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Massimo Reconditi
2006/2007
Motori molecolari
Interazioni DNA-proteine
Alcuni aspetti della biofisica. 2.
Citochinesi
Alcuni aspetti della biofisica. 3.
Biomeccanica e bioreologia
Argomenti del corso:
Interazioni molecolari:
Es.: Interazioni elettrostatiche tra cariche e dipoli
Le forze di dispersione
Il legame idrofobico
F = -k ∆x
Se ∆x = 1 nm
Allora F = 1 pN
Forze viscose:
F = -γ v
γ è il coefficiente di viscosità
F = d(mv)/dt
mv è la quantità di moto
Se una proteina collide con una molecola d’acqua la forza della collisione
sarà F = 18-36 10-12 pN
Se una molecola in acqua (n=1.33) assorbe un fotone verde (λ=500 nm) al secondo,
la forza dovuta alla collisione vale 1.0 10-15 pN.
Se una molecola assorbe 109 fotoni/s (p.es. da un laser molto potente), la forza è
ancora molto bassa, 10-6 pN.
Forze gravitazionali:
F = mg
g=9.8 m/s2
Esempio: una proteina di 100 kDa ha una massa di 166 10-24 kg.
F=9.8 · 166·10-24 N = 1.6 10-9 pN
Forze centrifughe:
F = qE
Esempio: uno ione di sodio con q=1.6 10-19 Coulomb sente una forza elettrica
quando si muove attraverso un canale ionico. Se il potenziale attraverso
la membrana è ca 60 mV, per uno spessore di 4 nm, allora il campo
elettrico è 15 106 V/m
La forza sullo ione è 2.4 pN
Anche le forze di Van der Waals hanno una natura elettrostatica. Esse originano
dalla separazione di carica indotta tra atomi vicini. Il loro valore può arrivare
a ca 100 pN per nm2 di interfaccia proteina-proteina.
Forze magnetiche:
B → →
LAB = ∫ F ( r ) •d r
A
LAB = E A − E B
Nel mondo degli atomi, delle molecole, delle cellule, le forze che
conosciamo a livello mesoscopico danno luogo a fenomeni che il
senso comune non si aspetterebbe. Vediamo per esempio l’effetto
della viscosità del fluido (acqua) sul moto di un batterio.
F dv
=η
A dx
ρLv
Numero di Reynolds Re =
η
Dove ρ è la densità del mezzo, L la dimensione caratteristica
dell’oggetto che si muove nel mezzo a velocità v, η il coefficiente
di viscosità
F = −γv = −6πηvr
(Legge di Stokes)
Qual è la forza che i motori molecolari devono generare per mantenere
il movimento di un batterio di 2 µm di lunghezza, come ad esempio
l’E.coli che nuota nell’acqua a una velocità di 25 µm/s, con un valore
di γ = 6πηr = 20 nN s/m?
x ~ 5 pm = 0.05 Å