QUINTA EDICION PARTE I Jeremy M. Berg Johns Hopkins University School of Medicine John L. Tymoczko Carleton College Lubert Stryer Stanford University Contenidos web de Neil D. Clarke Johns Hopkins University School of Medicine EDITORIAL REVERTE, S.A. Barcelona - Bogoté - Buenos Aires - Caracas - MéxicoCubierta: La cubierta posterier muestra un complejo formado por una molécula de aminoacilsRNA y el facior de elongacién EF-Tu Usiorsidad ds Benoa Airws riencias Veloringriat Fen Wiroca, ‘] bas. de a poor Hecwp OY O89 1 05 Bias eSocigh som Eelicidn oviginal en lengua ingles pubticada por cp W.H, Freeman and Company, New York Copyright © 2002 by W. H. Freeman and Company Versidn espatiola de la 5*edicién: Prof, D. José M. Macarulla Catedrético de Bioguimica y de Biologfa Molecular Gran Cruz de Ia Orden Civil de Alfonso X el Sabio Con la colaboracién de los Caledréticos y Profesores de Bioguimica enumerados en el Prélogo Propiedad de: EDITORIAL REVERTE, S. A. Loreto, 13-15, Local B (08029 Barcelona - ESPANA Tek G4) 93 439 33-36 Fax: (34) 93 419 51 89 E-mail: reverte@reverte.com Intemet: hup:fwvww:severte.com Reservados tovdos tos derechos, La reproduccidn total o parcial de esta obra, por cual uier medio 0 procedimiento, comprendidos la reprografia y tratamiento informéticn, y ls distribucidn de ejemplazes de ella mediante alguiler © préstamo pidblicos, queda ‘gurosamente prohibida sin Is antorizacidn escrita de los titulares del copyright, bajo las sanciones establecidas pot ls leyes. Eatcién en espaol © EDITORIAL REVERTE, S. A., 2003 Impreso en Espaiia ~ Printed in Spain ISBN: §4-291-7484-9 Depésito Legal: B - 23627 - 2003 Smpreso por Ferrer Olsina Viladomat 158-160 (8015 BarcelonaA NUESTROS PROFESOR! ¥ NUESTROS ESTUDIANTESSobre los autores JEREMY MM. BERG ha sido Catedratico y Director (Presidente del De- partamento) de Bioffsica y Biofisica Quimica en la Johns Hopkins University School of Medicine desde 1990, En Standford se licencié y gradué en Qui- mica (donde aprendié cristalografia de rayos X con Keith Hodgson y Lubert Stryer) y se doctoré en Quimica en Harvard con Richard Holm. Postetior- ‘mente complet6 su periodo postdoctoral con Carl Pabo. El Profesor Berg ha recibido el Premio de Quimica Pura otorgado por la American Chemical So- ciety (1994), el Premio Eli Lilly de investigacién Bésica en Quimica Biolégica (1995), el premio al joven cientifico més sobresaliente del afio en Maryland (1995) y el Premio Harrison Howe (1997). Estando en la johns Hopkins ha recibido el Premio de Docencia W. Barry Wood (elegido por los estudiantes de Medicina), el Premio de Docencia a estudiantes de Posigrado y el Pre- mio de Catedratico Docente en Ciencias Preclinicas. Es coautor, junto con Stephen Lippard, del libro de texto Principles of Bioinorganic Chemistry. JOHN L. TYMOCZKO posee la Cétedra Towsley de Biologia en el Car. leton College, donde ha impartido docencia desde 1976. Actualmente en- sea Sioquimica, Laboratorio de Bioquimica, Oncogenes y Biologia Mole- cular del Cancer y Ejercicios de Bioquimica, y comparte la docencia de un curso intraductorio de Bioenergética y Genética. EI Profesor Tymoczko se li cencié en la Universidad de Chicago en 1970 y se doctoré en Bioquimica €en la Universidad de Chicago con Shutsung Liao en el Instituto Ben May de Investigacién sobre el Céncer. A continuacién obtuvo un puesto pastdoc- toral con Hewson Swift del Departamento de Biologia de la Universidad de Chicago. La investigacién det Profesor Tymoczko se ha centrado en recep- tores esteroideos, particulas de ribonucleoproteina y enzimas proteoliticos. LUBERT STRVER posee actualmente la Cétedra Winzer de la Escuela de Medicina y es Catedrético de Neurobiologia en la Universidad de Standford, fen cuya Facultad ha permanecido desde 1976. Obtuvo su graduado en la Harvard Medical School. El Profesor Stryer ha recibido miiltiples galardones Por su investigacién, entre los que se incluyen el Premio Eli Lilly de Invest {gacién Basica en Quimica Biolégica (1970) y el Premio a los Inveritores més Distinguidos de la Asociacién de Poseedores de la Propiedad intelectual. Fue elegido miembro de la Acadernia Nacional de Ciencias en 1984. El Profesor Suyer fue previamente el Presidente y Director Cientifico del Instituto de In- vestigacion Aflymax, Es fundador y miembro del Consejo de Asesores Cien- tificos de Senomyx, una compafifa que est utilizando el conocimiento bio- quimico para el desarrollo de moléculas saborizantes y aromatizantes nuevas Y Mejoradas para utilizar en productos de consumo. La publicacién de la primera edicién de su libro de texto Biochemistry en 1975 transformé la en- sefianza de la Bioquimica.Sa ——— estr FIGURA 9.44 Un m structural conservada en los po Durante mis de 25 aflos y a to largo de euatro ediciones, la Biogudiniea de Suyer hs presentado esta preciosa asignatura de una forma extraordinaria. mente alractiva y clare. E! estilo entrctenido y su atractivo disefio an he~ cho que nuestros estudiantes lean y estudien este libro con deteite a lo largo de nuestros afios de docencia. Por tanto estuvimos encantados al tener Ia ‘oportuniclad de participar en la revisién de este libro, La tarea ha sido emo- tiva y un tanto frustrante, debido a Jos profundos cambios que estin trans- formando el campo de la Biogufmica a medida que nos adentramos en el siglo XX1, La Bioquimica esté progresanda réipidamente al pasar de ser ana fencia que se desarrollaba pricticamente por completo en la poyata del ke orio a ser una ciencia que puede estudiarse mediante ordenadores. La te capacidad para determinar secuencias genémicas enteras ha apor- lado Tos dates necesarios para realizar comparaciones masivas de secuen- cias derivadas de proteinas cuyos resultados pueden ser utilizados para for- mular y comprobar hipotesis sobre su funcién bioguimica, La potencia de estos nuevos ingtodos se explica gracias al impacto de la evoluci6n: muchas moléculas y vias bioguimicas se han generado por duplicacién y modifica cidn de otras ya existentes. Nuest desafio al escribir la quinta edicién de este libro de texto ha consistido en introduc este cambio de planteamiento cn la Biogufmica manteniendo el estilo claro y seductor que he caracteri- ‘ado las cuatro ediciones precedentes, [Una nueva perspectiva molecular de Ia evolucién Cm posi afecar ala docencia dela Biogas ets concptos ba Sadosen la evolcidn? Con feenenca, nacromoldulas eon un miso ot zen evoluivo desenpeian funciones bioldpicas diversas a pesar de que su ay el mecanismo de acci6n viene shictas caacteiscas com nes. Un ejemplo es la fara do protefnas que coniiene macromoléelas fidamentales para mover el misc, para informar sobre la presencia de adenuliaa ep el torent sanguneo para oruestar a formatctn de cade nas de aminofcids, Las caracerfstcas fundamentles de una fama de protefnas de este tipo, una vez presentadas conto dalle l estudiantes, se Conviertenenun modelo que el etudiose pute apiar cadaver que see es capac de cease en cf ess propiedaes, observadas en an nuevo Context, se han adepiado para desempefar otis fncionesbiogulmicas. A to lay del texto, se cola el icono de un atl etlizado alco proteus y en los orgenes evolves DOS CAPITULOS NUEVOS. Para permitir gue los estudiantes capten la po tencislidad de estos conceptos se han afladido dos eapitulos completamente nuevos. B! primero, “Evolucién biogafmica” (Capitulo 2) es un breve tra yecto desde el origen de 1a vida hasta el desarrollo de organismos plavice iulares. Por una parte, este cay ccuias y a las vias bioquimicas en su eontexto dentro de Ia eétula. Por otra lo supone una introduccisn a las molé:PREEACIO parte, intents que tos estudiantes obtengan un eonoeimiento rnuis profiaido examinando e6mo ests orokéculas Y vias str= jerom en respuesta de logicas. fundamentales, pitulo 2 have que al nusins aspectos aparentemente extrafios de Ia Biogutmica 105 para ef estudiose., Por ejemplo, la presen- jgmentos de ribonuctedticos en los cofactores bie quimivos puede explicarse por la probable existencia de un mundo primitivo basado fundamentalmente en el RNA. El lo nuevo, “Investiyaci6n de Is Evolueién” (Ca- pitulo 7), desatvolla las bases concepiuates de la compara ign de secuencias de proteinas y dcidos nucleicos. Este ca- pitulo puede compararse con os capitulos “Investigacién en pproteinas" (Capitulo 4) e “Investigacion en genes” (Capitulo 6) que tan concienzudamente han analizadn Tas (éenicas ex- perimentales en las ediciones anteriores. Su objetivo es ca- pacitar a los estudiantes para que utilicen Ja vasta informa- cidn disponible en las bases de datos de secuencies y de structures de una forma eritica y eficiente. Adiesnis, fn perspectiva evoluiiva segundo capit ONGANIZACISH DEE TEXTS. El enfoque evolutive afecta a fa ‘organizacidn del texto, que se divide en cuatro partes prinei- pales. Como en ta edicién precedente, Ia Parte | introduce lenguaje de ia bioguimica y las estructuras de los tipos de mo- Icoulas biolégicas mas importantes. Las ites partes restantes se corresponden con tres importantes desafios evolutivos: es decir, fa imterconversién de las distintas formas de energia, la reproducei6n molecular y la adaptacin de células y organis- nis @ entornos cambiantes. Esta disposicidn es comparable a la via evolutiva bosquejada en el Capitulo 2 y sigue su curso clo Torna aauural desde lo senciflo bucia lo mas complejo, 4a PARTE J, 6L pise8o morecutaR b& 14 vip, presenta los ti- pes mis importantes de macromoléculas biol6gicas, inclu yen las proteinas, dcidos nucteicos, carbohidratos y hipidos, « introduce los conceptos bisicos de catilisis y actividad en- ‘rumatica. Aqui hay dos ejemplos de cémo una perspectiva evo- fwiiva ha dado forma al material de estos capitalos: $F Capitute 9, que trata de estrategias catalticas, | examina cuatro clases de enzimas que ban evo- Lucien para afvontar desalios espeetficos: pro Hoinver unt reaccién quimica bisienmente lenta; poloneiae al miximo la velocidad absoluta de una teaceidn, eatalizar una reaecién en un lugar y 0 ‘on otros: muchos lugares altemnativos: y evitar una teaveion secundaria nociva. Bn eada caso, el texto consider ef papel de ts evolucién en el ajuste fine de Ix propiedad clave. HL Capitate (3, que trata de conductos de mem- iat y sistemas de bombeo, incluye las prime- ray tidimensionales detalladas de un tennuducte idnico y de una bombs de ones, Como Bominio ‘extncellar Dominia ineracelar ® | la mayorfa de los dems conduetos y bombas importantes estan emparentados evolutivamente con estas protefnas, csiay dos estructuras constituyen poderosas plataformas para examinar el fundamento molecular de la actividad de estas clases cle moléculas tan importantes para el funcio- rnamiento, epite otros, del sistema nervioso, La PARTE I, eansroreacvin ¥ Gatco agmenTO DE La ENERGIA, examina Lis vias para la intereonversién de las distintas for. mas de energfa. El Capitato 15. que trata de la wansduecién de sefiales, se centra en emo fragmentos de DNA que codi- fican médulos proteicos relstivamente sencillos en vez ce pto- teinas completas se han me7clado y acoplado durante el trans curso de la evoluein para generar el hilo conductor que define Js rutas de transduccién de sefiales. Fl grueso de la Paste TI ‘analiza las vias de generacitin de ATP y otras moléeulas que almacenan energia. Estas vias se han organizado en grupos ‘que comparten enzimas comunes. Las reeeiones que las in- fegran pueden analizarse una vez y, mientras estas rescciones cesta atin frescas en 1a mente del estudiante, se puede jlustrar su participacién en distintos contextos bioligicos 4 El Capftulo 16 abarca ta glicotisis y la gluconeogénesis, En algunos aspectos, una via es la inversa de la otta, y un nndcleo de enzimas que son communes a ambas vias catali- zan muchas de las etapas centrales de ambas ratas. El es- tudio conjunto de las vias ayuda & ilustrar eémo influye la enotgia libre a la hora de dirigir el proceso global bien cen la direccidn de ta degradacion de Ia ghucosa, bien en la dirceviin de sintesis de glucosa, EL Capitolo 17, que trata del ciclo del secido eitrico, entaza a traves de aspectos evolutives el complejo piruvato des- hidrogenasa, que aporta moléculas al ciclo del ficido ci luico, y el complejo a-cetoglutarato deshidrogenasa, que cataliza una de las etapas clave del propio ciclo. La fosforitaci6n oxidativa, en el Capitulo 18, continga in mediatamente en el Capitulo 19 con las reacciones lumi-| osins de la fotosfntesis para re levisticas comunes de estas vias, lear las méltiples carae- + Lat discusién de las reacciones fa fotosinte- sis en el Capftuta 19 conduce de forma natural a la diseu- | sid de las rescejones oscuras ~es decit, las imtegrantes lel cicto de Calvin—en el Capitulo 28, Esta vie enlaza de forma natural con la via de las pentosas fosfato, también contemplada en el Capitulo 20, porque en ambas rutas exis- ‘en enzimas comunes que interconvierten saicares de tres, cuatro, cinco, seis y siete étomos de carbono, La PARTE Hf, SivTESIS on LAs MOLECULAS Dr A vipa, Se cen (a en la sintesis de macromotéculas bialégicas y sus com- onentes ¢ EI Capitulo 24, que trata de la biosfatesis de aminodcidos, ‘esti conectado con el capitulo precedente que trata de la legradacién de aminoscidos por medio de una famitia de ‘enzimas que incorporan © retiran grupos amino del es- ‘queleto earbonado de los aminoscidos, EL Capitulo 25 abatca Ja biosintesis de nuclestidas e in- cluye el papel de los aminoscidos como precursores bio- sintéticos. Un aspecto evolutivo clave subrayado aqui es que muchos de los enzimes de estas vias son miembros de Ja misma familia y eatalizan renceiones quimicas ané- togas. El enfoque sobre los enzimas y las teacciones co- ‘munes a estas rutas biosintéticas permite al estudiente | comprender la légica de las vias en vez de tener que me morizar un conjunto de reacciones que aparentemente no | estan relacionadas. Los Capitutes 27, 28 y 29 tratan sobre la replicacién, re- eombinacidén y reparacién del DNA, la sintesis y madu- racién del RNA y la sintesis de proteinas, Las conexio- nes evolutivas entre los sistemas procariéticos eucaristicos ponen de manifiesto eém los procesos bio gatmicos bésicos se han adaptado pars funcionar en se- res vivos més complejos. 1. recién determinada estnic- tura del ribosoma offece al estudiante una visién de un | posible mundo temprana de RNA en el que los feidos nn leicos y no las protet isban casi todos los, papeles principales « la hora de catalizar las vias impor ‘antes, ws desempe! LaPARTEIV, resrussts » cammios annarvrats ditige una mi rida a e6mo las células monitorizan y se adzuptan a cambios con su entome. De hecho. la Parie TY explora los sistemas sen- soriales, el sistema inmunitario, los motores moleculares y el citoesqueleto. Estos capftulos iusiran eximo los procesos de sefializacin y respuesta, introducides con anterioridad en el texto, se integran en los organismos pluricelulares para gene- sae potentes sistemas bioqufmicos que detectan y responder fs Prefacio ‘los cambios del entomno. De nuevo, Ia adaptacién de las pro: lefnas a nuevas funciones es un aspecto clave de estas ang mentaciones. [Conceptos quimicos integrados A To latgo del texto hemos incentado integer bos conceptos guimicos, Aqué se inclayen los fundarnentos del mecunismo dde accién de enzimas seleccionados, las. tundamentos ter vodindmices del plegamiento y ensamiblaje de proteinas y ‘otras macromoléculas y las estructuras y reaetividades qui micas de fos cofactores mas frecuentes. Estos importantes as- Pectos constituyen la base de nuestro conocimiento sobre to- dos Jos procesos biolégicos. Nuestro objetivo no es proporcionsr un estudso enciclopédico de los mennismos de lis reaceiones enziméticas, En ver de ello, hemos escogide determinados temas para un estudio a nivel quimico més de- tallado que penmita a Tos estudiantes comprender emo tas caracteristicas quimicas contribuyen a satisfacer fas necesi dades biolégicas, Con frecuencia, la vision quimica depends de queten- ow ‘gamos un conocimiento claro Ue Tas estracturas de las bio- moléculas. Cuando ha sido necesario, hemos adoptado cconsiderables precauciones a Ia hora de elaborae ilustra ciones estereoguimicas. pre cisas de estas molécalas. Estas estructuras favoreceriin que cl estudiante adquiera un conocimienta intuitivo de sts for- mas y comprenda cémo estas formas afeetan a su reactivi= dad. Aspitina ca sete) Nueva puesta al dia para incluir descubrimientos recientes Dado el espectacular avance de ta bioguimica modema, no sorprende que se haysn producido hallazgos sustanciales desde la publicacién de 1a cuarta edicién, De entre ellos, ef mms dlestacado es Ia secuenciacién del genoma humano y de los genomas de muchos organismos mas senci que evolutivo def texto nos permite incorporar de forma ns tural Ie informacién que surge de estos esfuerzos histéricos La determinacién de tas estructuras tridimensionales de las Proteinas y cnsamblajes macromoleculares tambign se ha ida desarrollando a un ritmo asombroso, t ‘Como ya se ha sefialado anteriormente, ki discusién sobre membranas excitables del Capitulo 13 incorpora las, trueturas detalladas de un conducta isco (el condueto pro: caristico del potasio} y de una bomba de iones (la ATPasa 1 del reticulo sarcoptisinieo). iPREFACIO 7} ricurs 9.21 complejo protens de ViH-Crxivan La capacidad para describir los procesos de ka fosforila- | cidn oxidative en el Capftuto 18 se ha beneficiado enor | memente de a determinacifin de las estructuras de dos | grandes complejos de protefnas de membrana: la cito- | cromo ¢ oxidasa y el citocromo bey + Enel Capitate 18 se recogen los recientes descubvimien- tos en relacién con la estructura tridimensional de la ATP. sintasa, entre los cuales se inclaye el notable hecho de que durante ef trascurso de la catélisis hay partes del enzima | gue roum En el Capitulo 28, la determinacién de la estructura del ri- bbosoma transforma la discusién de la sintesis de proteinas. © La determinacion de fa estructura de Ia particula central del nucleosoma (un complejo protefna-DNA de gran tar ‘mafio) facilita a descripcidn, en el Capitulo 31, de los pro- ccesos clave de Ta regulacién génica en eucariotas Por ultimo, cada uno de los tres ‘capitulos de la Parte IV est basado en recientes logros estructurales. vidad del estudiante para retener Jos eonceptos clave de los sistemas sensoriales (Capitulo 32) ea favo~ rocida por las estructuras de Ia rodopsina y del condveto ‘nico antes mencionado. © BI Capitulo 33, que trata del sistema inmunitario, inctuye ‘ahora Jas estructuras recientemente determinadas de los receptores de las células T y de sus complejos, » La determinacién de tas estructuras de las proteinas que actiian como motores moleculares miosina y quinesins han puesto de manifiesto por vez primera las conexiones evo- Iutivas en las que se basa el Capitulo 34, que trata de mo- tores moleculares, [itustraciones nuevas y mejoradas Laselacién entre estructura y funcién siempre ha sido un tema dominante en Bioguimica. Esta relacion se hace aiin mais evidente «los estudiantes que utiizan Ja quinia ediciGn gracias al uso generalizado de mo- delos moleculares. Estos modelos superan a los de la ccuarta ediciGn en varios aspectos, ‘Todos han sido disefiados y elaborados por uno de nosotros JMB), medianie MOLSCRIPT, pars re- saltar las caracteristicas estructurales mis impor- tantes, La aspiracién de los autores es que el lec- for sea capaz de escribir el pie a partir de la observacidn de fa figura, Heios seleccionado el diagrama de cites como ef mé- todo més eficiente y més claro de representar la estructura molecular. Todos los modelos moleculares se representan ‘con un estilo consistente, Asi, Jos estudiantes pueden com: parar fécilmente estructuras y adquiir familiaridad y f cilidad a la hora de interpretar los modelos. Las anota- clones resaltan las caracterfsticas clave de los: modelos moleculares, Se han afladido muchos modelos moleculares nuevos, que | sieven de base para la comprension estructural de mol culss adieionales y, en algunos casos, permiten Ia repre- sentacién de miiples facetas de la misma molécula. Ademis de los modelos moleculares, la quinta edicién incluye ss esquemas que proporcionan una visién de conjunto de las vias y procesos y que sitia estos procesos en su contexto biolégico. El ahosome {al prineipio det capitulo 29), ee eeeELE LS BE A RIE RE | Nuevos efementos pedagégicos 1. quizta ediei6n offece herramnicntas adicio- niskes para ayuar al estadiante aprender Ia materia de la asignatura, ICONOS. Los icons se tiizan para resaltar tres ‘calegorfas de material, lo que hace més ficil la localizaciéu de estos t6picas por parte del es ‘ucdiante interesado © del profesor. ‘gr Un caduceo indica el comienzo de una * aplicacién clinica. El icono de wn drbol estilzado sefala tas secciones 0 pitrafos que exploran principe! o exchusivamente as- pectos evolutivos de la bicquimics. “gy Un rate y wn dedo hacen referencia a animciones de si- tio Web del libro de texto (ywwewhfteeman,comibiochem5) para aquellos estudiantes que desven reforzar su com prensiGn de los conceptos con medics electrénicos. MAs PROBLEMAS. El nimero de problemas ha aumentado en ‘un 50%, Se han creado cuatro nuevas categories de prable- mas para adquirirdestreza en aspectos espociicos. Los © meconistans requieren que el estue diante sugiera o elabore un mecanisme quimic. Los Prohtemas ste inter hacen pre- unlas sobre un conjunto de datos que se ofreven en forma gréfica 0 tabulada. Estos ejercicios dan unc idea a los es {udiantes sobre emo se alcanzan conclusiones eientificas Los * ‘oles requieren que os estudiantes utilicen ta informacién procedente de roiltiples capftutos para conseguir una respuesta. Estos problemas refuerzan en el estudiante la nocién de que tos diversos aspectos de Ta bioquimica se encuentran interre- lacionados Los Probie estimulan y syudan a los es tudiantes a sacar provecho de las animaciones y semina- ros que ofrece nuestro sitio Web, Los problemas multi- media se encueatran tanto en el libro como en nuestro sitio Web. pretacién de Preacio 2 alfashéees anfipatieas RUEVOS CONTENIDOS DE LOS CAPITULOS Y TERMINGS © 'Al principio de cada capitulo se prosentan los contenidos 2 ‘modo de titulares principales que sirven de base al estudiante ala hora de organizar la informacién del capftulo. Los prin- ‘eipales titnlares aparecen de nuevo en el resumen del cape twlo, ayudando a organizar la informacién para repasaria de forma mis Fécil. Un conjunto de términos clave también ayuda a los estudiantes a centrarse y a repasar los conceptos impor- ‘antes, Geto det aciso cen oe 200, Frou 4 La glleliss y el ecto det det eitrico esténPREEACIO {a quinta edicién de Biowriiniea ofove 6s eapitnes que fi Biegufmica: “Invested en preveinas” (Caprtvlo 4), sean las hersamicat “Juvestigacion en nen (Capitulo 6) © “Invesigacidn de Ta eveluci6n” (Capviulo 7). Cuaala se considera oportumo, v2 otras partes del texto se preseatan tSenieas experimentales adicionales, Investigacion en proteinas (Capitulo 4) Purifcacin de preinas Seccidn 4.1 Contrfugacisn éilenencial Sexcién 4.1.2 Salling aut Seccia 4.1.3 Dialiss Seccidn 4.1.3 (Crumatogratia de tamizaclo molecular Seeciba 41.8 CCromatogratia de intercambi inion Secckin 4.1.3 Cromatoavatia de afinisind Sooeisn 4.1.3 Cromatogratéa guid eis proskin” Secein 4.1.3 Enecroforens en gel Secsion 41.4 Iroelecimenfoque Seeciée 4.1.4 Eleciotoresis bidimensional Seceién 4.1. Evalutcién evsitaiva y cxantiativa de ta puificacié de pyovetnas Soccién 4.1.5 Uteacenifugacicn Seccion 4.1.5 Espectromettia de masts JMALDI-POP) Secein 4.1.7 Hella dactlar de la masa de un pSptido. Soosién 4.1.7 Depyadacign de Ediman Seccign 4.2 Secuenciscion de protefnas Seecidn 4.2 Preuicoién de amtcwerpo polisonates. SecciSn 4.3.4 Pwelcciin le aicuerpestonaelonales Seoskén 4.3.2 nsayo de immnashsorsign aeciade a enzimas (ELISA) Sevciin 4.3.3 ‘Trasieeneia Western Secciin 434 Mierosenpia de resco Sescion 4.3.5 Marcaje con la protest luoresente vende Soecién 43.5, Microseopiainmunecleeteinica Soevisn 4.3.5 Sintesis aommdtca de phy: en fase slida Seceién 4.4 Especoscopfade resovancia mngnitica muctear Seed 45.1 Especioscopis NOESY Seecisn 4.3.1 Critalograia de rayos X- Seocign 4.5.2 | investigacién en proteinas (Otros capitulos) Punamento de a faocescencia de fa protest onde Soeekin 5.6.5 i luorescente Cristal rola en ef Hampo. Saccisn 83. Uizacinn tla expeetnscopia de fhuarescencia para wali nesseciones enzime-susrata Seecién 8.3.2 Unizaciow se ssabivors freversbles para eantogralar Leone ties Seven BS. sii det estado de wansicid para estar bes veuem etivas de Tos enzimas. Soccidn 8.5.3 Anticactpes «talticom envimas. Seecion 85.4 Mnvestigncion om genes (Capituto 6) Anilisis modi unite wsticekin. Seecidn 6.1.1 y a ‘Teeicss de slew santo y Nowthem: Seecidn 6.1.2 Mod didesoxi se ane ps Lo sernenicieign del DNA, Seesidn 6.1.3 Asis de dcidos warts 4 fee vey Sean 6 Le Ronen en eadens ely La gohan WeRE SeveiGn 61S | | 1 téenioas de | i | ‘Teonolozia det DNA recombi Clone del DNA en bactenas Seeciones 6.2 Record sromoscmion Seccicn 6.24 Clonai do genes encarisicos en hacterias Ssccign 6.3.) Anilisis ve los nivoles de expresign (chips wenicos) Seecion 6.3.2 Introducein de ‘Animales transgenicos. Seccién 6.3.4 Alteaviin de genes Seosi6n 6.3.5, Pésnidos gue provacan tumnores.Seceién 6.3.6 Mutagenesis dirigids Soociom 6.4 te Seceiones 62 — 6b yeas genes en cucariotns Seeciin 63:3 [investigacién en genes (Otros capitutlos) Seainenact en eqn de padene de dead Secuna22 ‘eet Je a hella psy cractias gs roles Secon 311 Tomar tee crmatina (CMP) Sei 3.23 | investigacian de la evolucién (Capitulo 7) Médos de companein de sues. Scie 72 oss alfeaco de seucneas Secon 72 ‘Worn elspa sleds lneariets meme tra Sesctn 721 Maite dunt Scent panes sues Seceon 733 Reyeccuce aogier per cocoar motos Ta, Seon 3.3 Canuytad le escures ecunderipr emp de ‘lemneia de RNA Sectn 138 Cersnec de ible eves 74 Goines connatcr Sectin 753 [otras eéentcas Science exbhidmos po exevan de tra MALDITO¥ Seen 11 ‘ede ponron pr investi april de iments Scene ‘vd gran edo para aaa hes trunentraies Secon 1234 etapa de escort sof boned CFRAD pn ma ifn fal en Mena Secon 126 "Ten de allan paa ned J acta cond Seco 3 Med penal doe Sesion 18.2. fagon po esorei gntics nl(MRD) Seeidasat “® Técnicas animades: En reeann-comfbioeems x6 pode enon cxplictcionessnimads do tGesicas experiments vuilizads para explorar genes y proteins.Prefacio ™ Ein el texto, este icon indice} eomienzo de una aplicacinclfnica, Cuando se ha considera oportuno, aparecen en el texto otras correspondencias clinicas mis breves sin el icon Entormedsdes priieat Seeeién 3.6.1 Escorbuto y estabilizacion del coligeno Seccidn 3.63 Deteocin de antigenos con BLISA Seecién 43.3, Insolciencia de vasopresina Sevcign 4.4 Accisn de lu penicitina Seccién 8. Vitaminas hidrosolubles $ecci6n 8.6.1 Vitatinas tiposolubles en la coagulocidn de ta sangre y en la visio Seecidn 86.2 Tnhbidoes de la proteasa. Seecién 9.7 ‘Andras carbénica y osteaparosis Seocidn 9.2 Uso de isozimas para el diagnéstio de lesiones tnlares Seccidn 10.3 Enfsema Seceién 10.5.4 Prevencin de trombosis.Seccidn 10.5.7 Hemofilia Seccién 105.8 -Rogulacin de Ia cougulacién de la sangre. Seecin 10.59 Grupos sanguiness. Secci6n 11.25 Anibisticos que inhiben it glcosilcién Seecién (1.3.3, Enfermedad de as e6hulas | Seocién 11.35 ectnas y Ia respuesta iflamatoria, Seecisn 114.1 Virus de le gripe Seecién 1142 Uso elicn de Tiposomas Seccién 12.4.4 Asprina e ibuprofeno Seovign 12.5.2 La digital y fale carditco congestiva Seoci6n 13.2.3 Resistencia a muiples firmacos y fibrosis quistica Secciin 13.3 Inibidores de fa protetna quinasa como férmacos antcaneeri- ‘geno Seccién 155.1 Coteray tos ferns Seccidn 15.5.2 Intoleraneia a le lctoss. Seceién 16.112 Toxicidad de la galietose Seecisn 16.1.13 Cicer y glicotisis Seecién 162.5 Insoficiencia de fesfatasa y acidosis Vivica Seccign 17.2.6 Bribery envenenamiento por mercurio y aséaico Seecién 17.3.2 Enfermedades mitocondriales Seccin 18.6.5 Anemia hemoltica Seceidn 20.5.1 Insuficiencia de glucosa 6 fosfato deshidrogenasa. Seceisn 2052 Trastorno del almacenamiento del glued Bs Insuffeiencia de cammitina Seccign 22.2.3 Sindrome de Zellweger Seoeidn 2234 CCetoss iabetiea. Secci6n 22.3.6 Uso de ihibidores de la dcido prasosintetasa coma firmacos Secci6n 22.49 Bectos de ta aspirina en las vias de seilizacion ne Seecidn 21.5.4 lestorea en el trastorno hepatico Seccién 22.11 Seccién 22.6.2 Cineer cervical y ubiquitina Seceitn 23.2.1 Degradacin do protenas y la respi nna Seecign 23.23, Trastornos heredados del cielo de fa urea hipsramonemia) Seecign 23.4.4 Errees innaios en la degsnlacion de stinoscides. Soci 23.6 Niveleselevados de homorsiina y enfermedad vaietar Secci6n 242.9 Trastomos hereditaios del motabolisoo de Iss povfrinas Seccisn 24.4.4 Finmacos anticancerfgenes que bloguean la snes de imi Taco Seceidu 25.3.3 Pelagra, Seccién 25.5 Gita Seecién 256.1 Sindnome de Lesch-Nyhan Seccicn 25.6.2. Intemupeién del motebotisma de lipides come enusa det sfa- rome de Fsuiiencia vespratria ayuda y fa enfermedad de Tay Sochs Seoci6n 26.1.6 1Usn diagnistico de los niveles de colesterol en sangre ‘Seccién 26.3.2 Hipercolesterolemia y arenescleosis. Seccidn 25.3.5 ‘Tratamiento clinic de los nveles de cofesteol Secci6n 263.6 Ragoitsmo y viteina D.Secci6n 26.4.7 Ansibigticos disigios contra la DNA girasa. Seocidn 27.34 Reparacién defecuosa del DNA y cincer Seccién 27.6.5 Corea de Huntington Seecida 27.6.6 Deteccin de eareindyenos (est de Ames) Seociin 27.6.7 Antbistccs que inhiben la tnusctipeiéa. Seceién 28.19) [informa de Burkit y Fencemia de las células B. Sex 28.26 “Talasemia Secciin 28.3.8, Aiiictcos que inden i intess de proefnas. Seocién 295.1 Difteria Seccién 29.5.2 Inanici profongada Secciba 30.3.1 Diabetes Seccfn 303.2 Regulacign del peso comporsl Sesckin 30.3.3 Efectos metabstices del etanol Seceién 30.5 eroides anabélicns Seccidn 31.3.3 SERMSs y ences de peck Sescién 31 Cazuera alos colores. Seecicin Uso de la eapssiina pats el trstamisata del door Seccisin 32.5.1 Supresores del sistema inmnitaria. Secci6n 33.4.3 MHC y reeheaa alos asplanies Ssoci6n 335.6 Vacun del SIDA Seeci nfermedades autimunitavias Scevifn 33.62 Sistoniainmuitario y einoer Seveign 34.63 Miosinas y sonlera Seevion 342.1 (Quinesinas y tastomos del sistema nervioso Secein 34.3 Taxol Seccién 84.3.14 ait PREFACIO Ewe ieono indie el inicio dk rouchas discusiones que resaian Tz sind de protefmas ‘otros aspectos evoluivos a r'vel molecalar que proporcionan wna plataforma quo ayuda at cesudiante organiza fa ies maci6a. Por qué este conjunto de 20 aminoicidos? Seevi6n 3.1 ‘Muchos exones codifian dominios proeicos Seccion 5.6.2 ‘Trades cualiicay en enzinae hiceoliions Seosisn 9.1.4 Prinepales pos de enzims que escinden pépidos Secci6n 9.1.6 CCentsosactvos fasades cn ezine en las anbidiass eatbonicas ‘Seecién 9.24 Ln ndctes eatin comin en los enzimas de resieign deco 1 Seecifn 9.34 Dominios de le NPasas con sie P- Seen 94 Hemoglobina feat Seceién 10.2.3 Un micloo catlitco comin en las proteins guinasas Seecion 10.4.3 {Por qué existen varios grupos senguineos en hummnos? Seccisin 11.25 Hombas i enes relacionadas evnluivamente Seecidn 13.2 ATPasus de tipo P Secuiéa 132.2 [Dominios cessete dle nin al ATP Seocién 12.3 Familias de transportadonessecunderiow Secciin 134 Subunidades del receptor deta weaticotina Sencién 13.5.2 CCompariziones de fas secuencias cle eDNA de canduetos de 0 dio Seccién 13.54 Homolog en Ios com clos le patsia y sain Sevetin 13.5.5 ‘Uso de I comparacign de ser ueeias para comprenier los con ductos do sodio ycaleo Sceisa 13.5.7 Bolvcien de las vias mshcieas Seecidn 16.3.6 Csmo adquisié su oncogén el sarcoms de Rows? Seccion 15.5 CCaricerstiensroourrentes de as vs de transdcsién de sos es. Secciin 15.6 Por qué es la glucosa un combusble tn iuportante? Seccidn 160.1 ‘Us lugar de unidn comin en lasleshidrogenctas Seovin 16.1 £0 |La superfailia de transporters ME (el principal facltador) ‘Seccién 16.2.4 Tsoenzias de la (acato deshidmogenasa Seceién 16.42 Relacin evotatva dela slicoisisy la gluconeogenesis Scccién 1643 Descarboxitackin del w-ceveghutnato y pinavato Seecid 17.1.4 EBvolucién de fa suocini-OoA sinvetasa Seecion 17.1.7 Flstola evotativa del ciclo del deido etico Seocién 17.3.3 Oxigenes endosirabitioos de fas mitocondrias Seeci6n 18.1.2 Conservacicin de la esrucira del citgevome © Seecién 18.3.7 Caractorsticns comes de Ja ATP. sintase y les proteins G Seccisn 18:45 Proteins desacoplaaies empareniodas Seeci6a 1864 [Bvolucion de los cloveplasios.Sescidin 19.12 (Orfgenes eveluves Ue a fotesinesis Seecion 19.6 volucin de la via Cy, Seccién 202.3 ‘Aumont la complejidad en Ta rogulacién de In ghucdgeno fos- Ailsa. Seceien 21.3.3 4. funiia wanvlasa Seovidn 21.4.3 Ua motive recurente en a activacién de grapos carboxilo Seesion 22.22 Los poliquetilos las sintetsas de péptidas no ribossmiens se porecen ala feido prasosinttast Seecién 22.410 Equivalents procardtios de la via de la ubiquitin y el proven Sonus Seocidn 23.24 Una itis de Seccign 28:33 Evaluci del ciel de in urea Seecisn 23.4.3 EX dominio NTPasa eon hucle Pen lanlteogenass Seen 241.1 Buapas ccurrentes en Ia sintesiy del anilla de purina Seecién 25.23 Ribonscleida reductaras Secekin 25.3 _Aumento de Tos nivale de wrsto durante fa evolucii de los p= naiws Secein 25.6.1 ‘La eaperfmilia del citocromo PASH. Secein 26.43, DNA polimerasas Secei6n 27.2.1 Hecasas. Soveidn 272.3 fewimas dependientes del pisidoxal Relaciones evolutivas de las recombioasas y tnpoisomerasis Seccién 27.82 Similimdes en la maquinariatrnsceipclonal de arqueabaccerias y encavotas Seocidn 2824 Bvoluciin de! procesamionta cnaizado por el explicoosoma Seecion 282.4 CCaser de aminowcilARNA sinteasas Seecién 292.5 Composicign dl ribosoma primoviial Seccidn 29.3.1 Evolucign de I minica molecule Sovciéin 20.44 ‘Una familia de proteinas con dominios communes para la unis (el igando Seceiéa 31.14 _Evolucin independiente ve ls Yugares de uisn al BNA de Tas rotenas reguladoras SeceiSa 31.15 Sales de CpG Seecidn 31.25 -lementon de respuesta a hier. Seeci6m 31.42 ‘La falia de cocepares de sustancits aromas Soeci6n 32.1.1 Evolucign del mRNA. del receptor del gusto Seccidn 32.2.5 Byolucicn de ftorrceptores Seocidn 32.34 Fl plegamiento de las inmunoglobulins Seccion 33.2 Relacicn ent Is acting y a hesoxuinssa y otras proweinas pro- cations Seocisn 34.2.2 Tubulin y te fila de N'TPases con bucle P Seccidn 38.3.1-Suplementos de apoyo a quinta edicién de Bioquimi Ssh sSESESEERSDESSEA Prefacio If t La quinta edicién de esta Bioguimica ofrece una amplia seleecién de suplementos de gran calidad para ayudar a los estudiantes y a los educadores, [Para ef profesor Banco de preguntas impresas y en CD-ROM NUEVO. Marilee Benore Parsons, University of Michigan-Dearborn. Print Test Bank 0-7167-4384-1; Computerized Test Bank CD-ROM (hibrido Windows/Macintosh) 0-7167-4366-8 El banco de preguntas ofrece mas de 1700 preguntas planten ilitipte eleccién, emparejamientos o respucstas covtas. La ve ws en formatos de iin electrical bbanco de preguntas permite que los edueadores puedan introdueit cambios, reorga- nizar las preguntas o incluir su propio material de forma sencilla, CD-ROM Instructor's Resource NUEVO © W.H. Freeman and Company ad Suiwanas, Ine, 0-7167-4385-X El Instructor's Resource CD-ROM contiene todas las ilustraciones det libro de texto, Se incluye Presentation Man: taciones facil de usar. Cada ims + Pro, una aplicacién para organizar presen- ‘se almacena en varios formatos y resoluciones, desde los sencillos ficheros jpe y sif hasta diapositivas de Power Point® predise- fhadas, para Tos educadores que utiizun tts programas de presentacién, ‘Transparencias 0-716 7-4422-8 Un volumen con las ilustraciones del libro de texto a todo color, optimizadas para la proyeccién en clase. | Para el estudiante Student Companion Richard 1. Gumport, College of Medicine at Ur- buna-Champaign, University of Nino's: Pras H_ Deis, Rutgers University y Nancy Counts Ger- ber, San Franciseo State University. Soluciones campiiadas a los problemes del libro de rexto pro- porcionados por Roger E. Koeppe 1, University of Arkansas O-TH6TABES-3, Mais que una simple guia de estudio, el Sr dent Companion es un recurso docente esen- cial disefiado para satisfacer !as necesidades del estudiante a todos los niveles. Cada capi- | ‘| |PREFACIO tulo comiewya con un extracto reswenido cel capita dal bro de texto correspondiente, Una ampli fists de ahjetivos slo- ccentes permite que ef estudiante repass nipirlarmomic fe com ccoplos clave: Un ejercicio de aateevainieiin permite gue is estudiantes refresquen ripidamente sus conacimienios ¥ una serie de problemas adicionales invite 2 estuciante a sphiear is Conoeimientas de bioguimica, Se inc ye fu soucién com- pleta de cada problema del texto para ayadlar 2 los estudian- {es a comprender mejor las ideas fundamentiles. Se pueden aulguirir y descargar eapitulos sueltos del Student Companion cen la direc ‘www.wkfreeman.convbiochemS | Clinical Companion NUEVO: Kirstie Satisman, PhD. y Gonton Tomeselli, M. D. Johns Hopkins University School of Medicine. O-716T-4738-3, Disefado para estu- diantes y educaclores in- leresados en. las aptiea- clones clinieas, eb Clinical Companion es ‘un wast compendio de casos médicos y diseu- siones clinicas, Contiene umerosos problemas y referencias al libro de texto. Temas tales como el glaucoma, la fibrosis quistica, Ta enfermedad de Tay-Sachs y fas en- fermedades auioinmuni- tarias se abordan desde tuna perspeotiva bioqot- mica, VTOCHEM [Lecture Notebook NUEVO: b-7167-4682-4 Par fos estudizates que se encuentran demasiado ceupa- dos toniande aptintes y 00 prestan atencién a la clase, el Lee: va coleccin de ilusiraciones del libro de texte ew blames negro dispuestas en el mismo orden en {que uparecen cx el lilvo y con mucho espacio alrededor para que fos estodiantes wmen sus notas, ze Newebuirk ware | Experimental Biochemistry, tercera edicion Robert L. Switzer: University of Mlinois, y Liam F. Garrity, Pierce Chemical Coxporation, 0-1167-3300- La nueva ediciGa de Experimental Biochemistry se ha re- ‘visado por completo y se ha aetualizada para convertitta en waa ppieza perfects para un curso modern de laboratorie de bic: (quinca. Abords le forma extensa las enieas importantes ati= lizacas en [a investigacién bioguimica actual y offoce a los es- fuinntes el fandamento tesrico necesario pars comprender los experimenios, Probado concienzudamente en clase, los experimentos incoxporan Ia serie com lets de materiales bio- ‘quimicos en un intento de simulat ef abajo en un laboraioria de investiga cin. Ademis, un amplio apéndice ofreve procedi- mientos detallades. part 1 preparacion de react vos y materiales, asf como alles sugerencias para ef educador, ‘TAMBIEN ACCESIBLE A TRAVES DEL PROGRARKA HARITUAL DE PUGEICACIONES DE W. HL. FREEMAN, Experimental Bioche- inistry esté diseflado para satisfacer todos las necesidades det laboratorio de bioguimies. Visite htp:/eustompub.whfrec- man.com para conocer més acerca de eéino crear su propio ‘manual de laboratorit estudiantes "] Esse icono conscta los materiales de ibro con aues tro sitio Web, Censulle en el interior de la cubleta frontal la dosceipcién completa de los recursos disponibles en \ww.whfreeman comfbiochems ~vceatticsser Sy, H, Freeman and Company tene ef orgullo de preseniar una coleccién semanal de restimenes y tun articulo de aparicign mensual de la familia de revistas Na- dure, incluyendo Narre, sus talos mensuales asocios y el recientemente lanzado Nature Review Journals. Por favor, vi- site: www.whifteentan.comvbiochems,| | Precio Hay un viejo prove:bio que atirma que uno nunca aprende realmente una asignstara hast cue la ensefia, Ahora sohewios que se aprende todavia mejor una asigmatura cuando se ecevihe sobre ella, Preparar la quinta edicién de Biochemistry nas his proporcinnado tuna mazavillosa oportunidad de reunir nuestro amor por la bioguimica y ta dovencia y compartir nuestro entesiasmo con estudiantes de todo el mundo, Aun si. el proyecto también ba resultado descorazoniador porque desde la publicacién de fs cuarta edlicisn se han tlevado a cabo muliauel de interesantes descubrimientos. La provuunta que nos plantedbamos continuaments era: ¢Cuiles son Tos eonocimilentos bioguafmicos que me- recen In pena’ Para responder a esta pregunta es preciso cominar a mayor cantidad posible de material nuevo y, posteriormente, decidir queé se incluye y, todavia peor, qué se excluye, Sin embargo, nosotros no empezamos a partis de cero, Nos sentimos a la vex afortunades ¢ intimidados al estar escribiendo Ja quinta edicién de la Bioguimica de Suryer. Afortunades porque tayimos como material de partida el mejor texto de bioquimica jams escrito. Intimidados porque tuvimos el desafio de mejorarto. En Ja medida en que lo hayamos conseguido, ha sido gracias 2 la ayuda de mucha gente. ‘Las gracias se dirigen en primer y destacado lugar a muestros estudiantes de le Johns Hopkins University ¥ Carleton College. No se ha escrito una palabra ni se ha tlatorado una ilustracién sin tener en cuenta que Drillantes y comprometidos estu- diantes detectarfan inmediatamente vaguedades y ambigiedades. Uno de nosotros UUMB} ageadece especialmente a fos miembros del laboraterio Berg el haber sopor- lado con tan buen dnimo afios de negligencia y requerimaientos para revisar Tos borra- dores de las ilustraciones cumdo deberian haber estado discutiendo sobre sas inves tigaciones, Coneretamente, da las gracias alas Dras. Barbara Amann y Kathleen Kolish, que han ayudado a mantener algo de orden en medio del esos, También agradecemos, A nuestros colegas de Ja Universidad Johns Hopkins y Carleton College que aos han apoyadlo, aconsejado, instruido ¥, sencillamente, soportado durante esta ards tarea. ‘Uno de nosotros (JT) fue galardonado generosamente con wna beca del Carleton Co- lege para liberarle de parte de sus tareas acadkmieas de forma que pudo centrarse mas en el libra ‘También estamos agradecidos a nuestros colegas de todo el mundo que han ae: tuado de revisores de Ia nueva edicidn, Sus comentarios meditados, sus sugerencias ¥ sus muestras de aliento nos han ayudado inmensamente a mantener fa excelencia de las ediciones precedentes, Estos revisores son: Mark Alper Michael Barbush Lukas K. Buehler University of California at Baker Universiny University of California Berkeley bogs See at San Diego L. Matio Amzel Johns Hopkins University © Aten Bush Johns Hopkins University os 1 Bieber Lniversity of Maryland, Paul Azari Michigan State University Baltimore Coury Colorado State University sy vet Beosnan ine cee Ruma Banerjoe University of Howard Hughes Medicat University of Nebraska Newfoundland Institute concentPREEACIO Oscar P, Chilson Washingson University Steven Clarke University of California at Las Angeles Philip A. Cole Jokns Hopkins University School of Medicine Paul A. Craig Rochester institute of Technology David L. Daleke Indiana University David Deamer University of California as Santa Cre Frank H. Deis Rutgers Universiny Eric $. Eberhardt Vassar College Dune C. Eichler University of San Francisco School of Medicine Stephen H, Ellis Auburn University ‘Nuran Ereal University of Missouri at Rolla Gregg B. Fields Florida Atlantic University Gregory J. Gatto Jn Johns Hopkins University Naney Counts Gerber Son Francisco State University Claibome Glover 1 University of Georgia E. M, Gregory Virginia Polytechnic Instite and State University Mark Griep University of Nebraska at Lincoln Hebe M, Guardiola-Diaz Trinity College James R. Heitz Mississippi State University Neville R. Kallenbach New York University 7 Hacold Kasinsky University of Britisk Columbia Dan Kirschner Boston College G. Barie Kino University of Texas at Austin James F. Koerner University of Minnesota Jobn Koontz University of Tennessee Gary R. Kunkel Texas A&M University David O, Lambeth University of North Dakota ‘Timothy Logan Florida Siate University Douglas D. McAbee California State University at Long Beach William R. Marcote, J. Clemson University Alan Mellors University of Guelph Dudley G. Moon Albany College of Pharmacy Kelley W. Moremen University of Georgia Scott Napper University of Saskatchewan Jeremy Nathans Johns Hopkins University Schoo! of Medicine Janes W. Phitlips University of Health Sciences ‘Terry Platt University of Rochester Medical Center Gary J, Quigley Hunser College, City University of New York des Howard Hughes Medical Instirute Gale Rhodes University of Souther Maine Mark Richter University of Kansas Anthony 8. Serianni University of Notre Dame Ann E, Shinnar Barnard College Jessup M. Shively Clemson University Roger D. Sloboda Darimouth University Carolyn M. Teschke University of Connecticut Dean R. Tolan Boston University Gordon Toltin University of Arizona Jeffrey M. Voigt Albary College of Pharmacy M. Gerard Waters Princeton University Linette M. Watkins Southivest Texas State University Gabriele Wienhausen University of California at San Diego James D. Willett George Mason University Gail R, Wilisky State University of New York av Buffalo Dennis Winge University of Uiwh Charles F Yocum University of MichiganPrelado ‘Trahajar con nuestros colegas de W. H, Feeemaa and Company ha sido una epe- Hencia manvillosa, Nos gustaria reconocer especialmente ef esfuerzo de las sizuienies personas. Nuestra editors de desarrlia, Susie Mor ba contribaide iamensamente al vito del proyecto, Durante este proces, Sussn se coavitid, a Ik fuerza, en uike este diante de bioquintica. Su comprensién sore como la materi de la asignatura. el fexto y | las ilustraciones serian percibidies por los estudiantes y su devoeién por la execlencia han sido ana verdadera fuente de inspieacion, ora det proyecto, Georgia Lee Hal- Ter. consiguié manejar fa totalidad det proyecto, desc el manuscrito hasta el producto fi nal, algunas veces con guante de terctopele y ofras veces eon mis fuerza, pero siempre de forma eficaz. Le meteulosa editors del mannserito, Patricia Zimmerman, aumenté la consistencia literaria y Ia claridad del texto, Las dischadoras Vieki Tomaselli y Pattici MeDermond hin efaborado un disefio y una maquetacisa elaros desde el punto de vista organizativo y aprauables desde ef punio de vista eststica, La bisqueda incansable de rues vig y Dena Betz, de las mejores fotografias posibles bu vinenie ua lurid y al alractivo del texto, Cecilia Varas, | Ja cooatinadors de tas justraciones, supervise sabiamenie el aspocto de cientos de nae jones y Julia de Rosa, ls divcctora de proxtuecién, manej6é con astucia todas las dificultades asociadas a 1a phiificacion, vomposicién y manufactaracién, | Neil Clarke. de la Universidad Johns Hopkins, Sonia di Vitorio y Mark Santee en- ibezaron Ios provectos nuultimedia nsociados al libro. La habilidad de Neil como pro- fesor y su conocimniento de fas ventajes y desventajas de Tos ordenadores, el talento de Sonia para editar y coordinar y su sentido del estilo y la gasti6n de Mark ai frente de tun proyecto en continue estado de cambio han hecho de! sitio Web un poderoso suplemento. | del texto cuya exploracise resulta muy divertida. También nos gustaria reconacer a los | lesurolladores multimedia que has convertido los guiones en las animaciones que se pueden encontear en nvestse sitio Wah. Por los mikiulas sobre Visiones Conceptuales daw | mes fas gracias a Nick McLeod, Koreen Wykes, ef Dr. Rey Tasker, Robert Bleeker yDa- | vid Hegarty. todos de disenos CADRE, Per las visnalizaciones tridimensionales de las rmoléculas et fos medialos de Visiones estructurales dames las gracias a Timothy Dris- | coli (molvisions.com —visuali de molgculas), Daniel I. Davis de lx Universi- dad de Arkansas en Payeiteviile prepars los cxsimencs interactives La editora Michelle Julet fue muestra snimadora, capstaz, consoladora y engatusadora, Cuando astibsinos cansedas, frustrados 0 dascoraranados nos mantenfa en movimiento, Junto a Michelle, los expertos en marketing John Britch y Carol Coffey nos introxlajeron en el nerocio de las publicaciones. Tumbién queremos da las gracias a los agentes do | ventas de W, H. Freeman and Company por sus excelentes sugerencias y st coneepeién | diel mercado, especialmente a la vicepresidenta de ventas Marie Schappert y también a | David Kennedy, Chris Spavins, Julie Hirshman, Cindi Weiss-Goldner, Kimberly Manzi Connaught Colbert, Michele Merlo, Sandy Manly y Mike Krotine. Damos las gracias a | Elizabeth Widdicombe, presidenta de W. H. Freeman and Company por no perder nunca Ta fe en nosotros, Por titi, el proyecto no habrfa sido posible sin el spoya constante de nuest milias, especialmente nuesttas esposas Wendie Berg y Alison Unger. Su paciencia, apoyo. y entusiasmo han hecho posible esta empresa. También damos las gracias 4 nuestros nie | Fios, Alex, Cotey y Ménica Berg y Janina y Nicholas Tymoceko por su paciencia y buen humor y por ofrecernos continuamente una perspectiva de lo que es realmente importante en la vida.PREFACIO a Con una repubisidid eronometien vas caieién cada siete aflos— el profesor Stryer socar a talus by guints edicion de su Fire aelminitile. Apante de ka proverbial eepositice y eleva nivel didietcn, en esta ogesi6n se advierten unas nove: hat sh. stores prest aces yy ntorias que quien © a eoluboraeiga de ds osos que sectualizan el libro —como aos explicah— Com Jas aporticiones mids recientes en cuimnta a texto, pro- blemas yf Sevuo: existen desde el principio materiales docentes complementarios muy tti- Jes por fueilitur el aprendizaje, entre los que se incluyen Jas paginas Web y un libro cde problems ‘AL ector espaiiol 6 hispanohublaate dobemos dec duccién. seeptan le camo siempre cue, en fa tra- s que las abreviatarss tienen rinse de Formulas y son por tao in traducibles (Ge spoyen en el nombre inekés: ef idioma oficial de la biogufiica), Ast, ror ejemplo, lecimos DNA y no ANN (par deoxynibenuciete acid), Namamos VLDL 2 las hipopoteinas de rauy baja densiduel trery tow density lipoproteins), etc. En ge- neral. est sivhis, aeeptadh: cniversaimenie, aelaran may bien el conceplo que encar- eauneio éste no se recuerda con exaetitu. Sin embarso, en esta Waducci6n nos hemos eesistide a uubizar excesives anglics- sos, tan comune en ols fext0s hispanos, tiles como, por ejemplo, Hamar a fas smut- tavioner de punto, puntuales. a los BNA ribosémicos, ribosomales, @ las proteinas vi ricas, virales, para no llegar agin dia ~ como dicon mis alumnos - & tratar los asuntos fanfics, vom animales. Pero hemos Hesse dmasiado tarde para salvar a las e3- tructuras “micorsacrieas” que ya son, par siempre. mitocondriales. A los biocatali- adores les seswnosHamando Jos enzimas (aunque sespetaonos naturalmente a quie- ties Tes sljlicas el ygnero femeninoy ya los conductos a través de las membranas 10 Jes fatnamas canes (un semticondueta se comprende bicn, pero un “semicamal” qu Donlni sor) aunque sf adoptamas otros ferminos, como “pateh clamp, eassette, es- pliccosome, primasas..." y otros mil batharismes répidamente difundidos y univ slmente ace Cootia on haber plasmado con fidetidad las ideas de los autores —miis el espiitu ‘que lz simple letra y deseo que esta obra excelent: sirva de ayuda efieaz para onu- preety poe odod boded © smd 3 mp Boged wey O ° Oo 8.3.1 ua rer ape do cna cnc 8. 11 moden de Mice Afenten ence pritbbd cea teciags aes a» Piha eles utente > Pppbiatsipasiaeat ne iatite tier ‘cine 7 i et 8.4.3 La mayutts de las reacciones bieguimicas inchuye rmiltiples sstatos 207 £14 Los envinnus alostéricos no siguen la cinética de Michaelis-Mewe 208 5 Los enzimas pueden inhibirse mediante moléeulas speed 209 Lo inhibiciin compssitiva y ne competitiva son Aisctaguibles cinekienineae 210 B52 Los inhibislores inreversibles se pueden utilizar para travsar el mapa det centro activa 210 8.5.3 Los andlopos ce! estado de transiciGn son eficaces, inhibidores de los enzimss 213 8.5.4 Los anticuerpos cataliticos demuestran la importancia de la unin selective del estada de wansiei6n para la actividad enzimética 213 85.5 La penicilina inactiva ineversiblemente un enizima clave en la sintesis de ts pared velular bacteriana 214 8.6 {as vitaminas son con frecuencia precursoras de Ios eoenzirans 216 86.1 Las vitamins hidrosolubles funcionan como coenzinas 217 8.6.2 Las vitaminas liposolubles pariicipan en procesos tan diversos como la coagulacisn de a sangre y Ia visién 219 Apéndice: Vie ¥ Ky se pueden determinar mediante la representacién doble reefproca CAPITULO 9 Estrategias cataliticas 227 9.0.1 Muchos enzimas utlizan unos pocos principios cataliticos bésieos 228 9.1 Protessus: facilitsn una reacelén dificil 28 9.1.1 La quimotripsing posee un residuo de serina sumamente revtivo 29 9.1.2 La accion de la quimotripsina tiene lugar en dos pasos cnlazados mediante un intermediatio unido covslentemene 9.1.3 La sesina forma parte de una iiada cataliien que incluye tambien a fa histidina y al éeido aspiitico 231 9.1.4 Las triadas eatalitieas se encuentran en otras ccozimas hidroliticos 24 9.1.5 La twiade cataltica se he analizado minuciosamente mediante mutagenesis dirigida 236 9.1.6 Las cistinprotessas,aspartiproteases y metaloproteasas son otras clases importantes de enzimas que escinden peptides 236 9.1.7 Los inhibidores de Ins proteasas son férmacos importantes 238 9.2 Anhidrasas earbénicas: aceleran las reaceiones répidas 239 9.2.1 Las anhidrasas carbénicas costienen un ion zine cesencial para ta actividad eatalitiea 240 9.2.2 La eatélsis supone la acivacién del agua por el zine 241 9.2.3 La tegeneractén rpida de ly forma activa del enzima se faciita mediante una lanzadera de protones 9.24 La evolueién convergente ha generado centras actives basados en el zine en diferentes anhidrasas carbonicas 244 9.3 Enzimas de restriceién: levan a cabo la escisiin del DNA mediante rraeciones muy espeeificas 248 9.3.1 La escisién del DNA se realize por una moléeula de agua activada por magnesio, mediante un desplazamiento, en linea deb oxfgeno 3° del fsforo 246ce ea 1 Los cavinns de restrieidn necesita magnesio oats br ative etalon 248 11 1 april eatalitic completo sélo se reine seampieias de mokculas tke DNA seeonoeido isi 248 sn lo cjpo 1 tlenen un Jnlomente estin relacionadas Ge genes 251 ties eaiico comin 9 prot Jeasido monofosfate quinasas: entalizan el 1 det grupo fosferilo entre nuctestidos sin Ia hid PLT Las NMP quinasas son una familia de enzimas que wen estructuras de bucle P 14.2 Lays auténticns susstaroe para pricicamente todos dns eaitnas dependientes de NTP son ios complejos de nclesido lrifosfato y magaesio (0 taangaweso) 254 “4.8 La unin del ATP induce grandes cambios ‘onformacionales 255 "9.44 Los dominios NTPasa con bucles P estin presentes ea diversas protefnas importantes 255 PITULG 10 Estrategias reguladoras: | tos enzimas y ta hemogiobina 261 10.1 La aspartato transearbamilasa se inhibe lostéricamente por ef produeto final de su propia via rmetabétien 262 WLLL La ATCasa conste de subunidades catalitieas y reguladoras separables 10.1.2 Las interacciones alostéricas en la ATCasa estan tnedindas por grandes combios en la estructura cuaternaria 264 19.1.3. Los enrimas regalados alostéricamente 0 siguen Ia cingticn de Michelis- Menten. 267 10.1.4. Los rwgeladores alostéricos modulan el equilibria entre los estados T y R 267 10.1.5 BI modelo concertado puede fornmularse en \érmminos cuantitativos 268 10.1.6 Los modelos seeuenciales también dan cuenta de los efectos alostéricas 209 10.2 La hemoglobina transporta eficazmente el oxigeno porque se une a él de forma cooperativa 269 10.2.1. La unign del oxigeno induce cambios estructurales jmportantes en las posiciones de! hierro ea ln hemoglobina 270 _pamerieescnsascnpcoseuncemnanrsieycc Indice 10.2.2 Lat unign del oxizeno meuditica ostensiblemente Ia estractara cunternarin de bs homme on 102.3 Fl efecto det 23-hinfnsfogticerato modula ln afinidad de fa hemozlebinw por ol exiseno m2 10.2.4 BI efecto Bohr: fos hidaweniones y el Jéxido de cearbone powenciaa fa Hikeraikin de os sen 2 10.3 1.98 isons aportans mados de regalacion especificas « los diferentes tejidos y en distintas fases del desaireolto 4 10.4 Una forma de regatar fa actividad enzi consiste en la miodificacion cnvalents 25 104.1 Le foofexibiedn es un mecanismie may efiew para regular Tas actividades de lay proteiinas diana 216 104.2 EL AMP cictico activa a fa proteina quinasa A porque altera su estructura cuaternris| 208 10.4.3 ELATP y la protefna diana se unen 2 una profunda ‘hendidura de In subunidad catalitica de Ia protein quinasa A. 279 10.5 Muchos enzimas se aetivan por escisiones ‘proteoliticas espeeifieas 280 10.3.1. Et quimovripsinégeno se aetiva por ruptura specifica de un tinico entace peptidice 28 10.5.2 La activacién proteolitics del tipsinégeno origina 1a formacisn de un centro para la unign del sustrto 281 10.53 La generacién de tripsina a partir de tripsindgeno cconduce @ Ia activacidn de otros zimégenos, 282 105.4 Algunos enzimas proteoliticas tienen inhibidores cespecificos 283 10.55 La coagulacién sanguinea se consigue mediante tuna cascada de aetivaciones de zimdgenos 10.5.6 Mediante ta rombina, el fibrinéyeno se convierte cen el cosigulo de fibrina 285 10,57 Una modificacién dependicate de tx vitamina K prepara a la protrombina para sv sctivicion 287 105.8 La hemofilia revel6 tina de Tas prineras etapas de lz coagulacisin 288 10.39 El proceso de ia cougutecidn debe ser regulado ‘con exactitud 239 5 11 Carbohidratos ULL Los monosaciridos son sitdehidos 0 cotonas con iutitiples grupos hidroxilo 296, TLL] Las pentosas y hexosas se ciclan para formar anillos de furanosa y pianos 298 11.1.2 Conformacidn de los anil de piranosa y de franosa 300 11.1.3 Los monesaciridos se unen a aleaholes y aminas por medio de enlaces glicosidicos 300 112 Los earbobidrates complefos se forman por tunién de monasacéridos 301 11.2.1 La sacarosa, lsctosa y maltosa son fos disacéridos nds comes 302 11.2.2 BI ghucdgeno y ef slenid6n son almavenes de glucose movilizables 302 11.2.3 La celulosa, el prinsipal polimero estructeral de las plantas esté Formac por cadenas lincales de unidades de glocost 303, 11.24 Los glicesaminoglicanos son cadenas de poliszeétidos snignicos Forraados por repeticiin de unidades de disacsridos 304oi INDICE H2.8 Unos encimss especitiens son responsables det censamblaje de los whizossesirides 308 H1.3 Los earbotidrates pueden wnirse a proteinas para formar gtiveprateines 306 HB. Los eubobidionss presen unitse-e fas proteinas a loves de micas de sspatracina (enlaces N30 bien sexing o wreonina genkivess On, 306 11.32 La glicositiciba de lis grofeinas tiene fg en €lintetior cel reticulo endoptismico y en el complejo de Golgi 307 11.33 Las glivoproteinas N-enluradas obienea sus anicares. iniciales de Cakes de dalicol en el rticuto endphisinico 308 11.344 Las vesteulas de ieaaspeorte Hevan las protefnas esd el reticuto endop ssrvice hasta et compleyo de Golgi para su posterior glicositaciin y distribucion 309 11.3.5 La manosa 6-fosfsto dirige a fos enzimas lisossmivos hacia sus destinos 310 11.3.6 Los rosiduos de glucosa se aifaden y se eliminan pa facilitar el plezamiento de las proteinas 310 11.3.7 Los otigosaesridos pueden “secuencianse” an 32 114.1 Las lectinas propician interacciones entte kas eéhulas 313 1142 Bl vinis de ta pripe se une a residuos de did silico 314 12. Las diversas membranas bioligieas tienen na serie de caracteristicas comunes 320 12 Lipidos y membranas celulares 319 12.2 Los sicidos grasos son componentes clave de los lipides 320 12.2.4 La nomenciaturs de los Geidos grasoss 320 12.22 La longitud deta cadena y ol grado de insaturacion de los écidos grasos pueden variar considerablemente 321 12.3 un las membranas hay tres tipos prineipates de lipidos 2 12.3.1 Los fosfotipidos son los lipids mas importantes de tas membranes. 322 125.2 Las membranas de Jas arqueobacterias estén, formadas por éteres lip(dicos con cedenas ramificadas 12.33 Los Mpidos de membrana pueden contener también hideatos de carbone 304 12.34 EE colesterol es un lipide basado en un aticfeo esteroideo 305 12.3.5 Los tipidos de membrana son motéculas anfipéticas que poscen una paste hidsofficn y otra bdr biea x 12.4 Los fosfolipidos y stieolipidos forman facidmente en medias Actos 26 12.4.1 Los fastotipies peston finmiar vest 1242 1 lipidieas 327 g bieapas hpi sea aiy dnpermneables a Jos iones y a ta mtyoria de bs mvak cules pire 125 Las prnteinas lesan a ¢ imayoria de los procesne que tienen lugar en tas membres 329. 12.5.1 Las proteins se anoeian con ia biespa Fipidiea ‘mediante formas muy varias 329 12.5.2 Las protefnas interaecionan con las membranas de smameras may diversas 330 12.5.3 Alpunas proteinas se asocian con lax: membranas mediante grupos hidsafobicns unidos de forma eovaente 12.54 Se puede predecir fa presencia de helices ‘ransmembranales a partir de la secuencia de arninogcidos 334 12.6 Los lipidas y muchas protefnas difunden répidamente en el plano de Ia membrana 35 12.6.1 El modelo det mosaico iluido admite el movimiento Iateral pero no ta tanstocacién a través de la membrana 336 12.6.2 La fluidez de fa membrana esti contsolada ppor la composicin de sus dcidos grasos y su contenido en colesteral 397 12.6.3 Todas las membranas biolégicas son asiméinicas 338 12.7 Lag cétalas eucar ticas contienen compartimientos dclimitados por membranas interna 338 12.7.1 Las protefnas se dirigen hacia compartimientos especificos mediante secuencis serial 339) 12.7.2 La fasin y la gemacién de membranas inaplican ‘muchos proceso biol6gicos importants Bal ‘onductos y bombas | de membrana 345 13.1. El transporte de molécolas a través de Jay membranas puede ser active 0 pasive 6 13.1.1 Muchas motéculas requieren protesnas \ransportadoras para atravesar fas membeanas 346 {3.1.2 Se puede cuantificar la energia libre almacenadta cn Ios gradientes de concentracion 347 13.2 Una famitia de proteinas de membrana emplea la hidrétisis del ATP para bombear iones a través de las membranas 3a 13.2.1 La ATPasa de calcio del reticuto sarcoplismico eS una proteins integral de membrane 348 13.22 Las ATPasas de tipo Pesiin conservadas desde un unto de vista evolutive y desarrolan una amplia gama de Funciones 350 13.2.3 La digital inhibe especificameate la bomba de Na! ¥ K™ porque Bloquea su dest sforilacién 350 13.3 La miihiple resistencia a firmacos y la fibrosis quistien ‘han llamado ta atencién sobre una familia de proteinas de ‘membrana con daminios de unin 2 ATP de tipo cassette 351| ARR RSS EIS TI TST ET [M4 Los transportadores sceundarios utllizan sradiente de concentracién para potenciar 1 formacién de otro geadiente 5 Conductos especiticos pueden realizar ripidamente f wansporte de jones a través de las membranas 383 135.1 Las medidas de conductaneia por “patch-clamp” revelan la actividad de conductos individuaes 354 13.5.2 Las proteinas de los conduetos iénicos estén csruidas a pattie de unidades similares 355 15:53 Los potencales de accn estin mediados por ‘cambios transitorios en lu permeabilidad al Nat y K* 357 13.54 El conducto de sodio es un ejemplo de conducto conitolado por voltaje 358 135.5 Los eonductos de potasio son homélogos del condueto de sod 359 13.56 La estructura del conducto de potasio revela el mecanismo del flujo idnico rapido y espeettico 359 13.5.7 La estructura del eonducio de potasio explica las répidas velocdades dot stanspese 302 13.5.8 Un condueto puede insetvarse por oclusion {i por: el modelo de la cadena de presiianio 368 136 Los nexus, 0 uniones sntimas, permiten el flujo de Tones y moléculas pequeiias entre eélulas comunicantes, 363, PARTE i) TRANSDUCC: ————~ ALM MIENTO DE LA ENERGIA 'ULD 14 Metabolismo: conceptos basicos y vision de conjunto 373 14.0. Las oélulas wansforman distnios tipos de energia 374 14.1 Bl metabotismo esti constituide por muchas reacciones acopladas ¢ interconectadas 374 1.1. Una reaccién termesdinimicamente desfayorable puede ser dsigida por otra favorable 395 14.1.2 ELATP es la divise universal de eneref libre en tos sistemas bioldgicns 376 14.1.3 Le hidrlisis del ATP diige el metabotismo mediante cl desplazamiento del equilibrio de las reaceiones acopladas. 377 {4.4.4 Bases estructurales del elevado potencial de trasfereacia de grupos fostorito del ATP 378 incice 14.1.5 El potencial de tanstecencia de fosfoetos es una forma importante 9) /a teansTonmacién de Ta enerp’a celular 14.2 La oxidaciéin de lay molGeukas earbonadas es uns fuente importante de [a eneryia celular 14.2.1 Los conipuesies de allo poencial de wemnsferenca de fosforilos pueden acoplar fa uxidactin det caubono con fa sintesis de ATP 14.2.2 Los gradientes de ines tries cle membranes proporcionan tna Forma importante de eneexia celular que puede ser acoplads con la sintsis sks ATP 14.23 Blapas ea la extraccidn de enerpia de fos alinnentos 143 Las vias metabélieas presentan muchos motives reeurrentes 14.3.1 Les transportadores activados son un ejemple lel sisetio modular ¥ de la economia del metabolismo 14.3.2 Las reacciones clave se repiten alo largo del metabolismo 14.3.3 Los procesos metabdlicas estin regulados principalmente de tes formas 14.34 Evoluciga de las vias metabsticas CAPT una introduccién al metabolismo ce la informacion 15.0.1 La Transduecin de SeBiales depende de los Cirewitor Moleculares: una vision general 15.1. Las receptores de siete helices transmembranales ‘cambian su conformacién en respuesta 2 la unién con el ligando y activan protefnas G 15.1.1. La unin del ligando a fos receplores 7TM causa Ia activacién de las proteinas G 15.1.2 Las Protefnas G oscilan entre las formas unidas a GDP y las unidas « GTP 15.1.3 Las proteiaas G activadas ¢ransmiten las sefales mediante su unisi. a otras protefnas 15,14 Las Proteinas G se desactivan de forma espontines| mediante ta bideslisis del GTP 15.1.5 ELAMP cieticw estinyula ta fosinl muchas progeinas diana mediance de la protefina quiasa A 15.2 La hidrslisis del fosfatiditinositel hisfosfate par ta fostolipasa € genera dos mensajeros 15.2.1 BI inosivob 1 Tiberas ions trisfosfate ace conductos para ‘ealein de los depisitos iuacetulaes, 15.2.2 Ei ciacilglieot activa a la proveina quinasa C, J cual fosforila muchas proteinas dina 153 Et ion caleio es un mensajera citosstica universal 15.3.1 Los Jonéforos permiten ta visulizacién de Jes cambios de concentracién det calcio 153.2 BI Calcio activa a la Calmodolina, nina proteina veguladora que estimula 2 muchos enzimas y transportadores 154 Algunos receptores se dimerizan en respuesta a la ‘unin con el lganda y expresan fa sevtat mediante fosforilacién cruzada 379 380 382 382 ah 386 390 391 15 Vias de la transtiuccion de sefiales 399 399 403 402 403 403 405 408 408 410 aninet INDICE I54L1 Alganos reveptores contlenen dominios trosina ‘quinasa dentro de sus estructuras covalentes, ala 15.42 Ras, otto tipo de proteina G sefalizadora 415 155 Los defcetos en las vias de seftatizacién pueden conducir al cincer u otras enfermedades 416 15.5.1 Los inhielas de La proteina quinasa pueden sec fiemacas anticanceswras efieaces 418 15.5.2 El célera y i tosferina se deben a une actividad allerada de In proteina G 418 15.6 Los aspectos recarrentes en tas vias de transduecin revelan ls reluciones evolu 49 [CAPRIS 1 Ghicolisis y Gluconeogenesis 425 160.1 La ghicosa es an combustible inportnte para ta mayor de oe organisms 26 162 Las fermentaciones suministran enerpa disponible en avsencia de oxigen 26 16.1 La plicolsis es una via de conversion de eneruia ‘en muchos organises 8 16.i La hexoxginas reliene fa glocesa ot la etal comienca ln gvolie as 16.12 La formncién de fractasa 1,6 -isfosfat 8 partir de lucas 6fosato 30 16.13 La aldolasa exind el azicar de seis earbonos cn dos fragmentos 6 tres earbonos 1 16.1.4 La triosa fosfato isomerasa recupera un fragmento de tres carbone a1 16.1.5 ‘Transformacion de la energia: la fosforilaciGn esti aacoplada a Ja oxidsciGn del gliveraldchido 3-fosiato por tun infermedianio togster 83 16.16 Formacién de ATP a partir de 1,3 bistosloglicerato 435 16.17 Gene: 16.18 Rendinnieny de cnengia de fs conversi6n de elucosa en pinussito 437 fa de otro STP y formacién de piravato 16.1.9 Mantenianiento del balance ren: Jos diversos destnos del piruvet 438 16.110 Bl centro de unin del NAD* es similar en rmuchas deshidrogenasas 16.1.11 Entrada do la fructose y Ta galsctosa en a glleotiss 440 16.112 Mochos adultos son intoterantes s la leche pique son deficientes en lactasa 442 16.113 Cuando falta la transferasa la galactosa results, muy 9 43 16.2 La vin glicolftica esta rigurosamente controlada 443 16.2.1 La fosfohetnapsinass es el emzima el control de fs aficalisis a4 16.2.2 Un envine bufuncional reswlado sintetiza y opratda fa finest 2 6-bistosts 485 16.23 La bevorquiasst y fs pirate quinasa marean también el ritmo de by gheobsis 447 16:24 Una familia de teansportadores posibiita kx cntrada y salida de glucoss en las ceiulas animales 448 16.25 Cénoet y plicolisis 449 16.3 La ghucoss puicde sintetizarse a partir de precursores no carbulidratados 480 16.3.1 La gluconces nesis no es la simple inversi6n de ta glicolisis 450 16.3.2 La conversiGn de pinwvato u fosfoenolpiruvato comienza con Ia formaci6n de oxalucetato 492 16.3.3 B) oxalacetato se (rausporta al citosol y se cconvierte en fosfoenolpinivato 434 16.34 La conversidn de fructosa 1,6-hisfostato en fiuctosa 6-fosfato y ortofasfato es un paso imeversible 454 16.35 La generacién de glucoss lidee es un importante punta de control 485 16.3.6 Ei la sintesis de glucose a partir de piravato se cconsumen seis grupos fostorilo de alto potencial de transferencia 455 16.4 La gluconeogénesis y la glicolisis se regulan de forma reciproca 456 16.4.1 Los ciclos de sustrato amplifican las sefiates metabélicas y producen calor 437 16.4.2. BL luctto y la alanina formados en ef misealo Ccontsietil se utiliza en otrus érganos 458 16.4.3 La glicolsis y la gluconeogenesis estén cntreeru7aidas evolutivanente 460 17.0.1 Una visiSn general del eiclo del deido eitrico 466, ITA El cielo del dcido eitrico oxida unidades de dos ‘earbonos 467 V7.1 Formacion de acetileoenzima Aa partir de pirsvato 467 17.1.2 Les enlaces flexibles permiten a la tipoamida desplazarse entre distinios centros activos 470 17.1.3 La citrato sintasa produce citrate a partit de oxalacetato y acetil-CoA an 17.14 El eittato se isomeriza a isocitrato 40 17.1.5 Fl isoctrato se oxida y descarboxita hasta eccetogiutarato 414 17.1.6 Por la descarboxilacién oxidativa det ‘-ceioglatarato se forma suceinil-coen ima A 475 17.1.7 A paste del succinil-coenzima A se genera un ‘compuesto con alto poteneial de iransferencia de grupos fosfato 495 17.1.8 Bl oxalseetato se regenera por oxidacisn del succinate anFy bveyniomcia del ciclo del deido efttico a cn el cielo del Seido citriea y sus contzoladas | H1 complejo piravate deshidrogenas se regal Jos waseamante mediante fesforitacién reversible 1 Leila del deida eittice esta controlado en vatios £8 Wt cielo del eido citricn es una fuente de views 1 Ul ciclo del deido eftrico debe ser caps de power com rapide, 16) Fa anterrummpeiéa del metabolismo del piruvato es 1 ste lef eriberi y del envenenamiento por mescurio 1.6 Baywculaciones relativas a fa historia evotutiva heli del acide eftice (C4 HT cielo del glioxitato permite a las plantas y Iti ereeer en acetate Fosforilacion oxidativa caviotas, ta fost las mitocondrias ion oxidativa tiene 1-1 Lass mitocondtrias estén rodeadas por una doble scant UL! Las mitocondtias son el resultado de una entasenbisis 18.2 La fosforitacién oxidativa requiere ta teimsferencia de electrones, 151 Bleetrones de aka energia: potenciales redox ‘cambios de la energia libre 131.12 Una diferencia de potencial de 1,14 voltios entre | NADH y el Op impalsa el transporte de electrones. » teaués do Ta cadena y permite la formacién de vic prnlionte de protones 2.4 Puede haber wansferencia de electrones entre sys que no esidn en contacto (8.5 Lat cadena respiratoria esta formada por cuatro iplejes: tres bombas de protones y una conexiéin. ica con el cielo del fide citric 12.1 Los eleetrones de sito potencial del NADH entra 48 480 481 482 482 2 492 493 494 494 496 497 498, vv fn cadena respiratoria por la NADH-Q oxidorreductass 499 tosiato y ATP. 20.4.3 Otra visin: el ciclo del Calvin y ta via de Tas pentosas fosfato 20.5 La plucosa 6-fosfato deshidrogenass tiene un papel clave en Ia proteceién frente a las especies veactivas del oxfgeno 20.5.1 Ladeficiencia en giucosa 6:tostato deshidrogenasa 59) 539 560 500) 560 362 563 568 566, 568 568 568 sm sm ‘origina un tipo de anemia hemolitica inducida por féemacos $71 | SESS a ese mercrateermnoy:cremmmememeneer mmerenrmctto-memmnmie nT165" Fs owasiones ana deficiencia de glucose 6-fosfate Iulia puede Ser una ventaja evolutiva Metabolismo del glacigeno 10-1 Una vision general det metabolismo det plueégene (in del glucigeno requiere » de varios enzineas 114 tat fastoribisa catalia fs escisiin fosforoiticn del once par dar ghacosa Lfostato 11+ Vora a depradacion def gluetgeno se necesita, anlen on enviaws deseamificante 11 La fastogiocomutasa convierte fa glucose I-fostato 1 haces Gf 1 -C FE higado contiene glucusa 6-fostatasa, un envina Fools asente en el maiiseulo 114 1M pikidoxal fosfato participa en la excision fale del glacdégeno “12 1 fosforilasa se regula por interacciones Mostevieas y fosfor 11 La fasforitasa de miiseulo se regula por Ia care 11 La tosforitasa de higado genera glucosa para su io ew otto afidos 4° 5 Lay fosforilasa quinasa se activa por fosforlacidn 1 tas tones ealeio 1.1 Ln adrenalina y ef gneagén son sefiales para la teyichwidn del gluedgena 11 Laws proteinas G transmiten la seal para et inicio ss lv degradacién det glucégene 11 Sar degradacién del glucégeno debe poderse le ssetw sipidamente 114 La regulacién de la glucSgeno fosforilasa se hizo ‘our coupleja a medida que el enzima evolucions HA 18 ghicdgeno se sintetiza y degrada por vias aerentes 111 La UDP-glucose es uns forma activada de (12 La glucbgeno sintasa cataiza la transferencia de Ivusa desde UDP-glucosa a una cadena en crecimiento 14.6 Un enzima ramificante foema los enlaces a-1.6 144 La plucdgeno sintasa es el cnzima regulador clave vs ta sintesis de glucégeno 145 BI ghuedgeno es una Forma muy eficiente de stnxgcenmamiento de glucosa sn S77 578 579 579 580 581 581 se 583 585 586, 589 580 580 500 so lngice mst regulan recipracamente degradacon y sis del gluedigeno se 592 15.4 La protein fosfatnst 1 inviere los efecins reguadores fe Jas quivasses en el mctabetisme del ghuedzena 592 21.5.2 La inviting estima ta siaesis del glacdgeno. a activa ba proteina fasfatast # 593 21.5.3 E) metabolisme del etmoigeno on ol bigauly regula ol nivel de ghicasa en sangre sig 2154 Las enFormedaes del ahnecmaicate de glucsigeno pueden entenderse en tErminos hixquionives 595) CAPITULO 22 Metabolismo de los dcidos grasos 601 22.0.1 Una visién general del metabotismo de los feidos grasos wot 22.4 Los triacilgliceroles son depésits de ener may concentrada 6 22.1.4 Los lipides de la dieta se digietea mediante 1as fipasas pancredticas re 22.1.2 Los lipidos de la dieta se transportan en los uilomicrones on 22.2 La ulilizncién de los fides grasos como combustible requiere tres ecapas de procesamiento 60S 2.1. Las lipasas seguladas por AMP ciclice hidrolizan 2 los triacilgliceroles ms, 22.2.2 Los deidos grasos se unen al coenzimna A antes de oxidarse 60%, 22.23 La carnitina transporta los dcidos grases de cadena Targa activados hasta la mati miiocondal oer 22.2.4 En cad vuelta de ta oxidacién de fos dcidos grasos se genera acetil CoA, NADH y FADH; oor 22.2.5 La oxidiacién completa del palmitate sinde 106 moléeulas de ATP 609 22.3 Clertos decidas yrasos requieren etapas adicionales para su degradacién oi) 22.3.1 Para la oxidacién de los écidos grasos insaturados se requieren una isomerasa y una reductasa 10) 22.32 Los deidos grasos de cadena impar producen propionilcoenzima A en la tiolisis de la etapa final el 22.3.3 El propionil-Coa se convierte en sneeinil-Coa en una reaceién que requiere vitamina Bye oil 22.34 Los fcidos grasos también se oxidan on los peroxisomas ou 3.5 Si predomina ta degradacida de las grasus, a partie ‘del aceti-coenzimaa A se forman cuexpos ceténicos 61s 22.3.6 Los cuerpos eet6nicos son un combustible importante en ciertas tejidos, 616 22.3.7 Los animales no pueden convertt los fides _prasos en glucosa or 224 Los dcidos grasos se sintetiann y degradan por vias diferentes, on 22.4.) La formacién de malonil-cocnzima A es la etapa limitante en ta sintesis de cides grasos ow 22.42 Los intermediarios en la sintesis de Ios dicidlos ‘estin unidos a una proteina portadara de aclosfnpice 22.4.3 EI cielo de clongacién en la sintesis de fos éeitns Por un complejo enzimico mubifancieinal 22.45 La unidad flexible de fosfopantcietna de kt ACP. (anspor el sustata de un centro acs x otto 22.4.6 22.4.7 Ei citrato wansporta grupos acctilo dese ta mitocondhia hasta e! citosol para Ia sintesis de fciclos pasos 22.4.4 Ea tos eucariotss tos deidos graces son simtetizades ais 620 2 22.48 Fuentes de NADPH para la sintesis de didlos grasos. 623 22.49 Los inhibidores de fa Geido graso simetasa pueden ser firmacas ities 2.4.10 Variaciones sobre an tema: la sinterasa de poliquétidos y fa sintetasa no ribosémica de pptidos se parecen a la dcida graso sintetasa 22.5 La acetileoenzima a carbos! ‘laye en el control del metabol 2.6 La elongacién y ini ‘grasos se realizan por sistemas end 22.6.1 Les enzimas unidas a la membrana generan Scldos grasos insaturados ino de los Seidos ysaturacién de los eidas mitieos accesorios 22.6.2 Las hormonns eicosanoideas derivan de deidos 180s poliinsaturacins {7UL2 23 Recambio de las proteinas y catebolismo de los aminadeldos 23.1 Las proteinas se degradan a aminodcidos 23.1.1 Digestion y absorciéin de las proteinas de ka dieta 23.1.2-Las proteins eelulares se degradan a velocidades Uiferentes 23.2 Bl reeambio proteico est muy regulado 23.2.1 La ubiquitina etiqueta a fas protefnas para su destruceién 3.2.2. Bl proteasoma digiere las proteinas marcadas con ubiguitina 23.2.3 La degradacién de las proteinas puede utilizarse pera regular funciones bioligicas 23.24 La vin de ta ubiguitina y el proteasoma tiene sts Ccorrespondiantes procariticas 23.3 La primera etapa de ta degradacién de climinacidn del nitrégeno 23.3.1. Los gnupos e-amiino se convierten en in amonio por desaminacion oxidative del glatamato 23,3.2 En fas aminotransferases, et piridoxal Fosfaro Foema bases de Sch intermediarias 23.33 La aspartato aminotransferasa es miembro de tuna famitia grande y versiil de enzimas dependientes Je piridoxat La serina y ta treonina pueden desaminasse 23. oa isa gjerce una Funciéa rasa 624 626 026 626 633 co 6a 634 635 635 636 638 638 a9 639 640. 62 083 683 }4 ¥1 lon amonio se convierte en urea en la mayoria de los vertebraclos terrestres ag 23.4.1 cick de la urea comicnza con la formacién de carbamnitiost ae 645 2 Fl cicto de ti urea est ligado al cielo del dcide citicw 646 34.3 Eeohovin del ciels de ta aren 646 254.4 Deteetos hereitarios del cicte de he urea produeen hiperamoneunia y pueden ocasionar isiones cereteles 647 23.4.5 Le wea wo e« Ja inien manera ie deshacerse del exoeso de miisigen 648 23.5 Los dtomos de carbone de ios aminodcidos degradados aparecen en los principa inntermediarios metabéticos 649 23.5.1 EI piruvato come punto de entrada al metabolisme 650 23.5.2 Bl oxalacesato come punto de entrada al metabolismo 650 23.5.3 Bf e-cetoglutarato como punto de entrada al rmetabotisme 651 23.54 El succinil-coencima A es un punto de entrada para vatios aminoseidos no polaees 682 255.5 La degradacion de la motioning requiere le formacisa de un donante de metios, la S-adenosilmetionina 652 23.5.6 Los aminoseidos de cadena ramificada originan acetil CoA, aeetscetate y propionil-c 0A, 652 25.5.7 Para la depradaci6n de los amsinogcidos aromiticos 654 “4 Biosintesis de aminodcidos 24.0.5 Una visién de conjunto de la sintesis de ami 24.1 Fijacién det nitrogeno: los microorganismos utiliza ATP y un potente reduetor para reducir el nitrégeno atmosférico a amontaco 666 24.1.1 cofactor herro-matibdeno de la nitrogenase se lune al nitrégeno atmosferico y lo reduce 667 24.1.2 BY ion amonio se incorpora @ los aminodcidos a través de glutamato y de ghiarnina 668 24.2 Los aminodcidos se construyen a partir de ios del elelo det feido eitriew y mportantes: 676. 24.2.1 Los seres humanos pueden sintetizar algunos ‘auninodcides pero deben obener ef resto a partir de la dieta or 24.2.2 La quiralidad se estublece en una etapa comin 1 todos los uminosicidos on 24.2.3. Para formae asparragina 8 partir de aspartate ‘se necesite un intermediario adenilado on 24.2.4 El glutamaio es el precursor de la glutamina, poling y arginina 672425 La serina a cisteina y a gficina se forman a pair el 3fosfogicerato ou 24.2.6 1 tetrahidrofolnto transporta fragmentos ‘monacarhonlos activados cen diversas grads de oxidacisn on 24.2.7 La S-adenosilmetionina es et principal donador de grupos metilo ow 24.2.8 La cistefna se sintetiza a partir de serina y hornocisteina 678 24.2.9 Un nivel clevado de homocistefna esté relacionado con enfermedades vasculares ow 24.2.10 El siquimato y ef corismate son intermediarios en la biosintesis de aminoscides aromsticos 678 24.2.1) La tript6fano sintctasa ilusira a canalizacién de sstratos durante Ia: 68) 243 La biosintesis de aminodcidas esté regulada por retroinhibicion 681 24.3.1 Las vias ramificedas requieren una regutacion comple 682 24.3.2 La actividad de la glatamina sintetasa esta rmodillada por una cascada enziradtica ona 244 Los aminoicidos son fos precursores de muchas Diomotéculas 685, 244.1 BI alutation, un »-glutamil-péptido, ‘amortiguador de sulfhidtiles y como antioxidante 686 24.4.2 Bl éxido nitrico, una motécula seal de vida media may breve, se forms a partir de ls arginina 686 24.4.3 Las porfirinas do mamiferes se sintetizan & partir de glicina y succinil-Coeuzima A 687 24.4.4 Atgunos tsstoos congénitos del metabolismo de las porfirinas provocan su acumulacién 88 APITULG 25 Biosintesis de aucleétidos 28.0.1 Visin de conjunto de la bioséntsis de nuclides ¥y sa nomenclatura 604 25.1 En Ia sintesis de novo, el anillo de pirimidina se construye a partir de bicarhonato, aspartato y alutamina oon 25.1.1 El bicihonato y otros compuesios de carbone xigenados se activan por fosforilacién 695 25.1.2 Ta cadena lateral de la glutamina se puede hrideolizae para genera amoniaca 695 25.1.3 Los intesmediarios se pueden desplazar entre los 696 ccentros sctivos por eanalizacién indice —-bow 25.1.4 F ogniate incorpora un anillo de ribosa procedente fel PRP pera focmar un nuclostide pivimidinico que se convierte en uridtate 1.5 Los nnclesitidas mane, di- y tifostito son interconvertibles 25.1.6 La CTP se forma por aminscién de UTP 5.2. Las bases pairicas se pucien sintetizar de novo 0 reciclar mediante vias de reseste 252.1 Las vias de recuperacién disminuyen el gasto de enesgia itracelular 25.2.2 FI sistema de anillos de Ia purina se easambla sobie Ia ribosa fosfato 25.2.3 El anillo de purina se ensambla mediante sucesivas telapas de activacion por fostoritacién y sustiucién 252.4 EL AMP y el GMP se forman a partir de IMP 25.3 Los desoxirribonuclestidas se sintetizan por reduceidn de ribonuclestides mediante wn mecanisino ‘en el que intervienen radlicales 25.3.1 EI timidilato se forma por metilaci¢n del ae ivridilato 25.3.2 La dihidrofolato reductasa calaiza la regenera {el tetrahidrofolato, an wansportader de fragmentos monovarbonados 3.3 Ciertos firmacos anticanceripenos de gran eficacia Dloquean la sintesis degimidtato 25.4 Las etapas clave de a biosintests de nnetestidas se regulan mediante retroinhibiei 25.5 NAD*, EAD y coenzima a se Forman a partir del ATP 25.6 Aiteraciones del metabolismo de los nuclestidos pueden pravacar situaciones patolégicas 25.6.1 En los seres Inrmanos, las purinas se degrada ‘urate 696 or 698, 698 699 701 702 704 05 705 107 708 709 709 Rnineaesaaiccasa a cRNMNRGRIRRE TOORAK Cagis meetin ttevoxxte| — INDICE 25.6.2 Pl sfndrome de Lesch-Nyhan es una consecuencia dramtica de mutaciones en un enzima de las vias de sseuperacign 70 ‘osintesis de lipidos de | membrana y de esteroides ns 26.1. Et fstatidate os wn intermediario comin en la sintesis de fosfolfpldos y triseilglicevoles 16 26.1.1 La sintesis de Fosfolipidos requiere on Intermediario acuvada 116 26.1.2 Los plasmaldgenas y otros cterfosfolipidos se sintetizan a portir de dilidroxiaectona fasta 18 26.1.3 Los esfingefipidos se sintetizan a partir de un cerimide’720 26.1.4 Los ganglidsidos son estingolipids ricos en cearbohidralos que contienen azicares fcidos mm 26.1.5 Los esfingolipidos confieren diversidad a be estructura y funcién de los Hpiddos ma 26.1.6 61 sindrome de la dificultad respiratoria y ta enfermedad de Tay-Sachs son resultado de trastornos del Imetabolisino lipftien. nm rol se sintetiza a partir de ima a en tres etapaas m2 262.1 La sinesis de mevalmato, que se activa a isopentilpirofosfato, inicia la sintesis del eolesteral m3 26.2.2 BI eseualena (Cy) se sintetiza a partir de sois moiéeulas de isopentlpitofestato (Ce) ms 26.2.3 Fl escualeno se cicla para format colesterol ns 26.3 La compleja rogutacién de la biosintesis de colesterol tiene Ingar a varios niveles 76 26.3.1 Las lipoproteinas transportan colesterol y twacilgliceroles por todo el organismo mm 26.3.2 Las concentraciones sanguinens de ciertas lipoproteines pueden ser iiles para el diggndstico 728 26.2.3 Las lipoprotcings de beje densidad desempefan un papel clave en el metabotisino del eolesterol 728 26.3.4 El reveptor de LDL es una protefna transmembraal on cinco regiones fueionales diferentes 730 26.3.5 La earencis del receptor de LDL. origina hipercolesterolemia y ateraselerosis 730 26.3.6 EI mantenimiento clinica de las concentraciones de colesterol puede comprenderse a nivel bioguimico ma 26.4 Ente los derivados importantes del colesterol se inctuyen las sales biliores y las hormonas esteroideas 73 264.1 Nomenclatura de las hormonas esteroidens 13 264.2. Los esteroides se hidroxilan mediante fas chtoeromo P4S0 twonooxigenasas que uiilizan NADPH y O, 734 2644.3 Bl sistema citccrome P450 es general y realiza una funci6a de proteccién 735 2644 La pregnenolona, un precursor de owes muchos esteroides, se forma a partir del colesteral por ruptura de st cadena lateral 735 264.5 Stntesiy de ta progesterona y de los cotticasternides « partir de la pregnenotona, 7s 26.46 Sintesis de los andrdgonos y de los estrdgenos a patir de pregnenotona 736 ae tc st SNE 26.4.7 La vitamins } deriva del sterol por la aceién de Ia Juz que compe un tus anton io Fi os precuseor de ana amplia 738 [capinu ed : | reparac 745 27.1 FLDNA powde adaptar diversas formas estruettarales 745 2TAA BEDNA-A os tat dt -on caracteristicas diferentes de las del DNA-B, ta forma més frecuente 747 27.1.2 Los sureos mayor y menor estén recubiextos por grupos capaces de formar poentes de hididgeno especificos de la seevencia 748 27.1.3 Los resultados de estudios de existates de moléculas iénticas de DNA han puesto de manifesto varisciones locales en la estructura del DNA, 748 27.1.4 FI DNA-Z es una doble hélice levégira en la que los foslatos del esqueleto se disponen en forma de zigzag. 749 27.2. Las DNA polimerasas necesitan un molde y un chador 750 27.2.1 Todas las DNA polimerasas presentan saracteristicas estructurales comunes 750 Gm de la polimerasa intervienen dos iones metsiicos unidas 751 27.2.3 La especificidad de la replicacién ests doterminada por la formacicn de puentes ée hidndgeno y por fe complementariedad de forrnas entre las bases 751 27.2.4 Muchas polimerasas cortigen las bases recién alladidas y climinan los ervores 752 27.2.5 La separaciéa de las hebras de DNA reguiese hrelicasas especificas y la hidrlisis de AFP 183 27.4 EI DNA de doble hebra se puede enrollar sobre si mismo para formar estructuras superenrolladas. 734 27.3.1 BI iimero de enlace del DNA, una propiedad (opol6gica, desermina el grado Ge superenrollamiento 754 27.3.2 FI ndmero de giros compleios de fa hélice y el grado de torsiGis de In supethélice estén relacionados entre si medianie el nmere de enzce 27.3.3. Las topoisomerasas de tipo T reljan estructuras superenrolladas 736 27.4.4 Las topolsomerasas de tipo IT pueden introducie superenrollamientos negatives por medio det acoplamiento 2 fa hidelisis det ATP. 157 274 La replicacién de las dos hebras del DNA ene hgar rapidamente a partir de lugares especificns de iniciacion 759__ ae 274.1 La primera simtetizs un eebador que permite ef is det DNA 7160 274.2 Una de tas hebris del BINA se sintetiza de forma continua mienivas que ls ot sinetiza a base de fraganentos 761 274.3 La DNA livasa une los extremos del DNA et resiones de cable hebra 761 27.44 Li replicacidn del DNA reyuiere polimerasis cow tun elevaddo nivel de progresividiad 762 2745 Las hebras guis y xetardads se sintetizan de forrna coordina 763 27.4.6 La siptesis de DNA es mis compleja en eucariotas que en procariotas 64 27.4.7 Los telémeros son estructuras caracietisticas de los extremos de crommosomas fineales 105 27.4.8 Los telmeros se teplican mediante fa telomerasa, tuna polimerasa especializada gue lleva su propio molde de RNA, “765 275 A veces. moléculas de DNA de doble hebra con secnencias parecidas se recombinant 166. 27.5.1 Las reacciones de recombinacién se realizan a través de intermediarios con wniones de Holliday 766 27.5.2. Las recombinasas estin relacionadas cevolutivamente con lus topoisomerases 168 27.6 Las mutactones imptican cambios en Ia secaencia de bases del DNA, 768 27.6.1 Algunos mtégenos guimicos son bastante espectficas 769 27.62 La luz ulttavioleta produce dimeros de pirimidina 770 27.63 Se utiliza toa una gama de vias de repacacin el DNA 70 27.5.4 En el DNA, la presencia de timina en lugar de ‘uracile permite la reparacién de Ins eitosinas desaminadas 771 27.6.5 Muchos tipos de efiwcer se deben a una reparacion defectuosa de! DNA ™m 27.66 Algunas enfermedades genéticas se deben a la ‘expansin de repeticiones de tres nuclesties 7 27.6.7 Muchos earcinéigenos potenciales se pueden Geteetae 9 partir de sua on mutagénica en bacterias 773 PATULO 28 Sintesis y Maduracién del RNA 781 28.0.1 Una visigu general de la sintesis del RNA 782 28.1 La transcripeién esti catalizada por la RNA. polimerasa 783 28.1.1 La transcripeton comtienza en las secuencias ‘promotoras del molde de DNA, 784 28.1.2 La subunidad sigma de la RNA polimerasa recomoce a fas secuen 1s promatoras 785 28.1.3 Para que tenga lugar Is transeripeion 1a RNA. polimerasa debe desenrollar In dable hélice del molde 786 28.1.4 Las cadenas de RNA se forman de novo y creben cel sentido de 5! a 3° 786 28.1.5 La elongacidn tiene lugar en burbujas de transeripeién {que se desplazan a To largo del molde de DNA 787 28.1.6 Una boruuilla de RNA sepuida por vanios vesiduos de luracto determina el fin de Ia transcripcin de algunos genes. 788 lncice 28.1.7 La poe eo ayinls a Finalizar bs ranseripeién fe sigur 789 28.1.8 fos preeunsnres lel RNA tls tunsferencia y ribesimiey sulicn hidetiisis y nuuiliciones quinieas dospucs de la eranseripoion 790 nseripelin 91 28.2 Fit eueariotas, Ix transcripeiin y ba tradueciin estén separadas en el espacia y en el Liempa, 32 28.2.1 Bu tos cucarioras, el RNA se sinfotize) mediante Ines pos de RIVA polimerasas 793 28.2.2 Blementos que actiisn en cis y en trans: Bhaguees y llaves de la transeripcion 794. 28.2.3 La mayorta de jos promatores de la RNA polimerasa TI prescntau up compartimionta ‘TATA TATA box") proximo a La secuencis ds inicio de fa ttansoripeién 794 28.24 La protefna que se une sl compartimiento TATA, inicia el ensamblado del complejo de tanseripeiin activo | 795 28.2.5 Con los promotores de excariotes interaccionen ritiples factores de transcripcién 796 28.2.6 Las secuencias porencindoras pueden estima la ‘ranscripeiin de secuencias con inicio a miles de bases de distancia 797 28.3 Los productos de Ia transeripelin de las tres polimerasas de eucariotas deben procesarse m7 mRNA se ita 28.3.1 Bn los extremos del transerito pe tna cofia en 5 y una cola politA) en 3° 798 2832 La modificacién posttransetipcional del RNA modifica ls proteinas codificadas por et mRNA 798 28.3.3 Los puntos de corte y empalme de los precursores de mRNA se especifican mediante secuencias situadas cen fos extreimos de los intrones 799 28.4 Fl empalme eonsiste en dos reacciones de teansesterificacion 800) 28.3.5 Los RNAs aucteares pequefos (siRNAs) de fos espliceosomas catatizan el empalmado de los precursores del mRNA 80 28.36 Algunas moléculas de pre-mRNA pueden softs empalmes segtin vfs alternaivas y producir mRNAS diferentes 303 28.4 Bl descubriniiento det RNA catalitio results revelador tanto desde el punto de vista del mecanismo como de la evolucién 804 Uio = Sfntesis de proteinas 813 29.1 La sintesis protete traduceién de requiere seeuencias de nuclestidos a secuencias de aminoicidos 814 29.1.1 La sintesis de protefnas largas requiere una frecuencia de error pequena sid 29.4.2 Lay moléculas dle RIVA de transferencka tienen un disetio comin ais 29.1.3 El aminoSeido activado y el anticodén del RNA estén. en los extemos opvestos de la molécula con forma de L. 817 29.2 Las aminoncil-{RNA sintetasas interpretan et cédigo genétleo 8i7 29.2.1 Los aminodeidos se activan al eomienz por adenilaci6a sis.noice 9.2.2 Las aminoacil-12NA simttasus Cienen ngares de uctivacidn may discriqwicativos para Tos aminoicidss 819 29.2.3 La coneccivn de pruebas dle las amtinasei- NA Sntetasas sumenta ia deta en Ja sintess de fas preteinas 820 20.24 Las sintetasas reerinoeen Jo kes vatican» los tallos aceptores de fas moticuis de RNA de transtewencia 820 29.2.5 Las aminoacilIRNA sintoi: puede disse con das clases. 822 29.3 Un ribosoaa es una particule ribonuclenproteiea (798) formada yor waa subunidid pects (30S) y otra grande (50S) 823, 293.1 Los RNAs ribosémicos (58, 168 y 235 FRNAs} Xesemperian wn yapel fundamental en Ia Sintesis de: las proveinas 4 203.2 Las proteinas se sinttizan en la direecign del exttemo arsinico al catboxtlicn 526 29.3.3 EL RNA mensajern se traduce en la direceién esas 826 2034 La sebial de partida es AUG (0 GUG) prosedida or vais buses que se aparean con el FRNA de 16S 827 29.3.5 La sintesis de proteinas en las bacterias se inicka con el formiimetionil-RNA de transferencia 828 29.3.6 Los ribosomas tienen tres lugares de unién paca Jos (RNAs conformados por las subunidsdes 308 y 708828 29.3.7 Cando se forma del enlace pepticlicn, ta enema Polipepiica en crecimiento se transfiore ce un 1RNA a otro 829 20.3.8 Sélo las imerucciones codén-anticodén determina 1 aminodcide que se incorpora 831 293.9 Algunas moigculas de RNA de transferencia Feconocen més de un cod6n a causa del halaneco cen ef apareamienta de las bases 832 29.4 Los factores proteicos desempefian papeles clave en Ia sintosis de las proteinas 933 204.1 1 formilmetionilRNAF se coloca en ct Iugar P del sibosoma durante fs fortmaci6n del complejo de iniciacm 708 833 29.4.2. Los faczores de elongacin iransportan los faminoacil-RNAs al sibosonia 934 204.3 La formacidn de un enlace peptidico va seguida de ta ‘ranslocaciGn, dependiente de GTP, de fos RNAS y ef mRNA SM. 29.44 La sfotesis de Ta proteins se termina por medio de Factores de liberacién que Teen los eadones stop 535 29.5 La sintesis de proteinas eucariétieas difiere de la sintesis de proteinas procariétieas privelpalmente en ta inicincidn de la traduccion 837 nner erent EES 29.5.1 Muchos antibidticos sctian por inhibieién de Fa sintesis proteien sag 29.5.2 La toxina de Is difteria blogues la sfntesis de proteins en cucatictas al inbibir a nanslocseiéa 829 tabolisme 845 nn del 1.4 FL metabotismo consta de vias metabélicas facrtemente interconeetadas 845, 30.1.1 Mecimissws freoucates en la regulacicn metabsticn 846 30.1.2 Principales vies metabticas y centros de contrat 847 30.1.3 Conexiones clave: glucoss 6-fostito, piruvato y acetil-CoA 949. 30.2 Cade drgano tlene un perfil metanstico caracteristica 851 30,3. La toma de allmento y el ayuno inducen, cambias metabéticos 854 30.3.1 Las adaptaciones metabsticas al eyano profongedo Feducen al mfnimo la degradacién de proiefnas 856 303.2 Los desajustes metabélicos en la diahetes derivan de luna relativa deficcncia de insalina y exceso de glucagon 858 30.3.3 Homeostasis calérica: una forma de regular l peso corporat 858) 304 La seleccién de combustibles durante et elereiclo viene determinada por la intensidad y la duracié, de la actividad 800 30.5 Et etanol altera ef metabolismo energético et higado 864 31.1 En procariotas, las protefnas que se unen al DNA, To hacen de forma especifica 2 los lugares de regulaciGn de los operones 868, 311.1 Un operdn esta formado por elementos de regulacidn y por genes que codifican protefnas 809) 31.1.2 El operador lac tiene una secuencia de bases simérsien 870 31.1.3 En ausencia de lactosa, fa protefna represora lac se une al operador y bloguea Ia transcrip 870. 31.14 La unis de figandos puede provacar cambios estructurales on proteins reguladoras 87 31.1.5 En procariotas, ef operén os una unidad de regulacién habitual 872, 31.1.6 La anscripcidn se puede estimatar medianie proteinas que establecen contactos con la RNA polimerasa 873 SLIT BL motive hélice-giro-hélice es freeuente en muchas proteinas procaristicas que se unen al DNA. a 31.2 La mayor complejidad de fos genomas eucariéticos requiere intrincados meeanismos de regulaetén génica 874 31.2.1 Los mucleosomas son eomplejos de DNA e histonas 875 31.2.2 BLDNA eucaristica se enrolla slrededer de Jas histonas para formar los mucleosomas 876 31.2.3 Bl control de Ig expresion géniea requiere la reestrueturacion de Ja eromatina sirM24 Los intensi cadores estimulan la transeripein al pperiurbar fa estrcctara de fe cromatina 878 12.5 Le modifieaciéa del DNA puode alterar Jos patrones Ue expresién geniew 878. BLS La activacién y ta eepresién de fa transeripeisn festin mediadas por inferacciones proteina-proteina 879 31.1 Los esteroides y otras moléculas hidrofbicas ‘Similares atraviesan la membrana y se wen a receptores: aque se unea al DNA 879 31.3.2 Los seceptores hormenales nucteates regulan la transcripeién mediante la incorporacion de cosctivadores {y correpresores al complejo de transcripei6n, 881 31.3.3 Ciertos Mirmacos acnéan sobre los receptores de hormonas esteroidens 883 21.3.4 La estructura de la eromatina se modula mediante tmodificaciones covalentes de Tas cola de las histonas 884 51.3.5 Las desacetilasas de histonas contribuyen a reprimir fa transeripeion 885 31:6 La unién de lgandos a receptores de la membrana puede sar Ia transctipeién mediante cascadas de fosforitacin 886 91.3.7 La estmetara de la eromatina disminuye el tam: ‘el genoma de una forma muy effcaz 314 La expresién génica se puede controlar a niveles post-transeripefonales 887 31.4.1 Bn procariotas, a atenuacién es un mecanisme que regula fa transeripeién modutando la estructura secundaria del RNA naciente 887 31.4.2 En animales, los genes relacionados con et metabolism del hieiro se regwlan a nivel de la traduccién 888 PARTE IV RESPUESTA A CAMBIOS ————"_ AMBIENTALES CAPITULO 32 Sistemas sensoriales B97 32.4. El ofato detecta una amplia variedad de eompuestos orgainicas 898 32.1.5 La capacidad olfativa esté mediada por una familia ‘enorme de receptores con siete hélices transmembranales 899 32.1.2. Las sustancias olorosas estAn codificadas por un ‘mecanismo counbinatorio sor 52.1.3 Imngenes por resonancia magnética funcional revelan regiones del cerebro que procesan informacién sensorial 902 Indice —foexvil 32.2 EL gusto es Foncionan x conv finacién de sentidas que de diferentes mecanismos 32.211 Lo secueneiacién del senoma himano ha permitido ‘estabrir wns gran familia le eeeptores 77M para eb 32.2.2 Ue pluses TIM resgonde a os ccempaeste 32.2.3 Los sabores salads se Hetcrtan mnicialmens por el paso de tenes soc 19.24 El sahor 2 ues a comklct0s nics o proceds de Tos elovtes de tos Inidrogeniones ¢ieios) en lox condu 32.25 Umami, el sahor del gletuinat», se detoetn por tuna forma especializada fe ecepror de watt 32.3 Las molGeulas Fotorrecepto 1a luz visible 32.3.1 La rodopsina, an receptor 7TM especializado, fabsonbe ta loz. visible 32.3.2 La absorcion de Ia fwz induce una isomerizacién cespecttiea det H-ets-retnal anid 32.33 La disminucidn de los niveles de ealeto. inducida por Is luz, coordina ta recupera 3234 La visi6n en color est mediada por tres eceptores 4e Tos conos, que son homelogos Ge la rodopsina i: det ojo detectan 32.3.5 Ciertas recombinaciones en fos genes de fos plementes verde y rojo provocan Ia “ceguera a os colores” 324 Ja audicién depende de ta deteccién testimullos mecénicos ida de 324.1 Las cefulas auditivas emplean un haz coneetado de eslorcocilios para detectar rovimientos tnuy pequetios 32.42 Se han identificado condvetas mecanosensibles en Drosophila y en bacterias 325 Bl tacto incluye la sensibilidad a ta presién, temperatura y a otros factores 32.5.1 Estudios sobre In capsaicina, el principio active de Tas guincillas, revelan ta existen ‘alas alkas temperataras y otros estos doloresos x “ambientales como et campo magnStico terestre 2 Sistemas sensores sutles detectan ros factores [ CAPTULO 33 EI sistema inmunitario 33.0.1 EI sistema inmnunicario se adapta utilizando Tos principios de la evoluein 33.4 Los antieuerpos poseen dos unidades distintas: tuna que se une al antigens y otra electors 903 904 906, 906 906 907 907 908. 909 910 ou on 98 91 de un receptor sensible reapers RRS STvt f-— INDICE 2 FL plegamiente de ta fn Formato par un arinazén eon est ‘sandwich hela que conciene bueles hipervariables 926 32.3 Las anticwerpos se nen a mokécuas espeetfieas pow medly de sus hueles hipervaveites 97 Tes estos de rigs X h puests de mranifiosto ‘ents 96 ven Tos amicuerjs a fos iti 97 33.3.2 Los untigenos grandes se unen a los anticuerpos: por meifio de mumerasas interaeviones 929 334 La diversidad surge por los reordenamientos de Jos genes 9. 334.1 Los genes J “de empelone) y tos genes D Gliversidad) fumentan fe divervidad! te antieneape 930 3242. Medians be asociacian comin gtonis y be mutacin omitica se paciien zencrar nis de MP anticucrpos distintes 934 33.43 La aligoonesacidn de amtionerps expresdos en fa superficie de estates samevturas desoneselona la seereeiin de anioverpos 932 3344 Gracias & ha nunslocacidn de los genes Vin Se Forman distntes tipo p08 933 335 Las proteins det compleje principal de histocompatibifiiad exponen antigenos peptidicas en fa superficle de tas ecutos pars que los receptores de las e€lulas los reconurean on 33.5.1. Los péptides presentados por las proteinas MHC ‘ocupin un profindo sureo Flanqueads por nélices alfa 935 33.5.2 Los receptones de las eélulas T son proteinas parecidas a Tos antiewerpos que presentan tegiones variables y constantes 937 33.5.3 FECDR de las eflulas T citotéxicas setia de forma coorilinada eon Jos receptores de ccluls T 937 3354 Las células T ayudantes (0 auxiliares) estimulan a fas células que presentan péptidos exttafos unidos 2 proteinas MHC de clase IL 939 33.5.5 Las oflulas T ayudantes dependen del receptor de ccélulas T y de Ci para reconocer peptides extranos en Tas células que presentan antigenos 940, 33.5.6 Las protefas MHC son mvy variadas oar 335.7 Los virus de la iamunodeficiencia humana inutlizan cf sistema tnmunitaria al desteir las edlolas T ayudanes 942 33.6 Lax respuestas inmunit fas frente a antigenos propios se amalan 943, n ol tm, las eSlulas Tse someten @ una seleccisn posiiva y a wna selecciéin negativa 943 336.2 Las enfermedades autoiomunitarias surgen a patie de Lr goneracion de respuestas itemunitarias Frente a antigenos propios oa 33.6.3 El sistema inmunitario desempefia un papel en a prevencién det ciincee 945; ores mofecclares 9: 34.4 Ta mayorin de las proteinas de: los motores niokeeutares sen miembros de ta superfamilia de lay NTPass ean karo P 951 34.1.4 Un motor proteico est forma por un miles ATPasa y una estructare extends 982 34.1.2 La unin e bidrélisis det AEP inducen cambios conformacionales y de ainida de waxin en les motores proteicos 954 34.2 Las miosinas se desplazan 1 to Targo de Milamentos de netina 956 34.2.1 El méscule es un complejo de miosina y acting 957 34.2.2 La actina es un polimero polar, autoeasumnblante y dindmiee 958 342.3 Los movimientos de las proteinas mottices aisladas se pueden observar directamente 960 3424 La liberacién de fosfato dispasa al golpe de potencia de la miosina 960 34.2.5 La longitu del beazo de palaneca determina la velocidad del motor 962 34.3 La quinesina y la dineina se desplazan a lo largo de los microtibules 962 343.1 Los microtibulos son polimeras ciliadicos hiuecos 963 34.3.2 BI movimiento de la quinesina es muy progresiva 968 34.3.3 Pequetios cambios estructurales pueden invertir Ia polaridad del motor 966 34.4 El movimiento bacteriano se genera mediante ‘un motor rotativo 967 344.) Las bactesias nadan mediante la rtacion de sus Nagelos 967 34.4.2 La rotacién de los flagelas acterianos se genera por un flujo de protones 968, 34.4.3 La quimiotaxis bacteriana depende de la inversi6n de le rotacién flagelar 969 Apéndices Al Glosario BI [Respuestas a los problemas cL fndice alfabet DIDiseno molecular de la vida Parte cle una particula ipaprotelea, Un modelo de la estractura de la apolipoprateina a! (en armril) mussra fas tinas ce Hpidos que la rodeen. La apolipoprotein es el componente prcteica principal de fas pariculas de Ipoprotelna de alta densidad de la sangre, Estas pattculs son efcaces transportadores de ipilos porque el Eompanente proteice canstituye una intrfase entre ts cadenas hidrof6bicas del lpido y el entorno acuoso del torrente sanguines {fasedo en fae reteroncas apariads por Steen Have.