La replicazione del DNA consiste nella sperazione ovvero nella
denaturazione del DNA in due filamenti stampo per la sintesi di un nuovo filamento complementare. Come risultato le due molecole di DNA a doppia elica ottenuto nel processo di replicazione sono costituite da un filamento originale e da un filamento di nuova sintesi. Andiamo a vedere i diversi passaggi che caratterizzano la repplicazione del DNA: Il DNA Ë sintetizzatp attraverso un voluminoso complesso molecolare contenente enzimie altre proteine che lavorano insieme , detto complesso di replicazione o replisoma, che si lega al filamento stampo e catalizza tutte le reazioni coinvolte nella duplicazione del DNA. Per poter essere duplicati i due filmaenti del DNA per prima cosa devono essere svolti e separati , ovver denaturati, in modo da esporre la sequenza nucleotidica da copiare. Ad innescare il processo di replicazione sono numeroso proteine iniziatrici che si legano al DNA e distanziano la catena rompendo i legami ad idrogeno. I legami ad idrogeno sono molto deboli , per cui non Ë richiesta una grande quantit‡ di energia per romperli. Gli enzimi responsabili nel processo , sono invece le DNA ELICASI , i quali sfruttando l'energia ottenuta dall'idrolisi dell'ATP , scorrono rapidamento il DNA , sveolgendo la doppia elica e rompendo i legami ad idrogeno , favorendo l'esposizione dei songoli filamenti , che cosÏ possono fungere da stampo per la sintesi della nuova catena di DNA. Il punto specifico dove inizia lo svolgimento della doppia elica Ë detto punti di inizio della replicazione e si distingue per una particolare sequenza nucleotidica : una sequenza capace di attrarre proteine iniziatrici e particolarmente facili da aprire poichË ricche di coppie A-T. Nella maggior parte dei casi la replicazione del DNA procede in una maniera bidirezionale : si formano cosÏ due forcelle di replicazione per ogni origine che si muovono in direzioni opposte. Il DNA svolgendosi produce quindi stampi a singolo filamento per la sintesi di nuovo DNA. Si forma cosÏ una bolla di replicazione. Quando la seprazione della doppia elica Ë iniziata , per far in modo che le basi complementari non si appaino tra di loro spontaneamente ai filamenti singoli esposti si attaccano proteine che legano il filmanento singolo(SSBP) , quando un tratto di DNA Ë stato replicato queste proteine si staccano. Successivamente la polimerizzazione delle catene nucleotidiche complementari ai filmenti parentali avviene grazie all'azione di un enzima: la DNA polimerasi, che assembla le singole unit‡ monomeriche rappresentate dai desossiribonulceosidi trifosfato (dATP,dCTP e cosÏ via..) sintetizzando uno dei due filamenti della molecola di DNA, usando il filamento orginale come stampo. L'aggiunta dei nuovi nucleotidi catalizzata dall'enzima DNA polimerasi avviene sempre all'estremit‡ 3' del filamento in allungamento. Quindi l'allungamento del filamento avviene all'estremit‡ 3' , dunque la catena cresce in direzione 5'-3'. A questo punto c'Ë un dubbio , ovvero, se la dna polimerasi aggiunge nucleotidi a partire dall'estremit‡ 3' di una catena preesistente come puÚ iniziare la sintesi del DNA una volta che sono stati separati i due filamenti? A tal proposito , nel processo di replicazione, subentra un'enzima chiamata primasi , che sintetizza senza bisogno di innesco un breve tratto di RNA chianato primer complementare al filamento di DNA parenale.In seguito il prime RNA sar‡ degradato da enzimi specifici e sostituito da DNA. Tuttavia i due filamenti di DNA sono appaiati tra loro in direzioni opposte , di conseguenza in corrispondenza di ogni forcella di replicazione, un filamento viene sintetizzato su uno stampo che va in direzione 3'-5' che Ë quindi la direzione corretta , mentre l'altro filamento si former‡ su uno stampo opposto , dunque in direzione 5'-3'( la forcella Ë asimmetrica). I due filamenti figli sono distinti in base al tipo di crescita: il filamento chiamato guida Ë sintetizzato in modo continuo dato che cresce in direzione 5'-3' , mentre l'altro filamento chiamato ritardo dovendo crescere in direzione 3'-5' Ë formato da .brevi frammenti discontinui. Tali frammenti discontinui sono chiamata , frammenti di okazaki , legati man mano tra di loro dalla DNA ligasi,formando un nuovo filamenti integro con polarit‡ 3'-5'. Per completare la replicazione del DNA Ë necessario eliminare tutti gli RNA di innesco dei filmaneti di okazaki , oltre all'inesco iniziale del filamento guida , sostituirli con DNA e unire i frammenti di okazaki , in modo da creare un filmaneto continuo. Per svolgere questi processi , intervengono una nucleasi che degrada l'RNA , una DNA polimerasi riparativa , che sostituisce DNA all'RNA e la DNA ligasi che lega i frammenti di okazaki.