La biologia studia gli esseri viventi e il loro funzionamento.

Gli aspetti fondamentali che distinguono gli esseri

viventi sono:
 gli organismi possiedono l’informazione genetica contenuta nei geni, formati in tutti gli organismi
(tranne alcuni virus) da DNA;
 gli organismi regolano il loro metabolismo, sono in grado di cambiare materia ed energia con
l’ambiente (=sistema aperto). Le reazioni metaboliche sono regolate per mantenere l’omeostasi, la
stabilità delle condizioni interne dell’organismo;
 gli organismi rispondono agli stimoli che provengono dall'ambiente esterno;
 gli organismi crescono e si riproducono garantendo così la perpetuazione della specie a cui
appartengono;
 le popolazioni di viventi sono soggette a evoluzione, le caratteristiche delle popolazioni cambiano nel
tempo adattandosi all'ambiente;
 ogni organismo vivente ha una gerarchia strutturale, cioè è composto da diverse parti che cooperano
in modo armonico. Salendo di gerarchia si riscontrano un maggior numero di proprietà;

atomo →molecola →macromolecola→ cellula→ tessuto→ organo→ sistema/apparato→

organismo →popolazione →comunità →ecosistema →biosfera
 gli organismi sono formati da cellule.

Teoria cellulare
Il dogma centrale della biologia afferma che il flusso dell’informazione genetica è monodirezionale. Per
esprimere un’informazione genetica il DNA viene trascritto in RNA e poi tradotto in proteine.
Il termine “cellula” fu introdotto per la prima volta nel 1655 da Robert Hooke per descrivere piccole cavità
osservate all'interno di una sezione di sughero con un microscopio rudimentale di ingrandimento 30x. Da
allora la cellula è stata studiata in dettaglio e oggi è il protagonista di una teoria universale:
1. tutti gli organismi viventi sono dotati di cellule (unità elementari);
2. la cellula è l'unità di base della struttura degli organismi;
3. tutte le cellule derivano da cellule preesistenti.

Tale teoria venne formulata da Schleiden-Schwann-Virchowi intorno alla metà del XIX secolo.
Successivamente, nel 1830 Robert Brown osservò il nucleo. La tassonomia raggruppa gli esseri viventi in
domini, a loro volta comprendenti diversi regni di organismi unicellulari o pluricellulari, in grado di generare
energia necessaria per la sopravvivenza.

sei regni

NB. 1mm=1000m=1000000nm
1mm=103m=106nm
1m=103nm=10-3mm=10-6m
1nm=10-3m=10-6mm=10-9m
bacteria ed archaea dim. 0,1-5m
eukarya dim. 10-100m
(globuli rossi dim. 7m)
Microscopi
Il primo strumento in grado di amplificare la capacità risolutiva dell'occhio umano fu realizzato nel 1600. Il
1
potere risolutivo umano è circa mm, al di sotto di 0,1 mm sarà impossibile distinguere due punti. Per
10
avviare a questo problema nella storia sono stati utilizzate prima le lenti di ingrandimento e poi i microscopi:
- ottico→ dotato di due sistemi di lenti: l'obiettivo e l'oculare. Il preparato viene attraversato da un
fascio di luce (riflesso da uno specchio), l'obiettivo riflette un'immagine ingrandita verso l'oculare che
la ingrandisce a sua volta.
ingrandimento 1000-1500x
potere risolutivo fino a 0,2m
- elettronico→ esso si basa sull'utilizzo di un fascio di elettroni, i quali hanno una lunghezza d'onda più
breve di quella della luce (ciò permette di ottenere un maggior potere risolutivo). Esistono due tipi di
microscopio elettronico: il TEM (a trasmissione) e il SEM (a scansione).
ingrandimento fino a 100’000x
potere risolutivo fino a 0,2 nm
- a forza atomica→ ha un braccio mobile con un atomo sulla punta che scorre sulla superficie e traccia
il suo profilo atomico. La cellula emette e riceve delle onde armoniche→ sonobiologia

Cellule
Le cellule si dividono in eucariotiche (uni/pluricellulari) e procariotiche (unicellulari).

cellula eucariotica cellula procariotica

- nucleo con più molecole di DNA lineare;
-organuli per la divisione delle funzioni;
-ha una membrana esterna fluida;
-ha bisogno del citoscheletro (impalcatura protei.);
-può scambiare con l’esterno grandi quantità di
materia, grazie alla plasticità della membrana;
-non ha nucleo, ma ha il nucleoide (regione che
contiene una molecola di DNA circolare);
-non ha organelli;
-poche proteine;
-ha la parete cellulare per formare una struttura
rigida e per proteggere la cellula;

(esocitosi/endocitosi)

Evoluzione procarioti-eucarioti
La cellula procariote nasce circa 3,9 miliardi di anni fa, mentre 2,1 miliardi di anni fa nasce la cellula eucariote. I
procarioti all’inizio erano eterotrofi e anaerobi (si cibavano con il nutrimento ricavato dagli autotrofi e
non avevano bisogno di ossigeno).
Per permettere di cibarsi persero la parete cellulare e ciò aumentò le dimensioni della cellula. Di conseguenza,
si formarono introflessioni, da cui passarono sostanze esterne all’interno= endocitosi o fagocitosi→ si
formano così gli organelli. Il citoscheletro si forma poiché la cellula diventa talmente grande che deve
evolversi.
La degradazione interna forma il DNA e il nucleo (non si sa precisamente come).

I cianobatteri (2,4 . 109 anni fa) hanno evoluto la capacità di usare determinate molecole. Svolgevano una
reazione che liberava O2 (ossigeno molecolare) in atmosfera. Dunque, si accumula ossigeno
morivano

batteri aerobi batteri anaerobi vivono in zone senza O2

(non riescono a vivere con cellule
O2 in atmosfera)
Nasce il processo di endosimbiosi con un batterio aerobio e una cellula: il batterio entra nella cellula e forma
il mitocondrio (che infatti contiene DNA) che utilizzerà l'O2 per produrre ATP.
= origine cellula eucariotica

Evoluzione unicellulare-pluricellulare
Una cellula madre dà origine a tutte le cellule figlie vicine per il beneficio del nutrimento=
(vantaggio per la sopravvivenza):
1. (unione fisica) le cellule sono legate da ponti citoplasmatici;
2. comunicazione/cooperazione fra le cellule
3. specializzazione o differenziazione in vari ambiti
4. separazione interno-esterno

differenziamento= i geni sono uguali in tutte le cellule, ma sono

diversamente espressi in una cellula o in un'altra;

Chimica della vita

composizione della cellula: 70%-80% acqua
20%-30% composti organici
1% composti inorganici
In natura vi sono 92 elementi (sostanza non divisibile in altre componenti), 25 di questi sono essenziali per la
vita e si dividono in:
 elementi plastici primari (96%)→C, H, O, N
 elementi plastici secondari (3,5%)→P, S, Ca, Mg, Na, K, Cl
 elementi oligodinamici (0,01-0,001%)→Fe, Co, Zn, Mn, Mo, Cu, I, F
 elementi accidentali→ Pb

H 2o (molecola polare)
I legami sono di 104,5° poiché l’ossigeno è più elettronegativo rispetto all’idrogeno.
Due molecole d’acqua si attraggono per polarità —> quindi H si legherà a un’altra
molecola grazie ad un legame a idrogeno. L’acqua può fare massimo quattro legami a
idrogeno:
 1. stato liquido fa tre legami ad idrogeno (li forma e li disfa contemporaneamente);
2. stato solido→ ha sempre quattro legami stabili;
3. stato gassoso→ fornisce energia, si staccano i legami.

Le molecole d’acqua hanno una grande coesione tra di loro, il legame a idrogeno crea una grande
stabilità anche con altri elementi.
Adesione.
L’acqua ha un alto calore di evaporazione, cioè ha la necessità di tanto calore per passare da liquido a
gas e quindi di rompere i legami. Inoltre, ha la capacità di stabilizzare la temperatura —> le cellule
ricevono calore e riescono a mantenere una temperatura adatta.
Acqua come solvente.

Carbonio (forma i composti organici)

Il carbonio può formare massimo quattro legami covalenti. Concatenandosi ad altre molecole di
carbonio forma le macromolecole: carboidrati, lipidi, proteine, acidi nucleici.
Svolgono reazioni di polimerizzazione: demolizione per idrolisi (+H2O) e sintesi per condensazione
(-H2O). Le molecole organiche hanno la capacità di autoassemblaggio, formando organelli e altre
strutture che costituiscono la cellula.

Le PROTEINE (polimero di aminoacidi) svolgono una funzione strutturale, di deposito, di movimento,

di trasporto, di segnale, di difesa e di regolazione. La proteina presenta quattro strutture:
- primaria→ è una sequenza di aminoacidi legati da un legame peptidico;
- secondaria→ è definita dalla disposizione
spaziale della catena polipeptidica con legami a
idrogeno tra >CO e -HN;
- terziaria→ è definita dalla forma che la proteina
assume dopo essere stata stabilizzata da legami
a idrogeno, di solfuro (S-S molto forti) e altre
interazioni fra aminoacidi;
- quaternaria→ è definita dall’associazione di più catene polipeptidiche, come ad esempio
l'emoglobina. Essa è formata da due subunità α e due subunità β legati a quattro gruppi eme
che contengono gli ioni Fe2+.
proprietà
La proteina si denatura (rottura di legami e cambiamento della struttura che implica la perdita della
sua funzione) con alta temperatura, pH e concentrazione salina. Può rinaturarsi se non è
completamente danneggiata. Ha la capacità di auto assemblarsi, le proteine Chaperon molecolari in
condizioni di stress aiutano la proteina ad avvolgersi. Inoltre, la proteina risente dell'ambiente e può
andare incontro a modificazione post-traduzionale.

Gli ACIDI NUCLEICI sono il DNA e l’RNA. Nel 1952 James Watson e Francis Crick iniziarono lo studio
della struttura tridimensionale del DNA.

- DNA→è un acido nucleico (acido desossiribonucleico) costituito da lunghe catene di

nucleotidi. Ogni nucleotide formato da una base azotata, uno zucchero e un gruppo fosfato

L’adenina e la guanina sono purine formate da un doppio anello,

mentre la timina e la citosina sono pirimidine formate da un anello
singolo. Ogni filamento di DNA (costituito da nucleotidi) è unito da
un legame covalente, legame fosfodiesterico. Il legame che si forma
avviene fra il carbonio in posizione 5’ di uno zucchero e il gruppo
fosfato legato al carbonio 3’.
1. Il gruppo fosfato determina il carattere acido dei polimeri poiché
è di carica negativa;
2. lo zucchero desossiribosio ha cinque atomi di carbonio;
3. le basi azotate sono formate da un anello costituito da atomi di azoto e carbonio, cui sono
uniti i vari gruppi funzionali. Tra lo zucchero e la base si forma un legame
glicosidico.
- RNA→ l’acido ribonucleico è costituito dallo zucchero ribosio. È formato da un
singolo filamento e ha la funzione di intermediario tra il DNA e la costruzione
di proteine specifiche. In posizione 2’ ha un gruppo OH in più del DNA e
presenta una nuova base azotata l’uracile, che ha la struttura simile alla timina.

L’ATP (adenosintrifosfato) è formato dal nucleotide adenina legato a tre gruppi fosfato. Il legame fra
il primo e il secondo fosfato e quello fra il secondo e il terzo è detto legame ad alta energia, poiché la
loro rottura genera grandi quantità di energia. Se viene tolto un gruppo fosfato diventa
adenindifosfato (ADP), mentre se vengono tolti due gruppi fosfato diventa adeninmonofosfato.
Cellula eucariote
La cellula è formata dal nucleo, dalla membrana plasmatica, dagli organuli e dal citoscheletro. Gli
organuli sono immersi in un ambiente acquoso, chiamato citosol.

- R.E. (reticolo endoplasmatico) = può essere liscio o ruvido, vengono chiamati

rispettivamente reticolo endoplasmatico liscio (REL) e reticolo endoplasmatico ruvido (RER).
Il RER è così chiamato poiché sulla sua superficie vi sono gradi quantità di ribosomi. Inoltre,
esso comunica con l’apparato di Golgi attraverso vescicole;
- apparato di Golgi = è posizionato tra il reticolo e la membrana. Questo apparato ha più
funzioni, una delle più importanti è glicosilare il reticolo, ovvero aggiungere zucchero. Inoltre,
produce proteine + grassi che vengono successivamente smistati.
- lisosomi = sono organuli che digeriscono le sostanze che devono essere eliminate.
- mitocondrio = è la sede della sintesi dell’ATP, ed è composta da molecole di DNA
circolare;
- perossisoma = rende innocue delle sostanze pericolose come l’H2O2 (perossido di
idrogeno).

1. CITOPLASMA→ è la porzione interna della cellula che non è occupata dal nucleo. È formato
dal citosol + organelli. Il citosol è un liquido composto per il 70%-90% da acqua, ma anche
sostanze minerali e ioni Na+, K+ e Ca2+.

2. MEMBRANA CELLULARE→ è un sottile involucro di circa 7-9 nm che avvolge la cellula.

funzioni
-di protezione, poiché protegge da agenti esterni;
-trasporto poiché regola gli scambi di ioni e
sostanze fra l'interno ed esterno;
-interazione fra cellule-comunicazione;
-barriera di permeabilità che definisce la struttura
fisica;
-recettori per segnali per il riconoscimento.
È costituita principalmente da fosfolipidi e proteine, ma contiene anche colesterolo e
glicolipidi. (proteine 50%-70%, carboidrati 1%-10%, componente fluida e lipidi 30%-50%)
Nel 1972 venne idealizzato il modello a mosaico fluido da S.J. Singer e G. Nicolson.
I lipidi presenti sulla membrana sono i FOSFOLIPIDI, COLESTEROLO, GLICOLIPIDI.
a. fosfolipidi= sono molecole che derivano dal glicerolo e una
molecola con una regione polare e una apolare (anfipatica).
Il fosfolipide ha una testa polare (composto idrofilo) e una coda
apolare di acidi grassi formati da 12-20 aminoacidi (composto
idrofobo).
Da una parte all'altra della membrana vi sono due tipi diversi di
fosfolipidi: all'esterno vi è la fosfatidilserina fosfatitiletanollamina e
all’interno vi è la fosfatidilcolina sfingomielina.
Questa asimmetria è molto importante poiché favorisce gli scambi
tra sostanze e per una maggiore flessione e rotazione della membrana.
 La fluidità della membrana dipende dal tipo di lipidi da cui è composta. Vi è una
temperatura di transizione fra lo stato più gelatinoso o fluido. Nelle membrane gli acidi
grassi dei fosfolipidi variano:
-la lunghezza della catena (catena lunga=gelatinoso e temperatura di transizione minore,
mentre una catena corta=fluido);
-saturo o insaturo (tutti i legami semplici rendono la membrana più gelatinosa, mentre i
doppi legami la rendono più fluida).
b. colesterolo (steroidi)= il colesterolo impedisce l’eccessiva fluidità, quindi regola la
fluidità. Se T<Tm aumenta la fluidità, se T>Tm diminuisce la fluidità.
Gli organismi eterotermi possono modificare la lunghezza degli acidi grassi aggiungendo
legami doppi e trasformandolo in grasso insaturo, oppure aggiungendo colesterolo.
c. proteine= costituiscono il 50% del peso della cellula, sulla membrana si possono
trovare:
-proteine integrali: entrano nel doppio strato fosfolipidico e si dividono in proteine
transmembrana che attraversano la membrana e le proteine monotopiche che si trovano
solo da un lato della membrana;
-proteine periferiche: si aggrappano alle teste dei fosfolipidi formando un legame a
idrogeno (debole);
-proteine ancorate ai lipidi: sono appoggiate esternamente alla membrana e formano dei
legami covalenti (forti) con i lipidi.

L’asimmetria delle proteine conferisce caratteristiche diverse: mobilità limitata dal peso, tra cellule
vi sono giunzioni strette che impediscono il passaggio di fluidi tra una cellula e l’altra e di
conseguenza bloccano anche la mobilità della cellula stessa. Inoltre, le proteine sono fisse, alcune
servono per l’ancoraggio del citoscheletro.

d. glicoproteine e glicolipidi= gli zuccheri contenute in queste sostanze sono

posizionati solo all’esterno della cellula. Possono andare incontro a glicosilazione (:
aggiunta di uno zucchero) nel RER e nel Golgi. Gli zuccheri formano legami covalenti con i
lipidi o con le proteine che si legano o all’ossigeno o all’azoto.

Permeabilità della membrana

Le sostanze possono entrare e uscire dalla cellula in modi diversi. Il trasporto passivo avviene
secondo gradiente di concentrazione, quando cioè una sostanza si sposta da una zona in cui la sua
concentrazione è maggiore a un'altra in cui la concentrazione minore. Questo processo è spontaneo
e non richiede energia.

Il trasporto attivo avviene contro gradiente di concentrazione, quando c'è una sostanza si sposta ad
una zona in cui la sua concentrazione è minore a un'altra in cui la concentrazione è maggiore.
Richiede energia, che viene fornita dall' idrolisi dell'ATP.

La membrana è semipermeabile, ciò significa che può essere attraversata liberamente solo da
piccole molecole non polari (come O2 e CO2), oppure da piccole molecole polari neutre come l'acqua
e urea, mentre non può essere attraversata da grosse molecole polari e dagli ioni. Per regolare
l'entrata e l'uscita delle molecole di dimensioni più grandi di tutti gli ioni sono presenti specifici
sistemi di trasporto.
-La diffusione semplice è il movimento delle particelle da una zona ad alta concentrazione a una
minore concentrazione, avviene secondo gradiente di concentrazione ed è un processo di tipo
passivo.

-L'osmosi è un caso particolare di diffusione e consente nel passaggio di acqua attraverso una
membrana semipermeabile che separa due soluzioni a diversa concentrazione: l'acqua passa
spontaneamente dalla soluzione più diluita (ipotonica) a quella più concentrata (ipertonica).

Le sostanze come gli ioni e gli zuccheri, che non attraversano la membrana per diffusione semplice,
possono essere trasportate mediante proteine di trasporto (transmembrana) che agiscono in modo
specifico per ogni singola sostanza da trasportare. Queste proteine operano secondo due
meccanismi fondamentali: la diffusione facilitata e il trasporto attivo.

Le PROTEINE DI TRASPORTO si dividono in proteine carrier (o trasportatori) e proteine canale. Le

proteine carrier possiedono una regione che riconosce la molecola da trasportare per
complementarità di forma, legano la sostanza e cambiano la conformazione rilasciandola dalla parte
opposta della membrana. Si dividono in uniporto, simporto e antiporto.

Le proteine canale sono canali ionici per il trasporto di ioni. Sono anch’essi selettivi per la molecola.
La loro apertura avviene in seguito a segnali elettrici o legandosi con una molecola specifica. Le
proteine possono essere anche porine, meno selettive. Sono canali per sostanze grandi che non siano
ioni. Si trovano prevalentemente nei batteri e grazie ad essi entrano gli antibiotici.

-La diffusione facilitata consiste nel trasporto di una sostanza secondo gradiente di concentrazione
mediante una proteina di trasporto. È un processo passivo e non richiede energia.

-Nel trasporto attivo le sostanze sono trasportate attraverso proteine di membrana, dette pompe,
che le spostano contro gradiente di concentrazione utilizzando l'energia ottenuta dal l'idrolisi
dell'ATP. Si divide in trasporto attivo DIRETTO e INDIRETTO.

Il trasporto attivo diretto consiste nel portare una molecola contro gradiente con l’aiuto di una
proteina carrier. Si forma un’asimmetria di carica e quindi un potenziale di membrana (-70mV). Un
esempio di trasporto attivo diretto è la pompa sodio-potassio.
Lo ione sodio (Na+) è circa 10 volte più concentrato all'esterno della cellula, mentre lo ione potassio
(K+) è circa 30 volte più concentrato all'interno. questo gradiente di concentrazione prodotto da una
proteina intrinseca, la pompa sodio-potassio ATPasi, che trasporta i due ioni contro gradiente: tre
ioni Na+ all'esterno e due ioni K+ all'interno, utilizzando l'energia prodotta dall' idrolisi dell'ATP. I
gradienti di Na+ e K+ sono i principali responsabili del potenziale di membrana: controllano il volume
cellulare, conferiscono le cellule nervose e muscolari le loro proprietà di eccitabilità e sono coinvolti
nel trasporto di alcune sostanze nutritive come zuccheri, aminoacidi...

Il trasporto attivo indiretto consiste nel trasporto di due soluti

contro gradiente. A sinistra troviamo un trasporto attivo diretto
che genera un gradiente di un’altra sostanza (H+). A destra
abbiamo un trasporto accoppiato: vanno secondo gradiente H+ e
contro gradiente S.

3. NUCLEO→ è l’organulo caratteristico della cellula eucariotica. È ben

visibile al microscopio ottico (5µm). Può essere di forma sferica,
ellittica o lobulato (tipico dei globuli bianchi).
Di solito in una cellula si ha un nucleo, ma esistono delle eccezioni:
-globuli rossi (eritrociti) non hanno il nucleo poiché sono pieni di
emoglobina per il trasporto di O2
-cellule polinucleate (fibre muscolari). Quando le cellule singole che
si uniscono e hanno più di un nucleo si dice = sincizio.
Il nucleo può trovarsi centralmente (come nei neuroni) o spostato (come negli adipociti).
zone del nucleo
a. involucro nucleare (esterno)→ costituito da due membrane (4 strati fosfolipidici), fra
le due membrane vi è uno spazio detto perinucleare. Sulla membrana vi sono punti di
interruzione = pori nucleari. Il nucleo è in continuità di membrana con il RER, ma ognuno
mantiene la sua funzione. dimensione 10nm-50nm. I pori nucleari sono adibiti per il trasporto
fra esterno-interno e ha un canale di range di apertura di 9-40nm.
permette la diffusione di trasporto passivo trasporto attivo per il
uefhushfuhuofhuoerherhuorhfuhrfudhsjsfjsdflsdjfijsfjiafkjkjkpassaggio di molecole più grandi
come RNA e proteine (nella traduzione)

I pori sono fondamentali per l’espressione genica

poiché permettono l’uscita di RNA e l’entrata di
proteine. Fra un poro e l’altro vi sono filamenti
proteici di lamina nucleare che fanno parte del
citoscheletro (per far si che il nucleo non collassi).
 b. nucleoplasma e matrice nucleare (interno)→ sostanza morfa con base acquosa +
cromatina che contiene il DNA;
c. nucleolo (centro)→ serve a sintetizzare l’RNA ribosomiale (rRNA) usato per formare un
ribosoma (non porta informazione genetica). L’RNA si forma per copiatura del DNA.
ribosoma= struttura cellulare (non organulo) costituito da RNA e proteine. Viene
assemblato nel nucleolo→ le proteine entrano nel nucleolo dai pori ed esso forma l’rRNA per
assemblare il ribosoma. L’rRNA promuove la sintesi proteica: azione catalitica di possedere
informazioni.

Organizzazione del DNA

La struttura tridimensionale del DNA venne scoperta nel 1953 da James Watson e Francis Crick. Il
DNA è un acido nucleico (acido desossiribonucleico) costituito da lunghe catene di nucleotidi. Ogni
nucleotide formato da una base azotata, uno zucchero e un gruppo fosfato. (vedi pag. 5)

→ rapporto tra le due dimensioni elevatissimo = alta possibilità di

jsijirottura; per questo il DNA non può rimanere sciolto, ma deve
hfiiorganizzarsi.
Il DNA ha una struttura a doppia elica e i due filamenti sono
antiparalleli con direzione 5’-3’. Le basi si trovono al centro, mentre
all’esterno vi è lo zucchero e i fosfati alternati. I due filamenti si
legano grazie alle basi azotate secondo lo schema (per avere un
diametro costante):
A=T due legami idrogeno
G≡C tre legami idrogeno
La molecola del DNA ha moltissimi legami a idrogeno, quindi il
filamento è estremamente stabile, perché ogni singolo legame è
debole (quindi facili da rompere per separare singolarmente i due
filamenti), ma la moltitudine dei legami lo rende stabile.

Le basi azotate sono quelle che portano l’informazione, poiché sono variabili.
La forma di organizzazione del DNA durante il normale svolgimento delle sue funzioni è
comunemente chiamata cromatina. Una cellula per dividersi si deve organizzare diversamente per
trasmettere alle cellule figlie la propria informazione = si organizza in cromosomi (struttura adatta al
processo di divisione cellulare). Il DNA si organizza all’interno del nucleo in cromatina o cromosoma
in base alle funzioni che deve svolgere la cellula. I cromosomi sono delle strutture estremamente
compatte del DNA che consente alle cellule figlie di ricevere l’informazione genetica senza il pericolo
che il DNA venga danneggiato. Il DNA deve essere sempre in forma organizzata e compatta, ma
esistono gradi di compattazione diversi che vanno dal DNA al cromosoma.
Il DNA come prima forma di organizzazione si deve avvolgere ad un nucleo proteico (proteine
basiche, cariche positivamente) = istoni. Gli istoni si organizzano in ottameri, cioè otto istoni → due
coppie di ciascuna proteina H2A, H2B, H3, H4. Essendo proteine cariche positivamente ed
essendo il DNA carico negativamente, il legame che si forma è ionico.
Questo ottamero di istoni con il DNA che fa due giri su di esso, costituisce l’unità strutturale della
cromatina = nucleosoma (otto istoni e 146 nucleotidi).
Tra un nucleosoma e l’altro vi è un istone H1 che stabilizza il DNAlinker (il DNA non legato agli
istoni).
primo grado di compattazione→ NUCLEOSOMA (di 10nm)
secondo grado di compattazione→ EUCROMATINA (di 30nm)
terzo grado di compattazione→ ETEROCROMATINA (di 700nm)
quarto grado di compattazione→ CROMOSOMI (di 1400nm)

La cromatina ha la funzione di mantenere il DNA compatto in modo che rimanga dentro al nucleo, i
cromosomi hanno la funzione di spartire il DNA quando esso si duplica.
Il DNA è leggibile solo sotto forma di nucleosomi ed eucromatina. Nello stato di eterocromatina e di
cromosoma il DNA non si può esprimere (non funziona), poiché il DNA è molto compatto e le basi
non si riescono a leggere; dunque, in questo stato l’eterocromatina costitutiva ha una funzione
strutturale. L’eterocromatina facoltativa ha la possibilità di diventare eucromatina ed essere
espressa.

Informazione genetica
Il DNA è una molecola informazionale, cioè contiene l’informazione genetica e quello che differisce
da una molecola all’altra è la sequenza di basi azotate. Il concetto di informazione si basa sulla
riduzione dell’incertezza, maggiore è l’incertezza e maggiore è l’informazione. La struttura del DNA
rende conto delle funzioni:
- contenere l’informazione
- trasmettere l’informazione
- esprimere l’informazione
- cambiare l’informazione (mutazione = sbaglio)

contenere l’informazione
L’informazione è contenuta dalla successione di basi, più precisamente nel filamento singolo del
DNA. Se conosciamo un filamento siamo in grado di conoscere anche l’altro per complementarità
delle basi.
 trasmettere l’informazione
Il DNA deve essere contenuto in tutte le cellule per trasmettere alle cellule figlie l’informazione
genetica. Quando la cellula si divide per mitosi per dare origine a due cellule figlie, il DNA deve
duplicarsi.
Una mutazione è un errore o un cambiamento nel DNA. Nel momento in cui trasmetto
l’informazione alle cellule figlie e duplico un’informazione sbagliata, con una mutazione, sto
trasmettendo una mutazione. Invece, se una cellula ha un errore e non si duplica, quell’errore non ha
significato. Una mutazione si verifica solo nel momento in cui la trasmetto.
Per la duplicazione è necessario avere un doppio filamento (per controllo, è un sistema di sicurezza
per una trasmissione fedele dell’informazione).

Duplicazione del DNA

La duplicazione de DNA avviene secondo un modello semiconservativo, ovvero si prende la doppia
elica, si apre e ognuno dei due filamenti farà da stampo per i filamenti successivi (chiamati filamenti
nuovi).

Il filamento madre si separa e ognuno dei filamenti figli fa da stampo per un nuovo filamento, in
modo che si ottengano due molecole identiche. La direzione aggiunta di nucleotidi (quindi la
direzione di allungamento del DNA) è sempre da 5’ a 3’.

Per aggiungere un nucleotide alla catena di DNA e quindi formare un legame fosfodiesterico
(legame covalente) è necessaria l’energia. Il nucleotide per potersi attaccare alla catena
polinucleotidica necessita di tre gruppi fosfato, poiché perdendone due libera energia che utilizzerà
per la formazione del legame. Ricaverà gli altri due gruppi fosfati mancanti da due molecole di ATP.

L’enzima che aggiunge il nucleotide alla catena di allungamento si chiama DNA polimerasi, sfrutta
l’energia per catalizzare il legame fosfodiesterico. Il filamento stampo riferisce alla polimerasi a quale
nucleotide attaccarsi attraverso le basi. Solamente il nucleotide con la base complementare, forma
un legame a idrogeno per permettere alla DNA polimerasi di legarsi.

→ma la DNA polimerasi come fa a sapere quale nucleotide aggiungere? I quattro tipi di nucleotidi
sono già presenti nel nucleo e muovendosi sbattono contro il DNA, ma solamente quello che ha la
base complementare al nucleotide che fa da stampo forma il legame a idrogeno.

Il processo ha inizio nei punti di origine (sono sparsi per tutta la lunghezza del filamento), detti ori,
da qui si formano delle bolle di duplicazione. All’estremità di ogni bolla vi è una forca di duplicazione.
Le zone dove vi sono più punti di origine sono ricche di AT e non GC, poiché il legame essendo
doppio e non triplo è più facile da rompere per aprire la doppia elica.

Sui punti di origine si vanno a posizionare tutti gli enzimi necessari per duplicare il DNA. Vi sono
delle proteine (MCM) che segnalano il punto di replicazione e quando quel punto è stato o meno
duplicato. Il DNA per duplicarsi impiega mediamente 6h-8h ed è il tempo più breve possibile per
evitare di formare errori.
 1. Il primo enzima che partecipa è l’elicasi che svolge e apre la doppia elica dalla forca,
rompendo i legami a idrogeno. Per evitare che i due filamenti si ricongiungano intervengono
delle proteine destabilizzatrici (che si legano ai singoli filamenti).
2. La topoisomerasi taglia i filamenti di DNA ed impedisce che i filamenti si riavvolgano, quindi
rimuove la torsione. I nuovi filamenti che si formano devono essere complementari rispetto ai
vecchi-stampo, antiparalleli e direzione di allungamento 5’-3’.
3. Prima di sintetizzare il DNA, grazie alla DNA polimerasi (può solo aggiungere nucleotidi ad
un filamento preesistente), interviene un innesco, primer, che serve alla DNA polimerasi per
agganciarsi e allungare la catena. Questo innesco è costituito da RNA costituito da 5-10
ribonucleotidi ed è sintetizzato dalla primasi partendo dall’estremo 3’.
4. La duplicazione del filamento che ha l’estremità 3’ libera
procede senza interruzioni partendo da un solo primer =
filamento veloce, mentre il filamento antiparallelo è detto
filamento lento e procede a ritroso.

La DNA polimerasi aggiunge nucleotidi solo in direzione 5’-

3’nel nuovo filamento di DNA al primer.

L’estremità 3’ rimane non duplicata quindi la primasi sintetizza

un primer, la DNA polimerasi aggiunge nucleotidi formando un
frammento di Okazaki (nome del ricercatore giapponese che li
trovò e sono formati da circa 100-2000 nucleotidi). Quando raggiunge il primer precedente, la
DNA polimerasi si stacca e quando è pronto il primer del pezzo
precedente 2, aggiunge nucleotidi per arrivare a 1.
5. Infine, la DNA ligasi unisce i filamenti 1, 2; quindi catalizza la formazione di legami
fosfodiesterici fra i vari frammenti. Il filamento lento viene completato.

Quando il DNA ha finito la duplicazione, l’RNA del primer viene espulso→ tranne l’ultimo pezzetto
dell’estremità 3’, poiché non vi è l’ancoraggio per la DNA polimerasi e quindi non può essere
sostituito. Questo pezzo andrà perso e ciò implica che i filamenti di DNA si accorceranno ad ogni
duplicazione.

Ma l’informazione genetica non viene compromessa, poiché all’estremità 3’ vi è una molecola detta
telomero, è una breve sequenza ripetuta molte volte che non contiene informazione genetica.

Ad ogni processo replicativo il filamento si accorcia e perde telomeri, una volta persi tutti i telomeri
si inizia a perdere informazione genetica e si va incontro alla morte cellulare= invecchiamento.

Non tutte le cellule si accorciano allo stesso modo, le cellule staminali e germinali (anche cellule
tumorali) contengono un enzima, telomerasi, che contiene un frammento di RNA con una sequenza
complementare a TTAGGG e allunga il filamento di DNA stampo. L’RNA dell’enzima si attacca al
telomero e spostandosi gli fa da stampo, così che il telomero accresce. L’obiettivo dello stampo che
procede —> allungare il filamento di DNA con le basi che non contengono informazione, in modo
tale che si possa inserire un primer, così che la DNA polimerasi riesca ad agganciarsi al primer e
allungare il filamento. A questo punto si crea un filamento più lungo che devo eliminare (attraverso
la telomerasi). Ciò permette di ripristinare la lunghezza dei telomeri grazie alla transcriptasi inversa
(enzima che riesce a riformare il DNA partendo dall’RNA).
L’accuratezza del processo di duplicazione garantisce che tutte le cellule siano uguali, ma vi è la
possibilità che ci siano degli errori. Possiamo dividere gli errori in:
- errori causati dalla DNA polimerasi→ errori fisiologici
La DNA polimerasi durante il processo di duplicazione controlla che ogni nucleotide sia stato
aggiunto correttamente (se vi è un errore nella catena percepisce che si è formata una
1
deformazione del filamento) e ogni 109 nucleotidi trova un errore, fa un passo indietro in
direzione 3’-5’ e rimuove quelli appaiati in modo errato. Dunque, la DNA polimerasi ha anche
la capacità di correggere gli errori tornando indietro, per questo motivo si dice che la DNA
polimerasi ha un’attività esonucleasica in direzione 3’-5’, cioè è capace di tagliare il nucleotide
più esterno.
- errori accidentali
Vi è un sistema di riparazione fatto da una cinquantina di proteine, tra cui enzimi, con la
funzione di scorrere lungo la catena del DNA e percepire le modificazioni di forma=
riparazione per excissione. In questo processo viene tagliato dall’interno il filamento
danneggiato dalla endonucleasi e poi sostituito dalla DNA polimerasi e la ligasi ricostruisce il
filamento corretto.
La cellula è capace di correggere gli errori, ma questi vanno corretti prima che la cellula si duplichi e
che passi l’informazione alle cellule figlie.

→ma la cellula come fa a sapere qual è il filamento giusto rispetto a quello sbagliato? L’unico modo
è quello che si basa sul riconoscere quello che è il filamento più recente. Il filamento vecchio ha una
marcatura, sono presenti gruppi chimici che lo identificano. Ciò esclude di correggere un errore sul
filamento vecchio.

Espressione genica
Il genotipo è l'informazione ereditaria contenuta nel DNA, mentre il fenotipo corrisponde alle
caratteristiche fisiche che si manifestano. Il collegamento fra genotipo e fenotipo è rappresentato
dalle proteine.
Quando la cellula si differenzia utilizza parzialmente l’informazione (spegne dei geni e ne lascia attivi
altri).

DNA→RNA→proteine
Il dogma della biologia afferma che vi sono due fasi nel processo di
passaggio dell'informazione: la trascrizione, ovvero il trasferimento
dell'informazione genetica da DNA a RNA; e la traduzione, cioè l'utilizzo
dell'informazione dell’RNA per costruire una proteina.

Il linguaggio è diverso nelle fasi: il DNA e l'RNA sono polimeri costituiti da monomeri di nucleotidi,
dunque, la trascrizione non implica un cambiamento di linguaggio. Nella traduzione vi è una
conversione dal linguaggio degli acidi nucleici nel linguaggio dei polipeptidi, polimeri costituiti da
monomeri di 20 aminoacidi. L’RNA dovrà fare da messaggero per trasportare l'informazione
genetica del DNA all’esterno del nucleo (mRNA). Devono essere codificati 20 aminoacidi con
quattro basi azotate, quindi mi serviranno 64 combinazioni→43
Come mai l’informazione genetica nel momento in cui deve essere utilizzata ci dà la codifica di
proteine (e non ad altre macromolecole)?
Le proteine hanno delle caratteristiche che da sole sono capaci di portare ad una struttura vivente.
Sono capaci di costituire i filamenti, i tessuti e i componenti anche quando sono sotto forma di
enzimi. Inoltre, sono capaci di essere segnali per definire il piano costruttivo di un vivente.

Gene
Vennero scoperti all’inizio del ‘900. La parola viene coniata per indicare l’unità ereditaria mendeliana
→l’unità di trasmissione di un carattere; era un concetto scoperto da Mendel, perché studiava la
trasmissione dei geni, senza sapere cosa fossero. Il gene è una regione di DNA che codifica (da
l’informazione) per una proteina = definizione secondo il dogma centrale della biologia. Per essere
più precisi, quando si dice che trascrivo vuol dire che copio un pezzo di DNA in RNA. Ma esistono
diversi tipi di RNA:

-mRNA (10%)

-rRNA (70%-80%)

-tRNA (10%-20%)

Quindi dire che il geno è un tratto di DNA che codifica per una proteina, è come limitare la
definizione al 10% dei geni. Dunque, il gene è una regione di DNA che viene trascritta= unità di
trascrizione. Il gene esiste solo nel momento in cui viene trascritto. Le cellule hanno geni espressi
diversamente e si scoprono continuamente dei geni nuovi, perché si trovano condizioni cellulari
sempre nuove.

Trascrizione
La trascrizione è la sintesi di DNA in RNA. Il DNA ha due filamenti, per creare un filamento stampo
userò il 3’-5’ poiché lo stampo è complementare e antiparallelo.

L’RNA è complementare al filamento 3’-5’ che

gli fa da stampo e ha la stessa sequenza
informazionale del 5’-3’ del DNA. Dunque, il
filamento 5’-3’, ha una sequenza che porta
l’informazione uguale all’RNA viene definito
filamento senso. Mentre, il filamento 3’-5’ fa da
stampo è detto filamento antisenso. (servono
due filamenti per una maggior sicurezza)

0. fase iniziale. Il primo enzima che partecipa è l’elicasi che svolge e apre la doppia elica dalla
forca, rompendo i legami a idrogeno. Per evitare che i due filamenti si ricongiungano
intervengono delle proteine destabilizzatrici (che si legano ai singoli filamenti).
La topoisomerasi taglia i filamenti di DNA ed impedisce che i filamenti si riavvolgano, quindi
rimuove la torsione. (procedimento uguale alla duplicazione)
L’inizio della trascrizione è determinato dall’RNA polimerasi che indica da dove partire (= è
l’enzima che sintetizza l’RNA a partire dal DNA).
L’RNA polimerasi ha una lieve capacità di correggere gli errori, ma non è importante che
abbia una capacità così sviluppata, perché si forma un filamento di RNA che andrà eliminato.
L’RNA polimerasi catalizza l’aggiunta dei nucleotidi a seconda della complementarità. Il primo
nucleotide che viene aggiunto ha 3 fosfati perché non ha avuto bisogno di perdere 2 fosfati, in
più non ha bisogno del primer (poiché quest’ultimo è fatto di RNA).
 1. prima fase. Prima del gene vi sono delle sequenze regolatrici che indicano qual è l’inizio di
quel gene e tra queste vi è il promotore: è la sequenza che si trova prima del gene. Al
promotore si vanno a legare delle proteine chiamate fattori di trascrizione che entrano nei
solchi del DNA per capire quali basi ci sono all’interno.
Questo insieme di proteine assume una conformazione tale per cui si può legare anche l’RNA
polimerasi: senza tutti questi fattori, l’RNA polimerasi non si lega. Dopo essersi legato si
attiva tutto il complesso.
Il promotore si posiziona sul filamento senso (3’-5’), mentre l’RNA polimerasi su quello
antisenso (5’-3’).
Dunque, nella prima fase, l’RNA polimerasi si unisce al promotore sul DNA e inizia la sintesi
dell’RNA. Su un filamento stampo posiziona dei nucleotidi di RNA per formare l’mRNA.

(Nel gene ci sono delle sequenze regolatrici anche molto distanti dall’inizio della trascrizione.
Il gene non ha inizio e fine definiti, ma c’è un inizio e una fine del tratto che viene trascritto.)

L’mRNA che si forma grazie all’RNA polimerasi si chiama trascritto primario di mRNA.
→questo trascritto primario è così chiamato, poiché non è ancora pronto per uscire dal
nucleo, deve subire un processo di maturazione sempre all’interno del nucleo.
La maturazione coinvolge tre processi: CAP in 5’, POLI-A in 3’, splicing.

° CAP in 5’
Al primo nucleotide viene aggiunto un nucleotide modificato la settemetilguanosina in 5’. Ci sono
tre gruppi fosfato, a questi è stato aggiunto il nucleotide modificato.
→settemetilguanosina poiché è stato aggiunto un gruppo metile e guanosina poiché c’è una guanina.
Le funzioni principali del CAP sono di riconoscimento dell’estremità 5’, protezione e per far attaccare
il ribosoma in modo corretto nella traduzione.

° POLI-A in 3’
Sull’estremità 3’ viene aggiunta una coda di poli-A, cioè dei nucleotidi con l’adenina. Questi
nucleotidi possono essere da 50 a 250. Le funzioni sono analoghe a quelle del CAP: riconoscimento
dell’estremità 3’ e protezione dell’RNA. Inoltre, ha un ruolo molto importante nella traduzione (nella
sintesi delle proteine). Quando l’mRNA è presente viene letto dalle proteine e viene sintetizzato nei
ribosomi. Viene degradato a partire dal 3’, se la coda di poli-A è più lunga, l’mRNA “vive di più”. I
poli-A decide quanto vive questa proteina.

° splicing
Lo splicing è un fenomeno che avviene esclusivamente negli organismi superiori = ci fa capire che
questo tipo di maturazione caratterizza l’evoluzione genetica degli eucarioti.
È un rimaneggiamento di tutto il gene. Il trascritto primario contiene delle regioni che contengono le
informazioni degli aminoacidi, ma ci sono delle regioni che non contengono informazione e che
devono esser rimosse = queste regioni sono chiamate INTRONI (non portano informazione per
aminoacidi). Quelle che contengono l’informazione vengono chiamati ESONI.
Lo splicing è un meccanismo per cui nel trascritto primario vengono rimosse tutte le regioni che non
contengono l’informazione per creare la proteina e cucire insieme tutti gli esoni, grazie all’enzima
RNA ligasi.

La rimozione degli introni e la cucitura degli esoni è compiuta da un complesso di proteine associate
a piccoli RNA che riconosce le parti da tagliare, chiamato spliceosoma. È sconosciuto come lo
spliceosoma sia in grado di riconoscere le parti da eliminare, ma si è trovato con certezza che gli
introni cominciano tutti con GU e concludo con AG.

Inoltre, gli introni sono molto più grandi degli esoni: la materia che elimino è molto più grande
rispetto a quella che rimane all’interno. Le parti che vengono eliminate (introni) dopo l’eliminazione
vengono riciclati.

Il locus genico è il luogo in cui si trova un gene, l’informazione genetica. Una scoperta recente ha
mostrato che da un gene si formano più prodotti genici (cioè più RNA maturi pronti per essere
tradotti). Tutti gli step visti in precedenza possono avere delle forme alternative.

1- Trascrizione alternativa: abbiamo detto che la trascrizione parte da un promotore, ma si

è visto che gran parte dei geni possiedono più di un promotore. Questo comporta che essi si
possono legare a più fattori e quindi a più polimerasi. Avendo più promotori la trascrizione
comincia in punti diversi e l’mRNA porta ad avere un mRNA maturo lungo o corto.

2- Splicing alternativo: si è osservato che i geni sono capaci di fare più forme di splicing a
partire dallo stesso gene.
In un gene, dove si alternano esoni e introni, può accadere che vengano considerati degli
esoni e introni alternativi rispetto alla forma canonica.
esempio. Può accadere che l’esone2 venga considerato
parte dell’introne e quindi non venga tenuto. Dunque, la
forma matura dell’mRNA è formata solo dall’E1+E3+E4
(senza E2).

In media ogni gene può fare quattro splicing alternativi. Può essere specifico per cellule
diverse o anche per la stessa cellula in circostanze diverse.
Forme di RNA maturi diversi formeranno proteine mature diverse.
Spesso gli esoni codificano per i domini (parte proteica con un ruolo preciso e una struttura
propria).
Lo splicing alternativo dallo stesso gene produce proteine diverse, quindi ottengo mRNA
diversi e di conseguenza proteine diverse.

3- Poliadenilazione alternativa: il trascritto può iniziare o finire più indietro a seconda di

quando viene aggiunta la coda di poli A.

caratteristiche del gene

dimensione media del gene: 27000kb (kilo basi)
numero medio di esoni: 8,8
numero minimo di esoni: 1
 dimensione media esone: 145 paia di basi
dimensione media introne: 3500 paia di basi
dimensione media mRNA maturo: 2875 paia di basi
lunghezza media di una proteina: 450 aminoacidi
distanza tra i geni: 108 kilobasi (sono molto distanti, questo ci fa capire che tutti gli errori hanno
poca probabilità di trovare un gene).
Inoltre, esistono geni sovrapposti o un gene dentro l’altro.

Codice genetico
Per comprendere con quali modalità l'informazione genetica passa dal genotipo al fenotipo bisogna
capire in che modo il linguaggio chimico del DNA viene tradotto nel linguaggio chimico delle
proteine. Questo linguaggio è costituito da simboli o segni che hanno un significato, ma bisogna
conoscere anche delle regole per passare da un linguaggio all’altro (un codice=codice genetico).

Il codice genetico è l’insieme di regole che mette in relazione il linguaggio del DNA e quello delle
proteine. Vi sono due tipi di linguaggio: quello del DNA formato da quattro segni (basi azotata) e il
linguaggio delle proteine formato da 20 amminoacidi.
Il codice è composto da 3 basi = numero minimo di basi che combinate tra loro superano i 20
amminoacidi (fa 64 combinazioni). Così hanno costruito una tabella, il vero codice genetico che
associa a tre basi con un aminoacido (può essere espresso con una lettera o con tre).

Il codice genetico è formato da triplette, tra queste vi sono tre triplette che non codificano per
nessun aminoacido e sono chiamate triplette di stop (UAA, UAG, UGA).
ed è formato da diverse caratteristiche:
1. è ridondante o degenerato, in quanto sono presenti più triplette di basi per uno stesso
aminoacido;
2. è universale, in quanto è condiviso da tutti gli organismi;
3. non è ambiguo, poiché ad una tripletta corrisponde un solo aminoacido.
ATG codifica per la metionina (Met)= tripletta o codone di inizio, è sempre il primo aminoacido di
tutte le proteine.
Il codice viene utilizzato sull’mRNA maturo.
Traduzione
Il messaggio dell'mRNA deve essere prima interpretato dall'RNA di trasporto (tRNA), che converte
le sequenze di tre lettere (codoni) dell’mRNA nelle sequenze di una sola lettera (aminoacidi).
Nel citoplasma sono presenti forniture di aminoacidi prodotti ad esempio dal cibo. Il compito del
tRNA è di abbinare gli aminoacidi ai rispettivi codoni. Per fare ciò i tRNA devono:
1. unirsi agli aminoacidi giusti;
2. riconosce sulla mRNA i codoni;
3. interagire con i ribosomi.
Il tRNA è formato da un singolo filamento di RNA di 80 nucleotidi.
Avvolgendosi su sé stesso, forma

dei legami a idrogeno tra le basi complementari. Ad un'estremità ripiegata,

vi è l'anticodone che è complementare al codone dell'mRNA. All'altra
estremità vi è il sito di legame per l'aminoacido. Il complesso può aggiungere
il suo amminoacido alla catena polipeptidica. I tRNA carichi, si chiamano
aminoacil-tRNA. Esiste un enzima che si chiama aminoacil-tRNA sintetasi
che è capace di associare il tRNA all’aminoacido corrispondente. Esistono
tanti enzimi quante sono le coppie tra tRNA e aminoacido specifico.

I ribosomi sono gli organismi che si trovano nel citoplasma e che coordinano il funzionamento di
mRNA e tRNA.
Esso consiste in due subunità una maggiore ed una
minore, ciascuna formata da proteine e dall'RNA
ribosomiale (rRNA). La subunità maggiore ha tre
diversi rRNA, mentre quella minore ha una molecola
di tRNA. Queste due subunità sono unite solo quando
i ribosomi svolgono la sintesi proteica. Vi sono anche
dei ribosomi all’interno del nucleo (oltre che nel RER e
nel citosol), che svolgono la funzione di controllo
prima che mRNA maturo esca e che si sia formato
bene. Ogni ribosoma ha un sito di legame per l’mRNA e tre siti di legame per il tRNA:

-sito A (amminoacidico) è il sito di attacco dell'anticodone del tRNA;

-sito P (peptidico) è il sito di attacco per l'aminoacido trasportato dal tRNA;
-sito E (exit site) è il sito di distacco per il tRNA scarico di aminoacidi.

Nella traduzione vi sono tre fasi:

1. fase di inizio, dove l'mRNA entra in contatto con il tRNA che trasporta l'aminoacido e avviene
l'attacco delle due subunità. Questa fase ha la funzione di stabilire esattamente dove ha inizio
la traduzione. Una molecola di mRNA si unisce alla subunità ribosomiale minore, mentre uno
speciale tRNA si lega al codone di inizio AUG. Il tRNA di partenza ha l'anticodone UAC che
trasporta l'aminoacido metionina.
La subunità maggiore si unisce a quella minore formando il ribosoma, qui il tRNA scorre nel
sito P e il sito A scorre verso il secondo codone di mRNA, pronto ad accogliere altri tRNA.
 2. fase di allungamento, dove vengono aggiunti nuovi aminoacidi alla sequenza, secondo un
processo di allungamento che si svolge nella subunità maggiore e avviene in tre tappe: (a)
riconoscimento del codone, (b) formazione del legame peptidico, (c) traslocazione del tRNA.

3. fase di terminazione. L'allungamento continua finché nel sito A del ribosoma giunge un
codone di arresto (UAA, UAG, UGA) che interrompe la traduzione. Al codone di arresto si lega
una proteina=fattore di rilascio. Il peptide completo si stacca e abbandona il ribosoma e le due
subunità si separano. Ogni peptide si avvolge e si ripiega si forma una sequenza segnale.

L’insieme di tutti i ribosomi che leggono lo stesso mRNA prende il nome di polisomi. La coda di poli
A decide quante volte deve essere letto quel ribosoma.

Il ribosoma inizia a tradurre dall’ATG e alla fine ci sarà una regione non tradotta fra il CAP 5’=
regione UTR (regione non codificante) e una regione UTR in 3’ non tradotta.
Da AUG a stop è la parte che darà origine alla proteina.
Gli RNA si dividono in mRNA, tRNA, snRNA, snoRNA.
Come per la trascrizione, alla fine della traduzione la cellula svolge dei controlli. Vi sono due
approcci:
-agisce sulla coda di poliA (sul gene specifico). La coda di poliA determina l’attività e la stabilità
dell’mRNA;
-attraverso una regolazione generale della cellula, aumentando o diminuendo il numero dei
ribosomi, oppure producendo una maggior quantità di fattori di sintesi proteica.

controllo dell’espressione genica:

1. trascrizioni alternative che riguardano l’RNA: splicing alternativo….
2. fattori di trascrizione
3. le proteine una volta tradotte possono essere modificate= modificazioni post traduzionali
4. epigenetica→ branca della biologia che riguarda lo studio della cromatina (dei cambiamenti
fenotipici ereditabili da una cellula in cui non si verifica un cambiamento del genotipo).

Genoma umano
Il genoma umano è il complesso di tutta l’informazione genetica (DNA) contenuto nella cellula. La
genomica studia la struttura, la funzione e le differenze fra genomi.
In ogni organismo servono informazioni proporzionali alla
complessità dell’organismo, dunque esiste una proporzionalità
fra quantità di genoma e la complessità dell’organismo, ma una
non proporzionalità tra la complessità dell’organismo e
grandezza del genoma.
Nel nostro genoma ci sono circa 21000 geni che codificano per
proteine. Il genoma è organizzato in cromosomi. In ogni cellula
abbiamo 46 cromosomi (=filamenti di DNA). Abbiamo 22 coppie
di cromosomi e due cromosomi sessuali X e Y. I cromosomi
dall’1 al 22 li abbiamo in duplice copia. Oltre ai 46 cromosomi (23
coppie) ho anche genoma mitocondriale.
Un genoma singolo formato da 23 cromosomi sono 3,2 miliardi di basi (quindi nel genoma completo
vi sono 6,4 miliardi di basi). Il genoma mitocondriale ha un numero preciso = 16.569.
In ogni cellula si hanno circa 2m di DNA che pesa 7pg.
nucleare
organizzazione del genoma umano
mitocondriale
Il DNA mitocondriale da un contributo al DNA totale dello 0,5%. Del DNA nucleare solo il 27% del
genoma è costituito da sequenze correlate ai geni, mentre i ¾ del genoma è detto DNA extragenico
(veniva definito DNA spazzatura, ma si scoprì che era importante dal punto di vista strutturale).
Di quella parte di 27% solo il 10% è codificante.
Il nostro genoma è stato sequenziato (un cromosoma per tipo) nel febbraio 2001. Nel 2007 è stato
sequenziato il genoma diploide (due coppie per ogni cromosoma).
Tra due esseri umani ci deve essere un 0,1% di differenza, quindi 6 milioni di basi diverse, numero
piccolo, ma sufficientemente grandi per corrispondere tutti alla stessa specie.
Funzioni dei geni: L’mRNA tradotto in proteine→ metabolismo 22%, informazione genetica 25%,
struttura 20%, segnalazione cellulare 12%, funzioni tessuto-specifiche 20%.

Il genoma è l’insieme del DNA, trascrittoma è l’insieme degli RNA, proteoma è l’insieme di tutte le
proteine della cellula. Tutte le cellule di una stessa specie hanno uguale genoma, ma diverso
trascrittoma e proteoma. Ogni tipo cellulare sintetizza uno specifico gruppo di proteine:
1. proteine comuni a tutte le cellule. Possono essere proteine abbondanti (quelle che si trovano
nel citoscheletro, nei cromosomi, nel reticolo endoplasmatico, nel Golgi e nel ribosoma) e
proteine non abbondanti (come, ad esempio, gli enzimi per le reazioni centrali del
metabolismo);
2. proteine specifiche per le singole cellule (trascrittoma e proteoma saranno specifici di quelle
cellule). In una cellula vi sono circa 10.000-20.000 proteine differenti, ma solo alcune centinaia
di proteine che distinguono-differenziano una cellula da un’altra.

Il destino delle proteine

I ribosomi che sono la sede della sintesi proteica si trovano o nel citosol o nel RER. Le proteine che
vengo sintetizzate nel citosol vengono destinate agli organelli solo quando sono state
completamente sintetizzate. Le importazioni verso gli organelli possono essere:
importazione post-traduzionale vs co-traduzionale
1. importazione post- traduzionale dei ribosomi citoplasmatici.
La proteina contiene una sequenza segnale specifica,
contenuta nei primi 20 aminoacidi che ne determinano la
“meta”. I possibili destini a livello del citosol sono: mitocondri,
nucleo o perossisomi.
Come fa a sapere dove deve andare?
Sparso nel citoplasma vi è un recettore che incontra il
segnale della proteina, quando incontrano l’organulo corretto
esso grazie alla proteina traslocatrice che riconosce la
sequenza segnale si unisce per complementarità di forma.
Una peptidasi taglia la sequenza segnale.
2. importazione co-traduzionale dei ribosomi del reticolo. Nel
citosol il ribosoma sintetizza una proteina che contiene una
sequenza segnale che viene letta da un recettore detto RSP.
Questa sequenza segnale viene riconosciuta dal recettore,
mentre la proteina si sta traducendo. Tutto l’insieme si sposta
nel citosol fin quando non trovano una proteina traslocatrice
nel reticolo ruvido. A questo punto si lega tutto al reticolo,
compreso il ribosoma, e la proteina finisce di essere tradotta
dentro al reticolo ruvido. I ribosomi sul reticolo ruvido si
trovano lì perché sono stati portati mentre stavano portando
una proteina.
Le proteine sintetizzate nel reticolo si spostano nell’apparato
di Golgi, qui possono essere distribuite o nella membrana plasmatica o portate fuori dalla
cellula o portate al lisosoma.
Una volta che le proteine vengono tradotte e sintetizzate (sequenza di aminoacidi) per essere
pronte possono avvenire una serie di modificazioni post-traduzionali. Possono essere:
-rimozione della prima metionina (AUG è un segnale molto forte, ma può non servire e viene
tagliato);
-taglio della sequenza segnale (grazie alla peptidasi);
-da una proteina grande si tagliano tante catene funzionali;
-rimozione di parti interne (=inteine) è come uno splicing proteico, ma è una condizione rara;
-aggiunta di carboidrati formando le glicoproteine (che si andranno a posizionare anche sulla
membrana);
-aggiunta di lipidi formando le lipoproteine;
-modificazioni chimiche come la metilazione (aggiunta di un gruppo metile -CH3), fosforilazione,
acetilazione o l’unione di più subunità;
-equilibrio sintesi/degradazione, infatti è in grado di sintetizzarsi o degradare quando è necessario =
plasticità della cellula.

4.ENDOMEMBRANE→
a. reticolo endoplasmatico (RE) è una
rete estesa di canali e cisterne appiattite
estremamente plastiche che è
direttamente collegato con l’involucro
nucleare. Nella cellula eucariote esistono
due tipi di reticolo endoplasmatico: liscio
che ha un aspetto uniforme dovuto
all’assenza di ribosomi e ruvido (in
continuità di membrana con il nucleo) che
presenta sulla superficie una grande
quantità di ribosomi.
La parte interna del reticolo è detto lume.

Il reticolo endoplasmatico ruvido svolge due importanti funzioni: amplia la superficie delle
membrane interne della cellula producendo nuovi fosfolipidi e incorporandoli nella propria
membrana. Porzioni della membrana del reticolo ruvido si staccano sottoforma di vescicole che si
fondono con le altre parti del sistema di endomembrane. In secondo luogo, i ribosomi ancorati al
reticolo partecipano alla sintesi delle proteine di membrana o destinate ad altri organuli oppure a
essere secrete dalla cellula.
Nelle cellule dove ci sarà bisogno di sintetizzare un gran numero di proteine ci sarà un reticolo più
sviluppato ed esteso. Nel reticolo ruvido avvengono la maggior parte delle modificazioni post-
traduzionali: modificazioni chimiche, rimozione della sequenza segnale (N-term), taglio della
metionina, ripiegamento della proteina.
Sono presenti disolfuri isomerasi che catalizzano il legame ponte disolfuro delle proteine.
Nel reticolo avviene la prima fase della glicosilazione (aggiunta di zuccheri→ glicoproteine).
Inoltre, nel reticolo avviene il controllo del ripiegamento corretto delle proteine, poiché le proteine
se entrano in condizione di stress (aumento di temperatura, pressione…) possono ripiegarsi male.
Ad esempio, l’Alzheimer è causato da un accumulo di proteine ripiegate non correttamente. Vi sono
due sistemi:
 -UPR (unfolded protein response)→ blocco della sintesi proteica e attivano gli chaperon
molecolare per ripiegare correttamente le proteine;
-ERAD (degradazione associata al RE)→ questo sistema mira al riconoscimento di proteine
mal ripiegate e alla loro demolizione.
Una proteina con zone idrofobiche deve ripiegarle all’interno, se è flessa nel modo sbagliato e la zona
viene esposta rischia di attirarne altri che si aggregano e si accumulano (prioni).
Le patologie che insorgono a seguito di un accumulo di proteine mal ripiegate sono:
-l’Alzheimer è causata dall’accumulo di proteine beta-amiloide piegate in modo anomalo nel cervello
dei pazienti affetti. Con l’invecchiamento cellulare diminuiscono le funzionalità dei sistemi di
controllo;
-la malattia di Creutzfeldt-Jacob (o della mucca pazza) dipende dall’accumulo di una forma mal
ripiegata e aggregata di una particolare proteina, chiamata PrP (proteina prionica).
Il reticolo endoplasmatico liscio possiede sulla membrana importanti enzimi che hanno un ruolo
fondamentale nella sintesi dei lipidi (fosfolipidi, glicolipidi, colesterolo) e sono la fonte del
rinnovamento della membrana della cellula. Un’altra importante funzione svolta dal reticolo
endoplasmatico liscio è di immagazzinare ioni calcio indispensabili (es. per la contrazione muscolare).

Il reticolo endoplasmatico liscio del fegato, reni e intestino partecipa al metabolismo degli zuccheri.
In questi organi, il glicogeno viene scisso e diventa glucosio-6-fosfato + H2O, ma per andare in
circolo è necessario un enzima che si trova nel reticolo liscio (glucosio-6-fosfatasi) che toglie il
fosfato in modo che riesca ad entrare nel flusso ematico.
Nelle cellule del muscolo e del cervello non è presente il reticolo endoplasmatico liscio, poiché è
necessario avere in circolo dei gruppi fosfati liberi.
L’alcol, i farmici e i veleni raggiungono il fegato dove avviene la reazione di idrossilazione per
eliminazione, cioè avviene la rimozione di essa grazie all’urea. Quando assumiamo alcol, la risposta
dell’organismo è la produzione di più reticoli endoplasmatici lisci ed enzimi provocando assuefazione
o resistenza ad altri farmaci. La plasticità può innescare il meccanismo dell’assuefazione.

b. apparato di Golgi è un organulo cellulare che prende il nome dal

biologo che per primo lo osservò all’interno delle cellule nel 1898 con
il microscopio ottico. È costituito da un insieme di cisterne
appiattite contornate da vescicole, che hanno la proprietà di potersi
fondere. L’apparato di Golgi costituisce una sorta di stabilimento per
la lavorazione finale e lo smistamento dei prodotti provenienti dal
reticolo endoplasmatico. Il Golgi è diviso in tre regioni:
-faccia cis è rivolta verso il reticolo endoplasmatico e serve da “ricevimento merci” e accoglie
le vescicole di trasporto prodotte dal reticolo. Queste vescicole vengono incorporate nella
membrana dell’apparato di Golgi dove formano una nuova cisterna;
-centro è la regione mediana
-faccia trans è rivolta verso la membrana e può essere paragonata ad un “magazzino
spedizioni” dove le molecole finite vengono impacchettate in vescicole e trasportate in altre
sedi.

Questa direzionalità del Golgi è in relazione alla sua funzione. Le vescicole si staccano per
gemmazione dai due reticoli e portano il loro prodotti (proteine o lipidi) alla faccia cis del Golgi. Il
prodotto lo attraversa (faccia cis, regione mediana e faccia trans) e quando arriva nella faccia trans
forma delle vescicole che si staccano e vengono direzionate nelle varie parti della cellula (membrana
plasmatica, all’esterno o ai lisosomi).
I prodotti semilavorati che giungono dal reticolo endoplasmatico subiscono vari tipi ti
trasformazioni. In primo luogo, avviene la seconda fase della glicosilazione e la sintesi dei glicolipidi
(vengono aggiunti altri zuccheri). Il Golgi ha anche la funzione di smistamento dei prodotti finali.
Vi sono due modelli di interpretazione di questo apparato:
-modello delle cisterne stazionarie→ il trasporto delle proteine dentro al Golgi è gestito dalle
vescicole (che sono rivestite da sostanze che danno la direzione);
-modello di maturazione delle cisterne→ è un meccanismo secondo cui le cisterne maturano
spostandosi dal lato di entrata a quello di uscita e modificano i prodotti trasportati lungo il
percorso.

Le proteine e i lipidi che vengono prodotti raggiungono la membrana plasmatica per poi uscire dalla
cellula o diventare parte della membrana stessa o di altri organuli. Non tutti i prodotti sono smistati,
ma possono rimanere all’interno del Golgi.

Il trasporto di materiale verso l’interno o l’esterno

-esocitosi→ è un processo che avviene rilasciando all’esterno il prodotto del reticolo
endoplasmatico o del Golgi. Le vescicole si fondono con la membrana e rilasciano all’esterno le
sostanze. Questo processo genera sulla membrana un aumento di volume. È necessario ristabilire
l’equilibrio con endocitosi-endocitosi.
L’esocitosi rilascia le cellule all’esterno grazie alle cellule secretrici, che si dividono in:
→ secrezione costitutiva: è un processo che avviene costantemente (es. ghiandole epidermide che
devono produrre grasso);
→secrezione regolare: è un processo per cui la cellula produce il proprio secreto, lo trattiene e solo
nel momento del bisogno si fonde con la membrana e lo rilascia all’esterno (es. neurotrasmettitori o
enzimi digestivi).
Quando una vescicola fa esocitosi si fonde con la membrana; quindi, per portare una proteina o
glicoproteina sulla membrana è necessario che la vescicola abbia sulla sua membrana queste
sostanze.

-endocitosi→ è un processo per cui un’introflessione

della membrana plasmatica, racchiude il contenuto e
forma una vescicola che si riversa all’interno. Può essere
di tre tipi:
• fagocitosi: riguarda la capacità di portare
all’interno sostanze grandi solide o ad altre cellule
come batteri. I neutrofili e i macrofagi eliminano
per fagocitosi la sostanza. Fanno parte del sistema immunitario. La cellula deve formare delle
‘braccia’ per cambiare la forma della cellula = pseudopodi (interviene citoscheletro). Per digerire
quello da eliminare la vescicola viene direzionata ai lisosomi;
• pinocitosi: è la formazione di una introflessione che porta all’interno gocce di fluido che si
trovano all’esterno della cellula con formazione di vescicola. È un trasporto aspecifico di
sostanze, vengono anche fatti per compensare una esocitosi attiva;
• endocitosi mediata da recettori: è la formazione di una vescicola con recettori=proteine che
legano in modo specifico una sostanza. È il trasporto specifico di una sostanza poco
 concentrata. Dal momento che i recettori sono anche strutture più vicine per rendere efficiente
il sistema, sotto ai recettori vi è un rivestimento detto clatrina (per irrobustire la membrana e
definire la direzione delle sostanze all’interno);

5. LISOSOMA → tutte le sostanze che entrano nella cellula e che devono essere demolite sono
destinate al lisosoma. Il lisosoma è un organulo con una struttura sferica, sono in numero
variabile che dipende dal bisogno della cellula (in media 300). Hanno una singola membrana che la
circonda e hanno la principale funzione di digerire le sostanze.
Per digerire una sostanza il lisosoma deve “rompere”
i legami fra le molecole, per fare ciò al suo interno è
necessario che abbia degli enzimi specifici=idrolasi
acide (nucleasi, lipasi, proteasi, glicosidasi, fosfatasi,
solfatasi, fosfolipasi…). Si dicono acide poiché
lavorano solo in ambiente acido, si attivano con
pH<7, quindi con una maggiore concentrazione di H+
rispetto al compartimento citosolico dove il pH è circa neutro (pH=7,2).
Il meccanismo che permette il passaggio degli ioni attraverso la membrana è il trasporto attivo. I
lisosomi hanno sulla loro membrana una grande quantità di pompe protoniche, cioè trasportatori
attivi=proteine carrier che portano ioni H+ contro gradiente, per fare in modo che il pH sia circa
uguale a 5. Il pH ha un’acidità tale da attivare determinati enzimi digestivi. Ciò comporta che se si
dovesse rompere un lisosoma gli enzimi digestivi nel citosol non si attivano, perché incontrano un
pH basico. La presenza di questo pH acido che attiva gli enzimi fa sì che dentro al lisosoma venga
digerita anche la membrana del lisosoma; infatti, all’interno del lisosoma vi è un rivestimento di
glucidi per proteggere il lisosoma da un’autodigestione. Il lisosoma ha il compito di digerire le
molecole rompendo i legami per permettere il riciclo di esse.
Il lisosoma si costruisce grazie a proteine o
glicoproteine che subiscono le maturazioni tipiche del
reticolo liscio e ruvido e dell’apparato di Golgi. Il Golgi
dalla faccia trans libera delle vescicole per permettere
loro di compiere l’esocitosi, ma libera anche vescicole
per rifornire il lisosoma dei suoi enzimi e
glicoproteine.

Il lisosoma può avere anche un altro modo per formarsi e mantenersi. Infatti, nel momento di
bisogno si forma l’endosoma. L’endosoma precoce è la vescicola che si forma a seguito di
un’endocitosi e contiene sostanze da digerire. Esso può diventare lisosoma se riceve dall’apparato di
Golgi gli enzimi digestivi e sviluppare la capacità di portare all’interno ioni H+. Nel momento in cui
l’endocitosi diventa fagocitosi si parla di fagosoma.
Una ricerca recente ha mostrato che nella cellula esistono degli organuli circondati da due
membrane che dopo qualche tempo “scomparivano”. La cellula ha sviluppato un sistema per digerire
i propri organuli quando non c’è più bisogno di essi (quando sono danneggiati o quando sono in
quantità troppo elevate). Questo meccanismo si chiama autofagia, cioè autodemolizione e l’organulo
è chiamato autofagosoma= è una vescicola formata e circondata dal reticolo liscio che contiene la
parte cellulare da demolire. Per essere demolito completamente, l’autofagosoma si deve fondere con
il lisosoma.
La cellula vive in un bilanciamento costante di sintesi-demolizione.
Una scoperta recente ha notato che nei liquidi extracellulari esistono delle microvescicole che si
trovano all’esterno della cellula. Queste microvescicole sono di diverse dimensioni, possiamo trovare
una suddivisione di questi organelli in base alla loro grandezza:
-grandi (0,1-2 µm)
-piccole (30-100nm) = esosomi
La loro principale funzione è di entrare e comunicare con altre cellule (trasporto di molecole
racchiusa da una vescicola). Per entrare utilizza diversi metodi: per endocitosi, oppure si lega a
recettori che entrano mediante endocitosi o per fusione della membrana della vescicola a quella
della cellula. Gli esosomi possono trasportare, oltre a proteine, glucidi e lipidi, anche acidi nucleici.
È per questo che si possono trovare all’interno molecole di RNA.

6. PEROSSISOMI→ i perossisomi hanno una struttura simile ai lisosomi, sono per lo più sferici e
hanno un diametro medio di 0,5 m. Anch’essi si formano e si demoliscono in base alla
presenza. Sono degli organuli presenti in tutte le cellule, ma in particolar modo nelle cellule
del fegato e nel rene. Si formano a partire dal reticolo endoplasmatico liscio e sono capaci di
aumentare di dimensioni o di dividersi a metà. La loro capacità di aumentare di numero è data
dalla loro capacità di crescere e di scindersi.
Ci sono diverse reazioni biochimiche, che sono utilizzate dalla cellula per smaltire delle
sostanze tossiche o estranee, che per rendere queste sostanze utilizzabili devono eliminare
come prodotto di scarto il perossido di idrogeno (H2O2, acqua ossigenata). Questi composti
attraverso dei percorsi di ossidazione, grazie a degli enzimi chiamati ossidasi, danno come
prodotto di scarto l’ossigeno e il perossido di idrogeno. L’acqua ossigenata è una molecola
reattiva e tossica, ed è necessario che la molecola diventi innocua. Ci sono degli enzimi
specifici chiamata catalasi che scindono in acqua e ossigeno. Il perossisoma è un organulo
deputato a rendere innocuo il perossido di idrogeno, grazie alla presenza all’interno
dell’organulo di catalasi.
reazione 2H2O2 →O2 +2H2O

7. MITOCONDRI→ il mitocondrio nasce per

endosimbiosi e ha una forma e dimensione
variabile (1-10 m). Presenta due membrane,
una interna e una esterna. La membrana interna
è ripiegata in creste mitocondriali, ciò comporta
che ci sia una maggior superficie che svolge la
sua funzione principale (sintesi di ATP). Mentre,
la membrana esterna è molto diversa rispetto a
quella interna, poiché è una membrana molto permeabile, con una grande quantità di porine
che permette lo scambio di sostanze con il citosol. Fra le due membrane lo spazio è molto
simile al citosol ed è chiamato spazio intermembrana. Mentre dentro la membrana interna vi
è una matrice mitocondriale ed ha delle caratteristiche specifiche. All’interno della matrice
troviamo il DNA mitocondriale, di origine batterica, numerosi ribosomi liberi e molti enzimi
necessari per catalizzare le reazioni che avvengono all’interno. Qui avviene anche una
trascrizione e traduzione per sintetizzare proteine specifiche del mitocondrio, ma la maggior
parte di proteine vengono sintetizzate e importate dal citosol grazie ad una sequenza segnale.
 I mitocondri sono gli organuli in cui l’energia chimica contenuta negli alimenti, come gli
zuccheri, viene convertita nell’energia chimica di ATP. Questo processo prende il nome di
respirazione cellulare. La funzione del mitocondrio (=la sintesi dell’ATP), avviene grazie ad una
serie di reazioni che avvengono grazie ad enzimi che si posizionano sulla membrana interna
del mitocondrio. Il mitocondrio è capace di dividersi nel momento del bisogno.

L’ossidazione del glucosio e degli acidi grassi libera degli

elettroni. Nella membrana interna dei mitocondri vi
sono delle proteine (che formano la catena di trasporto
degli elettroni) che gestiscono gli elettroni provenienti
dalla demolizione del glucosio e degli acidi grassi.
Le proteine sfruttano il passaggio di questi elettroni per
spingere gli ioni H+ dalla matrice mitocondriale fino allo
spazio intramembrana generando un potenziale.
Il gradiente protonico fa sì che gli ioni H+ tendano a spostarsi spontaneamente dalla parte
intramembrana verso la matrice mitocondriale con un’energia potenziale data dal gradiente.
Questa energia viene sfruttata dalla proteina ATP sintasi per unire ADP e un gruppo fosfato
e formare l’ATP. Gli ioni alla fine della loro catena di trasporto devono essere incanalati in una
molecola d’acqua.
8. CITOSCHELETRO→ Il citoscheletro oltre a
conferire alla cellula una forma, è molto
importante per il mantenimento della struttura e
per il movimento. È costituito da proteine e da
filamenti di diverse dimensioni. Possiamo
riconoscere:
-microfilamenti di actina (diametro 6-7nm):
i microfilamenti sono fibre flessibili e solide costituiti da due siringhe intrecciate. I filamenti di
actina si legano l'un l'altro e ad altre proteine per formare fasci di fibre che conferiscono il
supporto meccanico a diverse strutture cellulari.
Il monomero è chiamato G-actina e ha la capacità di legare una molecola di ATP. Questa
capacità di legarsi ad una ATP conferisce alla molecola una polarità e una direzione. Il
polimero è chiamato F-actina.
L’idrolisi dell’ATP serve per stabilizzare la struttura del filamento. Inoltre, il filamento è detto
dinamico, poiché non mantengono sempre una lunghezza fissa, ma possono polimerizzarsi o
depolimerizzarsi in entrambe le direzioni (sia all’estremità +, sia all’estremità -). La differenza
si nota nella velocità di reazione, in quanto all’estremità + la velocità di polimerizzazione è di
circa 5-10 volte maggiore.

formazione di un filamento di actina

Nel momento in cui la cellula ha bisogno di formare il citoscheletro ( ad esempio per formare
gli pseudopodi) sintetizza dei monomeri di actina e li assembla.
• prima fase → nucleazione: dove avviene l’incontro dei primi monomeri di actina che
iniziano ad unirsi
• seconda fase → allungamento: dove il filamento continua ad aggiungere monomeri,
avviene la polimerizzazione in entrambe le direzioni
 • terza fase → stazionaria: dove il filamento non accresce in numero di monomeri,
poiché si aggiungono e staccano monomeri in proporzione. La fase stazionaria si
raggiunge nel momento in cui la concentrazione critica è in equilibrio =
concentrazione di monomeri liberi che fa sì che i monomeri nel filamento siano in
equilibrio. Quando ho una concentrazione critica minore della concentrazione il
filamento rimane costante e tenderà a polimerizzarsi, al contrario il filamento
depolimerizza.
L’estremità + polimerizza 5-10 volte più velocemente dell’estremità -, quindi nonostante
entrambe le estremità abbiano la capacità di polimerizzare, nella fase stazionaria l’estremità +
polimerizza completamente, mentre l’estremità – depolimerizza. Questo fenomeno è
chiamato treadmilling.
MINUTO 20.20

Le proteine di frammentazione
Le proteine incappuccianti, si attaccano da un’estremità o dall’altra e bloccano la
polimerizzazione o depolimerizzazione, se il filamento è instabile.

Organizzazione dell’actina
È possibile avere una disposizione spaziale dei filamenti grazie alla presenza di altre proteine
accessorie: proteina di legame. La disposizione può essere a fasci o a rete intrecciati. La
struttura a fasci la possiamo trovare nei microvilli (filamenti con estremità + all’esterno).
La struttura a rete ha la funzione di sostegno della cellula, ancorando il citoscheletro alle
proteine della membrana plasmatica.
La cellula muscolare è la cellula
Distrofina (proteina che serve da attenuatore di stress). Le cellule muscolari a seguito di
sforzo fisico producono una rigenerazione=produzione maggiore dei fasci: ipertrofia
muscolare.

Distrofia muscolare non sta dietro alle microlesioni.

Movimento cellulare viene generato per due meccanismi:

1.assemblaggio e disassemblaggio dei filamenti (polimerizzazione/depolimerizzazione)
2.motori proteici
Il motore proteico dell’actina è la miosina. Proteina che è in grado di generare movimento.
Esistono diversi tipi di miosine, specializzate per le diverse funzioni cellulari. La struttura è
molto simile l’una dalle atre:
hanno una testa globulare, un collo che è una regione piccola molto mobile ad alpha elica.
Infine, vi è una coda allungata. La proteina ha una direzione NH2-COOH.
La testa ha due funzioni: legare l’ATP per generare il movimento, ma ha anche un sito di
legame per l’actina.
Il collo è costituito da catene leggere che permettono di essere molto mobili
La coda è capace di legare strutture diverse, ha un’attività specifica per ogni contesto.
La miosina genera movimento grazie all’idrolisi dell’ATP.

Processo ciclico actina-miosina

Ogni ciclo dura 50 millisecondi
Ascolta registrazione

Funzioni dei microfilamenti:

strutturale data dalla

-filamenti intermedi (10nm)

-microtubuli (24nm)