LOGICAMOLECOLAREDELLAVITA Tuttigliorganismiviventihannoglistessitipidisubunit monomerichechevannoacostituirelemacromolecolebiologiche

LEBIOMOLECOLE:COMPOSIZIONECHIMICA

INARANCIOICOMPONENTISTRUTTURALIDEGLIORGANISMI:DEVONOESSERE ASSUNTIINQUANTITANOTEVOLI INGIALLOELEMENTILACUINECESSITAELIMITATA(SONOPRESENTIINBASSISSIME QUANTITAMAHANNORUOLIESSENZIALI) SOLO30DEI90ELEMENTINATURALISONOESSENZIALIPERGLIORGANISMIVIVENTI IDROGENO,OSSIGENOAZOTOECARBONIORAPPRESENTANOIL99%DELLAMASSA TOTALEDELLAMAGGIORPARTEDELLECELLULE

LACHIMICADEGLIORGANISMIVIVENTIEORGANIZZATA INTORNOALCARBONIO,CHERAPPRESENTAOLTRELA METADELPESOSECCODELLECELLULE

Ilcarboniopuformare legamisingoliodoppicon atomidiossigenoodiazoto. Sipossonoformarecatene carboniocarboniomolto stabili. DueatomidiCpossono condivideredueotrecoppie dielettroni,formandodoppi otriplilegami UnCpulegarealtriquattro C ScheletridiatomidiCcui possonoesserelegati gruppifunzionali

IquattrolegamisingolicheunCpugeneraresono dispostisecondounastrutturaatetraedro

LarotazioneintornoadunlegameCCpuessere influenzatadaltipodigruppofunzionalelegato

UndoppiolegameC=Cpicortoerigidoetuttigli atomigiaccionosullostessopiano

Igruppifunzionalideterminanoleproprietchimiche dellebiomolecole

Moltemolecolesonopolifunzionali,ciocontengono gruppifunzionalidiversi,conproprietadiverse Es.istidina:

REATTIVITACHIMICA
LADISTRIBUZIONEDEIGRUPPIFUNZIONALIALTERALA DISTRIBUZIONEDEGLIELETTRONIELAGEOMETRIADI ATOMIVICINI,MODIFICANDOLAREATTIVITA DELLINTERAMOLECOLA EPOSSIBILEANALIZZAREEPREDIREIL COMPORTAMENTOCHIMICOELEREAZIONIDELLE BIOMOLECOLEINBASEAIGRUPPIFUNZIONALICHE POSSIEDONO LAROTTURAELAFORMAZIONEDILEGAMICHIMICI DURANTEILMETABOLISMOCELLULARERILASCIA ENERGIA,UNAPARTEINFORMADICALORE

STRUTTURATRIDIMENSIONALEDELLE BIOMOLECOLE:
SOLOSPECIFICHEFORMETRIDIMENSIONALIDIUNA BIOMOLECOLA,TRALETANTEPOSSIBILI,SONO QUELLEBIOLOGICAMENTEATTIVE LASTRUTTURATRIDIMENSIONALEDIUNA BIOMOLECOLAEDETERMINANTEPERLINTERAZIONE BIOSPECIFICA

TREDIVERSIMODIDIRAPPRESENTARELASTRUTTURA TRIDIMENSIONALEDIUNAMOLECOLA

ASIMMETRIA:QUANDOALCSONOLEGATIQUATTRO DIVERSIGRUPPI

ESISTEDICONSEGUENZAUNENANTIOMERO

IDUEENANTIOMERISONOSTEREOISOMERI CONFIGURAZIONALI

CHIRALITA

Lamolecolabsovrapponibileallaimmagine specularedellamolecolaa

ISOMERIACISTRANS

ISOMERIADIPOSIZIONEEDICATENA NEGLIALCHENI

STEREOISOMERIA CONFIGURAZIONALECISTRANS

ISOMERICISTRANS POSSONOESSEREISOLATIEPURIFICATI

LEINTERAZIONITRALEBIOMOLECOLE SONOSTEREOSPECIFICHE

STEREOSPECIFICITA:CAPACITADIDISTINGUERE DUEISOMERI

Stereoisomerichevengonoriconosciutidarecettori sensorialidellolfatto

Odoredella menta

Odoredel comino

Stereoisomerichevengonoriconosciutidarecettori sensorialidelgusto

Aspartame (saporedolce)

(saporeamaro)

Laforzadilegamedipende:

Dallaelettronegativitrelativadegliatomiimpegnatinel legame Dalladistanzadeglielettronidilegamedaogninucleo Dallacaricanucleare

LAFORZADILEGAMEVIENEESPRESSACOMEENERGIADILEGAME. SIMISURAINJOULE(J) 1CALORIA=4,18J

NELLACELLULAAVVENGONOCINQUETIPIDI TRASFORMAZIONICHIMICHE
TRASFERIMENTODIGRUPPIFUNZIONALI OSSIDAZIONIERIDUZIONI REAZIONICHERIORGANIZZANOLADISPOSIZIONE DEILEGAMIINTORNOADUNOOPIUATOMIDIC REAZIONICHEROMPONOOFORMANOLEGAMICC REAZIONIDICONDENSAZIONE,CONELIMINAZIONEDI UNAMOLECOLADIACQUA

INMOLTEREAZIONIBIOCHIMICHESONOCOINVOLTEINTERAZIONI TRANUCLEOFILI(GRUPPIFUNZIONALIRICCHIDIELETTRONIEDIN GRADODIDONARLI)EDELETTROFILI(GRUPPIFUNZIONALICARENTI DIELETTRONIECHEPOSSONOCATTURARLE)

LEMACROMOLECOLE BIOLOGICHE

Nelleproteine,negliacidinucleicienei polisaccaridiimonomerisonolegatitraloro tramitelegamicovalenti. Lestrutturetridimensionaliedicomplessi sopramolecolarisonotenutiinsiemeda interazioninoncovalenti,debolise consideratesingolarmente Leinterazionidebolisonofondamentali perilfunzionamentodellemacromolecole biologiche

Iquattrotipidiinterazionidebolitra biomolecole Energiadi

Interazionideboli
Legameidrogenotra C=O::::HO gruppineutri Legameidrogenotra C=O::::HN legamipeptidici Interazioniioniche attrattive Interazioniioniche repulsive Interazioni idrofobiche Interazionidivander Waals

stabilizzazione KJ/mole

821 821

NH3+:::COO NH3+NH3+

42 21 48 4

Legamead idrogeno

Legamiidrogenodiimportanzabiologica

Lattrazionetraleduecaricheelettricheparziali massimaquandoitreatomicoinvoltisonoallineati

InterazionidivanderWaals

RAGGIODIVANDERWAALS Quandodueatominoncarichivengonoatrovarsimolto vicinileloronuvoleelettronichesiinfluenzanoavicenda. Levariazionicasualidellaposizionedeglielettroniintorno alnucleopossonogeneraredipolielettricitransitoriche induconodipolielettricitransitoriedoppostinellatomo vicino.Iduedipolisiattraggonoportandoidueatomi ancorapivicini.Manmanocheinucleisiavvicinanole duenubielettronichecomincianoarespingersifinoache siarriveradunpuntoincuiattrazioneerepulsione esattamentebilanciata

LEINTERAZIONINONCOVALENTITRALE BIOMOLECOLESONOINFLUENZATEDALLEPROPRIETA DELSOLVENTE

PROPRIETASOLVENTIDELLACQUA

Nelghiaccioognimolecoladiacquaformaunmassimodiquattrolegami idrogeno,generandounreticolocristallinoregolare.Allostatoliquidoed atemperaturaambiente,ognimolecoladiacquaformainmedia3,4 legamiidrogenoconaltremolecolediacqua. Lastrutturadelghiacciorigidaeregolare. Allostatoliquidolemolecolesonoincontinuomovimentoequindii legamiidrogenosiformanoesiromponocontinuamente

Lacquaformalegamiidrogenoconisoluti

Lacquainteragisceelettrostaticamenteconisoluticarichi Compostiidrofili Compostiidrofobici

LacquascioglieisalicomeilClorurodisodio idratandoestabilizzandogliioniNa+eCl.Lecariche ionichevengonoparzialmenteannullateedilreticolo cristallinosiindebolisce. Interminidientropia,aumentaildisordine(entropia)e sihaunavariazionedienergialiberafavorevole( G= HTS)

Icompostinonpolarideterminanovariazionienergetiche nonfavorevolinellastrutturadellacqua

Gliacidigrassialungacatenahannocatenealchilicheidrofobicheche vengonocircondatedaunostratoaltamenteordinatodiacqua.

Raggruppandosiinmicelleespongonounaminoresuperfichepercuilo stratoordinatodacquadiminuisce

LEINTERAZIONIDEBOLISONOFONDAMENTALI PERLASTRUTTURAELAFUNZIONEDELLE MACROMOLECOLE IlDNAeleproteinecontengonotantisitipotenziali perlaformazionedilegamiidrogeno,vander Waals,idrofobici,(ionici) Leffettocumulativodituttiquestilegamideboli diventaenorme Lastrutturapistabilequellaincuiilmaggior numerodipossibilitdiformazionedilegami debolisoddisfatta