Corso di Biochimica 1

Architettura delle cellule

Cenni sulla struttura della cellula procariotica ed eucariotica.
Differenze e similitudini tra cellule animali e vegetali.

cellule procariotiche cellule eucariotiche

Le immagini non sono sulla stessa scala https://meet.google.com/qam-mhzv-evo
Che cosa è un organismo vivente?
Attualmente non vi è consenso sulla definizione della vita.

Una definizione diffusa è che gli organismi sono sistemi aperti che mantengono
l'omeostasi, sono composti da cellule, hanno un ciclo vitale, mantengono il
metabolismo, possono crescere, adattarsi al loro ambiente, rispondere agli stimoli,
riprodursi ed evolversi.
Un virus: il batteriofago PHIX174
(pdb: 1cd3)

Infetta Escherichia coli

E’ vivo ?

• diametro: ca. 280 Å

• 420 catene polipeptidiche e oltre 500000 atomi
• capside icosaedrico
• DNA circolare a singolo filamento con 5386 nucleotidi

J Mol Biol (1999) 288: 595-608

Ci sono tre livelli di organizzazione della vita: un albero filogenetico illustra i tre domini
in cui sono suddivisi gli esseri viventi.

“The time will come I believe,

though I shall not live to see it,
when we shall have very fairly true
genealogical trees of each
great kingdom of nature. ”

Charles Darwin
Burkhardt, F. & Smith, S. (1990) The
Correspondence of Charles
Darwin 1856-1857 (Cambridge Univ. Press,
Cambridge, UK), Vol. 6. page 456

Le ramificazioni indicano la modalità di divergenza da un progenitore comune. Analogamente ai batteri, gli

archea sono procarioti ma hanno alcune peculiarità degli eucarioti. Proc. Natl. Acad. Sci. (1992) , 89, 2931
Le cellule sono le unità strutturali e funzionali di tutti gli organismi viventi

Le caratteristiche universali delle cellule viventi

Tutte le cellule hanno:

• un nucleo (eucarioti) o un nucleoide (procarioti)

• una membrana plasmatica e
• un citoplasma.
Le cellule sono le unità strutturali e funzionali di tutti gli organismi viventi
Il nucleo (eucarioti) o il nucleoide Membrana plasmatica:
(batteri, archaea) contiene il materiale doppio strato fosfolipidico
genetico: DNA e proteine associate. Il resistente e flessibile.
nucleo è racchiuso in una membrana Selettivamente permeabile a
molte sostanze. Include proteine
di membrana con funzioni di
trasporto, di trasduzione del
segnale, ed enzimatiche.

Citoplasma: il contenuto acquoso della cellula, le particelle

sospese e gli organelli, ottenuto dopo rottura della membrana

Supernatante: contiene il citosol, soluzione

concentrata di enzimi citosolici, RNA,
proteine, metaboliti, ioni inorganici.
Precipitato (o pellet): particelle, ribosomi, organelli,
granuli di stoccaggio, mitocondri, cloroplasti, lisosomi,
reticolo endoplasmatico.
centrifugazione Il citosol è definito come quella
porzione del citoplasma che rimane
nel supernatante dopo una rottura
gentile della membrana plasmatica e
centrifugazione dell'estratto risultante
a 150.000 x g per 1 ora.
Differenze principali fra le cellule eucariotiche e procariotiche
Differenze principali fra le cellule eucariotiche e procariotiche

Procariotiche Eucariotiche
Protozoi, Cromisti, Piante, Fungh
Organismi tipici Batteri, Archaea
i, Animali
~ 1-10 µm ma con estremi ~ 10-100 µm ma con estremi
Dimensioni tipiche di 0.1-700 µm estesi fino a dimensioni metriche
Vero nucleo con doppia
Tipo di nucleo nucleoide; non c'è un vero nucleo
membrana
In genere a forma di anello, a
molecole lineari (cromosomi)
DNA volte forma un cromosoma
con istoni
lineare
sintesi RNA all'interno del
entrambe nel citoplasma,
Sintesi RNA e proteica mancando il nucleo
nucleo, Sintesi
proteica nel citoplasma
Ribosomi 50S + 30S 60S + 40S
Cloroplasto no nelle alghe e nelle piante
cellule singole, colonie,
Organizzazione in genere cellule singole, colonie organismi multicellulari con
specializzazione delle cellule
Divisione cellulare scissione, gemmazione mitosi e meiosi
. Il DNA è organizzato in un singolo
cromosoma circolare, inoltre possono
contenere plasmidi, DNA circolare,
che codificano per enzimi catabolici,
per la resistenza ad antibiotici o legati a
meccanismi per lo scambio di materiale
genetico tra organismi
Sistema endomembranoso
nucleo
reticolo
endoplasmatico
rugoso

proteine sintetizzate
per l’esportazione

vescicole di
trasporto
reticolo
lisosoma endoplasmatico
liscio

lato
cis
nucleo
apparato del Golgi
lato
cis

granuli secretori
fagosoma
endosoma

endocitosi o fagocitosi esocitosi di prodotti di secrezione

(batteri, detriti,etc) (proteine, polisaccaridi, etc)
Differenze principali fra le cellule animali e vegetali
I mitocondri: la centrale energetica della cellula

• I mitocondri sono sede della respirazione

cellulare con dimensioni 1-2 µm.

• Possiedono due membrane una esterna

liscia e una interna ripiegata in creste;
contengono quindi due compartimenti uno
spazio intermembrana e una matrice. Gli
enzimi del metabolismo ossidativo sono
presenti sia sulla membrana interna che
nella matrice.

• Contengono DNA,RNA e ribosomi

necessari per la sintesi di alcune proteine
specifiche della membrana mitocondriale
interna
Come fa la materia vivente ad estrarre energia dall’ambiente circostante in
modo da rimanere vivente?
membrana esterna
membrana interna tilacoidi
ribosomi
DNA

DNA
cristae
matrice

ribosomi

membrana interna

membrana esterna
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Le catene di trasporto degli elettroni
citosol

spazio
intermembranario

fumarato
succinato

matrice

potenziale sintesi di ATP potenziale

chimico guidata dal elettrico Dy
DpH gradiente (interno
(interno elettrochimico negativo)
alcalino)
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 Gli organismi possono essere classificati in base alla loro fonte di energia (luce solare o
composto chimico ossidabile) e la loro fonte di carbonio per la sintesi di materiale cellulare.

Tutti gli organismi combustibile

ridotto

Fototrofi Chemotrofi
(energia alla ossidazione di combustibili chimici combustibile
fonte di (energia dalla luce solare) ossidato
energia Litotrofi Organotrofi
(combustibili (combustibili
inorganici) organici)

Autotrofi Eterotrofi
fonte di (carbonio composti
carbonio (carbonio da CO2)
organici)

Cianobatteri Batteri purpurei Batteri sulfurei e ad Maggior parte dei batteri

Piante vascolari e verdi idrogeno Tutti gli eucarioti non fototrofici
esempi