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DI LABORATORIO
Proff. Vittorio Sambri, Davide Treré, Luca Morandi; Prof.ssa Monica Cricca
a cura di
ר ו פ א ס ב י ר ל ע ת יד
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Medicina di laboratorio
Indice
PREFAZIONE E RINGRAZIAMENTI ........................................................................................................................................... 6
PROGRAMMA D’ESAME.......................................................................................................................................................... 7
M0. INTRODUZIONE ALLA MICROBIOLOGIA CLINICA .......................................................................................................... 11
M1. CONCETTI BASE DELLA MICROBIOLOGIA CLINICA ........................................................................................................ 12
M1.1 MICROBIOTA ............................................................................................................................................................ 12
M1.2 DISBIOSI ................................................................................................................................................................... 14
M1.3 COLONIZZAZIONE .................................................................................................................................................... 14
M1.4 SEPSI ......................................................................................................................................................................... 19
M2. MICROBIOLOGIA DELLE INFEZIONI DELLE ALTE E BASSE VIE AEREE ............................................................................ 20
M2.1 INTRODUZIONE ........................................................................................................................................................ 20
M2.2 INFEZIONI DELLE ALTE VIE RESPIRATORIE ............................................................................................................... 21
M2.3 INFEZIONI DELLE BASSE VIE RESPIRATORIE ............................................................................................................. 24
M2.4 INFEZIONI FUNGINE ................................................................................................................................................. 50
M3. MICROBIOLOGIA DELLE INFEZIONI DEL TRATTO GASTRO-INTESTINALE...................................................................... 61
M3.1 CARATTERISTICHE DELLE INFEZIONI DEL TRATTO GASTRO-INTESTINALE .............................................................. 61
M3.2 HELICOBACTER PYLORI ............................................................................................................................................ 62
M3.3 DIARREA INFETTIVA ................................................................................................................................................. 63
M3.4 INFEZIONI VIRALI...................................................................................................................................................... 73
M3.5 INFEZIONI DA AGENTI EZIOLOGICI PROTOZOARÎ .................................................................................................... 73
M3.6 INFEZIONI ELMINTICHE............................................................................................................................................ 76
M4. MICROBIOLOGIA DELLE INFEZIONI DELL’APPARATO CARDIOVASCOLARE .................................................................. 78
M4.1 INFEZIONI DEL CUORE ............................................................................................................................................. 78
M4.2 INFEZIONI DEL TORRENTE CIRCOLATORIO (BLOODSTREAM INFECTIONS – BSI) .................................................... 82
M5. MICROBIOLOGIA DELLE INFEZIONI DEL SISTEMA NERVOSO ........................................................................................ 93
M5.1 VIE DI INFEZIONE...................................................................................................................................................... 93
M5.2 CLASSIFICAZIONE DELLE MENINGITI ....................................................................................................................... 94
M5.3 SEGNI CLINICI DELLE MENINGITI ............................................................................................................................. 95
M5.4 MENINGITI A LIQUOR TORBIDO ............................................................................................................................... 95
M5.5 MENINGITI A LIQUOR LIMPIDO ............................................................................................................................. 100
M5.6 MENINGO-ENCEFALITI A LIQUOR LIMPIDO ........................................................................................................... 100
M5.7 ASCESSI CEREBRALI ................................................................................................................................................ 109
M5.8 MIELITI INFETTIVE .................................................................................................................................................. 110
M5.9 DIAGNOSI DI LABORATORIO .................................................................................................................................. 110
M6. MICROBIOLOGIA DELLE INFEZIONI DELLE VIE URINARIE............................................................................................ 114
M6.1 CLASSIFICAZIONE DELLE INFEZIONI DELLE VIE URINARIE ...................................................................................... 114
M6.2 MODALITÀ D’INFEZIONE ........................................................................................................................................ 114
M6.3 MICROBIOTA DELLE VIE URINARIE......................................................................................................................... 115
M6.4 MECCANISMI DI DIFESA DELL’OSPITE .................................................................................................................... 115
M6.5 FATTORI DI RISCHIO DELL’OSPITE .......................................................................................................................... 115
M6.6 EZIOLOGIA DELLE UTI ............................................................................................................................................. 116
M6.7 SINTOMI DELLE UTI ................................................................................................................................................ 121
M6.8 DIAGNOSI E URINOCOLTURA ................................................................................................................................. 122
M7. MICROBIOLOGIA DELLE INFEZIONI PROTESICHE E CUTANEE .................................................................................... 125
M7.1 INTRODUZIONE AL PROBLEMA .............................................................................................................................. 125
M7.2 CLASSIFICAZIONE DELLE INFEZIONI ....................................................................................................................... 126
M7.3 DIAGNOSI DI INFEZIONE PROTESICA RITARDATA .................................................................................................. 127
M7.4 DERMATOFITOSI .................................................................................................................................................... 130
APPENDICE: CASI CLINICI ED ESEMPÎ DI DOMANDE .......................................................................................................... 132
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Medicina di laboratorio
PREFAZIONE E RINGRAZIAMENTI
Questa dispensa di Medicina di laboratorio contiene le sbobine fatte dagli studenti del canale B iscritti al
terzo anno del corso di laurea in Medicina e Chirurgia presso l’Alma Mater Studiorum, durante l’A.A.
2021/2022.
Le lezioni sono state tenute dal prof. Vittorio Sambri per la parte di Microbiologia clinica, dal prof. Davide
Treré per la parte di Patologia clinica e dal prof. Luca Morandi per la parte di Biochimica clinica.
La parte di Microbiologia clinica si basa prevalentemente sulle lezioni della prof.ssa Monica Cricca, ampliate
con argomenti trattati dal prof. Sambri.
Le varie sbobinature sono state rilette e controllate, nonché unificate da me, Q. U.
Desidero, acciò, in questa sede ringraziare sbobinatori e revisori che hanno contribuito colle loro prestazioni
alla realizzazione di questa dispensa.
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Medicina di laboratorio
PROGRAMMA D’ESAME
Il corso integrato di Farmacologia comprende tre moduli:
1. Microbiologia clinica (2 CFU) – prof. Vittorio Sambri – prof.ssa Monica Cricca;
2. Patologia clinica (2 CFU) – prof. Davide Treré;
3. Biochimica clinica (1 CFU) – prof. Luca Morandi.
Microbiologia clinica:
• Diagnosi di laboratorio delle patologie infettive: metodi e valore clinico del dato microbiologico.
Microbiologia delle infezioni delle alte e basse vie respiratorie e infezioni nel paziente
immunocompromesso. Microbiologia delle infezioni dell’apparato gastro-enterico ed
intraddominali. Microbiologia delle infezioni delle vie urinarie. Microbiologia delle infezioni di cute,
ossa e articolazioni. Infezioni delle protesi articolari. Microbiologia delle infezioni dell’apparato
cardiocircolatorio e sepsi. Microbiologia delle infezioni del sistema nervoso centrale. Microbiologia
delle zoonosi.
Patologia clinica:
• Le proteine sieriche. [Separazione elettroforetica delle proteine sieriche; profili elettroforetici
associati a patologie specifiche; proteine della fase acuta e velocità di eritrosedimentazione (VES).] Il
laboratorio nella valutazione della funzione emostatica. [Indagini di laboratorio per la valutazione
della funzionalità piastrinica, della fase plasmatica della coagulazione e del sistema fibrinolitico;
indagini di laboratorio per la definizione degli stati di ipercoagulabilità.] Diagnosi di laboratorio della
coagulazione intravasale disseminata (CID). [Fisiopatologia della CID; indici di attivazione del
sistema della coagulazione; indici di attivazione del sistema fibrinolitico; indici di consumo dei fattori
della coagulazione.] Diagnosi di laboratorio delle dislipoproteinemie. [Lipoproteine plasmatiche e
loro metabolismo; lipoproteine ed aterosclerosi; valutazione quantitativa e qualitativa dell'assetto
lipoproteico.] Il laboratorio nella valutazione diagnostica del diabete. [Classificazione del diabete;
alterazioni metaboliche del diabete; esami di laboratorio per la diagnosi del diabete e per il controllo
del paziente diabetico.] Il laboratorio nella valutazione diagnostica dei disturbi dell'equilibrio acido-
base. [Quadri di laboratorio delle acidosi e delle alcalosi respiratorie e metaboliche; l'emogasanalisi
nella definizione diagnostica dei disturbi semplici e complessi dell'equilibrio acido-base.] Esami di
laboratorio di primo livello per lo studio della funzionalità epatica. [Bilirubina e urobilinogeno;
enzimi sierici indicatori di citolisi e di colestasi, rapporto albumina / globuline; fattori della
coagulazione.] Esami di laboratorio per lo studio delle funzionalità renale. [Esame delle urine
(chimico, fisico e del sedimento); determinazione della concentrazione ematica di composti azotati
non proteici (uremia - BUN, creatininemia e uricemia), prove di clearance, prove funzionali di
diluizione e di concentrazione.]
Biochimica clinica:
• Biochimica Clinica e Biologia Molecolare Clinica: inquadramento nell’ambito della Medicina di
laboratorio, finalità e limiti. Biomarcatori. Fase pre-analitica, analitica, post-analitica e
standardizzazione di un test di laboratorio. Fonti di variabilità biologica. Proprietà diagnostiche dei
test di laboratorio. Prelievo, raccolta e validità dei campioni per la diagnostica di laboratorio.
Sensibilità, specificità, valori predittivi, curve ROC e validazione clinica nei test di laboratorio.
Medicina personalizzata: nuovi approcci diagnostici e bioinformatici nel comprendere le basi
biologiche delle malattie; caratterizzazione del singolo paziente a seconda delle modificazioni
genetiche ed epigenetiche per una opportuna stratificazione e adozione delle terapie più efficaci.
Sviluppo di test diagnostici, prognostici e predittivi attraverso metodi di Next Generation e nanopore
Sequencing. Principi di epigenetica. Utilizzo di biomarcatori genetici ed epigenetici in oncologia e
nelle malattie neurologiche. Eterogeneità tumorale e sequenziamento a singola cellula. Biopsia
liquida: valutazione dell'evoluzione tumorale o della malattia neurodegenerativa attraverso
biomarcatori a DNA/RNA da plasma, CSF, saliva, urine. Utilizzo di tool bioinformatici nell'analisi di
dati ottenuti tramite saggi di Next Generation Sequencing e radiogenomica. La diagnostica di
laboratorio liquorale nelle patologie del SNC.
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Medicina di laboratorio
Testi consigliati
• Murray Patrick et al., Microbiologia Medica, EDRA.
• Marcello Ciaccio e Giuseppe Lippi, Biochimica Clinica e Medicina di Laboratorio, EdiSES.
Contatti
• Prof. Vittorio Sambri à vittorio.sambri@unibo.it
• Prof. Davide Treré à davide.trere@unibo.it
• Prof. Luca Morandi à luca.morandi2@unibo.it
Modalità d’esame
A ogni candidato verranno formulate due domande su argomenti di due delle tre discipline selezionate dalla
commissione. Nel caso in cui lo studente ne facesse richiesta, verrà posta una terza domanda inerente la
disciplina non oggetto delle prime due. Il voto finale corrisponderà alla media dei voti ottenuti nelle singole
prove.
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PARTE I
MICROBIOLOGIA
CLINICA
Microbiologia clinica
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Microbiologia clinica
La microbiologia clinica è importante perché permette di passare dal germe (che è quello che si studia in
microbiologia medica) al paziente.
Si potrebbe fare un paragone tra la concezione del mondo tolemaica e quella copernicana: la microbiologia
medica è come la prima (la Terra – corrispondente al microbo – è al centro dell’universo), mentre la
microbiologia clinica coincide con la seconda (il Sole al centro corrisponde al paziente). Quello che spetta a
noi, ora, è pensare al microrganismo nel quadro clinico di un paziente.
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Microbiologia clinica
M1.1 MICROBIOTA
Il microbiota è l’insieme di microorganismi che colonizzano (vivendo in simbiosi) il corpo umano, i quali
risultano assolutamente necessarî per
esso. Può essere localizzato in diversi
distretti anatomici e ad oggi può essere
considerato un “organo accessorio” con
funzioni omeostatiche e metaboliche.
Perfino zone fino a qualche tempo fa
ritenute sterili, come le basse vie
respiratorie, si è scoperto che ospitano una
particolare tipologia di microbiota, il
microbiota polmonare. Seppur in costante
evoluzione durante la vita di ciascun
individuo, è fondamentale mantenerne
l’equilibrio. Per avere un’idea
dell’importanza che assume nell’organismo si può pensare che il peso totale dei germi che compongono il
microbiota sia superiore ai 2 kg (in un uomo adulto che pesa all’incirca 70 kg) ed equivale a miliardi di
microorganismi. Attualmente si conoscono più di 40.000 specie batteriche e 9,9 milioni di geni che
compongono questo sistema, al momento sono stati individuati geni di specie ancora sconosciute. Si
potrebbe pensare di studiare il microbiota intestinale attraverso la coltura delle feci o con svariati cicli di
PCR; tuttavia, entrambi i metodi risultano fortemente limitativi. Il primo a causa di tutte quelle specie che
faticano a crescere in coltura o che hanno bisogno di specifici terreni per poter crescere. Il secondo perché è
necessario conoscere in precedenza le specie che si vanno a ricercare.
La metodologia che al momento risulta più efficace è invece la metagenomica, una tecnica moderna che
utilizza il gene 16S rRNA, importantissimo in tassonomia perché nei batteri costituisce una sorta di targa
genetica, poiché rappresentato in modo continuativo in una determinata specie. La tassonomia batterica più
comune è proprio quella che si basa sulle caratteristiche del gene 16S rRNA. Durante gli studî, per rendere il
processo più snello, vengono osservate solo alcune delle 9 sequenze variabili (solitamente la 3 e la 4)
all’interno del gene 16S rRNA. Questo perché alcune sequenze presentano una “banca dati” più consistente.
La regione 9, in particolare è considerata la più interessante poiché presenta materiale per differenziare due
microorganismi distinti. Nel complesso la tecnica permette di distinguere due specie diverse e addirittura
due genotipi diversi della stessa specie. Per far ciò si parte dalla PCR, con la quale si ottengono le sequenze
d’interesse, queste sono poi sequenziate attraverso la next generation sequencing (NGS).1 Conoscere la
costituzione del microbiota è importantissimo per poter regolare situazioni a rischio come la disbiosi:
variazione nel rapporto fra le varie specie batteriche.
1
Next generation sequencing (NGS): tecnologia innovativa e altamente versatile che permette il sequenziamento in
parallelo di milioni frammenti di DNA; questo permette di eseguire analisi di molteplici geni contemporaneamente, con
una resa diagnostica superiore al sequenziamento tradizionale, accorciando drasticamente i tempi dell’analisi genetica.
Le migliaia di sequenze analizzate sono messe assieme da un sistema bioinformatico altamente preciso che fornisce la
sequenza più probabile.
Sequenziamento di Sanger (SGS): è il metodo di sequenziamento di prima generazione sviluppato da Fredric Sanger nel
1977. Comprende l'incorporazione selettiva di desossinucleotidi che terminano la catena da parte della DNA polimerasi
durante la replicazione del DNA in vitro. Questa tecnica di sequenziamento permette di ottenere due sole sequenze a
partire da un segmento e per questo un errore su una delle due sequenze ha un peso ingente sullo studio, che
corrisponde al 50%.
12
Microbiologia clinica
[Dalla dispensa Cricca] In questa immagine vengono mostrate diverse specie batteriche e lieviti che possono
colonizzare diversi tratti dell’organismo.
A livello della cute, ad esempio, risiedono gli Stafilococchi coagulasi negativi che vengono chiamati così per
essere distinti dallo Staphylococcus aureus, l’unico in grado di produrre coagulasi. Tra gli stafilococchi
coagulasi negativi che possono risiedere nella cute ci sono lo Staphylococcus haemolyticus e lo S. epidermidis.
Sempre nella cute possono risiedere dei Corynebacteria, come il C. jeikeium o il C. striatum, che in alcune
situazioni possono mutarsi da batterî residenti a batterî patogeni, soprattutto nei pazienti diabetici. C’è anche
il Pityrosporum ovale o Malassezia furfur, un lievito residente nella cute che si può trasformare anche in
patogeno.
Si possono vedere anche diversi microorganismi presenti nel tratto urogenitale, che sono presenti
soprattutto a livello dell’uretra, tra cui l’Ureaplasma parvum e il Corynebacterium aurimucosum.
A livello dello stomaco e dell’intestino abbiamo Helicobacter pylori e anche dei batterî anaerobi, come il
Bacteroides fragilis o il B. thetaiotaomicron, i quali, nei casi di pazienti che soffrono di mucositi (e che quindi
possono avere soluzioni di continuità della mucosa intestinale), possono passare nel torrente ematico e
causare sepsi. Sempre in questa zona si possono trovare diverse specie di Streptococchi, molti Lactobacilli,
come il L. gasseri, il L. casei e il L. reuteri.
Nella cavità orale, faringe e sistema respiratorio risiedono la Candida albicans, le specie apatogene di
Neisseria, come la N. sicca, e gli Streptococchi viridanti, tra cui lo S. salivarius. Questi ultimi in caso di
operazioni dentistiche possono dare sepsi a intermittenza e, in caso di problemi cardiaci, possono insidiarsi
a livello delle valvole cardiache e dare una patologia, l’endocardite. La Candida albicans invece in soggetti
immunodepressi può dare il mughetto.
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Microbiologia clinica
M1.2 DISBIOSI
La disbiosi porta alla perdita della condizione di equilibrio del microbiota, nota come eubiosi. Per cambiare
lo stato del microbiota da eubiosi a disbiosi bastano 2 sole compresse di antibiotico, a seguito delle quali per
tornare a una condizione normale sono necessarî 6 mesi. L’equilibrio è quindi molto precario.
[Dalla dispensa Cricca] Un disequilibrio del microbiota è spesso associato ad una serie di condizioni che
possono avere esiti negativi nell’ospite. Infatti, nel neonato, dove inizia la colonizzazione da parte del
microbiota, ci sono dei batterî che sono in grado, prima dello svezzamento, di metabolizzare dei prodotti della
dieta che l’ospite non è ancora in grado di metabolizzare autonomamente, contribuendo quindi alla sua
nutrizione. Inoltre, con lo sviluppo del sistema immunitario, il microbiota può interferire con l’attecchimento
di specie patogene e quindi proteggere il soggetto dalle infezioni. Di conseguenza la disbiosi può essere una
concausa di diverse patologie, tra cui l’asma, l’eczema, l’intestino irritabile, il morbo di Alzheimer o
l’osteoporosi. Si parla comunque di una associazione, non di una chiara azione patogenetica nell’assetto di
questa tipologia di patologie.
Bisogna prestare attenzione ad articoli talvolta allarmistici riguardanti la disbiosi e lo sviluppo di autismo o
altre patologie, in quanto basati su studi condotti su modelli animali, perciò privi di validità scientifica per
l’uomo.
M1.3 COLONIZZAZIONE
Per colonizzazione si intende la presenza di un particolare microorganismo in una sede del corpo, nello
specifico si tratterà di batterî patogeni, che migrano principalmente alla rinofaringe, orofaringe e cavità
rettale. La loro presenza è completamente asintomatica, non è associata a una produzione di anticorpi e
quindi non causa una risposta immunitaria da parte dell’organismo ospite.
Vengono detti colonizzatori perché presenti in numero cospicuo, tanto da essere rilevati dagli strumenti di
campionamento: ad esempio, lo Staphylococcus aureus e la sua colonizzazione a livello delle coane nasali
può essere rilevato tramite tampone.
Alcune tipiche colonizzazioni sono quelle da:
• Neisseria meningitidis (nello 0-15% della popolazione fra i 0 e 18 anni di età), batterio in grado di
causare la meningite;
• Staphylococcus aureus sulla cute (35-40%);
• Haemophylus influenzae (5-10%);
• Streptococcus pneumoniae (0-50%).
Il paziente colonizzato (portatore sano) può essere individuato tramite il prelievo con tampone sterile che
viene poi inserito in una provetta detta swab. Da qui viene poi inserito in un agar e messo in coltura.
evitare errori, è bene considerare che c’è una percentuale (0-50%) di individui in cui lo pneumococco
colonizza di norma le alte vie aeree e in questo caso si deve assolutamente evitare l’errore ditrattare una
colonizzazione. Per questo motivo è importantissimo quantificare il numero delle colonie presenti sulla
placca di coltura e scegliere di conseguenza la giusta soluzione terapeutica; infatti, è bene tenere a mente
che la semplice colonizzazione da Streptococcus pneumoniae non costituisce un fattore di rischio per lo
sviluppo della polmonite.
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Microbiologia clinica
colistina e la nistatina, che inibiscono la crescita di Gram–, Gram+ e miceti. Per la Neisseria meningitidis non
si parla di diffusione ambientale, in quanto batterio molto fragile, per cui la sua trasmissione necessita
contatti molto stretti tra soggetto portatore e soggetto sano e per questo motivo è un agente patogeno che
si va a diffondere soprattutto nei mesi autunnali e invernali, quando si sta maggiormente in ambienti chiusi
e il contatto è più ravvicinato.
Con un tampone naso-faringeo seminato su Thayer-Martin, spesso si può riscontrare la presenza del
patogeno, tuttavia anche in questo caso si tratta di un fenomeno di colonizzazione che non deve
preoccupare. La colonizzazione anche questa volta non costituisce un fattore di rischio per lo sviluppo della
meningite.
M1.3.4 SARS-CoV-2
[Dalla dispensa Cricca] Il campionamento per il Covid-19 viene attualmente eseguito tramite l’utilizzo di
tamponi simili a quelli della Neisseria meningitidis, spinti fino a toccare la rinofaringe e oltre a campionare
quest’ultima, viene campionata anche l’orofaringe. Entrambi i cotton fioc vengono poi inseriti nella provetta
che contiene una soluzione di trasporto, detta medium. Essa è composta da agenti inibenti la crescita di
batterî e miceti e altre sostanze che mantengono il virus per il trasporto. Si stanno studiando dei nuovi metodi
di campionamento, legati ad esempio alla saliva, che potrebbero coadiuvare o sostituire l’analisi di tamponi
rino- e orofaringei.
travaglio per verificare o meno la presenza del germe. Va tenuto in considerazione però che questatecnica
ha i suoi limiti e può risultare ipersensibile.
Paesi diversi presentano procedure diverse per quanto riguarda lo screening dello Streptococcus agalactiae,
ad esempio in Inghilterra non viene eseguito nessun tampone. Questo perché si ritiene che l’incidenza della
sepsi neonatale sia troppo bassa per rendere convenienti i benefici rispetto ai costi.
attiva è stato dimostrato come la trasmissione del patogeno è estremamente preoccupante in alcuni
ospedali, dove il numero di pazienti contagiati in uscita è di molto superiore a quelli già contagiati in ingresso.
L’obiettivo è proprio quello di ridurre tale trasmissione nell’ambiente ospedaliero, poiché anche con un solo
paziente infettato da CPE sottoponiamo a rischio tutti gli altri che potrebbero essere contagiati tramite
normali attività di nursing. È importante sottolineare che in questo caso un’infezione da CPE rappresenta un
fattore di rischio per lo sviluppo di batteriemia.
La sorveglianza viene condotta verso alcuni
geni e nel caso in cui vengano individuate
infezioni/colonizzazioni da CPE, si mettono
immediatamente in atto strategie di
isolamento del paziente, poiché esso
rappresenta un rischio per tutti gli altri
pazienti ospedalizzati. L’individuazione dei
geni viene fatta tramite tampone rettale e
successiva coltura. Diviene poi necessario
seguire i pazienti individuati con un follow-
up che si protrae nel corso degli anni.
Per lo screening si utilizza la tecnica della semina su terreni cromogenici, cioè in grado di colorare i batterî
che vi crescono in base alle loro caratteristiche metaboliche. In questo modo si è immediatamente in grado
di riconoscere il tipo di batterio presente incoltura in base al colore che vien fuori a seguito delle peculiari
reazioni metaboliche messe in atto dal batterio e dal terreno stesso, permettendo al microbiologo di eseguire
anche centinaia di screening al giorno. Questa tecnica dà indicazione di sospetta positività, che viene spesso
verificata con test di conferma come la spettrometria di massa o il test immunocromatografico.
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Microbiologia clinica
Alternativamente possiamo sondare la presenza di CPE con il test molecolare. Questo viene svolto
utilizzando un piccolo dispositivo in grado di rilevare la presenza di cinque geni (KPC, VIM, NDM, IMP, OXA-
48). La tecnica può avere vantaggi e svantaggi rispetto all’utilizzo dei terreni cromogenici:
• il test molecolare è più rapido rispetto alla coltura sul terreno cromogenico (circa 2h, rispetto alle
18-24h impiegatenel secondo caso);
• il test molecolare verifica la presenza di un gene che può non essere strettamente correlato alla
presenza di una specie carbapenemasi-produttrice.
Analizzando il rapporto rischi-benefici risulta comunque vantaggioso sfruttare il test molecolare, infatti nel
caso in cui si trovasse un gene della stessa famiglia di uno dei cinque geni sopracitati che si sospetta possa
essere correlato alla presenza di CPE-produttori (es. gene OXA-23), seppur in genere poco frequente, il rischio
di considerare il paziente colonizzato non arreca danni, ma aumenterebbe unicamente le misure di
precauzione prese nei suoi confronti. Non c’è rischio di over-trattamento in quanto ricordiamo che le
colonizzazioni non vengono mai trattate con gli antibiotici. Al contrario, non mettendo il paziente sospetto
in isolamento si rischierebbe di diffondere la potenziale infezione all’interno delle strutture sanitarie.
M1.4 SEPSI
La sepsi è una distruzione multiorgano molto severa che può condurre il paziente allo shock settico, e un
paziente che sviluppa uno shock settico ha delle serie problematiche di recupero. Quando si presenta un
quadro clinico da shock settico, la diagnosi eziologica non ha troppa importanza, ciò che importante è
rimuovere il paziente dallo shock. Quando si è davanti a un quadro clinico così grave si ha poco tempo per
decidere e bisogna prendere delle decisioni giuste. Se un paziente arriva con un quadro clinico di sepsi in PS,
si avranno a disposizione solamente 12 ore per somministrargli una terapia antibiotica efficace.
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Microbiologia clinica
M2.1 INTRODUZIONE
Le infezioni delle vie respiratorie vengono divise in:
• riguardanti le vie aeree superiori (cavità nasali, mucosa orale, faringe, laringe, trachea, seni
paranasali e orecchio medio);
• riguardanti le vie aeree inferiori (bronchi, bronchioli, polmoni).
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Microbiologia clinica
capsula sono ceppi più mucosi e lucidi, o capacità di replicarsi nei macrofagi (es. M. tuberculosis
e L. pneumophila).
I microrganismi che vanno a ledere la mucosa respiratoria causano un danno e impediscono l’azione di difesa
della mucosa stessa, quindi possono penetrare e dare infezione/sovrainfezioni batteriche.
Ci sono tre meccanismi principali responsabili con cui accade ciò:
• effetto citopatico diretto: legame, danneggiamento e distruzione della parete mucosa tipico dei virus
(es. virus dell’influenza) à sovrainfezioni batteriche frequenti (tipiche da post-influenza);
• leucocidina: tipica dello Staphylococcus aureus, distrugge i leucociti;
• immunopatologia virus-mediata: risposte immunitarie montate contro virus danneggiano la mucosa.
M2.2.1 Faringo-tonsilliti
Interessano prima di tutto la faringe (sia orofaringe
che rinofaringe), inoltre coinvolgono anche l’anello
linfatico del Waldeyer, ovvero l’insieme degli organi
linfoidi situati nelle cavità orale e faringea: le
tonsille. Si distinguono le tonsille linguali, palatine,
tubali e le adenoidi.
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Microbiologia clinica
In generale oltre il 50% delle faringo-tonsilliti hanno eziologia virale (Adenovirus, Coxsackievirus A,
Enterovirus, EBV, HSV, RSV, virus influenzale e parainfluenzale, CMV). Le restanti hanno eziologia batterica,
in particolare il 30% è dovuto a infezioni da Streptococcus pyogenes, caratterizzate da sequele tardive di tipo
autoimmune, tra le quali la principale è la malattia reumatica. Di minore importanza sono lo Staphylococcus
aureus, l’Haemophilus influenzae e il Bacteroides melaninogenicus (anaerobio commensale del cavo orale).
Per il prelievo per la diagnosi si utilizza il tampone faringeo:
• tampone con tappo rosso: per indagine virale (contiene sostanze che inibiscono la crescita di batterî
e miceti), utilizzato anche per infezioni da SARS-Cov-2;
• tampone con tappo rosa: per ricerca di batterî e miceti, è il medesimo utilizzato per il tampone della
mucosa rettale, delle cavità nasali e, appunto, della faringe.
Nell’immagine è visibile un esempio di angina bianca da Streptococcus pyogenes, nonché una coltura su agar
sangue in cui è ben visibile l’emolisi completa ad opera delle colonie batteriche (S.P. è beta-emolitico)
Esiste anche una forma di difterite di tipo cutaneo (ECDC), le cui manifestazioni
sono ulcere a livello di mucose e cute. È rilevante in tempi recenti in quanto si sono
verificati casi tra i migranti che raggiungono l’Unione Europea attraverso il
Mediterraneo. La diagnosi si effettua mediante un tampone cutaneo e un esame
colturale.
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Microbiologia clinica
forma acuta è presente una prima fase con iperemia del timpano, che può essere seguita da una fase
suppurativa con estroflessione della membrana ed eventuale perforazione.
I principali agenti eziologici dell’otite media sono così distribuiti:
4. Otite media acuta:
• Streptococcus pneumoniae (25-30%);
• Haemophilus influenzae (20-25%);
• Moraxella catarrhalis (3%).
5. Otite media cronica (frequentemente polimicrobica):
• Staphylococcus aureus;
• Gram– (Escherichia coli, Proteus spp, Pseudomonas spp);
• Anaerobî.
Caso clinico
Paziente al pronto soccorso con dolore all’orecchio, febbre e in stato confusionale, si esegue la
rachicentesi con esame cito-chimico e successivamente molecolare. Il primo indica chiaramente
un’infezione di tipo batterico e l’esame molecolare permette di individuare subito S. pneumoniae come
agente eziologico. È un esempio eclatante di otite media seguita da meningite batterica per contiguità.
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Microbiologia clinica
La diagnosi avviene tramite tampone o drenaggio nasale; in alternativa spesso si effettua una biopsia della
mucosa palatina nei punti in cui questa si mostra necrotica, e successivamente un’indagine microbiologica.
Per quanto riguarda gli Aspergilli, sono sufficienti l’osservazione al microscopio e l’esame colturale; i
Mucorales invece sono più complicati. Non sono infatti dotati di ife settate, ma di ife cenocitiche, ciò li rende
particolarmente fragili e a rischio rottura durante l’allestimento del preparato per il microscopio o della
coltura. Vi è, infatti, un alto numero di falsi negativi, complicato dal fatto che non risultano efficaci nemmeno
i test immunologici (per galatto-mannano). In conclusione, in caso di sospetta infezione da Mucorales, è
preferibile l’utilizzo di test molecolari, che sono però ancora primitivi.
Caso clinico
Paziente con otite media perforata, si eseguono tampone auricolare e drenaggio del liquido. L’esame
colturale e quello microscopico evidenziano la presenza di ife fungine di Aspergillus flavus.
M2.3.1 Tracheo-bronchiti
Tracheiti e bronchiti sono delle infezioni di “confine” in quanto interessano distretti compresi tra le alte e le
basse vie respiratorie. Colpiscono soprattutto bambini con meno di due anni, anziani e soggetti
immunodepressi: nei bambini in età prescolare le infezioni che si organizzano a livello di trachea e bronchi
sono fondamentalmente di origine virale; questo è molto importante per scegliere la terapia, infatti,
somministrare antibiotico a un bambino piccolo con bronchite non è una scelta adeguata, in quanto è
un’infezione prevalentemente di origine virale e non, appunto, batterica. I virus che causano tracheite e
bronchite nei bambini in età prescolare sono:
• Virus influenzali (poco rilevanti) e parainfluenzali;
• RSV (virus respiratorio sinciziale) à è il più rilevante;
• hMPV (Metapneumovirus umano);
• Rhinovirus;
24
Microbiologia clinica
• Adenovirus;
• Coxsackievirus.
Tutti questi agenti sono responsabili, inoltre, delle cosiddette “flu like illness”: infezioni respiratorie simili
all’influenza, ma che differiscono da questa sia in termini di severità clinica che di importanza epidemiologica
(influenza è molto più grave). Le flu like illness sono forme da raffreddamento che si contraggono a partire
da ottobre fino a primavera, invece, l’influenza si contrae durante lo specifico periodo epidemico.
Invece, considerando i soggetti adulti, soprattutto gli anziani, e i soggetti immunodepressi, gli agenti
responsabili di queste infezioni del tratto respiratorio sono dei batteri con dichiarata capacità patogena:
• Haemophilus influenzae B;
• Streptococcus pneumoniae;
• Moraxella catarrhalis;
• Bordetella pertussis.
Il soggetto immunodepresso
Il soggetto immunodepresso è un soggetto con una parziale competenza del sistema immunitario: le
cellule immunitarie sono numerose, dunque, un soggetto può avere un deficit che interessa solo alcune
branche della risposta immunitarie, oppure può avere un deficit di tipo globale. Il tipico esempio di
paziente immunodepresso è il soggetto che riceve un trapianto di cellule staminali ematopoietiche, il quale
deve andare incontro ad una forte terapia immunosoppressiva per garantire un corretto sviluppo cellulare;
ancora, altri esempi sono rappresentati dal paziente neoplastico e dal paziente in dialisi. Il soggetto
immunodepresso è un soggetto abbastanza difficile da trattare ed è opinione comune che sia IL paziente,
ovvero, il paziente su cui bisogna investire, proprio perché è difficile trattarlo e perché rischia di morire. Il
prof ritiene però che, per quanto i soggetti immunodeficienti siano meritevoli di attenzione e alta
considerazione, essi siano numericamente “poco” rilevanti (meno dell’1% dei pazienti che frequentano un
normale ospedale) e caratterizzati da una “microbiologia collaterale”, ovvero, circoscritta unicamente al
soggetto immunodepresso stesso e non considerabile per la maggioranza.
M2.3.2 Bronchioliti
Oltre a infezioni quali tracheiti e bronchiti, vanno considerate le bronchioliti, ovvero, le infezioni dei
bronchioli. Proprio a causa del continuum anatomico tra le varie strutture, non si avrà mai un paziente con
bronchiolite senza bronchite; pertanto, questa classificazione delle varie infezioni ha uno scopo puramente
didattico.
Tra questi il più importante è il virus respiratorio sinciziale, ovvero, un Paramyxovirus a RNA molto rilevante
per due motivi: è responsabile della bronchiolite, soprattutto nei soggetti sotto i 6 anni di età, e ha una
cadenza stagionale molto precisa. La “stagione” dell’RSV va da novembre fino a marzo, quindi trovare un RSV
a luglio in un bambino affetto da bronchiolite è molto improbabile; la circolazione dell’RSV è evidentemente
connessa al fatto di stare al chiuso nelle scuole, a stretto contatto, …
La diagnosi di bronchiolite da RSV è una diagnosi molto importante, infatti, la bronchiolite da RSV è una forma
ragionevolmente severa da portare il bambino verso il pronto soccorso a causa di un’insufficienza
respiratoria. L’infezione da RSV, specie nel bambino, è inoltre molto diffusiva, dunque, è bene isolare i
bambini affetti da bronchiolite insieme ad altri nelle stesse condizioni, proprio per evitare la diffusione della
malattia.
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Microbiologia clinica
Recentemente sul discorso RSV [povera Vittoria Ferragnez] ci si è dovuto ricredere: da quando si hanno a
disposizione dei test multiplex per fare diagnosi di infezione delle medie-basse vie respiratorie si è scoperto
che RSV circola anche tra la popolazione adulta, e tendenzialmente anziana, provocando forme di
bronchiolite che prima erano abbastanza sconosciute, proprio perché nessuno conosceva l’eziologia di
queste forme respiratorie. I test multiplex, basati su PCR, permettono di identificare simultaneamente RSV,
influenza A e B, questo ha portato all’identificazione di RSV inaspettati. Grazie a queste nuove tecniche è
stato possibile comprendere la causa dell’elevato numero di casi di influenza che si verificano annualmente:
gli agenti eziologici non sono solo Influenza A e B ma anche appunto RSV (cosa che prima non era stata
considerata proprio perché i dati epidemiologici dimostravano che RSV causasse infezione solo nei bambini
e non negli adulti).
L’agente batterico responsabile di bronchioliti è Mycoplasma pneumoniae.
Bordetella pertussis
Bordetella è un batterio che attualmente ha una copertura vaccinale molto efficace: nel passato il vaccino
era fatto con cellule di Bordetella denaturate a causa del calore, e questo comportava un elevato numero di
effetti collaterali e una bassa protezione; invece, attualmente il vaccino si basa sulla tossina purificata della
Bordetella, cosa che ha consentito di eliminare gran parte degli effetti collaterali, dati dal batterio Gram–, e
aumentare la protezione verso la parte patogena responsabile della pertosse. La pertosse è una malattia che
negli ultimi anni è fortemente riemersa perché le persone non si vaccinano e questo ha portato, oltre che ad
un aumento dei casi di pertosse nell’adulto (à la pertosse, così come le malattie esantematiche, è una
malattia dell’infanzia e tutte le malattie dell’infanzia, se prese da adulto, hanno una severità clinica molto
maggiore: si pensi a morbillo e varicella), soprattutto ad un aumento dei casi di pertosse nel neonato.
Il vaccino antipertosse è costituito da tre dosi nel primo anno di vita e un richiamo a sei anni; è obbligatorio
per i nati dal 2001.
Considerando la
mappa che riporta i
casi di pertosse in
Europa nel 2018, si
può notare come
essi siano
consistenti.
Apparentemente in
Italia i casi sono
pochi, questo
perché la mappa
riporta unicamente i
casi notificati,
infatti, c’è uno
specifico
regolamento di
igiene che impone
ad ogni medico, che
osservi o sospetti un
caso di malattia
infettiva e diffusiva,
di notificarlo ai
dipartimenti di sanità pubblica, il quale trasmette l’informazione alla regione che, a sua volta, la trasmette al
Ministero. Il ministero verifica i dati e li invia a Stoccolma dove vengono realizzate queste mappe che,
appunto, hanno validità se il sistema di notificazione funziona bene (come accade in Germania).
In Italia c’è un gravissimo problema di sottonotificazione, come dimostra il caso seguente: sul sito web
dell’istituto superiore di sanità vi è una mappa che riporta i casi di meningite batterica divisi per regione, in
particolare, ogni regione ha un colore diverso a seconda del numero di casi di meningite batterica identificati
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Microbiologia clinica
per 100.000 abitanti; alcune regioni, a causa di deficit nel sistema di notificazione, non hanno alcun caso di
meningite batterica, cosa appunto molto improbabile.
L’Emilia-Romagna per far fronte a questo grave problema di sottonotifica ha messo in atto una valida
strategia: sono state incrociate il 30% delle notifiche cliniche (fatte dal medico alla regione) che non avevano
notifiche di laboratorio associate (dunque considerate invalide) con il 30% delle notifiche di laboratorio che
non hanno mai raggiunto effettivamente la regione. Infatti, affinché una notifica clinica sia valida ci deve
essere una notifica di laboratorio che confermi l’effettiva presenza di un certo microorganismo, es: un medico
individua un caso di meningite e notifica il caso alla regione, e allo stesso tempo un laboratorio notifica alla
regione di aver isolato Neisseria meningitidis.
Questo sistema ha permesso di
capire che 1 caso su 3 non veniva
notificato.
La regione Lombardia,
sicuramente una regione di
altissimo livello, non usa un
sistema di notifica come quello
utilizzato dall’Emilia-Romagna:
per esempio, per la gestione delle
resistenze antibatteriche si fa un
giorno al mese di campionamento
per il laboratorio (è solo un giorno
su 30), invece, in Emilia-Romagna
viene trasmesso giornalmente
tutto quello che si fa e si riscontra,
e non solo una volta in un mese.
Il grafico soprastante riporta la distribuzione dei casi europei di pertosse ogni 100.000 abitanti in base all’età
e al genere: i soggetti più colpiti sono i neonati, proprio perché sono quelli che non si sono ancora vaccinati
e che sono quindi più a rischio.
Diagnosi di pertosse
La diagnosi si fa attraverso tre sistemi:
• esame colturale su terreno selettivo;
• ricerca di anticorpi antitossina, perché è la tossina che è responsabile della malattia: è il sistema
diagnostico di riferimento;
• PCR che si può fare su materiale di derivazione delle alte-basse vie per verificare la presenza del
genoma della Bordetella.
La diagnosi di infezione da Bordetella con esame colturale non è molto sensibile perché la diagnosi di
laboratorio deve essere fatta su un campione biologico che sia rappresentativo del processo patologico: ad
esempio, se un bambino si presenta in PS con i classici sintomi della pertosse (bassa saturazione, crisi
respiratoria,…) vuol dire che si è già in fase di pertosse conclamata; la pertosse in fase conclamata è causata
dalla tossina e non dalla Bordetella, quindi, dato che si è in fase conclamata, sarà molto difficile trovare a
livello delle secrezioni delle alte vie Bordetella in quantità coltivabili e, conseguentemente, l’esame colturale
sarà difficilmente positivo.
Utilizzando la PCR, invece, è molto probabile che il risultato sia positivo: questa positività potrebbe, però,
non essere veritiera in quanto la PCR dà positività anche in un soggetto che magari è solo colonizzato. Per
comprendere meglio questo aspetto, si consideri il seguente caso: un soggetto si presenta con un quadro
sintomatologico simile alla pertosse, si decide di fare una PCR e questa risulta positiva. A questo punto
bisogna valutare situazione e contesto: se il soggetto ha una sintomatologia non grave ci si può permettere
di aspettare e fare ulteriori test per accertarsi che non sia un falso positivo se, invece, il soggetto è un
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Microbiologia clinica
bambino con una condizione molto severa bisogna agire tempestivamente (somministrando, ad esempio,
antibiotico) e sperare di aver fatto una giusta diagnosi.
In ogni caso la diagnosi è comunque fondamentalmente sierologica.
Pannelli sindromici
I pannelli sindromici molecolari multiplex sono una nuova tecnica di PCR che va a fornire informazioni clinico-
epidemiologiche su patogeni in grado di generare infezioni a livello dello stesso distretto anatomico.
Mediante un solo pannello sindromico è quindi possibile ricercare contemporaneamente una lista di
patogeni tramite PCR, questo viene utilizzato come strumento diagnostico nelle infezioni delle vie aeree, del
tratto gastro-enterico, ecc…
La massima efficacia nell’utilizzo di questa modalità di diagnosi è raggiunta solo tramite una corretta
interazione tra clinico e microbiologo: infatti una semplice lista di tutti i patogeni il cui genoma è stato rilevato
con la PCR, non aiuta il clinico a fare diagnosi, anzi può anche confonderlo.
Si presentano due principali problematiche:
• distinguere le infezioni dalle colonizzazioni;
• capire se la presenza del DNA sia effettivamente indice di presenza del microorganismo.
Chiaramente, se l’esame diagnostico viene svolto prelevando materiale a livello di tessuti “sterili”, dove non
vi è microbiota, ci sono buonissime probabilità che il DNA trovato appartenga al microorganismo causante
l’infezione, ad esempio in caso di polmonite effettuando un lavaggio bronco-alveolare (BAL)2.
A riprova della difficoltà di interpretazione dei pannelli sindromici, è stato svolto uno studio utilizzando lo
stesso pannello sindromico per infezioni gastro-enteriche a livello di tre laboratorî italiani (Novara, Cesena,
Pescara) su persone sane: tutti i risultati delle PCR sono risultati differenti.
Le PCR abbinate a pannelli sindromici diventeranno sempre più disponibili a livello laboratoriale: la grande
domanda di analisi di tamponi per SARS-CoV-2 ha portato molte strutture a investire soldi per potenziare la
propria capacità di svolgere analisi molecolari, i cui costi sono molto scesi rispetto all’era pre-Covid,
diventando addirittura quasi competitivi con le analisi colturali; per tale motivo le modalità di diagnosi in
futuro cambieranno.
2
Il lavaggio bronco-alveolare (BAL) è una pratica molto invasiva, si attua inserendo un broncoscopio fino agli alveoli,
per poi eseguire un lavaggio con 100/50 mL di soluzione fisiologica, successivamente recuperata e inviata al laboratorio
per le varie analisi.
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Microbiologia clinica
Sensibilità e specificità
Sensibilità di un esame diagnostico à Si definisce sensibilità di un esame diagnostico la capacità di
identificare correttamente i soggetti ammalati, ovvero affetti dalla malattia o dalla condizione che ci si
propone di individuare. Se un test ha un'ottima sensibilità, allora è basso il rischio di falsi negativi, cioè
di soggetti che pur presentando valori normali sono comunque affetti dalla patologia o dalla condizione
che si sta ricercando.
Alta sensibilità = alta probabilità che un soggetto malato risulti positivo al test e, quindi, bassa probabilità
che un soggetto malato risulti negativo al test
Il difetto di un test sensibile è che può dare dei falsi positivi (“trova troppi positivi”) e quindi si rende
necessario un test di conferma.
Classificazione epidemiologica
La classificazione epidemiologica divide le polmoniti in due grandi categorie:
• polmoniti acquisite in comunità (CAP), quindi contratte dal paziente negli ambienti di vita quotidiana;
• polmoniti nosocomiali (HAP), contratte dal paziente in ambiente ospedaliero.
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Microbiologia clinica
o sono causate da virus, da batterî o da sovra-infezione batterica in presenza di infezione virale, avviene
spesso con i virus dell’influenza con sovra-infezione da pneumococco (giocano un ruolo fondamentale
le vaccinazioni antinfluenzale e anti- pneumococcica, consigliate per l’anziano).
CAP in età neonatale o pediatrica: in età pediatrica le infezioni virali sono predominanti, ci sono però alcuni
batterî isolati in casi di polmoniti neonatali e pediatriche:
o Streptococcus agalactiae, soprattutto nel neonato, nel quale è anche agente infettivo di meningite.
Per questo si effettua uno screening nelle donne attorno alla 37ª settimana di gravidanza con tampone
vagino-rettale per verificare la presenza di S. agalactiae ed eventualmente iniziare terapia antibiotica
per scongiurare la possibile infezione del nascituro al passaggio nel canale del parto;
o Staphylococcus aureus;
o S. pneumoniae;
o Haemophilus influenzae;
o Moraxella catarrhalis.
CAP nell’anziano: nell’anziano, invece, data la frequente ospedalizzazione e l’elevato numero di farmaci
assunti, le infezioni sono causate da diversi batterî antibiotico-resistenti, anche ad ampio spettro:
o S. pneumoniae penicillino-resistente;
o MRSA (stafilococco aureo meticillino-resistente);
o Enterobatterî ESBL (β-lattamasi ad ampio spettro, bloccano le cefalosporine di III generazione) sono
trattati tramite l’utilizzo di inibitori delle β-lattamasi insieme a β-lattamici (esempio
Piperacillina/Tazobactam); alcuni sono anche produttori di carbapenemasi;
o Pseudomonas aeruginosa: possiedono meccanismi di resistenza basati su scarsa permeabilità di
membrana o aumentata attività della pompa di efflusso;
o CR-Acinetobacter baumanni (resistente ai carbapenemi): acquisiscono resistenza con meccanismi
genetici e spesso possiedono i medesimi geni di resistenza degli enterobatterî (solitamente però non
presentano il gene KPC);
o vi sono poi agenti eziologici virali, come i virus influenzali A e B, RSV e Rhinovirus.
Agenti eziologici di polmonite in soggetti con fibrosi cistica: la fibrosi cistica è una malattia genetica che
causa, tra le altre manifestazioni, la secrezione di un muco particolarmente denso nelle vie respiratorie, a
causa di una minore secrezione di elettroliti e una conseguente minore secrezione di acqua. Questo muco
patologico favorisce la colonizzazione da parte di batterî e predispone a infezioni delle vie respiratorie, anche
da parte di microrganismi non comunemente isolati in casi di polmoniti in soggetti senza fibrosi cistica.
I principali agenti eziologici sono:
o S. aureus e H. influenzae sono i primi colonizzatori in età pediatrica;
o segue in età adolescenziale la colonizzazione da parte di P. aeruginosa (da una colonizzazione
importante tende a formare biofilm)
Altri microrganismi peculiari:
o Burkholderia cepacia (letale nel 20% dei casi);
o Stenotrophomonas maltophilia;
o Achromobacter xylosoxidans;
o miceti filamentosi: Aspergillus spp, Scedosporium apiospermum.
In un soggetto immunodepresso le cause possono essere, oltre a quelle appena citate, anche una serie di
microrganismi differenti:
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Microbiologia clinica
o Aspergilli (funghi filamentosi): una devastazione per i pazienti ematologici e neutropenici; causano
aspergillosi invasive principalmente polmonari, che possono diventare sistemiche, velocissime
nell’accrescimento, di difficile diagnosi e spesso mortali;
o Cryptococcus neoformans: causa di polmonite nei pazienti HIV+;
o Pneumocystis jiroveci: causa di polmonite nei pazienti HIV+ o con alterazione delle cellule T;
o Nocardia: micobatteriosi atipiche;
o Herpesviridae (CMV, HHV-6, HSV1 e 2, VZV): possono causare polmoniti in pazienti trapiantati o con
altre forme di immunodepressione.
Polmonite cronica: tubercolosi. È una forma indolente, inizia lentamente con febbricola, tosse (secca,
produttiva, emottisi), perdita di peso, sudorazione notturna (sintomi aspecifici). Può dare una polmonite,
come nel corso di un’infezione primaria oppure, in una serie di pazienti, se rimane latente, può riattivarsi in
corso di immunodepressione o immunosenescenza (es. anziano). Per cui possiamo avere sia una polmonite
primaria che da riattivazione.
Classificazione eziologica
La classificazione eziologica divide invece le polmoniti in tre categorie, sulla base dell’agente patogeno:
• polmoniti batteriche;
• polmoniti virali;
• polmoniti fungine (molto rare);
Classificazione anatomo-patologica
La classificazione anatomo-patologica divide le polmoniti in base alla localizzazione anatomica dell’infezione:
• polmoniti alveolari: localizzate a livello degli alveoli (prevalentemente batteriche): in ambito
radiografico si evidenzia maggiore radiopacità a livello del parenchima polmonare, reso più denso
dall’infezione;
• polmoniti interstiziali: localizzate nei setti inter-alveolari: hanno comunemente eziologia virale, ad
eccezione di quelle causate da patogeni respiratori atipici, ossia batterî resistenti alle penicilline
come Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila.
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Microbiologia clinica
Diagnosi di polmoniti
Per quanto concerne la diagnosi, questa può essere svolta attraverso varie tipologie di esami:
• Ricerca di materiale genetico tramite PCR: questa tecnica viene utilizzata partendo da campioni
biologici ottenuti attraverso aspirati bronchiali, bronco lavaggi, campioni bioptici, tampone
nasofaringeo, campioni salivari e campioni fecali. Per lo svolgimento della PCR c’è un codice colore
per indicare l’urgenza del risultato: viola entro 4h, rosso entro 24h e verde entro 48h.
• Ricerca dell’antigene tramite test rapido: viene utilizzato un campione ottenuto con tampone
nasofaringeo. Andando ad analizzare il processo passo-passo si ha che:
o viene svolto un tampone nasofaringeo;
o il materiale viene messo in una provetta nella quale è presente una soluzione lisante che ha
enzimi che degradano e sciolgono la membrana lipidica dei virus in modo da mostrare meglio
gli antigeni;
o si ottiene una soluzione in cui saranno presenti gli antigeni;
o infine, la soluzione ottenuta dalla provetta è posta sul test rapido che in 15-20 min mostrerà
l’esito: barra di controllo e seconda barra allora è positivo, solo barra di controllo il test è
negativo. Il test è invalido se non ho la barra di controllo e va ripetuto.
• Test rapido di ricerca anticorpale: viene fatto con un pungi-dito, il sangue viene posto su una card
che mostrerà una eventuale positività in circa 10 minuti. Si otterrà una barra di controllo, una barra
per l’eventuale presenza di IgM e una per l’eventuale presenza di IgG (possono comparire entrambe
o solo una). Nel caso in cui sia assente la barra di controllo, analogamente a quanto detto prima, il
test è considerato invalido e di conseguenza è necessario ripeterlo.
• Test sierologico: viene svolto attraverso un prelievo di sangue venoso nel quale, il materiale è posto
in una piastra con 96 pozzetti contenenti antigeni specifici, quindi, successivamente, attraverso dei
test immunoenzimatici e di immunofluorescenza, vengono ricercate IgM e IgG.
I test rapidi hanno una grande efficacia per via della loro velocità e in quanto non vanno a gravare sull’attività
dei laboratorî. Tuttavia, questi risultano essere meno affidabili e accurati dei test svolti a livello laboratoristico
e di conseguenza spesso, soprattutto nei casi in cui la sintomatologia risulta essere più grave, il test viene
ripetuto. Comunque, lo svolgimento dei test rapidi funge da filtro che è necessario per non sovraccaricare di
lavoro i laboratorî.
Gli esami sopracitati differiscono per efficacia e invasività, infatti non tutte le condizioni cliniche permettono
di svolgere determinati tipi di prelievo.
Per esempio, il prelievo dell’espettorato prevede la raccolta del materiale dopo un colpo di tosse, ma il
paziente può, erroneamente, riempire il barattolo sterile con saliva, rendendo il materiale non idoneo per
una diagnosi di polmonite; per tale motivo è fondamentale che il laboratorio analizzi il materiale con blu di
metilene al microscopio per distinguere la saliva dall’espettorato.
Inoltre, in caso di espettorato positivo per pneumococco, essendo quest’ultimo un colonizzatore delle alte
vie aeree, risulta complicato capire se sia effettivamente la causa dell’infezione o solo presente nel prelievo
per una contaminazione da colonizzazione. Per distinguere la colonizzazione dall’infezione è necessario che
il laboratorio faccia una conta semiquantitativa della carica batterica.
Tutte queste problematiche si verificano solo se si utilizza come modalità di prelievo l’espettorato o l’aspirato
tracheale/bronchiale: svolgendo un lavaggio bronco-alveolare, che d’altro canto è più invasivo e pericoloso
per alcune categorie di pazienti (es. pazienti ematologici), il materiale in esame ha sicuramente un rischio
minore di contaminazione da colonizzazione.
Con l’esame colturale semiquantitativo è possibile distinguere una colonizzazione da un’infezione,
soprattutto in esami che si basano su prelievi dell’espettorato. Solitamente gli agenti eziologici delle
polmoniti sono presenti in alte concentrazioni all’interno delle secrezioni respiratorie, minimo 105 UFC/mL,
mentre le concentrazioni di microrganismi colonizzanti delle vie aeree non superano 104 UFC/mL.
Se dall’analisi dell’espettorato di un paziente con polmonite risultano presenti 4 microrganismi diversi, di cui
tre concentrati fra 102-103 UFC/mL e uno concentrato 106 UFC/mL, si può dire con certezza che l’ultimo dei
quattro sia l’agente eziologico della polmonite in corso.
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Microbiologia clinica
Naturalmente bisogna porre attenzione a non trattare univocamente dati provenienti da analisi differenti: la
PCR, essendo molto più sensibile, darà valori di concentrazione UFC/mL molto maggiori rispetto al test
colturale, proprio perché è tutto in proporzione al tipo di analisi effettuata (105 UFC/mL in coltura
corrispondono a circa 109 UFC/mL in PCR).
Campioni prelevabili
Questi campioni possono essere utilizzati non solo per fare diagnosi di infezione polmonare batterica, ma
anche fungina e virale:
• Espettorato (anche indotto, tramite utilizzo di aerosol di fisiologica) à si richiedono al pz colpi di
tosse profondi, così da raccogliere materiale delle basse vie respiratorie. Il materiale è buono per
successive indagini microbiologiche, ma richiede una valutazione per verificare che sia idoneo per
coltivare i batteri; questa valutazione viene fatta tramite esame microscopico (vedi dopo).
• Aspirato naso-faringeo à prelievo sempre delle basse vie respiratorie, ma leggermente più alto,
usato generalmente nei bambini, per la ricerca della Bordetella pertussis o infezioni di tipo virale. Si
utilizza un pannello che comprende batterî come le Bordetellae pertussis e parapertussis, Chlamydia
e Mycoplasma pneumoniae; poi ci sono tutti gli agenti virali: i quattro Coronavirus che danno infezioni
più lievi, rispetto al SARS-COV-2, perché si fermano a livello dei bronchi e sono transitorie.
• Aspirato tracheale e bronchiale à utilizzati dei sondini per aspirare il materiale in punti più profondi
rispetto al naso-faringeo (si arriva alla trachea e ai bronchi);
• Lavaggio bronco-alveolare (BAL) à è il prelievo più invasivo ma più efficace per quanto riguarda la
raccolta di materiali delle basse vie respiratorie;
• Spazzolatura endobronchiale à usato un citobrush, che spazzola la mucosa endobronchiale per
isolare batterî che creano un biofilm o quando c’è un muco abbondante come nei pazienti affetti da
fibrosi cistica. È una tecnica scarsamente impiegata, ma che in alcuni casi può essere molto efficace.
Il muco viene poi fluidificato con ditiotreitolo (che fluidifica i polisaccaridi facenti parte del muco e libera i
batterî che qui rimangono imbrigliati), così da aumentare la performance diagnostica.
Per valutare l’idoneità dell’espettorato (ad alto rischio di contaminazione salivare) si fa uno striscio colorato
con blu di metilene e l’espettorato viene considerato idoneo se
ricco di polimorfonucleati (come mostrato nell’immagine a lato).
Se, al contrario, sono presenti molte cellule epiteliali di tipo
squamoso, che rivestono la mucosa orale (rapporto
citoplasma/nucleo alto: citoplasma abbondante e nucleo piccolo
al centro della cellula), allora vuol dire che sono presenti molte
cellule di desquamazione e magari anche pochi
polimorfonucleati, questo vuol dire che il campione non è
idoneo, perché si tratterà per lo più di saliva.
Importante è considerare il rapporto tra globuli bianchi e cellule
epiteliali della mucosa orale:
• se il rapporto è intorno al 3:1, allora l’espettorato è idoneo;
• se è minore o uguale a 2 il campione non è considerato idoneo e si richiede un ulteriore
campionamento.
Questa valutazione è importante per evitare di dare in un referto dei falsi-negativi: negatività non perché
non c’è patologia, ma magari perché il prelievo non è avvenuto nella maniera corretta.
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Microbiologia clinica
• Agar herellea (alto a dx) à selettivo per inibire la crescita dei Gram+. È un terreno che in base alla
fermentazione del lattosio fa virare il colore dal violetto al giallo.
o Le Enterobatteriacee (E. coli, Klebsiella pneumoniae), fermentando il lattosio, si presentano
in colonie che virano verso il giallo
o I batteri che non fermentano il lattosio (come Pseudomonas) invece prendono colorazione
bianca o violetta.
Nell’immagine è presente la Klebsiella, che
si distingue per la produzione di una
capsula che dà un aspetto mucoso.
• Agar sangue (basso a dx) à terreno non
selettivo, sul quale crescono tutti i tipi di
batterî, tranne i più selettivi, come
Hemofilus influenzae. Quest’ultimo può
crescere su terreni arricchiti con agar
cioccolato.
• Agar cioccolato (basso a sx) à arricchito
con fattori V e X per la crescita degli
emofili. Contiene anche agenti selettivi per
garantire la crescita degli emofili rispetto
ad altri bacilli Gram–.
Parallelamente a queste piastre selettive e non
selettive, ci sono terreni per la crescita dei lieviti. Questi si vedono anche su agar sangue, ma è più semplice
individuarli se vengono usati terreni di Chrome-candida, cromogeni, con reagenti incorporati che fanno virare
il colore a verde, blu, rosa, bianco. A seconda del colore che assumono danno indicazioni sulla specie presente
nel tratto respiratorio.
• La colorazione verde è tipica della Candida albicans;
• le colonie blu sono tipiche della Candida tropicalis.
Quelle che risultano bianche o violetto-rosa, vengono poi sottoposte a spettrometria di massa Maldi-Toff per
riconoscere la specie esatta. Glabrata, Krusei e Parapsilosis sono le più comuni nelle colonie che risultano
rosa-bianche (all’occhio esperto la lucentezza e le varie tonalità di rosa già permettono di distinguere le varie
specie).
Oltre alle piastre, un’ulteriore semina viene fatta su un terreno che favorisca la crescita dei funghi filamentosi
e dei lieviti. Il terreno è SAB-CAF (Sabouraud-CAF), specifico per inibire la crescita dei batterî e selezionare
quella di lieviti e funghi filamentosi. È un terreno solidificato a becco di clarino per aumentare la superficie
di semina ed è a chiusura stagna, che facilita i tempi prolungati di incubazione perché impedisce la
disidratazione del terreno. Essendo i funghi filamentosi normali contaminanti ambientali ed essendo presenti
nell’ambiente molte spore fungine, è facile contaminare una piastra quando la si apre per l’osservazione: per
questo le provette si aprono solo sotto cappa a flusso laminare, garantendo l’isolamento del fungo
filamentoso e permettendo l’identificazione
dell’agente realmente presente nelle vie aeree.
Carica batterica
È importante per valutare il ruolo patogeno di un
microorganismo isolato da materiale patologico.
Nel tratto respiratorio è presente un microbiota alveolare e contaminanti del cavo orale che possono
contaminare il prelievo del tratto respiratorio.
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Microbiologia clinica
Antibiogramma
L'antibiogramma è un esame diagnostico in vitro che consente di saggiare la sensibilità di
un microrganismo a uno o più farmaci antimicrobici.
L’interpretazione è analitica, di laboratorio, e rappresenta un buon punto di partenza per scegliere il farmaco
più adatto. A partire dall’antibiogramma è quindi necessario fare una valutazione clinica più complessa e più
ragionata per capire la terapia migliore.
Per quanto riguarda la classificazione S/I/R, S indica che il microrganismo è sensibile a un certo farmaco, R
indica invece che è resistente. La lettera I significa che il batterio non è sensibile al farmaco con dosaggi
normali, ma lo diventa se aumenta la dose o l’esposizione al farmaco stesso; quindi, è necessario un
approccio terapeutico più aggressivo.
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Microbiologia clinica
Esempio di antibiogramma:
Enterobacter è resistente ad amoxicillina + acido clavulanico e
sensibile a tutti gli altri farmaci. La classificazione sensibile o
resistente si valuta in base alla MIC: data questa, ci sono i break point
che indicano i valori per cui un ceppo è resistente o sensibile ad un
farmaco. Ad esempio, la Amikacina (prima riga) ha una MIC <=2. Dato
che un ceppo è sensibile se la MIC è <=8, resistente se > 16, in questo
caso il ceppo è sensibile a questo farmaco. C’è un’ulteriore classe
interpretativa, che è quella intermedia: significa né sensibile, né
resistente.
Nel caso di Haemophilus influenzae abbiamo come unica resistenza il
Sulfa/Trimeth. Tutti questi dati vengono da EUCAST, ente europeo
che si occupa della valutazione degli antibiogrammi. Si occupa di
monitorare nel tempo valori di break-point definirli in maniera
univoca e poter fare un’interpretazione il più affidabile possibile.
Test rapidi
Utili per lo screening dei pazienti che arrivano in PS. Sono effettuati su campioni di urina, quindi il prelievo è
semplice. Per quanto riguarda Streptococcus pneumoniae, questo produce antigeni che sono rilasciati nel
torrente circolatorio nel momento in cui infetta le vie respiratorie profonde e possono essere filtrati dal rene,
motivo per cui li troviamo nelle urine. Il test è sempre immunocromatografico, con banda di controllo: se c’è
positività si colorerà anche la seconda banda in prossimità del campione (sample).
Esiste un altro pannello sindromico per i pazienti con polmonite nosocomiale, che prevede più target rispetto
al pannello pediatrico: virus (meno rispetto al pannello precedente, come MERS-Cov, VRS, Adenovirus e
Coronavirus; non è presente SARS-
CoV perché da anni non dà più casi)
e batterî atipici (Mycoplasma,
Chlamydia, Legionella
pneumophila).
Altri batterî sono tutti quelli
presenti nella tabella.
Oltre a questo, sono indicati i geni
della resistenza: il CTX-M, fornisce
la resistenza alle cefalosporine di
terza generazione, quindi ceppi
resistenti alle β-lattamasi ad ampio
spettro. Ci sono poi i 5 geni di
resistenza ai carbapenemi: KPC (più
frequente), NDM, Oxa48-LIKE, VIM,
IMP (inesistente in Europa).
Fornisce quadro di infezione e
meccanismi di resistenza nel giro di
un’ora. L’esame colturale validerà
poi il test molecolare. Il pannello dà
anche la carica, batterica o virale,
solitamente più alta rispetto a quella che poi viene confermata con l’esame colturale (sovrastima di log in
base 10) perché si cerca il genoma e probabilmente è presente anche quello di microorganismi già morti a
causa del processo infiammatorio.
Altri test
Se non si usano i pannelli sindromici, ci sono altri test molecolari, eseguiti sui singoli agenti eziologici: per i
virus influenzali si fanno tamponi di ricerca dell’RNA (con PCR e retro-trascrizione del genoma virale) e ricerca
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Microbiologia clinica
degli antigeni virali. I virus per i quali si ricercano sia gli antigeni che il genoma sono: virus influenzali,
parainfluenzali, respiratorio sinciziale, adenovirus e coronavirus.
I test di ricerca del genoma sono anche per i batterî atipici Mycoplasma, Chlamydia e Legionella.
Hanno valore anche i test sierologici per la diagnosi (con scarsi significati per la diagnosi di polmonite
batterica) di batterî atipici (i tre sopra citati) e infezioni virali, tramite ricerca di anticorpi.
La diagnosi sierologica ha senso innanzitutto perché l’espettorato (che sarebbe il prelievo più semplice da
fare) è assente o scarsamente presente. Inoltre, tramite la diagnosi sierologica è possibile ricercare le IgM,
ovvero classe anticorpale che indica un’infezione acuta, e vengono ricercate anche le IgG, fondamentalmente
per fare una diagnosi di esclusione. In un paziente con infezione acuta da M. pneumoniae devono essere
presenti le IgM, perché le sole IgG non caratterizzano la fase acuta.
Le IgM sono poco specifiche in una risposta sierologica, pertanto nel caso in cui non siano presenti altri
metodi diagnostici bisogna aspettare la cosiddetta sieroconversione, ovvero 15 giorni dopo la comparsa del
primo referto diagnostico di IgM positive compaiono anche le IgG.
Quando, per esempio, ritroviamo la presenza di IgM contro il M. pneumoniae, vuol dire che è in corso
un’infezione acuta dovuta a quel batterio. La presenza di IgG, invece, dimostra che precedentemente c’è
stato un contatto col batterio, ma non ci troviamo più in una fase acuta.
Mycobacterium tuberculosis
Mycobacterium tuberculosis è un importante agente eziologico di polmonite nei pazienti già immuno-
compromessi. Questo dà infezioni latenti nel tessuto polmonare, formando granulomi caratterizzati da
necrosi caseosa che al loro interno contengono bacilli di Koch, in stato latente e inattivato, ma vitali, con
possibilità di riattivazione e insorgenza della malattia a seguito dell’abbassamento delle difese immunitarie.
Si formano caverne e causa emottisi [n.d.s. quando si tossisce sangue], ma si può avere anche passaggio nel
sistema circolatorio e quindi formazione di granulomi anche nel tessuto osseo, renale e SNC. La riattivazione
porta alla malattia tubercolare (10% dei casi).
L’infezione primaria è caratterizzata da tosse secca, produttiva, emottisi, da febbricola, perdita di peso e
sudorazioni notturne. È una forma di polmonite subdola in quanto non determina nel paziente uno stato di
malessere tale per cui quest’ultimo pensi che sia necessario recarsi in pronto soccorso, egli non ha
un’estrinsecazione clinica preoccupante. Solitamente la febbricola serale di pochi decimi, unita alla perdita
di peso e alla sudorazione notturna sono i segni che preoccupano maggiormente il paziente, ma rimane vero
che solitamente passa del tempo prima che il paziente diventi consapevole di avere un problema.
Ciò deriva dal fatto che ad oggi la malattia tubercolare si sviluppa in modo inapparente e solitamente
l’infezione primaria si acquisisce nell’età giovanile/adulta. La situazione è, quindi, variata rispetto a 50 anni
fa, quando essa era patrimonio degli alunni delle scuole elementari. Ad oggi in generale la tubercolosi è una
malattia meno frequente e fondamentalmente è una malattia legata a situazioni di povertà e a condizioni
non ottimali di sovraffollamento, malnutrizione o ambientali.
Nell’immagine si osservano micobatteri tubercolari nel parenchima dell’organo bersaglio, il quale di fatto è
il polmone, ma parlare solo di polmone è riduttivo.
Il 90/95% dei pazienti che hanno sviluppato l’infezione primaria, passano poi all’infezione tubercolare latente
(LTBI), stadio in cui il soggetto che ha risolto clinicamente il complesso primario tubercolare, si trova con una
presenza di Mycobacteria vitali in zone all’interno del granuloma, ma senza avere alcun sintomo. Non si può
parlare di infezione cronica poiché non è un’infezione progressiva che sta producendo dei sintomi, ma è
latente, la situazione finché risulta possibile rimane “congelata”.
Nel 10% dei casi dalla fase di latenza avviene una riattivazione che porta alla malattia tubercolare vera e
propria. Quest’ultima avrà una situazione di coinvolgimento di più organi bersaglio, di più apparati, più
evolutiva. Le cause di riattivazione sono molteplici. Tra esse sicuramente c’è uno stato di malnutrizione e di
deperimento organico.
Esiste un serbatoio di infezione, costituito dai soggetti con un’infezione latente, che può riesplodere e dare
una forma attiva.
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Microbiologia clinica
Diagnosi
La diagnostica è molto diversa nell’infezione
primaria rispetto all’infezione latente.
Nella forma di tubercolosi attiva, sia primaria sia
non primaria, quindi anche in una riattivazione, il
soggetto è malato, presenta dei sintomi, i quali
portano alla necessità di diagnosticare
rapidamente la presenza di batterî in materiali
patologici. Il materiale patologico tipico su cui
vengono eseguiti gli esami è l’espettorato (raccolto
chiedendo al paziente di emetterlo tramite lo
sputo), ma possono essere usati anche altri
materiali patologici che siano rappresentativi del
processo patologico che si vuole diagnosticare.
Nella forma di tubercolosi latente, invece, ci si
trova di fronte a un sospetto difficile da individuare
dal punto di vista clinico, poiché il soggetto tubercolare latente non presenta sintomi, sta bene. In questo
caso quindi si può procedere con l’identificazione della risposta immunitaria specifica e in questo ambito non
può essere utilizzata la risposta anticorpale, siccome essa è praticamente nulla. È necessario, pertanto,
identificare una risposta di tipo cellulo-mediata tramite test chiamati “test di ipersensibilità ritardata” come
il test della tubercolina o IGRA, i quali sono dei test che vengono eseguiti non sul paziente ma su linfociti
prelevati dal paziente e poi stimolati in vitro per osservare se c’è una risposta da IFN-γ.
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Microbiologia clinica
Microscopia
L’esame microscopico viene effettuato solitamente tramite
la colorazione di Ziehl-Neelsen, che è la più classica. Essa
mette in evidenza una caratteristica tintoriale dei
Mycobacteria che è l’alcol-acido resistenza (questa
caratteristica è comune a tutti i Mycobacteria, non
identifica solo il Mycobacterium tuberculosis). I micobatterî,
infatti, sono resistenti alla decolorazione con alcol o acidi
(BAAR), quindi, in questa procedura, una volta che è stato
utilizzato il primo colorante, rosso, essi resteranno
effettivamente di colore rosso. Un’altra colorazione
utilizzata è l’acridina.
Nell’immagine si osserva l’esame microscopico con la
colorazione di Ziehl-Neelsen: i bacilli rossi sono i
Mycobacteria.
Coltura
L’esame colturale può essere eseguito sia su terreno solido, Lowenstein-Jensen, sia su terreno liquido. In
questo caso terreni solidi e liquidi sono altrettanto fondamentali. L’importanza del terreno solido, infatti, sta
nella possibilità di osservare lo sviluppo delle colonie e la loro morfologia, quindi permette a un occhio
esperto, con approssimazione, di stabilire se si è davanti a un Mycobacterium tuberculosis o davanti a un
micobatterio non tubercolare. Il terreno liquido è altrettanto fondamentale e assume particolare importanza
a fronte di un difetto del terreno solido, per il quale se la contaminazione da germi non tubercolari è molto
alta, il terreno che era solido tende a liquefarsi proprio per l’attività del germe contaminante.
L’approccio colturale per la diagnosi del Mycobacterium tuberculosis ha come svantaggio la lenta crescita di
quest’ultimo. Prima di dichiarare negativa una coltura per il Mycobacterium tuberculosis, infatti, è necessario
aspettare almeno 6 settimane, 42 giorni. Vale un discorso diverso per i micobatterî non tubercolari, i quali si
dividono in due gruppi: quelli a rapida crescita (48/72 ore) e quelli a lenta crescita (6 settimane, 42 giorni,
come il M. tuberculosis).
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Microbiologia clinica
Il problema relativo a queste tempistiche è che in presenza di un paziente sospetto per la malattia
tubercolare, aspettare 42 giorni espone al rischio di diffusione dell’infezione e dal punto di vista
epidemiologico la probabilità che ciò succeda è consistente.
Inoltre, è da considerare che la tubercolosi polmonare può essere suddivisa, dal punto di vista nosografico,
in forme aperte e forme chiuse. Nelle forme chiuse è presente il tubercolo che cresce, ma siccome esso non
si apre su vie aeree, il soggetto tossisce senza diffondere l’infezione. Nelle forme aperte, invece, il tubercolo
aggetta su una via aerea; quindi, con la tosse il soggetto espelle batterî e perciò è altamente infettante. Per
questi motivi aspettare è un rischio. Inoltre, una rapida diagnosi è utile anche per formulare una terapia
specifica.
La coltura è deludente come approccio perché, anche in terreni arricchiti ad esempio con vitamine, si sta
trattando di batterî a lenta crescita. In realtà è da specificare che nelle forme aperte con una carica batterica
molto consistente la positività emerge anche dopo due settimane. Il problema si presenta nel caso di
negatività, in cui per arrivare al definitivo, certo, negativo, è necessario aspettare 6 settimane.
Metodi molecolari
I metodi molecolari sono fondamentali:
1) hanno la capacità di identificare il M. tuberculosis rispetto ad altri micobatterî non tubercolari;
2) ad oggi hanno tutti la capacità di identificare la presenza di situazioni generiche connesse
all’antibiotico-resistenza. La resistenza che ormai da anni viene determinata è quella da rifampicina,
ma oggi ci sono sistemi diagnostici che associano questa, alla resistenza contro la streptomicina e
l’isoniazide. Grazie ai test molecolari, quindi, abbiamo a disposizione una sorta di antibiogramma
molecolare che può essere molto utile nell’immediato per capire se il batterio è resistente.
I metodi molecolari ad oggi sono quelli di riferimento poiché presentano varî vantaggi, come la facilità e la
velocità di esecuzione, entro poco più di un’ora dall’arrivo del campione in laboratorio si hanno già delle
informazioni. La tecnologia chiamata GeneXpert è stata definita dall’Organizzazione Mondiale della Sanità
(OMS) il riferimento per la diagnosi di tubercolosi nei paesi in via di sviluppo. L’azienda americana creatrice
di GeneXpert ha ricevuto il consenso dall’OMS per propagare il proprio sistema nei paesi in via di sviluppo,
soprattutto in Sudafrica, nazione dove la tubercolosi ha un’enorme diffusione, ma che tramite l’impiego
costante di questa metodologia, oggi sta raggiungendo una situazione controllata della diffusione della
malattia. L’impiego di queste metodiche ha il limite di avere alti costi. A questo proposito è stata ridotta
l’incidenza di tubercolosi in modo consistente anche grazie a programmi di supporto.
In generale per quanto riguarda i costi dei varî metodi diagnostici la microscopia non ha un effettivo costo,
necessita semplicemente di un addetto in grado di preparare il vetrino e di leggerlo; la coltura costa poco
(pochi euro); ogni test molecolare costa all’incirca 50 euro, quindi, è evidente come sia problematico adottare
questo metodo, soprattutto in alcuni paesi.
Questi tre metodi diagnostici, dalla microscopia alla PCR, hanno sensibilità diverse. La microscopia è il
metodo che ha sensibilità inferiore. L’esame colturale ha una sensibilità maggiore perché anche in presenza
di pochi batterî, essi comunque possono crescere ed essere osservati. La PCR è il metodo più sensibile in
assoluto, ad oggi questo metodo molecolare è ultrasensibile e in grado di rilevare anche piccole “tracce” di
DNA del batterio.
È sempre importante contestualizzare l’utilizzo di questi test diagnostici nell’ambito della situazione clinica
del paziente. Nel caso di un paziente in cui è la prima ipotesi diagnostica, il primo sospetto di malattia, si
esegue tutto il flusso diagnostico e, se nei test ultrasensibili molecolari si ha un risultato positivo, si può
procedere con la diagnosi perché c’era già un’ipotesi iniziale, il paziente non ha subito un trattamento, ha un
quadro clinico coerente, il rischio epidemiologico è coerente, la coltura ha tempistiche troppo lunghe, perciò,
è possibile basarsi sul test molecolare e iniziare la terapia. Nel caso in cui, invece, il paziente non è una prima
ipotesi diagnostica, ma si tratta di un paziente già in trattamento da 3 o 4 mesi, il cui quadro clinico è di totale
risoluzione della malattia, la microscopia, ad esempio, diventa significativa perché i test molecolari
rimangono positivi anche a guarigione avvenuta e possono far sorgere dubbî nel verificare l’efficacia della
terapia e quindi nel verificare l’effettiva guarigione.
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Microbiologia clinica
Bisogna sempre porre l’attenzione su cosa si vuole diagnosticare, su cosa si sta cercando, richiedendo certi
esami, altrimenti nel caso del paziente già in trattamento, con un test molecolare che risulta positivo,
potrebbe sorgere il dubbio che la terapia non stia funzionando anche dopo mesi di trattamento e si
potrebbero commettere errori.
Legionella pneumophila
È un batterio Gram– asporigeno, dotato di flagello polare e parassita endocellulare facoltativo. Tutte le specie
di Legionella sono batterî ambientali che ritroviamo negli ambienti naturali e artificiali. Spesso si ritrovano a
livello di reti idriche contaminate e in serbatoi di acqua ad alta temperatura (è un batterio termofilo).
Non è stata dimostrata trasmissione interumana, ma l’infezione avviene esclusivamente tramite via
respiratoria per inalazione di aerosol infetto proveniente da ambienti acquatici contaminati, sia naturali che
artificiali. In questi ambienti si può trovare libero o associato in biofilm, necessita però di infettare altre cellule
per potersi riprodurre e in ambiente acquatico queste sono rappresentate principalmente da diverse specie
di amebe (protozoi); nell’organismo umano invece, una volta infettato si ritrova nei macrofagi alveolari.
Esistono 61 specie di Legionella. Legionella pneumophila è la specie più frequentemente rilevata nell’uomo
ed è costituita da 16 sierogruppi. Il sierogruppo 1 causa il 95% delle infezioni in Europa e l’85% nel mondo.
Anche in Italia l’analisi della distribuzione di specie e sierogruppi ha confermato la prevalenza di Legionella
pneumophila sierogruppo 1.
Dal punto di vista diagnostico, la sensibilità e specificità dei metodi diagnostici per L. pneumophila
sierogruppo 1 sono abbastanza elevate mentre sono inferiori per gli altri sierogruppi di L. pneumophila o per
altre specie di Legionella.
Diagnosi
Dal punto di vista diagnostico la L. pneumophila risulta problematica in quanto non sono presenti i sintomi
della classica polmonite di comunità (tosse produttiva di espettorato, dolore toracico, brividi, febbre e
respiro affannoso), ma semplicemente una leggera febbriciattola e astenia.
La sensibilità e la specificità degli esami diagnostici per L. pneumophila sierogruppo 1 sono abbastanza
elevate, mentre sono inferiori per gli altri sierogruppi o per altre specie di legionella.
I saggi diagnostici correttamente utilizzati sono:
- esame colturale;
- rilevazione di anticorpi (IgG e IgM) su sieri nella fase acuta e convalescente della malattia;
- rilevazione dell’antigene urinario;
- rilevazione del DNA batterico mediante PCR.
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Microbiologia clinica
Il test è di tipo immunocromatografico: è presente una striscia di cellulosa dove sono deposti degli anticorpi
anti-antigene della Legionella. Se nelle urine è presente l’antigene della Legionella, gli anticorpi si legano e si
forma una striscia rossa a livello della scritta “sample” e una a livello della scritta “control”.
Gli ospedali sono la fonte principale di contagio da legionellosi a causa, ad esempio, di impianti di acqua calda
vecchi o di impianti di condizionamento dove la condensa non è drenata bene. Ogni paziente, anche solo
lontanamente sospettabile di legionellosi, viene esaminato subito, perché se il test viene fatto dopo 48h dal
ricovero in ospedale e risulta positivo, allora l’infezione è di tipo nosocomiale e l’ospedale deve assumersene
la responsabilità. Solo in Emilia-Romagna vengono fatti circa 13000 test ogni anno in coniugazione con
l’antigene da pneumococco urinario, nonostante i casi positivi per la legionellosi siano alla fine molto ridotti.
Questo test viene quindi effettuato principalmente con uno scopo medico-legale.
Terapia
• Il farmaco deve penetrare nei macrofagi.
• Non sono efficaci i β-lattamici e gli aminoglicosidi (amikacina e gentamicina, 30S).
• Sono efficaci i macrolidi (eritromicina, 50S), tetraciclina e chinoloni.
Il monitoraggio ambientale è estremamente importante: nei grossi impianti con acqua calda e condense
dev’essere verificata l’assenza di colonizzazione. Nei servizî sanitarî, inoltre, vanno messi filtri 022 che
impediscano il passaggio di batteri proprio per evitare che la Legionella colonizzi.
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Microbiologia clinica
SARS-CoV-2
I Coronavirus sono dei virus a RNA (quindi presentano una buona variabilità genetica) dotati di un involucro
pericapsidico e presentanti delle spicole, dette anche spikes o proteine S, che formano una “corona” da cui
deriva il nome del genere.
Per i Coronavirus è fondamentale il concetto dello spillover: con questo termine si intende il passaggio del
virus da una specie animale all’uomo e l’eventuale successiva circolazione interumana dello stesso che si
verifica se presenti i recettori adatti (per il SARS-CoV-2 sono i recettori ACE2). Lo spillover sta alla base della
nascita dell’attuale pandemia ed è favorito dallo stretto contatto tra uomo e animali selvatici.
Ad oggi si conoscono in totale sette diversi Coronavirus:
1. Human Coronavirus 229E;
2. Human Coronavirus OC43;
3. Human Coronavirus NL63;
4. Human Coronavirus HKU1;
5. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV): oggigiorno non si registrano più casi.
Questo fu identificato per la prima volta nel 2003 in Cina, portò alla morte di 650 persone e si pensa
sia stato veicolato da pipistrelli e zibetti;
6. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV2): agente eziologico della pandemia in
corso;
7. Sindrome Respiratoria mediorientale da Coronavirus (MERS-CoV): vi è ancora qualche caso sporadico
che interessa solamente il medio-oriente. Fu identificato per la prima volta nel 2012 in Arabia
Saudita, portò al decesso di 800 persone ed è stato veicolato dai dromedarî.
I primi quattro sono dei Coronavirus che determinano delle infezioni con sintomatologia lieve che interessa
le alte vie respiratorie o al massimo i bronchi, sono di scarso significato patogeno per l’uomo. Gli ultimi tre
Coronavirus invece hanno una importanza patologica molto maggiore in quanto determinano l’insorgenza di
polmoniti interstiziali, in più questi hanno delle caratteristiche in comune in quanto appartengono tutti alla
classe dei β-coronavirus.
Analizziamo più nel dettaglio il SARS-Cov2. Questo virus, come già detto, è l’agente eziologico della pandemia
in corso e fu identificato per la prima volta a Wuhan nel 2019. Il veicolo non è ancora stato identificato anche
se l’infezione partì dal mercato di Wuhan dove erano presenti varî animali e frutti di mare (si pensa siano
interessati i pipistrelli).
Il SARS-CoV-2 analogamente a tutti gli altri Coronavirus è un virus a RNA a singolo filamento con polarità
positiva che tuttavia non presenta una elevata variabilità. Il genoma del virus codifica sia per proteine
strutturali, tra cui le proteine S, che per proteine non strutturali. Il recettore a cui le proteine S si legano è il
recettore ACE2 presente a livello della mucosa respiratoria ma anche a livello intestinale. Il periodo di
incubazione del virus è mediamente di 5-6 giorni, anche se il tempo massimo di incubazione può raggiungere
le 2 settimane.
Il Covid-19 è a tutti gli effetti una polmonite, infatti il primo sintomo, oltre alla generica febbre, è quella che
viene detta desaturazione felice: il paziente sta male ma non se ne rende conto. La desaturazione è
compensata, finché improvvisamente giungono difficoltà respiratorie molto severe.
Essendo una polmonite, il virus va ricercato nel materiale rappresentativo del processo patologico, ossia le
secrezioni delle alte vie respiratorie (è lì che il virus entra e si replica prima di procedere verso le vie inferiori).
I primi casi avuti a febbraio 2020 fecero preoccupare perché, seguendoli giorno per giorno, in giornata molti
apparentemente non avevano più il virus. Il motivo era che erano intubati e desaturati, per questo il virus si
andava a riscontrare giù in fondo alle vie respiratorie.
La diagnostica, quindi, è sempre stata un cardine sulle alte vie respiratorie.
Il virus, il suo materiale genetico e/o i suoi antigeni, può essere trovato a livello di:
• alte vie respiratorie, quindi in tutte le secrezioni respiratorie;
• nelle feci e negli “swabs” (tamponi) rettali in quanto sono presenti recettori ACE2 a livello intestinale
(specialmente se la sintomatologia comprende diarrea). Nel materiale fecale le componenti
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Microbiologia clinica
antigeniche perdurano per tempi maggiori rispetto a quanto queste non lo facciano a livello della
mucosa respiratoria;
• in alcuni soggetti è possibile trovare il materiale genetico virale a livello ematico (questo è associabile
a una infezione particolarmente severa);
• lo si può trovare in alcuni fluidi corporei come i fluidi oculari, anche in assenza di congiuntivite, e nel
fluido cerebrospinale;
• nei campioni respiratorî delle basse vie aeree come il lavaggio bronco-alveolare.
In questa immagine è possibile osservare come in campioni diversi è possibile trovare antigeni per tempi
diversi (“stool PCR”, la curva gialla indica le feci) e anche la comparsa anticorpale. È importante sottolineare
che le componenti virali sono osservabili anche 3-4 giorni prima della manifestazione sintomatica.
A sinistra della linea tratteggiata ci sono le settimane che precedono l’evidenza sintomatologica: il paziente
è infetto ed infettante, ma non è malato. Bisogna sottolineare la differenza tra infezione e malattia: non è
malato perché non ha sintomi. Cercando di capire quando applicare la determinazione molecolare, essa sarà
probabilmente negativa perché la quantità di virus, rappresentata dalla linea rossa, è decisamente bassa
nella prima settimana dall’esposizione, mentre comincia ad aumentare nella seconda.
A tre settimane/20 giorni la PCR è al massimo delle sue possibilità diagnostiche, in quanto il virus compare.
La PCR rimarrà attiva per 3 settimane e dopo questo periodo si potrà determinare la risposta anticorpale
specifica. La PCR su tampone naso faringeo è rappresentata dalla curva azzurra; cala e tende a zero dopo
tre/quattro settimane. Questa indica la possibilità di isolare agevolmente il virus dal tratto respiratorio, in
quanto in esso il virus si replica. Utilizzando il lavaggio bronco alveolare, il soggetto rimane positivo più a
lungo perché il materiale è più ricco di virus nella fase finale.
La curva gialla indica la positività sulle
feci e il fatto che il virus viene
eliminato per molto tempo. Infatti,
andando ad attuare una
determinazione ambientale del virus
nelle acque reflue si può avere un’idea
di quanto virus stia circolando.
Tuttavia, ciò non ha nessuna rilevanza
diagnostica, poiché non si tratta di
un’infezione gastroenterica. Per
quanto riguarda le IgM e le IgG esse
presentano una particolarità: le linee
tratteggiate escono insieme. In una
fase PCR positiva si hanno già gli
anticorpi, questo è molto utile.
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Microbiologia clinica
Diffusione
Il numero dei casi continua a crescere, nonostante sia ragionevolmente calato il tasso di crescita. Il virus è
diffuso in tutto il mondo: America, Europa, Asia pacifica, Africa. Importante è focalizzarsi sul caso dell’Africa
in cui la stima che viene fatta oggi del numero di casi è di circa 100 milioni di casi al giorno.
Il record riportato è basato su ciò che sappiamo: gli altri continenti riportano, mentre l’Africa no. Il problema
è che si sa cosa sta circolando ma non come, quando, dove.
Di conseguenza l’Africa rappresenta un serbatoio di virus molto grande di cui nessuno ufficialmente si cura
e che si dovrebbe mettere in sicurezza. Il problema è che buona parte dell’Africa ha una spesa sanitaria pro
capite per anno che è la metà del costo di una dose di vaccino. In più buona parte dei vaccini che sono in
circolazione utilizzano la catena del freddo: i vaccini non riuscirebbero neanche ad arrivare in una capitale
dell’Africa, naturalmente in base al Paese, in quanto potrebbe esserci mancanza di energia elettrica. Per
esempio, con Pfizer in Africa si farebbe poco, in quanto esso deve essere tenuto a -20°/-80°.
Per questo si dovrebbero trovare altre soluzioni; sarebbe già meglio utilizzare un vecchio vaccino a virus
ucciso liofilizzato, conterebbe poco ma almeno farebbe un minimo, almeno ci potrebbe arrivare.
Trasmissione
Per quanto riguarda la trasmissione è bene ricordare la differenza tra droplets e aerosol.
I droplets sono più grossi, contengono più virus, e proprio perché sono più grossi cascano più rapidamente e
potenzialmente contaminano le superfici.
L’aerosol è più piccolo, permane in sospensione per più tempo e ha una carica virale inferiore.
All’inizio ci sono state paranoie sulla presenza del virus su oggetti, sulle maniglie delle porte. A questo
proposito la sopravvivenza del virus è sicuramente possibile nell’ambiente ma non così a lungo. Anche per
quanto riguarda la trasmissione oro-fecale, essa non avviene.
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Microbiologia clinica
Per il Covid-19 non esiste una categorizzazione del rischio assoluta: è chiaro che se un paziente ha più di 65
anni, presenta una broncopneumopatia cronica ostruttiva, insufficienza renale, è iperteso, avrà una
situazione peggiore dal punto di vista prognostico. Occorre notare che alla fine è la stessa categoria di
pazienti (circa 70mila) che muore di influenza in Europa. Quindi, queste forme respiratorie si aggravano sui
quadri di patologie intercorrenti.
Diagnosi
Per quanto concerne la diagnosi questa può essere svolta attraverso varie tipologie di esami:
• Ricerca di materiale genetico tramite PCR: questa tecnica viene utilizzata partendo da campioni
biologici ottenuti attraverso aspirati bronchiali, bronco lavaggi, campioni bioptici, tampone
nasofaringeo, campioni salivari e campioni fecali. Per lo svolgimento della PCR c’è un codice colore
per indicare l’urgenza del risultato: viola entro 4h, rosso entro 24h e verde entro 48h;
• Ricerca dell’antigene tramite test rapido: viene utilizzato un campione ottenuto con tampone
nasofaringeo. Andando ad analizzare il processo passo-passo si ha che:
o viene svolto un tampone nasofaringeo;
o il materiale viene messo in una provetta nella quale è presente una soluzione lisante che ha
enzimi che degradano e sciolgono la membrana lipidica dei virus in modo da mostrare meglio
gli antigeni;
o si ottiene una soluzione in cui saranno presenti gli antigeni;
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Microbiologia clinica
o infine, la soluzione ottenuta dalla provetta è posta sul test rapido che in 15-20 min mostrerà
l’esito: barra di controllo e seconda barra allora è positivo, solo barra di controllo il test è
negativo. Il test è invalido se non ho la barra di controllo e va ripetuto.
• Test rapido di ricerca anticorpale: viene fatto con un pungi-dito, il sangue viene posto su una card
che mostrerà un’eventuale positività in circa 10 minuti. Si otterrà una barra di controllo, una barra
per l’eventuale presenza di IgM e una per l’eventuale presenza di IgG (possono comparire entrambe
o solo una). Nel caso in cui sia assente la barra di controllo, analogamente a quanto detto prima, il
test è considerato invalido e di conseguenza è necessario ripeterlo;
• Test sierologico: viene svolto attraverso un prelievo di sangue venoso nel quale il materiale è posto
in una piastra con 96 pozzetti contenenti antigeni specifici, quindi, successivamente, attraverso dei
test immunoenzimatici e di immunofluorescenza, vengono ricercate IgM e IgG.
I test rapidi hanno una grande efficacia per via della loro velocità e in quanto non vanno a gravare sull’attività
dei laboratorî. Tuttavia, questi risultano essere meno affidabili e accurati dei test svolti a livello laboratoristico
e di conseguenza spesso, soprattutto nei casi in cui la sintomatologia risulta essere più grave, il test viene
ripetuto. Comunque, lo svolgimento dei test rapidi funge da filtro che è necessario per non sovraccaricare di
lavoro i laboratorî.
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Microbiologia clinica
Andando ad analizzare questi dati, si può vedere come le famose varianti siano rapide nel fare il loro mestiere.
Le prime varianti inglesi, che ora si chiamano alfa, sono comparse all’inizio di gennaio. Nella settimana del 20
aprile si è raggiunto l’80% di nuove diagnosi da alfa.
Nel secondo grafico viene rappresentato il contrario: quanti sono quelli che non sono alfa tra le nuove
diagnosi. A inizio gennaio erano il 96%, ad aprile il 5.2%. Pertanto, questo virus quando trova la variante
giusta, quindi quella con una maggiore fitness infettiva, agisce in fretta. La variante delta fa ancora prima:
impiega un mese e mezzo contro i quattro mesi dell’alfa.
Ora la delta è presente al 99.9%. Quindi, quando si trova la variante giusta il virus è micidiale, cambia lo
scenario. Per fortuna i vaccini funzionano anche contro queste varianti.
C’è una distinzione dei vaccini per quanto riguarda la loro efficacia. Quando si parla di efficacia del vaccino si
intende la capacità di prevenire la malattia severa e moderata, mentre l’efficacia sulle infezioni risulta essere
minore. Sulle infezioni ponderate questo vaccino funziona generalmente bene, al 95%, anche se qualcuno un
poco meno (es. Sinovac). Sulla malattia severa, quella che porta in ospedale e forse in terapia intensiva,
l’efficacia è ingente. Se si è vaccinati e ci si ammala, si ha meno del 5% di probabilità di avere malattia grave.
Questo funziona su tutte le varianti. Anche il Sinovac su questa arriva quasi al 90%, mentre sulle infezioni
molto meno.
Oggi come oggi il virus
continua a circolare, si
hanno decine di persone
vaccinate che si infettano.
Non si può sapere
esattamente quanti siano i
vaccinati che si infettano,
ma solo quelli che si
ammalano; tuttavia, se si
ammalano lo fanno in
maniera molto moderata.
Si sta raggiungendo la
famosa fase di endemia, la
quale permetterebbe di
venirne fuori in maniera
sensata.
Importante è analizzare la
categoria degli operatori
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Microbiologia clinica
sanitarî perché sono tutti vaccinati e perché è abbastanza facile reperirli, non bisogna cercarli. Gli operatori
sanitari che si ammalano non fanno cluster secondari, non ci sono casi secondari. Nella prima ondata gli
operatori sanitari erano tra i peggiori casi che ci fossero, spargevano e infettavano. Adesso la situazione, per
l’appunto, è molto diversa.
Per quanto riguarda l’utilizzo della PCR essa ha un’applicabilità che deve avvenire in tempi ben definiti, se si
applica prima della comparsa dei sintomi è molto probabile avere un falso negativo, mentre all’esordio dei
sintomi si riesce a riscontrare molto bene il virus.
L’Istituto Superiore di Sanità (ISS) chiede da cinque mesi ai laboratori di riferimento del sequenziamento di
fare una volta al mese, in un giorno predefinito, una raccolta e un sequenziamento di campioni positivi,
derivanti dalla pratica di laboratorio, identificati in quel giorno. È stato fatto il 24 agosto, poi il 26 settembre
con lo scopo di vedere che cosa sta circolando.
Questi sono i dati parziali della sola regione Emilia-Romagna, in quanto comunque i tempi per la raccolta
sono prolungati.
Dati di fine agosto, da notare la quantità di B.1.517.2, che rappresenta 98 campioni su 151.
Tutte le sottovarianti presenti al momento derivano dalla delta.
Il sistema di classificazione nota qualcosa di diverso (es. una delezione).
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Microbiologia clinica
non neutropenici possono però esser colpiti, come pazienti con l’influenza (dove l’aspergillosi può verificarsi
come complicanza), pazienti ricoverati in terapia intensiva (anche nei pazienti Covid-19) o pazienti
ematologici trattati con CAR-T cells (linfociti chimera che combattono le cellule tumorali).
Facendo riferimento a un recente studio: a Victoria, Australia, sono stati analizzati pazienti ospedalizzati
nell’arco temporale di 11 anni (2005-2016) per ricercare l’incidenza dello sviluppo di infezioni invasive. Tra
tutti i pazienti ospedalizzati, ovvero 619.702, circa 32.815 erano pazienti onco-ematologici e 1765 trapiantati.
Dei pazienti onco-ematologici, il 2,04% ha sviluppato un’infezione invasiva nei 12 mesi successivi alla
diagnosi; nei pazienti trapiantati di midollo parliamo invece del 6,29%. Si può notare come la percentuale sia
più alta nei trapiantati piuttosto che nei pazienti con leucemia. Dunque, anche il trapianto è un’importante
fattore di rischio per questi pazienti ematologici.
Il grafico a destra mostra, invece, quali sono le infezioni fungine invasive più comuni, divise per patologia. Si
rileva che le infezioni invasive più comuni sono quindi le aspergillosi invasive e le infezioni da Candida
invasive, mentre le mucormicosi (più rare) sono più comuni nei trapiantati e nei pazienti con leucemia
mieloide e linfoide. In questo
contesto, per candidiasi
invasive si intende la presenza
di Candida a livello ematico,
quindi una sepsi.
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Microbiologia clinica
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Microbiologia clinica
M2.4.4 Specie
Le specie di Aspergillus che
danno aspergillosi polmonare
invasiva sono molteplici. Quella predominante è l’Aspergillus fumigatus, con tipica colorazione grigio-
verdastra data dai conidi che presentano questa pigmentazione, mentre le ife sono trasparenti. Il colore delle
ife è visibile voltando la piastra e osservando il retro (anche nella coltivazione dei funghi neri, voltando la
piastra, è osservabile la colorazione nera delle ife poiché producono melanina).
Oltre al fumigatus, vi sono altre specie di aspergillo, tra cui il flavus e il niger. Queste sono le tre specie più
rilevate in pazienti immunodepressi con aspergillosi polmonare invasiva.
M2.4.5 Diagnosi
Per quanto riguarda la diagnosi, è presente un protocollo definito da alcune associazioni europee
(EORTC/MSG) che aiuta i clinici nel poter definire una diagnosi come certa, probabile o possibile. Non basta
individuare il patogeno per fare diagnosi perché le spore fungine, che sono diffuse nell’ambiente ed
estremamente volatili, si possono ritrovare nel materiale patologico a causa di una contaminazione
(avvenuta nel momento del campionamento), o può accadere che un paziente sia colonizzato senza
necessariamente presentare infezione. La diagnosi viene categorizzata, in base al rischio di insorgenza della
malattia, in tre criterî: criterî dell’ospite, criterî clinici e criterî microbiologici.
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Microbiologia clinica
Criterî dell’ospite à Sono rappresentati dalle eventuali malattie e terapie in atto. Possono essere ad esempio
il fatto di essere neutropenici, di aver subito un trapianto di midollo allogenico, avere un’immunodeficienza
congenita o assumere corticosteroidi (immunosoppressori): sono tutti fattori di rischio dell’ospite.
Criterî microbiologici à Sono rappresentati da: esame microscopico diretto (osservazione del materiale
patologico al microscopio), esame colturale, esame anatomopatologico in seguito a biopsia, test sierologici
con indicatori quali il galatto-mannano e il β-1,3-D-glucano.
Si può fornire diagnosi di aspergillosi invasiva certa quando si ha una diagnosi istopatologica che deriva
direttamente da una biopsia del materiale prelevato dal paziente, con la presenza di ife fungine. Si dice
diagnosi istopatologica perché qui l’esame microbiologico non vale: infatti, essendo l’albero respiratorio
soggetto a contaminazione esterna, è necessario osservare le ife fungine nel pezzo istologico per dare
diagnosi certa, tramite esame microscopico diretto o anatomopatologico (Alcuni funghi, come il fusarium,
possono essere anche isolati nel sangue; in questo caso l’esame microbiologico può essere effettuato perché
il sangue è materiale sterile).
Per la diagnosi di
aspergillosi invasiva
probabile si dispone di
criterio dell’ospite +
criterio clinico + criterio
microbiologico. Il criterio
microbiologico può essere
un semplice esame
colturale o, nel caso di
esame colturale negativo,
si può avere un test
sierologico positivo, ad
esempio i galatto-
mannani positivi. Quindi,
ad esempio, in caso di
criterî dell’ospite positivi
(es. neutropenico), tac
suggestiva, coltura
negativa ma galatto-
mannani positivi, si può formulare una diagnosi probabile.
Per una diagnosi di aspergillosi invasiva possibile non si dispone né di criterio microbiologico né di quello
istologico, rimangono i criterî dell’ospite e clinici: es. un paziente neutropenico con tac suggestiva, senza la
certezza microbiologica.
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Microbiologia clinica
colorato col calcofluor (che si lega alla chitina della parete, dando una colorazione azzurro/verdastra). Nella
foto alla pagina precedente vediamo le ife settate nel sedimento di BAL in un paziente con leucemia mieloide
acuta con febbre, neutropenia e febbre.
• Esame colturale
Oltre all’esame
microscopico diretto, il
materiale patologico può
essere preso e messo in
coltura. La semina viene
fatta in tubi sigillati
ermeticamente (per evitare
una contaminazione
ambientale),
successivamente, dopo circa
5-10 gg, se è avvenuta la
crescita, si effettua una semina su piastre di Sabouraud (terreno tipico per la crescita dei funghi filamentosi),
prelevando con un’ansa il fungo filamentoso dal tubo ed effettuando 3 “pic” nella piastra (per questo in
genere si osservano 3 grandi colonie).
A partire da un esame colturale si possono
osservare sia caratteristiche macroscopiche che
microscopiche. L’esame microscopico effettuato
sulla colonia avrà uno scopo diverso rispetto a
quello effettuato direttamente su materiale
patologico, ossia quello di determinare la specie
fungina tramite l’utilizzo della colorazione
lattofenolo cotton blu.
Si osservano caratteristiche dell’ifa, della vescicola ecc. A sinistra è presente un aspergillo e a destra un
fusarium, da notare le diverse caratteristiche morfologiche: nel primo caso si notano una vescicola con le
fialidi e i conidi, mentre nel secondo caso i macroconidi si aggregano a formare delle strutture senza nessuna
vescicola.
La parete cellulare degli eumiceti, esterna alla membrana plasmatica, presenta una struttura chimica molto
complessa. I componenti principali sono riconducibili a polisaccaridi di quattro tipi: Mannani, Glucani,
Chitosano (negli Zigomiceti) e Chitina. La chitina è un polimero formato da subunità di N-acetilglucosammina
ed è la componente che trattiene il colorante cotton blu, carico negativamente.
Questo test, dunque, da un lato anticipa la diagnosi, dall’altro risulta però essere aspecifico, quindi può dare
falsi positivi, in quanto:
• potrebbe comparire anche con terapia antibatterica con piperacillina-tazobactam o amoxicillina-
clavulanico;
• potrebbe essere rilasciato anche da altri miceti come il Penicillium, un fungo filamentoso non
patogeno normale contaminante quindi non agente eziologico di polmonite invasiva, anche
dall’Alternaria, dall’Histoplasma, dal Cryptococcus.
Quindi è un test di facile esecuzione, molto utile
ma è scarsamente specifico. Per questo è
importante considerare molti parametri per la
diagnosi.
Il test si avvale di micro-piastre a 96 pozzetti, sul
fondo dei quali sono presenti anticorpi
monoclonali che riconoscono antigeni del galatto-
mannano. Sono poi utilizzati anticorpi monoclonali
secondari marcati con un cromogeno che emette
un segnale nel momento in cui riconosce e si lega
all’immunocomplesso.
In genere: se il valore numerico che si ottiene dal test è superiore a 0.5 (alcuni laboratori utilizzano 1 come
valore cut-off), allora si considera il test positivo.
Questo testo può lavorare non solo sul materiale respiratorio, ma anche sul siero o sul plasma: nel caso di
infezione fungina invasiva, infatti, gli antigeni del galatto-mannano possono essere rilasciati nel torrente
circolatorio, non troviamo quindi l’ifa nel torrente circolatorio ma i suoi antigeni.
Un altro test molto utilizzato è quello del βD-glucano: il βD-glucano è un componente della parete del lievito
che viene rilasciata in modo più consistente del galatto-mannano nel siero. Questo antigene viene ricercato
se si sospetta infezione invasiva da lieviti o in particolare da candida. Il test è utile nel monitoraggio in pazienti
a rischio di sviluppare infezioni fungine invasive (pazienti con resezione intestinale), è eseguito sul siero e su
base bisettimanale; finché il test rimane negativo si può escludere con ragionevole certezza l’infezione, per
cui il valore predittivo negativo è estremamente elevato.
• Test molecolari
Altro test che si può utilizzare è il test di PCR, molto dibattuto soprattutto per l’utilizzo con i campioni di
sangue, quindi come un test da affiancare al GM. Il problema è che le ife fungine sono molto dure e resistenti;
pertanto, risulta difficile estrarre gli acidi nucleici, e di DNA di aspergillo in circolo ce n’è, ma è sempre molto
poco. Quindi per anni si è dibattuto sull’utilizzo o meno di questo test in diagnostica microbiologica, e ad oggi
esistono dei test commerciali sviluppati dalle ditte farmaceutiche che danno dei buoni risultati. Questo è un
test che anche su BAL dà una sensibilità molto superiore rispetto all’esame colturale. Si può usare quindi sia
su sangue che su BAL.
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Microbiologia clinica
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Microbiologia clinica
sviluppata una resistenza agli azoli. Generalmente tende a non essere utilizzata come farmaco di prima linea
in quanto l’amfotericina è un farmaco ad elevata tossicità.
È importante, come sottolineato nella tabella sottostante, conoscere la specie fungina, poiché alcuni funghi
presenteranno una resistenza intrinseca al voriconazolo, come l’A. niger, e altri all’amfotericina B, come l’A.
terreus.
Sensibilità ai farmaci
Per studiare la sensibilità in vitro dei funghi filamentosi si utilizzano, come suggerito da EUCAST, dei valori
soglia chiamati breakpoints che consistono in concentrazioni di farmaco in mg/L.
Questi valori variano da specie a specie. Per l’Aspergillus fumigatus trattato con amfotericina B:
• valori di MIC ≤ 1: il fungo è sensibile al farmaco;
• valori di MIC > 2: il fungo è resistente al farmaco.
Quando c’è IE vuol dire che ancora non è stata determinata.
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Microbiologia clinica
un aspergillo già resistente, e una volta iniziata una terapia con voriconazolo si vede che il paziente non
risponde. Dunque, non è una resistenza dovuta a una terapia con azoli che fa sì che tramite selezione
sopravvivano solo le ife fungine resistenti a questi, ma è dovuta a degli aspergilli già resistenti presenti
nell’ambiente.
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Microbiologia clinica
• diarrea, indice di un’aumentata eliminazione di fluidi con le feci (con più di 3 scariche diarroiche al
giorno);
• dissenteria, indice di un’aumentata eliminazione di fluidi con le feci, accompagnate da sangue e
muco. Il quadro clinico è accompagnato da uno stato di infiammazione e danno della mucosa
intestinale (febbre, tenesmo e crampi addominali);
• febbre enterica, quadro sistemico causato dalle Salmonella typhi e paratyphi A-C. Queste possono
entrare nella circolazione ematica e interessare molti organi ed apparati. Nelle nostre situazioni
geografiche le febbri enteriche sono forme estremamente poco probabili, ma muovendosi fuori da
queste situazioni geografiche bisogna tenere in considerazione queste possibilità.
È importante ricordare che diarrea e dissenteria non sono sinonimi, ma sono due cose diverse. Hanno
patogenesi differenti e di conseguenza anche espressione clinica diversa.
La diarrea è un’aumentata eliminazione di fluidi dal lume intestinale e quindi un’aumentata fluidità della
massa fecale.
La dissenteria, al contrario, è una situazione che non è causata da un’alterazione del riassorbimento di liquidi
a livello delle mucose intestinali, ma è causata da una vera e propria situazione di danno del tessuto mucosale
per cui nelle feci (che non sono per forza completamente liquide) c’è sempre muco e sangue. Spesso nei casi
di dissenteria, facendo un esame microscopico, si trova un tappeto di neutrofili, indice di flogosi batterica.
Da un punto di vista clinico l’immediata distinzione tra una e l’altra non è così semplice.
M3.2.1 Diagnosi
La diagnosi dell’infezione da Helicobacter pylori si avvale di diversi strumenti:
• Test diretti, volti a mettere in evidenza la presenza dell’agente patogeno. Si dividono in
o Invasivi: test effettuati su biopsia gastrica. Prevedono l’utilizzo di un sondino che consente
di prelevare un campione di tessuto gastrico che può essere così sottoposto sia ad esame
istologico che ad una analisi della sua attività ureasica o a PCR. Per la valutazione dell’attività
ureasica si pone il campione in un terreno semisolido con un indicatore di pH; se quest’ultimo
indica un cambiamento del pH virando da giallo ad arancione, si ha la presenza di batteri
ancora vitali, in grado di determinare il cambiamento di pH mediante la produzione di ureasi.
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Microbiologia clinica
o Non invasivi: Breath test. Si basa sulla somministrazione di urea marcata con Carbonio- 13
che, una volta ingerita, viene idrolizzata dall’ureasi batterica a livello dello stomaco, portando
alla produzione di ammonio e anidride carbonica marcata che, dopo essere stata liberata
mediante l’espirazione, viene rilevata da appositi strumenti.
• Test indiretti, volti a mettere in evidenza la risposta immunitaria nei confronti dell’Helicobacter
pylori. Si suddividono a loro volta in
o Test indiretti non invasivi: ricerca di antigeni di H. pylori nelle feci, mediante test ELISA o test
immunocromatografici, simili ai test di gravidanza, che prevedono lo striscio su piastre
reattive di materiale fecale. Se l’antigene è presente, si legherà ai rispettivi anticorpi e si avrà
il segnale di positività;
o Test indiretti sierologici: ricerca delle IgG sieriche mediante tecnica ELISA o Western blot.
Il difetto dei test indiretti non invasivi è che l’eliminazione fecale dell’antigene di Helicobacter non è un fatto
costante, ma dipende da quanto tempo prima è avvenuto un forte svuotamento gastrico.
Quando lo stomaco si svuota, emette nell’intestino una discreta quantità di antigeni.
Se questo fatto è già avvenuto e si raccolgono le feci, la quantità di antigene potrebbe essere sotto al limite
di sensibilità del test.
A questo si ovvia in maniera molto semplice, cioè ripetendo il test 3 volte in un intervallo di tempo compreso
tra una settimana e 10 giorni. Tutto questo ha senso farlo solo ed esclusivamente in un paziente con malattia
dispeptica.
Per quanto riguarda i test indiretti sierologici, essi indicano la sieroprevalenza, cioè la quantità di popolazione
che è positiva per gli anticorpi verso un determinato antigene; questa nei confronti dell’H. pylori nella
popolazione dei paesi occidentali è sopra il 60 % e in Africa o India ancora più alta. Non esiste quindi la
possibilità di trovare un nesso causale tra sieropositività e malattia dispeptica. Di conseguenza, la sierologia
ha solamente un carattere epidemiologico. [Studiatelo bene, fate onore a Vaira!]
Infezioni da batterî. Hanno un periodo di incubazione (dal momento dell’ingestione del cibo contaminato
alla manifestazione dei sintomi) di 3-7 giorni. I sintomi possono essere diarrea acquosa o dissenteria, ma
anche febbre e altri sintomi a seconda del microrganismo responsabile. La durata in genere è di qualche
giorno, massimo 7. Si possono avere delle complicanze tra cui la batteriemia, che può avvenire per Shigella,
Salmonella e Campylobacter; la presenza, soprattutto per infezione da Campylobacter jejuni, di reazioni
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Microbiologia clinica
autoimmuni secondarie come artrite reattiva e/o paralisi periferica ascendente legata alla produzione di
auto-anticorpi contro la mielina, questa condizione è denominata sindrome di Guillain-Barré.
Infezioni da virus. Il periodo di incubazione è brevissimo, di solito 1 giorno. I sintomi sono: vomito
prominente, compulsivo ed esplosivo (il Norovirus induce un tipo di vomito il cui aerosol può causare la
trasmissione dell’infezione ad altre persone), diarrea acquosa (non causano dissenteria), febbricola. La
durata è breve, il tutto è molto esplosivo e rapido per cui di solito in 1-2 giorni il paziente sta bene.
Infezioni da protozoi. Il periodo di incubazione è lungo, maggiore di una settimana, di solito 1-4 settimane.
La manifestazione dei sintomi in genere è graduale: ad esempio la Giardia causa una diarrea non esplosiva,
di qualche scarica al giorno, che può essere alternata a stipsi, ma comunque in genere è cronica (di durata
maggiore di 1 settimana), nausea, inappetenza.
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Microbiologia clinica
M3.3.3 Zoonosi
Per zoonosi si intende il passaggio di un microrganismo potenzialmente patogeno per l’uomo da un ospite
animale all’uomo stesso. Il passaggio è spesso mediato dall’alimentazione o da un vettore artropode. Le
zoonosi sono importanti nelle infezioni del tratto gastro-entico perché queste sono spesso causate dal
passaggio di microrganismi dall’animale all’uomo mediante l’alimentazione. Si parla di:
• circuito oro-fecale: introduzione di un organismo che poi viene liberato con le feci e successivamente
reintrodotto nell’ospite umano. Il termine si riferisce prevalentemente a infezioni a circolazione
interumana;
• via alimentare: introduzione mediante l’alimentazione di un patogeno che poi non segue il circuito
oro-fecale.
Vengono quindi trattati i principali agenti eziologici di zoonosi legate all’alimentazione secondo il documento
europeo della One Health del 2018. Dal punto di vista epidemiologico, a livello europeo, i microrganismi
maggiormente sorvegliati sono
• Campylobacter;
• Salmonella;
• Listeria monocytogenes;
• Shiga-toxin-producing E. coli (STEC);
• Brucella;
• Trichinella;
• Echinococcus.
Tra le zoonosi sotto sorveglianza su base
epidemiologica ci sono Yersinia,
Toxoplasma gondi e altre (Rabbia, febbre Q,
WNV, tularemia). Non tutte interessano il
tratto gastro-enterico e non tutte vengono
sorvegliate costantemente in tutte le
nazioni, ma vengono valutate a seconda dei
dati epidemiologici.
Tra le zoonosi più diffuse vi sono le campilobatteriosi con 246.571 casi in Europa, seguite dalle salmonellosi,
dalle infezioni da STEC, dalle yersiniosi e dalle listeriosi.
Campylobacter
Il Campylobacter è importantissimo dal punto di
vista epidemiologico per quanto riguarda le infezioni
del tratto intestinale: nei laboratori di microbiologia
è una delle analisi di feci più richieste insieme alla
Shigella e alla Salmonella. È un batterio ossidasi
positivo, quindi non fa parte delle
Enterobacteriaceae, è microaerofilo (cresce bene a
basse pressioni parziali di ossigeno), la sua
temperatura ottimale di crescita è di 42°C (sono gli
unici batterî le cui piastre per la coltivazione
vengono incubate a questa temperatura). È un
bacillo Gram–, elicoidale, asporigeno e presenta
flagelli polari. In Europa è la malattia gastro-
intestinale più frequente dal 2005 e nel 2018
abbiamo avuto una frequenza di 64 casi per 100.000
abitanti (la tendenza è rimasta stabile dal 2014 al 2018).
Il resevoir del Campylobacter, essendo una zoonosi, è rappresentato dai volatili da allevamento, in particolare
il pollame (pollo e tacchino): gli uomini si infettano per ingestione di carni poco cotte o non trattate
adeguatamente. È possibile l’infezione anche da latte contaminato non pastorizzato, contaminato da
Campylobacter spp (le cui principali specie sono l’E. coli e il jejuni) poiché, essendo un’infezione intestinale,
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Microbiologia clinica
può contaminare le acque e poi, di conseguenza, infettare altri animali come i bovini. Questo batterio inoltre
tende a sopravvivere bene nell’ambiente, perché tende ad associarsi alle amebe, che sono protozoi,
analogamente a quanto fanno le Legionellae.
La diagnosi viene fatta utilizzando un Fecal Swab con tappo verde, che contiene una palettina che permette
di raccogliere materiale fecale, eventualmente raccolto prima in un barattolo sterile. Dev’essere trasportato
il prima possibile in laboratorio (entro 1-2 h dal prelievo), eventualmente può essere conservato a 4 gradi per
un massimo di 48 h. Ovviamente, la prima cosa che si osserva in laboratorio è la consistenza del materiale:
se il materiale è solido, il campione non è idoneo all’analisi di questi microrganismi, la cui manifestazione
clinica è la diarrea. In genere quindi il materiale è liquido e ci si aiuta a trasferirlo per mezzo di una palettina
presente all’interno degli swab.
Il Campylobacter cresce su molti terreni, anche agar sangue semplice, ma
il materiale fecale, essendo particolarmente ricco di specie batteriche
contaminanti (del microbiota intestinale), necessita di terreni selettivi per
la ricerca di patogeni intestinali. I terreni per batterî intestinali
contengono in genere agenti selettivi di tipo antibatterico, come
vancomicina, importante perché inibisce la crescita di Gram+,
cefalosporine (cefoperazone), per inibire la crescita di Gram–, e il
cicloeximide, per inibire la crescita fungina. Ci sono poi delle sostanze
come il carbone vegetale (ma anche l’ematina e il sodio piruvato) che,
come matrice del terreno al posto del globulo rosso, facilita l’aero-
tollerabilità, essendo il Campylobacter microaerofilo. Inoltre, pigmenta di
nero il terreno stesso (terreno Karmali).
La crescita avviene a 42 gradi e la piastra viene tenuta in incubazione per 48 ore, formando colonie quasi
dello stesso colore del terreno, un po’ più grigiastre.
Salmonella
La salmonellosi è la seconda causa di infezione gastro-intestinale dopo la campilobatteriosi in Europa: nel
2018 sono stati rilevati più di 90.000 casi, con un’incidenza di 20 casi per 100.000 abitanti. La maggior parte
delle infezioni è data da S. enteritidis: questa è introdotta attraverso l’alimentazione e la sorgente principale
è rappresentata da pollame, ma anche da altre carni e uova. Appartiene alla famiglia delle
Enterobacteriaceae, a cui appartengono anche Shigella e altri batterî già visti, ossidasi negativi, Gram–,
aerobi-anaerobi facoltativi, asporigeni.
Le salmonellosi si dividono in due tipi che danno quadri clinici distinti:
• le salmonellosi minori, che sono delle gastroenteriti (in particolare enteriti), difficilmente diventano
infezioni sistemiche. Gli agenti eziologici delle salmonellosi minori sono dei serovar (sierotipi) di
salmonella che sono ubiquitari, come ad esempio la S. enteritidis, che sono diffusi in animali da
allevamento. In questo caso il serbatoio è l’animale e la trasmissione all’uomo avviene attraverso
ingestione di cibi contaminati;
• le salmonellosi maggiori sono invece infezioni sistemiche, causate da serovar che si sono adattati
all’uomo e che sono quindi ad esclusiva circolazione interumana, come la S. typhi e S. paratyphi A, B
e C. Il circuito è quindi oro-fecale: l’uomo elimina questi microrganismi con le feci, può contaminare
ad esempio le acque e quindi infettare altri uomini, perpetrando il circuito. Questo avviene anche
grazie a serbatoi umani, che in genere albergano queste specie di Salmonella a livello della cistifellea
e continuano a eliminare il microrganismo nell’ambiente e a perpetrare la circolazione interumana
(che non prende in considerazione il serbatoio animale). La Salmonella typhi e paratyphi, a differenza
delle salmonellosi minori, sono infezioni rare in comunità europea: sono perlopiù da importazione,
correlate ai viaggi al di fuori dell’Europa, principalmente in Asia. Nel 2017 si sono verificati 1098 casi
dei quali il 90% era correlato a viaggi.
In basso, una mappa dell’ECDC, che possiede i dati più aggiornati (2017), rappresenta i paesi più colpiti
colorati in rosso, ossia Francia e UK (>0,75 casi per 100.000 abitanti).
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Microbiologia clinica
La distribuzione di tifo e paratifo dipende anche dell’età: in neonati e bambini sotto i 4 anni è lievemente
maggiore nei maschi, tra i 15 e i 24 anni è più frequente nelle donne e poi l’incidenza cala negli anziani. La
Salmonella typhi, con 744 casi e il 68% di quelli totali, è sicuramente l’agente eziologico maggiore tra le
salmonellosi maggiori.
La patogenesi è basata su un
serbatoio quindi umano: la
colecistite cronica può essere
assolutamente asintomatica,
ma è associata allo stato di
portatori, infatti permette di
eliminare il batterio con le feci
nell’ambiente. Si ha quindi la
trasmissione oro-fecale,
abbiamo la colonizzazione del
tenue, l’invasione della
sottomucosa e poi,
attraversando i vasi linfatici e i
linfonodi mesenterici, si
riversa nel dotto toracico che
converge nel torrente
circolatorio, causando una
prima batteriemia transitoria.
Abbiamo poi l’infezione di
diversi tessuti, con moltiplicazione nei macrofagi del fegato, milza e midollo osseo e quindi una batteriemia
secondaria persistente. Dal fegato, la bile giunge alla colecisti (stato di portatore cronico) e si ha una
colonizzazione secondaria del tenue, che porta alla fase veramente sintomatica. Non è tanto la
colonizzazione primaria che dà il quadro di infiammazione intestinale, quanto la colonizzazione secondaria,
che prevede infiammazione e ulcerazione delle placche del Peyer. Infine, anche in questo caso, si avrà
l’eliminazione del batterio con le feci nell’ambiente.
Shigella
Le Shigellae sono parassiti esclusivi dell’uomo, perciò anche in questo caso non si parla di zoonosi, ma di
infezione interumana a circuito oro-fecale. Si distinguono quattro sottogruppi (S. dysenteriae, S. flexneri, S.
boydii, S. sonnei); la più importante dal punto di vista patologico è la S. dysenteriae, che produce la tossina
di Shiga (l’Escherichia coli produce la tossina shiga-like), il cui effetto citotossico inizialmente era stato
studiato su cellule “vero”, linee cellulari coltivate in vitro. Essa ha effetto sull’epitelio intestinale, causando
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Microbiologia clinica
una colite emorragica, ma soprattutto può entrare in circolo con conseguenze molto gravi, come la sindrome
uremico-emolitica, responsabile dell’elevata mortalità della shigellosi, oppure la compromissione del SNC,
per il suo effetto tossico sugli epiteli vascolari. La patogenesi ha origine con la penetrazione per endocitosi
delle Shigellae nell’epitelio intestinale; esse fuoriescono poi dalle vescicole endocitotiche, sfuggendo alla lisi
che avverrebbe a livello dei lisosomi, e si moltiplicano all’interno delle cellule riuscendo a sopravvivere, non
essendo indirizzate al fagolisosoma. Invadono poi le cellule circostanti con la distruzione delle stesse,
evadendo la risposta immunitaria. Invadono la sottomucosa e la lamina propria (dove si accumulano
metaboliti tossici ed endotossina) e quindi richiamano le cellule dell’infiammazione. Le cellule invase
producono segnali di danno che attirano i macrofagi, i quali sono la causa della uccisione delle cellule e della
distruzione della mucosa intestinale portandola alla necrosi, mentre le Shigellae invadono le cellule adiacenti.
Anche in questo caso l’epidemiologia è ECDC 2017: sono riportati circa 2 casi per 100.000 abitanti. Le persone
più colpite sono i bambini con meno di 5 anni di età e i maschi adulti tra i 25 e i 44 anni, soprattutto
omosessuali.
Si utilizza per la diagnosi un terreno Hecktoen, di colore verde petrolio, selettivo: la selettività è importante
per esaminare un campione di feci, molto contaminato, in cui il microrganismo responsabile del processo
infettivo è mescolato a una popolazione molto vasta e numerosa di specie batteriche e diventa quindi più
difficile da individuare. È quindi necessario utilizzare in primis un terreno selettivo per isolare il batterio
patogeno, ma molto spesso si usano anche terreni di arricchimento che favoriscono, attraverso un terreno
liquido, l’arricchimento delle specie patogene desiderate, in modo da isolare il microrganismo di interesse.
In questo caso gli elementi selettivi sono rappresentati dai sali biliari, che inibiscono la crescita di Gram+, e
poi vengono utilizzati lattosio, saccarosio e salicina, che sono metaboliti che vengono fermentati da molte
Enterobacteriaceae come l’Escherichia coli, ma non da Shigellae e Salmonellae. Questo comporta che in
questo terreno la crescita di Shigella e Salmonella non produca alcun pigmento messo in evidenza
dall’indicatore di pH, mentre per esempio le colonie di E. coli si colorano di arancione o giallo, molto ben
visibili. Le colonie di Shigella, invece, sono di colore verde, come il terreno, mentre quelle di Salmonella
risultano pigmentate di nero perché, essendo presenti citrato di ammonio ferrico e tiosolfato di sodio,
mettono in evidenza il solfuro di idrogeno prodotto dalla Salmonella.
Il terreno Hektoen è quindi un terreno cromogeno, che mette in evidenza colonie verdi, nel caso della
Shigella, e con punta nera, nel caso della Salmonella.
Abbiamo sempre lo stesso dispositivo per la raccolta del materiale: si fa una semina diretta del materiale
patologico sulle piastre, come per il Campylobacter, ma non necessita di ambiente microaerofilo e di una
temperatura di 42 gradi. Il Campylobacter veniva incubato per 48 ore per poi fare la lettura, invece per
Salmonella e Shigella abbiamo una semina diretta del materiale patogeno e viene fatta una lettura dopo 24
ore e una ulteriore lettura dopo 48 ore.
Per la Shigella e la Salmonella la temperatura è di 37 gradi e dopo 24 ore, se si osservano colonie, si può fare
un’identificazione delle specie tramite spettrometria di massa MALDI-TOFF.
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Microbiologia clinica
Per le Salmonellae si possono fare ulteriori passaggi su terreni cromogeni (che colorano la Salmonella di un
violetto malva), particolarmente in condizioni meno ottimali, in cui abbiamo 2-3 colonie nere sormontate
magari da colonie di Escherichia coli, di colore giallo, o altre Enterobacteriaceae che possono essere arancioni.
Si fa dunque una sottocoltura di una colonia
specifica, una coltura secondaria. In una
condizione non ottimale, ripassare una colonia
nera che si trova in mezzo alle altre in un terreno
di questo tipo può favorire l’identificazione di
Salmonella, che diventa viola in mezzo a una serie
di altri batterî di colori diversi, e comunque anche
questa colonia dovrà sempre passare per la
spettrometria di massa.
Un’altra strategia per isolare questo tipo di
batterî è utilizzare un brodo di arricchimento, in
questo caso un terreno selenite (brodo di
arricchimento in cui si inserisce il materiale
fecale, viene lasciato in arricchimento a 37° per
una notte; la peculiarità di questo terreno è che inibisce la crescita di ogni batterio eccetto per la Salmonella),
che favorisce la crescita delle Salmonellae e delle Shigellae rispetto a tutti gli altri batterî contenuti nelle feci.
Avremo quindi:
• una semina sulle piastre del materiale fecale con lettura nelle 24 ore;
• parallelamente, si fa una prima semina in brodo di selenite e, dopo 24 ore di arricchimento, si fa una
seconda semina su piastra Hecktoen con lettura dopo 24 ore dall’arrivo del campione al laboratorio.
Qui la semina viene fatta con arricchimento e sarà più probabile poter identificare le colonie di Shigella e
Salmonella: si tenta la prima strada, per tentare di avere una diagnosi più rapida, e comunque si ha una sorta
di backup alle 48 ore, per confermare una eventuale diagnosi fatta alle 24 ore oppure per poter identificare
quei casi che ci si è persi non arricchendo il materiale di partenza, con spettrometria ed eventuali piastre
cromogene (che non sono selettive, colorano quindi i batteri in base al loro metabolismo, nel caso della
Salmonella di violetto).
La reazione di Widal-Wright, invece, è una ricerca sierologica, oggi non più utilizzata, che cerca gli anticorpi
anti-Salmonella typhi, paratyphi e anti-Brucella utilizzando l’agglutinazione: essa sfrutta sospensioni
batteriche dei batterî sopracitati marcate con coloranti e si fanno reagire con il siero del paziente. Se sono
presenti anticorpi si forma una reazione di agglutinazione nel siero del paziente. Questa tecnica veniva
utilizzata quando questi tre batterî erano molto diffusi e davano delle “febbri di origine sconosciuta” (FUO)
e sono quindi stati associati insieme in una sola tecnica diagnostica che oggi non ha più valore clinico, sia per
la bassa prevalenza di queste infezioni che per le migliori tecniche diagnostiche oggi presenti.
Escherichia coli
Normalmente presente nel tratto intestinale di uomo e bovini. Prototipo del batterio Gram–. In alcune
situazioni è adesivo e a parte alcune sottopopolazioni non da patologie intestinali. Gli E. coli sono difficili da
differenziare gli uni dagli altri, essendo simili dal punto di vista sia genetico che antigenico: l’unica cosa che
si può utilizzare come una sorta di classificazione è la loro capacità patogena.
Prenderemo in considerazioni solo le infezioni da Escherichia coli entero-emorragico, che sono quelle che
hanno un valore patogeno più significativo nei confronti dell’uomo. L’esame colturale dell’Escherichia coli,
infatti, non ha grande importanza, è sempre presente in un esame fecale. Bisogna piuttosto mettere in
evidenza un’eventuale produzione della tossina entero-emorragica, che causa infezioni più gravi, necessita
di ospedalizzazione ed è caratterizzata da una mortalità più elevata.
I principali quadri patologici da infezione di E. coli sono:
• infezioni esogene, di origine animale (come le zoonosi da E. Coli entero-emorragico);
• meningite neonatale intra-partum, dovuta al passaggio dei ceppi K di E. coli dal retto al canale del
parto (endogena);
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Microbiologia clinica
Zoonosi da ceppi entero-emorragici (STEC: E. coli produttore di tossina shiga-like): è dovuta a un serbatoio
che è il bovino adulto, in genere asintomatico: le carni sono contaminate (come nelle infezioni da
Campylobacter nel pollame) e inoltre, eliminando il microrganismo nell’ambiente con le feci, può infettare
per esempio le acque che vengono utilizzate per irrigare i campi, contaminando anche ortaggi e vegetali.
Quindi attraverso l’alimentazione l’uomo si può infettare, andando incontro a una dissenteria con un periodo
di incubazione che va da 3 a 8 giorni. Importante è sì la sintomatologia locale, la dissenteria, ma anche le
complicazioni, dovute all’azione sistemica della tossina shiga-like, quindi la sindrome uremico-emolitica e il
possibile danno a livello del sistema nervoso centrale. Il tasso di mortalità è del 3-5 %.
L’epidemiologia del 2018 riporta 8.161 casi di STEC con incidenza di 2.28 casi per 100.000 abitanti, con un
incremento del 39% rispetto al 2017.
Abbiamo diversi sierogruppi di EHEC, sono identificati da O (antigene Outer membrane) seguito da un
numero che si basa sul gruppo progressivo di isolamento. La maggior parte dei casi è dovuto al sierogruppo
O157 che è quello più importante e di cui si è parlato di più.
Famoso è l’outbreak verificatosi in Germania nel 2011 con l’infezione di 3950 persone, 53 delle quali sono
morte (51 erano tedeschi) e 800 persone infettate hanno sofferto della sindrome uremico-emolitica. In
questo caso pare che l’alimento incriminato fossero i germogli di soia, contaminato da STEC (quindi
probabilmente un bovino infetto ha liberato con le feci il batterio che ha contaminato un serbatoio per
l’irrigazione).
Essendo E. coli componente del microbiota intestinale, l’isolamento in coltura non permette di distinguere i
ceppi patogeni. La diagnosi da E. coli EHEC può essere quindi effettuata semplicemente con un test
immunocromatografico, in cui viene messo in evidenza non tanto la presenza del batterio, ma la presenza
della tossina. Si utilizza una card (il principio è sempre lo stesso) per mettere in evidenza le shiga-like toxins.
Yersinia
La Yersinia enterocolitica e la Yersinia pseudotubercolotica sono le specie più importanti dal punto di vista
patogeno per la specie umana, sono responsabili di enteriti. Sono zoonosi e il serbatoio è rappresentato
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Microbiologia clinica
principalmente da suini: la via di contaminazione è quindi assunzione di carne poco cotta o cruda (esiste
anche la Yersinia pestis, agente eziologico della peste, che non c’entra però in questo contesto).
Si ha un danno della mucosa come nelle Shigellae, può
causare diarrea, ma soprattutto dissenteria. La Y.
enterocolitica può portare a adenite mesenterica che può
mimare anche un’appendicite acuta (analogamente, la Y.
pestis attacca i linfonodi, in questo caso non mesenterici) e
può diventare un’infezione sistemica in pazienti
immunocompromessi. Può causare anche poliartrite
reattiva, soprattutto in soggetti HLA B-27 positivi. Per
poliartrite reattiva si intende una artrite post-infettiva, non
legata alla presenza del batterio nel cavo articolare, ma a una
reazione immunomediata, scatenata dall’infezione.
Il terreno di coltura si chiama CIN, la crescita ha la peculiarità
di avvenire a 32 gradi, 10 gradi in meno rispetto al
Campylobacter, per 48 ore. Questo terreno è sia selettivo
che cromogeno, l’indicatore di pH vira tra il giallo e il rosso e la Yersinia cresce con la punta rossa e un alone
chiaro circostante.
Vibrio cholerae
Poco importante nelle nostre zone, sono infezioni da importazione, che si vedono quindi soltanto in pazienti
che si sono recati in zone endemiche per queste infezioni. È un bacillo Gram–, mobile per il flagello polare,
aerobio-anaerobio facoltativo, asporigeno, non capsulato. Può essere trasmesso per via oro-fecale, per
ingestione di acqua o alimenti contaminati da materiale fecale di individui infetti: ha quindi trasmissione
interumana. I cibi critici sono i frutti di mare, soprattutto in paesi in cui non c’è un elevato standard igienico
e una corretta gestione degli impianti fognari e dell’acqua potabile, portando quindi a una contaminazione
dei serbatoi di acqua da parte di queste feci infette da Vibrio cholerae.
È in corso la settima epidemia di Vibrio cholerae, iniziata ne 1961 in Asia meridionale, raggiungendo l’Africa
nel 1971 e l’America nel 1991. I sierogruppi che possono causare epidemia sono 2, il ceppo O1 e il ceppo
O139: il primo è il più importante, il secondo interessa più che altro il sud-est asiatico; altri sierogruppi sono
poco patogeni per l’uomo, possono causare deboli forme di diarrea e non sviluppano vere e proprie
epidemie.
La semina viene fatta dopo arricchimento in acqua peptonata3: si mette il materiale patologico nel solito
fecal swab, con tappo verde, viene fatto arricchimento in acqua peptonata e poi isolamento su terreno
selettivo, dove il Vibrio cholerae appare in colonie rosse con alone trasparente.
Clostridium difficile
Una delle principali emergenze in campo sanitario e microbiologico: il Clostridium difficile è un microrganismo
molto particolare, agente di infezione principalmente in ambito nosocomiale. È l’agente eziologico della
colite pseudomembranosa, che insorge a seguito di una terapia antibiotica per os (via orale): viene infatti
depauperato il microbiota intestinale, favorendo la proliferazione di microrganismi ivi presenti; il Clostridium,
che è in grado di trovarsi anche in forma di spore e resistere agli antibiotici, si guadagna una nicchia ed è
capace di esercitare la sua funzione patogena attraverso tossine citotossiche, determinando una colite di tipo
infiammatorio, con la produzione proprio di pseudomembrane.
È un bacillo Gram+, anaerobio obbligato, dotato di flagelli.
3
Acqua peptonata: acqua ricca di peptoni e agenti selettivi che consentono l’arricchimento del Vibrio cholerae, un po’
come il terreno selenite. Sono terreni selettivi liquidi che favoriscono la crescita di un batterio Gram– rispetto agli altri,
arricchendone la presenza e favorendone l’isolamento (in questo caso gli agenti selettivi favoriscono la crescita proprio
del Vibrio cholerae).
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Microbiologia clinica
Solitamente il trattamento per un’infezione da Clostridium difficile consiste nel prescrivere al paziente
antibiotici contro il Clostridium, come il Metronidaziolo. Tuttavia, essendo il problema nato in primo luogo
dall’uso scorretto di antibiotici solitamente questo intervento è temporaneo e non risolutivo e il microbiota
sarebbe in uno stato ancora peggiore. Si possono utilizzare gli anticorpi monoclonali oppure la Vancomicina,
un antibiotico migliore ma più costoso, ma entrambi non sono lontanamente validi e cost-efficient come il
Fecal Microbiota Transplant, solitamente utilizzato in caso di recidive. È una pratica sicura e risolutiva, con
un’efficacia vicina al 98%, rimettendo il microbiota in uno stato di eubiosi. Inoltre, anche le complicanze a
lungo termine sono praticamente ridotte a zero. Bisogna prendere una donazione di feci, preferibilmente da
un superdonor; è un processo relativamente semplice e breve, si lavano le feci e si inserisce la sacca
contenente il microbiota in un endoscopio e la si inserisce a livello colico.
La diagnosi da Clostridium difficile parte dal sospetto diagnostico del paziente con diarrea trattato con
antibiotici. L’esame viene svolto su feci diarroiche, fondamentalmente liquide, si può valutare se il campione
è idoneo basandosi sul Bristol Stool Chart. Preso un campione fecale idoneo, si va a ricercare la presenza
dell’antigene GDH (glutammato deidrogenasi) comune a tutti i sierotipi di Clostridium difficile, che siano
tossinogenici o meno. Dopo aver valutato la presenza del Clostridium difficile con lo screening GDH, si cercano
gli antigeni delle tossine, in caso di positività si è di fronte a una CDAD, in caso di negatività degli antigeni
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Microbiologia clinica
delle tossine, o il Clostridium non è l’agente eziologico della diarrea, ma essa è causata da un altro patogeno,
oppure il test è errato e non è stato in grado di rilevare l’antigene proteico della tossina, cosa molto probabile,
in quanto sono presenti molte proteasi nelle feci. In questo caso bisogna fare un ulteriore step diagnostico,
si svolge una PCR per valutare la presenza del gene della tossina A e B, se questo test è positivo non è
comunque sicuro al 100% che si tratti di CDAD, bisogna valutare se il paziente guarisce con la terapia oppure
continua a presentare diarrea dopo 4/5 giorni.
Questo è da tenere in mente in quanto bisogna essere critici anche nell’analizzare i dati di laboratorio, i quali
devono servire come un altro strumento diagnostico nelle mani del clinico e non devono essere considerati
come oro colato.
L’uomo è il principale serbatoio di questa infezione. Questo protozoo non invade la mucosa intestinale, ma
si dispone su di essa determinando un danno dei microvilli e, quando presente in numero molto elevato,
determina malassorbimento, che si presenta clinicamente come diarrea. Nel 2017 si sono registrati 19.437
casi di giardiasi nell’EU con un’incidenza di 5,5/100.000 abitanti, principalmente nella fascia d’età da 0 a 4
anni con una rete di infezione di 17,6 casi per gli individui di sesso maschile e 14,9 per il sesso femminile.
Nella fascia da 0 a 4 anni è possibile riscontrare un’incidenza 3 volte superiore alla media. I paesi più colpiti
sono stati Belgio, Estonia e Svezia. Secondo l’OMS è sufficiente l’ingestione di 10 cisti per dare un’infezione
nel 100% dei casi. Le forme cistiche di Giardia possono sopravvivere anche in acque clorate per 60-90min
quindi, considerando il numero esiguo di cisti necessarie, l’ingestione di acqua di piscine può portare a
infezione (anche il trofozoite può restare vitale in acque clorate quasi per un’ora).
Il ciclo inizia con l’ingestione di alimenti o acque
contaminate da cisti. A livello intestinale avviene la
liberazione dei trofozoiti che proliferano per scissione
binaria. Sempre a livello intestinale avviene il passaggio
dalla forma vegetativa a quella cistica e l’eliminazione
delle cisti con le feci.
Questa è un’immagine istologica di una biopsia
intestinale colorata con ematossilina eosina; è possibile
notare la presenza di un gran numero di forme vegetative
che determinano danno dei villi e malassorbimento.
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Microbiologia clinica
questo, dal punto di vista patogenetico, l’infezione è più grave rispetto a un’infezione da Giardia. La presenza
di oocisti nelle feci è fondamentale per la diagnosi di infezione da Cryptosporidium.
Dal punto di vista laboratoristico si può evidenziare la presenza di cisti nelle feci con colorazione di Ziehl-
Neelsen. Attraverso la colorazione con carbolfucsina, il Cryptosporidium parvum si colora di rosso,
successivamente si esegue decolorazione con alcol-acido e si prosegue alla colorazione con blu di metilene.
Le cisti resisteranno alla decolorazione e sarà possibile osservare in un campione di feci a fresco le cisti rosse
in campo blu. Si possono eseguire saggi di immunofluorescenza che permettono di evidenziare la presenza
del patogeno attraverso l’utilizzo di anticorpi anti-Cryptosporidium. Gli anticorpi legati emettono un segnale
fluorescente rilevato tramite l’utilizzo di microscopi a ultravioletti.
[Figura B: Le oocisti di Giardia duodenalis sono più grandi rispetto a quelle di Cryptosporidium e vengono
messe in evidenza con anticorpi anti-Giardia].
L’esame di immunofluorescenza è un
saggio diretto e ha la maggior sensibilità
e specificità, seguito dalle tecniche
immunoenzimatiche. I test molecolari
permettono di identificare
Cryptosporidium a livello di specie:
questo è necessario nella diagnosi
differenziale perché alcune specie
diverse dal C. parvum sono apatogene.
Oltre a E. hystolitica e le specie morfologicamente simili a questa, come E. dispar, esistono molte altre specie
di Entamoeba che sono in grado di colonizzare il tratto G.I., ma che non sono responsabili di patologia. Sono
però importanti per la diagnosi differenziale con E. hystolitica, per questo è importante riconoscerle tramite
una diagnosi di specie.
Si può effettuare tramite diverse metodiche:
• identificazione microscopica: osservazione di cisti o trofozoiti in campioni di feci concentrati o no.
Risulta difficile fare una diagnosi di specie: l’unica caratteristica identificativa è la presenza di globuli
rossi fagocitati all’interno delle amebe, tipico di E. hystolitica;
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Microbiologia clinica
• ricerca anticorpale: viene eseguita in pazienti con una malattia extraintestinale, negativi alla ricerca
di cisti e trofoziti in un campione fecale con esame microscopico diretto. La ricerca anticorpale è
importante nelle regioni in cui l’infezione da E. hystolitica non è endemica in quanto indice di
un’infezione in corso; nelle regioni in cui è endemica, la ricerca anticorpale non è utile a questo
scopo;
• ricerca antigenica: molto utile dal punto di vista diagnostico in aiuto all’identificazione microscopica
per distinguere le specie patogene da quelle apatogene;
• test molecolari: test di prima scelta per distinguere E. hystolitica da E. dispar.
Ricapitolando: la diagnosi diretta si avvale dell’analisi microscopica diretta delle feci, della ricerca degli
antigeni protozoarî tramite test di immunofluorescenza o immunoenzimatici (esistono test più semplici, i test
immunocromatografici che possono mettere in evidenza gli antigeni di Entamoeba, di Giardia e di
Cryptosporidium) e test molecolari, utili per distinguere E. hystolitica da E. dispar. La diagnosi sierologica con
ricerca di anticorpi anti-E. hystolitica è utile nelle aree in cui l’infezione non è endemica.
ECHINOCOCCUS GRANULOSUS à Questa infestazione è tipica del SNC; è necessario ricordare però che
questo forma delle cisti di grosse dimensioni fino a 10 cm a livello del fegato.
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Microbiologia clinica
TAENIA SOLIUM E TAENIA SAGINATA à L’uomo è l’ospite definitivo, ossia colui che alberga le forme adulte
di notevoli dimensioni, anche diversi metri. Questa è un’infestazione tipica dell’intestino, ma è possibile
anche a carico del sistema nervoso centrale.
Nel caso della Taenia solium si manifesta una malattia detta cisticercosi in cui l’uomo non si comporta da
ospite definitivo bensì da ospite intermedio. In questa patologia l’uomo si contamina a seguito dell’ingestione
delle uova della Taenia, successivamente si formano delle cisti di dimensioni più piccole rispetto a quelle
dell’Echinococcus. Le cisti si formano a livello della cute, dell’occhio e altri visceri. La Taenia solium è l’unica
a dare la cisticercosi. Questo tipo di tenia non è presente sul territorio italiano, al contrario è presente la
Taenia saginata che determina teniasi intestinale.
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Microbiologia clinica
M4.1.1 Endocarditi
Le endocarditi sono infezioni del foglietto interno del cuore che interessano prevalentemente le valvole
cardiache, sane o alterate, e/o altre aree dell’endocardio. Si manifestano in soggetti con: preesistenti lesioni
cardiache (ad es. malattia reumatica), protesi valvolari, difetti congeniti, malattie valvolari degenerative
nell’anziano; tutte queste condizioni rappresentano fattori di rischio per l’insorgenza di un’infezione a livello
valvolare. Si parla principalmente di infezioni batteriche e fanno sempre seguito a una batteriemia almeno
transitoria. I principali agenti eziologici sono:
• Staphylococcus aureus: patogeno professionale che possiede meccanismi patogenetici (adesine) tali
da permettergli di colonizzare anche una valvola sana;
• batterî opportunistici: vanno a infettare delle valvole già soggette ad alterazioni anatomiche o
sostituite con protesi valvolari, che favoriscono la formazione di biofilm. Es. streptococchi viridanti,
facenti parte del microbiota del cavo orale, e batteri Gram- del gruppo HACEK, appartenenti
anch’essi al microbiota del cavo orale: Haemophilus influenzae, Actinobacillus
actinomycetemcomitans, Cardiobacterium hominis, Eikenella corrodens, Kingella kingae (batterio
che è anche associato all’artrite infantile). Essi presentano scarsa patogenicità ma alta capacità di
aderire alla fibrina; sono normalmente presenti sulla cute e per questo davano frequentemente,
eccetto l’H. influenzae, endocardite nei soggetti che abusano di droghe per via endovenosa (poiché
chiaramente questa è una pratica non sterile in cui tramite l’iniezione veniva trasportato nel circolo
ematico tutto ciò che si trova sulla superficie cutanea).
Clinica
Spesso è una situazione associata a batteriemia continua e a un quadro di sepsi, quindi febbre, brivido,
cefalea, ipotensione, astenia e malessere. In più abbiamo l’alterazione delle valvole cardiache, con
conseguenti soffî, ed eventuali complicanze, come emboli settici (che partono dalle valvole colpite e causano
infezioni metastatiche) o insufficienza cardiaca. Esistono forme subacute a decorso lento e inizio subdolo
(febbricola, astenia), con in questo caso una batteriemia non continua.
M4.1.2 Miocarditi
Le miocarditi sono infezioni del foglietto medio del cuore, il muscolo cardiaco. Gli agenti eziologici
responsabili sono:
• virus (causa principale): Enterovirus (es. Coxsackievirus), Parvovirus B19, HHV6;
• batterî: Staphyloccous aureus, Corynebacterium diphteriae (in particolare la tossina);
• protozoi: Trypanosoma cruzii responsabile della malattia di Chagas, viene trasmesso attraverso un
artropodo vettore, una cimice ematofaga (bisogna prendere in considerazione anche trasfusioni,
trapianti e via madre-feto);
• elminti: Trichinella spiralis.
Trypanosoma cruzii
Il Trypanosoma cruzii possiede un ciclo vitale particolare: il protozoo dopo aver
infettato la cimice viene trasmesso come tripomastigota durante il pasto ematico del
vettore attraverso gli escrementi; l’entrata può avvenire attraverso le mucose o la
cute. Questa cimice si ciba anche di frutta, per cui una delle cause più frequenti ma
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Microbiologia clinica
peruviani e su di loro è stato fatto uno studio epidemiologico di tipo sierologico che ha portato a scoprire che
molti di essi hanno gli anticorpi per il Chagas. In Italia quindi se ci si trova davanti un paziente peruviano con
quei sintomi è facile pensare subito al Chagas e sottoporlo ai necessari test diagnostici. Questo è possibile
perché l’Italia ha un flusso migratorio dal Sudamerica ragionevolmente basso. Ci sono invece paesi europei
come Spagna e Portogallo che hanno un flusso migratorio dal Sudamerica molto più consistente, legato
soprattutto ad una questione di ex-
colonie. È chiaro che in questi paesi
la sorveglianza è molto più
complicata. In Spagna si sono
verificati diversi casi di trapianto di
cuore proveniente da un immigrato
con il Chagas, quindi il ricevente ha
contratto il Chagas.
Questo pone dei problemi nel senso
che è molto importante individuare
i fattori di rischio, in modo da
essere in grado di riconoscere quei
casi in cui è necessario indagare per
una eventuale infezione da
Trypanosoma.
Trichinella spiralis
Le Trichinellae sono degli elminti che hanno dimensioni piuttosto ridotte: la
femmina può raggiungere i 4 mm di lunghezza, mentre il maschio è più piccolo,
lungo intorno a 1-2 mm; lo spessore è di 50 μm circa e la parte caudale contiene
gli organi sessuali. Si conoscono sette specie patogene di Trichinella: la più
importante dal punto di vista patogeno per l’uomo è la Trichinella spiralis, diffusa
in tutto il mondo. La trasmissione avviene mediante l’ingestione di carne cruda
o poco cotta di animali selvatici, che contiene gli embrioni in cisti muscolari di
Trichinella (è una zoonosi con trasmissione per via alimentare).
Le infezioni da Trichinella si possono definire rare anche se probabilmente sottostimate, dal 2011 al 2015 i
casi registrati sono stati:
Nella tabella si fa riferimento nel 2015 all’epidemia di Genova che ha visto coinvolte 52 persone (34 adulti,
18 bambini) a seguito del cenone di Capodanno presso un agriturismo dove hanno consumato carpaccio di
“carne bovina”, probabilmente mista a carne di cinghiale selvatico, responsabile della trasmissione
dell’infezione. Il periodo di incubazione è stato di circa 20 giorni, 36 persone (34 adulti, 2 bambini) sono
risultate sierologicamente positive, di cui 4 ospedalizzate.
A livello mondiale l’incidenza annua è di 10.000 casi, con una mortalità del 2%. Nell’UE prima del 2008 si
avevano circa 800 casi all’anno, nel 2016 si è scesi a 200 casi, attualmente si sta registrando un calo. Nel 2017
ci sono stati 224 casi in 15 diversi stati UE, più del 70% dei casi si sono verificati in Bulgaria, Croazia e Romania.
L’incidenza globale si aggira intorno agli 0,03 casi/100.000 abitanti e la principale sorgente di infezione è il
consumo di carne “undercooked” di maiale di origine non controllata (non da allevamento) e di carne da
caccia, soprattutto cinghiale.
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Microbiologia clinica
Ratti e roditori sono i primi responsabili del mantenimento dell’endemicità di questa infestazione. Gli animali
carnivori e onnivori, come orsi e cinghiali, si infestano nutrendosi dei roditori.
Le manifestazioni cliniche di trichinellosi possono essere:
• sintomi intestinali: diarrea, dolore addominale soprattutto nella fase che segue l’ingestione;
• segni muscolari di miosite: dolori e spasmi;
• segni cardiaci: tachicardia, alterazione del ritmo che si manifestano entro il primo mese;
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Microbiologia clinica
M4.1.3 Pericarditi
Le pericarditi sono infezioni del pericardio, la membrana di rivestimento esterna. Le pericarditi spesso sono
dovute a complicazioni di infezioni polmonari che per contiguità diffondono al pericardio. Possono essere:
• pericarditi secche: sono le più frequenti, a eziologia virale e con scarso essudato [il pericardio viene
interessato per via ematica, tipico di Enterovirus con viremia, es. Echovirus e Coxsackievirus B];
• pericarditi essudative o purulente: a eziologia batterica, dovute a batterî che possono causare anche
infezioni delle vie respiratorie profonde: Staphyloccocus aureus, Streptoccocus pyogenes,
Streptococcus pneumoniae, Enterobacteriaceae, Pseudomonas aeruginosa, Haemophilus influenzae;
• pericarditi croniche: causate dal Mycobacterium tuberculosis quando si ha la riattivazione in un
paziente immunocompromesso (versamento emorragico, pericardite costrittiva);
• pericarditi fungine: da Histoplasma capsulatum, diverse forme di Aspergillus, Blastomyces,
Coccidioides, Candida;
• da parassiti: Echinococcus, amebe, Toxoplasma.
[Clinica: dolore toracico, difficoltà a respirare, tosse secca].
Le cause sono al 95% virali, il che dà una certa tranquillità al medico poiché non esistendo una terapia
specifica per ogni tipo di virus non è necessario individuare lo specifico agente eziologico: nella maggior parte
dei casi la situazione si risolve somministrando cortisone ed eseguendo una pericardiocentesi.
La sepsi non corrisponde alla batteriemia, infatti un paziente con emocoltura positiva non è detto che sviluppi
la sepsi. Si tratta di un quadro clinico di fallimento multiorgano, una cascata che inizia con la riduzione della
funzionalità di uno o più organi e che può evolvere verso lo shock settico.
Se un paziente presenta solamente batteriemia non si può sapere se questa evolverà in uno shock settico,
ciononostante nel caso in cui si presenti un paziente in pronto soccorso con febbre elevata, brivido ed
emocultura positiva, bisogna subito intervenire in maniera utile, poiché ha una fortissima probabilità di
andare verso lo shock.
Questa evoluzione da una sepsi iniziale a shock settico può impiegare meno di 24 h. Per intervenire abbiamo
a disposizione le cosiddette golden hours, 12 h circa da quando il paziente viene identificato come a rischio
di sviluppare sepsi e shock settico, alla effettiva manifestazione dello shock. Quindi in caso di batteriemia, se
interveniamo entro questo intervallo di tempo in maniera efficace con una terapia antibiotica, è molto
probabile che questa non evolva in shock.
In questa situazione è anche possibile tentare una terapia empirica, la quale però deve sempre essere
utilizzata con molta attenzione poiché non è priva di rischi; questi pazienti impiegano poco tempo a
sviluppare insufficienza renale. Se ad esempio viene somministrata una combinazione di 4 farmaci, fra cui la
vancomicina4 si sottopone il rene a un elevato rischio.
L’emocoltura è un esame che consente di individuare i microrganismi responsabili dell’infezione con ottima
affidabilità, in tempi rapidi e su un numero elevato di campioni: rappresenta dunque lo strumento più idoneo
alla gestione delle infezioni del torrente circolatorio. L’emocoltura deve essere eseguita secondo un
protocollo standardizzato che va rispettato per ottenere un risultato ottimale in termini di specificità e
sensibilità.
Le infezioni del torrente circolatorio possono essere classificate su base clinica in:
• batteriemie: se i batterî sono presenti in bassa carica; in genere il SI è in grado di eliminare le cellule
batteriche e le infezioni, spesso asintomatiche, si risolvono spontaneamente;
• setticemie: i batterî e le loro tossine sono presenti nel torrente ematico in quantità più consistenti.
Può essere provocata da diverse condizioni, in primis da focolai infettivi presenti in alcuni distretti
corporei (polmonite, artrite) che possono complicarsi e causare infezione del torrente ematico; altre
possibili cause sono endocardite, cateteri vascolari, manovre dentistiche o strumentali invasive. Una
possibile complicanza della setticemia è rappresentata dall’infezione di organi e tessuti (endocarditi,
artriti etc.), soprattutto in pazienti immunodepressi che rispondono in maniera difettiva alla carica
batterica;
• sepsi (sindrome da risposta infiammatoria sistemica): l’eccessiva presenza di batterî nel torrente
circolatorio genera una massiccia produzione sistemica di citochine infiammatorie e di mediatori
vasoattivi. A lungo andare questa condizione può tradursi in shock settico;
• shock settico: stato terminale della sepsi caratterizzato da disfunzione multiorgano e ipotensione.
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La vancomicina è impiegata per le infezioni da Gram+, in particolare Stafilococchi meticillino-resistenti. È un farmaco
nefrotossico, deve essere impiegato con cautela nei pazienti con ridotta funzionalità renale.
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Microbiologia clinica
Quando si ha una infezione localizzata che evolve verso una situazione ascessuale, per esempio un ascesso
apicale in un dente, si instaura una risposta flogistica che può non riuscire a controllare la crescita batterica.
I batteri possono entrare in circolo ed essere controllati, ma finché non si risolve il focus infettivo questo
evento può ripresentarsi.
Ad esempio, un diverticolo colico è una possibile sorgente di batteriemia intermittente: quando la crescita
batterica arriva oltre una certa soglia può “scaricare” nel circolo e ciò può ripetersi finché non si interviene
sul diverticolo stesso.
M4.2.1 Batteriemie
La presenza di batterî nel circolo è un fatto assolutamente anomalo, ma molto frequente e può essere
originato da una serie di condizioni patologiche e iatrogene che sono estremamente comuni oggi:
• endocardite batterica è data dalla presenza di una “vegetazione” in cui sono mescolati fibrina e batterî,
che si forma su una valvola cardiaca che ha un flusso non laminare. Se le valvole hanno un difetto di
stenosi o di insufficienza, il flusso tende a essere non laminare (ovviamente dipende da quanto è severo
il difetto valvolare) e di conseguenza aumenta la coagulabilità del sangue: può formarsi un deposito di
fibrina sulla valvola lesionata.
Questa vegetazione che all’inizio è sterile, viene spesso colonizzata dalla presenza di batterî provenienti
dal circolo, poiché risulta un terreno ottimale di attacco e quindi di crescita per i batterî stessi.
I batterî in molti casi hanno la capacità di crescere in biofilm (ad oggi la maggior parte delle infezioni
complicate sono causate da questo tipo di batterî): sono in grado di attaccarsi, specie su superfici
protesiche o anatomicamente danneggiate, e di crescere in una sorta di comunità batterica. Una
comunità batterica in biofilm è una colonia batterica che ha delle caratteristiche completamente
differenti dal batterio singolo isolato. Inoltre, esiste un fenomeno detto quorum sensing, un sistema di
comunicazione fra le cellule batteriche attraverso cui si scambiano informazioni relative all’ambiente e
riescono ad acquisire sistemi di resistenza ai farmaci antibiotici. Questa comunità batterica assomiglia
quasi a un organismo pluricellulare e si tratta quindi di una situazione più complicata da gestire.
• infezioni come polmoniti da pneumococco acquisite in comunità, dove dal 30% al 50% dei casi nelle
fasi iniziali sintomatologiche si verifica una fase batteriemica.
• materiali protesici come cateteri vascolari a permanenza, ad oggi sempre più utilizzati nelle terapie di
sostegno vitale. Questi implantable devices sono sistemi che vengono inseriti nel circolo del paziente
per una terapia cronica oppure per supporto nutrizionale e possono essere inseriti sia a livello periferico
che, più spesso, centrale. Inserire un catetere centrale non è una procedura banale, viene effettuata in
sala operatoria e può essere lasciato in sede a lungo, anche per 6 mesi.
In questa situazione si verificano due condizioni che favoriscono fortemente l’insorgenza di una
batteriemia:
o si verifica una perturbazione del flusso laminare dovuta alla presenza del catetere, per cui si
formano delle deposizioni di fibrina che possono venire colonizzate (vedi endocardite batterica);
o per quanto il catetere sia ben gestito dal punto di vista infermieristico, si tratta comunque di
un’apertura che interrompe l’integrità del sistema vascolare ed attraverso cui i batteri possono
penetrare.
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Microbiologia clinica
• estrazioni dentarie sono manovre teoricamente a rischio, in quanto durante l’intervento di rimozione si
provoca un sanguinamento e le gengive sono tutto fuorché sterili. Infatti, molti pazienti hanno una
situazione gengivale abbastanza compromessa, con una flora batterica anaerobia piuttosto
problematica a livello del solco perigengivale; la paradontite nei casi più gravi può portare fino alla
caduta dei denti. A livello orale non c’è quindi una condizione di sterilità e la quantità di batterî presenti
dipende dal grado di salute e di igiene del paziente; praticando questo genere di manovre si apre questa
cavità fortemente contaminata verso il circolo.
• manovre strumentali invasive: ci sono molte altre manovre mediche che possono agire in modo
iatrogenico (es. endoscopia). Si tratta sempre di situazioni in cui si opera in un distretto ragionevolmente
non sterile, aprendolo sul circolo.
Per esempio, quando un soggetto di sesso maschile inizia a invecchiare, la prostata può dare qualche
problema ingrossandosi; una delle prassi diagnostiche più utilizzate per capire la natura
dell’ingrossamento è la biopsia prostatica transrettale, in cui passando attraverso il retto si raggiunge
la prostata con un ago, per prelevare del tessuto. Passando dal retto c’è un elevato rischio di aprire il
contenuto batterico della mucosa rettale nel circolo prostatico e causare batteriemia. Per questo le linee
guida internazionali indicano una profilassi antibiotica pre-intervento per ridurre questo rischio.
Le batteriemie rappresentano un problema consistente. Per esempio, nel laboratorio microbiologico della
Romagna si riscontrano circa 100 emoculture positive al giorno su un bacino di utenza di circa 1.125.000
abitanti: effettivamente non sono pochi, ma potrebbero essere molti di più, questo perché le batteriemie
solitamente sono un fenomeno transitorio. Per esempio, quando ci si lava i denti, se si spazzola con una certa
veemenza e si ha una gengivite che produce sanguinamento, si apre un distretto con un’elevata carica
microbica sul circolo. Si dovrebbe avere una sepsi tutte le volte che ciò succede, invece questo non accade
poiché la carica batterica infettante gioca un ruolo fondamentale.
La differenza fra una batteriemia a carattere transitorio, dove accidentalmente una quantità limitata di
batterî si ritrova nel sangue e non genera alcun problema, e una batteriemia continua, che può evolvere
potenzialmente verso un quadro di sepsi, dipende fondamentalmente dall’equilibrio fra la carica batterica
(e la “virulenza” dei batteri in circolo) e la capacità del S.I. di rimuoverli in fretta.
Bisogna considerare che in circolo i batterî trovano una condizione ottimale per la loro moltiplicazione, basti
pensare che nelle colture si utilizzano terreni come l’agar sangue.
M4.2.2 Sepsi
La sepsi è una disfunzione multiorgano evolutiva, secondaria a un evento infettivo. Lo stimolo infettivo
genera una risposta flogistica abnorme, che va oltre la necessità di bloccare l’infezione. Le batteriemie sono
sicuramente una fonte di sepsi, ma non sono l’unica: ci sono per esempio sepsi urinarie, sepsi secondarie da
polmonite.
Ogni anno circa 27 milioni di persone nel mondo sviluppano sepsi e, di questi, solo 19 milioni sopravvivono
(30% di mortalità) anche se, alcuni di essi presentano complicanze a lungo termine, come danni neurologici
permanenti a livello del SNC. Gli individui più frequentemente soggetti a rischio di decesso per sepsi sono
neonati, bambini sotto i 5 anni di età e anziani; inoltre, nei Paesi in via di sviluppo le donne gravide che
sviluppano sepsi possono morire durante il parto. In Europa ogni anno si registrano circa 1.200.000 casi di
sepsi e la mortalità è del 13%.
Agenti eziologici
Si tratta degli agenti eziologici che vengono più frequentemente identificati in Italia, poiché l’eziologia della
sepsi è fortemente variabile a seconda della collocazione geografica presa in esame.
Negli ultimi anni si è registrata una diminuzione delle sepsi causate da batteri Gram+, come Enterococcus
faecalis ed Enterococcus faecium, generalmente localizzati nel tratto intestinale o colonizzanti la zona ano-
genitale, e da MRSA (Stafilococchi aurei meticillino-resistenti). Si è invece registrato un aumento delle sepsi
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Microbiologia clinica
da batteri Gram– (Klebsiella, Pseudomonas, E. coli, Acinetobacter), sia fermentanti che non fermentanti, e da
candida (C. albicans, C. parapsilosis, C. glabrata, C. krusei).
I focolai infettivi maggiormente responsabili delle infezioni del torrente ematico sono:
• infezioni del tratto respiratorio (35% dei casi di sepsi);
• infezioni urinarie (25%);
• infezioni gastro-intestinali (11%), ad esempio le infezioni da Salmonella typhi e S. paratyphi;
• infezioni cutanee (11%), ad esempio le infezioni profonde della cute da parte di Streptococcus
pyogenes o Staphylococcus aureus;
• infezioni dei tessuti molli (11%).
Per ridurre la mortalità legata a queste infezioni è fondamentale avviare tempestivamente una terapia, anche
empirica: diversi studi hanno dimostrato che, se l’avvio della terapia avviene entro le 24-48h dall’insorgenza
dell’episodio infettivo, si ha una riduzione della letalità pari al 20-30%.
Le graft infections da Candida sono particolarmente consistenti in due popolazioni:
o immunodepressi, essendo la Candida un normale colonizzante di vari distretti corporei (cavo orale,
mucosa vaginale, mucosa intestinale) in caso di un deficit del S.I. può espandersi;
o pazienti sottoposti a interventi chirurgici addominali fortemente demolitivi: per esempio, in caso di
resezione colica si espone il paziente a un discreto rischio di sviluppare candidemia.
Le infezioni del tratto respiratorio rappresentano la causa più comune di sepsi e a seguire le infezioni di
origine urinaria, gastro-intestinali, cutanee e dei tessuti molli.
L’avvio tempestivo di una terapia antibiotica mirata (entro le golden hours 12-24h) riduce la letalità del 20-
30%, quando la letalità dello shock settico è del 70%, quindi una mortalità piuttosto consistente. Perciò
diventa fondamentale intervenire tempestivamente.
Ricapitolando, il paziente post-chirurgico, immunodepresso, anziano, con comorbidità varie ha una discreta
probabilità di sviluppare una batteriemia e di evolvere verso lo shock.
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Microbiologia clinica
L’attivazione dell’immunità innata è quindi correlata alla presenza di un patogeno in generale (aspecifica) e
ciò determina un’eccessiva risposta dell’immunità innata (monociti e neutrofili), con produzione di citochine
pro-infiammatorie e fattori vasoattivi, che attivano l’endotelio e ne aumentano la permeabilità, tra cui TNFα,
IL-1β, IL-8. In questa enorme attivazione immunitaria si attivano anche il sistema del complemento e della
coagulazione. Questa risposta eccessiva dura per un po’ e poi si esaurisce e nelle fasi finali e tardive di sepsi
abbiamo un esaurimento, un crollo della RI dell’ospite. Questo meccanismo è importante che venga bloccato
presto con una diagnosi precoce; se non trattata la sepsi procede:
• produzione di fattori vasoattivi;
• aumentata permeabilità dei vasi sanguigni sistemici, non in modalità localizzata;
• alterata coagulazione, formazione di microtrombi;
• coagulazione intravasale disseminata (CID);
• si ha extravasazione, dai capillari sanguigni, passa meno sangue;
• si può avere ipoperfusione d’organo;
• mancata ossigenazione;
• disfunzione multiorgano, in fase molto tardiva, spesso mortale.
Il passaggio da una fase all’altra è rapido e per ogni ora persa, con un ritardo della terapia antibiotica
appropriata, si ha un aumento di mortalità dell’8%.
La sepsi è un’emergenza microbiologica, uno dei pochi casi in cui il microbiologo deve sbrigarsi in maniera
urgentissima.
Presenta quasi sempre sintomi aspecifici (e per questo è fondamentale la diagnosi tramite emocoltura); solo
in un caso si hanno segni quasi patognomonici: la batteriemia causata da Neisseria meningitidis nella fase
invasiva della sua infezione à causa la presenza di petecchie diffuse nel corpo (purpura fulminans), delle
emorragie cutanee, delle piccole chiazze, macchie puntiformi di colore rosso vivo. Si parla di un segno clinico
molto importante che viene riportato al laboratorio di modo che possa cercare la Neisseria.
Diagnosi
Il gold standard per effettuare la diagnosi di sepsi è l’emocoltura. È un test in cui si impiegano diversi flaconi
che contengono brodo eugonico, cioè un terreno liquido in cui teoricamente qualsiasi germe dovrebbe
riuscire a crescere. Qualunque germe che venga isolato
dal sangue di un paziente che ha febbre con brivido è
potenzialmente il patogeno.
Al fine di ottimizzare la resa in termini di sensibilità del
test, i flaconi sono leggermente diversi. Ci sono flaconi
che sostengono meglio la crescita dei batterî anaerobî
(non significa che non riescano a crescerci gli aerobî,
specie se presenti in elevata carica), altri per batterî
aerobî e alcuni flaconi dedicati alla crescita della Candida,
utili quando si ha un sospetto diagnostico di candidemia.
I principali tipi di flaconi sono:
• flaconi standard (8-10 mL di sangue): sono i flaconi più utilizzati. In particolare, poiché non si conosce
l’agente eziologico dell’infezione, a ogni prelievo il sangue deve essere ripartito equamente in flaconi
standard per batterî aerobi e flaconi standard per batterî anaerobi. L’infezione può essere causata
da batterî aerobi o anaerobi, che crescono selettivamente in uno dei due flaconi, o da batterî aerobi-
anaerobi facoltativi che crescono in entrambi;
• flaconi pediatrici (1-3 mL di sangue): permettono la crescita di tutti i tipi di batteri;
• flacone per i micobatterî;
• flaconi plus: contengono resine per inattivare i farmaci e vengono utilizzati in caso sia già stata
effettuata una terapia empirica.
Le emocolture vanno eseguite il prima possibile e prima della terapia empirica, così da poter raccogliere e
isolare la maggior quantità possibile di microrganismi. La terapia empirica si effettua prima
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Microbiologia clinica
dell’identificazione dell’agente eziologico e si basa su dati statistici locali di sorveglianza microbiologica, che
permettono di disporre di una panoramica generale dei principali microorganismi identificati nei materiali
patologici provenienti dai varî reparti ospedalieri. Ad esempio, se l’agente eziologico del 20% delle setticemie
in un reparto di terapia intensiva è Klebsiella pneumoniae, la terapia empirica effettuata è mirata contro tale
batterio: in questo caso vengono somministrati inizialmente carbapenemi e solo successivamente, se ad
esempio l’antibiogramma mette in evidenza la presenza di un ceppo di Klebsiella pneumoniae CPE (dotata di
carbapenemasi e resistente ai carbapenemi), vengono somministrati farmaci più efficaci, di livello superiore
o inferiore a quelli iniziali.
Per aumentare la sensibilità del saggio è preferibile effettuare più prelievi simultaneamente o distanziati di
5-15 minuti l’uno dall’altro: la sensibilità è del 65-80% se si effettua un prelievo, dell’80-88% se si effettuano
due prelievi e raggiunge valori di circa il 96-99% con tre prelievi; dunque, pur essendo sufficienti anche solo
due prelievi, è preferibile effettuarne tre. Inoltre, in presenza di cateteri vascolari è opportuno eseguire un
prelievo da catetere e un prelievo periferico. Poiché la presenza di febbre non è sempre correlata alla
batteriemia, ma tale sintomo spesso compare nella fase di risposta ai microrganismi (dunque quando la carica
batterica è più bassa di quella riscontrabile prima del picco febbrile), è consigliato effettuare il prelievo prima
del picco febbrile e non in concomitanza di questo. Effettuare più prelievi è utile anche per distinguere un
batterio contaminante, come uno stafilococco coagulasi negativo da un batterio patogeno, al fine di
prescrivere la terapia più adeguata. Se in un unico campione di sangue periferico vengono isolati stafilococchi
coagulasi negativi, essendo questi parte del microbiota cutaneo e avendo scarso potere patogeno, la loro
presenza nel campione può essere dovuta a contaminazione e non necessariamente a patologia: lo
stafilococco coagulasi negativo individuato in un solo prelievo da vena periferica viene definito
“contaminante” e non viene effettuato l’antibiogramma. La presenza di questo batterio ha significato
patologico se viene rilevata con più prelievi (tre, di cui uno da catetere) effettuati rispettando le norme
igieniche.
Altri batterî contaminanti cutanei a scarso potere patogeno sono: Bacillus spp., Corynebacterium spp.,
Propionibacterium spp., Aerococcus spp., Micrococcus spp.
In presenza di Stafilococchi coagulasi negativi nel sangue di un solo prelievo, viene refertato che la presenza
di questi è clinicamente rilevante in pazienti portatori di cateteri o altri device. Infatti, il catetere vascolare
rappresenta uno dei principali fattori di rischio per le infezioni del torrente circolatorio, anche nel caso di
microrganismi scarsamente patogeni (come gli Stafilococchi coagulasi negativi): questi batterî generano un
biofilm nei cateteri e sono poi in grado di colonizzare il torrente circolatorio. Se la colonizzazione viene subito
riconosciuta, il catetere viene bonificato o cambiato. I soggetti principalmente a rischio sono pazienti
debilitati, come degenti in terapia intensiva o immunocompromessi.
Nel referto è indicato anche il tempo di positivizzazione: effettuando due prelievi, uno da vena periferica e
uno da catetere, se il tempo di positivizzazione per il campione prelevato da catetere è più breve di circa due
ore è molto probabile che si tratti di setticemia CVC-correlata (correlata a catetere venoso centrale).
Il tempo di positivizzazione del flacone è un indice della carica batterica e del ritmo di moltiplicazione à un
tempo di positivizzazione breve è un indice prognostico negativo.
Fino a qualche anno fa i prelievi venivano effettuati durante il picco febbrile, in quanto questo rappresenta
una reazione immediata alla presenza del microrganismo in circolo. In realtà, la febbre non è correlata in
modo significativo alla presenza di batteriemia.
Il fattore che limita maggiormente la sensibilità dell’emocoltura è il volume di sangue prelevato. Per esempio,
nelle batteriemie da Gram- in genere sono presenti 10 c.f.u/mL di sangue, quindi se si preleva 1 mL si avranno
10 c.f.u, se si prelevano 2 mL 20 batteriî e così via (solitamente un flacone contiene 10-15 mL). Al giorno
d’oggi i sistemi di emocoltura hanno un sensore che misura la quantità di sangue che viene inserita, se questa
è eccessiva o insufficiente viene emesso un rumore. Se la quantità di sangue è troppo poca allora la sensibilità
sarà ridotta.
Un’emocoltura viene considerata positiva se il sistema determina la presenza di anidride carbonica, infatti
sul fondo dei flaconi utilizzati è presente una membrana semipermeabile che rileva la quantità di CO2
prodotta e diventa rossa. Lo spettrofotometro dell’incubatrice percepisce il cambiamento di colore ed
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Microbiologia clinica
emette un suono. Se il volume ematico prelevato è eccessivo, oltre a contenere molti batterî sono presenti
anche molti globuli bianchi (è un’infezione, quindi la conta dei globuli bianchi aumenta molto, arrivando
anche a 30 mila per mL) i quali producono CO2, che viene rilevata dall’incubatrice ed erroneamente
interpretata come indice di attività batterica.
Fino a qualche anno fa molti testi dicevano di fare due set di prelievi (quattro flaconi: due aerobi e due
anaerobi) a distanza di 20-30 minuti. In realtà non è mai stato dimostrato che le batteriemie siano
intermittenti. È infatti più opportuno l’approccio single strategy, il quale consiste nell’effettuare due o tre
set di prelievi ravvicinati.
Perché vengono fatti più prelievi?
• Per aumentare la sensibilità: la sensibilità aumenta infatti dal 65-80% con un prelievo all’ 80-88% con
due prelievi e al 96-99% con tre prelievi; se viene rilevato un E. coli in una provetta su sei, è
improbabile che la sua presenza sia dovuta alla scarsa igiene dell’infermiere che ha fatto il prelievo.
In questo caso quindi la presenza di più campioni permette di mettere in evidenza il patogeno anche
se ha una carica molto bassa.
• Per differenziare un contaminante da un reale patogeno: se viene rilevato S. epidermidis (normale
componente del microbiota cutaneo) solo in uno o due flaconi su sei, probabilmente si tratta di un
falso positivo, dovuto a una non corretta disinfezione della cute prima del prelievo. Effettuando un
prelievo da un catetere centrale a permanenza, se sul device è presente una vegetazione batterica
(per esempio una patina di biofilm con stafilococchi) questa viene rilevata nelle analisi, ma non è
responsabile della batteriemia. Bisogna quindi interpretare i risultati dell’emocoltura dal punto di
vista clinico: se il paziente non ha device medici, non è immunodepresso e vengono trovati coagulasi
negativi in circolo, perché possano essere ritenuti responsabili della sepsi almeno il 50% dei flaconi
devono essere positivi (è improbabile che tutti i flaconi siano contaminati). Nel caso di prelievi fatti
a distanza di tempo, è più probabile che siano entrambi contaminati (vengono fatti due “buchi” nel
paziente): con prelievi ravvicinati invece, può essere contaminato dalla cute non disinfettata solo il
primo flacone.
Si stima che la quota “non evitabile” di falsi positivi sia attorno al 2% (prevalentemente costituita da
STAFILOCOCCHI COAGULASI NEGATIVI, BACILLUS spp, CORYNEBACTERIUM spp,
PROPIONIBACTERIUM spp, AEROCOCCUS spp, MICROCOCCUS spp).
Di seguito sono elencate le norme da seguire durante un prelievo per ridurre al minimo la contaminazione
ematica da parte del microbiota cutaneo.
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Microbiologia clinica
Per l’emocoltura vengono prelevati, nel caso di un paziente con peso > 36.3 kg, circa 20 mL di sangue per set
(flacone aerobio+anaerobio), mentre per i pazienti pediatrici, a seconda del peso corporeo, vengono
prelevati da 2 a 4 mL di sangue per set, si possono infatti utilizzare i flaconi pediatrici.
La conservazione del flacone è molto importante e questo dovrebbe essere incubato immediatamente per
mantenere costante la temperatura a 37°C. Qualora non fosse possibile incubare immediatamente il flacone,
è importante mantenere i campioni a temperatura ambiente, mai refrigerarli (ciò potrebbe infatti causare la
morte di moltissimi batterî, compromettendo l’analisi del campione, rendendo il tempo di positivizzazione
molto più lungo). I batterî conservati a temperatura ambiente continuano a moltiplicarsi e, per evitare il
rischio di non rilevare la positività nonostante la presenza di batterî, il flacone deve necessariamente essere
posto all’interno dell’incubatore prima della fase di plateau. Sul fondo delle cellette dell’incubatore sono
infatti presenti dei detector in grado di rilevare il segnale fluorescente proveniente dal fondo dei flaconi: il
segnale viene attivato dalla variazione del pH all’interno del flacone, determinata dalla produzione di CO2
dovuta al metabolismo batterico. La registrazione del segnale fluorescente emette un allarme, dopo il quale
il flacone viene rimosso dall’incubatore e sottoposto al percorso diagnostico microbiologico. Il tempo che
intercorre tra l’inserimento del flacone nello strumento e il momento in cui viene emesso il segnale
dall’allarme è definito tempo di positivizzazione, fondamentale per valutare in maniera semi-quantitativa la
carica batterica: maggiore è la carica batterica, più breve è questo tempo. Il ritmo replicativo di un batterio
influisce sul tempo di positivizzazione: vi sono batterî con ritmo replicativo più accelerato di altri e in genere
i batterî Gram– replicano più rapidamente dei batterî Gram+. Il flacone deve rimanere all’interno
dell’incubatore finché non viene registrato il segnale fluorescente e, se tale segnale non dovesse comparire
entro 5 giorni, i campioni verrebbero rimossi. La maggior parte delle emocolture si positivizza infatti in
24/48h, l’unica eccezione è rappresentata nel caso di endocarditi, spesso causate da batterî come
streptococchi viridanti presenti in bassa carica e caratterizzati da una fitness replicativa lenta, in tal caso si
attende fino a circa 10/14 giorni (lo stesso vale nel caso di alcune infezioni del sangue).
Percorso diagnostico
La diagnosi prevede innanzitutto il prelievo di un’aliquota di sangue dal flacone dell’incubatore per effettuare
l’esame microscopico, che fornisce in tempi brevissimi alcune informazioni sul tipo di microrganismo che sta
causando l’infezione. Osservare ad esempio al microscopio se il batterio interessato sia Gram– o Gram+
permette di indirizzare la terapia empirica sull’utilizzo di determinati farmaci piuttosto che altri; inoltre, in
caso di cocchi Gram+ è possibile notare la disposizione a catenelle (streptococchi) o a grappoli (stafilococchi),
oppure rilevare la presenza di infezioni miste (più rare) con bacilli Gram– e cocchi Gram+. L’osservazione al
microscopio ci permette di riconoscere anche la presenza di blastospore di lievito e, in tal caso, indirizzare il
paziente verso una terapia antifungina. Al fine di ottenere queste informazioni è necessario osservare il
campione dopo l’incubazione e non il campione di partenza: infatti, l’incubazione permette di ottenere un
campione con un’alta densità di cellule batteriche osservabili al microscopio.
Parallelamente all’esame microscopico viene eseguito l’esame colturale in cui i campioni vengono posti
principalmente su una piastra di agar sangue ed eventualmente, se fosse stata rilevata la presenza di lieviti,
su terreni specifici per questi ultimi. Questo esame ha lo scopo di distinguere un’infezione mista da
un’infezione singola e di identificare la precisa specie batterica che la causa. Una volta ottenuta la colonia è
possibile analizzarla e procedere con:
• l’identificazione della specie: l’esame più semplice per l’identificazione della specie è la
spettrometria di massa MALDI-TOF. Per questo esame viene preparato un piastrino metallico con
spot prestabiliti in cui vengono poste le cellule batteriche; si aggiunge poi una matrice liquida che
uccide i batterî e consente la ionizzazione della cellula; si inserisce la piastra all’interno di uno
spettrometro di massa che colpisce i batterî, rompendo la membrana e liberando le proteine cariche
positivamente; sottoponendo la piastra a un campo elettrico, le proteine cariche positivamente
migrano verso il polo negativo, con tempi differenti in base alla massa. Si ottiene così uno spettro di
massa caratteristico per ogni specie batterica, che viene confrontato con un database per identificare
la specie. La spettrometria di massa nel caso della Klebsiella pneumoniae è inoltre in grado di rilevare
anche un picco proteico che indica la resistenza ai carbapenemi legata al gene KPC.
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Microbiologia clinica
Test molecolari
In presenza di infezioni determinate da microrganismi il cui isolamento o la coltura in vitro con le metodiche
classiche richiedono tempi troppo prolungati (ad esempio infezioni miste) è possibile ricorrere ai saggi
molecolari eseguiti a partire da emocoltura o direttamente dal campione di sangue. A partire da emocoltura
positiva sono disponibili pannelli sindromici, test che permettono la rilevazione di un’ampia gamma di
patogeni contemporaneamente; tale test ha durata di circa 45 minuti e permette di definire sia i ceppi
infettanti che i meccanismi di resistenza. Inoltre, vi è il test FISH che, oltre a identificare la specie, è anche in
grado di definire il valore della MIC. Altri test, eseguiti direttamente a partire dai campioni di sangue,
permettono di anticipare la diagnosi ma sono in grado di determinare esclusivamente la specie infettante
(es. PCR real time in grado di rilevare e identificare più di 40 specie di patogeni batterici e fungini).
M4.2.3 Candidemia
Le candidemie sono infezioni caratterizzate da mortalità particolarmente elevata (può raggiungere anche il
40%) e i soggetti maggiormente a rischio sono pazienti ricoverati in terapia intensiva, portatori di device
vascolari, pazienti immunodepressi, diabetici, pazienti sottoposti ad emodialisi, neonati pretermine e chi fa
uso di droghe per via endovenosa.
Le principali specie di candida isolate a livello europeo sono la Candida albicans (70% delle infezioni da
Candida), la C. glabrata, la C. tropicalis, la C. parapsilosis e la C. krusei.
91
Microbiologia clinica
Candida auris
La Candida auris è una specie emergente di Candida, isolata per la prima volta nel 2009 nell’orecchio di un
paziente in Giappone. Risulta molto importante dal punto di vista clinico per la resistenza della maggior parte
dei suoi ceppi al fluconazolo e per la velocità con cui questi sono in grado di sviluppare resistenza anche alle
echinocandine, a cui sono inizialmente sensibili. Inoltre, tale Candida è particolarmente difficile da
identificare (anche se sia la spettrometria di massa che la PCR sono in grado di rilevarla) e diffonde in maniera
rapidissima negli ambienti ospedalieri, contaminando le mani degli operatori e le superfici, motivo per cui
risulta fondamentale il rispetto delle norme igieniche in ambiente sanitario. I primi casi in Europa sono stati
registrati nel 2013, mentre il primo
caso in Italia è stato registrato nel
2019 a Genova.
Gli isolati di C. auris sono quasi tutti
resistenti al fluconazolo e un terzo
degli isolati sono resistenti ad
amfotericina B. La maggior parte
sono sensibili alle echinocandine,
ma possono sviluppare resistenza al
trattamento.
92
Microbiologia clinica
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Microbiologia clinica
94
Microbiologia clinica
Le infezioni virali, che invece inducono una risposta di tipo linfocitario-macrofagica, presentano il
liquor limpido, infatti nonostante ci sia cellularità è molto più limitata.
L’unico caso in cui si può parlare di meningite batterica a liquor limpido è quello della meningite
tubercolare, perché il Mycobacterium tuberculosis non è piogenico, ma induce una risposta
prevalentemente macrofagica, quindi il liquor rimane limpido.
Questa classificazione è molto importante in medicina d’urgenza, perché in tempi relativamente
brevi consente di capire se ci troviamo di fronte a una situazione preoccupante in cui studiare
l’eziologia in modo tempestivo è necessario (e questo è il caso delle meningiti a liquor torbido, quelle
batteriche).
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Microbiologia clinica
L’eziologia della meningite ha una notevole variabilità ed è possibile individuare una classificazione dei
patogeni più frequenti sulla base dell’età paziente. La classificazione è stata creata grazie a dati
epidemiologici e non è dunque assoluta, bensì può avere delle eccezioni.
L’eziologia delle meningiti batteriche dipende dall’età e dalla presenza di particolari fattori di rischio.
Se si ha un neonato con in corso una meningite accompagnata da sepsi neonatale, quadro clinico
estremamente preoccupante sia nella fase acuta, sia per gli eventuali reliquati neurologici, gli agenti
eziologici più frequenti sono:
1. Streptococcus agalactiae, costituente del microbiota vaginale, che può essere acquisito per
passaggio tramite canale del parto infetto; esiste uno screening con tampone vagino-rettale
effettuato a 36 settimane di gestazione, al fine prevenire l’infezione del neonato;
2. Escherichia coli, può essere responsabile di meningite neonatale, soprattutto i ceppi K. In questo
caso non c'è una vera e propria procedura, in quanto E. coli è facente parte del microbiota intestinale:
durante la gravidanza si può però effettuare un esame delle urine per evidenziare un'eventuale
cistite, che può rappresentare un rischio di trasmissione al feto;
3. Listeria monocytogenes, che può essere trasmessa per via transplacentare o al momento del parto.
Se la meningite a liquor torbido colpisce un bambino che ha un’età compresa tra 1 e 24 mesi, gli agenti
eziologici possono essere più variabili:
1. Streptococcus agalactiae;
2. Streptococcus pneumoniae;
3. Neisseria meningitidis;
4. Haemophilus influenzae tipo B;
5. Escherichia coli.
Nei giovani adulti, fino a 18-22 anni l’agente più frequente è il meningococco, seguito dallo pneumococco.
Un tempo la meningite che insorgeva in giovani in questa fascia d’età veniva chiamata ‘’meningite delle
caserme’’ poiché il servizio militare obbligatorio era il primo momento in cui i ragazzi entravano a contatto
stretto con molte atre persone, e si aveva quindi la circolazione del meningococco
Nell’età adulta (25-65 anni) invece si inverte la frequenza degli agenti eziologici e quindi si ha più
frequentemente meningite da pneumococco, seguita da quella da meningococco.
Nell’anziano sopra i 65 anni lo pneumococco è il responsabile più probabile e si ha una ricomparsa della
meningite causate da Listeria monocytogenes.
Non compare nell’anziano la Neisseria meningitidis in quanto sono necessarî contatti ravvicinati di
collettività, in ambienti chiusi, per favorire la trasmissione interumana, situazioni che riguardano le persone
di una certa età in maniera minore.
96
Microbiologia clinica
e Streptococcus agalactiae (sensibile ai β-lattamici, tra cui appunto l’ampicilina); alternativamente si possono
usare entrambi.
In caso di S. pneumoniae resistente a Cefotaxime e in caso di L. monocytogenes resistente ad ampicillina si
usa vancomicina.
Streptococcus agalactiae
[Dalla dispensa Cricca]
• Batterio che colonizza il tratto intestinale e genitourinario.
• Il 5-30% delle donne sono portatrici di GBS (Group B Streptococcus) a livello vagino-rettale.
• La trasmissione dell’infezione al neonato avviene durante il passaggio nel canale del parto.
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Microbiologia clinica
Listeria monocytogenes
[Dalla dispensa Cricca]
La fonte di infezione sono i formaggi, in particolare quelli freschi.
In un soggetto adulto sano affinché si abbiano sintomi (che sono simil-influenzali) sono necessari 108
UFC/grammo di alimenti, 1000 UFC/g nel caso di liquidi, come il latte.
Tra i soggetti più colpiti da una un’infezione sintomatica, che dia meningiti, ci sono anziani, neonati, donne
in gravidanza (possono trasmetterlo al feto sia durante il passaggio nel canale del parto che durante la
gravidanza, perché la Listeria è in grado di invadere e attraversare la placenta). Il deficit dell’immunità cellulo-
mediata favorisce l’instaurarsi della malattia.
Neisseria meningitidis
[Dalla dispensa Cricca]
La Neisseria meningitidis può causare:
• meningite;
• meningite e sepsi meningococcica;
• sepsi meningococcica.
Nell’immagine a lato si nota un peculiare esantema petecchiale, causato dalla sepsi che spesso accompagna
la meningite, che non scompare alla digitopressione. È un sintomo patognomonico della meningite
meningococcica.
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Microbiologia clinica
M5.4.3 Vaccini
[Dalla dispensa Cricca]
• Meningococco: dopo l’introduzione del vaccino anti-meningococco di tipo C, che viene effettuato
nel primo anno di età, si è registrata, grazie ad un fenomeno di immunità di gregge (herd immunity),
una riduzione di casi in tutte le fasce di età. Dal 2015 questo vaccino è stato però sostituto con un
vaccino tetravalente (ACW135Y) perché il vaccino per il gruppo C, diminuendo l’incidenza di questo
gruppo, tendeva a favorire per effetto replacement gli altri gruppi (in particolare B e Y). Un’altra sfida
è rappresentata dall’introduzione nel calendario vaccinale regionale, a partire dal 2017, della
vaccinazione contro il meningococco B.
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Microbiologia clinica
In laboratorio arrivano diversi liquor da analizzare, i più urgenti arrivano dal pronto soccorso, gli altri dai
reparti e possono essere liquor di sorveglianza oppure di sospetto di L. monocytogenes, oppure di altra
derivazione. Nei casi urgenti di pazienti che si presentano in pronto soccorso con tutti i sintomi di una
meningite è richiesta una diagnosi rapida, quindi per individuare il possibile agente eziologico si scelgono test
molecolari.
Il FilmArray Meningitis/Encephalitis Panel è un test unico che rileva l’eventuale presenza di uno dei 16
principali agenti eziologici della meningite nel liquor del paziente in una sola ora.
Segni clinici delle encefaliti: visto l’interessamento delle meningi (meningo-encefalite) avremo i tipici sintomi
da meningite già descritti; ci sono però dei segni/sintomi che troviamo solo nelle encefaliti e che ci
permettono di distinguerle. Proprio perché stiamo parlando di un’infezione dei neuroni del SNC possiamo
avere la perdita di alcune funzioni cerebrali in corrispondenza della zona di tessuto colpita: afasia, emiparesi,
cambiamenti nel comportamento o nell’umore, disturbi di personalità. Questi ultimi tre sono sintomi
neurologici che differenziano le meningo-encefaliti, dalle meningiti (dove invece si ha alterazione dello stato
di coscienza inteso come sopore, confusione).
3. ME da Borrelia burgdorferi;
4. ME leptospirosica (infezioni “anitteriche” da Leptospira interrogans, la più patogena per l’uomo);
5. ME tubercolare (infezione da Mycobacterium tuberculosis).
Brucellosi
Le specie più importanti di Brucella spp sono: B. melitensis, B. abortus, B. suis, B. canis (nomi che fanno
riferimento alle specie da cui vengono isolati).
Nel 2017 in EU ci sono stati 381 casi confermati con una incidenza di 0.09 casi per 100 000 abitanti. Le
incidenze più alte sono state registrate in Grecia, Italia e Portogallo. I pazienti più interessati sono maschi
compresi nella fascia di età 25-44 anni.
È una zoonosi: deriva dall’ingestione di latte non pastorizzato o carne contaminata. Gli animali sono quindi il
serbatoio di questa infezione. Può essere una malattia professionale dei veterinari, i quali vengono più
facilmente a contatto con animali infetti (il rischio aumenta se assistono al parto dell’animale).
Si manifesta con una infezione sistemica [brividi, sudorazione, perdita di appetito, cefalea e talvolta
linfoadenopatia], che interessa meningi e sistema nervoso centrale, e porta a una febbre ondulante, con
picco serale, calo di notte e ritorno alla temperatura normale la mattina (può durare per mesi e anni).
Si individua o attraverso un esame colturale o con un esame sierologico, detto di Widal-Wright, che rileva gli
anticorpi anti-Brucella attraverso una reazione di agglutinazione tra l’antigene, presente nel reattivo, e gli
anticorpi eventualmente presenti nel siero del paziente (insieme a quelli anti-salmonella, in particolare per
le salmonelle maggiori: S. typhi e S. paratyphi).
Neurosifilide
È la fase terziaria dell’infezione da Treponema pallidum. Gli uomini sono l’unico reservoir (non è una zoonosi)
e la trasmissione è verticale o per contatto diretto con secrezioni o lesioni infette (trasmissione sessuale).
Neuroborreliosi
È una meningite subacuto-cronica dovuta a Borrelia burgdorferi trasmessa all’uomo dalle larve e dalle ninfe
delle zecche Ixodes (è una zoonosi).
È associata alla malattia di Lyme, caratterizzata da febbre, cefalea, astenia e un caratteristico rash cutaneo
denominato eritema migrante (sintomo patognomonico), una manifestazione ad anello che parte nel punto
del morso della zecca e che tende ad espandersi col tempo (anche decine di centimetri).
Se non trattata l’infezione può interessare le articolazioni (artropatia cronica), il sistema nervoso centrale
(paralisi facciale, sordità, meningite) ed il cuore (blocchi atrio-ventricolari e mio-pericarditi).
Meningite leptospirosica
È una zoonosi: il batterio, del genere Leptospira, viene escreto con le urine di animali selvatici infetti e così
contamina le acque. Entra in un ospite che si trova a contatto con l’acqua infetta attraverso soluzioni di
continuità nella pelle. Outbreaks recenti sono stati associati all’attività di “adventure racing”.
Il ceppo più importante nella patologia umana è Leptospira interrogans che presenta 23 sierogruppi.
Meningo-encefalite da ameba
La Naegleria fowleri (definita “ameba mangia cervello”) è un’ameba che si
trova nelle acque dolci e nel suolo. L’infezione, estremamente rara, non
avviene bevendo acqua contaminata, ma quando l’acqua penetra all’interno
del naso; non è in grado di trasmettersi da persona a persona e ha una
mortalità estremamente alta, superiore al 97% (solo 4 persone su 143 che si
sa essersi infettate negli USA dal 1962 al 2016 sono sopravvissute).
Nel 2004 si è verificato in Italia un caso di un bambino di 9 anni che ha acquisito
l’ameba facendo il bagno nelle acque dolci del Po, il bambino è poi deceduto 6
giorni dopo la comparsa dei sintomi: la Naegleria fowleri causò una meningo-
encefalite primaria fatale.
102
Microbiologia clinica
Nell’immagine B si osserva la zona di infezione e un test di immunofluorescenza con anticorpi marcati con
fluorocromi che hanno messo in evidenza la Naegleria all’interno del tessuto cerebrale.
La diagnosi può avvenire mediante: una visualizzazione diretta attraverso un esame microscopico, in cui si
può spesso osservare l’ameba muoversi rapidamente in un campione fresco di liquor (esame scarsamente
sensibile), ricerca di antigeni all’interno del liquor o nei tessuti post mortem, oppure mediante test molecolari
PCR (ricerca del genoma).
Trypanosoma brucei
Le meningo-encefaliti protozoarie sono infezioni a esordio subacuto o cronico, aventi come agente eziologico
più comune il Trypanosoma brucei (di cui si conoscono due sottospecie con diversa localizzazione, il
gambiense e il rhodosiense). Entrambe le sottospecie provocano la malattia del sonno (l’infezione porta
infatti fino al coma). La malattia è diffusa nell’Africa sub-sahariana. La zoonosi è trasmessa da un artropode
vettore, la mosca tse-tse.
Il T. gambiense causa il 98% delle tripanosomiasi, in particolare forme di tipo cronico, in Africa centrale e
occidentale.
Al T. rhodesiense è invece imputabile il 2% delle tripanosomiasi. È responsabile delle forme acute, è diffuso
in Africa orientale e meridionale e in questo caso la malattia presenta mortalità elevata in un breve arco
temporale. La prognosi è infausta nelle forme da T. brucei rhodesiense.
Il quadro clinico è rappresentato da meningo-encefalite con turbe del sonno che evolvono fino al coma.
Plasmodium falciparum
Il Plasmodium falciparum provoca la malaria quartana maligna. Il coinvolgimento del SNC (emorragie
cerebrali) avviene perché si formano pile di eritrociti alterati, che formano pile nei capillari del SNC. Essi
determinano un blocco della circolazione, una lesione dell’endotelio e una fuoriuscita del sangue.
L’interessamento encefalico si manifesta come una meningo-encefalite maligna ed emorragica, con sintomi
quali il coma, forme emiplegiche, forma delirante, forme di allucinazione e confusione. Anche la meningo-
encefalite da P. falciparum presenta un’elevata mortalità.
Toxoplasma gondii
L’infezione da Toxoplasma gondii è una zoonosi: viene acquisita tramite l’ingestione di cisti, che vengono
eliminate dalle feci di gatto. Le cisti provocano nel SNC delle masse cerebrali piuttosto cospicue, che si
associano a segni neurologici focali.
L’infezione è nella maggior parte dei casi asintomatica. L’infezione diventa sintomatica nei pazienti
immunodepressi e in caso di trasmissione materno-fetale.
Echinococcus granulosus
Echinococcus granulosus è un verme piatto costituito da più segmenti: una testa, o scolice, con uncini, un
breve collo, un segmento immaturo, un segmento maturo e l’utero [con 400-800 uova, ciascuno di 30-35 μm,
103
Microbiologia clinica
200 volte più piccolo della forma adulta]. L’immagine a microscopico elettronico
mostra i rostri della testa, che gli consentono di aderire alla mucosa.
Ciclo vitale. Il ciclo vitale inizia dalla forma adulta, ospitata all’interno dell’intestino
dell’ospite definitivo (i canidi), che rilascia la proglottide gravida all’interno delle feci.
L’ospite definitivo è l’ospite in cui ha luogo la riproduzione sessuata e quindi dove
alberga la forma adulta dell’elminta: i canidi. Dalla disgregazione della proglottide si
liberano le uova nell’ambiente e vengono ingerite da pecore, capre e suini, ospiti
intermedi. Le uova embrionate sono ingerite dagli animali che si cibano di vegetali;
all’interno dell’intestino dell’ospite intermedio si schiudono e con gli uncini aderiscono
alla mucosa intestinale. Le oncosfere, o larve, possono attraversare l’epitelio intestinale e diffondere in alcuni
organi, come fegato, polmone ed
encefalo. La schiusa delle uova provoca
l’invasione dei visceri attraverso il
torrente circolatorio e procurano la
formazione delle cisti idatidee.
All’interno della cisti idatidea, avviene
la maturazione dell’Echinococcus
granulosus, che però è parziale e non
arriva mai alla forma adulta. Quando
un animale carnivoro si ciba
dell’erbivoro, avviene la liberazione
delle forme immature che a livello
dell’intestino maturano a forma adulta.
Anche l’uomo può essere un ospite
intermedio dell’E. granulosus:
attraverso l’alimentazione può fungere
da ospite intermedio e ospitare a livello
intestinale le cisti idatidee. In questo modo, come gli altri ospiti intermedi erbivori, può presentare le cisti
idatidee a livello viscerale.
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Microbiologia clinica
Dati. Nel 2017, sono stati confermati 827 casi di echinococcosi nell’UE. La frequenza di infezione è
0.19/100.000 casi, con un decremento del 13.6 % rispetto al 2016. La maggior parte delle infezioni (71.4%) è
stata provocata da E. multilocularis ed E. granulosus, con rispettivamente 146 casi (26, 3%) e 409 casi (53.3%).
Ciclo vitale. Le cisti che si formano nell’ospite intermedio non hanno le stesse dimensioni dell’E. granulosus:
molto spesso sono al di sotto di 1-2 cm di diametro. L’uomo rappresenta l’ospite definitivo: gli adulti si
formano nell’intestino tenue, in un arco temporale di 50-60 giorni, e possono persistere fino a 25 anni.
Normalmente c’è solo un verme infettante: la tenia si àncora alla mucosa intestinale attraverso gli uncini che
sono presenti sulla testa dell’elminta. Gli elminti contengono all’interno l’utero e tutte le cellule uova:
vengono rilasciati i segmenti nell’intestino, che si rompono e rilasciano le cellule uova. La cellula uovo può
essere assunta tramite l’alimentazione da un ospite intermedio, che è rappresentato dal suino o dal bovino.
105
Microbiologia clinica
Cistocercosi. La cistocercosi è
un’infezione che non riguarda il territorio
italiano ed è data solo dalla Taenia
solium. Nel territorio italiano si è abituati
ad osservare l’infestazione da Taenia
solium in cui l’uomo funge da ospite
definitivo e non quella dove funge da ospite intermedio: la malattia in questo caso è detta cistocercosi.
L’infezione avviene mediante l’ingestione di uova di T. solium: l’uomo si contamina similmente a quanto
accade per l’ospite intermedio e ingerisce le cellule uovo. Analogamente a quanto avviene nel suino, le uova
si schiudono, si ancorano alla mucosa, penetrano l’intestino, vengono trasportate dal torrente circolatorio
virtualmente ad ogni organo con una predilezione per muscolatura, cute, occhi e SNC. La larva matura in
cisticerco e si accresce all’interno di una capsula cistica. Le manifestazioni cliniche dipendono dalla sede in
cui si verifica l’accrescimento della cisti: in genere dà affezioni al SNC (epilessia, cecità e paralisi), ai tessuti
sottocutanei (cisti visibili all’osservazione della cute) e all’occhio. La malattia non è una malattia tipica
dell’Italia e dell’Europa, ma caratteristica dell’Asia e dell’Africa.
Toscana virus
Il virus Toscana è stato isolato per la prima volta 50 anni fa da una ricercatrice italiana dell’Istituto superiore
di sanità, dal pappatacio (Phlebotomus perniciosus), sul monte Argentario, vicino a Grosseto, in Toscana.
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Microbiologia clinica
Nel 1983, questo virus è stato riconosciuto come agente eziologico della meningite. Fino al 2010 si riteneva
che esso fosse diffuso solo in Toscana e nel Sud Italia, nelle aree a Sud degli appennini. Tuttavia, studiando
molti soggetti con encefaliti estive si è scoperto che il virus Toscana è il responsabile del 80% delle meningiti
estive asettiche a liquor limpido. Inoltre, si deve considerare che non tutte queste meningiti sono
autolimitanti e in forme lievi, ma una parte dei soggetti colpiti può avere meningo-encefalite, con necessità
di ricovero in terapia intensiva.
Bisogna sottolineare anche che negli ultimi anni a causa dei notevoli cambiamenti climatici si ha una
diffusione sempre maggiore del virus anche in aree geografiche lontane da quella di origine, come ad
esempio nel sud della Germania, pur considerando che questa tipologia di virus è caratterizzato da una
notevole stagionalità dovuta alla diffusione del vettore solo in determinati momenti dell’anno.
107
Microbiologia clinica
Rabies virus
La rabbia è una patologia di origine zoonotica, non trasmessa da artropodi, ma dal morso di mammiferi
infetti. In moltissime aree del mondo la rabbia è endemica e quindi il morso di un qualsiasi mammifero (cani,
pipistrelli, mucche, volpi…) può essere causa della patologia. In caso di un morso a rischio è dunque
108
Microbiologia clinica
fondamentale sottoporsi alla profilassi vaccinale antirabbica in tempi molto rapidi, poiché si tratta di una
patologia progressiva, con una mortalità che, in assenza di trattamento, supera il 70%.
Mappa delle aree geografiche del mondo in cui la rabbia è considerata ad alto rischio. Le aree rosse sono
aree in cui c’è alto rischio di contatto con cani rabidi; le aree arancioni sono ad alto rischio di contatto con
pipistrelli infetti e altra fauna. [Fonte: OMS]
Non c’è un caso umano sul territorio italiano da diversi anni, però è un’infezione ancora diffusa in alcune
regioni del mondo.
I principali vettori di questa malattia sono i cani rabidi nelle zone afroasiatiche e i pipistrelli in Sud America e
Groenlandia. La rabbia viene trasmessa all’uomo attraverso il morso dell’animale rabido. L’animale infetto e
sintomatico rilascia il virus attraverso la saliva (la malattia provoca anche una forte ipersalivazione). Il virus,
non appena è penetrato grazie al morso dell’animale rabido, migra lungo gli assoni dei neuroni sensitivi fino
a raggiungere il SNC. Post-morte, a un esame autoptico, è possibile evidenziare i caratteristici corpi di Negri.
Le manifestazioni cliniche, a livello dell’uomo, avvengono dopo un periodo di incubazione che varia a seconda
dell’entità e della sede del morso. I morsi a livello del volto hanno tempo di incubazione breve, i morsi a
livello degli arti inferiori hanno tempi di incubazione più lunghi. La sintomatologia compare dopo un periodo
di incubazione medio di 5-6 settimane e la malattia, che ha una durata in genere di 2-6 giorni, si manifesta
con modificazioni del carattere, disturbi delle sensibilità nella sede della ferita, scialorrea, cefalea, vomito,
febbre alta con idrofobia, acrofobia (spasmo dei muscoli respiratori ai minimi soffî d’aria), agitazione
psicomotoria, manifestazioni paralitiche, paralisi, accessi convulsivi e morte per paralisi respiratoria.
Nel sospetto di infezione umana si può eseguire un vaccino o una sieroprofilassi, con introduzione di anticorpi
umani antirabici.
La rabbia è malattia diffusa in tutto il mondo; risulta rara nell’uomo, ma frequente negli animali, nei quali si
distingue una rabbia urbana, che colpisce in genere il cane e altri animali domestici, e una rabbia silvestre,
che interessa in genere gli animali carnivori e i pipistrelli. Esiste un monitoraggio degli animali rabici ai margini
delle città: il serbatoio del virus è rappresentato dall’animale rabido selvatico, che trasmette il virus agli
animali domestici, che lo trasmettono all’uomo.
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Microbiologia clinica
• per penetrazione diretta (in seguito a trauma cranico aperto o per manovre neurochirurgiche);
• per estensione diretta da strutture contigue infette (es. da otite, sinusite, mastoidite).
Agenti eziologici. Gli ascessi del SNC spesso sono ascessi polimicrobici. Se non sono traumatici,
principalmente sono dati da batterî di tipo anaerobio (Bacteroides fragilis, Clostridium, Peptococcus,
Peptostreptococcus), streptococchi viridanti e Staphylococcus aureus, soprattutto come complicanze di
endocarditi. Questi agenti eziologici raggiungono il SNC attraverso la via ematica e sono quelli più frequenti.
Esistono anche ascessi post-trauma e post-neurochirurgia (Staphylococcus aureus, Streptococcus ed
Enterobacteriaceae).
Questi rappresentano gli agenti eziologici del paziente immunocompetente: esistono anche ascessi cerebrali
in pazienti immunodepressi provocati da organismi peculiari, come Nocardia farcinica.
Gli ascessi intracranici sono encefaliti purulente circoscritte, che a seconda del luogo di localizzazione
possono essere classificati in:
• ascessi cerebrali: raccolta di pus nel cervello;
• ascessi subdurali: raccolta di pus tra dura madre e aracnoide;
• ascessi epidurali: raccolta di pus tra dura madre ed endostio del cranio.
È importante la diagnosi precoce di ascesso cerebrale perché può guarire grazie alle moderne terapie e la
mortalità è del 10%, ma se si rompe la mortalità sale fino all’80%. La diagnosi non è microbiologica ma di
imaging, si usano TC e risonanza magnetica.
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Microbiologia clinica
infezioni localizzate nel parenchima encefalico e il responsabile di questo tipo di infezioni non si trova
necessariamente nel liquor. Sarebbe un miglior materiale da analizzare quello derivante da una biopsia del
parenchima encefalico. Questa richiede però un metodo estremamente invasivo e pericoloso, vanno dunque
valutati attentamente i rischi e i benefici della procedura. Si effettua la biopsia del parenchima encefalico
solo per avere certezze in casi particolari come quelli di sospetta encefalite erpetica a liquor negativo.
Si deve sempre tenere in considerazione che molto spesso non si ha discontinuità patologica e anatomica tra
meningiti ed encefaliti, ma si hanno situazioni di meningo-encefaliti, che partono dallo spazio subaracnoideo,
per poi coinvolgere anche il parenchima.
Per il prelievo del liquor cefalorachidiano occorre fare una rachicentesi,
in cui si ottiene un volume solitamente di 10 mL.
Nell’immagine vediamo l’esame macroscopico del liquor
cefalorachidiano. Il prelievo di liquor (9-12 mL) avviene con la rachicentesi
tra la IV e V vertebra lombare, dopo disinfezione con alcool etilico 70% e
colorexidina (dal centro alla periferia). Dev’essere eseguito prima
dell’inizio della terapia antibiotica empirica. La rachicentesi avviene
ponendo il paziente in posizione rannicchiata per aumentare lo spazio tra
le due vertebre.
Il prelievo di liquor permette già di osservare le differenze macroscopiche: il liquor dovrebbe essere limpido
e diventa torbido in caso di meningite batterica purulenta.
Il sangue è un altro materiale che può essere utilizzato per fare diagnosi, anche se non è a diretto contatto
con il SNC ma solo attraverso il circolo. Si tratta di un’analisi non sempre rilevante.
[Il clinico deve dare un’ipotesi diagnostica sul paziente in esame, in base alla quale il microbiologo farà tutti
gli esami necessarî per dare una risposta al quesito diagnostico. Non deve essere il medico clinico a valutare
quali esami devono essere effettuati e quali invece no.]
Nelle immagini sono visibili i risultati di indagini a microscopio dopo colorazione di Gram.
Nella prima immagine sono ben visibili i neutrofili polimorfonucleati e si tratta infatti di liquor torbido. Inoltre,
la presenza di diplococchi Gram– con disposizione a chicco di caffè permette di fare una diagnosi immediata
di Neisseria meningitidis.
111
Microbiologia clinica
Nella seconda immagine sono ben distinguibili diplococchi Gram+ che portano alla diagnosi di Streptococcus
pneumoniae.
Nella terza immagine, colorata con inchiostro di china, si distinguono le blastospore di Criptococcus
neoformans, un micete capsulato, non colorabile per la presenza della capsula che lo rende impermeabile al
colorante. La meningite da Criptococcus era in passato diffusa tra pazienti fortemente immunodepressi come
i soggetti con AIDS, oggigiorno è però molto rara in quanto la maggior parte delle persone HIV positive
vengono trattate con terapia HAART.
L’esame colturale viene svolto su diversi terreni che consentano potenzialmente la crescita di tutti i batterî:
1. agar sangue (tutti i batterî);
2. terreno Tayer-Martin (Neisseria meningitidis);
3. agar cioccolato (Haemofilus);
4. agar Sabourad (funghi);
5. agar sangue in anaerobiosi (anaerobi);
6. terreno BHI (arricchimento).
Molto importante è l’esame d’arricchimento effettuato in un brodo molto ricco (BHI o BSD) che consente di
far crescere anche i batterî che hanno più difficoltà a crescere in vitro; permette infatti di aumentare la carica
batterica e la loro conseguente disseminazione. L’esame viene svolto inserendo qualche goccia di liquor
all’interno del brodo e lasciando poi la provetta all’interno di un termostato per tre giorni. Se dopo tre giorni
il brodo è limpido significa che non è cresciuto nulla, se invece il brodo si è intorbidito si potranno seminare
i batterî presenti all’interno per poter svolgere ulteriori analisi.
112
Microbiologia clinica
A volte se si ha il sospetto di una meningo-encefalite di origine virale può avere senso l’analisi sierologica,
purché si aspetti il tempo sufficiente alla comparsa anticorpale. Quindi le ricerche anticorpali nei casi di
encefalite, meningoencefalite a sospetta eziologia virale vanno ben valutate nell’ambito dello sviluppo
dell’infezione. Se i sintomi del paziente sono insorti da troppo poco tempo, avremo un falso negativo, cioè il
test è negativo, ma l’infezione è presente, in quanto c’è l’impossibilità di determinare le IgM non ancora
formatesi.
Fino ad ora si è intesa un’indagine sierologica su un campione di sangue, tuttavia potrebbe essere utile
effettuarla anche sul liquor (sempre contestualmente a quella sul sangue).
In caso di infezione virale, infatti, si ha quasi sempre un danno della barriera ematoencefalica e quindi gli
anticorpi presenti nel siero tenderanno a passare nel liquor.
Verificare la presenza degli stessi anticorpi nei due fluidi corporei e valutare il danno della barriera tramite
parametri biochimici, istituendo un indice di barriera, risulta estremamente utile.
Ad esempio, se la barriera non è danneggiata, ma sono presenti delle IgM nel liquor, significa che si ha una
sintesi intratecale di anticorpi specifici e dunque infezione è confermata. Se invece la barriera è danneggiata
e si hanno IgM e IgG a basso titolo nel liquor, probabilmente derivano da un trasudamento dal circolo che ha
invaso il liquor.
Questo tipo di analisi e di ragionamenti diagnostici di sierologia sul liquor risultano piuttosto complicati e
richiedono una certa esperienza. Attualmente non esiste un metodo diagnostico convalidato, per il quale
sarebbe necessario avere una serie di campioni sicuramente positivi e una serie sicuramente negativi in modo
da poter valutare la sensibilità e la specificità dell’analisi. Ciò è possibile per la sierologia sul sangue, ma non
per le analisi del liquor in quanto sebbene in caso di patologie si possano ottenere campioni positivi, non è
al contrario possibile, per ragioni etiche, sottoporre pazienti sani a un prelievo di liquor al fine di avere a
disposizione campioni che siano certamente negativi.
113
Microbiologia clinica
Le infezioni delle vie urinarie (UTI) sono tra le più frequenti cause che portano il paziente dal medico e sono
diffusissime nelle loro forme più leggere. Alcune di esse, però, possono portare anche alla sepsi e dare luogo
a complicazioni molto gravi. La categoria di pazienti più a rischio è sicuramente quella delle donne in
gravidanza ed è per questo motivo che nei protocolli di controllo della gravidanza fisiologica (che decorre
senza complicazioni o problemi) l’urinocoltura è prescritta ogni trimestre, nonostante l’assenza di sintomi.
114
Microbiologia clinica
Come si può apprezzare dalla tabella, i primi quattro elementi (Stafilococchi coagulasi negativi,
Corynebacterium, Enterobacteriaceae e M. smegmatis) sono presenti sia nei soggetti di sesso femminile, che
in quelli di sesso maschile. Al contrario, Lactobacilli (che contribuiscono a mantenere il pH vaginale), anaerobi
(Streptococcus, Bacteroides, Veillonella) e Candida sono esclusivi del microbiota vaginale.
115
Microbiologia clinica
Patogeni convenzionali
I patogeni che sono più comunemente causa di infezione delle vie urinarie per via ascendente sono:
• E. coli: è il responsabile della maggioranza delle infezioni delle vie urinarie di comunità;
116
Microbiologia clinica
• Staphylococcus saprophyticus: è uno stafilococco coagulasi negativo, patogeno solamente per le vie
urinarie;
• Enterococcus faecalis ed Enterococcus faecium;
• Enterobacteriaceae: Klebsiella spp., Proteus spp., Citrobacter spp., Serratia spp., …
• Pseudomonas aeruginosa: Gram–, non fermentante;
• Staphylococcus aureus.
Patogeni opportunisti
I patogeni opportunisti sono microorganismi che normalmente non portano a malattia, ma che risultano
patogeni in situazioni particolari come l'immunodeficienza. Alcuni di questi sono:
• Candida albicans;
• Streptococcus agalactiae, che si segnala nelle donne giovani in età fertile, per il problema legato
alla trasmissione al feto durante il passaggio nel canale del parto;
• Corynebacterium urealyticum;
• Pseudomonas spp.;
• Stenotrophomonas maltophylia (simile a Pseudomonas).
Contaminanti
I contaminanti sono tutti i batterî normalmente presenti in una determinata area anatomica. Essi si trovano
anche nell’urinocoltura, ma bisogna prestare attenzione a non scambiarli per patogeni (ad esempio di fronte
a una cistite e a positività ai Lactobacilli non si può attribuire a questi l’infezione, poiché essi sono dei normali
commensali).
Alcuni di essi sono:
• Lactobacilli;
• Corynebacteria (tutti ad eccezione del C. urealyticum);
• Streptococchi viridanti;
• Stafilococchi coagulasi negativi (tranne S. saprophyticus).
Non bisogna rischiare di trattare una contaminazione, ma bisogna essere critici, cercando di mantenere un
senso e considerando lo status del paziente e i risultati del laboratorio.
Batterî
• Lo Staphylococcus aureus è responsabile della produzione di ascessi renali.
• Un altro batterio a cui bisogna prestare attenzione è il Mycobacterium tuberculosis, poiché la tubercolosi
urinaria è un evento molto raro ma presente. In seguito a una disseminazione biliare il micobatterio
impiega poco tempo a raggiungere il rene.
• La Leptospira interrogans è una spirocheta. Alcuni sierogruppi hanno capacità patogene ed è un batterio
zoonotico. Essa circola in maniera inapparente, senza produrre malattia in molti animali (ad esempio
ratto, vacca e maiale), ma in alcune situazioni si può venire a contatto con un sierotipo patogeno e
acquisirlo.
Leptospira interrogans
La leptospirosi è una malattia abbastanza seria, è invasiva e ha prognosi importante. Purtroppo, essendo la
diagnosi difficoltosa, essa viene formulata tardivamente. Ne consegue che il trattamento viene
somministrato quando la malattia è già in uno stadio avanzato, cosa che ne riduce l’efficacia. Solitamente,
l’infezione è acquisita venendo in contatto con acque contaminate da urine di ratto; la congiuntiva è la porta
117
Microbiologia clinica
d’ingresso della Leptospira, da cui essa, attraverso il circolo, arriva al rene, dove viene ultrafiltrata, per poi
passare nelle urine.
La Leptospira interrogans dà un’infezione sistemica simil-influenzale, che in genere si risolve in una
settimana. A questa prima fase può però seguire una seconda fase, che interessa il SNC e viene chiamata
malattia di Weil (interessamento anche renale, epatico, polmonare e cardiaco).
Diagnosi: ricerca di anticorpi su campione ematico; ricerca degli antigeni nelle urine; PCR siero, liquor e urine.
Elminti
Schistosoma haematobium
È un elminta che diffonde per via ematogena, ed è l’agente eziologico della schistosomiasi, un’infestazione
presente anche in alcune aree europee come Corsica e Sardegna e che, al momento, conta circa 200 milioni
di persone infettate al mondo.
Essa è solitamente asintomatica, ma, talvolta, nella sua forma uro-genitale genera ematuria, ovvero presenza
di sangue nelle urine.
Un tempo, per definire l’urina ematurica, si usava il
termine “urine a lavatura di carne”, poiché, così come
si osserva una colorazione rossastra, quando si mette
la carne sotto l’acqua, lo stesso avviene anche nel
caso di ematuria macroscopica.
Un’altra complicanza della schistosomiasi è la disuria,
ovvero la difficoltà nell’iniziare la minzione,
nonostante si senta lo stimolo minzionale.
È possibile osservare questo tipo d’infestazione da
elminta soprattutto negli immigrati, che possono poi
introdurla nel mondo occidentale.
Complicanze: carcinoma della vescica, soprattutto
dove l’infezione è diffusa in maniera consistente.
La schistosomiasi ha due localizzazioni: ne esiste una forma intestinale, data da diverse specie, tipica di
America Centrale e Asia, e una forma uro-genitale, data da Schistosoma haematobium, che riguarda quasi
tutta l’Africa, il Medio Oriente, e alcune aree della Corsica e della Sardegna.
118
Microbiologia clinica
Lo schistosoma, come è visibile dall’immagine al ME, presenta una ventosa nella parte
ventrale che consente di attecchire alle mucose. Spesso l’elminta di sesso maschile,
che ha dimensioni minori rispetto a quello di sesso femminile, alloggia in una
insenatura ventrale del corpo della femmina, così da viaggiare protetto in questa
doccia ventrale dell’elminta femminile.
Primi casi autoctoni europei. Il mollusco che ospita lo schistosoma è stato trovato nel
2014 in Corsica ma, viste le somiglianze ambientali, è probabilmente presente anche in Sardegna.
Il numero dei casi nel 2014 è stato pari a 11, mentre nel 2015, quando l’attenzione nei confronti della
schistosomiasi è aumentata, sono stati eseguiti più controlli e sono stati individuati 110 soggetti infestati fra
i residenti in Corsica e 8 fra i turisti italiani.
Diagnosi di laboratorio. La diagnosi di laboratorio si basa sulla ricerca delle uova a livello urinario. Le urine
devono essere raccolte nel primo pomeriggio e dopo aver fatto esercizio fisico, poiché esso fa contrarre la
parete vescicale e le uova sono più concentrate.
L’alternativa è una biopsia vescicale.
La diagnosi sierologica è possibile e ha alta sensibilità, purtroppo, però, non consente di distinguere le
diverse specie. In un soggetto non esposto alla schistosomiasi intestinale negli ultimi anni, che si sia
recentemente recato in aree geografiche come la Corsica, si può anche tentare di fare diagnosi in questo
modo (dal momento che la positività del test è correlata con altissima probabilità a un’infestazione da S.
haematobium), ma se ci si trova davanti a un soggetto immigrato da un paese in cui l’elminta è molto più
diffuso, non si può determinare la specie.
Hantavirus
Trasmissione. La famiglia degli Hantavirus è molto complessa e comprende virus che trovano serbatoio nei
roditori. L’uomo si infetta tramite aerosolizzazione di secrezioni provenienti da roditori infetti (feci, urine e
altre secrezioni corporee).
Epidemiologia. È un’infezione emergente, che è diventata oggetto di studio negli ultimi 25 anni.
È un’infezione di cui è difficile definire con precisione l’andamento e l’epidemiologia. Dal 2013 in poi si è
registrato un aumento dei casi (2157 casi nel 2013 à 4239 casi nel 2017) ed è difficile capire se questo
aumento sia reale o se sia dovuto al fatto che il virus viene maggiormente ricercato attraverso esami di
laboratorio.
I paesi che sicuramente presentano il maggior numero di casi sono la Finlandia e la Germania (70% dei casi
totali).
Patologia. L’infezione da Hantavirus provoca un quadro di febbre emorragica con sindrome renale o
nefropatia epidemica. La mortalità arriva fino al 5-15%, percentuale abbastanza alta, pertanto, non è un
problema da sottovalutare.
Specie di interesse medico. La famiglia degli Hantavirus comprende diverse specie di interesse medico:
o Hantaan (5-15% di mortalità): presente in Asia e Russia;
o Dobrava (5-15% di mortalità): presente nei Balcani, in paesi come la Slovenia;
o Seoul (1% di mortalità): virus ubiquitario;
o Puumala (1% di mortalità): di origine finlandese, presente in Europa.
In Italia, tutti i casi che si sono verificati sono stati registrati come casi di importazione.
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Microbiologia clinica
[Il prof ritiene che il motivo del ridotto numero di casi risieda nel fatto che nel nostro Paese questo tipo di virus
venga ricercato poco a livello di analisi di laboratorio, di conseguenza non vi saranno molti casi. Inoltre, egli
afferma che è alquanto improbabile che l’Hantavirus sia completamente assente nel nostro Paese, dal
momento che esistono specie localizzate in Paesi confinanti con il nostro, come la specie Dobrava in Slovenia].
Diagnosi di laboratorio. La diagnosi di infezione da Hantavirus viene effettuata tramite la ricerca di anticorpi
specifici in un campione ematico.
Ci sono altri virus che entrano in diagnosi differenziale con la schistosomiasi e l’Hantavirus per la
manifestazione di cistite emorragica, presente anche in:
• Poliomavirus umano BK (in pz immunocompromessi);
• alcuni sierotipi di Adenovirus (11, 21), che possono infettare diverse sedi (tratto GI, respiratorio,
urinario).
Poliomavirus
Riguarda il paziente immunocompromesso. I Poliomavirus sono virus a DNA che vengono acquisiti per via
respiratoria e che comprendono diversi virus. Quelli noti da più tempo sono JCV e BKV, i cui nomi derivano
dagli acronimi dei nomi e cognomi dei primi pazienti in cui sono stati isolati questi virus.
Hanno un genoma circolare, analogamente a Papilloma Virus (tant’è che una volta erano considerati facenti
parte della famiglia Papillomaviridae, poi sono stati scorporati e ad oggi costituiscono una famiglia a parte,
detta Poliomaviridae).
L’infezione viene acquisita per via respiratoria, si moltiplica inizialmente nelle alte vie respiratorie, a cui fa
seguito una prima viremia con localizzazione a livello renale. Il virus si moltiplica quindi a questo livello e in
seguito si ha una seconda fase viremica transitoria, che si risolve molto bene nel paziente
immunocompetente.
L’infezione renale latente può dare problemi nel paziente immunocompromesso, dove si può avere una
riattivazione del virus:
o il virus BK si può moltiplicare a livello renale e dare una possibile cistite emorragica nei trapiantati di
midollo; può anche comportare nefropatia e perdita del rene nel caso di trapiantati di rene, che
necessitano di un monitoraggio costante;
o il virus JC è invece soprattutto responsabile di infezioni a livello del SN, come una leucoencefalopatia
multifocale progressiva. Viene richiesta la ricerca di DNA virale soprattutto in seguito a encefalite.
Diagnosi precoce di riattivazione di BK à nefropatia associata a Poliomavirus BK (eventuale rigetto di
trapianto):
• biopsia renale: è un’indagine invasiva, ma gold-standard; è rischiosa in un paziente appena
trapiantato, perciò non viene sempre eseguita);
• indagini non invasive:
1. ricerca delle decoy cells nelle urine;
2. viral-load sierico;
3. viral-load urinario.
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Microbiologia clinica
Gli anticorpi contro l’Ag T di SV40 sono in grado di riconoscere anche gli Ag T di JCV e BKV, perciò sono usati
indistintamente per mettere in evidenza le infezioni da questi virus.
Esame citologico eseguito su sedimento urinario in cui sono state messe in evidenza le decoy cells, cellule spia
della presenza dell’infezione da BKV, che si caratterizzano per avere un rapporto nucleo/citoplasma a favore
del nucleo, con inclusioni intranucleari a vetro smerigliato con marginazione della cromatina. Quando viene
visualizzato un reperto anatomo-patologico di questo tipo, si può sospettare una nefropatia da Poliomavirus.
Nell’immagine a destra, è utilizzato inoltre uno staining per il riconoscimento di Ag T per mettere in evidenza
il virus.
121
Microbiologia clinica
• ascessi renali;
• batteriemia (urosepsi).
M6.8.1 Prelievo
Per ottenere dei risultati chiari, ma soprattutto validi, è importante che durante il prelievo del materiale
patologico (urina) siano rispettate le seguenti condizioni:
- Il prelievo deve essere effettuato prima dell’inizio della terapia antibiotica.
Riguardo a questo punto spesso si riscontrano problemi; infatti, nella maggior parte dei casi il prelievo
viene effettuato dopo che il paziente è già stato sottoposto a terapia antibiotica. Ad esempio, potrebbe
trattarsi sia di pazienti ospedalizzati (che vengono sottoposti a terapia antibiotica per problemi
preesistenti), sia di pazienti che presentano delle recidive (hanno già provato a trattare il problema con
un determinato tipo di antibiotico, il quale, però, si è rivelato inefficace e quindi il problema si è
ripresentato).
- È necessario raccogliere il mitto intermedio (parte centrale della minzione).
Per raccogliere il materiale nel modo corretto, a seguito di un’accurata detersione dei genitali esterni
(che serve a ridurre la carica batterica presente a questo livello), è necessario buttare i primi millilitri di
urina (è proprio in quei millilitri che sono contenuti la maggior parte dei batteri che contaminano le vie
urinarie inferiori) e raccogliere il mitto intermedio (che dà una visione più rappresentativa della carica
virale e del contenuto di batteri presenti in vescica).
M6.8.2 Trasporto
Il trasporto del campione al laboratorio deve avvenire rapidamente (Uriswab entro 24 ore, se conservato a
temperatura ambiente).
Questo punto è molto importante perché la carica batterica si modifica nel tempo: i batterî possono crescere,
moltiplicarsi e, in questo modo, il contenuto e la carica batterica di partenza si modificano.
Spesso i laboratorî di microbiologia non si trovano nei pressi degli ospedali o delle strutture in cui avvengono
i prelievi, ma possono essere lontani anche diversi chilometri. In Italia esiste una legge (legge Balduzzi) che
stabilisce qual è il numero di popolazione che deve afferire a un laboratorio di microbiologia: secondo questa
legge “è sensato, a livello economico” avere un laboratorio di microbiologia ogni 1.500.000 abitanti. I
campioni, quindi, nella maggior parte dei casi, per raggiungere il laboratorio dovranno compiere molta
strada. Esiste quindi un tempo di trasporto, un tempo di arrivo al laboratorio, che è sicuramente superiore al
tempo “consentito”. Oltre ai problemi che riguardano la distanza e il tempo di trasporto, esistono anche
122
Microbiologia clinica
difficoltà logistiche, bisogna infatti organizzare una rete di trasporti che faccia arrivare i campioni in tempo
utile e che allo stesso tempo sia sostenibile economicamente.
Per evitare che la carica batterica iniziale si modifichi durante il tempo di trasporto al laboratorio, è necessario
utilizzare un sistema che stabilizzi la crescita batterica, cioè un sistema che vada a inibire la crescita dei
batteri. Solitamente esso si basa sull’acido borico.
L’acido borico, a determinate concentrazioni, inibisce la crescita batterica.
La concentrazione di acido borico da utilizzare dipende strettamente dal volume di urina contenuto nella
provetta. Se si utilizzano concentrazioni troppo alte, l’acido borico non ha più azione inibente sulla crescita
batterica, ma va direttamente a uccidere i batterî e, di conseguenza, quella coltura non è valida (essa
risulterebbe negativa, in quanto i batterî sono stati uccisi). L’effetto inibente sulla crescita batterica da parte
dell’acido borico utilizzato in adeguate concentrazioni è valido per circa 24 ore: dopo 24 ore tutto ciò che è
contenuto in provetta muore.
Per la coltura vengono utilizzate piastre cromogeniche, in cui si ha la crescita colorata di diverse specie
batteriche.
Ad esempio, nelle piastre in figura (che sono quelle che vengono utilizzate più frequentemente nei laboratorî)
E. coli cresce in rosso, le Enterobacteriaceae in verde e gli Enterococchi in verde smeraldo.
A seconda del risultato si può proseguire o meno con la spettrometria di massa per identificare la specie (nel
caso delle specie Enterobacteriaceae, essa deve essere eseguita perché le specie coinvolte potrebbero essere
diverse, come Klebsiella, Enterobacter, ecc.) e poi si può procedere con l’antibiogramma.
5
UFC = unità formanti colonie.
123
Microbiologia clinica
124
Microbiologia clinica
Le protesi infette sul totale dei pazienti operati ogni anno sono:
§ circa il 2% per protesi del ginocchio;
§ 1,5% per protesi d’anca;
§ per dispositivi di osteosintesi come chiodi, placche e fili che gli ortopedici utilizzano nel riparare le
fratture, più la frattura è esposta maggiore è il rischio, in quanto la porta aperta in seguito al trauma
non si riesce mai a pulire completamente; per questo motivo il rischio di infezioni va dall’1-2% per le
fratture chiuse fino a più 30% per le fratture aperte.
Queste percentuali possono sembrare basse, ma ogni anno vengono operati centinaia di pazienti.
Spesso il chirurgo che realizza la protesi non è lo stesso che torna a operare nel caso vi sia infezione; questo
avviene perché per la protesica si ricorre spesso a strutture private che cercano di evitare gli interventi meno
proficui di remissione.
I principali agenti eziologici di infezioni di protesi osteoarticolari sono gli stafilococchi coagulasi negativi. Lo
stafilococco coagulasi negativo è un batterio a scarso potere patogeno che può formare un biofilm sui
cateteri, determinando l’insorgenza di sepsi. Nei mezzi di osteosintesi il principale agente patogeno è lo
Staphyococcus aureus, soprattutto in fratture esposte.
Per questo motivo il risultato del laboratorio necessita sempre di una forte critica clinica, altrimenti si corre
il rischio di trattare una contaminazione invece di un’infezione, e dal momento che il reimpianto protesico
nel caso di infezione richiede una terapia antibiotica con immobilizzazione del paziente per un circa mese e
mezzo, la situazione diagnostica risulta ancor più complicata.
Inoltre, spesso i risultati microbiologici riscontrano infezioni a eziologia polimicrobica, dal momento che la
genesi di queste infezioni è una chirurgia sporca e la localizzazione in cavità articolare non permette il
richiamo della risposta flogistica, per cui si sviluppa sempre un’infezione. Molto spesso succede anche che
protesi clinicamente sporche dove sono manifesti i segni di un’infezione non diano alcun risultato nell’esame
microbiologico, per cui l’eziologia rimane sconosciuta.
125
Microbiologia clinica
Dietro a questa problematica ci sono prassi medico-legali molto importanti: impiantare una protesi infetta,
così come reimpiantare in caso di sospetta infezione che invece non sussiste, comporta risarcimenti
importanti al paziente.
M7.1.1 Biofilm
L’elemento fondamentale nella genesi delle infezioni protesiche è la creazione di un biofilm. Il biofilm è una
pellicola di matrice polisaccaridica che viene prodotto dai batterî nel momento in cui aderiscono ai dispositivi
impiantabili; i batterî si trovano all’interno del biofilm, in tal modo sono protetti dalla fagocitosi del sistema
immunitario e dall’azione degli antibiotici. (Oltre ai batterî, possono trovarsi anche altri germi, per esempio i
funghi). I batterî possono generare infezioni di tipo cronico con la possibilità di generare emboli settici che
possono infettare altri distretti anatomici. Nel caso di un’infezione protesica con formazione di biofilm è
necessaria una concentrazione di antibiotico 10 volte superiore al normale per uccidere il batterio protetto
all’interno del biofilm. Per lo studio diagnostico è molto importante isolare il batterio dal biofilm per coltivarlo
in vitro; la separazione avviene tramite dispositivi meccanici come onde d’urto (sonicazione) che rompono il
biofilm liberando i batterî, oppure tramite solventi chimici come il ditiotreitolo, che scioglie i polisaccaridi
liberando i batteri in un mezzo liquido che viene poi utilizzato per le colture in vitro.
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Microbiologia clinica
Sono solitamente acquisite durante l’intervento, è possibile la diffusione ematogena da focolaio infettivo. È
dovuta a organismi a bassa o media patogenicità (CONS, streptococchi, Corynebacteriaceae,
proprionibatterî) che solitamente contaminano la cute, il cavo orale o le mani. L’approccio terapeutico in
questo caso richiede la rimozione della protesi, al suo posto è posizionato del cemento spaziatore per
mantenere i capi articolari in posizione; viene utilizzata una terapia antibatterica sia in situ per bonificare
l’ambiente di impianto della protesi, sia sulla protesi stessa, a seguito dell’esecuzione degli esami
microbiologici.
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Microbiologia clinica
anche mantenere un’aliquota per la conta dei granulociti neutrofili, se non riscontrati l’infezione non
sussiste;
2. prelievo di biopsie peri-implantari (attorno all’impianto protesico, almeno 3 pezzi e preferibilmente
5 o 6 campioni di tessuto;
3. coltura degli elementi protesici, raccogliendo la protesi in contenitori sufficientemente grandi che
la mantengano in condizione di sterilità fino al laboratorio; maggiori difficoltà di gestione del
campionamento.
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Microbiologia clinica
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Microbiologia clinica
In conclusione
Per quanto riguarda le infezioni protesiche bisogna ricordare:
• principali microrganismi e la peculiarità dei microrganismi a lenta crescita, nell’ambito delle infezioni
protesiche ritardate;
• set base di prelievi che devono essere inviati in laboratorio (liquido sinoviale in flaconi da emocultura;
campioni protesici; campioni bioptici da un minimo di tre a un massimo di 5-6, delle dimensioni di
circa 1 cm3);
• tempi di incubazione lunghi (14 giorni).
M7.4 DERMATOFITOSI
[Non spiegato a lezione (non richiesto all’esame da Sambri) – tratto dalla dispensa Cricca]
Le dermatofitosi (o “tigne”, poiché un tempo si credeva fossero causate da vermi) sono infezioni fungine
della cute provocate da dermatofiti, funghi filamentosi che possono infettare la cute glabra, il cuoio
capelluto, le unghie e i peli. Queste infezioni sono superficiali, interessano lo strato corneo della cute, perciò
non sono microrganismi invasivi. Essi hanno come peculiare capacità enzimatica la produzione di una
cheratinasi, che permette loro di utilizzare la cheratina come fonte di nutrimento.
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Microbiologia clinica
M7.4.2 Terapia
Per quanto riguarda le tigne della pelle la terapia fa riferimento a Miconazolo, Terbinafina, Ketoconazolo.
Per le infezioni del cuoio capelluto si possono utilizzare la Griseofulvina, Terbinafina, Itraconazolo,
Fluconazolo.
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Microbiologia clinica
La risposta giusta è la C. Questo perché si tratta di una polmonite di comunità: il paziente stava
bene, era in casa sua, e dopo (magari) cinque giorni arriva in ospedale faticando a respirare.
L’ipotesi più verosimile è che si tratti di un quadro di polmonite da S. pneumoniae, dato che il 75%
delle polmoniti di comunità, che in gergo medico vengono siglate CAP, sono da pneumococco.
Quindi perché l’emocultura? Perché la polmonite da S. pneumoniae è solitamente preceduta da
una batteriemia dello stesso batterio. Dunque, per aumentare la sensibilità della diagnosi, è bene
compiere una emocultura, ovviamente considerando che il paziente non abbia già iniziato a
prendere degli antibiotici, in questo caso l’emocoltura non avrebbe molto senso.
2. Qual è tra i seguenti parametri il più importante per ridurre il TAT (Turn Around Time), ovvero il
tempo impiegato per la positivizzazione della coltura, in un’emocoltura?
a. Tempo che intercorre tra il prelievo e l’inizio dell’incubazione: ad esempio un infermiere,
dopo aver eseguito i prelievi per fare l’emocoltura, potrebbe non riuscire a mandarli subito
in laboratorio per fare una emocultura e questo può allungare i tempi.
b. Temperatura dell’incubazione: normalmente i batterî si incubano a 36/37 °C, perché è la
temperatura alla quale la maggior parte dei germi cresce.
c. Il fatto che il paziente abbia ricevuto una terapia antibiotica empirica, quindi non mirata sul
patogeno specifico del paziente e senza aver fatto prima l’antibiogramma.
d. Orario di apertura del laboratorio.
La risposta giusta è la D. Teoricamente sono vere tutte, ma è proprio l’orario di apertura del
laboratorio che incide di più: se il paziente è effettivamente batteriemico, la positivizzazione
dell’emocoltura avviene nelle prime 12 ore (nell’80% dei casi). Questo vuol dire che se l’emocoltura
viene viene iniziata alle 9:00 del mattino ed essa si positivizza alle 21:00, il laboratorio potrebbe
essere chiuso equindi ci se ne accorgerà con 8-12 ore di ritardo. Questo può rallentare moltissimo
i tempi di diagnosi.
Inoltre, c’è un’altra problematica che concerne l’ambiente ospedaliero: se l’emocoltura si
positivizza a notte fonda, e il personale di laboratorio telefona in ospedale per comunicare il
risultato, potrebbe accadere che risponda un medico che non segue il paziente, e in questo caso
l’informazione potrebbe essere ignorata totalmente.
È molto importante che a qualsiasi ora, quindi, ci sia qualcuno in gradodi prendere delle decisioni
importanti che concernono la salute del paziente, cosa che anche noi saremo tenuti a fare.
3. La diagnosi microbiologica di infezione urinaria, cioè una infezione che si localizza dal meato
uretrale esterno fino alla pelvi renale, si ottiene principalmente con un’urinocoltura.
L’urinocoltura fatta tramite la minzione però NON è sterile, perché il tratto distale delle vie urinarie
è colonizzato da germi; quindi, per avere un risultato con valore clinico deve essere introdotta la
soglia di significatività clinica della carica batterica. In questi casi, normalmente si considera un
potenziale agente patogeno un microrganismo con una carica batterica maggiore di 1 x 105 CFU/mL
132
Microbiologia clinica
(carica batterica molto alta), poiché nel caso in cui sia più bassa, dato che siamo colonizzati da
moltissime specie batteriche diverse, il patogeno non viene considerato.
In quale dei seguenti casi, invece, si considera come potenziale agente infettivo un microrganismo
presente in carica batterica anche minore di 1 x 105 CFU/ml?
a. Paziente immunodepresso.
b. Paziente molto anziano, spesso i pazienti anziani sono cateterizzati per problemi di vario
tipo, soprattutto di tipo neurologico/neuromotorio, con conseguenti difficoltà nella
minzione.
c. Paziente sintomatico con una anamnesi positiva per una pregressa terapia antibiotica (es.
paziente con cistite che tre giorni prima ha preso l’antibiotico).
d. Paziente con catetere vescicale.
La risposta giusta è la C. La risposta A non è corretta, perché non è detto che l’immunodepressione
coinvolga la risposta a livello delle vie urinarie. La B non è vera, anche perché i pazienti molto anziani
sono spesso ipercolonizzati, quindi si considera significatività solo su una carica ancora più alta.
Attenzione: è ben diverso trattare una COLONIZZAZIONE rispetto ad una INFEZIONE.
La D è molto simile alla B: il catetere può “sporcarsi”, ovvero può formarsi un biofilm che attecchisce
su di esso ed è dunque normale che ci sia una carica batterica abbastanza elevata.
Nel caso della C, potremmo immaginare che un paziente si presenti in ambulatorio con febbre e
dolore alle vie urinarie alla minzione, e noi decidessimo di somministrare un antibiotico in maniera
empirica (non in maniera mirata, ma aspecifica). Il paziente potrebbe stare bene alcuni giorni, e poi
i sintomi potrebbero ricomparire in maniera più sfumata. In questo caso, la terapia empirica ha
fatto qualcosa: ha ridotto la capacità infettante del batterio, ma non lo ha eradicato
completamente. Facendo nuovamente l’urinocoltura, quindi, si troverà il germe responsabile
dell’infezione, ma con una carica batterica molto più bassa. Questo fa capire molto bene che il
laboratorio di microbiologia non ha alcun senso se non lavora a stretto contatto col clinico. Al
contrario di quello che può essere un dato di patologia clinica (es. glicemia di 190 mg/dL di plasma,
le cause possono essere diverse), in questo caso il dato permette direttamente di fare una diagnosi.
4. Nel caso di una sospetta epatite virale acuta, in cui il paziente presenta ittero, astenia,
ipertransaminasemia, quale indagine si può fare per capire subito l’agente eziologico?
a. PCR per HBV nel siero del paziente: in questo caso viene rilevato un pezzo di DNA del
genoma di HBV.
b. PCR per HBV su biopsia epatica guidata con l’ecografo.
c. HBe-Ag.
d. HBs-Ag.
e. HBs-Ab.
La risposta giusta è la D. In questo caso, se nel plasma si trova la presenza dell’antigene HBs, allora
possiamo fare una diagnosi certa: sicuramente si tratta di HBV. Attenzione: non bisogna confondersi
con gli anticorpi per HBs, questo perché avremmo segnato come positivi anche tutti i vaccinati. Se
si trovassero gli anticorpi, allora si potrebbe fare una esclusione, cioè si potrebbero
escludere le persone vaccinate contro l’epatite B. Questo non esclude che abbiano l’epatite!
133
Microbiologia clinica
All’esame clinico, ci sono diverse aree della cute (dorso, cosce, braccia) in cui compaiono piccole macchie
rossastre.
Qual è la diagnosi più sensata?
a. Meningite da N. gonorrhoeae.
b. Meningite da E. coli.
c. Meningite da N. meningitidis.
d. Meningite da S. pneumoniae.
e. Meningite da virus di La Crosse (LACV).
La risposta più probabile è la C. Questo perché il tempo di incubazione è abbastanza breve (due giorni), e
quindi difficilmente si potrebbe trattare di N. gonorrhoeae. Lo pneumococco, come anche l’E. coli, in un
ragazzo di 17 anni è molto improbabile che causi meningite. Il virus di LaCrosse è praticamente assente nel
territorio europeo, è invece molto più presente in America.
Quali di questi parametri sono considerati critici nella scelta diagnostica (cioè nel capire che si tratta di
quello specifico microrganismo)?
a. Il fatto che abbia mal di testa, vomito, febbre e petecchie.
b. Il party a cui ha partecipato con le ragazze.
c. Il fatto che abbia difficoltà a sentirci.
d. I sintomi da raffreddamento.
La risposta più precisa è la A, per via delle petecchie, un segno classico delle infezioni da Neisseriae. Gli altri
sintomi ci indicano soltanto la presenza di meningite, ma non il microorganismo. La difficoltà uditiva è un
sintomo secondario alla meningite e i sintomi da raffreddamento legati alla stagione invernale.
La risposta giusta è la B. La risposta E è fortemente improbabile, è difficile infatti che si sviluppi un’artrite a
seguito di un’infezione da meningococco (potrebbe invece accadere più probabilmente nel caso di una
infezione da gonococco).
134
PARTE II
PATOLOGIA
CLINICA
Patologia clinica
136
Patologia clinica
La patologia clinica, altrimenti chiamata medicina di laboratorio o analisi clinica o biologia clinico-medica è
la branca della patologia generale che si occupa di analizzare i campioni biologici di tessuto, sangue o altri
liquidi e secrezioni con lo scopo di valutare i parametri fisiopatologici ed effettuare una diagnosi.
137
Patologia clinica
La maggior parte di queste proteine sono sintetizzate prevalentemente dal fegato, mentre sono anche
presenti:
• un 20%, quindi una quota minore, che viene sintetizzata dalle plasmacellule e consistono nelle
immunoglobuline (o anticorpi);
• elementi del complemento e quindi sintetizzate dal sistema monocito-macrofagico;
• apolipoproteine prodotte dalla parete intestinale;
• ormoni proteici circolanti prodotti da specifiche cellule a funzione endocrina.
Nel loro insieme le proteine formano una soluzione relativamente stabile e si suddividono in base alla
solubilità in albumine (solubili in acqua) e globuline (solubili in soluzioni saline diluite).
Quando possibile in laboratorio si preferisce lavorare sul siero. Il plasma è la componente liquida del sangue,
dopo che questo è stato privato della componente corpuscolata. Il siero è il plasma senza i fattori della
coagulazione. In laboratorio si preferisce utilizzare il siero perché, pur avendo un campione di sangue con
anticoagulanti, i fattori della coagulazione possono determinare interruzioni dei circuiti automatici di analisi.
Buona parte dell’attività diagnostica di laboratorio viene effettuata tramite strumenti automatizzati, poiché
a parte la diagnosi molecolare, nessuna diagnosi viene più fatta a mano, per cui i campioni biologici seguono
dei percorsi in queste macchine dove vengono processati. Il materiale che arriva in laboratorio è trattato con
sostanze anticoagulanti: tuttavia, quando il plasma viene processato, si possono formare al suo interno dei
piccoli coaguli che interferiscono con il processo di analisi. È preferibile perciò, quando possibile, utilizzare il
siero, da cui il nome di “proteine sieriche” per le proteine che vengono analizzate. In condizioni normali, la
concentrazione delle proteine sieriche varia tra 6-8 g/dL.
inversamente proporzionale al loro peso molecolare, dividendosi in frazioni distinte chiamate “bande” o
“zone” di migrazione.
Originariamente questa tecnica consentiva di separare quattro tipi di proteine in quattro bande: il primo
consistente nel gruppo di proteine più veloci, che in realtà ne contiene soltanto una, l’albumina, e poi altri
tre gruppi denominati con le lettere greche α, β e γ. Oggi le tecniche più moderne dividono il gruppo α in α1
e α2. Normalmente, dunque, dalla separazione elettroforetica delle proteine sieriche si individuano i seguenti
gruppi o bande:
• albumina (3,2 - 5,6 g/dL; 52 – 68%);
• α1 globuline (0,1 - 0,4 g/dL; 2,4 – 5,3%);
• α2 globuline (0,4 - 1,2 g/dL; 6,6 – 13,5%);
• β globuline (0,6 - 1,3 g/dL; 8,5 – 14,5%);
• γ globuline (0,5 - 1,6 g/dL; 10,7 – 21%);
Il rapporto albumina/globuline varia da 1,2 a 1,7.
P1.2.1 Albumina
È la proteina ematica più abbondante e infatti è la principale responsabile della pressione oncotica nel
plasma. Ha un’emivita di circa 2-3 settimane (da ricordare). La sua funzione oltre a determinare e regolare la
pressione oncotica del sangue, è quella di trasferire e veicolare:
• sostanze insolubili nel sangue periferico (bilirubina, acidi grassi non esterificati);
• ormoni (tiroxina, triiodiotironina, cortisolo, aldosterone);
• farmaci (salicilati, warfarina, clofibrato, fenilbutazone);
• ioni (il 40% del calcio sierico).
[Da slide] La sua concentrazione plasmatica viene utilizzata principalmente come indice di funzionalità
epatica e dello stato nutrizionale: l’albuminemia diminuisce inoltre nelle nefropatie con proteinuria, nelle
ustioni, e nelle enteropatie protido-disperdenti. La riduzione dei suoi livelli plasmatici costituisce un elemento
caratterizzante la “risposta della fase acuta” (è una proteina della fase acuta).
Prealbumina o transtiretina
[non trattata a lezione]
• Denominata “prealbumina” in quanto migra davanti alla albumina, o “trans-ti-retina” in quanto
veicola la tiroxina e la RBP (retinol binding protein).
• È sintetizzata dal fegato ed è presente nel siero e nel liquor, dove costituisce una delle componenti
proteiche maggiori.
• Svolge principalmente una funzione di trasporto per aminoacidi, enzimi, farmaci, ormoni e vitamine.
139
Patologia clinica
• Ha un’emivita di due giorni e, per questo motivo, rappresenta un indice di funzionalità epatica e/o
dello stato nutrizionale più precoce rispetto all’albumina.
• Come l’albumina, i suoi livelli plasmatici si riducono durante la “risposta della fase acuta”.
P1.2.2 Banda α1
Anche questa è costituita per la maggior parte (90%) da un’unica proteina, l’α1-antitripsina (AAT).
α1-antitripsina
Il prefisso “α1” fa riferimento alla famiglia di proteine di appartenenza,
mentre il nome “antitripsina” è correlato alla funzione anti-proteasica di
questo enzima. Questa proteina è un inibitore della tripsina, ma l’attività
inibitoria si estende in realtà a più enzimi, svolgendo un’ampia attività anti-
proteasica. Si lega a elastasi, collagenasi, chimotripsina, plasmina e
trombina. Questi sono enzimi che vengono liberati dai polimorfonucleati
neutrofili durante un processo infiammatorio, poiché hanno attività
antibatterica.
Le proteine come l’α1-antitripsina sono necessarie a tamponare l’azione
isto-lesiva che potrebbero avere questi enzimi nei confronti delle cellule
dell’organismo. Essi, infatti, hanno la proprietà di distruggere i batterî, ma
potrebbero anche danneggiare le cellule proprie.
Il deficit di α1-antitripsina può causare enfisema polmonare ed epatopatia:
• la patologia polmonare si manifesta con broncopneumopatia cronica ostruttiva ed enfisema, tra la
terza e la quarta decade di vita. La malattia colpisce il polmone perché, soprattutto nei soggetti
fumatori o in quelli che vivono in ambienti con un alto tasso di inquinamento, vi è uno stimolo
irritativo cronico e basale a livello polmonare, che determina quindi una risposta flogistica continua.
Se manca l’α1-antitripsina, vi è una mancata inibizione soprattutto dell’elastasi, rilasciata dai leucociti
in risposta alla presenza di agenti irritanti nelle vie respiratorie, che distrugge le fibre elastiche del
parenchima polmonare, determinando l’enfisema;
• la malattia epatica è una vera e propria epatite dovuta a una patologia di accumulo. L’enzima nella
sua forma mutata non può essere infatti trasferito dal reticolo endoplasmatico degli epatociti
all’apparato di Golgi, accumulandosi nel primo. La malattia può essere piuttosto pericolosa, si
manifesta in età pediatrica e può evolvere in cirrosi e in epatocarcinoma.
La patologia da deficit di α1-antitripsina si trasmette come carattere autosomico recessivo con un’incidenza
di 1/2000-4000 nati vivi: è quindi, pur rimanendo relativamente rara, una tra le più comuni malattie
genetiche gravi. Si conoscono ad oggi più di 75 varianti del gene (SERPINA1, da SERine Protease INhibitor A1,
si trova sul cromosoma 14) e vengono classificate con le lettere dell’alfabeto. Una ventina di queste varianti
possono determinare una modificazione nell’attività dell’enzima, con conseguente manifestazione
patologica:
• la variante M è quella che si potrebbe definire “normale”, non è un termine corretto, ma sta a
indicare il fatto che è la più diffusa, poiché è presente in omozigosi in più del 90% della popolazione
europea ed è associata a normali valori dell’enzima;
• la variante Z:
o in omozigosi è pericolosa, poiché determina in questo caso una riduzione dei livelli di enzima
circolante dell’85-90%: questi pazienti hanno un elevato rischio di sviluppare la patologia
polmonare e nel 20% dei casi sviluppano una epatopatia;
o in eterozigosi (con variante M) la riduzione dell’attività dell’enzima è solo del 50% e mancano
quindi le manifestazioni cliniche;
• la variante S:
o in omozigosi causa riduzione del 40% dell’enzima rimanendo però asintomatica;
o in eterozigosi con la variante Z è pericolosa, causando soprattutto manifestazioni cliniche in
soggetti fumatori o in soggetti che abitano in aree urbane ad elevato tasso di inquinamento;
140
Patologia clinica
• la variante Null, molto rara, è però quella più pericolosa tra quelle conosciute, in omozigosi è
associata alla totale assenza dell’enzima e ad un elevatissimo rischio di sviluppare la patologia
polmonare ed epatopatia.
Curiosità: la patologia da deficit descritta finora, per quanto rara e pericolosa, potrebbe essere più
usuale di quanto si pensa: molto probabilmente due famosi musicisti, Chopin e Michael Jackson, soffrivano di
tale malattia.
Altre α1-globuline
Fra le altre alfa1-globuline si hanno:
• α1-glicoproteina acida (od orosomucoide): la sua funzione non è ancora perfettamente compresa,
ma le omologie nella sequenza amminoacidica con le immunoglobuline suggeriscono un suo ruolo
ancestrale nel sistema immunitario. È una proteina della fase acuta (che aumenta in particolare in
corso di malattie autoimmuni, quale il lupus eritematoso sistemico e l’artrite reumatoide) e un
inibitore del progesterone;
• α1-fetoproteina: è una albumina fetale sintetizzata nel sacco vitellino e, a partire dal 4° mese di
gravidanza, dal fegato fetale; dall’8° mese la sua concentrazione sierica decresce rapidamente,
consensualmente a un’aumentata produzione di albumina. Durante la gravidanza un suo aumento
indica difetti del tubo neurale, spina bifida o gravidanza gemellare, mentre una sua riduzione è
associata alla sindrome di Down. In età adulta il suo aumento è associato alla presenza di
epatocarcinoma;
• α-lipoproteine (HDL): le lipoproteine hanno una componente lipidica e una proteica. Le lipoproteine
possono essere classificate in base alla loro densità (HDL, LDL, VLDL) o sfruttando la tecnica
elettroforetica. In base a dove esse si fermano sul gel si possono individuare le α-lipoproteine, che
corrispondono alle HDL.
P1.2.3 Banda α2
Il picco α2 è costituito da due proteine fondamentali: la α2-macroglobulina e la aptoglobina.
α2-macroglobulina
L’α2-macroglobulina è molto grande, ha un peso molecolare di 800 kDa ed è
quindi seconda in dimensioni solo alle IgM, le immunoglobuline pentameriche.
Ha una funzione simile a quella dell’α1-antitripsina: un’anti-proteasi aspecifica,
che interviene anche nella regolazione dei processi emocoagulativi (insieme alla
α2-antiplasmina, inibisce l’azione fibrinolitica della plasmina sulla fibrina,
legandosi a essa), nella risposta immunitaria e nel trasporto di ormoni
(somatotropo e insulina). Non essendo state ancora riconosciute malattie da
deficit congeniti, si può dedurre che le malattie da deficit siano incompatibili con
la vita. Data la sua dimensione, nelle sindromi nefrosiche, come nelle
glomerulopatie importanti in cui il danno glomerulare è molto rilevante e si
altera il filtro glomerulare, determinando il passaggio delle proteine
plasmatiche, la macroglobulina non passa, rimane nel siero. Quindi non viene
dispersa nelle urine, anche in caso di glomerulopatie. Non è una proteina della
fase acuta.
Aptoglobina
L’aptoglobina ha la funzione di intercettare l’emoglobina che si libera dai globuli rossi. Vi sono infatti delle
tipologie di anemie, ossia le anemie emolitiche, che sono rare, ma possono provocare la liberazione di grandi
quantità di emoglobina. Questa quando arriva al glomerulo viene filtrata ed eliminata tramite le urine. In
questo modo si perde l’emoglobina, ma soprattutto il ferro contenuto in essa. L’aptoglobina, quindi,
intercetta l’emoglobina liberata in seguito a emolisi intravascolare, la capta e fa in modo che quindi il ferro
non venga eliminato tramite l’urina: il complesso aptoglobina-emoglobina viene rimosso dal plasma ad
141
Patologia clinica
opera del sistema reticolo-endoteliale e metabolizzato in AA e ferro. Nelle emolisi intravascolari i livelli
ematici di aptoglobina risultano ridotti, mentre aumentano in corso di neoplasie, traumi e processi
infiammatorî. Solo quando le anemie sono di grande entità l’azione dell’aptoglobina non riesce a rimediare
all’eliminazione dell’emoglobina.
L’emoglobinuria, il riscontro di emoglobina nelle urine, è l’espressione di una crisi emolitica che ha superato
le capacità di recupero dell’aptoglobina.
Nelle emolisi intravascolari i livelli ematici di aptoglobina risultano ridotti; l’aptoglobina aumenta, invece, in
corso di neoplasie, traumi e processi infiammatori.
Altre α2-globuline
Sono presenti anche altre proteine del picco α2, che però sono meno rilevanti:
• ceruloplasmina: deputata al trasporto del rame (proteina della fase acuta);
• α2-antiplasmina: inibisce l’azione fibrinolitica della plasmina (proteina della fase acuta);
• proteina trasportatrice della vitamina D (vitamin D binding protein, DBP);
• pre-β-lipoproteine (VLDL).
P1.2.4 Banda β
Sono distinguibili due tipi: β1 e β2, osservabili solo nei tracciati più raffinati,
non in quelli della routine diagnostica.
Nel picco β vengono espresse principalmente la transferrina (β1), proteina
deputata al trasporto di ferro nel plasma, e il fattore C3 del complemento
(β2), proteina della fase acuta.
Nelle anemie sideropeniche i livelli plasmatici di transferrina aumentano
come meccanismo di compenso per la conservazione del ferro, dando
origine ad un modesto picco nella regione β; aumentati livelli di transferrina
si riscontrano anche nella gravidanza e in corso di terapie estro-
progestiniche.
Transferrina
La transferrina (β1) (nei tracciati elettroforetici meglio condotti è possibile
distinguere un picco β1 e β2) è la proteina deputata al trasporto del ferro nel plasma.
Quando manca il ferro, e siamo in condizione quindi di sideropenia, i livelli plasmatici di transferrina
aumentano come meccanismo di compenso per la conservazione del ferro, dando origine a un meccanismo
inutile, poiché anche se si aumenta il trasportatore, la sostanza trasportata, ossia il ferro, non aumenta.
Tuttavia, il picco β1 può andare incontro a un modesto aumento. Aumentati livelli di transferrina si
riscontrano anche nella gravidanza e in corso di terapie estro-progestiniche. È una proteina negativa della
fase acuta.
P1.2.5 Banda γ
Tra le proteine della banda γ ritroviamo:
142
Patologia clinica
Se si facesse un’elettroforesi del sangue intero, si avrebbe anche un contributo del fibrinogeno, che è il
fattore di coagulazione che ha la maggiore concentrazione a livello plasmatico, tanto da poter essere rilevato
appunto nel tracciato elettroforetico.
Il fibrinogeno è classificato da alcuni
tra le β-globuline: tra i fattori della
coagulazione è quello a più elevata
concentrazione plasmatica (200-400
mg/dL).
Considerando l’immagine di fianco si
può vedere che a sinistra vi è un
grafico relativo all’analisi del siero,
mentre a destra vi è quello relativo al
sangue intero, in cui possiamo
osservare tra il picco β e il γ quello del fibrinogeno.
143
Patologia clinica
144
Patologia clinica
P1.3.6 Agammaglobulinemia
È un’immunodeficienza congenita a carico dei linfociti B: condizione rara, ma molto pericolosa, che non
consente al soggetto di produrre anticorpi. A questa può essere associato anche un deficit di linfociti T.
145
Patologia clinica
Si definiscono proteine della fase acuta tutte le proteine la cui concentrazione plasmatica aumenta almeno
del 25% durante un processo infiammatorio. Sono circa trenta.
146
Patologia clinica
Il mediatore che comunica al fegato che deve produrre queste proteine è l’IL-6, liberata a livello del sito di
infiammazione sia da cellule del SI, ma anche da fibroblasti, cellule epiteliali, cellule endoteliali. La produzione
di IL-6 è a sua volta stimolata da IL-1 e TNF-α, prodotti dai macrofagi.
Le proteine della fase acuta vengono prodotte in quanto giocano un ruolo importante nella regolazione del
processo infiammatorio. Tra queste proteine infatti vi sono:
• proteine pro-infiammatorie: opsonina, fattori chemiotattici, ecc., che favoriscono la flogosi;
• proteine antinfiammatorie: sono in realtà la maggior parte e arginano il processo infiammatorio. Il
fegato produce queste proteine per limitare tutti quegli eventi isto-lesivi di cui il tessuto normale
risentirebbe inevitabilmente nel momento in cui si cercasse di debellare l’infezione provocata da un
microrganismo. Ci sono casi in cui i danni prodotti dalla risposta infiammatoria sono maggiori di quelli
prodotti dal microrganismo (come accade ad esempio in caso di Covid-19), pertanto il ruolo di queste
proteine antinfiammatorie della fase acuta è fondamentale.
Le proteine della fase acuta svolgono un ruolo importante e da un punto di vista laboratoristico possono
essere utilizzate come indice di flogosi per diagnosticare e monitorare l’andamento del processo di
infiammazione. Teoricamente vi sono circa 30 proteine della fase acuta, ma non avrebbe senso monitorarle
147
Patologia clinica
tutte; bisogna ricercare quelle dal monitoraggio più efficace. La proteina che meglio si adatta a una
valutazione diretta e quantitativa della risposta della fase acuta è la proteina C reattiva.
Il grafico illustra il monitoraggio delle varie proteine della fase acuta prodotte a seguito di un danno tissutale
rilevante in un animale da laboratorio.
È evidente che la PCR (linea rossa) aumenta immediatamente e in maniera molto evidente a seguito dello
stimolo infiammatorio. L’aumento della PCR si inizia a osservare 6-8 ore dopo il danno tissutale e procede in
maniera esponenziale, raggiungendo il picco massimo dopo 48 ore, quando ha valori anche centinaia di volte
superiori a quelli di riferimento.
La proteina C reattiva è quindi l’indicatore più affidabile per diagnosticare e monitorare i processi
infiammatori.
Altre proteine sieriche vanno incontro a una riduzione della propria concentrazione ematica durante un
processo infiammatorio (es. albumina, che diminuisce in caso di sindrome nefrosica, transtiretina, α1-
fetoproteina, retinol binding protein, transferrina, fattore XII). La diminuzione di concentrazione ematica è
però troppo lieve e dunque non è un indice di flogosi efficace. Queste vengono chiamate “proteine negative
della fase acuta”, ma non hanno possibilità di competere con la PCR in ambito laboratoriale. Il significato
della riduzione di queste proteine durante la fase acuta e i meccanismi che ne regolano le variazioni
plasmatiche non sono stati ancora perfettamente chiariti.
148
Patologia clinica
La velocità di caduta varia da paziente a paziente, a seconda delle loro condizioni: il primo ad accorgersi di
ciò fu un ginecologo, il quale notò che le donne in gravidanza avevano delle velocità di sedimentazione più
elevate rispetto alla norma.
Il procedimento per ottenere la VES è semplice: si misura di quanti millimetri è sceso il livello dei globuli rossi
in un ora all’interno di una provetta millimetrata posta verticalmente. Ovviamente quest’operazione non
viene più fatta manualmente, ma tramite delle macchine automatizzate. La VES si misura in mm/h.
Nei soggetti con età inferiore a 50 anni i valori di riferimento della VES sono fino a 15 mm/h per il sesso
maschile e fino a 20 mm/h per il sesso femminile (con un incremento durante il periodo mestruale); dopo i
50 anni i valori salgono fino a 20 mm/h per il sesso maschile e fino a 30 mm/h per il sesso femminile.
Questa legge si applica a particelle ideali sferiche, i globuli rossi in realtà sono biconcavi, ma si può
approssimarne la morfologia. Per la legge di Stokes la velocità di sedimentazione di una particella in un liquido
dipende dal doppio del quadrato del raggio della particella (quindi dalle sue dimensioni), moltiplicato per la
differenza tra le densità delle due sospensioni (nel nostro caso è una costante), moltiplicato per la costante
di gravità (quindi un’altra costante); e il tutto fratto nove volte la viscosità del liquido.
Quindi, semplificando, l’equazione ci dice che la VES dipende dalle dimensioni dei globuli rossi e dalla
viscosità del sangue, la quale è strettamente correlata al numero dei globuli rossi. Definiamo la VES allora
come direttamente proporzionale alla massa degli eritrociti e inversamente proporzionale al numero degli
eritrociti.
predisposizione all’aggregazione. + +
età
2
Durante la fase acuta alcune
+ + +
proteine di questa fase, come il + + età + 10
fibrinogeno e le proteine + + 2
+ + + +
asimmetriche come le
+ + +
immunoglobuline, tendono a + legenda:
ridurre le forze elettro-repulsive globulo rosso
che fanno respingere tra loro i
acido sialico
globuli rossi. I globuli rossi allora
cominciano ad aggregarsi tra loro fibrinogeno ed
+ altre proteine della
(rouleaux) portando a un aumento fase acuta
del numeratore della legge di
Stokes, per cui aumenta la VES. Questo indice di flogosi è quindi un indicatore indiretto, in quanto dipende a
sua volta dalla produzione delle proteine della fase acuta. Si tratta, inoltre, di un parametro che dipende
anche da altri fattori, che possono essere disturbanti per la rilevazione o il monitoraggio del processo
flogistico. La VES varia, infatti, con l’età e il sesso, si modifica con una latenza maggiore rispetto alla PCR (in
quanto il fibrinogeno aumenta più tardivamente), e, infine, la VES varia anche a seconda delle patologie che
riguardano il numero o le dimensioni dei globuli rossi.
149
Patologia clinica
• Una policitemia da alta quota provoca un aumento del numero di globuli rossi e la VES risulta
diminuita à controbilancia l’innalzamento indotto da un eventuale infiammazione che non
risulterebbe diagnosticabile (falso negativo).
• Nel caso invece di una anemia, la VES sarebbe più elevata per il calo di numero di globuli rossi, ma
ciò non sarebbe indice di flogosi (falso positivo).
Per diagnosticare un processo infiammatorio è tuttavia più opportuno utilizzare la proteina C reattiva, in
quanto indice diretto (la VES è invece un indice indiretto, essendo dipendente dalle proteine della fase
acuta). Inoltre, la proteina che influenza maggiormente la VES è il fibrinogeno, ma questo aumenta dopo 21
giorni dall’inizio del processo infiammatorio e si riduce un mese e mezzo dopo. La VES, infine, dipende dalle
dimensioni del globulo rosso: le macrocitosi aumentano la VES, le microcitosi e la policitemia la riducono. Vi
sono quindi molti fattori confondenti. Per esempio, un paziente con anemia ha una VES aumentata, ma non
perché abbia un’infezione.
La VES è un indice indiretto e tardivo, ha molteplici limiti, sarebbe quindi meglio utilizzare la proteina C
reattiva. Il valore clinico della VES risiede comunque nel fatto che essa costituisce un metodo semplice e a
buon mercato per la valutazione dei processi infiammatori e di altri processi patologici.
[Si sconsiglia di farle entrambe in contemporanea. Si potrebbe fare prima la VES e, se il risultato non fosse
soddisfacente, fare in seguito anche la PCR, ma mai entrambe contemporaneamente per ragioni economiche
e logiche: non ha senso fare un doppio test quando già uno solo di questi, la PCR, è sufficiente e altamente
affidabile, e non ha senso fare la PCR prima e la VES dopo, perché la VES sarà sempre meno affidabile.]
È estremamente improbabile che un’alterazione degli indici di flogosi possa associarsi a uno stato di buona
salute, quindi bisognerà sempre indagare su quale disagio ci possa essere (nel caso di un danno tissutale non
immediatamente manifesto) o su quali siano le sue cause. La causa dell’alterazione potrebbe anche non
essere particolarmente rilevante, ma va comunque sempre rilevata per escludere la presenza, in certi casi,
di processi patologici.
Bisogna inoltre ricordare che la loro negatività non consente di escludere la presenza di un processo
patologico.
150
Patologia clinica
Il termine emostasi (dal greco di αἷμα «sangue» e στάσις «immobilità, interruzione») comprende tutti i
meccanismi fisiologici che l'organismo mette in atto per evitare perdite di sangue. Nell’uomo non è presente
una riserva di sangue, ma ciò che è in circolo è sempre utile e necessario, quindi bisogna evitarne la
dispersione. La milza può essere intesa anche come una riserva di sangue, perché ne contiene tanto; quindi,
in condizioni emergenziali può in qualche modo compensare, ma in realtà l’uomo non ha sangue di deposito.
Dunque, è fondamentale che una alterazione del sistema cardiovascolare venga compensata
tempestivamente.
In realtà il sistema emostatico è un sistema molto complesso perché allo stesso tempo riesce a garantire sia
l’interruzione di un’emorragia che il mantenimento della fluidità del sangue. Perciò grazie alla funzione
emostatica l'organismo può far cessare il sanguinamento di una ferita, pur mantenendo nello stesso tempo
la necessaria fluidità del sangue nel compartimento intravascolare.
Un’alterazione del processo emostatico si traduce clinicamente con due manifestazioni estreme:
• l’incapacità di mantenere il sangue fluido porta alla trombosi;
• l’incapacità di interrompere un sanguinamento porta all’emorragia.
Trombosi ed emorragie sono espressioni patologiche definite estreme dei disturbi dell’emostasi e sono
entrambe ugualmente importanti.
Si parlerà di emostasi primaria ed emostasi secondaria come se fossero due manifestazioni diverse, ma, in
realtà, l’emostasi è unica: viene scomposta solo per semplicità didattica. Bisogna imparare a considerare
queste semplificazioni su un test, nella pratica clinica sono processi integrati.
L’emostasi primaria consiste nella rapida formazione (pochi secondi) di un agglomerato di piastrine,
chiamato tappo emostatico primario (platelet plug), nella zona della lesione, che consente l’interruzione del
sanguinamento dai vasi capillari e dalle venule. Contemporaneamente alla formazione del tappo, si attiva il
processo di vasocostrizione che riduce la potenziale perdita di sangue diminuendo l’afflusso di sangue nel
distretto danneggiato. La vasocostrizione inoltre favorisce i processi di riparazione poiché consente loro di
lavorare in una condizione di pressione ridotta. È bene precisare però che la vasocostrizione non può essere
protratta all’infinito perché causerebbe l’ischemia dei tessuti a valle: è importante quindi che al ripristino del
flusso ematico corrisponda la solidità e resistenza del tappo emostatico e ciò si verifica grazie all’emostasi
secondaria. La formazione del tappo emostatico avviene in pochi secondi ed è fondamentale per arrestare
la fuoriuscita di sangue dai vasi capillari e dalle venule: è quello che succede quando ci si fa un taglio in cucina
o radendosi la barba, l’emorragia si arresta quasi subito. Tuttavia, il tappo emostatico primario è friabile: non
resiste a un flusso ematico ripristinato.
151
Patologia clinica
L’emostasi secondaria porta, per attivazione del sistema della coagulazione, alla formazione della fibrina, i
cui filamenti rafforzano il tappo emostatico primario, dando origine al tappo emostatico secondario: infatti,
le piastrine adese le une alle altre rappresentano una struttura friabile che deve essere cementata per
resistere al ritorno della pressione ematica; l’emostasi secondaria richiede alcuni minuti ed è importante
soprattutto per bloccare la fuoriuscita del sangue dai vasi di calibro maggiore.
A questo punto si può ripristinare il flusso ematico perché il tappo emostatico è molto più resistente.
In generale quindi le piastrine sono gli elementi fondamentali dell’emostasi primaria e i fattori di
coagulazione lo sono per l’emostasi secondaria.
P2.1.1 Piastrine
Nell’immagine a lato è presente uno striscio di sangue
periferico in cui si identificano: in basso al centro un
polimorfonucleato (a sx) e un linfocita (a dx), mentre sono
evidenziate dalle teste di freccia alcune piastrine al cui interno
sono visibili i granuli (visualizzabili anche con la colorazione di
May-Grunwald e Giemsa).
Le piastrine sono dei frammenti citoplasmatici che derivano dal megacariocita che a sua volta deriva dal
precursore midollare che si chiama megacarioblasto; si aggirano tra le 150’000 e 400'000 per mm3 e sono
per 2/3 circolanti e 1/3 sequestrato in un pool splenico. La vita media delle piastrine è intorno ai 10-12 giorni,
dopodiché vengono rimosse dai fagociti mononucleati del sistema reticolo-endoteliale. Le piastrine non
attivate hanno un diametro tra 1 e 4 μm e uno spessore di 1 μm, pari a 1/7-1/8 di un globulo rosso.
Tra le componenti delle piastrine, le più importanti sono:
• il sistema canalicolare aperto che è costituito dalla membrana plasmatica trilaminare la quale,
invaginandosi profondamente all’interno della cellula, aumenta notevolmente la superficie di
contatto con l’ambiente esterno e favorisce la già elevata reattività delle piastrine; inoltre, il sistema
è avvolto da un glicocalice contenente specifiche glicoproteine recettoriali (Gp);
• il sistema tubulare denso che è il REL, derivato da quello del megacariocita di origine. È in stretto
contatto con il sistema canalicolare aperto, permettendo alle piastrine di produrre e rilasciare in
circolo molto velocemente diverse sostanze;
• un complesso sistema citoscheletrico che permette alle
piastrine di modificare rapidamente (in pochi secondi) la loro
forma. Le piastrine circolanti hanno una “forma discoidale”,
mentre le piastrine attivate assumono una morfologia sferica
con emissione di pseudopodi contenenti recettori specifici
(“forma stellata”).
All’interno delle piastrine sono presenti dei granuli contenenti una
molteplicità di sostanze preformate e quindi immediatamente disponibili al rilascio, per cui le piastrine
possono sintetizzare sostanze, ma per lo più contengono già sostanze dentro i granuli pronte per essere
liberate in circolo. In particolare:
• i granuli α, poco opachi e molto numerosi, contengono:
o proteine adesive: vWF, fibronectina, trombospondina;
o fattori della coagulazione: fibrinogeno, vWF, fattore V, HMWK;
o inibitori della fibrinolisi: PAI-1, α 1-antiplasmina;
o sostanze ad azione anti-eparinica: β-tromboglobulina, fattore piastrinico 4 o modulatori di
crescita (PDGF, TGF- β).
• i corpi densi (granuli δ) contengono calcio, fosforo, ATP/ADP, istamina e serotonina.
presente un connettivo estremamente reattivo per le piastrine: quindi, quando le piastrine incontrano il
connettivo sottoendoteliale esposto (collagene, proteoglicani, fibronectina), si attivano attraverso degli
specifici recettori e la reazione piastrinica può essere schematizzata in tre fasi principali:
1. adesione delle piastrine al connettivo sottoendoteliale esposto e passaggio da una forma discoidale
a una forma sferica con protrusione di pseudopodi (forma stellata);
2. attivazione delle piastrine con liberazione in circolo del contenuto dei granuli piastrinici a diversa
attività biologica;
3. aggregazione di altre piastrine con formazione di un tappo emostatico primario.
1) Adesione piastrinica
Si tratta di un’adesione mediata da specifici recettori.
Sulla membrana delle piastrine ci sono dei recettori nominati GP (glicoproteina) seguiti da un numero. In
particolare, GP1A e GP1B sono i recettori che garantiscono alla piastrina di aderire al connettivo
sottoendoteliale (costituito da collagene, proteoglicani e fibronectina) che si espone in seguito a un danno.
Le cellule endoteliali sono poco resistenti, quindi
un danno anche lieve è in grado di alterarle.
Quando le cellule endoteliali vengono distrutte,
scoprono il connettivo sottoendoteliale.
Le piastrine riconoscono il connettivo e vi
aderiscono grazie a questi due recettori, in due
modi:
• direttamente, alle fibre collagene
attraverso il recettore GP1A;
• indirettamente, alle fibre collagene per
l’interposizione del fattore di von
Willebrand (vWF).
Il fattore di von Willebrand è un multimero, una grossa glicoproteina plasmatica, che forma multimeri
eterogenei, mediamente intorno alle 100 unità.
Il vWF viene sintetizzato dalle cellule endoteliali e dai megacariociti: nelle cellule endoteliali è contenuto in
vescicole di deposito, i corpi di Weibel-Palade, mentre nelle piastrine si trova all’interno dei granuli α.
Il vWF ha due funzioni:
• da un lato, media il legame tra piastrine e connettivo sottoendoteliale dei vasi sanguigni che hanno
subìto lesioni, quindi è coinvolto nell’emostasi primaria;
• dall’altro, solubilizza, veicola e stabilisce la funzione del
fattore VIII della coagulazione (proteggendolo dalla
degradazione), dunque, è coinvolto anche nell’emostasi
secondaria.
Shape change
Un’altra caratteristica delle piastrine è che, quando queste attivano i recettori, cambiano morfologia:
normalmente hanno una forma a disco biconcavo (assomigliano alle orecchiette baresi), poi, quando si
attivano, assumono una forma sferoidale con degli pseudopodi. Gli pseudopodi sono braccini che hanno
recettori che si “aggrappano” al connettivo sottoendoteliale esposto.
153
Patologia clinica
Questa coagulopatia è però meno riconoscibile dell’emofilia, perché fortunatamente, in molti casi, la
mutazione del gene che codifica per il vWF produce un deficit limitato dell’efficienza di questo fattore e
quindi molti pazienti sono asintomatici o hanno manifestazioni cliniche trascurabili che possono essere
154
Patologia clinica
valutate solo in laboratorio. I casi gravi sono effettivamente molto ridotti, circa 1,5 soggetti/milione di
abitanti, mentre l’emofilia tende a essere sempre grave.
Nei pazienti sintomatici, le manifestazioni cliniche più caratteristiche sono costituite da ecchimosi ed
ematomi non proporzionali all'intensità del trauma, epistassi, gengivorragie e mestruazioni abbondanti:
inoltre, a seguito di situazioni chirurgiche o odontoiatriche anche non particolarmente impegnative
(tonsillectomia, appendicectomia, estrazioni dentali), i pazienti manifestano sanguinamenti eccessivi e
prolungati.
Il vWF e la rispettiva malattia prendono il nome dall’ematologo finlandese Erik Adolf von Willebrand (1870-
1949), medico finlandese che intorno agli anni ‘20 visitò una ragazzina di nome Hjördis Sundblom che aveva
manifestazioni emorragiche ricorrenti anche
importanti. Inoltre, i genitori di Hjördis durante
l’anamnesi familiare riferirono che in realtà 7
degli 11 figli avevano manifestazioni simili e
addirittura 3 bambine erano già decedute. Von
Willebrand ricostruì l’albero genealogico in modo
che il quadrato rappresentasse il maschio, il
cerchio la femmina, lo scuro fortemente
sintomatico (Hjördis è il terzultimo pallino nero in
basso a destra) e il tratteggiato con sintomi lievi.
Grazie a questo lavoro, l’ematologo scoprì non
solo che le femmine presentavano con una certa
frequenza sindromi emorragiche, ma anche che
dei 58 soggetti studiati, 23 avevano avuto episodi di emorragia.
Una volta identificata la modalità di trasmissione, chiamò questa patologia “pseudo-emofilia” a seguito delle
differenze tra le due manifestazioni per quanto riguarda:
• la diffusione: l’emofilia colpisce prevalentemente i maschi, mentre in quest’altra patologia la
popolazione era costituita sia da maschi che da femmine. Inoltre, nel caso della famiglia Sundblom
c’era una certa prevalenza per le femmine;
• la diagnosi: i pazienti erano caratterizzati da un allungamento del tempo di sanguinamento.
Per queste due caratteristiche non poteva essere emofilia e venne chiamata col termine di pseudo-emofilia.
Successivamente si capì l’importanza del vWF battezzando la patologia col nome dell’ematologo.
Hjördis Sundblom morì per menorragia in occasione del suo quarto ciclo mestruale e questo fu uno stimolo
ulteriore per l’ematologo per approfondire le cause e la modalità di trasmissione della patologia. La malattia
di von Willebrand in base alle tipologie può essere trasmessa tramite una via autosomica dominante oppure
recessiva. In generale la possibilità di trasmettere la mutazione alla progenie resta elevata.
La diagnosi si basa sul riscontro dell’allungamento del tempo di sanguinamento e dell’aPTT (con PT normale),
oltre che sul dosaggio del fattore di von Willebrand. Il test di aggregazione piastrinica con ristocetina risulta
alterato, mentre il test di aggregazione con ADP è normale.
Sindrome di Bernard-Soulier
È una patologia estremamente più rara (colpisce un individuo su un milione), provocata non dalla mancanza
di vWF, ma dal deficit quantitativo o qualitativo del recettore GPIb (o, più precisamente, GPIb-V-IX).
L’alterazione si verifica conseguentemente a mutazioni dei geni che codificano per le quattro subunità del
complesso recettoriale, GPIbα, GPIbβ, GPV e GPIX, localizzati, rispettivamente, sui cromosomi 17p12,
22q11.2, 3q29 e 3q21.
Si trasmette secondo una modalità autosomica recessiva, manifestandosi clinicamente in omozigosi, spesso
i figli di genitori consanguinei. È anche nota una forma di malattia trasmessa per via autosomica dominante.
È caratterizzata clinicamente da una triade diagnostica specifica:
155
Patologia clinica
La diagnosi si basa sul riscontro dell’allungamento del tempo di sanguinamento e sulla determinazione
dell’espressione del complesso recettoriale GPIb-V-IX. Come nella sindrome di von Willebrand, il test di
aggregazione con ristocetina è alterato, mentre il test di aggregazione con ADP risulta normale.
2) Attivazione piastrinica
Subito dopo, ma in realtà contemporaneamente all’adesione piastrinica, si ha la liberazione di mediatori
chimici preformati a livello delle piastrine contenuti nei granuli. Oltre a questa liberazione, nello stesso
momento avviene anche la tempestiva neosintesi di alcune sostanze necessarie per le fasi successive.
Questi mediatori, fondamentali nella ricerca, ma perfino dal punto di vista terapeutico, sono molteplici,
tuttavia, verranno trattati quelli più funzionali dal punto di vista laboratoristico.
Tali sostanze comprendono:
• molecole ad attività vasocostrittrice e/o pro-aggregante (serotonina, TXA2, ADP, Ca2+): la
vasocostrizione è un riflesso nervoso che può essere protratto da sostanze liberate dalle piastrine;
per quanto riguarda l’azione pro-aggregante, essa favorisce la fase successiva dell’attivazione
piastrinica;
• fattori della coagulazione (fibrinogeno, fattore V): prodotti dal fegato, alcuni di questi hanno una
componente aggiuntiva contenuta nei granuli piastrinici;
• inibitori della fibrinolisi (PAI-1, α2-antiplasmina).
In questa fase si ha anche l’espressione in superficie del fattore piastrinico 3 (FP3) che è un complesso
fosfolipidico capace di fornire il sito di nucleazione critico per il legame del calcio e dei fattori della
coagulazione. FP3 è quindi necessario alla funzione della cascata coagulativa, mostrando ancora una volta
l’intersezione tra l’emostasi primaria e secondaria.
3) Aggregazione piastrinica
L’aggregazione piastrinica è mediata principalmente dall’ADP, liberato dai corpi densi. Un altro fattore che
media l’aggregazione piastrinica è il trombossano.
L’ADP attiva un altro complesso recettoriale presente sulla membrana della piastrina, modificandone la
conformazione: il complesso recettoriale glicoproteina (Gp) IIb/IIIa, rendendolo in grado di reagire con il
fibrinogeno.
156
Patologia clinica
Tromboastenia di Glanzmann
Il deficit quantitativo o qualitativo del complesso recettoriale GpIIb/IIIa (solitamente congenito) causa una
grave sindrome emorragica nota come tromboastenia di Glanzmann. Si trasmette secondo una modalità
autosomica recessiva e si tratta di una patologia rarissima: fino a pochi anni fa erano conosciuti pochi migliaia
di casi al mondo.
Le manifestazioni cliniche sono le stesse che si osservano nelle altre condizioni in cui è presente un deficit
della funzione piastrinica, anche se in questo caso il problema è di aggregazione e non di adesione:
sanguinamenti cutanei o mucosi in seguito a traumi minimi che si presentano nella infanzia/adolescenza,
epistassi, gengivorragie, menorragie ed emorragie post-traumatiche o chirurgiche.
La diagnosi si basa sul riscontro di un tempo di sanguinamento prolungato con tempi di coagulazione (aPTT
e PT) normali e normale conta e morfologia delle piastrine. Contrariamente alle sindromi di von Willebrand e
di Bernard-Soulier, nella tromboastenia di Glanzmann il test di aggregazione con ADP è alterato, mentre
risulta normale il test con la ristocetina. La diagnosi viene completata dalla misurazione dei livelli di GPIIb/IIIa,
di GPIIb e IIIa separatamente, e dal legame con il fibrinogeno utilizzando anticorpi monoclonali specifici.
L’ADP, oltre ad attivare il complesso recettoriale GpIIb/IIIa, assieme a trombina e collageno, attiva le
fosfolipasi A2 e C che liberano acido arachidonico dai fosfolipidi della membrana piastrinica (fosfatidilcolina
e fosfatidilinositolo).
L’acido arachidonico può avere due
diversi destini metabolici:
• la via lipossigenasica che
produce leucotrieni;
• la via ciclossigenasica che
produce prostaglandine.
Tra le diverse classi di prostaglandine
il trombossano A2 (TXA2) è
estremamente importante e
rappresenta il più importante agente
aggregante prodotto dal nostro
organismo. Il trombossano non solo
favorisce l’aggregazione delle
piastrine, ma consente anche il
mantenimento della vasocostrizione
necessaria a ridurre il flusso ematico
nel distretto colpito dall’emorragia.
L’aspirina è il più importante farmaco antiaggregante che viene utilizzato per prevenire episodi di trombosi
in pazienti a rischio, tuttavia, non nasce come farmaco antiaggregante, ma antinfiammatorio. Pertanto, se
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Patologia clinica
viene assunto come farmaco antiinfiammatorio, la sua azione antiaggregante6 diventa il più importante
effetto collaterale che si può avere, ovvero l’emorragia.
Se un paziente in terapia con aspirina si deve sottoporre a un intervento chirurgico, è importante che
sospenda la terapia almeno dieci giorni prima della data programmata per l’intervento.
L’aspirina (acido acetilsalicilico), oltre a essere un farmaco antiinfiammatorio, ha anche una funzione
antiaggregante perché inibisce irreversibilmente la ciclossigenasi.
Quindi, quest’azione nella pratica medica può essere:
• negativa per coloro che hanno necessità di terapie antinfiammatorie prolungate. In questi casi
l’effetto finisce per essere la complicanza più importante nei pazienti che devono prendere
cronicamente questi farmaci (ovvero i FANS) aumentando il rischio di emorragia;
• positiva per coloro che hanno un elevato rischio di trombosi. L’aspirina se usata come farmaco
antiaggregante ha quindi un’azione preventiva nei pazienti che rischiano una trombosi arterovenosa
o hanno avuto patologie che possono facilitare tale alterazione emostatica.
6
Non bisogna fare confusione tra farmaci antiaggreganti e anticoagulanti. Infatti, i farmaci antiaggreganti inibiscono
l’aggregazione piastrinica, mentre gli anticoagulanti inibiscono l’attivazione della cascata coagulativa. Non solo questi
hanno diverse indicazioni, ma hanno anche un diverso meccanismo d’azione.
158
Patologia clinica
159
Patologia clinica
Via intrinseca
La via di attivazione intrinseca prevede l’attivazione del fattore XII, che si attiva tutte le volte che il sangue
viene a contatto con una superficie diversa dalle cellule endoteliali, come anche con una provetta di
laboratorio. Il fattore XII attivato attiva a sua volta il fattore XI, che a sua volta attiva il fattore IX. Questo
attiva il fattore X, in presenza del fattore VIII, che viene solubilizzato dal vWF, e del fattore piastrinico terzo
(FP3), che viene espresso dalla piastrina quando questa viene attivata, e del calcio. Il fattore X attivato, grazie
alla presenza del cofattore V, del FP3 e del calcio, converte il fattore II, altrimenti chiamato protrombina nella
forma inattiva, in trombina, che rappresenta la forma attivata. La trombina a sua volta attiva il fattore I, o
fibrinogeno, in fibrina solubile, che poi viene resa fibrina insolubile grazie al fattore XIII e al calcio.
È bene ricordare che tutti i fattori della coagulazione possono essere indicati con un nome o un numero, ma
i nomi necessariamente da ricordare sono quelli di:
• protrombina (fattore II) che nella forma attiva si chiama trombina;
• fibrinogeno (fattore I) che nella forma attiva si chiama fibrina. Il fibrinogeno, inoltre, è la molecola
che si interpone fra i due recettori attivati di una piastrina in fase di aggregazione a riprova
dell’intersezione tra emostasi primaria e secondaria.
Via estrinseca
È la via che si attiva tutte le volte che c’è un danno tissutale. È la via più importante in vivo e comincia con
l’attivazione del fattore VII da parte del fattore tissutale (FT, precedentemente chiamato tromboplastina).
Questo è contenuto in tutte le cellule (soprattutto le endoteliali) e si libera quando vengono danneggiate. Il
FT attiva il fattore VII che attiva il fattore X, seguendo poi le stesse tappe finali della via intrinseca.
Dal fattore X le due vie convergono descrivendo quindi la via comune della cascata coagulativa.
• Fattori in comune alle due vie à X, V, II, I.
• Attivazione estrinseca à fattore tissutale, VII.
160
Patologia clinica
Il seguente schema sintetizza tutte le caratteristiche dei fattori di coagulazione (compreso il nome), ma è
necessario focalizzarsi sui tre box rossi:
• il fattore XII, come altri fattori di contatto, non è necessario alla cascata coagulativa in vivo, mentre
è molto importante in quella in vitro: infatti, nei pazienti in cui manca il fattore XII non si hanno
fenomeni emorragici. Il fattore XII è chiamato anche fattore di Hageman dal nome del primo paziente
che fu identificato con questo tipo di alterazione. Hageman era un ferroviere inglese che morì per
embolia polmonare, ovvero una trombosi, situazione opposta all’emorragia.
• il fibrinogeno è il fattore della coagulazione più rappresentato nel sangue periferico, tant’è che se si
fa la separazione elettroforetica delle proteine del plasma, si ha un picco in più che corrisponde a
questa molecola.
• i diversi fattori di coagulazione hanno diversa emivita e in particolar modo il fattore VII
(proconvertina) è quello con emivita minore (solo sei ore), quindi necessita di più turnover.
La cascata coagulativa è fondamentale per preservare l’organismo da perdite di sangue, ma può anche essere
pericolosa perché se viene attivata impropriamente ovviamente produce danni importanti. È importante che
la cascata coagulativa funzioni e operi bene, ma soltanto in condizioni appropriate. Per questo motivo
l’organismo produce anche inibitori della cascata coagulativa che la bloccano quando viene attivata in
maniera inappropriata. È fondamentale che ci sia un equilibrio tra fattori che accelerano la cascata
coagulativa (procoagulanti) e fattori che la fermano (anticoagulanti).
È lo stesso discorso visto per i fattori pro-infiammatori: l’infiammazione è uno strumento importante che
l’organismo ha nei confronti dei microrganismi patogeni, ma un’eccessiva infiammazione può causare dei
danni e quindi esistono una serie di proteine che la controllano e la inibiscono.
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Patologia clinica
Se si mette in una provetta di vetro o di plastica un campione di sangue, questo coagula e diventa
inutilizzabile in laboratorio. È quindi importante che il sangue arrivi liquido in laboratorio e per raggiungere
questo scopo all’interno delle provette si rimuove il fibrinogeno oppure si aggiungono anticoagulanti.
Si distinguono due principali gruppi di sostanze ad azione anticoagulante utilizzate nelle strategie
anticoagulative:
• sostanze chelanti il calcio che, di fatto, sottraggono il calcio alla cascata coagulativa rendendolo
indisponibile:
o citrato;
o ossalato;
o EDTA (acido etilendiaminico tetracetico) sotto forma di sali di sodio e di potassio.
7
La proteina C attivata è DIVERSA dalla proteina C reattiva, indice di flogosi.
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Patologia clinica
La vitamina K viene assunta con la dieta e appena arrivata subisce una riduzione (tramite la vitamina K
reduttasi) poiché solo nella forma ridotta può funzionare come coenzima per la γ- glutamilcarbossilasi.
Dopo aver partecipato alla reazione di carbossilazione, la vitamina K ha bisogno di due riduzioni in cui la
prima (esercitata dalla epossido reduttasi) serve per riportarla in condizioni simili a quelle di partenza: in
sintesi, la vitamina K esogena ha bisogno di una sola riduzione mentre a quella endogena (che viene riciclata)
ne servono due.
163
Patologia clinica
nell’adulto:
164
Patologia clinica
Gli inibitori della vitamina K agiscono bloccando la sintesi di nuovi fattori funzionali, ma quelli già presenti nel
sangue permangono attivi fino alla loro fisiologica degradazione; ciò comporta che:
• l’inizio dell’attività anticoagulante sia ritardato rispetto al momento dell’assunzione del farmaco a
seguito del graduale turnover dei fattori preesistenti;
• dopo l’interruzione del trattamento l’effetto persista fino alla sintesi graduale di nuovi fattori
funzionali.
Figura a sinistra: in rosso gli eritrociti, in viola un linfocita, in giallo le piastrine, in verde acqua la fibrina.
Figura a destra: in rosso gli eritrociti, in violetto un leucocita, in giallo la fibrina.
Osserviamo nelle figure soprastanti due “istantanee” al microscopio elettronico del processo di formazione
del tappo emostatico secondario. In particolare, osserviamo una situazione in cui la fibrina sta cominciando
a organizzarsi in tralci filamentosi e una seconda situazione in cui i tralci sono ampiamente formati e stanno
intrappolando gli eritrociti e i leucociti, andando a formare la struttura definitiva del tappo emostatico
secondario.
Plasmina (plasminogeno = forma inattiva circolante nel sangue) à enzima strategico della fibrinolisi, una
proteasi che dissolve il tappo emostatico secondario degradando fibrina e fibrinogeno.
L’attivazione del plasminogeno può avvenire tramite due diverse vie di attivazione: una intrinseca e una
estrinseca.
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Patologia clinica
Nella via estrinseca il segnale che attiva la fibrinolisi è liberato dalle cellule endoteliali e si chiama attivatore
tissutale del plasminogeno (t-PA). Questo mediatore sintetizzato dall’endotelio rigenerato determina
l’attivazione del precursore ematico inattivo plasminogeno in plasmina. La plasmina degrada la fibrina,
dissolve il tappo emostatico secondario che viene spazzato via dal flusso ematico ormai ristabilito, si
riproduce quindi la stessa situazione funzionale e morfologica del vaso prima del danno.
Il plasminogeno è il proenzima, mentre la plasmina è l’enzima fondamentale della fibrinolisi.
Nella via intrinseca l’attivazione avviene ad opera dei fattori di contatto, che sono il fattore XIIa, XIa, il
chininogeno ad alto peso molecolare e la callicreina. Questi fattori inizialmente erano stati associati alla via
intrinseca della cascata della coagulazione, successivamente si è visto che il loro ruolo è nell’innesco della
fibrinolisi. I fattori di contatto attivano una sostanza chiamata urochinasi, isolata per la prima volta nelle
urine, dove ha la funzione di dissolvere i coaguli di fibrina che potrebbero ostruire le vie di deflusso renali. È
una sostanza ubiquitaria (è secreta anche da fibroblasti, cellule epiteliali e macrofagi) che attiva il
plasminogeno in plasmina.
La fibrinolisi è modulata precisamente attraverso la presenza di varî inibitori, tra cui l’inibitore dell’attivatore
del plasminogeno (PAI), prodotto dalle cellule endoteliali (come l’attivatore tissutale del plasminogeno), l’α2-
antiplasmina e l’α2-macroglobulina che inibiscono l’azione della plasmina.
Disciolto il tappo emostatico, il flusso ematico può rispristinarsi correttamente e la parete del vaso riparata
sarà identica a quella precedente la lesione.
Chi ha un deficit di fattore XII non presenta problemi di tipo strettamente emostatico, ma di dissoluzione dei
coaguli, in quanto questo fattore è molto più determinante nell’attivazione del sistema fibrinolitico di quanto
lo sia nell’attivazione della cascata coagulativa.
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Patologia clinica
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Patologia clinica
Bisogna tenere presente che ogni sanguinamento è per definizione patologico, ma questi fenomeni
emorragici sono talvolta erroneamente chiamati “sanguinamenti patologici”, in riferimento alla presenza di
una causa patologica a monte, ovvero l’alterazione dell’emostasi, che ne determina la spontaneità o l’entità
sproporzionata al trauma. Per questo motivo sarebbe più corretto chiamarli sanguinamenti, o emorragie,
associate a patologie a carico dell’emostasi.
Note:
• l’emofilia è la più importante fra le coagulopatie legate a deficit della dell’emostasi secondaria;
• il sanguinamento tipico dei deficit piastrinici è immediato e profuso perché nell’immediato non si
riesce a formare il tappo emostatico primario; quello tipico dei deficit della coagulazione è più
modesto e riprende dopo rimozione della pressione locale perché il tappo emostatico primario si è
formato, ma non è stato rinforzato dalla fibrina, e non resiste pertanto al flusso ematico normale che
si viene a formare dopo la fine dell’effetto di vasocostrizione;
• i deficit dell’emostasi primaria sono principalmente acquisiti e più frequenti nelle femmine, mentre
i deficit della coagulazione, primo fra tutti l’emofilia, sono tipicamente ereditabili e legati al sesso
maschile.
Le analisi di laboratorio sono fondamentali per confermare una eventuale ipotesi di diagnosi, in quanto
permettono di discriminare tra alterazioni dell’emostasi primaria e secondaria, e fra i vari deficit specifici di
entrambi i gruppi.
Se un paziente presenta un’emorragia che non ha natura post-traumatica, ma è causata da un’alterazione
dell’emostasi, sono necessarî diversi esami di laboratorio per la diagnosi. In questo caso si verificano
emorragie spontanee o che non sono proporzionali al danno subito.
In attesa dei risultati degli esami di laboratorio, dal punto di vista clinico il medico può scorgere delle
indicazioni che lo possono orientare verso un deficit dell’emostasi primaria o secondaria. Si fa riferimento,
ad esempio, a eventuali operazioni ai denti; infatti, in caso di un’alterazione dell’emostasi primaria
l’odontoiatra se ne accorge durante la seduta, a causa di un sanguinamento immediato eccessivo. In caso di
169
Patologia clinica
P2.3.2 Emocromo
Il conteggio del numero di piastrine, eseguito con un normale esame emocromocitometrico, va considerato
insieme al tempo di sanguinamento per la valutazione dell’emostasi primaria.
• 150.000 - 400.000/μL: valori di riferimento;
• > 100.000/μL: i pazienti sono asintomatici e il tempo di sanguinamento rimane nella norma;
• 50.000-100.000/μL: il tempo di sanguinamento è lievemente allungato, ma senza alcuna
sintomatologia emorragica;
• < 50.000/μL: il tempo di sanguinamento è allungato significativamente; si osservano porpore
cutanee dopo traumi minimi e sanguinamenti a livello mucoso in seguito a piccoli interventi
chirurgici;
• < 20.000/μL: notevole rischio di sanguinamenti spontanei intracranici e in altre sedi interne, con
conseguenze gravi, potenzialmente letali se coinvolgono distretti sensibili dell’organismo.
170
Patologia clinica
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Patologia clinica
Il test di aggregazione può anche essere utilizzato per valutare l’adesione piastrinica. Utilizzando un
antibiotico, la ristocetina, che in vitro ha la capacità di attivare i recettori di adesione GpIb, avverrà il legame
con il fattore di von Willebrand, con conseguente adesione delle piastrine. Se dal test emerge che l’adesione
è alterata, le cause possono essere due: la mancanza del recettore di adesione (malattia di Bernard-Soulier),
oppure un deficit del fattore di Von Willebrand.
Se un paziente che presenta sanguinamento mostra risultati normali a tutti questi esami si può escludere
un’alterazione dell’emostasi primaria e si effettuano degli esami per valutare eventuali deficit dell’emostasi
secondaria. A questo punto sarebbe necessario dosare i fattori della coagulazione, ma questo non sarebbe
possibile economicamente. Questi test, infatti, vengono effettuati preventivamente per tutti i pazienti che
saranno sottoposti a interventi chirurgici. Si analizzano perciò di tempi della coagulazione.
172
Patologia clinica
alone di fibrina. L’intero procedimento viene cronometrato, ottenendo così il tempo trascorso, in secondi,
tra l’aggiunta dei reagenti sopracitati e la visualizzazione del “tappo” di fibrina in provetta.
Il tempo di coagulazione fisiologico va da 28 a 40 secondi, sebbene nel referto venga espresso con un
rapporto, aPTT ratio, in modo tale da annullare eventuali differenze dovute a variabili, come reagenti,
temperatura, operatore e che viene definito come il rapporto tra l’aPTT del plasma-citrato in analisi e l’aPTT
di un campione sicuramente sano. Il valore di riferimento di aPTT ratio è pari a 1; un innalzamento del valore
dell’aPTT ratio indica un allungamento di PTT e, di conseguenza, un paziente coagula in modo inappropriato.
In questo schema viene riassunta la via intrinseca (in rosso), espressa dall’aPTT ratio, e la via estrinseca (in
giallo), indicata dal PT ratio, con i rispettivi fattori di coagulazione coinvolti.
Avendo a disposizione due esami di laboratorio, combinando tutti i risultati possibili, si otterrebbero
quattro diversi quadri:
173
Patologia clinica
1. aPTT normale e PT normale: non c’è nessuna alterazione dei fattori della coagulazione;
2. aPTT allungato e PT normale: (linea gialla normale, linea rossa alterata) le ipotesi diagnostiche sono
riguardanti un’assenza dei fattori non comuni alle due vie, ma appartenenti solo alla via intrinseca e,
quindi, ai fattori XII, XI, IX, VIII;
3. aPTT normale e PT allungato: assenza del fattore VII (sola via estrinseca);
4. aPTT e PT entrambi allungati.
Nello specifico, in caso di aPTT allungato e PT normale, si ha un deficit dei fattori implicati nella via intrinseca,
XII, XI, IX e VIII. Il deficit del fattore XII non determina un’alterazione della cascata coagulativa, perché essa
viene comunque attivata dal prodotto stesso della via estrinseca (la trombina).
La carenza del fattore XI esiste, ma è rarissima, per cui la si considera in seconda battuta.
Rimangono, pertanto, il fattore VIII e IX, la cui assenza è caratteristica dell’emofilia.
Emofilia
In un paziente si misura un PT normale e un aPTT allungato, questo denota una mancanza di fattori a monte
esclusi quelli comuni alle due vie (XII, XI, IX, VIII). Considerando che il XII non è necessario per la cascata
coagulativa in vivo può essere escluso, perciò sono da valutare i rimanenti tre fattori (XI, IX, VIII). Il deficit di
XI è una condizione genetica molto rara, sono molto più frequenti deficit di VIII e IX, ovvero il quadro clinico
di un soggetto emofiliaco.
L’emofilia è una malattia emorragica congenita dovuta al deficit quantitativo o qualitativo del fattore VIII
(emofilia A, più frequente) o del fattore IX (emofilia B, più rara); entrambe le forme sono recessive e legate
al cromosoma X, pertanto la malattia si manifesta quasi esclusivamente nei maschi (eredità diaginica).
La condizione più frequente è quella di maschio sano e donna portatrice, da cui verosimilmente si avrà il 50%
dei figli maschi sani, l’altro 50% malato; il 50% delle figlie donne sane e l’altro 50% portatrici.
Nel caso di padre malato e madre sana, tutti i figli maschi saranno sani e tutte le figlie femmine portatrici.
Nell’ultimo, seppur più raro, caso di donna portatrice e padre malato, il 50% dei figli maschi sani e l’altro 50%
malato; il 50% delle figlie donne malate e l’altro 50% portatrici.
Il quadro clinico, identico nei due tipi di emofilia, è caratterizzato da emorragie spontanee o traumatico-
chirurgiche:
• tipiche manifestazioni della malattia emofilica sono gli emartri (versamento di sangue in
un’articolazione), più frequentemente localizzati alle articolazioni sottoposte a carico (ginocchio,
gomito, spalla e anca);
• altrettanto frequenti sono gli ematomi intramuscolari, che compaiono qualche giorno dopo un
trauma con tumefazione, indurimento ligneo, dolenzia del muscolo interessato ed eventuali sindromi
da compressione a carico di fasci nervosi o vasi arteriosi che, in specifiche localizzazioni, possono
assumere aspetti di particolare gravità.
• fra le emorragie mucose, frequenti e spesso copiose sono le epistassi; possono inoltre presentarsi
ematuria (sangue nelle urine) ed emorragie del cavo orale conseguenti anche a minimi traumi;
174
Patologia clinica
La cura per questa malattia consiste nella somministrazione selettiva per via endovenosa dei fattori deficitari
VIII o IX (in passato si trattava con trasfusioni di sangue).
Prima di somministrare uno dei due fattori bisogna però capire di che tipo di emofilia si tratta; per legge
vanno eseguiti dei test di dosaggio di entrambi i fattori, in realtà ci sono dei test di laboratorio molto più
semplici e meno costosi del dosaggio. Basta infatti prendere
una provetta di plasma del paziente con emofilia ignota e
aggiungere il plasma di un paziente con emofilia A, a questo
punto i possibili scenarî sono due:
• l’aPTT rimane allungato: il paziente con emofilia ignota
ha certamente un’emofilia di tipo A;
• l’aPTT diventa normale: il paziente con emofilia ignota
ha certamente un’emofilia di tipo B.
Per motivi medico-legali, però, non si può utilizzare questa
metodologia.
In sostanza per carenza di XII non si ha aPTT allungato non perché la via intrinseca non si attivi (nonostante
la sua poca rilevanza in vitro rispetto a quella estrinseca), ma piuttosto perché essa viene attivata dal prodotto
stesso della via estrinseca (la trombina).
Sistema INR
Per garantire una standardizzazione universale di questo valore si opera tramite il sistema INR (International
Normalised Ratio); l’INR prevede che il PT ratio sia corretto per la sensibilità della tromboplastina utilizzata
in quel laboratorio per attivare la via estrinseca, determinata sulla base dell’ISI (International Sensitivity
Index); il codice ISI viene quindi applicato ad ogni lotto di tromboplastina prodotta commercialmente per
indicarne la diversa capacità di attivare in vitro la cascata coagulativa.
L’INR prevede che il PT ratio sia corretto per la sensibilità della tromboplastina utilizzata in quel laboratorio
per attivare la via estrinseca, motivo per cui il rapporto tra il PT del paziente e il PT di controllo viene elevato
a ISI, International Sensivity Index, caratteristico di ogni lotto per indicarne la diversa capacitò di attivare in
vitro la cascata coagulativa.
L’INR di un paziente in terapia, indipendentemente dalla sua patologia, deve avere valori compresi tra 2 e
3,5.
Di fronte a un paziente con un INR = 1,2 in cura con Coumadin, è necessario aumentare il dosaggio dato che
il paziente non viene scoagulato correttamente à la terapia non è efficace.
Viceversa, un INR = 4,5 indica un alto rischio di emorragia, motivo per cui risulta essere una situazione più
pericolosa.
L’INR è fondamentale nel trattamento di pazienti con alterazioni della coagulazione, condannati a un
continuo rapporto col laboratorio, ponendo l’attenzione su diversi fattori, tra cui la corretta interpretazione
degli esami stessi, la quantità della vitamina K che il paziente la assume per via alimentare.
fattore tissutale, il fattore VII che attiva il fattore X, quest’ultimo attiva il fattore V e questo, a sua volta, il
fattore II. Invece di essere obliqua, la via estrinseca si sviluppa in verticale. Ciò che ha consentito di
comprendere questa ipotesi è che la trombina, oltre ad attivare il fibrinogeno e la fibrina, attiva il fattore XI,
questo attiva il fattore IX che, insieme al fattore VIII, attivano il fattore X. In questo schema, si osserva
l’esclusione del fattore XII e l’inclusione di tutti i restanti in un unico modello unificato, in cui l’ex via
estrinseca è la via di attivazione, potenziata dalla via intrinseca, portando alla massima efficacia della cascata
coagulativa in vivo.
P2.5 TROMBOFILIA
Il termine trombofilia, chiamata anche stato ipercoagulabile o di ipercoagulabilità, si riferisce a una
condizione clinica legata solitamente a pazienti giovani, di età inferiore ai 45 anni, che hanno una inusuale
predisposizione al tromboembolismo arterovenoso, con episodî recidivanti e anamnesi familiare positiva,
per cui questi pazienti hanno diverse manifestazioni trombotiche nella loro vita e solitamente hanno un
parente con la stessa alterazione.
Nelle condizioni di trombofilia si possiede una ridotta capacità diagnostica, per questo motivo risulta più
semplice effettuare approfondimenti su un paziente con un’alterata capacità di interrompere un
sanguinamento. Ci sono molti pazienti con trombofilia di cui non si conosce la causa, per cui non si può
eseguire una valutazione di laboratorio. Nonostante ciò, è opportuno sottolineare che emorragia e trombosi
hanno la stessa rilevanza clinica.
La trombofilia è una condizione estremamente frequente, responsabile di almeno il 10% delle morti in
ospedale ed è una concausa in un ulteriore 15% dei casi. Quindi si parla di una condizione non
particolarmente diffusa, ma particolarmente pericolosa.
Il termine “trombofilia” è stato introdotto nel 1965 dall’ematologo Olav Egeberg, contrapponendolo al
termine “haemofilia”, utilizzato per la prima volta nel 1828 dal tedesco Friedrich Hopff, studente di medicina
all’Università di Zurigo.
Le cinque principali variabili che si possono valutare in laboratorio per identificare la causa della trombofilia
(solitamente pz < 45 anni, con storia familiare positiva per trombofilia e con episodî ricorrenti di trombosi)
sono:
• determinazione della attività degli anticoagulanti naturali antitrombina III, proteina C e S;
• ricerca delle mutazioni del gene del fattore V;
• ricerca delle mutazioni del gene della protrombina;
• determinazione dei livelli ematici di omocisteina;
• ricerca di anticorpi antifosfolipidi.
178
Patologia clinica
Queste condizioni sono ereditate come tratti autosomici dominanti a penetranza variabile; lo stato di
omozigosi è incompatibile con la sopravvivenza, mentre i soggetti eterozigoti presentano o una riduzione
(tipo I) o un deficit funzionale (tipo II) della proteina interessata. Il rischio relativo di trombosi venosa per
questi pazienti è 5 volte (deficit di antitrombina III), 6 volte (deficit della proteina S) e 7 volte (deficit della
proteina C) superiore a quello della popolazione che non presenta deficit ereditari dei rispettivi fattori.
P2.5.4 Iperomocisteinemia
L’omocisteina è uno degli ultimi marker di trombofilia studiati, è un importante amminoacido che può essere
metilato a metionina o transulfurato a cisteina grazie agli enzimi e relativi coenzimi che sono la vitamina B12,
la vitamina B6 e l’acido folico (vitamina B9)9. Una mancanza di questi enzimi (mutazione genetica) e coenzimi
8
Per ricordartelo pensa ad Andrea Landi.
9
Viene rimetilata a metionina per azione di due diversi enzimi: la metionina sintasi (MS), che necessita della presenza
di vitamina B12 e di acido folico (metilentetraidrofolato: MTHF) come coenzimi, e la betaina-omocisteina
metiltransferasi. Viene transfulfurata a cisteina per azione dell’enzima cistationina β-sintetasi, che necessita della
presenza della vitamina B6 come coenzima.
179
Patologia clinica
(carenza alimentare) determina un accumulo dell’omocisteina che non può essere convertita. Altri motivi per
cui l’omocisteina si accumula sono:
• l’insufficienza renale, a cui si accompagna un calo drastico della clearance della sostanza;
• lo stile di vita (fumo, caffè, stress, sedentarietà);
• l’età avanzata;
• sesso maschile.
L’iperomocisteinemia è associata a un’aumentata incidenza di aterosclerosi e trombosi venosa.
L’aterosclerosi viene favorita poiché alti livelli di omocisteina provocano un danno tossico endoteliale
tramite:
• riduzione della sintesi di monossido di azoto e dell’azione vasodilatatoria a esso legata;
• produzione dell’anione superossido e aumento dello stress ossidativo, con effetto sulla ossidazione
delle LDL;
• promozione dei processi infiammatorî.
La trombosi origina dall’iperomocisteinemia perché questa determina:
• liberazione del fattore tissutale dai monociti;
• riduzione della espressione della trombomodulina;
• attivazione dei fattori XII e V;
• inibizione della proteina C.
Il numero di soggetti affetti da iperomocisteinemia è più alto di quanto ci si possa aspettare (la prevalenza
nella popolazione generale è del 4,8%) e sarà probabilmente sempre più associata alla trombosi
arterovenosa, oltre che a promuovere l’aterosclerosi, prima causa di morte nei paesi occidentali.
Concludendo, quelle esposte sono le cinque condizioni conosciute, diagnosticabili in laboratorio che possono
determinare una trombofilia, ma non sono sufficienti, ci sono infatti altri pazienti con trombofilia che hanno
una causa diversa da queste e che ancora deve essere indagata. La capacità di approfondimenti diagnostici
di laboratorio delle trombofilie è molto più ridotta, a differenza delle emorragie di cui si ha una migliore
capacità diagnostica.
180
Patologia clinica
181
Patologia clinica
Il danno endoteliale diffuso (attiva piastrine, via intrinseca e estrinseca) è determinato da:
• immunocomplessi circolanti: ci sono malattie autoimmuni (es LES) che producono complessi
antigene-anticorpo che se circolanti si depositano nell’endotelio casualmente in diversi tessuti,
causando una endotelite;
• infezioni (meningococco, vaiolo...);
• shock: termico, settico;
• vasculiti;
182
Patologia clinica
• anossia;
• acidosi.
Anche il Covid-19 causa danno endoteliale che evolve poi in trombofilia, aumentandone la letalità.
La CID può essere causata anche dall’immissione in circolo di sostanze ad azione diretta:
• veleni di serpente: il veleno della vipera Russel attiva direttamente il fattore X, altri veleni attivano
il fattore II;
• pancreatiti acute: la tripsina attiva direttamente i fattori X e II.
Bisogna ricordare che la CID è sempre conseguente ad un’altra patologia, non esiste una CID primaria, ma
esclusivamente secondaria. Alla base di una CID c’è sempre una condizione in cui si è liberato in circolo una
grande quantità di tromboplastina oppure ha determinato un grande danno endoteliale.
P2.7 CONCLUSIONI
Nella riga verde sono mostrati i quattro
esami cardine che servono per studiare un
paziente con un disordine dell’emostasi:
numero di piastrine, tempo di
sanguinamento, PT e aPTT.
In verticale le varie patologie che possono
determinare una alterazione dell’emostasi
primaria e secondaria.
C’è un esame di laboratorio che risulta
essere costante e caratterizza più degli altri
l’alterazione dell’emostasi primaria. Si
tratta del tempo di sanguinamento, che
sarà sempre allungato.
183
Patologia clinica
Il fattore di Von Willebrand serve per l’adesione delle piastrine, ma stabilizza anche il fattore VIII, quindi
impatta anche con la funzionalità del fattore VIII, che riguarda la via intrinseca e dunque un aPTT allungato.
Quindi si ha alterazione dell’emostasi primaria, perché media l’adesione delle piastrine, ma anche alterazione
dell’emostasi secondaria, perché interferisce con la funzionalità del fattore VIII, quindi aPTT sarà allungato.
Il tempo di sanguinamento nell’emofilia sarà normale.
Esempio: in un paziente con emofilia e una lesione, si formerà il tappo emostatico primario, il
sanguinamento si interromperà, però riprenderà a sanguinare dopo un po' quando si è ripristinata la
pressione. Quindi il tappo emostatico primario interrompe l’emorragia e perciò il tempo di sanguinamento
184
Patologia clinica
P3.1.1 Proteine
Le proteine sono grandi molecole costituite da sequenze di amminoacidi legati uno all’altro da un legame
peptidico, ossia un legame tra il gruppo carbossilico di un amminoacido e il gruppo amminico
dell’amminoacido successivo, con la perdita di una molecola d’acqua (reazione di condensazione).
Il termine “proteina” (πρώτειος: "primario", "in testa" o "in piedi davanti") è stato introdotto da J. J. Berzelius
nel 1838 per sottolineare l’importante ruolo di queste molecole, corrispondente a quella del DNA (oggi
secondo questa logica dovremmo chiamare “proteine” il DNA perché è questa la molecola primaria da cui si
producono le proteine).
P3.1.2 Glucidi
I glucidi (da γλυκύs: dolce), o carboidrati, sono composti chimici organici caratterizzati da una proporzione
delle tre componenti fondamentali, ovvero atomi di carbonio, di idrogeno e di ossigeno secondo la formula
(CH2O)n,, dove n è un numero che va da un minimo di 3 (triosio) a un massimo di 7 (eptosi). I monosaccaridi
che hanno questa forma possono poi formare strutture complesse.
P3.1.3 Lipidi
Per i lipidi non siamo in grado di identificare un denominatore comune strutturale o funzionale perché non
esiste. Sono infatti un gruppo eterogeneo di composti organici caratterizzati da insolubilità in acqua: sono
185
Patologia clinica
infatti insolubili in solventi polari come l’acqua (e per questo definiti idrofobi), mentre sono solubili in solventi
organici come etere dietilico o acetone, alcoli e idrocarburi.
A causa della loro natura idrofoba, i lipidi non sono in grado di circolare liberamente nel sangue, ma hanno
bisogno di trasportatori, ossia le lipoproteine.
P3.2 LIPOPROTEINE
La componente proteica, in particolare, oltre a svolgere un ruolo strutturale ha anche altre due funzioni
fondamentali:
• è la parte che viene riconosciuta dai tessuti periferici mediante lo specifico recettore:
l’apolipoproteina è quindi il target del recettore che direziona la lipoproteina nei tessuti (ne
determina il destino metabolico);
• le apolipoproteine fungono infine da coenzimi: quando transitano nei tessuti sono in grado di attivare
enzimi normalmente silenti.
Tutto questo assicura un trasporto efficiente della componente lipidica nel sangue.
Per questo motivo, l’interesse dei ricercatori è oggi rivolto a questa componente delle lipoproteine al fine di
intervenire nelle alterazioni delle lipoproteine plasmatiche, chiamate dislipoproteinemie.
186
Patologia clinica
La densità di una lipoproteina dipende dal rapporto tra la componente lipidica e quella proteica:
- i chilomicroni sono costituti al 99% da lipidi, mentre le proteine sono solo l’1%;
- le VLDL sono costituite per il 92% da lipidi e per l’8% da proteine;
- le IDL sono costituite per l’85% da lipidi e per il 15% da proteine;
- le LDL sono costituite per l’80% da lipidi e per il 20% da proteine;
- le HDL sono costituite per il 50% da lipidi e per il 50% da proteine.
187
Patologia clinica
• i chilomicroni hanno l’1% di proteine, quindi in pratica non si muovono e rientrano nelle γ-globuline.
Il risultato dell’elettroforesi è un
lipidogramma colorato specificatamente per
i lipidi che rifletterà le diverse frazioni
lipoproteiche presenti nel sangue.
188
Patologia clinica
Nella prima colonna sono visibili le lipoproteine ordinate in base alla densità, espressa in g/L, e al diametro
dell’ordine degli Å.
• I chilomicroni hanno dimensioni pari alla metà o ad un terzo di quelle delle piastrine, quindi sono
sostanze relativamente grandi. Hanno una densità bassissima, inferiore a quella dell’acqua.
• Le VLDL hanno una densità lievemente maggiore (corrispondente circa a quella dell’acqua) e
dimensioni più piccole.
• Le IDL hanno una densità lievemente maggiore dell’acqua e dimensioni ancora più piccole.
• Le LDL hanno una densità maggiore e una dimensione minore.
• Le HDL sono quelle con la densità maggiore e le dimensioni minori.
Riassumendo quindi maggiore è la dimensione, minore è la densità à dai chilomicroni alle HDL la densità
aumenta progressivamente fino ad arrivare a circa 1200 g/L; dai chilomicroni (fino a 12.000 Å circa, quindi 1
µm, dimensioni paragonabili a quelle di una piastrina) alle HDL si riduce progressivamente (le HDL, infatti,
circa sono 100/150 volte più piccole dei chilomicroni).
All’aumentare della densità, diminuisce sia la dimensione che l’eterogeneità (LDL e HDL sono molto più
omogenee rispetto a chilomicroni e VLDL).
189
Patologia clinica
Per ogni lipoproteina è importante ricordare la componente principale, ossia quella indicata in rosso:
trigliceridi per quanto riguarda chilomicroni e VLDL (rispettivamente 90 e 55), colesterolo esterificato per
quanto riguarda IDL ed LDL (39 e 42), proteine per quanto riguarda le HDL (50).
Il metabolismo dei lipidi può essere schematicamente riassunto in tre tappe fondamentali:
- trasporto dei lipidi esogeni;
- trasporto dei lipidi endogeni;
- trasporto inverso del colesterolo.
NB: Questa è una schematizzazione usata per semplificare la spiegazione didattica, ma in realtà il
metabolismo dei lipidi è un meccanismo unico e ben armonizzato.
190
Patologia clinica
4. da qui i chilomicroni
entrano in circolo
dove cedono la
apoA1 alle HDL,
dalle quali ricevono
invece la apoC2 e la
apoE;
5. la apoC2 è un
coenzima che attiva
l’enzima LPL
(lipoprotein-lipasi),
espressa sulle cellule
endoteliali dei
capillari del tessuto
adiposo e
muscolare, che
catalizza l’idrolisi dei
trigliceridi trasportati dai chilomicroni;
6. gli acidi grassi passano quindi dal chilomicrone al tessuto adiposo, dove vengono immagazzinati, o
al tessuto muscolare, dove hanno un ruolo energetico;
7. cedendo progressivamente trigliceridi a questi tessuti i chilomicroni diventano piccoli e densi e si
trasformano in residui (chilomicroni remnants) particolarmente ricchi di colesterolo;
8. grazie alla presenza della apoE i chilomicroni remnants vengono riconosciuti da specifici recettori
epatici e captati dal fegato;
9. i trigliceridi che non sono stati ceduti al tessuto adiposo e al tessuto muscolare e tutto il colesterolo
assunto raggiungono quindi il fegato.
Riassumendo, il tessuto muscolare e il tessuto adiposo sono i target dei trigliceridi assunti con la dieta
e trasportati dai chilomicroni. Durante questo tragitto, i chilomicroni perdono trigliceridi e si trasformano in
chilomicroni remnants, che contengono tutto il colesterolo assunto con la dieta (in quanto non viene ceduto
a livello adiposo o muscolare) e una minore quota di trigliceridi. I chilomicroni sono poi destinati al fegato.
Le funzioni fondamentali dei chilomicroni sono quindi
• fornire i trigliceridi alimentari direttamente ai tessuti muscolare e adiposo;
• trasportare tutto il colesterolo alimentare al fegato.
191
Patologia clinica
in continua proliferazione o che vanno incontro a un frequente turnover delle membrane hanno
bisogno di colesterolo;
• viene utilizzato per la sintesi degli acidi biliari primarî (acido colico e acido chenodesossicolico),
necessarî per l’assorbimento intestinale dei grassi presenti negli alimenti;
• una quota viene eliminata direttamente con la bile, la quale contiene quindi sia gli acidi biliari che
derivano dal colesterolo che colesterolo libero;
• viene redistribuito dal fegato ai tessuti periferici, dopo essere stato montato su un’altra classe di
lipoproteine, le VLDL.
Il nostro organismo è in grado di sintetizzare a livello del fegato il colesterolo a partire da molecole di acetil-
CoA, grazie all’enzima idrossi-metil-glutaril-CoA reduttasi o HMG-CoA-reduttasi (nome da ricordare), che ha
un ruolo molto importante soprattutto nell’approccio terapeutico attualmente più in uso per combattere le
dislipoproteinemie e l’ipercolesterolemia in particolare. In ultima analisi il colesterolo a disposizione è sia
endogeno, cioè prodotto grazie all’HMG-CoA reduttasi, che esogeno, quindi introdotto con la dieta.
A questo punto i trigliceridi, il colesterolo esogeno e quello sintetizzato ex novo dal fegato vengono montati
su un’altra tipologia di lipoproteine: le VLDL, prodotte dal fegato stesso, che ripartono dal fegato e tornano
in circolo.
Le LDL contengono quindi il colesterolo alimentare, il colesterolo acquisito dalle HDL e il colesterolo
neosintetizzato dal fegato (tre fonti diverse); sono infatti le lipoproteine con la percentuale maggiore di
colesterolo e quindi sono anche quelle più pericolose per quanto riguarda la colesterolemia.
Da un punto di vista fisiologico, il colesterolo è fondamentale per il corretto funzionamento delle cellule, ma
può risultare dannoso se presente in quantità eccessiva.
Le LDL hanno come ruolo principale la distribuzione del colesterolo ai vari tessuti, in particolare: ai tessuti
periferici che utilizzano il colesterolo come precursore per la sintesi degli ormoni steroidei (surreni e gonadi),
192
Patologia clinica
per la sintesi di vitamine liposolubili (ad esempio la vitamina D prodotta dalla cute) o per il turnover della
membrana plasmatica (cellule nucleate del sangue, renali, muscolari lisce, endoteliali e fibroblasti). Le LDL
non sono quindi per loro natura “cattive” perché svolgono un ruolo fisiologico fondamentale, diventano
“cattive” quando sono particolarmente concentrate o modificate.
Una volta svolta la loro funzione tornano al fegato che le riconosce grazie al recettore per le LDL, recettore
che riconosce apoB100.
Il rilascio intracellulare di colesterolo che consegue alla captazione delle LDL per endocitosi produce 3
principali effetti:
• l’attivazione dell’enzima acetilCoA-colesterolo aciltransferasi (ACAT), che favorisce l’esterificazione
ed il deposito di colesterolo all’interno degli epatociti;
• l’inibizione dell’enzima HMG-CoA-reduttasi, con conseguente blocco della sintesi intraepatica di
colesterolo;
• l'induzione della espressione della proteina SRE (sterol response element) che agisce sulla regione
"promoter" del gene per il recettore delle LDL, disattivandolo; pertanto, maggiore è la concentrazione
di colesterolo nell’epatocita, minore sarà il numero di recettori per le LDL espressi dall’epatocita
stesso, e viceversa.
Ipercolesterolemia
Una buona parte delle LDL viene ricaptata dal fegato grazie al recettore per le LDL,
in grado di riconoscere l’ApoB-100 e consentire l’ingresso di tali lipoproteine negli
epatociti. La scoperta di questo recettore ha consentito di capire molto sul
metabolismo delle lipoproteine e i ricercatori che lo hanno scoperto durante i loro
studi sull’ipercolesterolemia familiare, Joseph Goldstein e Michael Brown, nel 1985
hanno ricevuto il premio Nobel per tale scoperta.
Sulla membrana degli epatociti è presente il recettore per le LDL che capta selettivamente le LDL circolanti. I
ricercatori hanno scoperto che tale recettore viene espresso in maniera quantitativamente diversa dagli
epatociti, che quindi ne presenteranno sulla membrana una quantità estremamente variabile. La quantità di
recettore espresso dipende dalla quantità di colesterolo contenuto all’interno dell’epatocita stesso: più bassa
sarà la quantità di colesterolo presente all’interno dell’epatocita, maggiore sarà l’espressione del recettore
sulla sua superficie e viceversa. Il blocco del recettore, in caso di elevata quantità di colesterolo all’interno
dell’epatocita, fa sì che le LDL rimangano in circolo determinando un aumento della colesterolemia. Esiste
quindi un rapporto diretto tra quantità di colesterolo intraepatocitario, espressione del recettore delle LDL e
colesterolemia. La colesterolemia dipende quindi in un’ultima analisi dalla quantità di colesterolo presente
all’interno degli epatociti. Per ridurre la colesterolemia, la strategia più efficace è quella di ridurre la quantità
di colesterolo assunta con la dieta.
Meno colesterolo assunto à meno colesterolo trasportato dai chilomicroni negli epatociti à maggiore
espressione del recettore per le LDL à riduzione delle LDL nel sangue periferico.
Viceversa, una dieta ricca di colesterolo farà sì che il colesterolo circolante rimanga più elevato.
Il primo approccio utilizzato per ridurre l’ipercolesterolemia è quindi ridurre la quantità di colesterolo
assunto con la dieta. Quando la dieta non è sufficiente, si può intervenire con dei farmaci. I primi farmaci a
essere stati utilizzati sono stati la colestiramina e il colestipolo (ora non sono più utilizzati per gli importanti
effetti collaterali) ed erano sequestratori di acidi biliari primarî, che sono prodotti dal fegato e contengono
un’elevata quantità di colesterolo; essi vanno nell’intestino, dove vengono riassorbiti, e poi tornano nel
fegato (circolo enteroepatico degli acidi biliari). Interrompendo il ciclo, essi rimangono a livello intestinale e
vengono escreti con le feci e con essi il colesterolo contenuto al loro interno. Questo approccio, pur
risultando utile per ridurre la colesterolemia, presenta però diversi effetti collaterali.
193
Patologia clinica
I farmaci attualmente più utilizzati per ridurre la colesterolemia sono le statine, che inibiscono la HMG-CoA
reduttasi impedendo così la neosintesi di colesterolo endogeno da parte degli epatociti. Si riduce quindi la
quantità di colesterolo all’interno degli epatociti, aumenta l’espressione dei recettori per le LDL e si riduce la
colesterolemia.
Quindi, per ridurre i livelli di colesterolemia, è importante ridurre sia il colesterolo endogeno (tramite statine)
che quello esogeno (dieta controllata).
Partendo dal recettore è stato possibile sviluppare questa terapia farmacologica.
In realtà le HDL hanno almeno altre due funzioni fondamentali che non emergono dalla denominazione di
“trasporto inverso”:
• garantiscono il trasferimento del colesterolo alle IDL, ricevendo dalle IDL trigliceridi e fosfolipidi:
passaggio fondamentale per la trasformazione delle IDL a LDL, ricche di colesterolo. [In circolo, grazie
all’azione dell’enzima CETP (cholesterol ester transfer protein, oggi identificato con la apoD), le HDL
possono trasferire esteri del colesterolo su altre lipoproteine (sistema VLDL-LDL) ricevendo in cambio
trigliceridi e fosfolipidi.];
194
Patologia clinica
• sono un serbatoio di apolipoproteine che vengono cedute alle altre tipologie di lipoproteine; in
particolare sia i chilomicroni che le VLDL acquisiscono in circolo l’apoC2 e l’apoE dalle HDL.
1. prelevare il colesterolo che deriva dai processi catabolici dei tessuti periferici e trasportarlo al
fegato (trasporto inverso del colesterolo);
P3.4 DISLIPOPROTEINEMIE
Come ben sappiamo, la condizione di dislipoproteinemia è uno dei fattori di rischio principali per lo sviluppo
di aterosclerosi, che è alla base delle patologie cardiovascolari (cardiopatia coronarica e malattie
cerebrovascolari), le quali rappresentano la più frequente causa di morte nel mondo occidentale. Oggi non
ci sono dubbî sul fatto che una riduzione dei livelli lipoproteici riduce significativamente la mortalità
cardiovascolare; questo è stato dimostrato sia in studî di prevenzione primaria (pazienti che non hanno avuto
precedenti fenomeni cardiovascolari) sia in studî di prevenzione secondaria (pazienti che hanno avuto
almeno un episodio cardiovascolare).
Anche in questi pazienti, ovvero quelli che hanno già avuto un evento cardiovascolare, ridurre la
concentrazione di lipoproteine significa ridurre il rischio di un secondo evento cardiovascolare. È chiaro che
il metabolismo delle lipoproteine, visto in precedenza, ha un ruolo fondamentale nella insorgenza
dell’aterosclerosi e nel determinare quei numeri impressionanti legati alla mortalità cardiovascolare nel
mondo occidentale.
[Un grande numero di prove sperimentali e di dati epidemiologici hanno dimostrato che il processo
aterosclerotico, principale responsabile del danno ischemico che si determina nei pazienti con malattie
cardiovascolari, è accelerato dalla presenza di una iperlipoproteinemia e che la correzione, anche parziale,
della iperlipoproteinemia riduce significativamente la mortalità cardiovascolare].
195
Patologia clinica
Studio di Framingham
Prima di arrivare alle conclusioni sopra citate è stato necessario svolgere studî molto impegnativi, iniziati nel
1947 nella piccola città di Framingham [Pr: Fremingam], Massachussetts (USA), diventata famosissima nella
storia della medicina. Lo studio di Framingham è un classico esempio di studio prospettico: si esegue un
prelievo di sangue a un certo numero di soggetti (in
questo caso i 5000 abitanti di Framingham) e si
valutano una serie di parametri e indicatori (ad
esempio il peso, l’altezza, il sesso…); a questo punto
è necessario attendere numerosi anni e solo quando
i soggetti svilupperanno una serie di patologie si
potrà tentare di correlarle agli indicatori rilevati
all’inizio dello studio al tempo zero.
[Lo studio di Framingham ha dimostrato che ogni
incremento dell’1% della colesterolemia è associato
a un aumento di incidenza di cardiopatia ischemica
del 2-3%]. Lo studio di Framingham sta andando
avanti ancora oggi: i ricercatori sono arrivati a studiare i nipoti dei primi soggetti analizzati.
Gli studî prospettici sono fondamentali anche per definire la validità di un approccio terapeutico e capire se
un farmaco è efficace: si può, ad esempio, somministrare un determinato farmaco a un gruppo di pazienti e
un farmaco di altro tipo (o un placebo) a un altro gruppo; dopodiché si attendono diversi anni fino a che non
sarà possibile trarre delle conclusioni. Pensando all’attualità, degli esempî di studî prospettici sono quelli in
corso sui vaccini anti-Covid-19: infatti, solo una volta terminati gli studî sarà possibile conoscere con certezza
gli eventuali effetti collaterali a lungo termine (per ora sappiamo solo gli effetti nel primo anno post vaccino).
Gli studî prospettici prendono quindi questo nome proprio perché prima di poter concretizzare i risultati è
necessario attendere molti anni. Si tratta dunque di studî molto impegnativi e che richiedono numerosi
finanziamenti (è necessario eseguirli in diversi paesi e ripeterli nel tempo). Questi studî sono iniziati dopo la
Seconda Guerra Mondiale ed è stato possibile realizzarli proprio grazie alla ripresa economica avvenuta in
quegli anni.
Lipoproteina a – Lp (a)
[Dalle slide] La lipoproteina a – Lp (a) rappresenta una frazione lipoproteica con densità tra le IDL e le HDL e
migrazione elettroforetica di tipo pre-β.
197
Patologia clinica
La Lp (a) è una componente quantitativamente minore nella popolazione lipoproteica generale: la sua
importanza clinica deriva dal fatto che un incremento su base genetica dei livelli sierici di questa lipoproteina
è stato associato a un forte aumento del rischio di sviluppare cardiopatia coronarica.
La pericolosità delle Lp (a) è presumibilmente dovuta alla omologia tra la sequenza amminoacidica della apo
(a) e il plasminogeno: la Lp (a) potrebbe pertanto competere con il plasminogeno nel legame con il tPA
(attivatore tessutale del plasminogeno), inibendo l’attività fibrinolitica basale del tPA.
198
Patologia clinica
199
Patologia clinica
● gli indici di flogosi possono essere considerati indici di aterosclerosi. [Si è ipotizzato che i marcatori
di flogosi possano rappresentare indicatori indiretti di aterosclerosi silente, costituendo uno
strumento aggiuntivo per la definizione del rischio cardiovascolare individuale.]
Anche in questo caso, però, c'è un problema: gli indici di flogosi sono aspecifici, dunque si possono
modificare anche per altre cause oltre all'aterosclerosi. Al momento si sta quindi cercando di trovare
una specificità da un punto di vista quantitativo, cioè si sta cercando di identificare un livello oltre il
quale sia possibile correlare gli indici di flogosi esclusivamente all'aterosclerosi e non ad altri processi,
oppure trovare indici di flogosi specifici per l’aterosclerosi. Un'attenzione particolare è rivolta alla
proteina C reattiva (PCR), che potrebbe rappresentare un importante indicatore di rischio di
aterosclerosi e un importante fattore prognostico. Sono in corso degli studî prospettici a riguardo,
per cui è necessario attendere ancora qualche anno prima di poter trarre delle conclusioni. [Risultati
ancora preliminari, ma già consistenti sul piano del numero dei pazienti analizzati, hanno dimostrato
che i livelli di proteina C reattiva sono significativamente associati allo sviluppo di malattie
cardiovascolari, mostrando un potere predittivo indipendente e, talvolta, addirittura superiore a
quello espresso dai tradizionali fattori di rischio. Secondo alcuni autori, la PCR potrebbe addirittura
avere un ruolo “diretto” nello sviluppo e nella progressione delle lesioni aterosclerotiche, costituendo
quindi non tanto un marcatore di rischio, quanto piuttosto un vero e proprio fattore di rischio
cardiovascolare.]
Per quanto riguarda colesterolo frazionato, la frazione di colesterolo riferibile alle HDL si ricava misurando
prima il colesterolo totale e poi usando anticorpi anti-apoB, che determineranno la precipitazione di tutte le
altre classi di lipoproteine (VLDL, IDL, LDL). Eseguendo questo esame la mattina a digiuno non saranno
presenti chilomicroni, per cui rimarranno in sospensione esclusivamente le HDL e basterà dosare il
colesterolo presente nel sovranatante.
Per calcolare il colesterolo LDL, invece, si utilizza la formula Friedewald [Pr: Fridvold]:
Per risolvere questa equazione è necessario ridurre al minimo le incognite. Il colesterolo totale è noto perché
il valore viene ricavato tramite esame di laboratorio; lo stesso vale anche per il colesterolo HDL, ricavato con
il metodo analizzato precedentemente. Il colesterolo VLDL e il colesterolo IDL, invece, non sono noti.
200
Patologia clinica
Tuttavia, Friedewald ha scoperto che la somma tra colesterolo VLDL e colesterolo IDL corrisponde ai
trigliceridi (mg/dL) diviso 5 (o trigliceridi diviso 2,2 se consideriamo mmol/L) [tale approssimazione è da
ritenersi valida quando la concentrazione dei trigliceridi risulta inferiore a 400 mg/dL].
A questo punto, possiamo risolvere l'equazione:
10
Per quelli contro il politically correct: si tratta del “Danacol”!
201
Patologia clinica
valori tondi in medicina). L'indicazione migliore sarebbe quella di mantenere i livelli di colesterolo il più bassi
possibile ("low is better", come dicono gli americani), anche perché bassi livelli di colesterolo non sono
associati ad alcuna patologia. Lo stesso discorso si può fare ad esempio per i livelli di radioattività considerati
accettabili in un determinato ambiente (valore arbitrario). Questa indicazione ("low is better") non è però
valida per tutti i fattori: ad esempio, non vale per il secondo fattore di rischio dell'aterosclerosi, ovvero
l'ipertensione (in questo caso, sarebbe meglio dire "medium is better").
Oltre ai valori assoluti, è importante anche valutare il rapporto tra colesterolo LDL e HDL, che dovrebbe
essere inferiore a 3, e quello tra il colesterolo totale e il colesterolo HDL, che dovrebbe essere inferiore a 5.
L’indicatore tondo di 200 mg/dL continua ad essere usato perché più facile da comunicare al paziente ma
dobbiamo essere consapevoli che è nella valutazione dei livelli del colesterolo frazionato HDL e LDL e
soprattutto nel loro rapporto che si trovano indicatori di rischio più utili ed efficaci.
202
Patologia clinica
Il professore suggerisce a questo proposito di visitare i seguenti siti web, dove poter verificare come varia il
rischio di eventi cardiovascolari in base ai diversi fattori (età, sesso, abitudine al fumo, ipertensione...):
1. http://www.cuore.iss.it/valutazione/calc-rischio (istituto superiore di sanità)
2. https://siia.it/per-il-pubblico/calcolo-del-rischio-cardiovascolare
3. https://www.siditalia.it/clinica/formule-e-calcolatori (sito italiano di diabetologia)
203
Patologia clinica
Questi siti fanno comprendere come l’aterosclerosi sia sempre il risultato di una molteplicità di fattori, tutti
ugualmente interessanti nel definire un rischio complessivo. Ci si può inoltre rendere conto del peso specifico
di ciascun fattore.
204
Patologia clinica
Iniziarono quindi ampie ricerche sperimentali per curare questa patologia: nel 1893 Ferdinando Battistini
iniettò un estratto di pancreas bovino in due giovani pazienti affetti da diabete senza però avere successo,
data l’elevata presenza di enzimi attivi in grado di inattivare l’insulina, derivanti dal pancreas esocrino. A
seguito di questi tentativi si capì la necessità di separare la componente endocrina del pancreas da quella
esocrina, operazione tentata per anni da molti biochimici.
Il chirurgo canadese Frederick G. Banting, di ritorno dal fronte della Prima guerra mondiale a seguito di una
ferita, non trovando impiego negli ospedali, iniziò a lavorare come medico della mutua (analogo dell’attuale
medico di base). Ebbe successivamente un’intuizione geniale a cui dedicò il resto della sua vita: isolare il
pancreas endocrino in vivo, legando il dotto pancreatico e inducendo di conseguenza, una progressiva atrofia
della porzione esocrina. I biochimici del tempo non presero realmente in considerazione l’idea di Banting:
solo a seguito di fortissime pressioni, il biochimico John J.R. Macleod fornì gli strumenti per proseguire le
ricerche, senza però, inizialmente, prenderne parte. Banting e un laureando in medicina di nome Charles Best
iniziarono così a sperimentare questa tecnica di isolamento in vivo su alcuni cani.
La principale incognita per Banting e Best era capire per quanto tempo il dotto pancreatico dovesse rimanere
legato per consentire una sufficiente atrofia della porzione esocrina del pancreas: provando casualmente con
tempi progressivamente crescenti e iniettando gli estratti di pancreas ad altri cani in cui il diabete era stato
indotto, riuscirono, alla novantaduesima cavia, a trovare la formula temporale ideale. A seguito di questo
grande successo, Macleod e un altro biochimico di nome James Collip collaborarono al progetto cercando di
produrre un siero puro e iniettabile a partire da pancreas con componente esocrina atrofizzata.
205
Patologia clinica
Nel 1921 Frederick G. Banting e Charles Best scoprirono l’insulina, vincendo due anni dopo il premio Nobel
per la Fisiologia e la Medicina, insieme a John J.R Macleod e James Collip.
Banting morì durante la Seconda guerra mondiale.
Leonard Thompson fu il primo paziente trattato con “l’insulina di Banting”, nel 1922.
Segue una foto che fu famosissima: la prima bambina malata di diabete che, a seguito del trattamento con
l’insulina di Banting, riuscì a sopravvivere fino all’età adulta e a divenire madre.
P4.2 DIABETE
Il termina diabete oggi viene identificato con due patologie:
• diabete mellito: diffuso, è causato da una ridotta attività biologica dell’insulina; si definisce mellito
perché le urine risultano dolci al gusto;
• diabete insipido: molto più raro, causato da un deficit di ADH; si definisce insipido perché le urine
sono insapori e ipotoniche. Le urine sono “insipide” proprio perché contengono molta acqua (la
poliuria non è conseguenza di glicosuria).
In mancanza di specifiche, quando si parla di diabete ci si riferisce al diabete mellito.
206
Patologia clinica
• l’ADH ha come bersaglio le cellule del tubulo renale e ha la funzione di favorire il riassorbimento di
acqua. In caso di deficit, l’acqua viene filtrata dai glomeruli, non viene adeguatamente riassorbita e
viene quindi eliminata con le urine.
207
Patologia clinica
P4.2.3 Insulina
L’insulina è un ormone peptidico sintetizzato dalle cellule β pancreatiche ed è costituito da due catene A e
B, rispettivamente di 21 e 30 amminoacidi, unite tra loro da tre ponti disolfuro.
Viene sintetizzata sotto forma di un precursore di 110
aminoacidi, la pre-proinsulina, dotato di una sequenza
amminoterminale di 24 amminoacidi, detta peptide leader o
segnale; nel reticolo endoplasmatico la sequenza segnale viene
rimossa per formare la proinsulina, costituita dalle due catene
A e B unite da un peptide di connessione di 35 amminoacidi,
indispensabile per il corretto ripiegamento dell’insulina.
Dopo la formazione dei ponti disolfuro, la proinsulina viene
traslocata nell’apparato del Golgi dove il peptide di connessione
viene rimosso per taglio proteolitico con perdita di 4 amminoacidi, formando il peptide C, di 31 aminoacidi;
insulina e peptide C vengono quindi immagazzinati nei granuli secretori fino alla liberazione in circolo.
A seguito di appropriati stimoli, tra i quali principalmente l’innalzamento dei livelli di glucosio nel sangue
periferico (che entra nella cellula attraverso GLUT 2), l’insulina e il peptide C vengono rilasciati
equimolarmente dalle cellule β-pancreatiche. In circolo l’insulina viene velocemente catabolizzata dal fegato
e dal rene; la sua emivita è quindi breve, di circa 6 minuti.
La secrezione di insulina è caratteristicamente bifasica, con un primo picco precoce dovuto alla liberazione
in circolo dell’insulina preformata e un secondo picco tardivo conseguente alla sintesi di insulina ex novo. Il
secondo picco avviene se necessario ed è derivato dal permanere di valori di glicemia elevati.
Il glucosio presente nel sangue viene filtrato dal glomerulo e, in condizioni di normoglicemia, passa nel tubulo
per poi essere riassorbito a livello tubulare. Essendo il numero di carrier in grado di recuperare il glucosio
limitato, se la glicemia aumenta patologicamente lo zucchero rimane nelle urine, dove determina un richiamo
osmotico portando alla poliuria e successivamente alla polidipsia.
In condizioni normali, dopo un pasto, il trasportatore del glucosio verrà nuovamente captato all’interno della
cellula e al pasto successivo sarà nuovamente esposto sulla membrana. Ciò ovviamente non succede con il
diabete, in cui il trasportatore rimane sempre intracellulare.
208
Patologia clinica
P4.2.4 Epidemiologia
Il diabete è diagnosticato nel 3% della popolazione italiana. A questa quota di diabete diagnosticato si deve
aggiungere una quota, dello stesso ordine di grandezza, di diabete non diagnosticato, rappresentato
esclusivamente dal diabete di tipo 2: ciò significa che l’incidenza del diabete è doppia rispetto ai casi
diagnosticati; quindi, nel nostro paese vi sono non meno di 3.000.000 di soggetti diabetici, solo per la metà
riconosciuti come tali. Nelle diverse aree geografiche, si prevede un diverso incremento del diabete: minore
in Europa e nel Nord America, dove probabilmente è già aumentato in modo significativo, mentre si prevede
più di un raddoppio in Africa e Asia.
Complessivamente, si stima il seguente incremento: 415 milioni nel 2015 à 642 milioni nel 2040.
Questi numeri hanno fatto sì che il diabete abbia assunto una rilevanza socioeconomico-sanitaria pari a
pochissime altre condizioni. Il diabete più frequente (di tipo 2) tende ad incrementare con l’età, quindi
l’invecchiamento impatta sull’aumento della diffusione di questa patologia. Il diabete viene considerato
dall’OMS come la prima
emergenza sanitaria.
[Del 3% di pazienti diabetici,
il 10% soffre di diabete di
tipo 1 ed è in trattamento
insulinico, il restante 90%
soffre di diabete di tipo 2 ed
è in trattamento con
insulina (10%), con
ipoglicemizzanti orali (60%)
o con la sola dieta (30%).
La prevalenza del diabete di
tipo 2 aumenta con l’età: al
di sopra dei 65 anni oltre il
10% della popolazione
italiana risulta affetta da
diabete.]
P4.2.5 Diagnosi
Il presupposto fondamentale per diagnosticare il diabete è la valutazione della glicemia a digiuno (FPG,
ovvero “Fasting Plasma Glucose”):
• normale metabolismo glucidico: sotto i 100-105 mg/dL;
• diabete: sopra i 126 mg/dL. È consigliabile un secondo prelievo perché gli ormoni contro regolatori
dell’insulina possono influenzare il risultato;
• alterata omeostasi glucidica: il paziente ha una FPG tra 105 mg/dL e 126 mg/dL. Sono necessarî
ulteriori approfondimenti (OGTT o 2hrPPG).
209
Patologia clinica
Purtroppo, questo test ha una scarsa complianza, dove per complianza11 si intende il grado di collaborazione
da parte del paziente nel seguire più o meno scrupolosamente le prescrizioni del medico curante.
crescente, per poi restringersi restituendo il volume di sangue accumulato sotto l’effetto di una pressione
sanguigna decrescente.
11
Concetto da non confondere con la complianza o capacitanza in fisiologia, ossia la capacità che hanno i vasi sanguigni
di dilatarsi elasticamente sotto l’effetto di una pressione sanguigna
210
Patologia clinica
[La formula di conversione da mg/dL a mmol/L è: mmol/L = (mg/dL x 10) : peso molecolare; che nel caso del
glucosio è 180,095.]
Per quanto riguarda le prime due classificazioni, sono inappropriate definizioni come “giovanile” e “senile”,
in quanto non esiste una reale distinzione tra età giovanile e senile, o come “insulino-dipendente” e “insulino-
indipendente”, dato che qualsiasi forma di diabete mellito può richiedere una terapia insulinica.
Patogenesi
Questa patologia insorge soprattutto nei bambini e adolescenti. L’elemento fondamentale di questa forma
di diabete è rappresentato dalla distruzione delle cellule β-insulari. Il meccanismo è autoimmune,
probabilmente scatenato da agenti ambientali in soggetti geneticamente predisposti.
L’importanza dei fattori genetici è documentata dalle seguenti osservazioni:
• i bambini che hanno un parente di primo grado affetto presentano un maggiore rischio di sviluppare
la malattia rispetto ai coetanei che non hanno parenti di primo grado affetti (fenomeno della
aggregazione familiare);
• l’incidenza di concordanza cumulativa in fratelli di pazienti affetti da diabete di tipo 1 è del 10%, cioè
20 volte superiore a quella della popolazione generale della stessa età;
211
Patologia clinica
• l’incidenza di concordanza cumulativa fra gemelli omozigoti è tra il 35 e il 50% (a seconda delle
diverse casistiche), e può arrivare al 70% nei soggetti che hanno entrambi gli alleli del sistema HLA
ad alto rischio di malattia → se la patologia non fosse influenzata anche da fattori ambientali, la
concordanza sarebbe del 100%;
• il diabete di tipo 1 risulta fortemente associato con specifici antigeni di istocompatibilità di classe II
(in particolare HLA-DR3, HLA-DR4 e HLA-DQ2); l’allele HLA-DR2 avrebbe invece un ruolo protettivo.
Fattori ambientali
Tra i fattori ambientali potenzialmente responsabili abbiamo un’infinità di virus, però sappiamo
perfettamente che i pazienti infettati non sviluppano diabete. Tra le infezioni virali che oggi si ritengono
maggiormente associate al diabete è quella da Coxsackie B4 (da ricordare, perché è l’associazione più forte
tra quelle trovate).
Altri fattori potenzialmente responsabili (associazioni non del tutto confermate):
• infezioni batteriche, forse da micobatterî;
• alimenti, forse le proteine del latte vaccino assunte prima del quarto mese di vita (c’è una grande
diatriba a riguardo);
• tossine (?).
Tuttavia, fattori ambientali associati all’insorgenza del diabete sicuramente ci sono, ma non sono ancora stati
identificati.
[L’importanza dei fattori ambientali è documentata dalle seguenti osservazioni:
• i casi di T1DM aumentano nelle popolazioni che migrano verso aree geografiche ad alta incidenza;
• in alcune nazioni quali Polonia, Nuova Zelanda, Estonia e Stati Uniti, nella prima metà degli anni ’80
sono state registrate “epidemie” di T1DM;
• nei mesi invernali si osserva un aumento dell’incidenza della malattia.]
Meccanismi autoimmunitarî
Attraverso esperimenti ed esami autoptici (condotti su bambini che avevano sviluppato diabete di tipo 1) si
è scoperto che, prima della distruzione, le cellule β del pancreas vengono accerchiate da linfociti,
prevalentemente CD8+ e CD4+, e da macrofagi. Per cui sicuramente si tratta di una risposta autoimmune di
tipo cronico cellulo-mediata che ha un’azione distruttiva sulle cellule β pancreatiche: questi pazienti
sviluppano anticorpi contro le cellule β o contro l’insulina. Tuttavia, ad oggi, non conosciamo che cosa scatena
questa reazione autoimmune.
[Sebbene l’esordio del T1DM sia solitamente improvviso, la malattia risulta da un attacco autoimmune delle
cellule β di tipo cronico, presente da anni prima dell’inizio delle manifestazioni cliniche; iperglicemia e chetosi
si determinano quando più del 90% delle cellule β è stato distrutto.
Il ruolo dei meccanismi autoimmunitari è sostenuto da diverse evidenze:
• insulite: l’infiltrato cellulare che si osserva nei modelli animali durante le fasi iniziali del diabete
consiste per lo più di linfociti CD8+ e da un numero variabile di CD4+ e macrofagi; i linfociti CD4+ di
animali malati possono trasmettere la malattia ad animali sani, confermando il ruolo importante
dell’autoimmunità T mediata; inoltre, una infiltrazione linfocitaria è sempre documentabile nei
soggetti morti con diabete di recente insorgenza;
• autoanticorpi circolanti diretti contro le cellule insulari (ICA) e altri autoanticorpi si ritrovano nella
maggior parte dei soggetti con T1DM di recente diagnosi e sono spesso presenti nel periodo di
“prediabete”; inoltre, circa il 10% dei soggetti con diabete T1DM è portatore di altri disordini
autoimmuni organo-specifici quali la malattia di Graves, la malattia di Addison e la tiroidite di
Hashimoto.]
212
Patologia clinica
Caratteristiche cliniche
Il diabete di tipo 1 è fortemente sintomatico, si manifesta nel 95% dei casi prima dei 25 anni e comunque
sempre prima dei 35. Lo zucchero assunto con la dieta viene eliminato con le urine (glicosuria), il che porta,
in un paziente diabetico non trattato, a quella che è conosciuta anche come sindrome delle tre P:
• poliuria → aumento diuresi osmotica provocata dal richiamo osmotico del glucosio nelle urine
(glicosuria), talvolta associata a sintomi di disidratazione;
• polidipsia → sete intensa conseguente alla perdita di acqua ed elettroliti;
• polifagia → aumento dell’appetito, dovuto al fatto che il glucosio introdotto con la dieta non può
essere utilizzato come combustibile; quindi, il soggetto mangia molto, ma dimagrisce. Questo
aumento dell’appetito è conseguente al passaggio da una fase anabolica insulino-dipendente a una
fase catabolica da deficit insulinico.
In mancanza di zucchero vengono utilizzate fonti energetiche alternative:
1. Per primo viene attaccato il tessuto adiposo, con conseguente progressivo calo ponderale: gli acidi
grassi escono dal TA e si portano al fegato dove vanno incontro alla β-ossidazione per produrre
energia.
2. Dalla β-ossidazione degli acidi grassi si produce acetil-CoA che entra nel ciclo di Krebs reagendo con
l’acido ossalacetico. In caso di eccessivo catabolismo lipidico e un’accelerata β-ossidazione si produce
molto Acetil-CoA, che non trova una quantità sufficiente di ossalacetato con cui reagire; per cui si
accumula e dalla condensazione delle molecole di Acetil-CoA si ottengono i corpi chetonici: acido
acetoacetico, β-idrossibutile e acetone. Questi tre acidi determinano acidosi metabolica
(chetoacidosi) – un’alterazione dell’equilibrio acido-base che è la responsabile, insieme a condizioni
intercorrenti come infezioni o stress, del coma chetoacidosico. Prima dell’insulina di Banting, infatti,
i pazienti con diabete di tipo 1 morivano per scompenso dell’acidosi metabolica seguita dal coma.
Oggi i corpi chetonici sono uno strumento diagnostico per identificare lo scompenso metabolico
legato al diabete di tipo 1.
3. Dopo gli acidi grassi, vengono utilizzate come
substrato energetico le proteine provenienti dal
tessuto muscolare, il che comporta debolezza
muscolare.
213
Patologia clinica
1. La glicemia è normale, ma per mantenerla tale il paziente diabetico deve produrre più insulina. È per
questo motivo che col test da carico di glucosio, valutando l’insulinemia, si riesce a intercettare
questa condizione (si raccomanda di fare il test da carico di glucosio ogni mezz’ora). Si ha glicemia
normale e insulinemia elevata.
2. Aumentano le resistenze periferiche all’insulina; di conseguenza, oltre a un’iperglicemia
postprandiale, l’insulina continua ad aumentare, ma la glicemia non si risolve nei tempi in cui
dovrebbe risolversi dopo un test da carico di glucosio. Si ha insulinemia sempre più elevata e
iperglicemia post-prandiale.
3. Si verifica una sorta di scompenso legato al fatto che le cellule β pancreatiche, forse stressate per
diversi anni nel produrre troppa insulina, non riescono più a tenere il passo. Dunque, in questa fase
anche l’insulinemia si riduce, con conseguente notevole aumento della glicemia. Si ha ridotta
insulinemia e, di conseguenza, iperglicemia a riposo e diabete franco.
Non chiamiamo il diabete di tipo 2 “patologia dell’adulto” o “diabete non insulino- dipendente”, infatti molti
di questi pazienti assumono insulina come terapia; alcuni pazienti possono inoltre presentare i primi sintomi
anche in età giovanile.
Caratteristiche cliniche
L’evoluzione metabolica naturale del diabete di tipo 2, nei pazienti non adeguatamente trattati, prevede il
raggiungimento di valori di iperglicemia così elevati da produrre una poliuria tale che il paziente va incontro
a disidratazione – mancato equilibrio tra le enormi perdite di liquidi, dovuti agli elevatissimi valori di glicemia
raggiunti nella fase finale della malattia, e l’assunzione di liquidi. La disidratazione ha un effetto diretto sulle
cellule del SNC, inducendo coma iperosmolare. Oggi, grazie alle terapie, siamo in grado di scongiurare sia il
coma chetoacidosico (associato al diabete di tipo 1), sia quello iperosmolare, che dunque non rappresentano
più un rischio per il paziente diabetico. Gli elementi di pericolosità oggi associati al diabete sono le
complicanze che si sviluppano a seguito dell’iperglicemia.
[Il coma iperosmolare è caratterizzato da una disidratazione imponente prodotta da una diuresi eccessiva
non controbilanciata da un apporto idrico adeguato. Clinicamente si manifesta con iperglicemia gravissima
(anche > 1000 mg/dL), iperosmolarità, ipovolemia e ipernatriemia, insieme a segni di interessamento del
sistema nervoso centrale, che possono andare dall’obnubilamento del sensorio fino al torpore e al coma: sono
spesso presenti malattie concomitanti di vario genere e il coma può essere precipitato dalla somministrazione
di farmaci quali diuretici, corticosteroidi e fenitoina.]
12
Questo tipo di diabete è, infatti, chiamato diabete di tipo 1 lento oppure diabete di tipo 1.5, poiché le sue
caratteristiche sono una via di mezzo tra i due tipi principali di diabete.
214
Patologia clinica
Test di screening
È importante, quindi, sia per la madre che per il feto, diagnosticare precocemente e trattare l’iperglicemia
durante la gravidanza. Il test di screening deve essere eseguito tra la 24ª e la 28ª settimana di gestazione,
intervallo in cui si verifica il picco di incidenza di questa condizione.
• Microangiopatia diabetica → danno sistemico a carico dei piccoli vasi conseguente a iperglicemia
persistente, la quale determina un ispessimento della membrana basale che modifica gli scambî tra
il sangue e i tessuti. La localizzazione più frequente è a livello della retina (retinopatia diabetica) e ciò
ha determinato in passato un’elevata percentuale di cecità nei pazienti diabetici. Potenzialmente
tutti i capillari possono essere colpiti, ma quelli più vulnerabili sono, oltre a quelli della retina, i
capillari del sistema nervoso e i capillari renali con conseguente neuropatia diabetica e nefropatia
diabetica (responsabile di insufficienza renale).
• Macroangiopatia diabetica → interessa i grandi vasi ed è alla base dell’aterosclerosi. I pazienti con
elevata glicemia tenderanno ad alterare le LDL circolanti che, così modificate, sono in grado di
innescare il processo aterosclerotico. In questi pazienti, l’aterosclerosi si sviluppa più facilmente e
crea danni importanti a livello cerebrovascolare, a livello delle arterie coronarie e dei vasi periferici,
con una serie di conseguenze rilevanti (malattia cerebrovascolare, coronopatia e vasculopatia
periferica).
Tutte queste complicanze associate al diabete
sicuramente impattano in maniera significativa
sulla salute e sulla mortalità del paziente
diabetico, ma anche sulla sfera sanitaria.
[L’aspettativa di vita nei cinquantenni con il
diabete diminuisce di 7,5 anni negli uomini e 8,2
nelle donne]. L’impatto sanitario è, infatti,
enorme, visto l’elevatissimo numero di pazienti
diabetici, tanto che si stanno facendo i conti della
sostenibilità dell’ulteriore aumento del numero
di pazienti nei prossimi anni.
216
Patologia clinica
• Chetonemia e chetonuria → sono caratteristiche del diabete di tipo 1: se nel sangue periferico o
nelle urine sono presenti corpi chetonici, vuol dire che la patologia è già in una fase piuttosto
avanzata (accelerato catabolismo dei lipidi).
• Ricerca di auto-anticorpi specifici:
o anti-cellule pancreatiche (ICA: Islet Cell Antibodies);
o anti-insulina (IAA: Insulin Auto Antibodies);
o anti-acido glutammico decarbossilasi (GADA: Glutamic Acid Decarboxylases Autoantibodies,
o anti-GAD65);
o anti-tirosinfosfatasi (IA2);
o anti-ZnT8 → ZnT8 è una proteina di membrana presente nei granuli secretori contenenti
insulina all’interno delle cellule β pancreatiche. Come gli altri bersagli elencati, è un target
della risposta anticorpale che caratterizza il diabete di tipo 1.
N.B. Da un lato alcuni pazienti con diabete di tipo 1 non hanno gli anticorpi; dall’altro lato,
ancora più frequentemente, pazienti che hanno altre malattie autoimmuni presentano gli
stessi auto-anticorpi senza avere il diabete. Dunque, è bene conoscere questi indicatori
diagnostici, ma è importante tenere a mente che la loro sensibilità e specificità diagnostica
non è così elevata da poter costituire uno strumento diagnostico certo per il diabete.
• Tipizzazione per gli antigeni HLA → vi sono degli alleli associati al diabete di tipo 1: ne esiste uno
solo protettivo, mentre quelli che conosciamo maggiormente sono favorenti il diabete.
• Diagnosi molecolare delle forme genetiche → utiizzato nelle pochissime forme genetiche
conosciute, si tratta di una minima percentuale di pazienti che hanno un diabete da causa nota.
N.B. I più importanti indicatori diagnostici sono i primi due, utilizzati nella pratica clinica.
glucosio. Quando il glucosio è molto concentrato nel sangue periferico entra all’interno degli
eritrociti in grandi quantità e lega l’emoglobina.
N.B.: In qualche testo, ma anche in qualche esame di laboratorio, è possibile trovare il termine
emoglobina glicosilata anziché glicata, ma non è del tutto corretto – la glicosilazione è una reazione
che prevede l’intervento di un enzima e non è questo il caso. Il vantaggio di questo esame è la
possibilità di valutare qual è stata la glicemia media degli ultimi 30-40 giorni (tecnicamente gli ultimi
60 giorni, la metà di 120 giorni che è l’emivita dell’Hb).
• Indici di funzionalità renale à non è utilizzato per monitorare il metabolismo glucidico, ma per
valutare possibili complicanze come nefropatie o glomerulopatie. Gli indici di funzionalità renale
sono:
o microalbuminuria;
o BUN (blood urea nitrogen);
o creatininemia.
• Assetto lipidico (colesterolo totale e frazionato, trigliceridi) à è un altro fattore di rischio importante
da monitorare.
Albumina glicata
Tuttavia, in alcuni pazienti l’indicatore dell’emoglobina glicata può essere mal interpretato, per esempio nei
pazienti anemici. Per cui quando c’è un’alterazione qualitativa e quantitativa dell’Hb, prevalentemente nelle
malattie ematologiche, essendo questo parametro inattendibile, si ricorre all’albumina glicata. L’albumina è
una proteina plasmatica con un’emivita di 12-20 giorni, anch’essa si lega agli zuccheri circolanti quando questi
sono molto concentrati.
Il valore dell’albumina glicata si utilizza solo in alternativa all’Hb glicata nei pazienti con emopatie legate ai
globuli rossi perché la sua capacità retroattiva è molto minore (15- 20 giorni di emivita a fronte dei 120
dell’Hb). È possibile trovare anche il termine generale fruttosammine che sta a indicare un pool di proteine
plasmatiche, cui fa parte anche l’albumina, che legano il glucosio circolante.
219
Patologia clinica
Infatti [H+] è compresa tra 35 e 45 nmol/L: se si calcola la differenza tra le molarità degli altri ioni risulta
attorno a 106. Questa sua bassa concentrazione è spiegata dalla sua alta reattività ed è fondamentale che
essa rimanga costante.
Proprio per la sua bassa concentrazione, la sua presenza è espressa con la formula del pH:
In pH la lettera “p” sta per “logaritmo negativo in base 10” e “H” per “concentrazione degli ioni H+ espressa
in moli/L”.
Questa formula è stata introdotta perché l’espressione in moli/L comporta un elevato numero di zeri dopo
la virgola, quindi, per semplicità e praticità di calcolo è stata adottata la formula del pH.
Il professore esprime la sua opinione contraria riguardo questa convenzione: la formula del pH
comporterebbe semplicità di calcolo perché permette di avere un numero adimensionale e con solo due cifre
decimali. Tuttavia, la definizione stessa del logaritmo comporta delle complessità: “si dice logaritmo in base
A di un numero B l’esponente da dare ad A per ottenere B, con B che viene detto argomento del logaritmo”,
ad esempio il logaritmo in base 3 di 81 è 4 in quanto 4 è l’esponente da dare a 3 per ottenere 81. Questa non
è una semplificazione immediata. Vanno fatte inoltre due considerazioni:
1) utilizzando il pH, si sta valutando un parametro diverso rispetto alla concentrazione di ioni H+: quando
gli ioni H+ aumentano, il pH si riduce; quando gli ioni H+ diminuiscono, il pH aumenta. Esprimere una
grandezza in modo inverso alla quantità che si sta considerando non è d’aiuto;
220
Patologia clinica
221
Patologia clinica
di cariche positive da quel lato del compartimento, il che impatterà sul movimento di altre cariche
positive (come il calcio, ma soprattutto il potassio) e si creerà una diversa concentrazione di esse da
un lato e dall’altro del compartimento. Quindi il pH influenza i flussi transmembrana del potassio e
del calcio modificando la regolazione dell’attività cardiaca e neuromuscolare.
222
Patologia clinica
2) sistemi aperti (rigenerabili): di questo gruppo fa parte solo un sistema, il sistema bicarbonato/acido
carbonico, ma è il più importante che abbiamo per mantenere costante il pH. Esso ha la caratteristica
di essere rigenerabile, ovvero la base e l’acido possono essere rigenerati oppure eliminati in base alle
esigenze, poiché vengono scambiati con l’ambiente esterno.
Ci sono tre motivazioni per cui questo sistema tampone sovrasta tutti gli altri descritti:
1) è quantitativamente più rappresentato.
Infatti, il 65% di tutti i sistemi tampone sono
costituiti da bicarbonato/acido carbonico; il
sistema proteine/proteinati è invece il 35%,
tutti gli altri meno dell’1%;
2) è ubiquitario, ovvero si trova in quasi tutti i tessuti e compartimenti del nostro organismo, a
differenza degli altri sistemi tampone, che sono più o meno compartimentalizzati. Il sistema
bicarbonato/acido carbonico è invece in grado di funzionare in tutti i fluidi biologici;
223
Patologia clinica
Quindi il sistema polmonare, il sistema ematico e il sistema renale sono strettamente connessi e
interdipendenti nel loro ruolo di mantenimento del pH al valore di 7,4.
Equazione di Henderson-Hasselbach
I rapporti quantitativi tra le diverse componenti del sistema tampone sono regolati da questa equazione.
Essa stabilisce che, quando un sistema tampone è costituito da un acido debole e una base forte, come nel
caso di bicarbonato/acido carbonico (ma come anche la quasi totalità dei sistemi tampone del nostro
organismo), il pH corrisponde al logaritmo negativo della costante di dissociazione dell’acido costituente il
sistema tampone, sommato al logaritmo del rapporto tra la componente dissociata e la componente
indissociata:
[𝑨# ]
𝒑𝑯 = 𝒑𝑲 + 𝒍𝒐𝒈
[𝑨𝑯]
Tale equazione, riportata sul sistema bicarbonato (componente dissociata)/acido carbonico (componente
indissociata), diventa:
[𝑯𝑪𝑶# 𝟑]
𝒑𝑯 = 𝒑𝑲 + 𝒍𝒐𝒈
[𝑯𝟐 𝑪𝑶𝟑 ]
È quindi il rapporto tra bicarbonato e acido carbonico presente nel sangue periferico a determinare la
concentrazione degli ioni H+ (e di conseguenza il pH del sangue e dei fluidi biologici).
Per quanto riguarda la storia di questa equazione, essa fu inizialmente formulata da Henderson, che era un
biochimico, nel 1908, con un’espressione lievemente diversa: la concentrazione degli ioni H+ era uguale a K
(la costante di dissociazione) moltiplicata per il rapporto tra la concentrazione di acido carbonico e la
concentrazione di ione bicarbonato. Era quindi una formula molto più semplice.
Intervenne poi Hasselbach, che invece era un medico, proponendo di aggiungere il logaritmo negativo in
base 10 all’equazione per ottenere dei numeri più semplici, con meno zeri, arrivando nel 1916 a quella che è
la formulazione attuale dell’equazione. Questa formulazione permette sì di avere come risultato numeri con
meno zeri dopo la virgola, ma complica molto di più i calcoli.
Il professore sostiene che se si ritornasse all’equazione di Henderson, si faciliterebbe sia il lavoro di coloro
che stanno in laboratorio e sia il nostro approccio all’argomento.
224
Patologia clinica
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Patologia clinica
Riassorbimento di bicarbonato
Ha una denominazione fortemente sbagliata.
Prendendo in considerazione l’immagine, al centro si
trova la cellula del tubulo renale, a sinistra il
compartimento del sangue periferico e a destra il lume
del tubulo renale.
I primi ricercatori che studiarono questo processo
videro che, per compensare un’alterazione
dell’equilibrio acido-base, scompariva del bicarbonato
dal tubulo renale e ricompariva nel sangue, quindi
immaginavano che ci fosse un processo di
riassorbimento analogo a quello del glucosio:
pensavano che ci fosse una molecola carrier che
trasportasse il bicarbonato dal lume tubulare all’interno della cellula tubulare e poi dalla cellula al sangue
periferico. Pertanto, chiamarono il meccanismo “riassorbimento del bicarbonato”. Successivamente si scoprì
che il processo non è di questo tipo, ma il nome rimase sbagliato, quindi ancora oggi lo utilizziamo
impropriamente, poiché il processo non prevede nessun riassorbimento.
Il processo parte in realtà da un enzima che si trova all’interno delle cellule tubulari che prende il nome di
anidrasi carbonica: esso garantisce la costituzione di acido carbonico all’interno della cellula partendo da
CO2 e acqua come substrati. Questo non è presente in tutte le cellule, è una caratteristica delle cellule renali.
L’acido carbonico così formato all’interno della cellula si scompone in ioni H+ e ione bicarbonato: gli ioni H+
escono dalla cellula e giungono nel lume tubulare, attratti dal bicarbonato presente all’interno del lume
tubulare; lo ione bicarbonato invece va nel sangue periferico.
Gli ioni presenti nel sangue vengono tutti filtrati dal rene e poi gestiti a livello tubulare; questo vale anche
per lo ione bicarbonato, che quindi non va incontro a riassorbimento, ma una volta nel tubulo renale viene
neutralizzato dagli ioni H+ provenienti dalla scomposizione dell’acido carbonico all’interno delle cellule
tubulari. In altre parole, il motivo per cui i primi ricercatori pensavano che lo ione bicarbonato scomparisse
dal lume tubulare è che esso non si trova più nel lume come ione, ma viene legato dagli ioni H+ e neutralizzato,
mentre il motivo per cui “compare” nel sangue periferico è che proviene dalla scomposizione dell’acido
carbonico nelle cellule tubulari.
Tornando alla reazione iniziale, essa è regolata dalla presenza di ioni bicarbonato nella preurina: tanto più
bicarbonato sarà presente nel lume tubulare, tanto meno ce ne sarà nel sangue e tanto più quello nel tubulo
attrarrà ioni H+ fuori dalla cellula. In questo modo è stimolata l’azione dell’anidrasi carbonica e la successiva
dissociazione dell’acido carbonico.
226
Patologia clinica
Pensando a quale potrebbe essere il limite di questo sistema, intuitivamente viene da pensare che una volta
esaurito il bicarbonato nel tubulo renale (ovvero una volta che tutto quello disponibile è stato neutralizzato)
il sistema si blocchi, poiché la reazione catalizzata dall’anidrasi carbonica non è più stimolata.
In realtà non è così, poiché gli ioni H+ non sono assolutamente selettivi, quindi si legano benissimo a qualsiasi
ione negativo. Pertanto, una volta esaurito lo ione bicarbonato, sfruttano altri ioni negativi presenti nel lume
tubulare, in particolare lo ione fosfato 𝑯𝑷𝑶𝟐# 𝟒 .
Si arriva così al secondo meccanismo, in cui i primi ricercatori osservavano che, nonostante nel lume tubulare
il bicarbonato fosse esaurito, esso continuava a comparire nel sangue periferico: decisero di chiamare
pertanto questo processo, sempre impropriamente (ma bisogna ricordare che essi avevano a disposizione
strumenti molto limitati), “generazione di bicarbonato ex novo”.
Escrezione di acidi
Una volta che gli ioni negativi presenti nel lume tubulare
si sono esauriti, le cellule renali mettono in atto questo
meccanismo per produrre esse stesse degli ioni che
attraggano gli ioni H+ nel lume tubulare, in modo che
l’anidrasi carbonica possa continuare a funzionare.
Ad esempio, le cellule tubulari possono metabolizzare gli
aminoacidi, primo fra tutti la glutammina. La
glutammina viene scissa in acido α-chetoglutarico e
ammoniaca; l’ammoniaca esce per gradiente di
concentrazione verso il lume tubulare, dove può legare
gli ioni H+ producendo lo ione ammonio, che diventa poi
cloruro di ammonio.
227
Patologia clinica
Quindi sono le cellule tubulari stesse che producono l’accettore di protoni in grado di legare gli ioni H+ che
loro stesse producono.
Dosando l’escrezione di cloruro di ammonio nelle urine è possibile quantificare questo terzo sistema di
compenso.
Quando anche gli aminoacidi si sono esauriti, anche il meccanismo di compenso renale si esaurisce
definitivamente.
In conclusione, la capacità di compenso renale è molto più articolata, tuttavia va ricordato che questi
meccanismi non sono istantanei: il rene esprime la sua massima efficacia dopo giorni.
Questo è molto importante a livello clinico e laboratoristico, perché quando si legge un’emogasanalisi va
messa in conto la possibilità che il rene non abbia ancora messo in atto il suo sistema di compenso.
Considerare questo è fondamentale per interpretare correttamente quel tipo di esame.
228
Patologia clinica
conseguenza, anche pazienti con altre patologie possono avere un’alcalosi respiratoria non necessariamente
per una patologia polmonare.
La PaCO2 si riduce perché aumenta l’iperventilazione (anche lievemente superiore ai dati di riferimento).
Tanto più si riduce la bicarbonatemia (gli ioni bicarbonato nel tubulo vengono eliminati con le urine), tanto il
pH si avvicinerà ai valori di riferimento.
Per quanto riguarda gli esami di laboratorio, in caso di alcalosi respiratoria si osserva che:
• nel sangue arterioso:
§ il pH è aumentato (>7,44);
§ la PaCO2 è diminuita (<38 mmHg);
§ i bicarbonati sono ridotti seguendo sempre un’equazione di compenso che tiene conto del fatto
che la condizione si sia instaurata acutamente o cronicamente: per ogni riduzione di 10 mmHg
della PaCO2, la riduzione dei bicarbonati è in acuto di 2 mEq/L e in cronico di 5 mEq/L;
§ frequente ipokaliemia (con ioni H+ in uscita dalla cellula che causano l’ingresso di potassio).
• nelle urine:
§ il pH è alcalino;
§ i bicarbonati sono aumentati;
§ l’acidità titolabile è diminuita;
§ l’eliminazione di cloruro di ammonio è diminuita.
Per quanto riguarda gli esami di laboratorio, in caso di acidosi metabolica si osserva che:
• nel sangue arterioso:
§ il pH è diminuito (<7,36);
§ la PaCO2 è diminuita (<38 mmHg) a secondo del compenso: a ogni riduzione dei bicarbonati di 1
mEq/L corrisponde una riduzione della PaCO2 di 1,2 mmHg;
§ i bicarbonati sono diminuiti (23 mEq/L);
§ frequente iperkaliemia.
• nelle urine:
§ il pH è acido;
§ i bicarbonati sono diminuiti;
§ l’acidità titolabile è aumentata;
§ l’eliminazione di cloruro di ammonio è aumentata.
230
Patologia clinica
Per quanto riguarda gli esami di laboratorio, in caso di alcalosi respiratoria si osserva che:
• nel sangue arterioso:
§ il pH è aumentato (>7,44);
§ la PaCO2 è aumentata (>42 mmHg) di 0,5-0,7 mmHg (in media 0,6 mmHg) a ogni aumento dei
bicarbonati di 1 mEq/L;
§ i bicarbonati sono aumentati (>25 mEq/L);
§ frequente ipokaliemia.
• nelle urine:
§ il pH è alcalino
§ i bicarbonati sono aumentati;
§ l’acidità titolabile è diminuita;
§ l’eliminazione di cloruro di ammonio è diminuita.
P5.4 EMOGASANALISI
L’esame di laboratorio utilizzato per valutarne i disturbi all’equilibrio
acido-base si chiama emogasanalisi (EGA).
L’EGA si esegue su un prelievo di sangue arterioso13 eseguito
sull’arteria radiale con inclinazione dell’ago a 30 gradi, tenendo la
mano del paziente in lieve dorsiflessione; in alternativa si utilizzano
l’arteria femorale (profonda e poco comprimibile) o l’arteria brachiale
(molto innervata e quindi dolorosa). Questo tipo di prelievo è
impegnativo perché, a differenza delle vene, le arterie non si vedono.
Per identificare l’arteria radiale allora bisogna identificare il punto di
pulsazione di questa.
13
L’EGA è uno dei pochi esami che si esegue tramite il prelievo di sangue arterioso
231
Patologia clinica
Il campione deve essere analizzato immediatamente per evitare gli effetti del metabolismo cellulare che ne
modifica il pH; se il campione viene raffreddato in ghiaccio il risultato è comunque ritenuto attendibile anche
dopo 30-60 minuti dal momento del prelievo.
[“Immediatamente” è una parola incompatibile con la
diagnostica di laboratorio in quanto il dato di laboratorio
presuppone il prelievo, l’arrivo del materiale di
laboratorio, l’esecuzione del test, una validazione e il
ritorno dell’informazione. Tutto ciò chiaramente non è
possibile.
Un’ulteriore difficoltà è rappresentata dal fatto che non
tutti gli ospedali sono dotati di strumenti per il
raffreddamento delle provette in ghiaccio, questo significa
che possono esserci alterazioni del metabolismo
all’interno della provetta.]
L’emogasanalisi, dunque, deve uscire dalla routine di
laboratorio in quanto il medico di laboratorio non è in
grado di ottenere il risultato immediatamente. Per tale motivo, adesso è possibile trovare degli
emogasanalizzatori portatili appositi per l’emogasanalisi, almeno nei reparti di emergenza. Di conseguenza,
questo esame non si esegue più in laboratorio.
14
Non viene utilizzato il termine “normale” perché la normalità non è definibile.
232
Patologia clinica
conto della clinica, delle Aumento di 0,7 mmHg della anidride carbonica per ogni 55 mmHg
Alcalosi metabolica [HCO3-] mEq/L di aumento dei bicarbonati
condizioni del paziente, ecc.
15
Il professore aggiunge di non essere completamente d’accordo con questa definizione in quanto banalizza
l’argomento.
233
Patologia clinica
234
Patologia clinica
La paziente inoltre lamenta astenia e all’esame obiettivo appare disidratata con labbra secche e cute
anelastica, sollevabile in pliche. È inoltre ipotesa (95/65 mmHg), tachicardica (FCM 98 battiti/minuto) e
bradipnoica (FR 10 atti/min).
Da un paziente disidratato ci si aspetterebbe un’alcalosi metabolica. Questo perché un paziente disidratato
cerca di riassorbire più acqua possibile attraverso il sodio. Se il sodio entra, lo ione H+ deve uscire.
235
Patologia clinica
236
Patologia clinica
16
Per esami di primo livello si intende la presenza di un sospetto di alterata funzionalità epatica: si fanno questi esami
per avere un’idea di base per poi valutare l’ipotesi diagnostica tramite esami di secondo livello, i quali possono essere
di laboratorio o di altro tipo. “Di primo livello” indica anche che tali esami vengono svolti tutti e quattro
contemporaneamente, indipendentemente dal motivo per il quale si sta visitando il paziente: sia se si ha la certezza di
una malattia epatica da monitorare nel tempo, sia se si ha il sospetto di una malattia epatica, occorre prescriverli tutti
e quattro, attendere il risultato e iniziare a ragionare.
237
Patologia clinica
P6.2 BILIRUBINA
La bilirubina è il prodotto di degradazione dell’eme: la produzione giornaliera di bilirubina (250-350 mg)
deriva in massima parte (80-85%) dal catabolismo dell’emoglobina degli eritrociti invecchiati riconosciuti
dal sistema reticolo-endoteliale, presente principalmente nella milza, ma in maniera minore anche nel resto
del corpo. Un globulo rosso invecchiato [i globuli rossi vivono circa 120 giorni] sclerotizza e perde quella tipica
flessibilità della membrana facendo fatica a passare per i sinusoidi, quindi verrà riconosciuto e digerito da un
macrofago. Per il restante 15-20% la bilirubina deriva dall’eritropoiesi inefficace; una minima quota di
bilirubina deriva inoltre dal ricambio di proteine contenenti eme, quali mioglobina, citocromi e catalasi. Nel
fagocita del sistema reticolo-endoteliale l’emoglobina viene catabolizzata separando l’eme dalla globina,
dall’eme viene estratto il ferro dell’anello tetrapirrolico che viene consegnato alla transferrina e riportato al
midollo per la formazione di nuova emoglobina/globuli rossi. Quello che resta dell’eme viene catabolizzato a
bilirubina.
La bilirubina non coniugata è liposolubile e, pertanto, potenzialmente tossica; essa viene immessa in circolo
dalle cellule del sistema reticolo-endoteliale legata all’albumina (il carrier) e, in questa forma, raggiunge il
fegato. Nel fegato la bilirubina viene veicolata all’interno degli epatociti dove si lega a proteine citosoliche
(ligandina e proteina Z) che prevengono il suo rientro nel circolo ematico e la sua diffusione all’interno di
compartimenti epatocitari non idonei (si stacca una volta coniugata); viene quindi trasferita nel reticolo
endoplasmatico dove l’enzima uridina difosfato-glucuronil transferasi (UGT) provvede alla sua coniugazione
con acido glucuronico: la bilirubina coniugata è idrosolubile e, in questa forma, può essere eliminata con la
bile.
La bilirubina coniugata viene secreta dagli epatociti nei canalicoli biliari attraverso un processo ATP-
dipendente mediato da un trasportatore multispecifico di anioni organici chiamato MRP2 (Multidrug
Resistance-Associated Protein 2); giunta nel lume intestinale con la bile, la bilirubina viene degradata
(deconiugata e ridotta da parte di batterî anaerobî presenti nell’intestino) a urobilinogeno, prodotto piccolo,
incolore e idrosolubile. L’urobilinogeno ha tre diversi destini metabolici:
• la quota maggiore viene
ossidata a stercobilina e
urobilina ed eliminata con
le feci, alle quali
conferisce il caratteristico
colore bruno à questo
significa che ci si limita a
osservare il colore delle
feci: le feci poco colorate
(con poco urobilinogeno)
sono dette feci ipocoliche,
mentre le feci del tutto
decolorate (assenza di
urobilinogeno) sono dette
feci acoliche;
• una quota minore viene riassorbita a livello intestinale e ritorna al fegato tramite il circolo portale
(circolo entero-epatico dell’urobilinogeno), non è funzionale, è solo un riassorbimento passivo
insieme ad altre sostanze à dal fegato verrà poi escreta di nuovo ed eliminata;
• una piccola quota dell’urobilinogeno che viene riassorbito salta il filtro epatico. Esistono circoli
collaterali che fanno sì che non il 100% del sangue venga filtrato dal fegato. Una piccola quota di
sangue, che contiene urobilinogeno, lo salta entrando in circolo. L’urobilinogeno è una piccola
molecola che arrivata al rene viene filtrata ed eliminata con le urine à ciò che scappa al fegato viene
compensato dal rene. È, dunque, normale ritrovare tracce (ridotta quantità) di urobilinogeno nelle
urine.
238
Patologia clinica
Nella pratica di laboratorio non è possibile determinare la sola bilirubina indiretta; pertanto, si determina
prima la bilirubinemia diretta, poi si rende solubile la bilirubina libera e si determina la bilirubina totale, e
infine si calcola la bilirubina indiretta per sottrazione.
In un soggetto con una normale funzionalità epatica solitamente si ritrova nel sangue periferico solamente
una piccola quantità di bilirubina indiretta, quella che è stata prodotta dal sistema reticolo-endoteliale,
poiché quella diretta si trova nell’intestino.
Quindi, in condizioni fisiologiche, la bilirubina che si dosa nel sangue periferico è tutta nella forma indiretta,
ovvero è la bilirubina legata all’albumina che si sta dirigendo dai tessuti periferici al fegato. Mentre la
bilirubina diretta la dosiamo perché aumenta in condizioni patologiche, in condizioni fisiologiche non c’è
motivo di trovarla se non in tracce. Il valore di riferimento della bilirubina, che non deve superare in
condizioni fisiologiche, è 1 mg/dL.
P6.2.2 Ittero
Ittero è un termine clinico: si tratta dell’acquisizione di un colorito giallastro prima delle sclere (che si
colorano prima nella parte periferica, quindi può essere utile invitare il paziente a guardare verso l’alto;
condizione definita subittero), poi della cute e delle mucose, conseguente a un eccesso di bilirubina
(condizione definita ittero franco). Quindi il termine ittero si utilizza per l’esame obiettivo. In laboratorio si
parla di ittero da iperbilirubinemia, ovvero aumento dei valori di bilirubinemia.
Le manifestazioni cliniche iniziano a vedersi quando i valori di bilirubina superano i 2,5 mg/dL, ma si parla di
iperbilirubinemia già oltre 1 mg/dL (quindi già a 1,2 mg/dL).
La classificazione di laboratorio degli itteri li divide in base al rapporto tra i due tipi di bilirubina:
• itteri da iperbilirubinemia prevalentemente non coniugata – in cui l’80-85% della bilirubina sierica
è non coniugata à stessa condizione che si ha in buono stato di salute, ma i valori sono più alti;
• itteri da iperbilirubinemia combinata – la bilirubina è sia diretta che indiretta e quella diretta supera
il 50% (forma che normalmente non è presente).
239
Patologia clinica
questa forma di ittero sono la sferocitosi ereditaria, l’anemia falciforme e l’anemia da deficit
enzimatici (G6PD);
- eritropoiesi inefficace: alcune anemie (principalmente la talassemia maior e le anemie
francamente megaloblastiche) sono caratterizzate da un significativo aumento
dell’eritropoiesi inefficace, che può arrivare a produrre fino al 70% della bilirubina totale;
- degradazione dell’eme in raccolte extravascolari di eritrociti, quali estesi infarti tessutali
(soprattutto polmonari), emorragie interne (dalla rottura di un aneurisma dell’aorta allo
stillicidio da errate manovre per il posizionamento di un catetere) o ematomi di grandi
dimensioni.
Il quadro di laboratorio di un ittero emolitico è caratterizzato da: feci normali (che contengono più
urobilinogeno, ma non si coglie questa differenza), bilirubina nel sangue periferico aumentata, urobilinogeno
nelle urine aumentato in maniera significativa.
240
Patologia clinica
tutto prima della nascita). Dopo il parto, il neonato si autonomizza per questa funzione e gli
enzimi hanno bisogno di un po’ di tempo per essere attivati e quindi occorre da qualche
giorno fino a qualche settimana affinché la glucuronil-transferasi epatica arrivi a regime. Nel
frattempo, si accumula un po’ di bilirubina indiretta, che però nel giro di 15 giorni si riduce e
torna ai valori di riferimento. Quando i livelli di bilirubina superano i 20 mg/dL si può avere
l’ittero nucleare, causato dal passaggio di bilirubina attraverso una immatura barriera
ematoencefalica e precipitazione della stessa nei nuclei encefalici della base, ricchi di
componenti lipidiche, e in altre aree cerebrali à si viene a causare danno cerebrale che
dev’essere evitato. La “maturazione” enzimatica può essere stimolata dalla
somministrazione di barbiturici al neonato o alla madre (come si faceva in passato, pratica
ormai abbandonata perché causa parecchi effetti collaterali). Nei pazienti con valori
particolarmente alti di bilirubinemia si ricorre alla fototerapia, basata sul principio che,
sottoposta a intensa illuminazione con luce bianca o azzurra, la bilirubina si trasforma in una
serie di isomeri idrosolubili (fotoisomerizzazione) che vengono eliminati con la bile anche
senza coniugazione direttamente dal neonato.
- Sindrome di Gilbert: è una malattia autosomica recessiva con prevalenza relativamente alta,
intorno all’8%, e incidenza maggiore nel sesso maschile. È causata da una mutazione del gene
UGT1 (uridina difosfato glucuronil transferasi 1) che riduce l’attività transferasica dal 65 al
90%, mentre altre forme sono dovute a un deficit di ligandina. In questa sindrome i valori di
bilirubina sono solitamente tra 1,2 e 3 mg/dL e solo raramente superano i 5 mg/dL, restando
comunque sempre inferiori ai 6 mg/dL per tutta la vita. Quindi è una condizione benigna, ma
cronica, che si manifesta raramente prima del secondo decennio di vita, spesso in maniera
occasionale. L’ittero è asintomatico e l’iperbilirubinemia è accentuata da stress, malattie
infettive, febbre, sforzo fisico, ecc. La diagnosi è solitamente fatta per esclusione e
coadiuvata dall’anamnesi familiare.
- Sindrome di Crigler-Najjar I: condizione autosomica recessiva causata da una mutazione del
gene UGT1 che determina la completa assenza di attività glicuronil transferasica.
L’iperbilirubinemia è elevata (20-50 mg/dL); si presenta nel neonato ed è permanente. Prima
della fototerapia, la malattia portava alla morte nei primi anni di vita per encefalopatia da
bilirubina; con l’avvento della fototerapia e del trapianto di fegato la prognosi di questi
pazienti è notevolmente migliorata. In questo caso il trattamento con il fenobarbital non ha
effetto.
- Sindrome di Crigler-Najjar II: malattia autosomica prevalentemente recessiva causata da
una mutazione del gene UGT1 che determina un deficit enzimatico severo ma non assoluto.
Il quadro clinico può variare da paziente a paziente. L’encefalopatia da bilirubina è rara.
Solitamente l’ittero può rimanere latente fino all’adolescenza, con valori di bilirubinemia tra
6 e 20 mg/dL. La terapia è con fenobarbital, che riduce la bilirubinemia del 25%.
Per distinguere i varî tipi di ittero non è necessario analizzare quali enzimi sono deficitarî o altro, basta
misurare la bilirubinemia e, valutata questa, si può fare un’ipotesi diagnostica e procedere con la terapia. In
questi casi non c’è bilirubinuria. In queste situazioni l’urobilinogeno è aumentato nell’ittero ematologico, ma
non è aumentato nelle forme in cui sono alterati gli enzimi.
Questi sono i valori di riferimento:
• sotto i 6 mg/dL à sindrome di Gilbert;
• tra 6 e 20 mg/dL à sindrome di Crigler-Najjar di tipo II;
• sopra i 20 mg/dL à sindrome di Crigler-Najjar di tipo I.
241
Patologia clinica
242
Patologia clinica
In questo caso la bilirubina coniugata viene eliminata dal polo giusto perché l’epatocita non è
danneggiato, ma quando incontra l’ostruzione torna indietro fino a refluire nel sangue. Anche in
questo caso si troveranno sia la bilirubina diretta che l’indiretta nel sangue periferico e le urine
saranno ipercromiche.
243
Patologia clinica
Se l’ostruzione delle vie biliari è completa non è prodotto urobilinogeno, quindi le feci saranno
totalmente acoliche; se l’ostruzione è parziale la sintomatologia è molto simile a quella dell’ittero
epatocellulare. In entrambe le condizioni la quota di bilirubina diretta nel circolo periferico sarà
proporzionale all’intensità del danno.
Il laboratorio, attraverso la bilirubina, non discrimina l’ittero ostruttivo ed epatocellulare, perciò
entrano in gioco gli enzimi sierici.
La sensibilità della valutazione è molto elevata, per cui i valori di riferimento sono bassissimi, vicini allo zero:
è facile osservare una variazione.
Il rapporto AST/ALT è importante, ma va valutato con cautela perché deve però essere sempre confermato
da altre analisi. Significato generale:
• £ 1 è ragionevole pensare a un danno di origine virale;
• > 2 è indicatore di epatite alcolica.
244
Patologia clinica
Le AST sono meno specifiche: sono presenti sia negli epatociti che in molte altre cellule e hanno due
localizzazioni principali: citoplasma e mitocondri. L’ALT invece è più epatospecifica.
In caso di danno aumentano le epatospecifiche, quindi il denominatore del rapporto (ALT); il rapporto tende
a essere inferiore a 1. Delle AST si libera in circolo solo quella citoplasmatica. Con il perdurare del danno inizia
ad uscire anche la forma mitocondriale, che ha maggiore emivita; quindi, il rapporto tende ad aumentare.
Diventa superiore a 2 in caso di abuso di alcool perché esso non ha un’azione inducente, ma ha un’azione più
tossica e diretta sui mitocondrî, e quindi distruggendo i mitocondrî libera la parte mitocondriale del
numeratore della frazione. Con cautela si può interpretare questo rapporto: quando è minore di uno, è
ragionevole pensare a un’epatite nella fase acuta; quando si inverte e supera il 2, si può pensare che sia un
danno da alcol.
Grazie a questi valori è possibile differenziare tra loro le due forme di ittero viste in precedenza
(epatocellulare e ostruttivo).
La bilirubina è dunque importante per differenziare le forme di ittero preepatiche (cioè le forme di ittero da
iperbilirubinemia prevalentemente non coniugata) [il prof contesta la nomenclatura perché manca la
bilirubina transferasi che è intraepatica] dalle due forme di iperbilirubinemia mista: per queste ultime due
forme però si necessitano i valori di transaminasi, che aumentano in caso di danno epatocellulare, e di
fosfatasi alcalina, indice di forme di tipo ostruttivo.
245
Patologia clinica
remote negative. Intanto all’esame obiettivo non risulta ittero. Prima sapevo che la bilirubina fosse
aumentata, qui invece devo andare ad indagare. Analizziamo:
• VES: dall’emocromo risulta aumentata in maniera significativa (aumenta con l’età, ma non è
compatibile in questo caso con una condizione fisiologica);
• Bilirubina: risulta un valore di bilirubina totale di 1,63 dunque ci troviamo di fronte ad un
subittero. Osserviamo una iperbilirubinemia combinata;
• Enzimi: la fosfatasi alcalina e le γ-GT sono aumentate in maniera significativa, mentre le
transaminasi variano poco. Sospetto dunque che il paziente abbia una ostruzione. Un altro
elemento che mi fa arrivare a questa conclusione è il valore del colesterolo (la bile, infatti,
contiene questa sostanza, dunque in seguito ad una ostruzione delle vie biliari possiamo
notare ipercolesterolemia);
• Elettroforesi delle proteine sieriche: il rapporto albumina/globuline è lievemente ridotto,
tuttavia le γ-globuline risultano normali quindi non è presente un’alterazione da ittero
epatocellulare. Si riduce un pochino l’albumina, ma aumentano le β- e soprattutto le α1-
globuline.
In un paziente con queste caratteristiche (subittero da ostruzione, VES aumentata, indici di flogosi aumentati,
calo ponderale) posso pensare, come causa dell’ostruzione, ad una neoplasia. L’ecografia (esame di secondo
livello) dell’addome conferma una colestasi da ostruzione delle vie biliari extra-epatiche, mentre ulteriori
esami radiografici attribuiscono ciò alla presenza di un colangiocarcinoma extra-epatico.
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Patologia clinica
Gli esami di laboratorio che si hanno a disposizione per valutare la funzionalità renale sono quattro:
1. Esame delle urine:
a) esame delle caratteristiche fisiche;
b) esame delle caratteristiche chimiche;
c) esame microscopico del sedimento urinario.
2. Determinazione della concentrazione ematica di composti azotati non proteici:
a) uremia (BUN: Blood Urea Nitrogen);
b) creatininemia;
c) uricemia.
3. Clearance renali:
a) clearance dell’inulina e della creatinina per la determinazione del filtrato glomerulare;
b) clearance del PAI per la determinazione della portata renale plasmatica.
4. Prove funzionali:
a) prova di diluizione;
b) prova di concentrazione.
Di seguito delle raccomandazioni su prelievo e conservazione delle urine (in realtà non sono molto seguite
né troppo raccomandate):
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Patologia clinica
- si prendono le urine della prima minzione della mattina perché sono più concentrate, aiutando
l’aspetto analitico;
- accurata igiene delle mani e dei genitali prima del prelievo, senza però usare saponi antisettici perché
potrebbero eliminare batterî;
- raccogliere il mitto intermedio, perché il primo mitto potrebbe essere contaminato;
- nelle donne fertili evitare il periodo mestruale, in quanto ci potrebbe essere una contaminazione di
globuli rossi;
- raccolta delle urine nei lattanti: esistono device appositi con un adesivo che dovrebbero garantire il
prelievo il più possibile sterile;
- dovrebbero essere valutate immediatamente dopo il prelievo, anche se ciò non è sempre possibile,
o al massimo entro 2 ore mantenendo il campione conservato nel frigorifero.
Colore
Il colore dipende sempre dalla
presenza di un analita, quindi è cause di anomale colorazioni dell’urina
l’esame chimico che, individuando gli colore cause patologiche cause non patologiche
analiti, fornirà la spiegazione del rosso - emoglobina - farmaci
perché le urine hanno acquisito un - mioglobina - coloranti
- porfirine - bietole
determinato colore. Inoltre, anche in - rabarbaro
condizioni non patologiche, come nel arancio - pigmenti biliari - farmaci contro infezioni
caso dell’assunzione di farmaci, il vie urinarie
giallo intenso - urina molto - carote
colore è alterato. concentrata - fenacetina
Teoricamente dovrebbe essere - nitrofurantoina
giallo/giallo-oro/giallo-paglierino. giallo chiaro - diabete - nessuna
verde - biliverdina - vitamine
- batteri - farmaci psicoattivi
(pseudomonas) - diuretici
Aspetto
marrone - mioglobina - nitrofurani
Le urine devono essere limpide. In - pigmenti biliari - alcuni sulfamidici
alternativa possono essere torbide o blu - nessuna - diuretici
presentare schiuma. Una schiuma
biancastra è associata alla presenza di proteine che riducono la tensione superficiale, mentre la schiuma
giallo-verdastra o arancione scuro è legata alla presenza di pigmenti bilirubinici.
249
Patologia clinica
Peso specifico
Il peso specifico di una sostanza è il rapporto tra il peso in grammi della sostanza (urina raccolta) e il peso di
un uguale volume di acqua distillata a 4°C. In condizioni normali oscilla tra 1,014 e 1,026 [leggendosi tuttavia
millequattordici e milleventisei per semplificare, evitando la virgola], ovvero è simile a quello dell’acqua.
Se il peso specifico scende sotto 1,014 si parla di ipostenuria, situazione che si verifica quando il rene perde,
in parte, la sua capacità di concentrare e diluire le urine; quando i reni perdono completamente questa
capacità, il peso specifico delle urine rimane costantemente uguale a quello del filtrato glomerulare, cioè
intorno a 1,007 (isostenuria). Entrambi i termini sono riferiti a una ridotta capacità di filtrare le urine.
Nelle poliurie le urine hanno solitamente basso peso specifico (con l’eccezione importante del diabete),
mentre nelle oligurie il peso specifico delle urine è solitamente aumentato.
Siccome la struttura che concentra le urine è il tubulo renale, il peso specifico si può considerare come un
indicatore (aspecifico in quanto ne esistono di più specifici) della funzionalità tubulare.
Volume
Il volume urinario viene solitamente valutato a letto del paziente, soprattutto se ricoverato e cateterizzato.
Il volume delle urine, che viene valutato raccogliendo le urine nelle 24 ore, oscilla tra 800 e 1800 mL (circa
1,5-2 L al giorno). In generale la quantità di urina prodotta nell’arco della giornata non è costante: la notte
viene prodotta meno urina rispetto al giorno, con un rapporto giorno/notte di 2/1, consentendoci di riposare
per un lungo periodo di tempo, ma ci porta anche ad avere al risveglio un’urina più concentrata (motivo per
cui nell’esame delle urine viene utilizzata quella della prima minzione).
• Arresto completo della produzione di urina à anuria;
• < 800 mL à oliguria;
• > 2000 mL à poliuria (molto frequente in caso di diabete).
La diminuzione del volume urinario (oliguria) si osserva come conseguenza di una diminuita filtrazione
glomerulare che può essere dovuta a una alterazione anatomica dei glomeruli o a una riduzione del flusso
ematico. L’arresto completo della formazione di urina (anuria) si può verificare nella insufficienza renale
acuta in conseguenza di gravi lesioni tubulari o per ostruzione delle vie urinarie. L’aumento del volume
urinario (poliuria) si osserva in varie affezioni renali nelle quali il rene ha perso la capacità di concentrare i
soluti entro un certo limite.
Odore
Non viene refertato, ma può essere utile soprattutto quando si apre la stanza di un paziente che ha dormito
e non ha cambiato aria. L’odore delle urine viene definito lievemente aromatico. In condizioni di infezione
delle vie escretrici l’odore può acquisire una venatura fetida. La presenza di corpi chetonici fornisce alle urine
un odore fruttato, caratteristico quindi di pazienti affetti da diabete di tipo 1 o pazienti in digiuno prolungato
(energia prodotta a partire da substrati lipidici, porta all’eccessiva produzione di corpi chetonici). L’odore
ammoniacale è invece indice di urine mal conservate, quindi non più adatte alla valutazione analitica.
250
Patologia clinica
• nitriti.
Oltre a questi, si può richiedere qualunque tipo di analita nelle urine, si può richiedere per esempio la
concentrazione di un ormone o un metabolita. L’esame standard di default prevede l’esecuzione e la
valutazione degli analiti elencati sopra.
pH
È debolmente acido, con un valore medio intorno al 6 (varia fisiologicamente da 4,5 a 8, oscillando tra 5,5 e
6,5). È un’espressione dei sistemi di compenso che cercano di mantenere costante il pH del sangue:
quest’ultimo è mantenuto a 7,4 proprio grazie alle variazioni del pH urinario. Per mantenerlo costante deve
buttare fuori più acidi o più basi a seconda delle situazioni, quindi è assolutamente normale trovare questa
variabilità. Il pH urinario pari a 6 indica che l’organismo produce più sostanze acide che basiche e il
metabolismo è a pH acido, non neutro. Quindi il pH urinario risulta leggermente acido per mantenere basico
o neutro il pH ematico. La valutazione del pH è fondamentale per studiare le alterazioni dell’equilibrio acido-
base; va sempre valutato in un contesto generale di equilibrio acido-base. Costituisce la parte
complementare dell’emogasanalisi. Vi sono anche condizioni alimentari che possono modificare
transitoriamente il pH urinario.
L’acidità urinaria aumenta in caso di digiuno, se si segue una dieta particolarmente ricca di cibi carnei e di
grassi, in caso di prolungato esercizio muscolare o in seguito all’assunzione di farmaci acidificanti; viceversa,
la reazione delle urine sarà alcalina se si segue una dieta vegetariana, se si assumono farmaci alcalinizzanti o
nel caso di ritenzione urinaria con urine che ristagnano a lungo nella vescica (ipertrofia prostatica).
Proteine
La loro cospicua presenza è tra le poche caratteristiche associate quasi esclusivamente alla funzionalità
renale. La filtrazione a livello glomerulare si fonda sulle dimensioni: in particolare, le proteine di piccole
dimensioni filtrano liberamente e andranno a far parte della preurina, mentre le molecole di dimensioni
maggiori non vengono filtrate, ma escono tramite l’arteriola efferente, per cui ritrovare proteine di grosse
dimensioni nelle urine può essere associato a un danno alla barriera di filtrazione. Il limite di filtrazione è
definito dall’albumina: questa è la prima proteina che per dimensioni non viene filtrata e che quindi non si
trova nelle urine se non in tracce (in base all’impatto sterico che ha quel glomerulo, cioè le molecole di
albumina che arrivano perpendicolarmente al filtro passano, quelle con inclinazione minore non passano). In
generale comunque, come visto per il glucosio, l’organismo non si può permettere di perdere e sprecare
251
Patologia clinica
proteine, quindi nelle urine si riscontrano solo tracce (tra 40 e 80 mg al giorno, comunque non più di 150 mg
in condizioni fisiologiche) perché la maggior parte di queste viene riassorbita a livello tubulare: per cui, le
grandi proteine non vengono nemmeno filtrate, invece le piccole proteine con una dimensione inferiore ai
69000 Da vengono filtrate, ma vengono quasi completamente riassorbite; a livello urinario ne resta una
quantità minima (si parla di proteinuria fisiologica).
Quando la quantità di proteine filtrate supera i 150 mg, si parla di proteinuria.
Le cause possono essere diverse:
• alterazione glomerulare à se c’è un danno glomerulare la prima proteina ad essere filtrata è
l’albumina, quindi l’albuminuria è un indice sensibile di glomerulopatia;
• danno tubulare à in questo caso le proteine non vengono più riassorbite, quindi si ha proteinuria.
Per capire se c’è stato un danno glomerulare o un danno tubulare bisogna valutare il peso molecolare delle
proteine. Quindi l’analisi qualitativa della proteinuria aiuta a capire se essa è di origine glomerulare (proteine
di grandi dimensioni, dall’albumina in su) o tubulare (proteine di piccole dimensioni).
Emoglobina
È una molecola di dimensioni tali da passare il filtro glomerulare, tuttavia normalmente ciò non avviene in
quanto l’emoglobina è contenuta all’interno dei globuli rossi e anche quando i globuli rossi vengono fagocitati
dalle cellule del sistema del reticolo endoteliale (emolisi extravascolare), l’emoglobina viene trasformata in
bilirubina, ma queste reazioni non si svolgono a livello ematico per cui libera nel plasma non dovrebbe
esserci.
Essa si troverà libera nel sangue periferico solo in seguito a emolisi intravascolare (lisi dei globuli rossi in
circolo), per cui ritrovare emoglobina nelle urine in assenza di ematuria significa essere in condizioni di
anemia; l’anemia che ha determinato l’emolisi inoltre, viene aggravata dal fatto che l’emoglobina riesce a
passare la barriera di filtrazione glomerulare, viene eliminata, portando di conseguenza all’eliminazione del
ferro associato, necessario per la biosintesi.
Nel nostro organismo, tuttavia, esiste un sistema che ha il ruolo di evitare la dispersione dell’emoglobina con
le urine, basato sull’aptoglobina, una proteina della fase acuta in grado di legare l’emoglobina libera ed
evitare che quest’ultima venga ultrafiltrata dal glomerulo. Qualora tutta l’aptoglobina fosse impiegata
nell’attività di recupero ([aptoglobina] = 100-150 mg/dL) e la condizione di emolisi persistesse, allora avremo
emoglobinuria; pertanto, il riscontro di emoglobina nelle urine è indice di una anemia emolitica grave che
ha superato la capacità di recupero dell’aptoglobina.
[Da notare come si possa avere emoglobinuria anche nei casi di sanguinamento delle vie urinarie, che prevede
l’eliminazione di globuli rossi con le urine; in questa situazione gli eritrociti si trovano in una condizione di
osmolarità diversa rispetto a quella del sangue periferico e frequentemente vanno incontro a lisi. In questo
caso l’emoglobinuria si associa ai globuli rossi lisati nelle vie urinarie e non ad anemia emolitica.
Concludendo, l’emoglobinuria va interpretata come indice di una crisi emolitica in assenza di ematuria, se
presente ematuria va associata a emorragia delle vie urinarie.]
La ricerca dell’emoglobina nelle urine è quindi un test che non serve per valutare la funzionalità renale, ma
è utile per valutare eventuali condizioni anemiche patologiche.
Bilirubina e urobilinogeno
Si valutano per studiare il metabolismo della bilirubina, quindi eventualmente alterazioni della funzionalità
epatica. È fisiologico ritrovare tracce di urobilinogeno nelle urine e la bilirubina che si ritrova è solo quella
diretta (coniugata). Queste due considerazioni aiutano ad abbinare l’esame delle urine con l’esame del
sangue e col colore delle feci.
La bilirubina non coniugata (indiretta) è insolubile in acqua e non passa il filtro glomerulare, mentre la
bilirubina coniugata (diretta) è idrosolubile e può quindi passare il filtro glomerulare; in condizioni normali
la bilirubina circolante è per la maggior parte nella forma non coniugata e, pertanto, non si riscontra nelle
urine. Quando aumenta la bilirubina diretta (itteri epatocellulare e ostruttivo) si avrà bilirubinemia, urine di
colore scuro e a seconda dell’entità del danno si potranno avere feci acoliche o ipocoliche. Invece negli itteri
in cui aumenta la bilirubina indiretta (ittero emolitico o associato a deficit di coniugazione con l’acido
glucuronico), nelle urine non si trova perché non passa il filtro glomerulare, nemmeno aumentando la
concentrazione di molte volte.
L’urobilinogeno si forma nell’intestino per riduzione della bilirubina libera: per lo più viene eliminato con le
feci, mentre una piccola quota viene riassorbita ed eliminata poi con la bile e, in minima parte, attraverso il
rene (0,5-1,5 mg/24 ore); pertanto, in condizioni normali l’urobilinogeno è presente nelle urine solo in tracce.
Nitriti
Sono molecole che l’organismo fisiologicamente non produce, per cui la loro presenza nelle urine è indice
di un’infezione delle vie urinarie. Il nostro metabolismo, infatti, fisiologicamente produce nitrati (partendo
dalle verdure), che verranno quindi convertiti in nitriti da eventuali batterî (Escherichia coli, Aerobacter,
Proteus, Klebsiella, Pseudomonas, Enterococci, Staphylococcii ed altre) presenti a livello delle vie urinarie.
253
Patologia clinica
È importante ricordare che la positività al test è affidabile e sempre associata a un’infezione in atto, mentre
la negatività non consente di escludere la presenza di infezioni delle vie urinarie.
Si tratta quindi di un indicatore che non dà mai falsi positivi, ma può dare falsi negativi in caso di:
o l’esistenza di batterî incapaci di ridurre i nitrati in nitriti (si tratta di pochissimi batterî);
o elevato flusso urinario che non dà il tempo ai batterî di produrre una quantità tale di nitriti
determinabile laboratoristicamente.
Le esterasi leucocitarie sono enzimi contenuti nei granuli azzurrofili dei granulociti neutrofili. Quando c’è
un’infezione da queste cellule vengono liberate le esterasi leucocitarie, le quali sono quindi un ottimo
indicatore indiretto di infezione delle vie urinarie.
La caratteristica principale dell’esame delle urine è la sua aspecificità. Per cui se si ha un sospetto di
insufficienza renale non si parte dall’esame delle urine perché troppo generico.
Cristalli
I cristalli sono delle concrezioni che si formano nelle urine,
influenzate sia dalla dieta che dal pH. In ambiente acido
tendono a formarsi cristalli di acido urico, urati amorfi e
ossalato di calcio. In ambiente basico i cristalli più frequenti
sono i cristalli di fosfato triplo (ammonio, magnesio e
calcio) e fosfati amorfi.
È importante ricordare che la loro presenza nelle urine è
fisiologica e non ha nessun significato patologico, infatti
molto spesso non vengono nemmeno citati nei referti
(trovare o non trovare un cristallo non ha nessun
significato dal punto di vista clinico).
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Patologia clinica
Cilindri
I cilindri sono formazioni che riproducono a stampo il lume dei tubuli distali dei dotti collettori, quindi sono
proteine che precipitano nel lume tubulare, o perché sono particolarmente concentrate (e quindi quando c’è
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Patologia clinica
danno glomerulare), o perché c’è una stasi della preurina in particolari condizioni di pH. Si distinguono in
cilindri ialini (amorfi), costituiti solo dalla matrice proteica, e cilindri cellulari, a seconda delle cellule che
contengono (epiteliali, ematiche, leucocitarie). I cilindri granulosi sono costituiti da proteine e detriti di
emazie o cristalli. Per l’osservazione si mette una goccia di urina, si sceglie a piacere un colorante e si osserva
il campione. Nel sedimento urinario si possono osservare cristalli amorfi e sporcizia (perché non si è nelle
condizioni dei preparati istologici); si possono vedere cilindri contenenti cellule polimorfonucleate, o cilindri
ematici contenenti globuli rossi. Bisogna vedere il motivo per cui le proteine sono precipitate (danno
glomerulare, stasi di urina, pH alterato, ittero...) guardando quindi la causa che ha determinato la formazione
del cilindro. La loro natura molecolare indica che sono reperti frequenti in caso di patologie glomerulari:
l’alta concentrazione proteica nell’ultrafiltrato, unita a disidratazione, scarso flusso urinario e particolari
valori di pH, può favorirne infatti la formazione.
Muco
I cilindroidi sono invece cilindri costituiti da muco. Il muco nelle vie urinarie ha lo stesso significato del muco
nelle vie respiratorie. È l’espressione di uno stimolo irritativo; quando c’è una infiammazione dell’albero delle
vie respiratorie le cellule caliciformi mucipare producono muco a scopo protettivo. Lo stesso avviene nelle
vie urinarie. I cilindroidi di muco presenti nel sedimento urinario indicano un’irritazione a carico delle vie
urinarie, che deve essere indagata.
Globuli rossi
È importante ricordare la differenza tra emoglobinuria ed ematuria: la prima è presenza nelle urine di
emoglobina che può indicare patologie emolitiche.
L’elemento su cui riporre maggiormente l’attenzione, perché talvolta viene non adeguatamente considerato,
è l’ematuria. L’ematuria indica la presenza di sangue nelle urine, in particolare globuli rossi, dovuta a
emorragia.
L’ematuria macroscopica è quella che conferisce alle urine il colore rosso, quella che si vede e che preoccupa
il paziente. Il colore delle urine (e delle feci) ha un impatto importante, solitamente viene notificato subito al
medico di base.
L’ematuria microscopica invece si rileva solo al microscopio ed è divisa in macroematuria o microematuria
a seconda del numero di globuli rossi identificati al microscopio.
Questa è una raffinata classificazione quantitativa: macroscopica e microscopica, macroematuria (globuli
rossi distribuiti a tappeto) e microematuria (basso numero di globuli rossi). È importante tenere conto che
questa classificazione non ha significato qualitativo poiché l’ematuria è potenzialmente pericolosa
indipendentemente dall’entità. Anzi, paradossalmente una macroematuria può essere espressione di uno
sforzo fisico, di una perdita di massa particolarmente impegnativa o essere conseguenza di un trauma, quindi
essere transitoria. Ciò che può preoccupare di più è una microematuria consistente; anche pochi globuli rossi
nel campo microscopico (visti dall’operatore o valutati automaticamente), se persistenti e quindi presenti
256
Patologia clinica
nell’esame delle urine, devono preoccupare. Non si può dimettere un paziente con ematuria fintanto che
non si è capita la causa e auspicabilmente si è risolto il problema. Quindi è necessario porre attenzione e
adottare un percorso diagnostico efficace, utilizzando diagnostica per immagini, altri esami di laboratorio,
ecc. Ci può essere per esempio una neoplasia del tratto urinario in cui i vasi danno un piccolo sanguinamento,
che quindi va identificata e ne va specificata la localizzazione. Tra tutti gli esami delle urine quello nella pratica
clinica che talvolta viene sottovalutato è questo, anche se non si dovrebbe, soprattutto se si tratta di una
microematuria. Può aiutare a diagnosticare precocemente una patologia che potrà dare segni di sé dopo
qualche anno, in uno stadio più avanzato.
In caso di ematuria classica il globulo rosso si presenta non colorato e quindi traslucente, questi raramente
si presentano con la loro tipica forma a disco biconcavo, ma molto più spesso sono rigonfî (urine ipotoniche)
o disidratati (urine ipertoniche): la loro morfologia dipende quindi dall’osmolarità dell’urina.
L’ematuria ha questa caratteristica: è molto sensibile, ma poco specifica. Molto sensibile perché si è in grado
di identificare anche una bassa concentrazione di globuli rossi nelle urine; poco specifica perché in realtà non
dice nulla di più se non che ci potrebbe essere un’emorragia nelle vie urinarie. Ci può essere una molteplicità
di cause che devono essere indagate che possono essere alla base di una potenziale ematuria.
Due condizioni invece che possono rappresentare una contaminazione: sono le mestruazioni (l’ematuria in
una donna durante il periodo mestruale non deve preoccupare, per evitarla si possono fare le analisi al di
fuori di questo periodo) oppure un paziente che è stato cateterizzato (anche dopo 15-20 giorni nel paziente
ci possono essere tracce di globuli rossi); quindi in questi due casi l’ematuria non deve preoccupare;
dev’essere ripetuto l’esame delle urine per delle conferme, per vedere se si tratta di ematurie da
contaminazione.
In teoria le urine non dovrebbero contenere eritrociti; tuttavia, qualche globulo rosso può essere talvolta
riscontrato anche nelle urine di soggetti in buono stato di salute. Le principali cause di ematuria sono
rappresentate da: glomerulopatie, tumori delle vie urinarie, traumi renali, litiasi delle vie urinarie, infarti
renali, necrosi tubulare acuta, infezioni delle alte e basse vie urinarie e stress fisici.
257
Patologia clinica
Il colore del preparato non dà nessuna indicazione, dipende semplicemente dal colorante scelto
dall’operatore che compie l’analisi.
Primo esempio
Esame delle urine standard,
in cui sono riportati colore
e aspetto (refertati in
maniera discorsiva). Sono
riportati anche tutti gli altri
indicatori (glucosio,
proteine, emoglobina,
corpi chetonici, bilirubina,
urobilinogeno, nitriti, peso
specifico, leucociti, cellule
epiteliali). Nella sezione
“metodo” può essere
riportata la dicitura
citometria a flusso: questo indica che il sedimento viene letto da una macchina, un citometro a flusso. Non
ci sarà una valutazione discorsiva, ma si troverà il numero di leucociti e cellule epiteliali contati dalla
macchina. Questa è una fase di transizione: in qualche laboratorio si guarda ancora al microscopio il
sedimento, mentre in altri si usano macchine; questa seconda componente è economicamente più
vantaggiosa e probabilmente in futuro sarà tutto automatizzato. La situazione riportata in questo esempio è
di piena normalità. L’esame delle urine non richiede grandi capacità interpretative; è facile capire se c’è
qualcosa che non va guardando i valori di riferimento. Tutti gli indicatori devono essere assenti; si può solo
trovare qualche traccia di urobilinogeno. Il pH deve rientrare nell’intervallo di valori sopracitato e il resto
deve essere tutto pari a zero. Fare una diagnosi a partire dall’esame delle urine è facile.
258
Patologia clinica
Secondo esempio
In questo esame si nota
l’eccessivo valore di
glucosio, che indica
diabete; osservando il
peso specifico (normale)
si capisce che per
espellere l’enorme
quantità di glucosio si avrà
sicuramente poliuria. La
produzione dei corpi
chetonici giustifica
l’abbassamento del pH,
indice di acidosi
metabolica.
Se c’è un aumento di
glucosio (5000 mg/dL) si può pensare a un diabete all’esordio; di tipo I se c’è un aumento di corpi chetonici.
Il pH è basso a causa dei corpi chetonici che danno acidosi.
Si può trovare eventualmente anche una refertazione discorsiva: “rare cellule delle basse vie urinarie, viste
al microscopio”.
Se c’è aumento di bilirubina si sa che questa sarà di tipo diretto. Si scartano gli itteri da bilirubinemia indiretta
e ci si concentra sulla tipologia epatocellulare e sulla ostruttiva, con altri esami di laboratorio.
Terzo esempio
Osservando questo esame, si può
escludere l’ittero a iperbilirubinemia
indiretta, perché in tal caso sarebbe
assente bilirubina nelle urine. Il valore di
urobilinogeno esclude l’ostruzione
delle vie biliari (l’urobilinogeno non
dovrebbe esserci). In caso di ittero
epatocellulare invece si interrompe il
ricircolo entero-epatico di
urobilinogeno ed esso si ritrova nelle
urine. Questo ragionamento non è
sufficiente per fare diagnosi, però dà
delle indicazioni cliniche importanti per
la scelta degli esami di secondo livello. Si osserva anche che il valore del peso specifico è inferiore a quello
del filtrato glomerulare (1.007): in questo caso non desta preoccupazione poiché in soggetti con
iperbilirubinemia combinata il rischio è il danneggiamento delle cellule tubulari da parte della bilirubina, per
cui si interviene con l’iperidratazione del paziente.
Quarto esempio
Aumento di emoglobina, ma anche di globuli rossi. L’emoglobinuria è indice di una emolisi. C’è una trappola:
si potrebbe pensare a una malattia ematologica, ma in questo caso l’emoglobina deriva dalla lisi dei globuli
rossi (lisati a causa dell’osmolarità delle urine: questo avviene se c’è una ematuria importante). L’osmolarità
delle urine non corrisponde a quella del sangue: i globuli rossi si lisano perché sono in un ambiente che non
è il loro. Quindi l’emoglobinuria, in presenza di ematuria, non deve creare problemi di interpretazione.
259
Patologia clinica
260
Patologia clinica
l’aumento riguarda tutte e tre, allora è un indice preciso di malfunzionamento renale. Il termine usato nella
pratica clinica per indicarle tutte e tre è azotemia. In realtà è un termine improprio: di per sé azotemia
significa “concentrazione di azoto nel sangue”, ma si fa riferimento all’azotemia dopo l’allontanamento delle
proteine.
Alternativamente alla concentrazione ematica dell’urea, nella diagnostica di laboratorio viene più spesso
determinata la concentrazione ematica dell’azoto ureico (BUN: Blood Urea Nitrogen). Dato che nella
molecola di urea (PM 60) sono contenuti due atomi di azoto (PA 14), il rapporto urea/azoto ureico
corrisponde a 60/28, cioè a 2,14; pertanto, in soggetti con un normale apporto proteico giornaliero nell’
alimentazione (1g/kg di peso) i valori ematici di azoto ureico sono compresi tra 9 e 20 mg/dL.
L’uremia può aumentare sia quando il rene non funziona, sia in un soggetto che ha un’alimentazione molto
ricca di carne e di conseguenza di proteine; questa è la ragione per cui all’uremia si associa la misurazione di
un altro parametro completamente diverso: la creatinina.
261
Patologia clinica
Se aumentano tutte e tre contemporaneamente non può che essere a causa di danno renale, quindi questo
è il più importante esame di valutazione dell’indice di funzionalità renale che viene applicato
quotidianamente nella pratica clinica su di un campione di sangue periferico.
Quindi sarà sufficiente applicare la formula usando come concentrazioni quelle di una sostanza adeguata allo
scopo.
Le prove di clearance vengono utilizzate principalmente per la valutazione del filtrato glomerulare (e per
diagnosticare eventuali glomerulopatie), cioè del volume di preurina prodotta dal glomerulo nell’unità di
tempo per ultrafiltrazione del sangue circolante. La sostanza ideale da utilizzare a questo scopo dovrebbe
presentare le seguenti caratteristiche:
• essere filtrata completamente dal glomerulo;
• non essere né riassorbita né secreta dal tubulo;
• non legarsi a proteine plasmatiche;
• non essere metabolizzata dall’organismo;
• non essere eliminate attraverso altri emuntori o dispersa nei tessuti;
• essere priva di tossicità e ben tollerata;
262
Patologia clinica
Ricapitolando, la sostanza che meglio risponde ai suddetti requisiti è l’inulina, polisaccaride esogeno
costituito prevalentemente da unità di D-fruttosio (PM 5.000): l’inulina viene completamente filtrata dal
glomerulo ed eliminata con le urine senza essere né riassorbita né secreta dal tubulo; pertanto, la sua
clearance corrisponde esattamente alla quantità di liquido filtrato dai glomeruli nell’unità di tempo. Per
comodità di esecuzione, nella pratica clinica si ricorre più spesso alla creatinina, sostanza endogena che
presenta però il limite di essere parzialmente secreta dalle cellule del tubulo renale, soprattutto quando i
valori ematici si alzano per un deficit di filtrazione; tale limite viene comunque controbilanciato da un errore
tecnico relativo alla metodica utilizzata per la determinazione della creatinina che tende a sovrastimare la
concentrazione di creatinina sierica rispetto a quella urinaria.
264
Patologia clinica
• Prova di concentrazione: si opera una disidratazione volontaria del paziente non facendogli ingerire
liquidi per 12 ore: il paziente deve svuotare la vescica e consumare una cena priva di liquidi alle 18,
senza assumere altro alimento liquido o solido; alle 6, alle 8 e alle 10 della mattina successiva si
raccolgono tre campioni di urina: in condizioni di normale funzionalità tubulare, negli ultimi due
campioni, o almeno in uno di essi, il peso specifico deve superare 1,025; questo perché in una
condizione di carenza di liquidi ci si aspetterà un’urina molto concentrata dal peso specifico molto
alto. Se invece il peso specifico sarà normale, vorrà dire che il paziente non ha concentrato le urine
e quindi che il tubulo non ha funzionato correttamente. Questo è un indicatore meno raffinato di
quello della clearance del glucosio, ma usato spesso nella pratica.
• Prova della diluizione (prova inversa): al soggetto a digiuno dalla sera precedente si fa svuotare la
vescica e quindi si somministrano 1200 cL di acqua che devono essere bevuti in 30 minuti
(iperidratazione); nelle successive 4 ore, ogni 30 minuti si raccolgono separatamente le urine
formate: in condizioni di normale funzionalità tubulare, il peso specifico di almeno uno dei due primi
campioni deve scendere a un valore di 1,003; anche in questo caso, se le urine non sono diluite,
significa che il tubulo non ha funzionato. Questa metodica è meno utilizzata in quanto
frequentemente i pazienti che vi vengono sottoposti sono allettati e faticano a bere un quantitativo
di acqua così importante in soli 30 minuti, in più dare un carico d’acqua a un paziente con un
problema renale potrebbe causare un blocco renale e di conseguenza la cosiddetta “intossicazione
da acqua”.
Da un punto di vista teorico questi due esami sono equivalenti, ma il secondo è sconsigliato per i motivi
sopracitati: la scelta spetta comunque al medico in seguito alla sua personale valutazione.
265
Patologia clinica
266
PARTE III
BIOCHIMICA
CLINICA
Biochimica clinica
268
Biochimica clinica
La medicina di laboratorio, che costituisce la base della cosiddetta “medicina personalizzata” o “medicina di
precisione”, studia i campioni biologici provenienti dall’uomo:
• in vitro: sangue, feci, urine, liquor (per patologie associate a SNC), liquido sinoviale, tessuti;
• in vivo: direttamente sull’uomo, tramite spettroscopia di risonanza magnetica nucleare.
In questi campioni biologici, in particolare, analizza quei parametri biologici e chimico-fisici che possono
fornire informazioni su processi fisiologici e patologici che avvengono a varî livelli di organizzazione
strutturale (sistemi, organi, tessuti...).
La medicina di laboratorio oggi ha un ruolo centrale nella realtà sanitaria, come strumento fondamentale
nell’ambito della diagnostica e non solo, e ciò è possibile grazie ai grandi progressi che si sono fatti negli anni
per quanto riguarda le tecniche utilizzate. Ad esempio, il sequenziamento genico è diventato talmente
preciso da permettere di sequenziare il genoma o il trascrittoma di una singola cellula in poco tempo (nei
primi anni ’00 era necessario isolare molte cellule per estrarre il genoma e sequenziarlo).
Si è stimato che la medicina di laboratorio incida solo per il 2% sul budget, pur essendo implicata nel 70%
delle decisioni mediche, in campo diagnostico, prognostico, terapeutico e di monitoraggio delle patologie. In
qualsiasi campo medico, quindi, è necessario saper interpretare dei risultati di laboratorio, per avere una
visione globale dei sintomi e della patologia.
I test biochimici sono fondamentali per la medicina moderna. La maggior parte dei test biochimici viene
eseguita sul sangue usando plasma o siero.
Il plasma è il costituente liquido del sangue, in cui è presente nella percentuale del 55% della massa totale: è
una soluzione acquosa, di colore giallo e di carattere colloidale, contenente proteine, glucidi, lipidi, sali, che
differisce dal siero per il contenuto di fibrinogeno; si usa spesso nelle trasfusioni invece del sangue intero.
Per molti (ma non tutti) i test biochimici sul sangue, il plasma e il siero sono intercambiabili. Un’eccezione
può essere la biopsia liquida (liquid biopsy) in cui è meglio utilizzare il plasma come materiale di partenza
piuttosto che siero. Durante la formazione del coagulo molti linfociti sono sottoposti a lisi e rilasciano il loro
DNA nel siero, cosa che non succede nel plasma. Se bisogna cercare dei biomarcatori (es. DNA circolante
tumorale con delle mutazioni) è molto meglio utilizzare il plasma, in quanto si ha meno DNA derivante dalle
cellule normali e quindi la concentrazione di DNA tumorale in proporzione è maggiore rispetto che nel siero,
dove c’è anche DNA derivante da cellule normali, come i linfociti che vanno incontro a lisi.
Molti degli altri test più specialistici sono limitati a più grandi laboratorî o centri specializzati che offrono un
servizio nazionale o regionale.
Nell'affrontare il gran numero di richieste di test di routine, i laboratorî di biochimica dipendono fortemente
dalla strumentazione automatizzata legata al sistema informatico di laboratorio. Un buon esempio dietro
l'angolo: LUM, Ospedale Maggiore che processa 22 mln di test/anno. I costi sono di 18 mln € per 1500 tipi di
test provenienti da S. Orsola, ISBN, Maggiore H, Imola, Rizzoli e altri ospedali della provincia.
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Biochimica clinica
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Biochimica clinica
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Biochimica clinica
• pre-analitici: questi
sorgono prima del test vero
e proprio e possono
avvenire a livello clinico o di
laboratorio. La maggior
parte degli errori rientra in
questa categoria. Ad
esempio, l’utilizzo
dell’eparina come
anticoagulante è
fortemente sconsigliato
perché va a inibire la DNA
polimerasi che amplifica il
DNA, oppure fare un test di
pomeriggio piuttosto che di
mattina a digiuno, scambiare un’etichetta, sbagliare la tempistica del prelievo, ecc. questi errori sono
dovuti a mancanza di comunicazione tra gli operatori sanitari coinvolti nel processo. A volte si
prescrivono test in eccesso, aumentando solo il costo sanitario, senza avere un effettivo vantaggio
dal punto di vista dell’outcome, oppure test facilmente sostituibili con pratiche meno costose e
altrettanto efficaci;
• analitici: gli errori analitici di laboratorio sono rari: contaminazione del reagente, errori di pipettaggio
relativi a piccoli volumi di campioni, errori di calcolo;
• post-analitici: questi sono sempre più rari, ma includono, per esempio: errori di trascrizione durante
l'immissione dei risultati da un altro laboratorio nel computer manualmente, risultati mal compresi
quando questi vengono dettati telefonicamente al clinico, ecc.
I test biochimici sono per lo più discrezionali, ossia sono richiesti per:
• un fine diagnostico predefinito;
• lo screening di una patologia, senza ancora alcun indizio della sua presenza nell’individuo;
• definire il futuro rischio di una particolare patologia;
• definire la prognosi.
272
Biochimica clinica
autolisi e degradazione di proteine e acidi nucleici. Durante questo intervallo di tempo può verificarsi una
sostanziale degradazione dell'RNA. Il “tempo di ischemia” è attualmente suddiviso in “tempo di ischemia
calda” che si verifica durante l’operazione, dopo la legatura dell'afflusso di sangue fino alla rimozione del
campione dal corpo, e il "tempo di ischemia fredda". Il primo varia notevolmente (da pochi minuti fino a
ore), a seconda della complessità della procedura chirurgica, l'abilità del chirurgo, la modalità di intervento.
Il tessuto rimane vivo e reattivo, ma subirà un progressivo stress metabolico da ipossia.
Le modalità di trasferimento dei campioni chirurgici variano in base alla disposizione architettonica e alla
distanza tra sale chirurgiche e laboratorî di patologia. È pratica comune in molti ospedali immergere i
campioni di resezione chirurgica (o direttamente gli organi) in grandi contenitori pieni di formalina, che
vengono poi trasferiti al laboratorio di patologia a tempo debito, di solito una volta al giorno. Questa pratica
comporta dei problemi, poiché:
• i contenitori di plastica sono grandi e relativamente pesanti: possono verificarsi fuoriuscite;
• l'immersione dell'intero campione in formalina impedisce la raccolta di materiale fresco per la banca
dei tessuti; inoltre, la fissazione inizia, ma solo alla periferia;
• un ritardo nel trasferimento è in qualche modo giustificato dal fatto che “il tessuto è già in formalina”;
• gli infermieri chirurgici sono sempre più preoccupati per la potenziale tossicità e cancerogenicità
della formalina, poiché il fluido deve essere manipolato all’esterno della cappa;
• quando il contenitore arriva al laboratorio di patologia, l’apertura delle scatole e la manipolazione
del campione è la principale causa di diffusione dei fumi di formaldeide.
L'Agenzia Internazionale per la Ricerca sul
Cancro ha classificato la formaldeide come
agente cancerogeno di classe 1. Un
collegamento tra formalina e sintomi respiratorî
sono stati riportati non solo nei lavoratori delle
fabbriche di fiammiferi, ma anche nei membri
del personale ospedaliero professionalmente
esposti a questa sostanza. Sono state presentate
prove statistiche per un possibile collegamento
tra esposizione alla formaldeide e neoplasie
linfo-emopoietiche, un'osservazione che
potrebbe adattarsi ai dati che riportano un
eccesso di decessi dovuti al cancro del sistema
linfatico ed ematopoietico tra i patologi
britannici.
Si utilizza anche la tecnica del sottovuoto:
quando il tessuto viene prelevato dal paziente
viene inserito in buste, messo sottovuoto e
mantenuto a freddo per conservare il tessuto e
prevenire l’autolisi. La sigillatura sottovuoto
(UVS) mediante rimozione dell'aria previene la
disidratazione e favorisce il raffreddamento, e
quest'ultimo è il principale fattore di
conservazione che blocca l'autolisi enzimatica.
In effetti, è stato dimostrato sperimentalmente
che il raffreddamento a 4 °C è più veloce nei
tessuti trattati con UVS. Inoltre, il
raffreddamento dei campioni sigillati può essere
accelerato con procedure specifiche. Ulteriori
vantaggi sono legati alla possibilità di
standardizzare i tempi di fissazione e di
273
Biochimica clinica
implementare la banca dei tessuti. In effetti, si può determinare l’ora di inizio della fissazione in formalina,
evitando così una fissazione eccessiva, che può influenzare l’immunofenotipizzazione del campione.
Questi tessuti non vengono analizzati solo da un punto di vista morfologico, ma si effettuano anche dei test
molecolari, cioè si estrae o il DNA o l’RNA per analizzare mutazioni presenti all’interno del tessuto tumorale,
per poi dare informazioni all’oncologo che deciderà la terapia corretta per il paziente con quel tipo di tumore.
Def. Per accuratezza si intende la valutazione della vicinanza di un valore di prova al valore atteso. Il
valore atteso può essere ottenuto da uno standard di riferimento noto. Un metodo accurato produrrà, in
media, risultati vicini al valore reale di ciò che viene misurato. Quindi è la possibilità di ottenere come risultato
un valore il più vicino possibile a quello atteso, ovviamente coi macchinarî a disposizione.
274
Biochimica clinica
Per i dati che hanno una distribuzione gaussiana, come è quasi sempre nel caso di errori analitici, la forma
della curva è completamente definita dalla media e dalla SD
(deviazione standard), e queste caratteristiche sono tali che:
• circa il 67% dei risultati risiede nella media
dell'intervallo ± 1 SD;
• circa il 95% dei risultati risiede nella media
dell'intervallo ± 2 SD;
• oltre il 99% dei risultati rientra nella media
dell’intervallo ± 3 DS.
I medici devono spesso interpretare due o più serie di risultati
per la stessa analisi o gruppo di analisi eseguite in differenti
occasioni sullo stesso paziente. Una domanda importante è se un cambiamento analitico è dovuto
principalmente a imprecisioni di laboratorio o a un vero cambiamento nella condizione clinica del paziente.
Senza approfondire gli aspetti statistici di ciò, può essere applicata la seguente regola: se i risultati per analisi
eseguite su campioni prelevati in differenti occasioni, ma in condizioni identiche, differiscono per più di 2,8
volte la SD analitica, allora c'è una possibilità di oltre il 95% che un reale cambiamento nella concentrazione
della sostanza si sia verificata.
Def. La specificità del test è una misura della qualità del test fornendo un risultato negativo in assenza
di malattia. È espresso come percentuale dei veri negativi in tutti quelli senza la malattia (tutti gli individui
senza malattia comprenderà i veri negativi (TN) e i falsi positivi (FP).
Specificità= TN/ (TN+ FP) × 100%
Def. L'efficacia di un test può essere definita anche con il valore predittivo di un risultato positivo e
il valore predittivo di un risultato negativo.
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Biochimica clinica
inseriscono i dati e si calcola il grafico (curva ROC) con la soglia ideale che genera uno “spartiacque” tra i
negativi e i positivi, avendo il minor numero di falsi positivi e falsi negativi. Si ha anche la possibilità di
scegliere se spostare un po' la curva e avere più falsi positivi o più falsi negativi. Di solito è preferibile avere
più falsi positivi piuttosto che falsi negativi, perché avere molti falsi negativi sarebbe un problema.
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Biochimica clinica
Quando si fa l’esame citometrico si vanno ad analizzare le soglie (10 eritrociti/mm3, 5 leucociti/mm3); nei
neonati sono leggermente più alte perché la BEE non è completamente formata.
Le proteine totali sono molto importanti perché indicano la permeabilità della membrana, il glucosio e il
lattato invece per valutare se ci sono alterazioni dovute a metabolismi di batterî e l’emoglobina con la
eventuale degradazione in bilirubina per emorragie subaracnoidee.
Altri test sono il dosaggio:
• delle IgG per la sclerosi multipla;
• delle IgA in meningite purulenta e neotubercolosi;
• delle catene libere delle immunoglobuline in un’attivazione del sistema immunitario del SNC;
• degli anticorpi specifici: dosaggi sintesi intratecale col calcolo indice anticorpale Antibody index (AI=
anticorpo specifico/immunoglobuline totali della stessa classe) (es. morbillo, varicella zoster);
• dei marcatori tumorali: CA15.3, CA125, CA19.9;
• di β-amiloide, proteina Tau fosforilata per la malattia di Alzheimer;
• della proteina 14,3,3 non correlata al prione, ma indice di necrosi neuronale nella malattia di Creutzfeldt-
Jacob (CJD); la presenza di prioni la possiamo stabilire solo con Western Blot che è molto preciso in
questo caso.
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Biochimica clinica
Già oggi, grazie alla biologia molecolare, e domani, grazie agli investimenti di numerose case farmaceutiche,
ci sarà la possibilità reale di beneficiare di farmaci specifici e selettivi verso particolari pathway cellulari
presenti in particolari tipologie di malati: infatti, nella medicina tradizionale, i trattamenti sono pensati per
il cosiddetto average patient (paziente medio) adottando un approccio generalizzato, che può essere valido
per alcuni individui, ma non per tutti: nella medicina personalizzata si vuole migliorare questo aspetto
integrando tra loro le informazioni sul paziente, come il corredo genetico, l’ambiente in cui vive, l’interazione
ambiente-genoma e infine il suo stile di vita, per identificare il trattamento più adeguato.
Nell’immagine in alto si schematizza quello che avviene oggi in confronto a ciò che si auspica per la medicina
di precisione:
• oggi: oltre al paziente medio (in azzurro), tra i malati sono presenti anche altri soggetti con
caratteristiche diverse (gialli e rossi). Trattare questi individui allo stesso modo può portare a tre
diversi scenarî:
1. un outcome migliore per la maggior parte dei pazienti (i pazienti medî), perché nel corso dei
decenni si sono sviluppati farmaci sempre più performanti;
2. nessun beneficio per alcuni pazienti;
3. effetti collaterali per altri pazienti: questa è la situazione peggiore, che vuole essere evitata
dalla medicina personalizzata.
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Biochimica clinica
• nel 2030: l’obiettivo è quello di arrivare a una condizione dove l’analisi di genoma, ambiente e
caratteristiche della popolazione stessa, tramite l’ausilio dell’intelligenza artificiale (IA), porti alla
terapia più efficace per ogni paziente. In particolare, la IA diventerà uno strumento di elaborazione
imprescindibile delle molte informazioni provenienti dalle scienze omiche (genomica, proteomica,
ecc.), consentendo di adottare la strategia più corretta per ogni individuo.
Ciò che vuole comunicare la medicina di precisione e personalizzata (non solo nel futuro, ma anche adesso)
è che bisogna considerare il genoma del paziente, l’ambiente (dieta, stili di vita), e tutti i dati che arrivano
dagli studî popolazionistici di genetica che si hanno a disposizione. Attualmente inoltre è disponibile un
arsenale di farmaci più fornito e più traghettato nel bersaglio del pathway che si vuole intercettare. È quindi
possibile somministrare un certo farmaco a pazienti che hanno un certo pathway alterato. Si avrà dunque un
outcome incrementato in diverse tipologie di pazienti, con un calo degli effetti collaterali dovuti al farmaco
normale che si somministrava precedentemente.
erlotinib, il trattamento è efficace e si verifica un abbassamento delle potenziali recidive nel paziente. C’è
invece una mutazione chiamata T790M, nello stesso EGFR, che provoca resistenza a questi farmaci. Se si
identifica questa mutazione, si devono dunque utilizzare altri farmaci, come AZD9291. Quindi, in base alle
mutazioni trovate in geni cosiddetti driver, che veicolano la malattia, si deve somministrare il corretto
farmaco a disposizione. I Big Pharma stanno sviluppando sempre di più nuovi farmaci che abbiano come
target tutti i pathway legati ai varî tipi di tumore.
Nella tabella a lato sono presenti alcuni dei geni valutati con
questa metodica.
Nella pratica quindi:
• si sequenzia il genoma di un paziente,
• si identificano le mutazioni che il tumore porta
• si associa il farmaco più opportuno in relazione a quel tipo
di mutazione.
Quest’ultimo passaggio è a discrezione dell’oncologo che, in
base alle linee guida stabilite sui trial effettuati nel corso degli
anni e in quel momento, valuterà nell’arsenale di farmaci a
disposizione quali siano quelli più efficaci a colpire il pathway
coinvolto
nella popolazione tumorale.
[Dalle diapositive] L’obiettivo primario di MATCH è determinare
la percentuale di pazienti che risponde ai trattamenti, con una
regressione tumorale di una certa quantità. È chiamato objective
response rate. Il trattamento sarà considerato promettente se
almeno il 16% dei pazienti avrà regressione tumorale. L’obiettivo secondario del trial è determinare la
percentuale dei pazienti la cui malattia non peggiora nei successivi sei mesi. Questo è detto progression-free
survival. In aggiunta i ricercatori andranno a determinare anche il tempo di progressione del tumore e
valutare gli effetti collaterali del trattamento.
Un tempo si adoperava unicamente la chemioterapia portando alla morte di tutte le cellule in continua
proliferazione: da una parte si riduceva la massa tumorale, ma dall’altra si avevano effetti collaterali, tra cui
la perdita dei capelli oppure la morte delle cellule staminali. Adesso spesso si associa la chemioterapia a nuovi
farmaci o addirittura in alcuni trials ci si focalizza su questi fino ad arrivare a vere e proprie targeted therapies
(terapie a bersaglio molecolare), dove il farmaco, ad esempio l’anticorpo monoclonale, inibisce il pathway di
innesco della cancerogenesi.
esempio b-RAF, un oncogene mutato spesso nel codone 600, la cui mutazione più frequente è la
V600E, presente spesso in tutti questi quattro tipi diversi di tumore. Utilizzando come target lo stesso
driver gene che veicola la patologia, si utilizza lo stesso farmaco, ad esempio un anticorpo
monoclonale, che riconosce la mutazione V600E in tutti e quattro i tipi di tumore. Quindi, in questo
caso, il concetto è opposto: i diversi tipi di tumore vengono trattati non con diversi trattamenti, come
succedeva una volta, ma con lo stesso farmaco, perché si vuole inibire l’oncogene che scatena la
malattia, ossia b-RAF con mutazione V600E.
Una volta che i tessuti tumorali vengono portati in anatomia patologica, sarà il sequenziamento genomico a
permettere l’identificazione dei driver gene, ovvero i geni che guidano il processo di cancerogenesi.
282
Biochimica clinica
B2.2.2 FISH
Uno tra i test diagnostici storicamente e clinicamente più impiegati è la FISH (Fluorescence in situ
hybridization). Il saggio FISH è semplicemente la costruzione di una sonda a DNA (o RNA in alcuni casi) che
riconosce in modo specifico e selettivo alcune regioni del genoma: quindi, si sintetizza un patch di DNA che
corrisponde a uno specifico gene localizzato su un cromosoma, ad esempio il cromosoma 1 braccio corto
(1p), e lo si marca con un fluorocromo (una molecola che emette fluorescenza se eccitata a una determinata
lunghezza d’onda), ovvero il frammento di DNA e il fluorocromo vengono uniti chimicamente.
Normalmente i pezzi operatori arrivano all’anatomopatologo, vengono fissati in formalina e inclusi in
paraffina, poi delle sezioni del tessuto vengono fatte aderire a un vetrino che viene colorato ad esempio con
ematossilina-eosina, permettendo un’attenta valutazione del patologo. Dove è presente il tumore si possono
ibridare le sonde fluorescenti che sono rappresentative della porzione genomica di interesse.
283
Biochimica clinica
Nelle immagini soprastanti si mostra come si presenta l’ibridazione: in questo caso le sonde fluorescenti sono
sul cromosoma 1, braccio corto e banda 36 (1p36). Di norma si marca in verde la regione che si intende
analizzare e in rosso, per controllo interno, un’altra regione all’interno dello stesso cromosoma. Nell’esempio
riportato la sonda di controllo riconosce il braccio lungo e la banda 25 (1q25). Questo meccanismo permette
di avere un riferimento interno durante il processo del saggio.
È bene ricordare che il corredo genomico umano è diploide, per cui ci si aspetta due cromosomi 1 e che la
sonda vada a ibridarsi su due posizioni diverse a livello di singola cellula: in questo caso al microscopio
saranno visibili due pallini verdi (1p36) e due pallini rossi (1q25).
Nel caso di tumore sono possibili però degli scenarî differenti:
• una delezione, ad esempio di 1p36, determinerà la visione di un solo pallino verde a causa della
perdita di un braccio corto di un cromosoma 1;
• un’amplificazione, ad esempio di HER2, uno dei geni maggiormente amplificati nel tumore alla
mammella: quindi, effettuando la FISH in quella regione cromosomica invece di avere due pallini
verdi o rossi se ne avranno di più.
Riassumendo, la FISH serve essenzialmente per valutare perdita o guadagno di materiale genetico.
284
Biochimica clinica
Come si può capire se si hanno delle delezioni, ossia se è stato perso un pezzo di cromosoma in uno dei due
alleli?
- La sonda viene marcata con un fluorocromo, ad esempio rosso.
- Parallelamente si utilizza un’altra sonda, nello stesso cromosoma ma nel braccio lungo, e la si marca
con un fluorocromo verde.
- Si co-ibrida con le due sonde, una su 1p l’altra su 1q
- Nell’analisi di fluorescenza, se il paziente non ha perdita di materiale genetico, in ogni cellula si
vedranno due pallini perché sono presenti due alleli, quindi ci sono due pallini rossi e due pallini
verdi.
- Se il paziente avrà alcune cellule che hanno un solo pallino rosso (i verdi li ha sempre perché sono un
controllo, anche per stabilire quanti cromosomi 1 si ha in una cellula, dal momento che si può avere
anche una poliploidia, alcuni tumori sono poliploidi) significa che c’è stata una perdita.
- La stessa cosa avviene per quanto riguarda il 19q: si utilizzano due sonde, una rossa e una verde e si
vede se c’è stata perdita di materiale genetico.
285
Biochimica clinica
geni amplificati (es. EGFR nei tumori cerebrali, ErbB2 nel tumore della mammella), in altri, delezioni
in cui si perde uno dei due alleli;
• expression arrays;
• tissue microarray: l’anatomopatologo seleziona mediante “carotaggio” campioni dello spessore di
0,5 mm da 100 pazienti diversi con lo stesso tipo di tumore che vengono posizionati in un unico
microarray; a questo punto, attraverso anticorpi monoclonali o sonde specifiche come nella FISH, si
valuta l’espressione genica di 100 pazienti diversi in un unico saggio. Questo serve essenzialmente
per standardizzare i casi;
• analisi di SNP, cioè analizzare diversi pattern di nucleotidi in punti specifici del genoma di individui
diversi.
Specialmente quando si ha poco materiale di partenza (una small biopsy) il numero di cellule che si può
utilizzare non è estremamente grande, e quindi, se si hanno, ad esempio, 100 target, è impossibile svolgere
l’analisi. In casi come questo, sono più utili i DNA microarray. Possono svolgere analisi di perdita o guadagno
di materiale genetico e anche di espressione genica su tutto il genoma in parallelo, con un singolo
esperimento.
Nell’immagine sono presenti i robot che inizialmente preparano i microarray. In basso a destra è raffigurato
il classico microarray, dove ogni pallino corrisponde a una sonda a DNA, un oligonucleotide di 50-70 bp che
è stato disegnato in modo tale da rappresentare una porzione genomica precisa mappata sul genoma umano.
I microarray possono ospitare anche 200.000 sonde per ogni vetrino, e si possono quindi disegnare 200.000
sonde, che sono mappate lungo tutto il genoma di cui si sanno esattamente le coordinate.
Array CGH
Grazie al saggio CGH array (Comparative
Genomic Hybridization), si marca il DNA tumorale
con dei fluorocromi verdi, mentre il DNA normale
dello stesso paziente viene marcato in rosso.
Vengono inseriti sul vetrino i due DNA verde e
rosso in uguale quantità e qui si ibridano alle
sonde presenti. I due frammenti, in base alla
complementarità e al numero delle copie del
gene target, potranno non legarsi o legarsi in
maniera più o meno forte alla sonda, emettendo
fluorescenza a diverse lunghezze d’onda, che
potranno essere rilevate da una ccd camera e
tramite software si stabilisce il rapporto
286
Biochimica clinica
rosso/verde. Nei pozzetti si potranno quindi osservare diverse situazioni, elaborate da un software che
scansiona e determina i rapporti (su scala logaritmica) tra le due copie per singola posizione:
• se non si hanno né perdite né guadagni di materiale genetico, il rapporto di verde e rosso per singola
sonda sarà pari a 1 perché si hanno 2 copie di ciascun gruppo e il pozzetto apparirà giallo;
• se si ha più verde, allora sta prevalendo il DNA tumorale e questo significa che c’è stata
un’amplificazione o una duplicazione di quel gene in quella particolare posizione del cromosoma e il
pozzetto apparirà verde (rapporto maggiore di 1);
• se si ha più rosso, allora sta prevalendo il DNA normale e questo significa che c’è stata una delezione
di quel gene in quella particolare posizione del cromosoma e il pozzetto apparirà rosso (rapporto
minore di 1).
Esistono altri metodi per valutare delezioni e mutazioni, ma l’approccio più completo è l’aCGH, perché valuta
in un saggio tutto il genoma. La FISH è solo per piccole porzioni di genoma.
Expression arrays
Nel genoma umano sono presenti
21306 geni, sulla base degli ultimi dati,
risalenti al 2020. In un singolo
esperimento è dunque possibile
valutare il livello dell’espressione
genica. Si possono valutare anche i
trascritti: nei tumori c’è una certa
variabilità di espressione genica che
può essere usata come valore
prognostico, partendo dal tumore
primitivo si possono individuare i
287
Biochimica clinica
pazienti con migliore o peggiore prognosi. Si utilizza lo stesso approccio degli array: invece di ibridare il DNA
si valuta l’mRNA. In generale si fa una retrotrascrizione con una “reverse” trascrittasi (presente, ad esempio,
nei retrovirus) che sintetizza il cDNA partendo da RNA. Il cDNA tumorale viene marcato in rosso e quello
normale in verde. Si ibrida sul pozzetto e si valuta l’espressione genica di ciascuna sonda. Spesso ciascun gene
è rappresentato da più sonde (ad es. una per ogni esone) per valutare anche le varianti di splicing alternative.
Si può anche fare un die swap, quindi, nello stesso paziente, marcare prima il tumore col rosso e poi col verde
e viceversa, per confermare i dati. Infatti, a volte i fluorocromi hanno problematiche correlate alla
temperatura e alle condizioni meteorologiche: spesso in estate si ha un tasso di ozono elevatissimo a
Bologna, che degrada il fluorocromo rosso più velocemente del verde e questo altera i dati.
Alla fine, si ha una valutazione quantitativa del trascrittoma, con un panorama completo di tutti i trascritti
che esistono nella popolazione tumorale dell’individuo.
mammella estremamente poco aggressivo, con dimostrate nei follow up delle percentuali di recidiva
bassissime. Infatti, in questo caso a volte, dopo il trattamento con rimozione chirurgica, si può anche evitare
di insistere con la chemioterapia, dato che dà effetti collaterali importanti.
Coi test che si hanno a disposizione attualmente, si riesce a prevedere il futuro? Per quanto riguarda la
mammella, questo spesso è possibile. Diverse compagnie (tra cui quella del professore, che fondò anni fa a
Trieste, Alpha Genics) hanno lavorato per sviluppare test prognostici legati alla tipologia di tumore, grazie
alle nuove tecnologie di biologia molecolare. Anche in questo caso si parla di array d’espressione.
Ci sono tanti test molecolari che si basano su array disponibili sul mercato, in cui si marca con rosso o verde
il tessuto tumorale o quello normale e si ottiene il ritratto dei tumori. In verde sono rappresentati i geni
ipoespressi, in rosso invece i geni iperespressi. Ci sono algoritmi particolari che permettono l’analisi del
panorama generale in un cluster di pazienti.
Nella figura a destra, il gruppo in
verde rappresenta un cluster di
pazienti che hanno gli stessi
geni down-regolati, invece a
destra c’è un gruppo di pazienti
che per gli stessi geni ha un up
regolazione, e così via per altri
geni.
Grazie a questo primo paper
pubblicato su Nature all’inizio
degli anni 2000, i collaboratori
hanno cercato di raggruppare
dal punto di vista
dell’espressione genica varî tipi
di tumori alla mammella,
comparando l’espressione
genica con i marcatori classici usati abitualmente nella pratica clinica comune, soprattutto ER, PgR, Ki-67 ed
HER-2, tramite l’immunoistochimica. Ci sono una serie di farmaci contro questi marcatori (hanno analizzato
diversi tipi di tumore: carcinoma duttale invasivo, due carcinomi lobulari, un carcinoma duttale in situ, un
fibroadenoma benigno e varî casi normali).
La correlazione è stata trovata e hanno coniato quattro gruppi di tumori alla mammella che compariranno
nel referto dell’anatomopatologo:
1) Luminal A: normalmente hanno prognosi buona, sono quelli a prognosi migliore rispetto alle altre
classi. Tutti i tumori alla mammella vengono analizzati subito per la presenza, attraverso
l‘immunoistochimica, di recettori dell’estrogeno, del progesterone, HER2 e ki67, una molecola
legata alla proliferazione tumorale. Più è alto ki67 più il tumore prolifera e avrà più potenziale di
invasione dei tessuti circostanti e di metastatizzare. Luminal A [pr. Luminal ei] è positivo al recettore
di estrogeno e progesterone, è HER2– e presenta ki67 basso, significa che ha un tasso di
proliferazione basso, e per questo ha una prognosi abbastanza buona
2) Luminal B: sono identici ai luminal A, ma con ki67 più alto, quindi la prognosi è peggiore di luminal
A.
3) Triple negative: sono i peggiori. Normalmente sono negativi sia al recettore di estrogeno, sia al
recettore del progesterone, sia a HER2 e hanno ki67 alto.
4) HER2-enriched: se non trattati hanno cattiva prognosi, ma oggi esiste un farmaco che ha come target
HER2 amplificato, ossia un anticorpo monoclonale contro HER2, e quindi quando si sa che HER2 è
amplificato si tratta questo tumore con questo farmaco, e la prognosi è migliorata.
5) Normal-like breast cancer: questa classe è stata tolta.
289
Biochimica clinica
Un gruppo di ricerca olandese, di Amsterdam, di cui fa parte la ricercatrice Laura J. van’t Veer, segue un
approccio basato sull’idea di partire da un tessuto fresco, proveniente direttamente dalle mastectomie che
arrivano dalla sala operatoria (MammaPrint). Questi campioni di tessuto vengono portati in anatomia
patologica, dove il patologo individua la lesione e, ancor prima di analizzare istologicamente il campione, ne
preleva una porzione, che viene messa in una provetta in cui si trova una soluzione preservante, che stabilizza
gli acidi nucleici, in particolare l’RNA che è molto instabile. A questo punto la provetta viene spedita in un
laboratorio centralizzato ad Amsterdam, che ogni giorno processa i campioni che vi arrivano e dà come
risultato uno score alto/basso rischio di sviluppare metastasi.
Ciò è possibile tramite un’analisi dell’espressione genica, svolta su 70 geni, che, secondo un algoritmo, è in
grado di prevedere in modo molto affidabile il rischio di metastatizzazione.
Quando si effettua un prelievo macroscopico, quello che si ottiene non sono soltanto le cellule tumorali, ma
potrebbero esserci all’interno del campione anche altri tipi di cellule: linfociti, cellule endoteliali, cellule
stromali, che ‘’contaminano’’ la popolazione di cellule tumorali.
Attualmente si sa che il microambiente circostante il tumore, collabora e comunica col tumore stesso, al fine
di facilitare la proliferazione tumorale. Per questo motivo, dal punto di vista dell’analisi, è positivo il fatto di
raccogliere nel campione anche le cellule non tumorali, poiché permette un’analisi più precisa e dà una
visione più ampia sulla situazione del tumore.
Grazie a questo algoritmo bioinformatico è quindi possibile stabilire una
soglia che stratifica le pazienti nei gruppi sulla base di un’analisi che viene
effettuata sul tumore primitivo; questo è un evento rivoluzionario,
poiché prima si riteneva che il potenziale metastatico venisse acquisito
dalle cellule tumorali soltanto nelle fasi avanzate della cancerogenesi.
Dunque, l’innovazione portata da questo studio non è stata soltanto
l’individuazione di 70 geni, che stratificano le pazienti nei due gruppi, ma
anche la consapevolezza che il tumore primitivo aveva già l’impronta per
decidere se il potenziale metastatico era alto o basso.
Tutti i pazienti sopra la linea gialla [a dx] hanno una prognosi positiva,
quelli sotto la linea gialla hanno una prognosi negativa. La prognosi
290
Biochimica clinica
riguarda in particolare il rischio di sviluppare metastasi entro 5 anni dal test [domanda d’esame frequente].
Stratifica i pazienti in base alla prognosi.
Osservando i grafici di sopravvivenza di Kaplan-Meier [a sx]
si osserva che c’è una notevole differenza tra le donne che
hanno una good signature e quelle che hanno una poor
signature.
In seguito, ci sono stati tutta una serie di lavori che hanno
confermato i dati iniziali.
Tuttavia, uno svantaggio di questo test è dato dal fatto che
la donna deve sapere già prima di essere operata se ha
intenzione di effettuare il test oppure no, poiché altrimenti
non è possibile avere i campioni idonei. Inoltre, questo test
ha un costo che non viene coperto dal servizio sanitario
nazionale e che è una spesa nell’ordine di grandezza dei
3000€, a causa dell’elevato costo legato alla strumentazione
necessaria per effettuare questi test.
Un’ulteriore difficoltà è legata al fatto che è necessario avere
campioni di tessuto fresco, poiché non si può partire da
tessuti conservati in paraffina, dato che l’RNA si degrada;
infatti è necessario avere RNA integro e in elevate concentrazioni, al fine di avere un risultato affidabile con
la tecnologia del microarray. Se si utilizza un processo di standardizzazione con un controllo della
temperatura, l’RNA si trova tutto frammentato e non è quindi idoneo per le analisi di microarray, anche se si
possono fare le analisi di PCR.
La limitazione legata alla necessità di partire da un tessuto fresco impedisce quindi di fare analisi
retrospettive, ma si possono svolgere soltanto analisi prospettiche.
Un altro gruppo, questa volta californiano, ha invece sviluppato un test alternativo, che si effettua utilizzando
la real time PCR, che valuta quantitativamente il DNA o l’RNA di un certo numero di geni. In questo caso si
possono analizzare pochi geni alla volta, ma sapendo quali geni si devono analizzare è un meccanismo molto
utile e permette di partire da paraffina, se è stata rispettata correttamente la standardizzazione nel processo
di fissazione dei tessuti.
In questo lavoro sono stati analizzati soltanto 16 geni, utilizzando quindi un approccio molto diverso rispetto
a quello degli olandesi (che hanno invece analizzato tutti i 21.000 geni del genoma umano e hanno poi
selezionato i 70 più significativi: si tratta quindi di un’analisi non supervisionata, in quanto non si conoscono
a priori quali geni andare a indagare, ma facendo un’analisi globale di tutto il genoma si arriva poi a capire
quali geni fossero rilevanti).
L’ approccio dei californiani è basato sul fatto che in letteratura erano noti 16 geni che risultano alterati nei
casi di tumori della mammella, e sulla differente espressione di questi geni nei casi di tumori metastatici/non
metastatici: questi geni analizzati sono i classici geni noti per essere associati alla proliferazione cellulare.
Inoltre, è necessario avere dei geni normalizzatori, ovvero geni che sono costitutivamente espressi anche nei
tessuti sani, che servono per valutare il normale livello di espressione genica.
Anche con questo studio è stato possibile suddividere le pazienti in alto, medio e basso rischio di sviluppare
metastasi, come si osserva dalla curva di Kaplan-Meier [pagina seguente] derivata da questo studio.
In questo studio i casi analizzati sono molti di più poiché, potendo utilizzare i campioni conservati in paraffina,
si avevano molti più campioni idonei, giacché i reperti di anatomia patologica devono sempre essere
conservati per almeno 20 anni e quindi si è potuti andare a ritroso studiando un enorme numero di campioni.
Infatti, è importante considerare che è estremamente importante la fase di processazione dei campioni,
291
Biochimica clinica
292
Biochimica clinica
Attualmente per la lettura dei referti esistono dei software che aiutano a comprendere il potenziale cambio
nella funzione di una proteina a seguito di una mutazione missenso, in base alla differenza tra l’AA wild type
e quello mutato.
Questi algoritmi si basano sulla storia delle mutazioni di moltissime proteine, analizzando anche quanto è
conservata la funzione di una proteina a seguito di una specifica mutazione aminoacidica. Chiaramente in
alcune proteine particolarmente studiate, come RAS gli effetti delle varie mutazioni sono più noti che in altre.
In ogni caso una specifica mutazione può dare risultati molto diversi in base alla proteina in cui essa si trova.
293
Biochimica clinica
terapia vi è il 22% di pazienti che rispondono alla dose standard e il 5% che rispondono a una dose lievemente
aumentata. Al momento alcuni meccanismi di risposta/non risposta non sono ancora chiari, ma è importante
effettuare questa tipologia di test al fine di prevedere la risposta il più possibile. È importante sottolineare
che devono essere analizzate le mutazioni somatiche, poiché RAS non è mutato alla nascita del paziente (non
è una mutazione germinale, come ad esempio quella di BRCA nel tumore alla mammmella). Le analisi devono
quindi essere fatte a partire da una biopsia del tumore, dal quale viene estratto il DNA, che viene poi
sequenziato, oppure si utilizza la RT-PCR. KRAS ha solo alcuni codoni che vanno incontro a mutazione e quindi
non è necessario effettuare un sequenziamento di tutto il genoma, ma è sufficiente utilizzare la RT-PCR, che
riesce a quantificare gli alleli mutati nel tessuto in esame.
Tipologie di RT-PCR
Esistono due tipologie di RT-PCR, quella assoluta e quella relativa.
La PCR assoluta viene utilizzata per l’identificazione dei virus, ad esempio SARS-CoV-2, per il quale vengono
utilizzate tre regioni del genoma virale. Si analizzano contemporaneamente degli standard, ossia dei virus o
degli artefatti che simulano la presenza del virus, in concentrazioni note in 4 pozzetti diversi. Si delimita così
una sorta di curva standard che poi deve essere confrontata con quella dei pazienti per capire quante copie
per campione o per ml sono presenti.
HIV, HBV e HCV vengono valutati per mL di plasma, mentre per l’analisi di SARS-CoV-2 si utilizza un campione
differente; in ogni caso la PCR assoluta indica il numero di copie presenti in un determinato campione.
La RT-PCR relativa invece serve a quantificare l’espressione genica dei geni di interesse, come ad esempio è
stato fatto nello studio californiano precedentemente descritto per lo studio della prognosi dei tumori al
seno. Si devono utilizzare dei normalizzatori, ossia dei geni che sono costitutivamente espressi e che quindi
fungono da controllo, per valutare se gli altri geni sono espressi o down-regolati. Si valuta quindi quante volte
un gene è espresso rispetto al normalizzatore.
La real time-PCR offre dei vantaggi perché riesce a essere sensibile e specifica nello stesso modo, però
presenta un limite: non è possibile analizzare tante mutazioni in contemporanea, poiché è necessario
disegnare tanti primers di riconoscimento delle varie mutazioni. Questo approccio resta, quindi, valido per
gli oncogèni, ma per gli oncosoppressori, che presentano un numero elevato di mutazioni, risulta impossibile
effettuare un test allele-specifico mediante i primers. Si vedrà che il sequenziamento di Sanger ha una
sensibilità molto bassa, tale per cui devono esserci almeno 20 cellule mutate per poter essere identificate.
295
Biochimica clinica
Funzionamento
Quando una polimerasi crea un nuovo filamento
effettua una reazione di condensazione tra due basi
con formazione di un cosiddetto ponte ossigeno e
liberazione di pirofosfato. Nell’immagine si vede una
guanina presentante un gruppo ossidrilico e
un’adenina trifosfato: avviene una condensazione
con distacco di due fosfati.
Sanger ebbe l’idea di introdurre due molecole
didesossinucleotidi (ddNTP), ossia delle molecole che
non hanno un gruppo ossidrile (presentano -H
anziché -OH). Inserendo queste molecole nella
reazione la catena di allungamento si ferma in
corrispondenza di una base, poiché la polimerasi non
riesce a formare un ponte ossigeno tra il fosfato e il
ribosio.
296
Biochimica clinica
297
Biochimica clinica
contenere la mutazione per essere rilevate in modo affidabile. In alternativa si possono comparare i risultati
di un sequenziamento Sanger con quelli ottenuti da una real time-PCR, dato che quest’ultima è in grado di
studiare correttamente tessuti con una mutazione inferiore al 20%.
[Agli esami chiede spesso la detection del Sanger sequencing.]
La RT-PCR è più sensibile del Sanger (O.1% vs 20%).
Ci sono molti tumori che hanno eterogeneità tumorale: ovvero non tutte le cellule della popolazione
tumorale condividono le stesse mutazioni. Ci sono cloni diversi che hanno caratteristiche genetiche diverse
e questo crea problemi nella terapia.
Il sequenziamento di Sanger ha una sensibilità molto bassa e quindi si fa fatica a identificare i cloni e i sub-
cloni, anche perché nella porzione di tessuto selezionato dall’anatomopatologo non ci sono solo cellule
tumorali ma anche infiltrato linfocitario che è normalmente wild type e che contamina il tessuto tumorale.
Il NGS riesce ad essere molto sensibile (arriva all’1%) quasi come la Real Time PCR, e va a vedere tutto il
genoma in una sola volta.
Uno svantaggio del sequenziamento di Sanger è che, dovendo svolgere un gran numero di reazioni, impiega
tempi molto lunghi per realizzare un sequenziamento. Per questo motivo ad oggi viene frequentemente
utilizzata la NGS sequencing, presente in tutti gli ospedali medio-grandi.
Nell’immagine sottostante viene rappresentato lo studio fatto su un tumore al polmone in cui inizialmente
si testavano solo KRAS e EGFR in analisi mutazionali: EGFR aveva 4 esoni implicati (esoni 18, 19, 20, 21), KRAS
ne aveva 3 (esoni 2, 3, 4).
Oggi si ha la necessità di avere dei pannelli di geni analizzati in parallelo, sono necessari almeno 20-30 geni
per capire che farmaco dare al paziente. Diviene troppo oneroso il sequenziamento di Sanger e si preferisce
NGS, più idonea.
298
Biochimica clinica
B3.1 INTRODUZIONE
Il Progetto Genoma Umano è partito negli anni ’90, anche grazie a un italiano, Renato Dulbecco, il quale ha
ricevuto un premio Nobel, ed è durato circa 13 anni. Le prime due pubblicazioni apparvero su Nature e su
Science nel 2001, dove era stato sequenziato il DNA; ci vollero altri due anni e mezzo per assemblare il
genoma. Furono coinvolti due consorzî, uno pubblico e uno privato (Celera Genomics fondato da Craig
Venter) e furono impiegati 3 miliardi di dollari.
Parlando di numeri, l’uomo possiede 22 cromosomi oltre XY, le basi sono circa 6,4 miliardi; l’esoma, che
rappresenta l’1,5% del genoma totale, è di circa 34 Mb.
All’inizio degli anni 2000 Jonathan Rothberg, ingegnere biomedico americano, ebbe in famiglia un grave
problema di salute per cui il figlio venne portato in
terapia intensiva. I clinici gli dissero che per trovare una
soluzione avrebbero dovuto sequenziare il DNA del
bambino e che avrebbero impiegato 13 anni e 3 miliardi
di dollari. Questo lo spronò a creare una propria
piattaforma di sequenziamento, che venne terminata
nel 2007 e prese il nome di 454 FLX System. Questa
piattaforma permise una riduzione drastica dei costi e
dei tempi. Riuscì a sequenziare il genoma di Watson in
6 mesi, spendendo 2 milioni di dollari.
Ad oggi sequenziare un’esoma costa circa 250 euro.
Ci sono diverse piattaforme sul mercato oggi. Il numero di Gb per singola corsa per il Sanger è piccolissimo.
Con NGS ci sono talmente tante sequenze in parallelo da leggere (escono dalla piattaforma decine e centinaia
di milioni di sequenze) che si può leggere tutto il genoma almeno 100 volte in una sola notte.
• Piattaforma Illumina: ha il 90% del mercato perché è la più efficiente e la più attendibile.
• Piattaforma Roche: creata dallo stesso inventore del 454-NGS, Jonathan Rothberg, prevede la stessa
tecnologia del FLX ma utilizza variazioni di pH per leggere l’incorporazione dei nucleotidi. Questo gli
permise di risparmiare molti soldi per quanto riguarda il prezzo della singola corsa.
Il “454” (four-five-four) è una sistema per NGS che funziona tramite “biglie”, sfruttando il concetto di
miniaturizzazione. Il genoma da analizzare viene spezzato in piccoli frammenti lunghi circa 300 bp e inserito
in queste biglie. I frammenti, tramite l’enzima ligasi, vengono attaccati a adattatori universali, sia a destra
che a sinistra a ogni molecola di DNA del paziente. Nel 454 questa metodica non avviene una provetta alla
volta, come nel Sanger Sequencing ma, disponendo di un alto numero di biglie (per es. 100 mila), la reazione
avviene in parallelo su ognuna di esse (da qui il termine Parallel Sequencing).
299
Biochimica clinica
Il punto di svolta nello sviluppo della piattaforma fu dato dalla miniaturizzazione e dalla frammentazione del
genoma. Rothberg ebbe l’idea di frammentare il genoma in piccole porzioni, normalmente di 300 bp, grazie
a un sonicatore che svolge questo lavoro per mezzo di ultrasuoni.
300
Biochimica clinica
B3.3.1 Funzionamento
La piattaforma Illumina è la piattaforma che maggiormente ha preso piede nei laboratori del mondo (per
adesso: l’innovazione infatti, in questo settore, procede a una velocità incredibile: nel 2008 è stato
sequenziato il genoma di Watson in sei mesi con la piattaforma 454, ora con 1000 euro possiamo sequenziare
tutto il genoma). Questa piattaforma permette di sequenziare un intero genoma in una notte.
Ogni pezzetto di DNA purificato dal paziente va frammentato e a ciascun pezzetto (di 300-400bp) vanno legati
due adattatori diversi. La frammentazione avviene spesso per ultrasonicazione, quindi per un principio fisico,
o più raramente tramite enzimi come trasposasi. Con le nuove piattaforme, ad esempio Covaris, si ha una
standardizzazione più elevata: si può aggiustare la lunghezza e frammentare di più o di meno, ma
normalmente si frammenta in 300-400 bp.
Si legano con una ligasi alle due estremità dei frammenti degli adattatori, ossia sequenze nucleotidiche
universali (universali per la piattaforma che si usa, diversi quindi tra Illumina, Ion Torrent ecc.). Tutti i
frammenti, quindi, avranno gli stessi adattatori, in modo tale che questi ultimi possano riconoscere le
sequenze complementari che ci sono sulla flow cell. Sulla superficie del vetro sono depositate le sequenze
complementari agli adattatori, permettendo quindi che si riconoscano e si leghino sulla flow cell.
A questo punto, grazie a una polimerasi, avremo la polimerizzazione e la formazione di un doppio filamento.
Per denaturazione, il filamento originale si stacca e viene lavato via, mentre il filamento reverse appena
formato va a formare una struttura a forcina, riconoscendo l’adattatore complementare sulla flow cell. Grazie
all’aggiunta della polimerasi cominciano quindi a formarsi dei cluster di molecole di DNA identici al primo
frammento (bridge PCR). Quindi, inserendo un milione di frammenti di DNA appartenenti a un paziente sulla
flow cell, dopo alcuni cicli di PCR, si otterranno un milione di cluster relativi a ogni singolo frammento
aggiunto18.
17
Numero di sequenze processate contemporaneamente.
18
https://www.youtube.com/watch?v=HMyCqWhwB8E
302
Biochimica clinica
Ricapitolando:
1) Vengono aggiunte n molecole
(derivate dai genomi delle
cellule del campione,
prelevato e frammentato)
all’interno della flow cell.
Questo procedimento è necessario perché non si può sequenziare una molecola alla volta, ma c’è bisogno di
amplificare i frammenti in modo da avere un segnale “detectable”, ossia un segnale che raggiunga un minimo
di intensità di fluorescenza perché possa essere catturato. Bisogna amplificare clonalmente la singola
molecola, cosa che si fa con la bridge PCR (PCR a ponte), con formazione di una serie di cluster. Il risultato
sarà un segnale identico per ogni molecola del cluster e il numero di cluster sarà pari al numero di sequenze
che avremo alla fine della corsa (run).
Il sequenziamento avviene aggiungendo in soluzione delle basi legate a un fluorocromo, diverso in base al
tipo di base: 4 basi, 4 colori diversi.
303
Biochimica clinica
La polimerasi è presente in fase liquida (avviene tutto in fase liquida, aggiungendo in base alle necessità i varî
componenti) e a ogni ciclo vengono aggiunte le 4 basi coi 4 fluorocromi diversi (mentre con Ion Torrent non
era possibile, bisognava aggiungere una base alla volta).
A ogni ciclo quindi accumuliamo informazioni base dopo base: per esempio, se nel filamento da sequenziare
c’è una A, si appaierà una T e tutte le molecole del cluster emetteranno la fluorescenza relativa alla timina,
rendendo rilevabile il segnale sotto forma di un pallino luminoso. Dall’alto si vedranno quindi dei pallini, ciclo
dopo ciclo: tanti pallini luminosi quanti sono i cluster che abbiamo formato sulla flow cell.
Il sistema cattura la fluorescenza emessa coi 4 colori diversi in ciascuno dei pallini e assegna ciascuna base a
ciascun cluster, perciò base dopo base viene letta la sequenza del frammento del genoma del paziente. Alla
fine di ogni ciclo c’è un enzima che taglia via il fluorocromo appiccicato alla base integrata, che altrimenti
sarebbe un segnale aberrante per la base che viene dopo. Quindi ciclo dopo ciclo si taglia il fluorocromo
appiccicato alla base, si lava via tutto e si continua con il ciclo successivo, si aggiungono 4 basi, i 4 colori
diversi, poi c’è la lettura e l’assegnazione della base.
Il software è nato grazie a una collaborazione tra astrofisici e Illumina, tramite un algoritmo utilizzato per
osservare le collocazioni delle stelle nel cielo.
La caratteristica di Illumina è la
possibilità di poter leggere in
entrambi i versi: a ogni lavoro di
sequenziamento verranno prodotti
due tipi di file che consentiranno una
lettura in entrambi i versi. Grazie a
dei tool del software, il file può
essere utilizzato per confrontare la
sequenza col tratto di genoma
umano di riferimento in modo da
valutare se ci sono mutazioni. I
quattro colori usati per quattro basi
nel sequenziamento richiedono quattro scansioni per ogni ciclo. Questo comporta un tempo maggiore
nell’ottenere i risultati, così nel cercare di ottimizzare i costi dei fluorocromi e il tempo, Illumina ha sviluppato
anche un sistema a due colori:
• timina: verde;
• citosina: rosso;
• adenina: una miscela di rosso e verde;
• guanina: nero.
Il numero di spot dipende dalla flow cell; questo evento
di fluorescenza permette la lettura sia in forward sia in
reverse, per avere una consistenza maggiore
nell’assegnare ciascuna base alla posizione che andiamo
a individuare: in questo caso si parlerà di Paired-End.
Normalmente, la maggior parte delle corse viene
effettuata in Paired-End, per rendere il risultato più
attendibile, ma ci sono alcune eccezioni: per frammenti
molto corti, come i micro-RNA, che misurano 20-22 bp, è
sufficiente la Single-Read, per esempio.
Il sistema può essere impostato in 4 colori, quindi un
colore per base: Illumina invece, per risparmiare, utilizza
2 soli fluorocromi, che sono una componente molto
costosa (timina verde, citosina rossa, l’adenina è una
miscela tra rosso e verde, la guanina è “dark”, non ci
sono fluorocromi: siccome il sistema sa che in un certo
punto c’è un cluster, quando c’è buio, significa che è legata una guanina).
304
Biochimica clinica
Ciascuna base del genoma va letta tante volte per essere sicuri nel caso si trovi una mutazione di punto, per
esempio. Questo significa che bisogna dedicare un certo numero di cluster, e quindi di sequenze, per quella
porzione genomica.
Def. A causa dei frequenti errori delle macchine sarà necessario leggere diverse volte la sequenza in
esame. Il numero di letture viene definito profondità di lettura (cfr. sopra). La quantità di errori è definita
dalla Quality Score. Q10 significa un errore su 10 paia di basi, quindi accuratezza del 90%, Q20 1 errore su
100, Q30 1 errore su 1000 e così via. Le macchine Illumina sono molto affidabili, quasi sempre sul Q30.
In figura viene mostrata una porzione del gene K-RAS: in questo caso la depth of coverage è 15, ossia ogni
base del tratto di genoma è stata riletta 15 volte. L’alternanza di citosine e adenine indica una mutazione,
con una frequenza del 53% per la C e del 47% per la A. È probabile che si tratti di uno SNP, una eterozigosi
dei cromosomi in quella porzione di genoma, dato che le due percentuali sono vicine al 50%. In alto troviamo
la sequenza di riferimento, presente nei database, che noi tutti condividiamo (con qualche accezione data
dai polimorfismi), a cui andiamo a confrontare la sequenza ottenuta.
305
Biochimica clinica
306
Biochimica clinica
La seguente immagine, nella tabella in basso ricapitola il numero massimo di reads per ciascuna delle
macchine.
307
Biochimica clinica
presenza di delezioni o amplificazioni nel genoma (come nell’array CGH, ma in questo caso si avrà la
sequenza specifica di ciascuna porzione genica);
• geni di fusione: importanti in oncologia, molti sono geni driver che guidano la cancerogenesi.
Inattivandoli, o con anticorpi monoclonali o con inibitori, si può inibire la proliferazione di queste
cellule e avere un beneficio sul paziente;
• indagini forensi;
• reperti archeologici: sequenziare il DNA a partire da ossa, per verificare l’emigrazione di popolazioni
umane;
• microbioma: estrazione di DNA dalle feci per analizzare la popolazione microbica dell’intestino che
può essere associata a determinate patologie: la maggior parte dei batterî ha sequenze molto
conservate nelle regioni 16S e 23S, quindi grazie alla costruzione di primers particolari che
amplificano tutti i batterî (questo appunto perché sono complementari a sequenze presenti in tutti i
batterî), si otterranno degli ampliconi relativi a diversi batterî. Se poi vengono sequenziati, si potrà
riconoscere quali specie batteriche sono presenti nel microbioma (dell’intestino, dello stomaco, della
bocca, della pelle...) ed eventualmente ricollegarle a varie patologie;
• filogenesi dei virus;
• resistenze dei virus a determinati farmaci antivirali (es. HIV può avere resistenze che si possono
scoprire tramite sequenziamento) o resistenze dei batterî ad antibiotici;
• SARS-CoV-2 può essere sequenziato per rilevare eventuali mutazioni che danno un’aggressività
maggiore o minore allo stesso virus
B3.4.1 Genoma
L’esoma rappresenta solo 1,5% del genoma umano, il resto è
rappresentato da:
• sequenze regolatorie, promotori, enhancers, ecc. (5%);
• introni (20%);
• sequenze ripetute (junk DNA, inserzioni ancestrali di
retrovirus) oppure trasposoni (44%);
• non-coding RNA (lnRNA, miRNA, etc.) (15%).
Per questo motivo non si sequenzia tutto il genoma, ma si fa un
‘’Target enrichment‘’ per trovare le sequenze che sono utili.
2) Sonde che riconoscono sequenze di cattura: ci sono aziende che producono in provetta sonde di circa
50-60 bp, ognuna specifica per ciascun esone, tutte miscelate insieme. Una volta attaccati con delle ligasi
gli adattatori a destra e sinistra dei frammenti, ottenuti per ultrasonicazione, si catturano con le sonde
solo le sequenze codificanti, tramite biglie magnetiche.
309
Biochimica clinica
Queste vengono quindi caricate sul sequenziatore dopo aver lavato via tutte le altre sequenze. Queste
ditte offrono anche pacchetti custom e in questo modo posso decidere di sequenziare anche solo 50
geni. Infine, il DNA viene separato dalle biglie e viene sequenziato.
310
Biochimica clinica
19
Video sull’argomento: https://nanoporetech.com/how-it-works 159.
311
Biochimica clinica
B4.1 INTRODUZIONE
Recentemente sono stati conteggiati 21.306 geni nelle regioni codificanti, anche se ci possono essere piccole
variazioni. Parallelamente abbiamo anche, circa altrettanti, non-coding genes che servono per la regolazione
a livello post-trascrizionale; questi sono i cosiddetti long-non-coding RNA, che sono ancora poco noti perché
scoperti e studiati solo recentemente grazie al sistema della Next Generation Sequencing. 21.000 geni non
sono tantissimi, tant’è che nel 1990 si ipotizzava che l’uomo avesse oltre 100.000 e si ipotizzava anche che il
numero di geni fosse in un certo modo correlabile ad un discorso evolutivo; in realtà non è così: lo scimpanzé
ha 25.000 geni, i cani 19.000, i gatti 20.000. In realtà quello che ci favorisce, soprattutto dal punto di vista
intellettivo, è la nostra capacità di modulare questi geni e anche di cambiarne le potenzialità, per esempio
grazie allo splicing alternativo. Questo è uno dei maggiori metodi che ha la cellula per rendere più
vantaggiose tutte le varie combinazioni di esoni che sono rappresentative dei nostri geni. Fondamentalmente
tutte le cellule del nostro corpo (3.7 x 1013) condividono lo stesso genoma, ma abbiamo cellule molto diverse,
per esempio un neurone è molto diverso rispetto a un linfocita o a un globulo rosso, o ancora a una cellula
muscolare, ma tutte queste cellule condividono lo stesso genoma.
Il genoma contiene dunque informazioni in due forme: genetica ed epigenetica.
La seconda gestisce come, dove e quando questo genoma deve essere espresso ed è quindi importantissima;
ciononostante lo studio dell’epigenetica è uno studio di nicchia, perché è ancora molto indietro. Quest’ultima
è importante anche nei tumori, dove l’equilibrio epigenetico è completamente alterato.
312
Biochimica clinica
313
Biochimica clinica
3. la famiglia delle DNA-Metiltransferasi (DNMTs), che aggiungono gruppi metilici a livello del
DNA: precisamente sulle citosine che precedono le guanine (CpG).
• READERS: sono quelle proteine che leggono le informazioni scritte dai writers e fondamentalmente
possono essere raggruppati nelle Methyl-CpG-Binding-Domain (MBD) proteins.
È quindi una continua modulazione in base alle influenze che l’ambiente esercita sulla cellula.
Le modificazioni istoniche appena viste prendono il nome di codice istonico da un paper uscito su Science
all’inizio degli anni 2000.
314
Biochimica clinica
La famiglia di proteine che si occupa di metilare il DNA sono le DNA-metiltransferasi di cui esistono di due
tipi:
• la DNA-metiltransferasi I è quella che si occupa di
mantenere lo stato di metilazione durante la
replicazione cellulare. Questa riconosce dove è
metilato il DNA del filamento stampo e metila
esattamente nel filamento neosintetizzato le
stesse citosine: così si mantiene il pattern
epigenetico del metiloma;
• le DNA-metiltransferasi 3A e 3B che sono le de
novo-metiltransferasi: sono in grado di metilare
de novo, senza DNA stampo, nuove regioni per silenziare alcuni geni. Sono proprio queste ultime
che nei tumori si attivano e portano ad un’alterazione dello stato di metilazione.
Facendo un calcolo globale di tutte le 4 basi in percentuale nel genoma, statisticamente si potrebbe pensare
che ci sia un rapporto 50/50 tra adenine/timine e citosine/guanine, tuttavia non è così: le citosine e le guanine
rappresentano infatti solo il 42 %. Questo è giustificato dal fatto che le citosine metilate hanno un tasso di
mutazione più alto delle citosine normali: queste tendono infatti a trasformarsi molto più spesso in uracili,
che vengono poi letti come timine alla fine della replicazione e saranno quindi appaiate con adenine. Nel
corso dell’evoluzione questo fenomeno ha portato alla maggior comparsa di adenine/timine rispetto a
citosine/guanine. Tuttavia, la cosa importante è che a livello dei promotori, dove è importante che ci siano
le citosine che precedono le guanine e che possano essere metilate per modulare l’espressione genica, le
315
Biochimica clinica
316
Biochimica clinica
La DNA polimerasi è un enzima estremamente fedele, ha un’elevata capacità di proof reading, infatti essa
ha un tasso di errore di 1.66 x 10-8 bp-1. L’evoluzione ha premiato questo enzima dotato di estrema fedeltà,
in quanto è fondamentale che il genoma a ogni replicazione venga mantenuto stabile, integro; se così non
fosse e la DNA polimerasi facesse un errore di replicazione in una regione codificante, questo errore si
porterebbe avanti a ogni ciclo replicativo e potrebbe dare origine a diverse mutazioni che potrebbero portare
alla produzione di proteine anomale, causando un problema serio e concreto a quella cellula o a quel tessuto.
Le DNA-metiltransferasi, soprattutto la DNA-metiltransferasi 1, deputate al mantenimento dello stato di
metilazione, a differenza della DNA-polimerasi, hanno un tasso di errore abbastanza alto, attorno al 4%. Per
quanto riguarda il trasferimento del profilo di metilazione, ciò che è importante non è la perfetta
conservazione del pattern originale, ma il mantenimento del significato generale. A livello dei promotori vi
sono moltissime isole CpG, quindi se anche una isola CpG non viene metilata specificamente non è un grosso
problema se le altre isole CpG adiacenti sono metilate.
Per quanto riguarda il pattern di metilazione, nella maggior parte dei geni, la regione chiave per decidere se
esprimere o reprimere la trascrizione si trova a cavallo del “punto zero” o TSS (Transcriptional Start Site).
Solitamente questa zona è ricca di isole CpG e proprio qui la cellula decide se silenziare o meno (esistono
alcune eccezioni, ma sono molto poche, come promotori a valle o a monte). È quindi importante la
localizzazione della metilazione. Inoltre, la metilazione può svolgere un ruolo anche nello splicing: la
metilazione di eventuali isole CpG vicine al sito di splicing può influenzare la decisione della variante di
splicing della proteina ottenere.
20
Ad esempio, mutazioni missenso, che provocano la produzione di una proteina con catena amminoacidica alterata,
oppure mutazioni nonsenso che provocano la formazione di un codone di stop prematuro e quindi la produzione di una
proteina tronca.
317
Biochimica clinica
Solo l’1,5% del genoma è codificante, tutto il resto è costituito da quello che viene definito “junk-DNA”.
21
https://www.ted.com/talks/moshe_szyf_how_early_life_experience_is_written_into_dna?language=en
318
Biochimica clinica
2. se il rapporto è alterato, ad esempio nel caso in cui l’età biologica risulti più avanzata dell’età
cronologica, l’individuo è invecchiato precocemente; questo tipo di rapporto viene associato a
malattie legate all’invecchiamento come la malattia di Alzheimer o malattie neurodegenerative.
Quanto detto in clinica ha un risvolto enorme: infatti, se utilizzato in modo opportuno, questo metodo
potrebbe permette di diagnosticare precocemente malattia legate all’invecchiamento. Queste malattie,
prima fra tutte la malattia di Alzheimer, con le tecniche diagnostiche attualmente in uso, vengono
diagnosticate tardi, quando sono già molto avanzate. Una diagnosi precoce potrebbe migliorare la prognosi
e le prospettive di terapia di queste malattie.
Al contrario, esistono persone con età biologica più bassa dell’età anagrafica, per cui l’epigenoma è più
giovane (younger epigenome), aspetto assolutamente positivo.
Il fatto che l’analisi sia fatta dal sangue è un enorme passo in avanti, infatti l’alternativa sarebbe procedere
con una biopsia cerebrale, molto più rischiosa; è proprio questo uno dei problemi degli studî della delle
malattie neurodegenerative, la difficoltà nella raccolta dei campioni a causa della necessità di biopsie
cerebrali o prelievi di liquor tramite rachicentesi.
Infatti, le modificazioni della cellula che causano l’insorgenza del tumore sono sì riferibili ad alterazioni
genomiche22, ma spesso anche a modificazioni dell’epigenoma. Un esempio è un’ipometilazione globale a
livello del genoma: solo l’1,5% del genoma è codificante, la restante parte è costituita da long non-coding
RNA, introni, promotori, ma soprattutto da elementi ripetuti (trasposoni o retrovirus endogeni); questi
elementi ripetuti, come detto precedentemente, possono spostarsi da una parte all’altra del genoma
causando mutazione, quindi devono essere controllati e ciò avviene soprattutto grazie all’ipermetilazione del
DNA. Perciò, mentre nelle cellule normali un’ipermetilazione del DNA a livello di queste regioni evita che vi
siano mutazioni, nelle cellule tumorali l’ipometilazione può provocare l’attivazione di questi elementi
ripetuti, che, saltando da una parte all’altra del genoma, possono inserirsi a livello di una porzione codificante
causando mutazioni.
22
Aberrazioni cromosomiche; cambiamenti del numero di copie, quindi delezioni e amplificazioni; inserzioni e delezioni;
traslocazioni; mutazioni.
319
Biochimica clinica
Ad esempio, sono stati individuati due sottotipi di astrocitoma anaplastico (di grado 3): IDH-mutant e IDH-
wildtype, rilevati appunto tramite sequenziamento della famiglia genica IDH (IDH 1 e 2). Si è visto che
mutazioni di IDH 1 sono associate a prognosi migliori.
La stessa classificazione sarà valida per i glioblastomi: è possibile distinguere glioblastomi IDH-mutant e
glioblastomi-wildtype. È interessante notare come i glioblastomi IDH-mutant (soprattutto IDH1-mutant)
frequentemente derivino da un astrocitoma anaplastico di grado 3: quindi in caso di astrocitoma anaplastico
(spesso IDH1-mutant), nell’arco di due anni dopo l’intervento sarà riscontrabile, tramite risonanza
magnetica, una recidiva locale dovuta alla formazione di un glioblastoma di grado 4, di derivazione
dall’astrocitoma, che presenterà mutazione di IDH1.; rispetto ai glioblastomi primari (diagnosticati
direttamente come glioblastomi) che non hanno mutazione in IDH 1, i tumori mutati avranno una prognosi
migliore. I gliomi con prognosi peggiore saranno quindi i glioblastomi di grado 4 IDH-wildtype.
320
Biochimica clinica
Gliomi
I gliomi sono tumori del sistema nervoso centrale che si distinguono in gliomi di basso grado (grado 1 e 2),
di grado 3 e di grado 4. I gliomi di grado 4 sono detti glioblastomi e sono tumori molto aggressivi: la maggior
parte dei pazienti muore ad un anno dalla diagnosi e l’aspettativa di vita massima alla diagnosi è di due anni.
Le alterazioni legate allo sviluppo di questi tumori possono essere di tipo genetico (in verde) o epigenetico
(in blu):
• nel glioblastoma gran parte delle alterazioni sono di tipo genetico:
o amplificazione del gene EGFR;
o mutazione del gene del retinoblastoma RB;
o delezione di CDKN2A;
o delezione di PTEN;
o alterazione del promotore di TERT (subunità catalitica della telomerasi): è silenziata nelle
cellule non in attiva proliferazione ed espressa nelle cellule staminali al fine di ripristinare,
grazie alla sua attività di trascrittasi inversa, le microporzioni di sequenze ripetute
telomeriche perse ad ogni ciclo cellulare à è un gene espresso anche dalle cellule tumorali,
che così potranno replicare illimitatamente;
• nell’astrocitoma si ha una situazione a metà, con molte alterazioni di tipo genetico e circa altrettante
di tipo epigenetico (ad esempio l’ipermetilazione del promotore di alcuni geni);
• nell’ependimoma le alterazioni sono di tipo epigenetico.
321
Biochimica clinica
analisi del vetrino da parte dell’anatomopatologo, in modo tale da poter meglio prevedere il comportamento
del tumore.
Nei gliomi (in particolare nei glioblastomi), uno dei marcatori epigenetici più importanti e analizzati è il grado
di metilazione di DNA a livello del gene MGMT. In particolare, viene considerato marcatore prognostico
positivo la presenza di metilazione sul gene MGMT, quando il gene MGMT è metilato il tumore risponde
meglio alla terapia.
I glioblastomi sono tumori molto aggressivi, a livello terapeutico vengono trattati con agenti alchilanti come
la temozolomide23, in grado di agire a livello del SNC perché oltrepassa senza problemi la barriera
ematoencefalica. In quanto agente alchilante, la temozolomide aggiunge gruppi alchilici alle basi azotate,
solitamente a livello della guanina, formando degli addotti. Questi addotti rendono la replicazione del DNA
difficoltosa, provocando mutazioni e causando apoptosi delle cellule. Ovviamente questo effetto di apoptosi
si esplicherà maggiormente sulle cellule che replicano molto, in attiva replicazione, come le cellule tumorali.
Fisiologicamente, all’interno delle nostre cellule, esistono dei sistemi enzimatici di riparazione che ci
proteggono da questo tipo di danni causati da agenti alchilanti: uno di questi è proprio MGMT, il quale è in
grado di rimuovere il gruppo alchilico dalla base danneggiata. In condizioni fisiologiche questo meccanismo
di riparazione del danno è enormemente vantaggioso, ma diventa un problema nel caso di una terapia
antitumorale tramite agenti alchilanti, perché va proprio a contrastare la funzione del farmaco.
23
La temozolomide è uno dei pochi farmaci efficaci contro il glioma.
322
Biochimica clinica
Prima dell’utilizzo del sequenziamento, il livello di metilazione del promotore veniva valutato attraverso PCR
con utilizzo di due primer specifici.
1. Una reazione utilizza il primer
che riconosce la sequenza
contenente le citosine che
rimangono tali (quindi le
citosine metilate, non
trasformate dal sodio
bisolfito); questo primer quindi
lega l’allele metilato.
2. Una seconda reazione utilizza il
primer che lega la sequenza
contenente citosine diventate
timine (quindi le citosine non
metilate, che sono state
trasformate dal sodio
bisolfito); questo primer lega
quindi l’allele non metilato.
Tramite questa tecnica si analizza quindi la presenza di alleli metilati e si valuta quante cellule sono metilate
e quante no.
Lo stesso tipo di valutazione può essere eseguita con la Next Generation Sequencing: successivamente a
trattamento con sodio bisolfito, viene sequenziato il promotore del gene MGMT analizzando l’eventuale
presenza di uracile (riconosciuto come timina) al posto di cisteina, nel caso in cui la cisteina non fosse
metilata. [domanda d’esame frequente]
Il trattamento con temozolomide è previsto anche per i pazienti che non hanno il gene metilato, per i quali
tuttavia il farmaco non risulta estremamente efficace. Sono in corso trial clinici che prevedono la
combinazione di più farmaci (tra cui anche la temozolomide), ma non si è giunti ad una cura efficace. Anche
per i pazienti con promotori metilati, per i quali la terapia ha un’azione positiva, l’allungamento
dell’aspettativa di vita è pari a pochi mesi, al massimo uno o due anni.
24
L’uracile nel sequenziamento verrà riconosciuto come timina.
323
Biochimica clinica
In base al rapporto tra i prodotti che si ottengono dalla reazione di PCR è possibile dedurre se il gene è
maggiormente metilato o non metilato.
[Dalla dispensa di Murciano] Quindi, se tramite la PCR si aveva l’amplificazione del solo allele non metilato
(unico prodotto della PCR) voleva significare che quel gene non era assolutamente metilato o almeno che in
quella regione analizzata con PCR non si era verificata metilazione. Se dunque il primer riconosce le citosine
vuol dire che la sequenza a cui si lega è metilata, se riconosce le timine vuol dire che non è metilata. Molto
frequentemente si possono avere anche avere due prodotti di PCR positivi, dal momento che su un cromosoma
può essere avvenuta la metilazione e sull’altro no [mi sembra di aver capito che in questo caso entrambi i
primer (uno che riconosce i siti metilati e l’altro che riconosce le timine, dunque le citosine non metilate) si
legano a due cromosomi differenti che presentano rispettivamente citosine metilate e non, e quindi si
ottengono due prodotti di PCR positivi. Da questo se ne deduce che se il gene è molto espresso, tutti e due gli
alleli non sono metilati.
25
Mutazioni di IDH1 sono associate a prognosi migliori.
324
Biochimica clinica
non ci sono. Un’eccezione a questo è rappresentata dal glioblastoma secondario, tumore derivato da un
astrocitoma anaplastico (grado 3): in caso di astrocitoma anaplastico (spesso IDH1-mutant), nell’arco di due
anni dopo l’intervento (solitamente dopo 6 mesi) sarà possibile riscontrare, tramite risonanza magnetica,
una recidiva locale dovuta alla formazione di un glioblastoma di grado 4; questo glioblastoma viene definito
secondario ed essendo di derivazione dall’astrocitoma, presenterà mutazione di IDH1. Questo è l’unico caso
di glioblastoma con mutazioni di IDH.
I geni IDH1 e IDH2 wildtype (wildtype significa non mutato) codificano per enzimi coinvolti nel ciclo di Krebs
che portano alla formazione di α-chetoglutarato. I geni mutati, invece, portano alla formazione di 2-
idrossiglutarato. Il 2-idrossiglutarato è un oncometabolita che va a inibire le proteine TET, che sono delle
demetilasi, quindi proteine coinvolte nella demetilazione del DNA. Se queste proteine sono inibite e quindi
non possono esplicare la loro azione di demetilazione, aumenta il grado di metilazione dell’epigenoma. I
tumori IDH-mutant sono ipermetilati (fenotipo G-CIMP= Glial CpG Island Methylator Phenotipe) e
normalmente questo si associa a una prognosi favorevole; i pazienti con questo tipo di tumori possono
sopravvivere fino a 4/5 anni, al contrario dei pazienti affetti da tumori IDH-wildtype che nella maggior parte
dei casi muoiono a un anno dalla diagnosi.
[Dalle diapositive] Non sorprendentemente le proteine che legano gli istoni per leggere il codice di
modificazione e che lo mettono poi in pratica, sono frequentemente mutate nel cancro, causando un
malfunzionamento del signaling cellulare. Mutazioni in proteine associate alla cromatina o regolatorie sono
diffusissime nei cancri pediatrici, e la loro prevalenza in questi frequenti tumori ne sottolinea l’importanza
nell’oncogenesi. Nel 2012, gli sforzi sul sequenziamento del genoma hanno portato all’importante scoperta
che gli stessi istoni possono essere mutati nei tumori. Due gruppi hanno identificato mutazioni somatiche, con
elevata frequenza, nell’istone H3 nel glioma pediatrico ad alto grado (pHGG). Studi successivi hanno esteso
l’ampiezza di questa mutazione anche a condroblastoma, tumore osseo a cellule giganti, condrosarcoma,
sarcoma pediatrico dei tessuti molli, carcinoma a cellule squamose della testa e del collo e leucemia.
325
Biochimica clinica
Considerando la top list tra tutti i tumori, i tumori delle labbra, del
cavo orale, della faringe e orofaringe si collocano al sesto posto;
quindi, non è un tumore molto comune, ma neanche troppo raro. A
livello globale i paesi col tasso maggiore di questo tumore sono
India, Pakistan, Nuova Guinea, Ungheria, Francia e anche gli Stati
Uniti hanno un’incidenza abbastanza alta. L’incidenza è alta in
questi paesi perché molte persone sono abituate a masticare foglie
di vite o di tabacco che possono portare allo sviluppo di carcinomi
(es. carcinoma della lingua).
In Italia questi tumori sono associati soprattutto al fumo e alle
infezioni da HPV, ma non necessariamente.
326
Biochimica clinica
Si può cercare di identificare questi tumori in modo precoce analizzando le mutazioni presenti in questi
carcinomi. Ad esempio, facendo un test per p53 si potrebbe trovare il 72% dei pazienti con la mutazione, ma
si perderebbero i restanti pazienti che non presentano una mutazione per p53. Quindi non è la via giusta
sviluppare un test di diagnosi precoce a livello mutazionale perché questi presentano bassa sensibilità;
possiamo quindi considerare le modificazioni epigenetiche.
327
Biochimica clinica
Per effettuare questo test si utilizza uno spazzolino, come quello utilizzato nel pap-test. Dopo aver spazzolato
la mucosa dove si è osservata una lesione, si inserisce la parte terminale dello spazzolino in una provetta
contenente un liquido preservante26 DNA e RNA. Nel laboratorio sul campione è eseguita l’analisi NGS.
Questi 13 geni sono in grado di discriminare il tumore dal tessuto normale ed il test possiede una sensibilità
del 97% ed una specificità del 100%27.
Si tratta di un pannello di 13 geni la cui valutazione quantitativa dell’alterazione epigenetica ci consente di
sviluppare uno score: se il paziente supera una determinata soglia (1.06) sarà positivo e avrà un alto rischio
di sviluppare tumori; andrà quindi direttamente a fare la biopsia e a seguire tutti gli step di diagnostica
classica.
Si è inoltre potuto osservare che il test, oltre a essere importantissimo nel ricercare la positività dei pazienti,
dà indicazioni anche sulla prognosi:
- Il gene LINC0059 (è un long non coding RNA), è stato associato alla grandezza del tumore (T1 e T2
erano molto più metilati);
- Il gene EPHX3 è correlato alla presenza di metastasi (i metastatici erano poco metilati);
- Il gene ITGA-4 indica se la futura lesione può andare incontro a recidive o meno (in base allo stato di
metilazione si è potuto vedere che i pazienti con gene metilato hanno un rischio di recidive molto
più alto rispetto a quelli non metilati).
Un altro dato molto sorprendete riguarda i pazienti operati da questi tumori: prelevando con uno spazzolino
un campione dalla mucosa orale (nel punto dove è avvenuta la resezione) di uno di questi pazienti, se il
chirurgo ha svolto il suo intervento in modo accurato, il paziente si sarà negativizzato; i casi che invece si
positivizzano presentano recidiva.
Quindi questo test ha anche un impatto prognostico: si possono seguire anche pazienti già operati nel follow-
up, cui viene periodicamente effettuato un prelievo di cellule della mucosa buccale in corrispondenza della
zona operata per valutare se queste cellule tornano a essere positive; in quel caso vorrebbe dire che sono
rimaste alcune cellule dopo l’operazione che si stanno continuamente dividendo e che possono dare origine
a recidive loco-regionali o a metastasi, ed è quindi necessario intervenire nuovamente e rimuovere quella
porzione di tessuto.
26
Il liquido preservante consente di conservare DNA e RNA per circa un mese a temperatura ambiente.
27
I dati sono stati confermati da un’analisi multicentrica svolta in Italia.
328
Biochimica clinica
Alcuni processi di mutazione somatica generano mutazioni multiple in un singolo evento catastrofico,
tipicamente raggruppate in un’area genomica, portando a una sostanziale riconfigurazione del genoma. La
cromotripsi permette, in alcuni tipi di tumore, di accumulare moltissime mutazioni, per cui tutto il genoma
viene completamente stravolto.
Osservando la top list dei tumori più mutati, il melanoma è il più mutato in generale: per mutazioni
puntiformi, delezioni, inserzioni e retrotrasposizione (dovuta a quegli elementi ripetuti, che vengono
silenziati grazie alla metilazione del DNA, che possono riaccendersi e saltare lungo il genoma dando problemi
specialmente se accadono in porzioni codificanti).
329
Biochimica clinica
neoformazione cancerosa può essere anche in parte eterogenea dal punto di vista genetico, ci sono alcuni
cloni con determinate mutazioni e cloni che ne possono portare altre. Il genoma dei tumori perciò è dinamico.
28
Multiclonal Invasion in Breast Tumors Identified by Topographic Single Cell Sequencing.
29
Intratumoral Heterogeneity in Recurrent Metastatic Squamous Cell Carcinoma of the Oral Cavity: New Perspectives
Afforded by Multiregion DNA Sequencing and mtDNA Analysis; Prognostic impact of intra-field heterogeneity in oral
squamous cell carcinoma.
330
Biochimica clinica
30
Il “concetto della cancerizzazione di campo” (“field cancerization”) consiste nella teoria che, in una certa area della
mucosa orale, le cellule epiteliali subiscono un danno genetico che le induce a proliferare in maniera clonale. Questo
concetto spiega perché certi pazienti sviluppano più di un carcinoma orale con modalità sincrone o metacrone [da
internet].
331
Biochimica clinica
Uno dei problemi di questa metodica è legato all’invecchiamento: questo determina degli effetti confondenti
dovuti a cellule fisiologicamente in apoptosi.
Inoltre, il sistema NGS (Next Generation
Sequencing) può generare qualche errore;
bisognerà quindi distinguere se ciò che si analizza
sia il risultato di una mutazione tumorale reale
oppure un problema “tecnico” del sistema.
È necessario quindi partire da un grande
campione da analizzare (si parla di decine di mL di
sangue) per avere dei risultati consistenti e
veritieri.
Nei tumori cerebrali è molto difficile monitore il
tumore tramite liquid biopsy utilizzando un
prelievo di sangue; tuttavia, è possibile trovare
traccia del materiale genetico tumorale nel liquor che però può essere prelevato una volta (al massimo due
volte) soltanto nel corso della vita del paziente.
B6.3.2 Esecuzione
Per il prelievo del campione, viene utilizzata una particolare provetta che consente di mantenere integri gli
acidi nucleici: in queste provette ci sono delle sostanze specifiche per la preservazione a temperatura
ambiente di DNA e RNA.
Per il prelievo viene usato il plasma e non il siero: anche se nel siero si ha una maggiore quantità di DNA,
quest’ultimo deriverà dalla lisi dei linfociti, aumentando così il background wild-type di materiale genetico,
mentre con il plasma si avrà poco DNA da linfociti.
La standardizzazione deve essere massima, a partire dall’utilizzo degli stabilizzanti per mantenere integri gli
acidi nucleici.
Una ditta chiamata CellSearch propone un test che si basa sul prelievo di 7,5 mL di sangue e che grazie a un
sistema di riconoscimento antigene-anticorpo di cellule EpCAM+ riesce a riconoscere le cellule epiteliali di
origine mammaria e quindi a identificare le cellule tumorali della mammella in circolo.
332
Biochimica clinica
Secondo questo test, trovando almeno 5 cellule tumorali positive in circolo su 7,5 mL di sangue significa che
ci sono tante cellule tumorali in circolo poiché il tumore sta proliferando molto e la prognosi è normalmente
cattiva.
Un numero di cellule > 5 nel campione isolato indicano una prognosi peggiore, quindi in base al numero di
cellule circolanti mammarie si descriverà la prognosi del tumore.
La soglia di 5 cellule nel campione prelevato è variabile da tumore a tumore: per alcuni tumori la soglia è
spostata a 6 cellule, mentre in altri casi resta 5.
Inoltre, si cercherà il circulating circle DNA (DNA circolante in circolo) per determinare se i frammenti in
circolo presentano mutazioni o modificazioni epigenetiche.
Ricapitolando, dopo molti studî si è visto che la soglia 5 determina, se positiva, prognosi peggiore, se
negativa (quindi sotto le cinque cellule), prognosi migliore. Questa soglia non è sempre veritiera, infatti su
numeri molto alti si trovano alcuni falsi positivi e alcuni falsi negativi. Un altro svantaggio è che non si possono
analizzare queste cellule positive tramite NGS. Si stanno sviluppando però altre macchine che catturando
queste circulating tumor cells ne permettono il sequenziamento tramite estrazione del DNA.
333
Biochimica clinica
non invasivo; con un prelievo di sangue si vedono le mutazioni che avvengono a livello plasmatico, quali sono
le mutazioni che escono ogni 3 mesi da questo tumore e si valuta se danno resistenza o meno ai farmaci in
uso in modo da modulare la terapia.
B6.3.5 Conclusioni
Attualmente, più di 60 prove con un accumulo previsto di più di 20.000 pazienti con 11 tipi di cancro, stanno
affrontando le sfide poste dalla biopsia liquida.
Limitazioni:
• standardizzazione della procedura di raccolta del sangue per migliorare la stabilità dei campioni a
temperatura ambiente;
• definizione dei metodi di quantificazione del ctDNA;
• standardizzazione dell'isolamento di ctDNA per migliorare la resa e migliorare la sensibilità del
rilevamento di ctDNA per rare alterazioni molecolari per anticipare la farmacoresistenza.
In conclusione, la prossima generazione nell’approccio alla biopsia liquida probabilmente fornirà una migliore
potenza diagnostica, ma la domanda rimane: i trattamenti guidati dalla biopsia liquida si tradurranno in
risultati migliori?
334
Biochimica clinica
1. I test biochimici sono svolti su tutto il corpo? No, i test biochimici possono essere svolti solo su
campioni di tessuto.
2. In quale fase solitamente occorrono errori nei test biochimici? La maggior parte degli errori avviene
nella fase pre-analitica.
3. Il siero e il plasma sono completamente identici dal punto di vista biochimico per essere utilizzati in
saggi differenti? Per molti – ma non per tutti – gli esami svolti col sangue, c’è una piccola differenza
se a essere utilizzato è il plasma e non il siero, e viceversa. Il plasma è preferibile per i test di biologia
molecolare.
4. Come si calcola il valore predittivo positivo? Veri positivi / (Veri positivi + Falsi positivi) x 100%
5. Quale strumento statistico può essere utilizzato per identificare la corretta soglia per discriminare
pazienti sani e malati in un saggio valutativo quantitativo? Curva ROC.
6. Cosa è la precisione in un test biochimico? Il grado di dispersione (come varianza, deviazione
standard o coefficiente di variazione) in una serie di misure dello stesso tipo effettuate in specifiche
condizioni.
7. Quale non è un’importante causa di variazioni individuali in un saggio biochimico? L’istruzione, ad
esempio.
8. Come si calcola la sensibilità? Veri positivi / (Veri positivi + Falsi negativi) x 100%
9. Come si calcola la specificità? Veri negativi / (Veri negativi + Falsi positivi) x 100%
10. Come si calcola il valore predittivo negativo? Veri negativi / (Veri negativi + Falsi negativi) x 100%
11. Qual è il concetto dell’Umbrella trial? Un tipo di cancro, differenti mutazioni genetiche, si testano
molteplici farmaci per la specifica mutazione.
12. Cosa è un companion diagnostic test? Identifica i pazienti che sembrano beneficiare di una
determinata terapia. Identifica i pazienti in cui aumenta il rischio di effetti collaterali in seguito a una
specifica terapia. Monitora la risposta al trattamento con un particolare prodotto terapeutico per
adeguare il trattamento al fine di migliorarne la sicurezza e gli effetti.
13. Cosa può valutare la FISH? Copy number variations, larghe delezioni, riarrangiamenti genici, ecc.
14. In quale condizione sono comuni le delezioni 1p, 19q? Oligodendroglioma.
15. Gli expression arrays possono essere informativi sulla prognosi del cancro al seno? Sì, è stato validato
recentemente.
16. Cosa può individuare l’ACGH? Delezioni e amplificazioni nel genoma d’interesse.
17. Cosa individuano i companion diagnostic test di Cetuximab? Le mutazioni di KRAS.
18. Cosa può individuare la real time-PCR allele specifica? Mutazioni in un singolo punto.
19. Qual è il limite del sequenziamento di Sanger? Il 20% degli alleli mutati.
20. Quale potrebbe essere il limite della real time-PCR allele specifica? Solitamente è stimato tra 0,1-1%.
21. Quanti geni codificanti ha l’essere umano? Circa 21000.
22. Cosa s’intende per epigenetica? È lo studio dei cambiamenti nella funzione dei geni che è ereditabile
e non comporta cambiamenti nella sequenza del DNA.
23. Possono le modificazioni epigenetiche essere influenzate dall’ambiente? Sì, l’ambiente e il
microambiente possono cambiare la struttura cromatinica, le modificazioni degl’istoni e la
metilazione del DNA.
24. La metilazione degli istoni è sempre correlata col silenziamento genico? No, la metilazione agl’istoni
su H3-K9 e H3-K27 è stata correlata al silenziamento, mentre la metilazione a H3-K4 e H3-K36 sono
segno di espressione genica.
25. Quale base è solitamente metilata? C che precede G (CpG).
26. Le isole CpG sono importanti nel silenziamento genico? È vero, ci sono specifiche CpG, solitamente a
livello del promotore, ma con alcune eccezioni, che hanno un ruolo chiave nel sopprimere
l’espressione genica.
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Biochimica clinica
27. L’eterocromatina è sempre associata a uno stato inattivo dell’espressione genica? Sì, nelle regioni di
eterocromatina tutti i cinque strati dell’organizzazione cromatinica assicurano che i geni vicino a
queste caratteristiche stiano inattivi.
28. Le modificazioni istoniche sono dinamiche? Sì, gli istoni possono essere modificati da writers ed
erasers per adattare la cellula alle condizioni ambientali e queste modificazioni possono essere
interpretate da readers.
29. Le isole CpG a liovello del promotore controllano l’espressione genica? È vero, le isole CpG sono
regioni ricche di CpG ipermetilate in geni dow-regolati o silenziati, e ipometilate in geni espressi a
livello del promotore.
30. LINEs e SINEs sono elementi ripetuti nel genoma umano che sono ipermetilati a livello del DNA? È
vero, l’ipermetilazione di LINEs e SINEs sopprime il loro potenziale di trasposizione per evitare
instabilità genomica.
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Buono studio!