Il ciclo dell’azoto

La riduzione dell’azoto atmosferico:

una reazione difficile, ma qualcuno (i
batteri azoto-fissatori) deve farla…
≠
G

N2 + 3 H2
2 NH3 N2 + 3 H2
2 NH3

Coordinate di reazione

∆G0’ = -33.5 kj/mole (-8 kcal/mole)

…ma la reazione ha una energia di attivazione altissima.

 I batteri azoto-fissatori impiegano un
enzima detto nitrogenasi ed un forte
sistema riducente
N2 + 10 H+ + 8 e- + 16 ATP
2 NH4+ + H2 + 16 ADP + 16 Pi
Il complesso della nitrogenasi contiene
una reduttasi ed una dinitrogenasi
costituita da due subunità

Dinitrogenasi reduttasi
(Fe protein) – una volta
ossidata, dissocia dal
complesso

Dinitrogenasi
(Fe-Mo protein)

Centro Mo-Fe

omocitrato
L’idrolisi dell’ATP aiuta a “spingere” gli
elettroni dalla reduttasi al centro Mo-Fe

2 molecole di ATP. La loro

idrolisi abbassa il potenziale di
riduzione della reduttasi da
–250 a –400 mV

Centri ferro-zolfo
intermedi.

Centri MoFe

La struttura del centro Mo-

Fe ad alta risoluzione ha
rivelato un atomo d’azoto
(forse uno ione nitruro, N-)
legato nel mezzo del centro
Il destino dell’azoto: da ammoniaca a
biomolecole complesse
NH4+

Glutammina Glutammato

Tutti gli altri amminoacidi

Nucleotidi etc.

Reazione della
glutammina sintetasi
La glutammina sintetasi, un dodecamero
strettamente regolato
 In piante e batteri, la glutammato
sintasi produce due molecole di
glutammato a partire da glutammina
ed α-chetoglutarato:

NADPH o
ferredossina rid.

2
NADP o
ferredossina ossidata

Somma delle reazioni della glutammina sintetasi e della

glutammato sintasi:

Glutammato + NH4+ + ATP
Glutammina + ADP + Pi + H+

Glutammina + chetoglutarato + NADPH + H+
2 Glutammato + NADP+

_____________________________________________________________

NH4+ + chetoglutarato + NADPH + ATP
Glutammato + NADP+ + ADP + Pi

La biosintesi di nucleotidi è un processo
continuo nelle cellule, e può procedere
per una via “de novo” ed una via di
recupero

Amminoacidi (Asp e
Gly), ammoniaca, CO2, Via “de novo”: le basi
vengono ‘costruite’ già
riboso 5-fosfato
attaccate allo zucchero

Nucleotidi

Via di recupero: le basi

Basi libere (derivanti libere vengono attaccate
dalla degradazione attaccate allo zucchero da
dell’RNA e del DNA), enzimi detti
riboso 5-fosfato fosforibosiltransferasi
 Via de novo: i nucleotidi pirimidinici
sono formati a partire da aspartato,
ammoniaca e 5-fosforibosil-1-pirofosfato

5-fosforibosil-
1-pirofosfato
(PRPP)
Biosintesi dei nucleotidi pirimidinici:
produzione del carbamilfosfato

(in genere, derivato

dall’idrolisi della
glutammina)

Incorporazione
dell’ammoniaca nel
carbamilfosfato, ad
opera della
carbamilfosfato
sintetasi II
Il fosforibosil pirofosfato è una forma
attivata del riboso 5-fosfato

Via dei pentoso-

fosfati

riboso fosfato pirofosfochinasi

L’orotato, un intermedio della biosintesi
dei nucleotidi pirimidinici

Aspartato
transcarbamilasi

Diidroorotasi

Ubichinone
Diidroorotato
Ubichinolo
Deidrogenasi
(localizzata sulla superficie
esterna della membrana
Mitocondriale interna)
 L’orotato fosforibosiltransferasi
condensa orotato e PRPP per produrre
un nucleotide, l’orotidilato...

Orotato fosforibosil
transferasi
L’orotidilato viene decarbossilato ad
UMP e poi fosforilato ad UTP

Orotidilato
decarbossilasi

(UMP)

UMP + 2 ATP UTP + 2 ADP

UMP chinasi
e nucleotide difosfato chinasi
L’ UTP può essere amminato a CTP

Citidilato sintetasi
Biosintesi dei nucleotidi pirimidinici
I ribonucleotidi sono convertiti a
deossiribonucleotidi dalla
ribonucleotide reduttasi
Il timidilato (dTMP) viene prodotto a
partire da dUMP grazie all’enzima
timidilato sintasi
 Via di recupero: le basi libere vengono
attaccate al PRPP
O
Uracile O
NH
NH
N O Uracile fosforibosil O
H
transferasi -O P O
O
O

O- H H
+ H H
OH OH
O

-O P O
O H
O- H H O- O-

H O P O P O-
OH OH UMP
O O

PRPP

Adenina fosforibosil
transferasi

N
HN

N
N H Ipoxantina-guanina
fosforibosiltransferasi
Ipoxantina
(prodotto di
deaminazione
di adenina e
guanina)
 Cenni alla biosintesi de novo dei
nucleotidi purinici: i nucleotidi sono
‘costruiti’ sul ribosio fosfato
 Biosintesi dei nucleotidi purinici:
produzione della fosforibosilammina
Biosintesi dei nucleotidi purinici: una
vista d’insieme