Cinética enzimática

La cinética siempre estudia la velocidad de las cosas. En este caso vamos a

ver la velocidad de las reacciones en las que participan las enzimas.

Entonces es importante definir a qué vamos a llamar velocidad para este

caso de las enzimas. Como las enzimas convierten cosas (reactivos) en
otras (productos), vamos a pensar en la velocidad de una reacción como la
formación de productos en un determinado tiempo (por ejemplo: 2 atp

OM
por minuto). En un primer momento va muy rápido y se va deteniendo a
medida que pasa el tiempo.

.C
DD
La regulación de la actividad de las proteínas enzimáticas está
LA

determinada por varios factores:

 Cambios en el pH (medidor de acidez del medio). Como ya dijimos, la

proteína tiene una parte ácida, la cual se comporta de diferentes
FI

maneras dependiendo si su medio es ácido o básico, modificando su

forma y por lo tanto su función


Este archivo fue descargado de https://filadd.com

 Cambios en la temperatura. Como la estructura 2ria, 3ria y 4ria
están estabilizadas por uniones débiles, los cambios en la
temperatura modificarán estas y por lo tanto los sitios activos. Un
aumento de temperatura hace que la proteína pierda su estructura
o se desnaturalice (irreversible), mientras que las bajas
temperaturas rigidizan el sitio activo, volviendo las reacciones
extremadamente lentas (es reversible).
 Concentraciones de sustrato. Imaginemos una proteína como un

OM
albañil extremadamente entrenado pasando ladrillos; puedo
aumentar la cantidad de ladrillos y el los pasará rápidamente, sin
embargo hay un punto en que alcanzará el máximo de su capacidad
y los ladrillos que aumente tendrán que esperar. Cuando una

.C
proteína tiene exceso de sustrato por encima de su capacidad,
decimos que está saturada.
DD
Podemos ver como la velocidad
de la reacción aumenta al
aumentar la concentración de
sustrato, hasta alcanzar su límite
en el cual la velocidad alcanza el
LA

máximo y por más que aumente

el sustrato no aumenta la
velocidad.
FI

 Concentraciones de producto. Muchas proteínas regulan su

actividad dependiendo cuánto hay del producto que ellas generan,
es decir, si hay más del suficiente este puede desactivar el sitio


activo, el cual volverá a activarse cuando el producto se separe de

esta región de la molécula, es decir cuando baje su concentración y
haya que volver a producirlo.

Existen sustancias que pueden mejorar el funcionamiento de una

enzima o hacerlo más ineficiente. A estas se las llama moduladores.
Un modulador positivo se puede considerar como un activador,
mientras que los moduladores negativos son inhibidores de la
actividad enzimática.

Este archivo fue descargado de https://filadd.com

 OM
Tiempo

.C
DD
LA
FI


 Presencia de inhibidores. Puede haber inhibidores que se unan al

sitio activo de la enzima y no permitan que esta realice su función.

Pueden ser competitivos (si se unen al mismo lugar que el sustrato) o

no competitivos (si se unen a otro lugar).

Este archivo fue descargado de https://filadd.com

 OM
.C
 En este caso podrá retomarla sólo cuando el inhibidor sea
DD
desplazado o retirado. Cuando un inhibidor se une a una región de
la proteína que no es el sitio activo y la inactiva, se llama inhibición
alostérica
LA
FI


Cuando una enzima es inhibida alostéricamente por el producto de

una vía metabólica se llama feed-back o retroalimentación negativa.

IMPORTANTE: Las enzimas alostéricas no pueden explicarse por el

modelo de Michaelis-Menten que viene a continuación.

Enzimas Michaelianas

Este archivo fue descargado de https://filadd.com

Teniendo en cuenta la forma en la que una enzima se une con su
sustrato, se hizo una pregunta: ¿Cuál es la cantidad de sustrato que
necesito para que la velocidad de una reacción que tiene que ver con
una enzima llegue a la mitad? Es decir, cuánto sustrato necesito para
alcanzar la mitad de la velocidad máxima.

OM
.C
Ese valor es muy importante (y lo preguntan en todos los exámenes!) y
se llama Km, por constante michaeliana. Es un valor que sirve mucho
DD
porque me permite pensar qué tanto se “quieren” la enzima y el
sustrato, es decir la afinidad enzima-sustrato.

Si aumenta el Km, significa que necesito más sustrato para alcanzar la

LA

velocidad media, entonces BAJA la afinidad.

Si disminuye el Km, significa que necesito menos sustrato para

alcanzar la velocidad media, entonces AUMENTA la afinidad.
FI

Si lo pensamos en función de los inhibidores, un inhibidor competitivo

“molesta” a la unión de la enzima con el sustrato sin cambiar la
velocidad máxima. Es decir que hace que se necesite más


concentración de sustrato para alcanzar la misma velocidad, porque

hay otra sustancia que también se está metiendo. Un inhibidor
competitivo (IC) mantiene la velocidad máxima constante pero
disminuye la afinidad aumentando la Km.

Un inhibidor no competitivo se une a otro lugar donde no es el sitio

activo, entonces no afecta la afinidad de la enzima, pero imposibilita la
formación de productos. Un inhibidor no competitivo (INC) mantiene
la Km pero disminuye la velocidad máxima.

Este archivo fue descargado de https://filadd.com

 Velocidad máxima 1

Velocidad máxima 2

OM
Km2

Km1

.C
Para recopilar un poco la información que estuvimos diciendo, podemos
pensar en el siguiente gráfico. Este nos permite ver cómo son los dibujos
DD
en el caso de cada una de las inhibiciones
LA
FI


Este archivo fue descargado de https://filadd.com

 OM
Modificación covalente

Las enzimas, al ser proteínas, pueden sufrir cambios en su estructura. Hay

.C
cambios que son por las condiciones del medio (pH, temperatura) pero
hay otros que tienen que ver con uniones químicas fuertes que suceden
DD
con las proteínas.

La más frecuente de estas es la fosforilación y la desfosforilación. Es decir

el agregado de un grupo fosfato a una sección de la proteína (y luego la
remoción).
LA

Veamos de nuevo los grupos fosfato (que están presentes en el ADN y en

el ATP)
FI


Como se puede ver, es una molécula que tiene mucha carga negativa.
Imagínense que las proteínas son moléculas que tienen muy pocas
uniones fuertes (estructura primaria) y tienen muchísimas uniones débiles
(estructura 2ria, 3ria, 4ria). Entonces meter un fosfato en una proteína
genera un cambio muy profundo en la conformación. Esto es
biológicamente utilizado para que las enzimas tomen otras formas.

Este archivo fue descargado de https://filadd.com

Algo importante es que para poder fosforilar una proteína tengo que
tener un grupo fosfato (obviamente). Ese grupo fosfato generalmente
viene del ATP.

OM
.C
DD
En el dibujo vemos como se acerca una molécula de ATP a una proteína y
mediante una proteína quinasa le agrega un grupo fosfato. Entonces: las
quinasas son proteínas que fosforilan a otras proteínas (esto va a aparecer
más adelante). Y las fosfatasas son aquellas que sacan los grupos fosfato
LA

de las proteínas. Como puede “ponerse y sacarse” se considera que la

fosforilación es una modificación covalente reversible.

Si te cuento que hay modificaciones reversibles es porque hay otras que

FI

son irreversibles. Vamos a hablar un poco de eso.

Las modificaciones irreversibles son algunas que involucran la ruptura de



los enlaces peptídicos de la proteína. Es decir que se cambia la estructura

primaria de manera definitiva. El mayor ejemplo de esto son los
zimógenos, que son proteínas inactivas que necesitan que las rompan
para poder activarse.

En pocas palabras: una proteína grande inútil (zimógeno) la cortan y se

convierte en una proteína corta útil (enzima). También pueden llamarse
proenzimas (pro=antes, enzima=enzima)

Este archivo fue descargado de https://filadd.com

En este último dibujo se ve que ocurre un proceso irreversible al que se lo

OM
llama hidrólisis de la proteína. Esto la convierte en una enzima activa.

.C
DD
LA
FI


Este archivo fue descargado de https://filadd.com