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Composizione chimica delle cellule

Scuola Europea s6ita - bi4ita

idrogeno (H), ossigeno (O), azoto (N), carbonio (C), zolfo (S) e fosforo (P) = 98%

99% delle molecole cellulare sono H 2 0 (70% peso)

cellule hanno più proteina (50%) di DNA

Ioni importanti

sodio (Na + ) potassio (K + ) calcio (Ca 2+ ) magnesio (Mg 2+ )

ferroso, ferrico (Fe 2+ , Fe 3+ ) rameoso, rameico (Cu +, Cu 2+ )

ammonio (NH 4 + ) solfato (SO 4 2- ) fosfato (PO 4 3- )

Elementi traccia

ferro (Fe) zinco (Zn) rame (Cu) cobalto (Co) iodio (I) fluoro (F)

manganese (Mn) molibdeno (Mo) selenio (Se) vanadio (V) silicio (Si) cromo (Cr)

peso molecolare

somma dei pesi atomici

numero di Avogadro = 6.023 x 10 23 molecole/mole

soluzione con una mole di soluto = 1M

Tipi di legami

covalente ionico (attrazione elettrostatica, +/-) a idrogeno (δ+/δ-) van der Waals (interazioni idrofobiche)

capacità di legame

H O : 2

:

1

S : 2 N : 3 C : 4 P : 5

polarità

sostanze apolari = idrofobo sostanze polari = idrofilo

Acqua

partecipa direttamente a molte reazioni chimiche

forma approssimativamente tetraedrica

ghiaccio = rigida struttura cristallina (4 legami)

ottimo solvente

adesione vs. coesione tensione superficiale ionizzazione di molecole di acqua OH - vs. H 3 O +

acidi e basi

acidi cedono H + basi accettano H + H + può legarsi ad altre molecole

acidi

acido cloridrico HCl acido solforico H 2 SO 4 acido acetico (-COOH COO - + H + ) acido piruvico (-COOH)

basi

bicarbonato HCO 3 - + H + H 2 CO 3 ammoniaca NH 3 + H + NH 4 +

reazione reversibile

-COOH -COO - + H +

in teoria tutte le reazioni chimiche sono reversibili

pH

misura della concentrazione di H + acqua pura contiene 10 -7 mol/L 1M HCl contiene 1M di H + IM NaOH contiene 10 -14 M di H + - logaritmo della concentrazione pH = -log 10 [H + ] pH sangue = 7.4

tamponi (buffer)

riducono al minimo i cambiamenti di pH ciascun compartimento cellulare ha un pH controllato non si ionizzano completamente in acqua

molecole organiche

contengono C

forma determinata dalla valenza e dai legami covalenti

dimensioni, forma, solubilità e la reattività sono elementi significativi per comprendere la struttura e il funzionamento delle cellule

gruppi funzionali (FlatMol)

ossidrile

ossidrile
 
ossidrile

(alcoli)

etanolo

carbonile

carbonile
 
carbonile

(aldeidi)

acetaldeide

carbonile

carbonile
 
carbonile

(chetoni)

acetone

carbossile (acidi carbossilici)

carbossile (acidi carbossilici) acido acetico

acido acetico

carbossile (acidi carbossilici) acido acetico

amino

amino
 
amino

(ammine)

metilamina

fosfato (fosfati organici)

fosfato (fosfati organici) acido 3- fosfoglicerico

acido 3- fosfoglicerico

fosfato (fosfati organici) acido 3- fosfoglicerico

sulfidrile

sulfidrile
 
sulfidrile

(tioli)

mercaptoetanolo

Macromolecole

polisaccaridi (monosaccaridi) lipidi proteina (amminoacidi) acidi nucleici (nucleotidi) peso molecolare entro 10 3 e 10 6 g/mol

carboidrati (glucidi)

numerose funzioni biologici riserva energetica e trasporto dell’energia componenti strutturali (cellulosa, cartilagine) sistema immunitario fertilità sviluppo biologico

carboidrati (glucidi)

più comune fonte di energia

digestione richiede meno acqua di quella delle proteine o dei grassi

3,75 kcal per grammo esseri umani: numero limitato di glucidi monosaccaridi, disaccaridi, oligosaccaridi, polisaccaridi

glu

glucosio

mono-S

monosaccaride

di-S

disaccaride

poly-S

polisaccaride

amylum

amido

cellulose

cellulosa

glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
glu glucosio mono-S monosaccaride di-S disaccaride poly-S polisaccaride amylum amido cellulose cellulosa Tuesday, September 18, 12
A1. legame 1,4- α A2. amilosio B1. legame 1,4- β B2. cellulosa B3. microfibra di cellulosa

A1. legame 1,4-α A2. amilosio

B1. legame 1,4-β B2. cellulosa B3. microfibra di cellulosa

h. legame idrogeno

C. amilopectina o glicogeno (ramificato)

monosaccaridi

glucosio sintetizzato attraverso la fotosintesi esosi - C 6 H 12 O 6 pentosi

strutture chimiche

strutture chimiche glucosio mannosio galattosio fruttosio ribosio deossiribosio va utilizzato nella DNA <a href=http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov Tuesday, September 18, 12 " id="pdf-obj-26-4" src="pdf-obj-26-4.jpg">

glucosio

strutture chimiche glucosio mannosio galattosio fruttosio ribosio deossiribosio va utilizzato nella DNA <a href=http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov Tuesday, September 18, 12 " id="pdf-obj-26-8" src="pdf-obj-26-8.jpg">

mannosio

strutture chimiche glucosio mannosio galattosio fruttosio ribosio deossiribosio va utilizzato nella DNA <a href=http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov Tuesday, September 18, 12 " id="pdf-obj-26-12" src="pdf-obj-26-12.jpg">

galattosio

strutture chimiche glucosio mannosio galattosio fruttosio ribosio deossiribosio va utilizzato nella DNA <a href=http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov Tuesday, September 18, 12 " id="pdf-obj-26-16" src="pdf-obj-26-16.jpg">

fruttosio

strutture chimiche glucosio mannosio galattosio fruttosio ribosio deossiribosio va utilizzato nella DNA <a href=http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov Tuesday, September 18, 12 " id="pdf-obj-26-20" src="pdf-obj-26-20.jpg">

ribosio deossiribosio va utilizzato nella DNA

monosaccaridi

non sono essenziali

dieta completamente priva di glucidi può portare a chetoacidosi (chetosi)

diabete I coma cervello necessita glucosio

glucosio può essere prodotto da proteine e grassi

disaccaridi

monosaccaride + monosaccaride disaccaride glucosio + glucosio maltosio glucosio + galattosio lattosio glucosio + fruttosio saccarosio

legami glicosidici

legame glicosidico

glucosio + glucosio → maltosio + acqua legame glicosidico 1-4-α
glucosio
+
glucosio
maltosio
+ acqua
legame
glicosidico
1-4-α

strutture chimiche

strutture chimiche saccarosio sucrosio zucchero da tavola maltosio (1-4- α ) cellobiosio (1-4- β ) Tuesday,

lattosio

strutture chimiche saccarosio sucrosio zucchero da tavola maltosio (1-4- α ) cellobiosio (1-4- β ) Tuesday,

saccarosio sucrosio zucchero da tavola

strutture chimiche saccarosio sucrosio zucchero da tavola maltosio (1-4- α ) cellobiosio (1-4- β ) Tuesday,

maltosio (1-4-α)

strutture chimiche saccarosio sucrosio zucchero da tavola maltosio (1-4- α ) cellobiosio (1-4- β ) Tuesday,

cellobiosio (1-4-β)

oligosaccaridi

3-20 monosaccaridi legami glicosidici in varie posizioni possono essere covalentemente legati a proteine e lipidi

segnali di riconoscimento tra cellule

polisaccaridi

gigantesche catene di monosaccaridi

amido (1-4-α) cellulosa (1-4-β) chitina

polisaccaridi gigantesche catene di monosaccaridi amido (1-4- α ) cellulosa (1-4- β ) chitina Tuesday, September

amidi vegetali

amidi vegetali amido amilopectina moderatamente ramificata Tuesday, September 18, 12

amido

amidi vegetali amido amilopectina moderatamente ramificata Tuesday, September 18, 12

amilopectina moderatamente ramificata

glicogeno

deposito del glucosio nel fegato e nei muscoli degli animali

altamente ramificata

dunque amido e glicogeno sono depositi di atomi di carbonio ed energia di riserva

enzimi specifici digeriscono i vari glucidi

lipidi

composti idrocarburici insolubili in acqua numerosi legami apolari idrofobo

funzioni dei lipidi

barriere isolanti rivestimento protettivo per prevenire l’infezione e l’eccessivo aumento o perdita di acqua vitamine A, D, E, K ormoni (steroidi) lipoproteine (LDL, HDL)

acetil-CoA

lipidi sintetizzati da acetil-CoA acetil-CoA può essere sintetizzato da carboidrati, amminoacidi e acidi grassi coenzime A (tiolo) + acido acetico

acetil-CoA

acetil-CoA + acido acetico coenzime A acetil-CoA Tuesday, September 18, 12

+

acido acetico

coenzime A
coenzime A
acetil-CoA + acido acetico coenzime A acetil-CoA Tuesday, September 18, 12

acetil-CoA

trigliceridi

(triacilglicerolo)

lipidi semplici

solidi a 20 C = grassi

liquidi a 20 C = oli formati da glicerolo e acidi grassi (legame estereo)

lipidi

gl ac trg glicerolo acido grasso trigliceride
gl
ac
trg
glicerolo
acido grasso
trigliceride

acidi grassi

saturi o insaturi cis / trans

acidi grassi saturi o insaturi cis / trans Tuesday, September 18, 12

lipidi essenziali

alcuni lipidi insaturi devono essere ottenuti dalla dieta

vitamine A, D, E, K

immagazzinato nel fegato e nel tessuto adiposo

fosfolipidi

fosfolipidi 2 acidi grassi, 1 gruppo fosfato (-) Tuesday, September 18, 12

2 acidi grassi, 1 gruppo fosfato (-)

Tuesday, September 18, 12
Tuesday, September 18, 12
Tuesday, September 18, 12

steroidi

colesterolo funzione strutturale nella membrana solo in animali (non-vegetale) derivati (ormoni)

ormone acido biliare Tuesday, September 18, 12

ormone

acido biliare

glicolipidi

carboidrati legati a lipidi sulle membrane cellulare funzione simile a quella delle glicoproteine riconosce sostanze chimiche sui globuli rossi gruppi sanguigni formazione dei tessuti (cellule si attaccono)

Proteina

realizzano le istruzioni del codice genetico 20 amminoacidi proteina amminoacidi essenziali cellula tipica contiene >1000 proteina diversa enzimi (catalizzatori)

Tuesday, September 18, 12

legame peptidico

Tuesday, September 18, 12

struttura e funzione

4 livelli di struttura primaria (sequenza) secondaria (α-elica, foglietto β piegato) terziaria (forma totale 3D) quaternaria (complessi di polipeptidi)

struttura primaria

struttura primaria Tuesday, September 18, 12

struttura secondaria

struttura secondaria α -elica, foglietto β piegato Tuesday, September 18, 12

α-elica, foglietto β piegato

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struttura terziaria e quaternaria

struttura terziaria e quaternaria Tuesday, September 18, 12

ponte disolforo

ponte disolforo Tuesday, September 18, 12

Acidi nucleici

DNA, RNA 4 nucleotidi (A,T/U, G, C) nucleotide = ribosio + base + PO 4 informazione genetica nei cromosomi cromosoma contiene geni

-

DNA (mRNA tRNA rRNA) proteina

adenosina-5-acido monofosforico (AMP)

adenosina-5-acido monofosforico (AMP) <a href=http://chempaths.chemeddl.org/services/chempaths/?q=book/General%20Chemistry%20Textbook/Molecules%20in%20Living%20Systems/1982/nucleic-acid-structure Tuesday, September 18, 12 " id="pdf-obj-62-4" src="pdf-obj-62-4.jpg">
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successione antiparallela

successione antiparallela Tuesday, September 18, 12

nucleotide

nucleotide Tuesday, September 18, 12

coppie di nucleotidi

coppie di nucleotidi Tuesday, September 18, 12

basi azotate

basi azotate Tuesday, September 18, 12

Watson and Crick

hanno scoperto la struttura della DNA 1953 Rosalind Franklin, Maurice Wilkins premio Nobel 1962 doppia elica antiparallela

DNA

DNA Tuesday, September 18, 12

tipi di DNA

DNA nucleare (1/2 mamma, 1/2 papà) DNA mitocondriale (100% mamma)

DNA cloroplastico

RNA

acido ribonucleico polimeri di ribonucleotidi

molto simile al DNA (acido deossiribonucleico)

timina (T) sostituito dall’uracile (U) filamento singolo (doppio possibile)

RNA

sintetizzati attraverso la trascrizione di DNA

mRNA (messaggero) tRNA (transfer) rRNA (ribosomiale)

tRNA

attaccati ai amminoacidi utilizzati nella proteosintesi

dogma centrale

DNA mRNA proteina

DNA (mRNA tRNA rRNA) proteina

<a href=http://hawkesbiology.wikispaces.com/ Tuesday, September 18, 12 " id="pdf-obj-74-2" src="pdf-obj-74-2.jpg">
Tuesday, September 18, 12

modello a mosaico fluido (http://www.youtube.com/watch?v=CI0gITqoCrU)

modello a mosaico fluido ( <a href=http://www.youtube.com/watch?v=CI0gITqoCrU ) From DNA to protein ( http://www.youtube.com/watch?v=D3fOXt4MrOM ) https://www.facebook.com/s6ita.bi4ita.2012.2013 Tuesday, September 18, 12 " id="pdf-obj-76-15" src="pdf-obj-76-15.jpg">