Testi del Syllabus

Resp. Did. SANANGELANTONI ANNA MARIA Matricola: 005343

Docente SANANGELANTONI ANNA MARIA, 6 CFU

Anno offerta: 2018/2019
Insegnamento: 14931 - BIORIMEDIAZIONE
Corso di studio: 5043 - SCIENZE E TECNOLOGIE PER L'AMBIENTE E LE RISORSE
Anno regolamento: 2018
CFU: 6
Settore: BIO/19
Tipo Attività: B - Caratterizzante
Anno corso: 1
Periodo: Primo Semestre
Sede: PARMA

Testi in italiano

Lingua insegnamento italiano

Contenuti
La “bioremediation” è una tecnologia sempre più utilizzata per la bonifica
dei siti contaminati. Questo insegnamento tratta del ruolo che i
microrganismi svolgono nella gestione dei problemi di inquinamento
ambientale. Nella prima parte dell'insegnamento gli studenti saranno
introdotti alle diverse capacità metaboliche dei microrganismi rispetto ai
maggiori inquinanti ambientali e come queste capacità possono essere
utilizzate per risolvere problemi di contaminazione di acque e suoli.
Saranno inoltre introdotti alla consultazione delle specifiche banche dati
che raccolgono informazioni su tutte le vie cataboliche ad oggi
caratterizzate relative a diversi microrganismi e a diversi contaminanti.
Nella seconda parte saranno illustrate le principali tecnologie di
biorisanamento e infine saranno discussi casi di studio nei quali saranno
illustrate applicazioni delle conoscenze teoriche acquisite.

Testi di riferimento
Barbieri, Bestetti, Galli e Zannoni, "Microbiologia ambientale ed elementi
di ecologia microbica"(2008) Casa Editrice Ambrosiana
Martin Alexander “Biodegradation and Bioremediation” (1999) 2nd Ed.
Academic Press

Alcuni capitoli di questi testi sono stati fonte di informazione per

elaborare il materiale didattico (diapositive) mostrato a lezione. Questo
materiale è ogni anno aggiornato alla luce delle nuove conoscenze, pur
restando, le nozioni base, sostanzialmente invariate. Le diapositive
aggiornate saranno rese disponibili sulla piattaforma Elly man mano che
si svolgeranno le lezioni. Per gli studenti non frequentanti lo studio delle
diapositive dovrà essere integrato con lo studio sui testi suggeriti perché
le informazioni che contengono sono abbastanza schematiche e sono
sviluppate durante le lezioni e con la discussione di casi di studio.
Gli articoli discussi saranno resi disponibili sulla piattaforma Elly.
Si ricorda agli studenti, in particolare i non frequentanti, di controllare il
 materiale didattico disponibile e le indicazioni fornite dal docente tramite
la piattaforma Elly.

Obiettivi formativi
Gli studenti comprenderanno quali sono gli aspetti importanti del
metabolismo microbico per la depurazione e per la bonifica di siti
contaminati, quali sono le tecnologie di biorimediazione e come queste si
applicano. Saranno in grado di comprendere una relazione tecnica ed un
progetto di bonifica almeno per quanto riguarda gli aspetti biologici.
Sapranno leggere in modo critico un articolo scientifico che tratti di ruolo
dei microrganismi nei processi di bonifica e valutare l’applicabilità delle
tecnologie proposte alla risoluzione di problemi di inquinamento.

Prerequisiti
Microbiologia e Metabolismo microbico

Metodi didattici
Si alterneranno lezioni frontali con discussioni collettive di problemi
specifici. Gli studenti saranno chiamati a preparare due seminari su due
articoli scelti nelle banche dati bibliografiche (fra i più recenti). Nel primo
seminario saranno discussi articoli riguardanti l’isolamento di ceppi
microbici capaci di biodegradare o biotrasformare varie tipologie di
inquinanti, nel seminario finale si discuteranno articoli che trattano di
diverse tipologie di bioremediation in situ ed ex situ, di esperimenti pilota
in micro- o meso-cosmo o in impianti pilota in campo con la
caratterizzazione delle comunità microbiche implicate nel processo. Il
secondo seminario sarà, per gli studenti frequentanti, oggetto di
valutazione.

Modalità di verifica
dell'apprendimento Per gli studenti che frequenteranno le lezioni il primo seminario sarà
come un’esercitazione e non verrà valutato. Sarà invece valutato il
seminario finale e verranno verificate 1) la capacità dello studente di
scegliere l’argomento in base alle consegne del docente; 2) la sua
capacità di estrapolare dall’articolo scientifico scelto le informazioni
sostanziali e 3) la capacità di esporre (anche con l’uso di diapositive) il
lavoro scelto e discuterne i risultati. Alla fine del seminario il docente
porrà una domanda generale su uno degli altri argomenti del corso.
Per gli studenti non frequentanti l'esame sarà orale e verificherà che lo
studente conosca gli argomenti svolti nel programma, li sappia esporre e
discutere e sappia collegare i vari aspetti, biochimico-molecolare,
tecnologico, normativo relativi ai diversi tipi di inquinamento.

Programma esteso
Inquinanti ambientali organici ed inorganici, attenuazione naturale,
attenuazione naturale monitorata, biorimediazione. La degradazione
batterica di idrocarburi alifatici e aromatici e di alcune classi di
xenobiotici, in particolare clorurati in aerobiosi e in anaerobiosi.
Evoluzione e diffusione delle vie cataboliche. Bioaugmentation,
Biostimulation. Metalli e radionuclidi. Metodi di analisi (classici e
molecolari) delle comunità microbiche implicate nella biorimediazione.
Tecniche di biorisanamento in situ ed ex situ. Micorimediazione.
Rimozione azoto e fosforo dalle acque reflue: ossidazione anaerobica
dell’ammonio (ANAMMOX), applicazioni, eco-fisologia e biodiversità dei
batteri ammonio ossidanti. EBPR (Enhanced Biological Phosphorus
Removal) e microrganismi poly-P

Testi in inglese
italian

Bioremediation is an increasingly popular technology for remediation of

contaminated sites. The purpose of this course is to define
bioremediation and to describe the role of microrganisms in environment
remediation.In the first part of the course students will learn the different
metabolic capabilities of microorganisms and how these can be applied
to remediation of contaminated environments. The use of database
specialized in catabolic pathways will be explained. The main
bioremediation technologies will then be illustrated. In the last part,
practical situations, in which the student will see the application of
aquired competences, will be discussed

Barbieri, Bestetti, Galli e Zannoni, "Microbiologia ambientale ed elementi

di ecologia microbica"(2008) Casa Editrice Ambrosiana
Martin Alexander “Biodegradation and Bioremediation” (1999) 2nd Ed.
Academic Press
Some chapters of these texts have been a source of information for
developing the slides shown in lesson. This material is updated every
year in the light of new knowledge, while remaining basic information,
essentially unchanged. Updated slides will be uploaded on the Elly
platform as the lessons take place. For non-attending students the study
of slides must be integrated with the study on the suggested texts
because the information the slides contain is schematic and will be
developed during the lessons even with the discussion of case studies.
The articles discussed will be made available on the Elly platform.
Students who do not attend are warned to check the available teaching
material and directions provided by the teacher through the Elly platform.

The course provides a general introduction to the diverse roles of

microorganisms in bioremediation and solution of different environmental
pollution problems. Students will understand the important aspects of
microbial metabolism for the purification and reclamation of
contaminated sites, such as bioremediation technologies and how they
apply. They will be able to understand a technical report and a
reclamation project at least as far as biological aspects are concerned.
They will be able to read, critically, a scientific article that addresses the
role of micro-organisms in remediation processes and assess the
applicability of the technologies proposed for resolving pollution issues.

General microbiology and microbial metabolism

Frontal lessons and collective discussions of specific items will be

alternated. Students will be asked to prepare two seminars on two
articles selected, among the most recent ones, in the bibliographic
databases In the first seminar the articles should deal with isolation of
microbial strains capable of biodegrading or biotransforming various
types of pollutants, and molecular mechanisms of this degradation. In the
final seminar articles dealing with different types of bioremediation will
be discussed focusing on micro/mesocosm or in field trials of in situ and
ex situ remediation, with the characterization of the microbial
communities involved in the process. In the second seminar the
attending student will be evaluated
For the students attending the lessons, the first seminar will be like an
exercise and will not be evaluated while the final seminar will be
evaluated for: 1) student's ability to select the article on the basis of the
assignments of the teacher; 2) his ability to extract substantial
information from the scientific article and 3) the ability to expose (with
use of slides) the chosen work and discuss the results. At the end of the
seminar, the teacher will ask the student a question about one of the
topics in the program of the course.
For non-attending students, the exam will be oral and will verify if the
student knows the topics developed during lessons, is able to expose and
discuss them and knows how to connect the different aspects
(biochemical, molecular, technological, regulatory) concerning polluted
site reclamation with biological methods.

Organic and inorganic environmental pollutants, natural attenuation,

monitored natural attenuation, bioremediation. The bacterial degradation
of aliphatic and aromatic hydrocarbons and certain classes of
xenobiotics, in particular alogenated in aerobiosis and anaerobiosis.
Evolution and diffusion of catabolic pathways. Bioaugmentation,
Biostimulation. Metals and Radionuclides. Methods of analysis (classical
and molecular) of microbial communities involved in bioremediation.
Biodegradation techniques in situ and ex situ. Mycorimediation (fungi
remediation). Nitrogen and phosphorus removal from waste water:
anaerobic ammonia oxidation (ANAMMOX), applications, eco-physiology
and biodiversity of ammonium oxidants bacteria. EBPR (Enhanced
Biological Phosphorus Removal) and poly-P microorganisms