Documenti di Didattica
Documenti di Professioni
Documenti di Cultura
CINETICA ENZIMATICA
Cosa sono gli Enzimi ?
Biocatalizzatori estremamente efficaci
aumentano la velocit di reazione di 5/17 ordini
di grandezza
Tutte le reazioni biochimiche sono catalizzate da
enzimi
Sono proteine globulari con masse molecolari
elevate 12000/1000000
La loro attivit catalitica dipende dalla
conformazione proteica nativa
Continuano ad essere attivi anche quando
estratti dalla loro sede originale
Gli Enzimi spesso sono inattivi senza la pre-
ioni metallici
3
Classificazioni degli Enzimi
4
Le dimensioni della molecola enzimatica
centinaia .
5
6
Sito attivo
Piccola regione dellenzima detta tasca a cui si
lega il substrato attraverso interazioni deboli
formando il complesso ES
E+S ES E+ P
Riconoscimento E S secondo il semplice
modello chiave serratura di Fischer
Cinetica
enzimatica
LEGGE DI MICHAELIS-MENTEN
Importanza della cinetica enzimatica
Legge di Michaelis-Menten
descrive la dipendenza iperbolica velocit enzimatica vs..
concentrazione del
substrato
Permette di determinare due parametri Vmax Km
Velocit di reazione (s )
Vmax
-1
Iperbole rettangolare 0.3
saturi 0.0
0 Km 1000 2000 3000 4000
concentrazione dellenzima
pH dellambiente di reazione
temperatura
16
Attivit enzimatica influenzata dal
pH
Ogni enzima ha un pH ottimale in cui
lattivit massima
Le catene laterali degli aa possono
svolgere funzioni critiche nel sito attivo che
dipendono dal loro stato di ionizzazione
Es. rimozione di un protone da un residuo
di His potrebbe eliminare una interazione
ionica essenziale
Attivit enzimatica e Temperatura:
19
INIBIZIONE ENZIMATICA
INIBIZIONE IRREVERSIBILE
Si combinano o distruggono un gruppo
funzionale dellenzima, generalmente con
formazione di un legame covalente
21
Chimotripsina inattivata dal DIFP, per esterificazione del
residuo di serina-195
INIBIZIONE COMPETITIVA
Linibitore compete con il
substrato per lo stesso
sito attivo formando un
complesso catalitico EI
che non subisce catalisi
La Km apparente
aumenta
Vmax costante
Linibitore ha una
struttura simile al
substrato
Es di inibizione competitiva
Trasformazione del succinato a fumarato ad opera della
succinato deidrogenasi, tappa 6 del ciclo di Krebs
C
H 2C OH
C
HO O Il malonato ha una catena di 3 atomi di carbonio
Mentre il succinato di 4
Inibizione competitiva:
A: retta del reciproco della velocit iniziale di reazione in
funzione di 1/S in assenza di inibitore, B e C in presenza di
concentrazioni crescenti di I
1/V0
C
B
A
1/Vmax
-1/Km
1/S
INIBIZIONE INCOMPETITIVA
Linibitore si lega ad
un sito diverso da
quello del substrato
presente nel
complesso ES
Vmax risulta diminuita
e di conseguenza
anche la Km
apparente
INIBIZIONE MISTA
Linibitore misto si lega ad
un sito diverso dal sito
attivo del substrato, ma si
lega sia a E che a ES
Un caso speciale di
inibizione mista e
linibizione NON
COMPETITIVA con KI e
KI uguali, Vmax diminuire
mentre Km rimane
costante
Inibizione non competitiva:
A: retta del reciproco della velocit iniziale di reazione in
funzione di 1/S in assenza di inibitore, B e C in presenza di
concentrazioni crescenti di I
1/V0
C
B
A
1/Vmax
-1/Km
1/S