcoranti (solfonammidi)
52
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Composti eterociclici
Composti ciclici in cui uno o più atomi dell’anello sono
diversi dal carbonio (eteroatomi): N, O, S
Gli eterocicli si possono raggruppare in due classi: non
aromatici ed aromatici
• Quelli non aromatici hanno proprietà chimiche e fisiche
tipiche dell’eteroatomo che contengono
O
O O N O N
O
H H
lattone epossido lattame tetraidrofurano pirrolidina
O
H H
N N
S (CH2)4COOH
Biotina
Vitamine
53
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O S N N N
H H H
furano tiofene pirrolo imidazolo indolo
Il sestetto aromatico di elettroni delocalizzati è costituito dai quattro elettroni π
degli atomi di carbonio e da un doppietto elettronico libero dall’eteroatomo
• L'azoto pirrolico NON è basico!
• Furano e tiofene: il secondo doppietto solitario occupa un
orbitale sp2 perpendicolare al sistema π
sp2
N H O
COOH COOH N N
H2N H H2N H H
H
CH2 CH2 N N
istidina
triptofano
N NH N
H porfina
Amminoacidi, vitamine
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N
N
CHO CH2NH2
N H 3C N H3C N O
Antiossidanti - vitamina B6
Coloranti naturali negli alimenti
55
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Pirimidina e purina
Pirimidina: due atomi di azoto in posizione 1,3
N
pirimidina
R R
N NH
N OH N O
H
N N
N OH N O
H
citosina
56
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Stereoisomeria
Stereoisomeri: composti formati dagli stessi atomi,
legati con gli stessi legami, ma aventi strutture
tridimensionali differenti e non intercambiabili
Queste strutture tridimensionali vengono chiamate configurazioni
Isomeria
ISOMERIA di STRUTTURA
O OH C4H10O
C4H10
HH H
H H
H conformazioni
H H H H
H H
Stereoisomeria
• enantiomeria (o isomeria ottica)
• diastereoisomeria
57
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58
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59
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D D
C C
A A
B B
60
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Stereoisomeria
STEREOISOMERIA
ENANTIOMERIA DIASTEREOISOMERIA
configurazioni
61
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Proiezioni di Fischer
Introdotte per rappresentare la disposizione spaziale
D D
B C C B
A A
Proiezioni di Fischer
D D
B C C B
A A
62
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Il postulato di Fischer
Che relazione intercorre tra configurazione assoluta e
direzione di rotazione?
• Esempio: acido lattico (2 enantiomeri)
COOH COOH
α = + 3.8
H OH HO H
α = - 3.8
CH3 CH3
H OH HO H
CH2OH CH2OH
D-(+)-gliceraldeide L-(-)-gliceraldeide
63
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La convenzione D/L
• Si scrive in verticale la catena idrocarburica più lunga con il
carbonio carbonilico al vertice
• La configurazione D è quella che il gruppo funzionale a
destra, la configurazione L e quella con il gruppo funzionale
a sinistra
• È una convenzione adatta ai carboidrati e ai composti in cui
vi è un solo gruppo funzionale
CH2OH CH2OH
D-(+)-gliceraldeide
HBr
COOH COOH
riduzione
H OH H OH
CH3 CH2Br
D-(-) acido lattico
64
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Rev. ott-06
Diastereoisomeria. 1
Quando vi sono più atomi di carbonio asimmetrici, gli
stereoisomeri possibili sono al massimo 2n
3-fenil-2-butanolo CH3
* *
CH CH CH3
Ph OH
2n stereoisomeri = 4
H Ph Ph H Ph H H Ph
H OH HO H H OH HO H
diastereoisomeri
CH3 CH3
H Ph Ph H
H OH H OH
CH3 CH3
65
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Diastereoisomeria. 2
CH3 CH3
H Ph Ph H
H OH H OH
CH3 CH3
66
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Diastereoisomeria da isomeria
geometrica
Isomeri cis-trans nei cicloalcani e negli alcheni
• Sono stereoisomeri ma non enantiomeri – non presentano
attività ottica
X X
X
cis trans
isomeri geometrici
diastereoisomeri
isomeri geometrici
cis trans
X
X X X
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Carboidrati
Noti anche come zuccheri o glucidi, sono
poliidrosssialdeidi o poliidrossichetoni e loro derivati
• I composti organici più diffusi nel regno vegetale ed animale
• Il nome di carboidrati o “idrati di carbonio” deriva dalla
formula bruta: Cn(H2O)n
• Le piante verdi sintetizzano nelle foglie il glucosio mediante
la fotosintesi
Riduzione dell'anidride carbonica atmosferica mediante l'energia solare
68
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Monosaccaridi. 1
Formula Cn(H2O)n, n > 3
• Desinenza –osio (-oso). Triosi, tetrosi, pentosi, esosi etc.
Funzione aldeidica Æ aldo- pentosi, -esosi, etc.
Funzione chetonica Æ cheto- pentosi, -esosi, etc.
CH2-OH
CHO
O
CH-OH
CH-OH
CH-OH
CH-OH
CH-OH
CH-OH
CH2-OH
CH2-OH
aldopentoso
chetoesoso
H OH HO H
CH2OH CH2OH
D-gliceraldeide L-gliceraldeide
aldotrioso
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Monosaccaridi. 2
• Monosaccaridi con più centri chirali: si indica solo quello più
lontano dal gruppo carbonilico secondo la convenzione D,L
CHO
H OH
HO H
D-glucosio
H OH
H OH
CH2OH
• I monosaccaridi più importanti appartengono alla serie D
H OH
CH2OH
D-gliceraldeide
CHO CHO
H OH HO H
H OH H OH
CH2OH CH2OH
D-eritrosio D-treosio
CHO CHO CHO CHO
H OH HO H H OH HO H
H OH H OH HO H HO H
H OH H OH H OH H OH
CH2OH CH2OH CH2OH CH2OH
H OH HO H H OH HO H H OH HO H H OH HO H
H OH H OH HO H HO H H OH H OH HO H HO H
H OH H OH H OH H OH HO H HO H HO H HO H
H OH H OH H OH H OH H OH H OH H OH H OH
70
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H OH
HO H
H OH
H OH
CH2OH
D-(+)-glucosio
pf = 146°C pf = 150°C
α = +112 H 2O H 2O α D = +19
D
α D = +52.7
La forma con potere ottico rotatorio più alto è chiamata α-anomero, quella
con il potere ottico rotatorio più basso è chiamato β-anomero
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CHO H OH HO H
H OH H OH H OH
HO H HO H HO H
H OH H OH H OH
H OH H O H O
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pirano
O
CHO HO H
H OH
H OH H OH
H OH HO H HO H
HO H H OH H OH
H OH H OH H O
H O CH2OH CH2OH
CH2OH
H OH H OH
H OH
H O H O
H OH
HO HO
HO O
HO H HO OH
H HO H
OH H OH
OH
H OH H H H
H
α-anomero β-anomero
pf = 146°C pf = 150°C
73
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Glicosidi
Si formano per addizione di una molecola di alcol
H OH H OH
H O H O
HO CH3OH HO
HO OH HO OCH3
H OH H OH
H
H H H H
β-D-(+)-glucosio metil−β-D-glucoside
Glicosidi in natura
• Molte sostanze vegetali sono glicosidi
La parte zuccherina permette la solubilizzazione dell’aglicone nel mezzo
fisiologico acquoso
La porzione zuccherina è costituita da svariatissimi mono- e disaccaridi
H OH
arbutina
H O
HO
dalle foglie del pero
HO O OH (sbiancante della pelle)
H OH
H H
β-D-(+)-glucoside
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N-Glicosidi e deossizuccheri
N-Glicosidi
• L’aglicone è un sostituente amminico
R R
O OH O N
R R
N H 2O
H
β-anomero N-glicoside
N
N
N N
HO
O adenina
H H
H H
OH H
D-deossiribosio
adenosina
Deossizuccheri
• Monosaccaridi che mancano del sostituente alcolico su uno
o più atomi di carbonio
2-Deossiribosio (DNA)
L-ramnosio e L-fucosio (pareti cellulari di alcuni batteri, gruppo sanguigno)
OH OH
CH2OH OH O O OH
O CH3 CH3
OH
OH
OH H OH OH OH
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Amminozuccheri
Un gruppo amminico, come tale o in forma di N-
acetammide, sostituisce un gruppo ossidrilico
• D-glucosammina
Polissaccaridi dei vertebrati Æ cartilagini etc.
Chitina (esoscheletro di insetti e crostacei)
• D-galattosammina
Glicolipidi
• Acido N-acetilmurammico
Parete cellulare dei batteri
OH CH2OH O
CH2OH CH2OH HO
O O O OH
HO NH
HO OH HO OH H 3C
NH2 NH2 H
COOH
H 3C O
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MONOSACCARIDE DISACCARIDE
OLIGOSACCARIDE
POLISACCARIDE
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Disaccaridi
• Maltosio
Idrolisi parziale dell’amido
• Cellobiosio
Idrolisi parziale della cellulosa
Entrambi composti da due unità di glucosio
OH OH
O OH
HO O
OH HO
HO O
HO O
OH
O OH
O HO
HO OH
OH OH
α-(+)-maltosio OH α-(+)-cellobiosio
• Lattosio
Formato da galattosio e glucosio
galattosio OH
HO O
OHOH
OH HO
O OH
O CH2OH O
HO O O
OH OH
HO
OH
CH2OH
OH
α-(+)-lattosio OH
(+)-saccarosio
• Saccarosio
Formato da glucosio e fruttosio
Latte
Frutta e verdura
Cereali
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Polisaccaridi
Amido
• Polimero del α-D-glucosio
• Frazione solubile in acqua: amilosio
Polimero lineare (circa 1000 unità) legato con ponti α-glicosidici C1-C4
OH
O
OH
HO
OH
O
O OH
HO
OH OH
O
O OH
OH HO
O
OH OH
O O
HO O
OH OH HO
O HO
O OH OH
OH O
HO O OH
OH HO
O OH O
O OH O
HO O
OH HO
O OH
O O
O
HO
amilopectina HO
amilosio OH OH
Glicogeno
• Amido animale, struttura simile a quella dell’amilopectina
Cellulosa
Il polisaccaride più abbondante
Polimero del β-D-glucosio, 300-3000 unità
OH
OH
O
OH
HO O O
OH
OH O
HO O
OH HO O
O
OH
HO
cellulosa OH
Vegetali, cereali
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Amminoacidi e proteine
Le proteine sono ubiquitarie in tutti gli esseri viventi
Funzione di sostegno in una gran parte del corpo animale (collageno)
Costituenti essenziali in tutte le cellule viventi
La maggior parte della pelle, dei muscoli, dei tendini, dei nervi e del sangue
Enzimi, anticorpi e numerosi ormoni
• Dal punto di vista chimico le proteine sono tutte poliammidi
(polipeptidi) formate da molte molecole di α-amminoacidi
che si uniscono tra loro attraverso legami ammidici, detti
anche legami peptidici
Ogni proteina contiene 102-103 unità di amminoacidi e, poiché gli
amminoacidi naturali sono circa 20, il numero di combinazioni possibili è
enorme
Ogni polipeptide ha una composizione precisa in numero, tipo e successione
di amminoacidi
• Proteine coniugate
In cui la catena polipeptidica è legata ad un raggruppamento non peptidico
chiamato gruppo prostetico: acidi nucleici (nucleoproteine), lipidi
(lipoproteine), zuccheri (glicoproteine)
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Amminoacidi
Gli amminoacidi che costituiscono le proteine sono
acidi α-amminocarbossilici
COOH
H2N H
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CH2
Glicina (Gly) H Triptofano (Trp)
NP NP
N
H
(Ile) CH
NP
CH
NP CH3 CH3
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H 3N H
R
Possono reagire sia come basi, accettando un protone, che come acidi,
donando un protone
COOH COO COO
H H
H3N H H3N H H2N H
H H
R R R
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Peptidi
Poliammidi le cui unità monomeriche sono costituite da
α-amminoacidi
Oligopeptidi, polipeptidi
• Il legame ammidico tra il gruppo amminico di un α-
amminoacido e il gruppo carbossilico di un altro
amminoacido viene detto legame peptidico
• Le strutture dei peptidi vengono rappresentate scrivendo in
successione le sigle degli amminoacidi cominciando da
quello in cui il gruppo amminico è libero (amminoacido N-
terminale) e terminando con quello in cui è libero il gruppo
carbossilico (amminoacido C-terminale)
• Due peptidi sono diversi, anche se sono costituiti dagli
stessi amminoacidi, se la sequenza degli amminoacidi è
diversa
CH3 O
- H 2O H
CH3 CH COOH H CH COOH N
H2N C OH
NH2 NH2
O H
alanina glicina
legame peptidico
Il legame peptidico
• Il legame peptidico è planare
H O H H O
R
N N
N
H R H R
H O
Le catene laterali sono in posizione trans rispetto al piano del legame
peptidico
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Valore alimentare
Marcatori della specie di origine e del tipo
di tessuto
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ossitocina
L’ossitocina di gallina, bovina e umana è identica. Qualsiasi cambiamento
della sequenza degli amminoacidi provoca profonde modificazioni dell’attività
biologica
Molti peptidi complessi possono svolgere la stessa funzione in specie
differenti senza avere una struttura primaria identica. Ad esempio l’insulina
(51 aa) differisce nella disposizione di 4 aa nelle specie viventi. Tuttavia,
l’insulina bovina può essere utilizzata per la terapia del diabete
Le proteine con più di 100 aa vengono trasferite da una specie all’altra con
difficoltà Æ trapianto di organi
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Struttura terziaria
• Forma tridimensionale in seguito ai ripiegamenti della
catena peptidica
Ogni proteina ha una sola struttura terziaria, indispensabile per lo
svolgimento delle sue funzioni biologiche
• Forze che stabilizzano la struttura terziaria
ponti disolfuro (2 Cys–SH Æ Cys–S–S–Cys)
legami a idrogeno tra gruppi peptidici o gruppi polari delle catene laterali
legami elettrostatici tra gruppi acidi e gruppi basici
interazioni idrofobiche tra gruppi R non polari
• Denaturazione: perdita della struttura terziaria originaria
Comporta la perdita dell’attività biologica ed è spesso irreversibile
Struttura terziaria
dell’enzima tripsina
Struttura quaternaria
• Interazione tra catene polipeptidiche (sub-unità)
Esempio: emoglobina, formata da quattro sub-unità
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Enzimi
Proteine che catalizzano specifiche reazioni chimiche
La parola enzima significa “nel lievito”. L’uomo ha utilizzato gli enzimi fin
dall’antichità per produrre vino, aceto, formaggio
• Efficienza: Le reazioni enzimatiche, rispetto alle reazioni non
catalizzate sono normalmente 1010- 1020 più veloci
• Specificità: catalizzano una data reazione solo per un certo
substrato
• Stereospecificità: viene attaccato un solo stereoisomero, gli
altri rimangono inalterati
• Il nome di un enzima viene dato in base alla reazione che
l’enzima catalizza aggiungendo il suffisso -asi
La reazione enzimatica avviene in una zona ben precisa della proteina detta
sito attivo mentre il resto della proteina serve a favorire l’ingresso del
substrato nel sito attivo stesso e il contatto con i gruppi catalitici
L’adattamento della struttura del substrato a quella dell’enzima equivale
all’adattarsi della chiave alla serratura
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Lipidi
Sostanze organiche insolubili in acqua, che si trovano
nelle cellule e nei tessuti animali e vegetali
Vengono estratte con solventi apolari come etere, cloroformio e benzene
LIPIDI
Semplici Complessi
Fosfolipidi Glicolipidi
Fosfogliceridi Sfingolipidi
89
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Grassi o triacilgliceroli
I lipidi più abbondanti in natura
• Costituenti principali delle riserve alimentari dell'organismo
negli animali e nelle piante
• Esteri degli acidi grassi con il glicerolo (1,2,3-propantriolo)
CH2 OH CH2 O
O
CH OH
CH O
CH2 OH O
CH2 O
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CH2 O
O
CH O
O
CH2 O
H2O 3 NaOH
Na O
CH2 OH O
CH OH
Na O
CH2 OH O
Na O
91
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Na+ H2 O
H2 O
grasso
Na+
Na+ H2O
H2 O
Na+
Na+ H2O
Na+ Na+
H2O
H2 O
H2O
92
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Fosfolipidi
Costituenti essenziali delle membrane cellulari
Gliceridi che contengono un gruppo alcolico primario
esterificato con acido fosforico
• Capostipite: acido fosfatidico
Costituito da una molecola di glicerolo in cui uno degli ossidrili primari è
esterificato con l'acido fosforico, e gli altri due gruppi alcolici sono esterificati
con acidi grassi
O O O O
HO P OH HO P OR HO P OR RO P OR
OH OH OR OR
acido fosforico esteri fosforici
O CH2 O C R
CH2 O P OH
OH
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Terpeni e terpenoidi
Idrocarburi di formula bruta C10H15 (terpeni), o composti
ossigenati simili (terpenoidi)
Spesso isolati dagli oli essenziali delle piante
• Costituenti aromatici
• Impiegati nell'industria dei profumi
• Formalmente costituiti da due o più unità C5 (unità
isopreniche); molti sono ciclici
Isoprene: 2-metil-1,3-butadiene
isoprene
(2-metilbutadiene)
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OH
OH
geraniolo
(dalle rose e da altri fiori)
O
mentolo
limonene canfora
(dalla menta piperita)
(dalla sorza di limone
o di arancio)
OH
Diterpeni. Fitolo (clorofilla)
OH
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Steroidi
Contengono il sistema tetraciclico ciclopentanoperidro-
fenantrene
R
C D
A B
Colesterolo
• Intermedio nella biosintesi degli ormoni steroidici e degli
acidi biliari
• Costituente delle pareti cellulari animali e del tessuto
nervoso
I vegetali generalmente non utilizzano il colesterolo ma steroidi simili
Vitamina D
HO
HO
Colesterolo Vitamina D2
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Acidi nucleici
Acido deossiribonucleico (DNA) e acido ribonucleico
(RNA)
Polimeri formati di unità monomeriche (nucleotidi) che
• contengono il codice genetico di ogni cellula (DNA)…
• …o lo trasmettono mediante la sintesi proteica (RNA)
H OH H OH
H OH H OH
CH2OH CH2OH
OH OH OH
D-ribosio 2-deossi-D-ribosio
• Basi eterocicliche
NH2 O
N N
N HN
PURINE adenina guanina
N G N
A N H2 N N
H H
O NH2
R
NH N
R = H (uracile) citosina
PIRIMIDINE R = CH3 (timina)
N O C N O
U, T H H
• RNA: A, G, C, U
• DNA: A, G, C, T
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base azotata
base
HO CH2 O N
zucchero
O O-
P base azotata
fosfato
base -O O
CH2 O N
5'
zucchero
3'
O O
P base azotata
fosfato -O O n
base
5' CH2 O N
zucchero
OH
fosfato
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La doppia elica
• Il modello di Watson e Crick per il DNA è una doppia elica di
due molecole di DNA antiparallele tenute insieme da legami
a idrogeno
A T C A G T T C
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Rev. ott-06
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