Mutación

Clase 14
 Mutación
• Fuente original de variación genética
• Jerárquica
– Nucleótido
– Secuencia
– Gen
– Cromosoma
Mutación Deriva
+ -

Diversidad
+/- +
Selección Migración
 Efecto de Mutación
• Neutro
• Substitución
• Indel
– Efecto fuerte

• Mutación dirigida e inversa

 Frecuencias
• Asumimos:
– Alelo silvestre (A1)
– Alelo mutado (A2)
– Mutaciones reversibles de (A1 a A2)

• Frecuencia A1 a A2 ocurre u
• Frecuencia A1 a A2 ocurre v
• Frecuencia A2 es q
∆q = µp −νq
= u (1 − q ) − vq
= u − uq − vq
= u − q (u + v)
 Equilibrio

0 = u − q (u + v)
u
qe =
(u + v)
 ¿Qué tan efectivan son las mutaciones
cambiando frecuencias?

p1 = p0 − up0
= (1 − u ) p0

pt = (1 − u )t p0

¿Si u=10-5 cuántas generaciones se ocupan para reducir p a la mitad?

 Destino de las mutaciones
• Una mutación ocurre en forma heterocigota
• Mutación puede desaparecer por
apareamiento
• Hay 50% probabilidad de perder una
mutación en la siguiente generación

• Probabilidad de perder mutación en familia

de tmaño k = (½)k
 Mutaciones en poblaciones finitas

• Mutaciones se pueden perder al azar

• Teoría neutralista
– Efecto de deriva y mutación sobre diversidad

• Mucha utilidad actual en estudio de

evolución
• Probabilidad de una nueva mutación:
1
p0 =
2N

• Probabilidad de fijar la nueva mutación:

1
u ( p) =
2N
• Probabilidad de perder una nueva mutación
1
u (q) = 1 −
2N
 0.5
0.45
0.4
0.35
0.3
u(p)

0.25
0.2
0.15
0.1
0.05
0
1 10 100 1000
N
 Fijación y Pérdida
• Fijación y pérdida de los alelos involucran
escalas de tiempo muy distintas
– t pérdida entre 0 y 1/2N
– t fijación entre 1/2N y 1

– Usualmente frecuencia de mutación es pequeña

 Tiempo para fijar y pérdida

Fijar
T1 ( p ) = 4 N e
Pérdida

 Ne 
T0 ( p) = 2  ln ( 2 N )
 N 
Modelo de Alelos Infinito (IAM)
• Cada mutación crea un alelo nuevo
• Alelos son creados por mutación y perdidos
por deriva hasta alcanzar un equilibrio

• Produce un número alto de alelos y

diversidad genética
Modelo de Alelos Infinito (IAM)
• Cada mutación crea un alelo nuevo
• Alelos son creados por mutación y perdidos
por deriva hasta alcanzar un equilibrio

• Produce un número alto de alelos y

diversidad genética
 Diversidad Genética en IAM
• Kimura define por endogamia
1  1 
ft = + 1 −  f t −1
2Ne  2Ne 

• Los dos alelos no deben mutar

 1  1  
ft =  + 1 −  f t −1  (1 − u ) 2
 2Ne  2Ne  
• Dado que He = 1-f:

4 N eu
He ≅
4 N eu + 1
Modelo Mutaciones escalonadas (SMM)

• Mutaciones no ocurren en cualquier lugar

• Mutaciones son más probables en estados
adyacentes
• Afecta heterocigosidad: 1
He = 1−
– Usualmente menor (8 N eu + 1)
1
2

• Implicaciones para diferentes marcadores