Le due catene sono antiparallele. Una catena inizia da 3’ 5’ e l’altra 5’
3’. L’RNA polimerasi ha bisogno del primer, Il suo filamento verrà prodotto da 3’ e proseguiamo verso la forcella di duplicazione. Per l’altro filamento non possiamo andare nella stessa direzione per la marcia del DNA polimerasi poiché sono antiparalleli, quindi partiremo da 5’. La DNA polimerasi parte e và verso il punto di biforcazione, a mano a mano che i legami idrogeno si rompono e si apre la catena, il DNA polimerasi può facilmente continuare. Quindi il filamento 3’5’ viene sintetizzato in maniera continua man mano che si apre. Si chiama filamento guida. Per l’altro si parte dal punto di biforcazione e si allontana fino ad arrivare al 5’, per poi staccarsi e ritornare al punto di biforcazione (man a mano che la catena si stacca) per poi sintetizzare l’altro frammento. Quindi viene sintetizzato a frammenti; questi frammenti prendono il nome di Okazaki che verranno legati fra di loro dal DNA ligasi. Quindi grazie alla complementarietà delle basi si poteva anche chiarire quali potevano essere il meccanismo di duplicazione, perché conosciuta la sequenza di nucleotidi, la nuova sequenza sarà complementare a quella di stampo, ciò lo dissero Meselson e Sthaals, però la duplicazione nel dettaglio ce la spiegherà Okazaki. Il legame che avviene fra il gruppo fosfato legato al 5° atomo di C e l’atomo C3’ dello zucchero del secondo nucleotide è un legame fosfodiestere perché il fosforo del fosfato è legato con un legame estere allo zucchero del suo nucleotide ed è legato con un legame estere allo zucchero del secondo nucleotide, quindi questo legame che lega due nucleotidi si chiama fosfodiestere. ESPERIMENTO DI MESELSON E STHAALS Meselson e Sthaals fecero un esperimento che confermava il modello di duplicazione semiconservativo poiché c’erano molte ipotesi come quello conservativo e/o dispersivo. Il semiconservativo diceva ‘’un segmento parentale e l’altro di nuova sintesi’’, il conservativo diceva che la molecola madre si manteneva madre e dà due molecole figlie’’ il dispersivo diceva che un po’ della molecola madre và nella molecola figlia ed un po' della molecola madre và nell’altra molecola figlia. Meselson e Sthaals presero una catena di DNA e la misero in un terreno in cui erano presenti sostanze radioattive; utilizzò alcuni desossiribonucleotidi con all’interno del fosforo radioattivo o l’idrogeno radioattivo come il clizio. Quando gli elementi sono radioattivi, emanano radiazioni che possono essere viste su di una lastra. In questo terrenno avvenne la prima duplicazione del DNA ed osservarono le molecole figlie; capirono che la radioattività era presente in entrambi i filamenti. La prima molecola la misero in questo terreno radioattivo, quindi entrambi i filamenti erano radioattivi, poi presero la molecola radioattiva e la spostarono in un terreno dove c’erano i componenti del DNA ma senza il materiale radioattivo; quindi le nuove catene che si sarebbero sintetizzate non sarebbero state radioattive, anzi videro che si originarono due molecole figlie di cui una conservava un filamento radioattivo, ma nell’altra molecola non c’era radioattività, solo il filamento servito da stampo lo era. Quindi videro che ogni volta che si andava a duplicare, la radioattività andava sempre a diminuire. Quindi è stato dimostrato che un filamento si mantiene nella doppia elica figlia, l’altra è di nuova sintesi. Ecco dimostrato il modello semiconservativo.
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