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Alcune molecole o ioni, definiti polibasici, sono in grado di subire più di una protonazione. La specie
protonata, oltre ad aumentare la propria massa approssimativamente di 1 uma, assume anche una carica
positiva e subisce una modifica delle proprietà chimiche e chimico-fisiche (come idrofilia, potenziale
standard di riduzione, proprietà ottiche, etc.).
Più un acido è forte, maggiore è la sua tendenza a dare protonazione. Di contro, basi comuni come
gli idrossidi non sono in grado di deprotonare gli acidi molto deboli, ragion per cui si ricorre a composti a
carattere maggiormente basico quali l'idruro di sodio o la sodio ammide.