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Scopi della Biochimica

• Cercare di descrivere la struttura, l’organiz-


zazione e le funzioni della materia vivente in
termini molecolari
- Quali sono le strutture chimiche dei componenti della materia
vivente?
- Come fa la materia vivente ad estrarre energia dall’ambiente
circostante per auto-mantenersi?
- Come le interazioni tra molecole portano all’assemblaggio di
strutture sopramolecolari, organuli, cellule tessuti e organi?
- Come vengono controllate le reazioni in una cellula?
- Come fa un organismo a immagazzinare e trasmettere
l’informazione necessaria alla sua crescita e riproduzione?
Aree principali della Biochimica
• BIO-CHIMICA STRUTTURALE: studia la
relazione tra struttura chimica e funzione
biologica dei componenti la materia vivente;
• METABOLISMO: studia la totalità delle reazioni
che avvengono negli organismi viventi;
• BIOLOGIA MOLECOLARE (in parte): studia le
molecole che immagazzinano e trasmettono
l’informazione biologica e la loro chimica;
Elementi nell’universo, nella litosfera e nell’uomo

I 10 elementi più comuni Composizione elementale della


Nell’universo sono: litosfera e del corpo umano. Ciascun
numero rappresenta la percentuale del
ELEMENTO Parti per milione numero totale di atomi presenti.
Composizione della Composizione del
Idrogeno 750,000 Litosfera Corpo Umano
Elio 230,000 Oxygen 47 Hydrogen 63
Ossigeno 10,000 Silicon 28 Oxygen 25.5
Carbonio 5,000 Aluminum 7.9 Carbon 9.5
Neon 1,300 Iron 4.5 Nitrogen 1.4
Ferro 1,100 Calcium 3.5 Calcium 0.31
Azoto 1,000 Sodium 2.5 Phosphorus 0.22
Silicio 700 Potassium 2.5 Chlorine 0.03
Magnesio 600 Magnesium 2.2 Potassium 0.06
Zolfo 500 Titanium 0.46 Sulfur 0.05
Hydrogen 0.22 Sodium 0.03
Carbon 0.19 Magnesium 0.01
All others <0.1 All others <0.01
Legame ionico

F = k q1q2 / Dr2
Legami idrogeno
Legami idrogeno (H2O)
Legami idrogeno (ghiaccio)
Interazione di van der Waals
Domande fondamentali della
Biochimica
• In che modo una cellula estrae energia e
potere riducente dal suo ambiente?
• In che modo una cellula sintetizza i
precursori delle sue macromolecole (e poi le
macromolecole stesse)?

METABOLISMO INTERMEDIO
Metabolismo
Il metabolismo (dal greco μεταβολή =
cambiamento) è il complesso delle reazioni
chimiche che avvengono in un organismo o
in una sua parte. Molte di queste
trasformazioni della materia sono reversibili
e sono legate a variazioni della condizione
energetica.
Metabolismo
Il metabolismo si divide in due insiemi di processi:
catabolismo, che comporta la degradazione di
molecole complesse in molecole più semplici e
immagazzina energia sottoforma di legami
fosfoanidridici, principalmente nell’ATP.

anabolismo, che produce molecole complesse a


partire da molecole più semplici utili alla cellula.
Metabolismo
I processi anabolici sono endoergonici e
richiedono dunque energia. I processi catabolici
sono invece esoergonici: l'energia liberata da essi
viene conservata nella cellula (ed eventualmente
trasferita alle reazioni anaboliche) tramite
molecole “trasportatrici” di energia, tra le quali la
più comune è senza dubbio l'ATP.
(Acido palmitico)

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