Documenti di Didattica
Documenti di Professioni
Documenti di Cultura
dell’espressione genica
La regolazione
dell’espressione genica
La regolazione genica è la capacità di una
cellula di controllare l’espressione dei suoi
geni
La presenza
dell’amminoacido
triptofano nel terreno di
crescita inibisce invece la
sua sintesi interna.
Regolazione Genica nei
Procarioti
Il controllo può
avvenire in una delle tre
fasi che portano alla
sintesi proteica.
Avviene soprattutto
durante la trascrizione.
Regolazione Genica nei
Procarioti
Finalità:
-Rispondere rapidamente a cambiamenti ambientali
Logica:
-Risparmiare energia, quindi niente mRNA o proteine che non
servano subito
Base fisiologica:
-la maggior parte dei geni è espressa costitutivamente
-pochi geni sono regolati (induzione o repressione)
-la traduzione è subito successiva alla trascrizione
-gli mRNA hanno vita breve
Regolazione Genica nei
Procarioti
11
Curtis et al. Invito alla biologia.blu © Zanichelli editore 2012
F. Jacob & J. Monod…
…e il modello dell’Operone
Operone inducibile
13
L’Operone Lac
Gli induttori: il lattosio, se presente nel terreno di coltura, si lega al repressore lac
inibendo la sua capacità di legarsi all’operatore;
vengono sintetizzati gli enzimi utili alla degradazione del lattosio.
L’Operone Lac
Presenza triptofano
L’Operone Trp
I corepressori:
il triptofano, se presente
nel terreno di coltura, si
lega al repressore trp, ne
cambia la conformazione
permettendogli di legarsi
al sito dell’operatore;
insieme bloccano la
sintesi di triptofano.
L’Operone Trp
In assenza di triptofano, il
repressore è inattivo e
l’operone viene trascritto
L’attenuazione nell’operone trp
Il Fenomeno dell’attenuazione fa si che la sintesi dell’mRNA dell’operone trp venga
completata solo se il trp-tRNA è scarso.
La traduzione dell'mRNA leader avviene immediatamente a monte della sua trascrizione perché, a
causa dell'appaiamento delle sue regioni 1 e 2, l’RNA polimerasi si blocca per un tempo
sufficientemente lungo da permettere l'inizio della traduzione.
L’attenuazione nell’operone trp
•Se c'è carenza di triptofano, il
ribosoma si arresta in corrispondenza
della regione 1; si ha l'appaiamento
delle regioni 2 e 3, che non permette
l'appaiamento delle regioni 3 e 4, il
quale rappresenta un segnale di
terminazione: così l'RNA polimerasi
conclude la sintesi dell'operone.
L'appaiamento delle regioni 2 e 3 è
quindi un segnale chiamato di
antiterminazione.
- TRP Operon
TRP Operon.mp4
La regolazione dell’espressione
genica negli eucarioti
La regolazione dell’espressione
genica negli eucarioti
•I meccanismi di regolazione che possono essere
attivati dalle cellule eucariotiche sono più
numerosi e molto più versatili di quelli dei
procarioti.
•I geni eucariotici sono regolati in modo più fine,
e la loro trascrizione può essere aumentata o
diminuita a seconda delle necessità.
•Uno stesso gene può dare origine a diversi
mRNA a seconda del tipo di cellula in cui si trova.
Perché ci sono cellule differenti?
• Le cellule che appartengono allo stesso individuo hanno lo stesso genoma, ma tali cellule
sono di diversi tipi (cellule muscolari, cellule del pancreas, cellule del sangue…)
distinguibili dal punto di vista strutturale e funzionale.
Che cosa le rende differenti ?
L’espressione genica differenziale cioè quando, dove, e in che quantità ogni gene è
espresso.
Gene per
proteina del
citoscheletro
Restrizione spaziale e temporale
dell’espressione genica
1. Geni housekeeping (attivi in tutte le cellule)
Il differenziamento delle
cellule di un organismo
pluricellulare dipende
dall’inattivazione di certi
gruppi di geni e
dall’attivazione di altri.
I molteplici
meccanismi che
controllano
l’espressione genica
sono analoghi alle
valvole di controllo
delle tubazioni.
I livelli di regolazione
dell’espressione genica
DNA
Trascritto primario
(precursore)
mRNA
mRNA
traduzione degradazione
PROTEINA
Trascritto primario
(precursore)
mRNA
mRNA
traduzione degradazione
PROTEINA
Istoni
Linker
«Perle di una
collana»
TEM
Nucleosoma
(10 nm di diametro)
700
TEM
nm
Cromosoma in metafase
Il nucleosoma
•eucromatina:
dispersa nel nucleo e poco colorata, meno condensata.
•eterocromatina:
più condensata e colorata intensamente.
La struttura della cromatina e
l’espressione dei geni
• Durante la mitosi, la cromatina
assume uno stato fortemente
condensato e compatto
(conformazione chiusa) fino a
formare i cromosomi metafasici.
mRNA
mRNA
traduzione degradazione
PROTEINA
•I fattori di trascrizione sono proteine che determinano se e quando l’RNA polimerasi trascrive
il DNA, riconoscendo nel gene le sequenze di regolazione.
•Alcune sequenze del DNA, come la TATA box, si trovano comunemente nei promotori di molti
geni eucariotici e vengono riconosciute da fattori di trascrizione presenti in tutte le cellule
dell’organismo.
•Altre sequenze dei promotori sono specifiche di particolari geni e vengono riconosciute da
fattori di trascrizione presenti soltanto in particolari tessuti.
Regolazione della trascrizione mediante
specifiche proteine di legame
• TATA box, con una sequenza di consenso TATAAA
centrata a circa -25, che localizza il punto in cui la
trascrizione può avere luogo;
• inizio della trascrizione, dove si inserisce la RNA
polimerasi;
• sito degli elementi regolatori: enhancer e silencer anche
molto distanti dal punto di inizio, sia dal lato 5’ che 3’.
Regolazione della trascrizione mediante specifiche
proteine di legame
• TATA box + sito inizio della
trascrizione = promotore
basale.
• Fattori di trascrizione
generali: si legano al
promotore basale per
consentire l’attacco della
RNA polimerasi.
Regolazione della trascrizione mediante
specifiche proteine di legame
• I fattori di trascrizione
generali assicurano un
livello basale di
trascrizione.
• L’effettivo livello di
trascrizione di alcuni geni
può andare molte volte
oltre il livello basale. La
differenza risiede nei
fattori trascrizionali
gene-specifici, detti
attivatori.
Regolazione della trascrizione mediante
specifiche proteine di legame
Trascritto primario
(precursore)
mRNA
mRNA
traduzione degradazione
PROTEINA
Trascritto primario
(precursore)
mRNA
controllo del trasporto
mRNA
traduzione degradazione
PROTEINA
Trascritto primario
(precursore)
mRNA
PROTEINA
Trascritto primario
(precursore)
mRNA
PROTEINA
• RNA interference:
piccole molecole di
RNA, che interferiscono
con l’mRNA, lo
neutralizzano o
degradano.
Trascritto primario
(precursore)
mRNA
PROTEINA
controllo post-traduzionale
PROTEINA attiva o inattiva
Controllo post traduzionale
• La modifica di una proteina include la
rimozione di amminoacidi specifici o
l’aggiunta di sequenze segnale.
• Splicing alternativo
Splicing_ Alternative.mp4
• RNAi
RNA interference (RNAi)_ by Nature Video.mp4