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tumor suppressor genes has allowed Kinzler and Vogelstein (Nature 386:761,
1997) to propose a new subdivision of this vast gene family in two categories,
namely gatekeepers and caretakers.
Gatekeepers sono
Caretakers funzionano
benzopirene
aflatossina
Amina aromatica
Aflatoxins
Asbestos
Benzene
Cadmium
Coal tar
Creosote
DDT
Polycyclic aromatic
hydrocarbons
Radon
Solar radiation
Adriamycin (doxorubicin)
Androgenic steroids
Chlorambucil
Cisplatin
Cyclophosphamide
Cyclosporin A
Diethylstilbestrol
Ethylene oxide
Melphalan
Tamoxifen
Carcinogeni fisici
Ultraviolet light
Ionizing radiation (X-rays)
Asbestos
Micro-environment
malondialdehyde
4-hydroxynonenal
Deaminazione spontanea
Centinaia di uracile per genoma /giorno
Adenina ipoxantina
Guanina Xantina
5-metil-citosina Timina
DANNI DA RADIAZIONE UV
7-9
bending
44
bending
% of total daily
damage
Single-strand break
120000
50.9
N7-MethylGuanine
> 4000
35.6
> 10000
10.2
O6-MethylGuanine
3120
1.3
Oxidized DNA
2880
1.2
Depyrimidation
1320
0.5
Cytosine deamination
360
0.2
Double-strand breaks
0.01
Interstrand cross-links
0.01
TYPE OF DAMAGE
Depurination
Thymine-DNA-glycosilase
4-hydroxy
pentenal-fosfato
(-eliminazione)
PG fosfo-glicolato
(radiazioni ionizzanti)
PARP1
poli(ADP)riboso polimerasi
Riconosce interruzioni
PNK
Polinucleotide kinasi/3
-fosfatasi
Elimina 3P
Riparo SingleStrandBreak
XRCC1
FEN1
Flap endonuclease
Elimina vecchio filamento
RFC
PCNA
RPA
CARATTERISTICHE DEL
BASE EXCISION REPAIR (BER)
Il sistema di riparo BER non rappresentato da un
singolo complesso enzimatico ma da una serie di sistemi
enzimatici specifici per i vari tipi di danno a carico delle
basi del DNA
Nonostante la molteplicit dei sistemi enzimatici coinvolti
il processo avviene attraverso due soli meccanismi
generali (SP-BER e LP-BER)
Il sistema di riparo BER si evoluto per il ripristino di
modificazioni che avvengono naturalmente a carico delle
basi o per il ripristino di danni che mimano quelli di tipo
naturale
Trans-Lesion Synthesis
( TLS ) :
Processo difettivo in una
minoranza i casi che costituiscono
la forma variante di XP ( XPV),caratterizzata da insorgenza
tardiva e lenta progressione dei
sintomi;
Opera durante la fase S del ciclo
cellulare e permette al complesso
deputato alla replicazione del
DNA di superare il blocco
costituito dalla presenza di un
danno.
NUCLEOTIDE-EXCISION
REPAIR ( NER )
2 sotto-pathways:
Global-genome NER
( GG-NER ):
Rimuove le lesioni nei
filamenti trascritti e non
trascritti dei geni attivi e
non attivi
Transcription-coupled
NER ( TC-NER ):
Rimuove le lesioni dei
filamenti trascritti dei
geni attivi
A specialized NER
subpathway guarding
against mutations in
actively transcribed
genes
TFIIH viene reclutato attraverso linterazione diretta con XPC attraverso XPB
e p62 ( 62 kDa subunit )
TFIIH interagisce anche con RNA polimerasi II,CSA e CSB del TCR
XPB e XPD
Mostrano 7 motivi conservati con le DNA elicasi
ATP-dipendenti :
XPB
attivit 3 5 elicasi
XPD
attivit 5 3 elicasi ( stimolata
fortemente dallinterazione con p44 subunit
di TFIIH; molte mutazioni identificate nei
pazienti XP-D compromettono tale
interazione )
Pre-incision complex
Introduzione di rotture a singolo filamento nel
filamento danneggiato:
CH3
CH3
CH3
MutL
MutH, ATP
ADP+Pi
CH3
5
3
5
3
CH3
MutS
CH3
MutS
MutH
MutL MutH
CH3
1. Mismatch within 1 kb of
methylated GATC
5. Endonuclease of MutH
cleaves unmethylated DNA
at hemimethylated GATC
Microsatelliti
HNPCC=Hereditary
Non-polyposis colon
cancer
STRAND-BREAK REPAIR
Le radiazioni ionizzanti ed alcuni agenti chimici possono produrre rotture
che riguardano
la singola elica (single-strand breaks o SSBs)
la doppia elica (double-strand breaks o DSBs)
I meccanismi di riparo per gli strand-breaks sono essenziali per la
sopravvivenza della cellula
Le rotture nella singola elica vengono riparate attraverso un solo tipo di
meccanismo
Single-strand breaks repair (SSBR)
Le rotture nella doppia elica possono essere riparate attraverso due tipi
di meccanismo
Double-strand breaks repair by non-homologous end joining (NHEJ)
Double-strand breaks repair by homologous recombination (HR)
FORMAZIONE DI DSBs
Formazione dei DNA double-strand breaks (DSBs). I DSBs doppi (two-ended) possono
formarsi quando il DNA duplex rotto in due frammenti, ad esempio a causa di radiazioni. I
two-ended DBSs possono essere riparati attraverso la homologous recombination (HR) usando
i cromatidi fratelli intatti, oppure attraverso la non-homologous DNA end-joining (NHEJ) che
per pu portare ad un riarrangiamento della sequenza. I DSBs singoli (one-ended) si
generano quando la forca di replicazione incontra un single-strand DNA break che non stato
riparato. In questo caso la homologous recombination tra i cromatidi fratelli affiancati nella
forca di replicazione il meccanismo di riparo preferito e pi accurato.
Riparo:
HDR:homology-directed-repair
NHJE
NHEJ
Il meccanismo di riparo NHJE si basa su attivit proteiche importanti
HR
Strand resection:
Generazione di 3 ssDNA tails
da parte del complesso MRN
(Mre11, Nbs1 e Rad50)
Coating:
RPA (ssDNA binding) copre il
tratto ssDNA
RAD loading:
Rad51 ed altre proteine
(Rad52, Rad54, BRCA-1 e
BRCA-2) formano un
complesso che promuove
linvasione e lappaiamento
con la sequenza omologa
non danneggiata
Stand invasion and repair:
Una volta che lelica interrotta
appaia con la sequenza
omologa la DNA polimerasi
ripara linterruzione
Functions of BRCA1
Ubiquitination, DNA repair, transcriptional regulation
RING
BRCT
p53
RAD51
RB1
BRCA2
MSH2
ZBRK1
RAD50
CtIP
RNA Hel A
MSH2
ER
p300/CBP
BACH1
BRCA2
RPA:replication protein A
RAD51:recombinase
Gudmundsdottir K and Ashworth: The role of BRCA1 and BRCA2 and associated proteins in the maintenance of genomic stability
Oncogene 2006 25:5864
Weinberg and colleagues2 show that alterations in at least four pathways are needed.
Tumour formation can be mimicked in the laboratory by delivering the catalytic hTERT
subunit of telomerase (which maintains telomere length), combined with SV40 large-T
antigen, LT (which inactivates both the p53 and retinoblastoma (pRb) pathways), and an
activated ras oncogene (which induces transformation to a cancerous state, allowing
cells to grow indefinitely in the absence of growth factors). Nature 1999
Barbara Mc Clintock negli anni 30 not come cromosomi frammentati tendono a fondersi
mentre quelli normali sono pi stabili. Nel 1988 i telomeri vennero sequenziati.
Telomeri: sequenze ripetute migliaia di volte. Critical point: alcune centinaia di copie. Se lerosione continua si
ha perdita di informazione subtelomerica, ricombinazione, instabilit e aneuploidia. Lo switch della
telomerasipPreviene il fenomeno. Questo avviene in alcune cellule embrionali, in cellule staminali adulte e cellule
del sistema immunitario.
Telomeri: lunghezza:
9-15 kb in humans
fino a 100 Kb in mouse
shelterine
Dominante
negativo di
TRF2 attiva
ATM
ACD: adrenocortical
Displasia: displasia
delle ghiandole, perdita
della linea germinale
maschile e
iperpigmentazione
della pelle.
p53-defective:
I topi si sviluppano
normalmente,
liperpigmentazione
scompare. Fenotipo
normale ma..
Carcinomi!
Topi mutati TPP1acd/acd hanno difetti nel capping dei telomeri che porta ad una displasia
adrenocorticale. Spesso c morte in utero. Che succede se si toglie p53? Incroci con topi
p53-/-. I topi vivono e stanno meglio, per sviluppano carcinomi (non sarcomi come nel caso
di p53 -/-) come TERC -/- p53+/-. Molte traslocazioni. Come negli anziani?
(Else et al. 2009 Cancer Cell 15, 465)
Repressor in
shelterin
Repressor
ATM
TRF2
ATR
POT1a
NHEJ
TRF2
HDR
Rap1+Pot1
Ku70/80
Alt-NHEJ
reduntant
Ku70/80
5-resection
Reduntant?
53BP1
Telomeri: lunghezza:
9-15 kb in humans
fino a 100 Kb in mouse
shelterine
Dominante
negativo di
TRF2 attiva
ATM
ACD: adrenocortical
Displasia: displasia
delle ghiandole, perdita
della linea germinale
maschile e
iperpigmentazione
della pelle.
p53-defective:
I topi si sviluppano
normalmente,
liperpigmentazione
scompare. Fenotipo
normale ma..
Carcinomi!
Topi mutati TPP1acd/acd hanno difetti nel capping dei telomeri che porta ad una displasia
adrenocorticale. Spesso c morte in utero. Che succede se si toglie p53? Incroci con topi
p53-/-. I topi vivono e stanno meglio, per sviluppano carcinomi (non sarcomi come nel caso
di p53 -/-) come TERC -/- p53+/-. Molte traslocazioni. Come negli anziani?
(Else et al. 2009 Cancer Cell 15, 465)
Repressor in
shelterin
Repressor
ATM
TRF2
ATR
POT1a
NHEJ
TRF2
HDR
Rap1+Pot1
Ku70/80
Alt-NHEJ
reduntant
Ku70/80
5-resection
Reduntant?
53BP1