Bioinformatica

DOCENTI DEL CORSO: Dott. Alessandro Paiardini alessandro.paiardini@uniroma1.it Prof. Stefano Pascarella stefano.pascarella@uniroma1.it

Via degli Apuli 9 Tel. 06/49917700

Wikipedia

Cos la Bioinformatica?
La bioinformatica una disciplina scientifica dedicata alla risoluzione di problemi biologici con metodi informatici

Cos la Bioinformatica?
un indispensabile strumento di lavoro per il biologo moderno una nuova disciplina, che coniuga lo studio del vivente con linformatica l'insieme degli strumenti informatici, delle relative applicazioni e delle ricerche che possono essere prodotte tramite tali strumenti e tali applicazioni nei diversi settori della biologia e della medicina

una scienza che utilizzando le metodiche delle Scienze dellInformazione si occupa del trattamento e dellanalisi dei dati di tipo biologico una scienza multidisciplinare che integra conoscenze informatiche, chimiche, matematiche, biologiche allo scopo di collezionare ed elaborare sistematicamente ogni informazione per ottenere la massima resa dalle ricerche sperimentali ma anche per sviluppare queste ultime in modo pi mirato lo studio del vivente attraverso gli strumenti propri dellinformatica

BIOINFORMATICA:

VITA + INFORMAZIONE!

Che cos la vita?

Che cos linformazione?

Mi scusi, devo consegnare un pacco allUniversit La Sapienza: sa dirmi la strada? Certo! Giri alla prima a destra, poi al semaforo a sinistra, e prosegua diritto fino a P.le Aldo Moro

Che cos linformazione?

Mi scusi, devo consegnare un pacco allUniversit La Sapienza: sa dirmi la strada? Certo! Poi a sinistra, e diritto, a destra prima alla giri, fino a prosegua P.le Aldo Moro

Informazione: dato + struttura!

linformazione sempre strettamente correlata al concetto di dato, un osservabile presentato alla conoscenza, e di struttura, lorganizzazione ordinata del dato, che ne permette lapprendimento.

La Bioinformatica una scienza multidisciplinare

inf or ma ti c a

fisica

a ti c ma e t ma

Bioinformatica
a tic tis a t s

ch im ica

biologia

I 10 problemi principali per i quali un BiologoBiologo-nonnoninformatico si rivolge ad un Bioinformatico Bioinformatico

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. Che cosa fa questo gene/proteina? Con quali altri geni/proteine imparentato il mio gene/proteina? Puoi predire la struttura tridimensionale di questa proteina? Mi dici con quali altre proteine interagisce la mia proteina? Quali segnali (promotori, enhancer) sono presenti nel mio gene? Quali motivi strutturali sono presenti nella mia proteina? Quali residui della mia proteina devo mutare per farle acquisire una determinata funzione? Puoi progettare un inibitore/farmaco di questa proteina? Puoi scrivermi un programma per analizzare i miei dati?

10. Nel mio computer c un Virus!!! AIUTOOO!!!!

Cos la Bioinformatica?
l'insieme degli strumenti informatici, delle relative applicazioni e delle ricerche che possono essere prodotte tramite tali strumenti e tali applicazioni nei diversi settori della biologia e della medicina.

Gli strumenti della Bioinformatica

Internet Computer

Dati biologici

Reti informatiche

Le applicazioni della Bioinformatica

Basi di dati biologici Reti neurali

Allineamenti di sequenze Analisi e predizione di strutture proteiche Analisi di genomi Alberi filogenetici

Drug design

sempre dalla rete

in un futuro non troppo lontano potremmo essere in grado di costruire e far funzionare una

cellula virtuale (e-cell)

in cui progettare e realizzare esperimenti virtuali, con grande risparmio di risorse sia economiche che umane e animali