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 In
enzimologia
il reagente da trasformare in prodotto viene denominato
Substrato S
.  Il meccanismo prevede la formazione del complesso
 Enzima-Substrato [ES] 
 ,intermedio rispetto alla liberazione del
 Prodotto [P ]
e al ripristino dell’
 Enzima (E)
.Schema generale di una reazione catalizzata da un enzima: la prima tappa è la pveloce e quindi la
velocità
dell’intera reazione catalizzata
 dipenderà
dalla
 seconda  tappa lenta
. Entrambe le tappe sono
 reversibili
.
tappa veloce tappa lenta limitante la velocità di reazioneGliGli enzimienzimi sonosono modulabilimodulabili nellanella loroloro attivitàattività cataliticacatalitica dada parteparte didi varivari fattorifattori (temperatura,(temperatura, pH,pH, piccolepiccole molecole,molecole, ioni,ioni, ecc),ecc), perper consentireconsentire l’accelerazionel’accelerazione oo ilil rallentamentorallentamento delledelle reazionireazioni cheche catalizzanocatalizzano..
 
I
 sitisiti attiviattivi
, a forma di nicchie o fenditure, sono spazi tridimensionali situati entro la proteinaglobulare e in essi sono presenti:
Il
 complessocomplesso ESES
 si forma in una regione dellenzima,denominata
 sitosito attivoattivo
, che occupa normalmente non più del5% dell’area totale della superficie della molecola enzimatica.
Il sito attivo Il sito attivo
 
1) catene laterali di AA idrofobici per la creazione di un ambiente privo di acqua, simile alvuoto, ambiente ideale per l’accelerazione delle reazioni, rallentate invece dalle molecole diacqua.2) catene laterali di AA polari per formare legami deboli (legami H, ionici, di van der Waals)con i substrati per attuare il loro posizionamento nel sito attivo. Essendo questi legamideboli, il posizionamento dei substrati è facilmente reversibile;3) catene laterali di AA polari spesso cariche, di norma in numero non superiore a 5, confunzione di reattività catalitica, chiamati appunto residui catalitici, attivi nella trasformazionedi
 SS
 in
 PP
.
 
L’energia di attivazioneL’energia di attivazione
stato di transizionestato di transizione
Il substrato
 SS
 per esseretrasformato in
 PP
 deve passareattraverso lo stato di transizione
S
che è la specie molecolarepiù altamente reattiva di
 SS
, labilee instabile, facile da trasformare:lo stato di transizione
 S
è statoparagonato ad una biglia sullapunta di un ago per indicare cheGli enzimi
 abbassanoabbassano l’energial’energia didi attivazioneattivazione
 e aumentano la velocità delle reazionisenza modificare la costante di equlibrio (Keq).è uno stato critico che potrebbetrasformarsi in
 PP
 come pure dinuovo in
 SS
.L’energia necessaria per portarele molecole
 SS
 allo stato
 S
chiamato
 statostato didi transizionetransizione
, èdefinita
 energiaenergia didi attivazioneattivazione
.

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