BIOQUIMICA

BIOENERGETICA
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BIOENERGETICA

O Termodinámica bioquímica, es el estudio de los cambios de energía que

acompañan a las reacciones bioquímicas.

La energía es necesaria para que se lleven a cabo todas las reacciones

bioquímicas en los seres vivos, el modo en que un animal obtiene combustible
idóneo a partir de sus alimentos para proporcionar esta energía es básico para
el entendimiento de la nutrición y el metabolismo normales.

Las características más importantes de los seres vivos son: su complejidad y el

orden, y para mantenerlos requieren de energía libre del medio (el sol
primariamente), por lo que lo seres vivos tienen la capacidad de capturar,
transmitir y almacenar energía para su existencia.

De todos los tipos de energía, la energía libre es la más útil para poder predecir
si una reacción dada puede ocurrir en la célula.

La energía del sol se captura en forma de fotones por la clorofila presente en

plantas verdes y bacterias fotosintéticas, las mismas que la usan para producir
carbohidratos, lípidos y proteínas.
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Estos compuestos los consumen los animales y de ellos extraen la energía
para sus necesidades. De acuerdo a esto los seres vivos pueden ser autótrofos
cuando generan sus propios nutrientes y heterótrofos cuando consumen
nutrientes producidos por los autótrofos.

El flujo de energía en los sistemas biológicos se entiende mejor al aplicar los

principios de la termodinámica (estudio de las relaciones cuantitativas entre el
calor y las otras formas de energía).

Los sistemas bioquímicos son isotérmicos, no usan la energía calórica sino la

química.

Metabolismo

Conjunto de procesos químicos que mantienen los procesos vitales del

organismo.

Todo organismo vivo transforma la energía que toma del medio que lo rodea.
La energía es usada para la síntesis de macromoléculas para el crecimiento y
diferenciación del organismo; todos estos procesos se llevan a cabo por la
acción de enzimas, las cuales catalizan la compleja red de reacciones químicas
del metabolismo.
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Termodinámica química

Es el estudio de la interrelación entre el calor y el trabajo con reacciones

químicas o con cambios físicos. La termodinámica química involucra no sólo
mediciones de varias propiedades termodinámicas en el laboratorio, sino
también la aplicación de métodos matemáticos al estudio de preguntas
químicas y a las reacciones de los procesos.

Está basada en las primeras dos leyes de la termodinámica.

Los organismos vivos y sus constituyentes (células, moléculas, átomos)

pueden considerarse como sistemas físico-químicos que interaccionan con su
medio ambiente.

Sistema: una parte del universo con la cual se interrelaciona.

Frontera: define el espacio en el cual está confinado el sistema, límite que lo

separa del resto del universo (medio exterior o medio ambiente).

Sistema abierto: aquel que puede intercambiar masa y energía a través de la

frontera del sistema.
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Sistema cerrado: aquel que sólo intercambia calor (energía) por la frontera del
sistema.

Sistema aislado: ni materia, ni energía pueden intercambiarse con el medio

ambiente, por la frontera del sistema. (Sistema adiabático).

Un organismo vivo debe considerarse un sistema abierto porque intercambia

calor y materia con su medio ambiente.

Medio circundante: se refiere a la parte del universo que interacciona con el

sistema, es el espacio que se encuentra fuera de una superficie o frontera
imaginaria alrededor del sistema.

De acuerdo a las definiciones anteriores la tierra es un sistema cerrado , ya que

no intercambia cantidades mayores de materia con el universo. La célula en
cambio es un sistema abierto.

Propiedades del sistema: son aquellos atributos físicos que se perciben por
los sentidos o pueden hacerse perceptibles mediante métodos experimentales
de investigación y pueden ser medibles: cuando dependen del estado inicial y
final, ej energía, y no medibles (cualidades).
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La Bioenergética por tanto, es el estudio de los procesos mediante los cuales
las células vivas utilizan, almacenan y liberan energía. El componente principal
de la bioenergética es la transformación de energía, es decir, la conversión de
una forma de energía en otra.

Todas las células transforman energía. Por ejemplo, las células vegetales
utilizan la luz solar para obtener carbohidratos (azúcares y almidón) a partir de
principios químicos inorgánicos simples. En este proceso, denominado
fotosíntesis, la energía solar se convierte en energía química de reserva. Si los
carbohidratos de estas plantas son ingeridos por un animal (Red trófica), se
produce su ruptura y su energía química se transforma en movimiento (energía
cinética), calor corporal o enlaces químicos nuevos.

PRIMERA LEY DE LA TERMODINÁMICA

Establece que: la cantidad de energía en el universo es constante, por lo tanto,

la energía puede ser transformada, pero no creada ni destruida.

Por lo que la energía total de un sistema y la de su medio circundante

permanece constante. Cuando una cantidad de energía en una forma se
pierde, aparece una cantidad exactamente equivalente de energía de otra
forma. La energía química puede convertirse en calor, energía radiante o
energía mecánica
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Si un sistema intercambia calor o realiza trabajo sobre su medio ambiente, se
produce un cambio en su energía interna ΔU.

U = q - w
q: calor que el sistema intercambia con el medio ambiente.
w: trabajo que el sistema realiza sobre el medio ambiente.

Calor: es el intercambio de energía desde un cuerpo cálido a uno frío, cuando se

encuentran en contacto, por lo que se considera la cantidad que fluye a través de la
frontera de un sistema de un punto de mayor a un punto de menor temperatura,
durante un cambio de estado.

Trabajo: involucra el movimiento neto de la materia de un lugar a otro, y se

considera cualquier cantidad que fluye a través de la frontera del sistema durante un
cambio de estado, y se puede usar por completo para elevar un cuerpo en el medio
exterior.

q es (+), si se ha transferido calor al sistema, aumentando la energía interna del

mismo.
q es (-), si se ha transferido calor al medio ambiente, disminuyendo la energía
interna del sistema.
w: es (+), si el sistema ha realizado un trabajo, disminuye su energía interna.
w es (-), si el medio ambiente ha realizado el trabajo, aumenta la energía interna
del sistema.
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Los cambios de energía interna U experimentalmente, se pueden obtener
trabajando en un calorímetro adiabático; en el cual se puede medir los cambios
de temperatura y transformarse a valores de q.

En las reacciones químicas generalmente, la fuente de trabajo es el cambio de

volumen durante la reacción.

v2


w = v1 PdV

P: presión contra la cual se realiza el trabajo, V1 y V2 los volúmenes inicial y

final

U = q - w
w = PdV
U = q – PdV

Si el volumen es constante
dV = 0
U = q
q : calor a volumen constante.
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Si la presión es constante

U = qp - PV.

ENTALPÍA

H (H consumo térmico), la variación de esta magnitud da la medida de la

cantidad de calor suministrada o desprendida de un sistema cuya evolución
termodinámica tiene lugar a presión constante.

Cambios de entalpía: Muchas reacciones químicas se estudian a presión y

temperatura constante, ej medio ambiente, presión atmosférica.

qp = U + PV
qp = H.

qp: se denomina cambio de entalpía para una reacción y se simboliza por H.

Las reacciones bioquímicas ocurren en solución

Por tanto: H = U
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Cuando en una reacción intervienen componentes gaseosos

Se aplica la ley del gas ideal.

PV = nRT

PV = nRT

H = qp - PV

H = qp - nRT (KJ/mol)

R = 8.31 J/molK

T = K (grados Kelvin)
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SEGUNDA LEY DE LA TERMODINÁMICA

Establece que durante cualquier cambio físico o químico, una cierta cantidad
de energía se convierte en una forma de energía desordenada, al azar,
denominada entropía, la cual es incapaz de generan trabajo (entropía = energía
inútil; energía libre = energía útil).

Proporciona un criterio, para saber si un proceso ocurrirá espontáneamente o

no.

Define el cambio de entropía S (J/K) asociado con un cambio que ocurre en

un sistema cerrado, en términos de calor absorbido por el sistema a
temperatura constante.

Entropía

S, medida del desorden que experimentan todos los sistemas de forma
espontánea en su evolución, cuando un sistema alcanza el equilibrio
termodinámico su entropía es máxima.

S  q/T
S = Aq/T procesos reversibles.
S  q/T procesos irreversibles
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Un proceso ocurrirá espontáneamente si:

q  TS

Para procesos que ocurren a presión y temperatura constantes:

q = H

Para un proceso espontáneo se requiere

H - TS  0
H - TS = G
G  0

G: Energía libre del sistema o energía libre de Gibbs.

G = H - TS
G = H - TS

G: indica el trabajo máximo disponible del proceso, además el trabajo

asociado con los cambios de presión o volumen. Se expresa en Jouls/mol o
cal/mol.
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4.185 J = 1 cal

El metabolismo mantiene el orden estructural del organismo, extrayendo la

energía libre de los alimentos y liberando calor (energía inútil), el cual aumenta
el desorden del medio. El cambio de entropía indica si un proceso es
espontáneo o no. ΔS no es fácil de calcular por lo que es conveniente usar la
energía libre G como indicador de la espontaneidad de una reacción.

Las propiedades de G son:

1. La energía libre G disminuye durante todos los procesos espontáneos que

ocurren a presión y temperatura constantes (seres vivos).

2. La cantidad máxima de trabajo producida por un proceso bioquímico a

temperatura y presión constantes está determinada por G del proceso.

3. La energía libre G es la forma de energía que impulsa la maquinaria

bioquímica de todos los organismos.

4. El calor generado en los procesos bioquímicos mantienen la temperatura

corporal de los seres vivos para asegurar las reacciones catalizadas por
enzimas a velocidades adecuadas.
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ESTADOS ESTÁNDAR

El estado estándar de una substancia pura, se define como aquella forma en la

que la substancia es estable a una atmósfera de presión y a una temperatura
específica.

Para los solutos, el estado estándar se define más adecuadamente como una
solución de 1 mol/l de soluto.

Para las reacciones químicas en solución, el cambio de energía libre estándar

G0 es la energía requerida para convertir 1 mol/l de reactivos en 1mol/l de
productos.

G0 = H0 - TS0

En los seres vivos los procesos bioquímicos se realizan a pH 7, por tanto

partiendo de una reacción en equilibrio y estandarizando las condiciones de
reacción:

Temperatura = 298 K (250C)

Presión = 1 atm (101 KPa)
Concentración de reactivos y productos = 1 mol/litro
pH = 7,0
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A + B  C + D

K = C D / A B

G = G0 + RT ln C D / A B

G = G0 + RT ln K

K = constante de equilibrio
K = Productos/Reactivos
Si el proceso es reversible G = O

G0 = -RT ln K C D / A B

G0 = -RT ln K

En logaritmos de base 10

G = G0 + 2.303 RT log C D / A B

G = G0 + 2.303 RT log K

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Energía se define como la capacidad de realizar trabajo o de producir calor. El
cambio de energía libre de Gibbs es el criterio más útil para saber si puede
ocurrir determinado proceso bioquímico.

El cambio de energía libre de Gibbs G, representa la energía libre de los

productos, menos la de los reactivos.

G = G productos - G reactivos

G  0 el proceso es factible y es exergónico (valor negativo)

G = 0 el proceso está en equilibrio y es isoergónico

G  0 el proceso no es factible y es endergónico (valor positivo)

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REACCIONES DE ÓXIDO-REDUCCIÓN

La energía libre de los alimentos en las dietas de los seres vivos se libera de
manera controlada mediante reacciones de óxido-reducción que ocurren en
especial en las mitocondrias de las células.

En este tipo de reacciones la energía libre es directamente proporcional a la

capacidad de las moléculas que intervienen en las reacciones bioquímicas para
aceptar o ceder electrones.

Oxidación es la pérdida de electrones y la reducción es la ganancia de

electrones. Las reacciones de óxido-reducción representan la fuente más
importante de energía bioquímica. Las moléculas reductoras (donantes de
electrones) y las moléculas oxidantes (aceptoras de electrones) operan en
parejas conocidas como pares redox.

La habilidad de los pares redox para aceptar y donar electrones se puede

expresar cuantitativamente mediante la constante de potencial redox estándar
(E0).

Por tanto G0 se puede expresar como potencial redox (E0). Y, es frecuente
comparar el potencial de un par redox (E0) con el del electrodo del átomo de
hidrógeno, el cual a un pH 0 tiene un valor de 0.0 voltios (V); a pH 7 o
condiciones bioquímicas estándar, el potencial del electrodo del átomo de H es
de -0.42 voltios.
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En las reacciones de óxido de reducción del NAD+ y NADP+, estas substancias
contienen un átomo de nitrógeno cuaternario, el cual durante la reacción debe
ceder un par de electrones a otra molécula para reducirla, mientras que los
hidrógenos liberados durante la reacción biológica redox se transfiere mediante
enzimas a los componentes bioquímicos oxidantes, el NAD+ o NADP+, loS
cuales captan un ion hidruro (hidrógeno con dos electrones).

AH2 + NAD+  NADH + H+

AH2 + NADP+  NADPH + H+

El cambio de energía libre estándar de una reacción redox se calcula a partir

de la diferencia de potencial redox de los dos pares que conforman la reacción,
con la ecuación:

G0 = nFE0

F = constante de Faraday
n = número de electrones transferidos
E0 = diferencia entre los potenciales redox estándar del par
donador de electrones y el par aceptor de electrones.
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En las células vivas las reacciones redox no tienen lugar bajo condiciones
estándar, pues la concentración de los sistema redox está en un intervalo de
10-6 a 10-2 mol/l, y si los potenciales redox van ha ser de valor real, estos deben
calcularse para condiciones fisiológicas usando la ecuación de Nerst:

E = E0 + (RT/nF) ln K

E = E0 + (RT/nF) ln Ared  Boxid  / Aoxid  Bred 

E = potencial redox fisiológico del par redox Aoxid y Ared

R = constante de los gases
T = tempertura
n = número de electrones transferido
F = constante de Faraday

La energía proveniente de la oxidación de carbohidratos y lípidos mantiene las

reacciones bioquímicas requeridas para la vida.

Hay cuatro variedades de reacciones biológicas de óxido-reducción:

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Los electrones pueden ser transferidos del donador al receptor.

Citocromo b (Fe2+ ) - e-  Citocromo b (Fe3+ )

Citocromo c (Fe3+ ) + e-  Citocromo c (Fe2+ )
El citocromo c es el agente reductor y cede el electrón, oxidándose.
El citocromo b es el agente oxidante y acepta el electrón reduciéndose.

Los electrones pueden ser transferidos con proteínas en un proceso

formalmente equivalente a la transferencia de átomos de H.

FAD + 2H+ + 2e-  FADH2

Los electrones pueden ser transferidos como ion hidruro (H-)

NAD+ + H:-  NADH.

Reacción directa entre un reductor y el oxígeno molecular

AH + O2 + BH2  AOH + H2O + B

Las reacciones de óxido-reducción ocurren simultáneamente y no pueden

ocurrir una sin la otra.
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CLASIFICACIÓN DE LOS COMPUESTOS EN RICOS Y ESCASOS DE
ENERGÍA

Si consideramos la energía libre de hidrólisis de varios compuestos biológicos

de importancia, se hace un cambio de la bioenergética al método basado en la
estructura para entender las reacciones bioquímicas. Un compuesto rico en
energía, al hidrolizarse libera una cantidad de energía de alrededor de - 30
KJ/mol, ej el ATP, y muestra un potencial alto para transferir grupos. Los
compuestos con energía libre de hidrólisis menos negativa de - 30 KJ/mol son
escasos de energía y muestran un potencial bajo para transferir grupos, ej
glucosa-6-fosfato.

El concepto de enlace de alta energía es muy poderoso y simplifica el estudio

de la bioquímica y de la biología molecular.

Compuestos ricos en energía

Generan - 30KJ/mol o valores más negativos y poseen alta capacidad de

transferencia de grupos:

ADP, UDP-glucosa, ATP, 1,3-difosfoglicerato, Carbamoil-fosfato, Acilcarnitina,

ADN, ARN, Aminoacil-ARNt, Fosfoenolpiruvato, Fosfocreatina, Acetil coenzima
A, S-adenosilmetionina
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Compuestos escasos en energía

Generan - 30 KJ/mol o valores más positivos

AMP, Glutamina, Glucógeno, Lactosa, Glucosa-6-fosfato, Glucosa-1-fosfato,

Glutation, Insulina, Fosfatidilcolina.

Ejemplos:
ATP + H2O  ADP + Pi G0 = - 35.5 KJ/mol
ADP + H2O  AMP + Pi G0 = - 36.3 KJ/mol
AMP + H2O  Adenosina + Pi G0 = - 9.6 KJ/mol
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ENERGIA LIBRE ESTANDAR DE LA HIDROLISIS DE LOS FOSFATOS ORGANICOS

COMPUESTO G0 (kJ/mol) G0 (kcal/mol)

Fosfoenolpiruvato -61.9 -14.8

Carbamilfosfato -51.4 -12.3

Fosfocreatina -43.1 -10.3

ATP  ADP -30.5 -7.3

ADP  AMP -27.6 -6.6

Glucosa-1-fosfato -20.9 -5.0

Glucosa-6-fosfato -13.8 -3.3

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Reacciones acopladas

La energía libre contenida en las moléculas orgánicas se extrae mediante

varios procesos redox durante el catabolismo. Esta energía se almacena en la
molécula de ATP y se hace accesible para disparar procesos anabólicos o
endergónicos.

Todos estos procesos se realizan mediante reacciones acopladas, catalizadas

por enzimas específicas y en las cuales existe un intermediario común, cuyo
contenido de energía libre debe ser lo suficientemente alto para impulsar la
segunda reacción.

Muchas veces el ATP es el intermediario común.

Ejemplo:

1ra: Fosfoenolpiruvato + ADP  Piruvato + ATP

2da: ATP + Glucosa  ADP + Glucosa-6-fosfato

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El ATP sufre cuatro tipos de reacciones

1. En la más común el grupo fosforilo del ATP es transferido a un sustrato

receptor.

ATP + Glucosa  Glucosa-6-fosfato + ADP

2. En otra reacción se forma un derivado adenilado y se libera pirofosfato.

Glucosa-1-fosfato + ATP  PPi + ADP-Glucosa

2. El grupo pirofosforilo es transferido a un aceptor.

Mevalonato + 2ATP  5-Pirofosfomevalonato + 2ADP

4. El ATP reacciona con agua y metionina, para generar la S-

adenosilmetionina, pirofosfato y pirofosforilo.

L-metionina + ATP + Pi + H2O  S-adenosil metionina +

Ppi.
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NH2
N NH2
N
N
N
N N
O O O
O N N
HO P O P O P O O O + Pi
O
OH OH OH HO P O P O O
O
OH OH
OH OH
OH OH
ATP ADP
NH2 NH2
N N
N N

N N N N
O O O
O O + Pi
HO P O P O HO P O
O O
OH OH OH

OH OH OH OH

ADP AMP
NH2 NH2
N N
N N

N N N N
O
HO P O O HO O + Pi
O O
OH

AMP OH OH OH OH ADENOSINA
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Los productos que resultan de la hidrólisis del ATP: ADP y Pi se hallan
cargados negativamente, por lo que se repelen entre si por la repulsión de
cargas, por lo que resultan más estables que el ATP

La molécula de ATP a pH 7.0 tiene cargas negativas muy próximas entre sí, lo
que ocasiona una fuerte repulsión de sus cargas eléctricas, por lo tanto,
cuando se hidroliza el grupo fosfato terminal desaparece parte de la tensión
creada por la repulsión de las cargas eléctricas.

Los productos de la hidrólisis se estabilizan por resonancia.

LEY DE LIPMANN

Enuncia que el ATP es el donador universal de energía en plantas, animales y

bacterias. Esta ley es la base de la bioenergética. El ATP es la substancia
química más importante en la naturaleza. Se forma a partir de ADP y Pi durante
el catabolismo de las moléculas de combustible. El ATP proporciona la energía
química que puede ser usada para realizar trabajo químico, osmótico o
mecánico.
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Reacciones de las coenzimas

NAD+ :Nicotinamida adenina dinucleótido, sufre una reacción de reducción, es

un cofactor de enzimas, acepta el equivalente de un ion hidruro H-:, el NAD+
acepta un par de electrones de una substancia que se oxida (oxidación =
pérdida de electrones). El anillo aromático es la substancia relevante de la
molécula involucrada en aceptar los electrones. Cuando se ha realizado la
reducción, la reacción ha producido NADH y H+. La reacción a su vez puede
ser inversa.

FAD: Flavin adenina dinucleótido, acepta dos H y se reduce a FADH2, la

reacción también puede ser inversa.

NADP+ : fosfato de nicotinamida adenina dinucleótido, acepta un ion hidruro H:

y se reduce a NADPH más H+ y puede ser reversible.
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NH2 NH2
HO HO
O N O N
N N
O O O O
OH OH OH OH
N O N
O P O P O N O P O P N
O H O

OH OH H +
OH OH
N N

OH O O OH O O
O P O P
OH OH
OH OH
NH2 NH2
NAD

NH2 NH2
HO HO
O N O N
N N
O O O O
OH OH OH OH
N O N
O P O P O N O P O P N
O H O

OH OH H +
OH OH
N N

OH OH OH OH
O O

NH2 NH2

NADP
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O O
H
N CH3 N CH3
HN HN

O N N CH3 O N N CH3
H

H2

O O

P NH2 P NH2
O OH O OH
O O N O O N
P N P N
OH OH
O O
N N N N
O O

HO OH HO OH

FAD FADH