> Un chiarimento, se possibile, sul meccanismo catalitico di questo enzima.

> Ricordo brevemente: c'è una triade catalitica formata da tre residui
> allineati (Asp-102, His-57 e Ser-195). A pH fisiologico (7,4) la Ser non è
> dissociata per cui occorre "incoraggiare" la dissociazione. Il sistema
> adottato è quello di scambiare H+ fra Asp e His.
> Il punto non chiaro è questo passaggio nella spiegazione : "A pH 7,4 il
> residuo di Asp è ionizzato e può attrarreun protone dell'His, aumentandone
> considerevolmente la sua forza basica" e rendendo così possibile la
> dissociazione del gruppo -OH della Ser.
>
> Chiedo: intuito che per "aumentare la forza basica" si intenda che in
> seguito alla cessione dell'H+ l'His agisce da base meglio di prima, come e
> perchè si realizza questo? Esiste un riarrangiamento elettronico che mi
> sfugge e che potrebbe dar ragione dell'affermazione?
>
> Grazie

Oltre che in forma zwitterionica (neutra), gli amminoacidi possono

esistere in
forma protonata (cationica, acida) o in forma deprotonata (anionica,
basica).
L'abbondanza relativa delle tre forme dipende dalle costanti Ka1 e Ka2
e dal pH.

Il "side chain" pKa dell'Asp e' 3,86 (lasciamo stare per ora gli altri
pKa). ll punto isoelettrico e' 2,98.

Il "side-chain" pKa dell'His e' 6,10 e. ll punto isoelettrico e' 7,64.

Quindi gli amminoacidi che si comportano come acidi (o meglio

ulteriori o acessorie funzioni acide) hanno un PI minore di 6 e queli
basici (o meglio ulteriori o acessorie funzioni basiche) maggiore di
6.

A pH 7,4 l'His si trova vicino al suo punto isoelettrico quindi a tale

pH il numero delle molecole di amminoacido cariche positivamente quasi
eguaglia quello di quelle cariche negativamente. Questo vuol dire che
l'His a questo pH e' essenzialmente neutra, o meglio debolmente
basica. L'His e' l'unico amminoacido che ha il PKa nel range
fisiologico ed e' per questo che sta sempre nei siti attivi degli
enzimi quando c'e' bisogno di donare o ricevere un protone.

L'Asp invece a questo pH ben al di sopra del suo pPka sara' spostato
nel suo equilibrio avendo una bella carica negativa ed essendo un
acido debole puo' ricevere ancora protoni in questo caso dalla sua
base coniugata che e' la His (obbligata per ragioni steriche essendo i
residui nell'enzima coordinati e quindi con poca mobilita').

Riassumendo diciamo che a questo pH l'His che e' quasi neutra e'
"obbligata" a comportarsi come base per azione dell Asp quindi a
deprotonarsi di piu' rispetto al suo equilibrio naturale a questo pH.