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Ely730@libero.

it 11 Feb 2023

Biologicamente di Esposito Francesca 1

Biochimica
GLI SCHEMI
STRATEGICI
Scritti Da Esposito Francesca (by Biologicamente)
Ely730@libero.it 11 Feb 2023

Biologicamente di Esposito Francesca 2

Ciclo di Krebs
1. Condensazione e idrolisi . Enzima=citrato sinstasi

1
o
o
o

CoA

C
ll

-co,Ht.-ö
C
o C HzO

-5-COA
¿= ll

x
C
1-0
o
t
5 -
coa
=.

èitz
CH3
Cız

iHt.
AcetilCoA CHz
ño èo
éio
c C
1

Ö I

o
Ossalacetato
o

E Citrato
CitrilCoA
C C C

c c c c c c

c c c c c c

2. Isomerizzazione. Enzima=aconitasi
o

FHt
-


-

w O

ê
fHt


HzO
HzO
CHtH
P - to
H H o

H
-
GottO
äö
- o t C

ÇHz Çu
èio èo
I

o
-
Citrato CIS-aconitato Isocitarto
c c c cc c
c c c c c C
c c c
c c c

3. Decarbossilazione ossidativa . Enzima=isocitrato deidrogenasi

o
-
-
Ft
-

o

o

feHti
NADH

êtöö
NaDt Ht
H
+
COz
o
-0 - C H
1
Dc
-

~
o
-
o
o o D

êot
Ossidazione

ço
Decarbossilazione

o
I
e ossidazione
çéö o

Isocitrato Ossalosuccinato Alfachetoglutarato


c c c c c c C
c c c
c
c c c c c C
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Biologicamente di Esposito Francesca 3

Ciclo di Krebs
4. Decarbossilazione ossidativa. Enzima= complesso dell’alfachetoglutarato deidrogenasi
o

ll
c

coó
I
coa coz

FH
C
NaDt
L
NADH

B çttz
-HH
çö
CHz

è Legame tioestere
=oș
o
A Co

Alfachetoglutarato SuccinilCoA
c c c c
c c c c C

5. Fosforilazione al livello del substrato del GDP. enzima= succinilCoA sintetasi


coó
i

coó
CHz Pi coA I
I

GDP GTP
CHz L ß Cz
D

è èaz
>
¿
=oș
A Co

SuccinilCoA Succinato
c c c c
c C C c

6. Ossidoriduzione. Enzima= succiato deidrogenasi

coó
l
FAD FADH
e
-coó
2
ß
Cit l
D

A CH
¿
ó YH
¿ o oo
-

Succinato Fumarato
C C C C c c c c
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Biologicamente di Esposito Francesca 4

Ciclo di Krebs
-

8. Ossidazione. Enzima=malato deidrogenasi

oó Ht

Ę
NADT NADH O
\\ rcoó
H- D -
H
WD e
1

HH CHz
--
I

oó coó

Malato Ossalacetato
c c c c c c c c

7. Idratazione. Enzima=fumarasi

Ę
-
coó
HzO

ę
HO H
L
D

H Ht
o YH
-oo

Fumarato
Malato
c c c c

c c c c
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Biologicamente di Esposito Francesca 5

Beta ossidazione
Fase 1: gli acidi grassi devono recarsi nel mitocondrio

1.1 Step citosolitico


AMPt
olegame toesteRE
PPi
ATP

%....+
Il
HS
L icoa
i
-c0a
R s
o
R aciLcoo
acido SINTETASI
coenzimaA aeicoa
grasso

CITOSOL MITOCONDRIO

1. grasso acil adenilato


ATP
-
-D
o

.. Y
Yanyacil OPIROFOLFAP -THIO
TATP-
acidO
crasso adenitato

O
o

2 il FHS -
p AMD
-LOA
-At
Manp
R

acil adenilato tioestere

1.2 Trasporto nel mitocondrio

R
\

kgcathzçNİLĞÇo
ii ko
H

WO
3
i
-
IN
+
%E..OtHS-CoA
H3
alicoa
CaRNItina H3
C
( se igranona
solo
yı acilcarnitina
4e)
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Biologicamente di Esposito Francesca 6

Beta ossidazione
1. Ossidazione DOPPIOLEGAME Cz

-C3
FABHz
ii
FAD
ii
L P
rmerëarens
k
coA D -

coa
alIL Coa
Hz ¥
-çtzêçzs
DEIDROGENASI
acilcoa
TRANS A

2-ENOKLCOA
-
2. Idratazione

êòoll
Rerözgİns -
HzO
R
enc
C

-'s-CoA
coa
~

Hz
D
Ç H P
ENOIZ COALDRATASI 2
+
L COA

-3-IPROSSIACI
TRANS
-S2-ENOILCOA
3. Ossidazione

DHt

UL NADI ii
o
NADt
11 L D
k
-çtéömçptns-coa
RÇź
C
-cng-coa
BETA
-IDROSSIACIL-COA
Á R DEIDROGENASI
coa
b
-chetocacil
L CDA
-3-SPROSSIACK
4. Tiolisi

HS o
-CoA
o

ii
tHse
ll
ll
Ru

ÇéÇtş bRçźes
-coa
-ång-coa
-ozl
tiolasI
acilloa ACETIL COA
" DI
l J wmß
2
ACCORCIATO
I
b
-chetocacilcoa
b
ATOMI DI CARBONIO corpi
chetonici

krebr
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Biologicamente di Esposito Francesca 7

Ossidazione mono/poli insaturi


Monoinsaturi Polinsaturi

il
~ ~§
ş ş
s

-coA
OleoilcoA
Beta-ossidazione
.

(3 cicli) B
3 Acetil-CoA

țííscon CIS- deltatre-


dodecenil-CoA
I [enoilcoA]

Enoil-CoA isomerasi
l

H o
Il AdenoilCoA reduttasi
i ll Trans-deltadue-
s dodecenil-CoA
-coA
H

Idratazione
o

Beta ossidazione
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Biologicamente di Esposito Francesca 8

Ossidazione grassi con numero


dispari
H
Beta-ossidazione
o I

mywä H C -

H
-
D
-scoa
} - H
H
T Propionil-CoA
5 Acetil-CoA
çocoa
FHCOż
Propionil-CoA r
ATP

BiOtiNa
carbossilasi
\, ADP +

Pi
o

çi
l

O
\
E
f
t D-Metilmalonil-CoA
àio
o

5
oA.
Metil-malonil- Ciclo di
CoA epimerasi Krebs
l ^

Ho
I Coenzima
H t
i
C
B12
=
-H
.-1
C

düit Metil- i
o
5
coA
H -
C-H
5
ò+
l
co A malonil-CoA C

mutasi ò ìo
o
L-Metilmalonil-CoA Succinil-CoA
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Biologicamente di Esposito Francesca 9

Corpi chetonici
o
o

chz t
CH
ll

-à-scoa
3-C-SCOA
Acetil-CoA Acetil-CoA

#-
scoa
0)
a
c
Tiolasi
f
o

ą
CH
ll

3-CH2-C-SCOA
Acetoacetil-CoA
o

ll

120+ CH - -
SC0A
@
3-C
HMG-CoA sintasi
H I
-
-SCOA
x

OH o

ll

OąC
èiz
-
CH2-C-SCOA
-CHz-
HMG-CoA

O
3

6 HMG-CoA liasi

o O

C
ll
QC
-cHts
CH
-CHzt
3-4-scon.
Acetoacetato Acetil-CoA
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Biologicamente di Esposito Francesca 10

Biosintesi acidi grassi


Attivazione
FACETILCOAT FCO FATP FMALONIL FADPTIPI

2T
Acetil-CoA

-COAT
-D
PRE-STADIO (1) Trasporto di AcetilCoA dal mitocondrio al citosol

411
C000
ATP
ADD
tooo
l
e

LcoA
HS HC
2
B 1
tCoA
CITRATO SINTASI e
¿
-oo0t
ooo
eito
ossacacetato o
o

o o trasportatore citrato
D
citrato
dimetibrana
I l
l 1

MITOCONDrIO CITOSOL

PRE-STADIO (1) Trasporto di AcetilCoA dal mitocondrio al citosol

1
ooo
,
C0oo
ATP X
0
ADP
Hz C
e
I i Pi
-sloA
o
C L ß èH i
\
t
CHtz
-6000
D
-C-SCOA
eito ATP ¿ ACETICOA
ooo
-CITRATOLIASI
o oo
o
ossalacetato
citrato

CITOSOL

PRE-STADIO (1) L’ossalacetato rientra nel mitocondrio

cooo eoo
o
ENTRANEL MITO CONDRIO

eH
e NADH

Ht
L
NADT

$ p MITOCONdrIO
D
nHtdetr
¿ (,
MALATO

4000
ooo
DEIDROGENASI piruvato
-
B
ossacacetato OSSIPATO
malaTO

CITOSOL
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Biologicamente di Esposito Francesca 11

Biosintesi acidi grassi


FASE INIZIALE :Attivazione dell’acetilCoA

L’acetilCoA per entrare in biosintesi viene formato il malonil-CoA


L’acetilCoA è un enzima a
o
coz 1 biotina. La biotina è legata
lo \
l e
all’enzima e funziona come
i

CHz

-CHt-C
2
'-
I
-C
0
^ ACETIL o
braccio mobile che trasporta

CoA
-CoA
S-COA
CARBOSSILASI
ACETIL malonicoa CO2 fino al dominio
-COA
transcarbossilasi dove reagisce
con l’AcetilCoA

FASE CENTRALE

10.
O Lega l’acetilCoA
^\ r
e
-
CH
e
-

'
I
3
0
o o
s-CoA
~
MALONILCOA
Oapo
D
trasferimento O Lega il malonilCoA
-
ru

EFASJ ACIDOGRASSO SINTASI


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Biologicamente di Esposito Francesca 12

Biosintesi acidi grassi


primo ciclo della biosintesi (1) CONDENSAZIONE DI CLAISEN

o coz o
o o

è A CHz

-à-CH2-à-5-ACP
-chz-Ü-S-ACp
rro D
j a
¥

3
O

6 CHts
ACETOACETIL

-ACP
-E-5-KS
-
DACETILCOA
cegałoaks
MALONIL COA
legato
alliACP

primo ciclo della biosintesi (2)


RIDUZIONE DEL GRUPPO
CARBONILICOB

H
+
H o
NADP
CH
+
o o NADPH

3-C-CHZ-C-S-ACP
ll

CHtz -
DW ÖH
S-ACP
-à-eHa-C
B
3
BETA
-IDROSSIBUTIRRIL-ACP
primo ciclo della biosintesi (3) DELDRATAZIOne

cHs
H O HzO

Chtz -
-Üçà-s-ACP
D
S-ACP
-à-CHta-à
ÖH
TRANS BUTENIL
-ACP
-DELTA?
BETA
-(DROSSIBUTIRRIZ-ACP
primo ciclo della biosintesi (4) VIDUZIONE DEL DOPPIO LEGAME

Ht
o

chs NADPIP
o
NADPH

CH
-Ü=q-Ü-S-ACP
D
3-C2-C2-Y-S-ACP
TRANS BUTENIL
-ACP
-DECTA?
BUTIRRIL
-ACP
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Biologicamente di Esposito Francesca 13

Glicogenolisi
STADIO 1
Estremità non
riducente

çkoÜİİoLÜÄt"
o-
H OH
"a
Glicogeno fosforilasi
kPiA

HotY Ho
CHZOH

$
ö"O!
r
OT
lo
Tou
20H
-
õ
"WOK-TH10
.
Glucosio 1P Glicogeno accorciato di 1

STADIO 2

STADIOL

¤ Sposta un blocco di 3 residui glicolitici


dall’estremità di una ramificazione a un’altra STAD
102
i
Idrolizza il legame 1,6

STADIO 3

FCHtzOPOz
-
fosfogcucomutasi
-_
-
-
-

GLUCOSIOLFOSFATO glucosio gfosfatO

Glucosio 1-

oöŞnö
fosfato
*useusezseîtüiİm
Fosfoglucomutasi
L’enzima cede un gruppo Formazione di un Il gruppo fosforico al C1 viene
intermedio con due donato all’enzima per ottenere
-

fosforico al glucosio 1 fosfato


-

-
gruppi fosforici glucosio 6 fosfato
-
- -
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Biologicamente di Esposito Francesca 14

Sintesi del glicogeno


STADIO 1
W
o
il

cich
HH
N
HY
=
NN o e
čH

-CH
îykitîonkîoOoOcıdŞÅğûkûmîâî öomçûkölİâkpi ¿.
UDP-glucosio
pirofosforilasi

Glucosio 1 fosfato UTP UDP-glucosio

STADIO 2

CHZOH CHZOH CHzOH


l

"
ho
lot I
HóV 1 "
tal b
ito
Op -
-0
Öu
kor
uridlina
Q
kaòóò
ADP- glucosio Glicogeno

6Glicogeno sintasi
CH CHzOH CHZOH
2OH
tal9
Lo L
-o
2-0 p I l

e
mp-0
+

+ai K
+
-Quridina
kòóò d

Lor
1
ax
L

UDP P
cegame
Lf
14
STADIO 3

enziraramificante
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Biologicamente di Esposito Francesca 15

Catabolismo amminoacidi
Transaminazione ( il gruppo amminico è rimosso dall’amminoacido

coó coó tcoo coó


l

HC
e

-HtNH3"
t l
-HN
e C
-

=0
+
=o
l t
3
i i

D
Transaminasi
éete Amminoacido
CHtz
CHz
átz
Alfachetoacido
I

coõ
èoó generico
Glutammato
Alfa chetoglutarato

Deaminazione ossidativa

coo
t
Ht coó
H
Ne
3"
l
-tt
t NADPH
{
NADP
ezo
CHz C P
l

CH \
éte t NHat 7
2
Glutammato
I

Viene integrata
coõ
deidrogenasi čtte nella molecola di
L-Glutam mato carbamil fosfato
èoó
Alfachetoglutarato
6
Nuova
transaminazione
I
Krebs
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Biologicamente di Esposito Francesca 16

Trasporto dell’ammoniaca
tooc

-cHzcHz-çñH3coo
L-glutammato
Glutammina
sintasi
!
rATP

WDADP

o o NHs
- C CHz CH CH

-coo
O D
."
"0
2--
ò Glutammato fosfato
-
!
Glutammina
rNHa
sintasi LdPi

İ
-cHtz-cHz-Çİ3coó
H
L
N
Glutammina

Glutamminasi HzO

I
T

LD NHE UREA
-D
o
NHs
Cit Cit ¿
H-coo
2
L-Glutammato
2
O

Carbamil fosfato
ADP

Pmo
ADP ATP ADP
O o o o o

l mê H
,Nrü-o-o-
oOHeNr
-å-atmp"-o-e-oits
- ò
5-o-O
Bicarbonato Carbammato
ÖAtp Anidride acida
Carbamil
fosfato
carbonica-fosforica
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Biologicamente di Esposito Francesca 17

Ciclo dell’urea
Reazione 1 (luogo= mitocondrio)

Carbamil fosfato

NHz
Ornitina Pi
o

o coó P
fHzN
D

-Ü-NA-çtz)s-úñHscoó
Ornitina

-CHz-CHz-CHz-CllH
il
YNH

3
N C
Hz
opOz Transcarbamilasi
-

Citrullina
-

Reazione 2: (luogo=citosol)
AMP
coó
Asp
CHz

NHz ouć TVH


PPi
o ATP

L P D COO
-Ü-vA-çtz)s-û7Á3.co0
t
H N
C -

CunH
Argino succinato TNHzt

-NH-CCH2],
Citrullina sintasi Argino succinato

Reazione 3 (scissione)
L

coó
krebs
ß
-
i

CHz coó
o c
i
o
CNHzT
o
i

HeC ÑVH
A DHIN t Fumarato
Arginosuccinasi
=IHINH-CHO),
C
0O
I
C Arginina
-NH-CCHz),-Cu
H N

îNHst
Argino succinato
.

Reazione 4 (idrolisi)

o
ll

HZN -
coó Hz
0
HzN t too
l
CIHNHst -- HzN
-e-NHz
=NHINH-CHe),
-CHz-CHz-CHz-CillH
Arginasi YNH
D
5
Arginina Urea Ornitina
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Biologicamente di Esposito Francesca 18

Glicolisi
Stadio UNO

CHzOH CHzOPOź
o o
H H it
H
ESOCHINasI H
H

+
H
t ADPT
OH OH H
H
\

t ATP
! OH !
\

OH OH
OH
Mgzt
OH H OH
H

glucosio glucosiogfosfato

Stadio DUE

CHzOPOź fosfoglulosio
CHtaOH
isomerasi CzOPOź
H
H
O
H \

I i H O
l
OH H
\

i
OH
|
H

OH ! OH
H O H
H OH
FRUTTOSIO GFOSFATO

glucosiogfosfatO

Stadio TRE

CHzOPOŹ
CHzOPOź
CHtzOH
CHZOPOź
I I Itu I
TADP TH
+
i H D T ATP

l
OH

l i
OH H
i
H

fosfofruttosio chinasi
H O H O H
H
Mgzt
D
FRUTTOSIO GFOSFATO FRUTTOSIO 116 BISFOSFATO
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Biologicamente di Esposito Francesca 19

Glicolisi
Stadio QUATTRO

HzOPOź

ğ
CHZOPOź H 0

ç
1

=0

ç
=o
-

OHH
aldolasi HH
H

ç
HaOPOž
OH
Ht
-
-

-0
H
\
H GLCEBALDEIDE
DIIDROSSIACETONE
FOSFATO
3
Q

FOSFATO
-OHH
CHzOPOź
FRUTTOSIO 7
IGBISFOSFATO
Stadio CINQUE

ENZIMA TRIOSIO FOSFATOISOMERASI ETIM


:
O HzOPOź
WOHH
-
--

ç
t
-
H
-

ç
-\
e --\
=0
T

-
-
-
-

H -
OH
-
oH
HH
HzOPOź
"
1

2-

CHzOPOz
-
t
-

LLCERALDEIDE 3 FOSFATO
intermediO DIIPROSSIACETONE
ENEDIOlo FOSFATo

Stadio SEI

-O
2-
Op o -
o GLILERALDEIDE 3 z
-
H
ç
t
r-

FOSFATO DEIDROGENAST tNADH +


ç
H+
NAD
+
t t Pi
Ç
\
-OHH
G
\
-OHH
CHzOPOź
CHzOPOź
I BISFOSFOGUCERATO
.
GLCERALDEIDE 3 FOSFATO
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Biologicamente di Esposito Francesca 20

Glicolisi
Stadio SETTE

0
o 0
ç
0
p fosfoglicerato
CHINASI
ç
t ATP
ADP H
\

ç HzOOź
t -

OH
H

ç HzOPOź
-

-
OH
\

Mgat

bfosfogliceratO
1.3 BISFOSFOGUICERATO

Stadio OTTO

0
o0 =0
0
o

ç fosfoglicerato ç
mutasI 2
-

-0 PO

ç
-

ç HzOPOž
H
OHH
3
\

HH
2O
bfosfoglicerato fosfoglicerato

Stadio NOVE

o0
o
-00
0
è
ç I

-
OPOŹ
ENOLASI
ę
2
-

H -

ç
\
I tHzO
OPO3
\

HH H €
,
2O
H
L fosfoglicerato
FOSFOENOLPIRUvato

Stadio DIECI

O
O
00 . -0-

ç
C
piruvatO e
t ATP
-
ehtinasi
:=
OPO5
+ B
o
t
H+
ADP

èt
it
H

FOSFOENOLPIRUVATO
piruvato
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Biologicamente di Esposito Francesca 21

Fermentazione lattica
GLUCOSIO t 2 ZADP ZLATTATO T
ZATPTH

2O
D

PI+
O oo Ht
ì NADT
e NADH 100
è U e
=o
\

I
\
E
CHz
-Ht,
LATTATO
CH

3
DEIDROGENASI
PIRUVATO lattato

Fermentazione alcolica
GLUCOS 2 ZADP 2 - ZETANOLO TZCOZTZATPTZHZO
D
1Ot
+
H+
POT
coz NADH NADt
O OH
10 1 r w l
ß
i

CHz
D
Cz DCH
3-C-H
-C
-C-C
o piruvato
decarbossicasi
İH deldrogenasi
ALCOl
À
piruvato acetaldeide etanolo
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Biologicamente di Esposito Francesca 22

Gluconeogenesi
Ecucosio

120 p s p qlucosiogfosfatasi
qlosogfosfato
membranão
DEC Tl fosfoclucosioisomerasi

reticolo frultosiogfosfato
endoplasmaticO

HzO p y p
FRUTTOSIO L BISFOSFATASI

,6
FRUTTOSIOL 6 BISFOSFATO
,
Il aldolasi

qliceraldeidesfosfato diidrossialetonefostatotriosiofosfatoisomerasi
NADHTHT N NADT
D
cliceraldeide bfosiato
deidrogenass
ai bisfosfogcicerato

fosfogciceratochinasi
H ADPTP
3ATP
bfosfoclicerato
fosfocliceratomutasi
I
zfosfocicicerato

il
enolas
1
HzO t

fosfoenolpiruvato

PFEHHA ANTAACG

TI
GTP CERCNNECHINAG

MNA MTP
PIRNETOLMERSYNT
?
mitocondrio

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