UNIVERSIDAD NACIONAL DEL CENTRO DEL PERU

FACULTAD DEAGRONOMIA

CURSO: RECURSOS FITOGENETICOS

ING. ANGHELY LAPA CHANCA

 z

 Fenética (taxonomía numérica)

o Basada en tomar muchas medidas a los
R. R. Sokal
organismos bajo estudio (parecido global de
los organismos)
o Usar algoritmos de computadora para asignar
relaciones entre ellos
o Ignora características ancestrales versus
derivadas
o Método libre de cualquier teoría C.D. Michener
TAXONOMÍA
 Ciencia que se ocupa de clasificar los
seres vivos en grupos dispuestos
jerárquicamente.

 Taxón : grupos de
organismos
pertenecientes a
cualquier nivel de
clasificación.
 La unidad fundamental de la que
parte toda clasificación es la
especie.
 En biología sistemática la fenética, también conocida como
taxonomía numérica, es una técnica cuya finalidad es la
clasificación de los organismos basándose en su similitud,
generalmente en su morfología, o en cualidades observables,
sin tomar en cuenta su filogenia o relación evolutiva.

 La fenética ha sido ampliamente sustituida por la cladística. Sin

embargo, algunos biólogos continúan utilizando métodos
fenéticos, como una aproximación razonable de la filogenia
cuando los métodos cladísticos son computacionalmente
demasiado complejos.
 Es la similitud morfológica. Consecuentemente, los
organismos son agrupados sobre la base de su
similitud global (overall similarity); se clasifican en el
mismo grupo los organismos que tengan la mayor
cantidad de caracteres en común, los que son más
parecidos. La fenética tiene en cuenta, en teoría, la
mayor cantidad de caracteres disponibles,
cualquiera que sea su naturaleza, y considera que
todos los caracteres tienen el mismo valor.
 Dado que el número de especies y de caracteres a
estudiar puede ser muy elevado, es imprescindible la
ayuda de programas informáticos específicos. El
resultado es un dendrograma no enraizado
denominado fenograma, en que se establecen las
relaciones de parentesco fenético de los organismos
estudiados.
 Los objetos de estudio (los taxones terminales)
pueden ser especies, géneros o cualquier otra
categoría taxonómica y reciben el nombre de UTO
(unidades taxonómicas operacionales) (en inglés,
OTU, operational taxonomic units).
 Es una técnica de la estadística, llamada también análisis
multivariado.

Se utiliza para analizar estadísticamente la caracterización

morfológica y bioquímica de los organismos vivos, considerando
simultáneamente muchas variables (características) en un
conjuntode colecciones de germoplasma.

Para analizar cientos o miles de colecciones de una especie

vegetal, se utiliza en promedio 50 descriptores por cada colección
para caracterizarlos morfológicamente, mediante el uso de la “lista
de descriptores” editados por el IPGRIpara cada especie.
RELACIONES FENÉTICAS O DE SIMILITUD: se basan
en lo parecido entre los organismos, es decir en las
propiedades observadas en ellos.
RELACIONES DE PARENTESCO O GENEALÓGICAS:
indican el grado por el cual dos o mas organismos
están relacionados por un antecesor común.
RELACIONES CRONÍSTICAS O TEMPORALES: indican
el grado de cercanía en el tiempo de dos o mas
organismos.
RELACIONES ESPECIALES O GEOGRÁFICAS: denotan
el grado de situación espacial relativa entre dos o
mas organismos.
Las colecciones del germoplasma de un banco pueden
ser clasificadas por el porcentaje de semejanza,
separando los menos semejantes para su conservación y
utilización en el mejoramiento genético de una especie.

Unidad Taxonómica Operativa(UTO)

 Unidad de clasificación del germoplasma de una especie.

 Esuna colección.
• Técnicas numéricas, es la rama de la taxonomía numérica que,
mediante operaciones matemáticas, calcula la afinidad entre
unidades taxonómicas en base del estado de sus
características.

• Todo proceso clasificatorio se basa en las diferencias

existentes entre los objetos a clasificar. Esa variación es la
fuente de la evidencia taxonómica, también llamada
caracteres.

• El carácter puede definirse como cualquier propiedad que

varía en las OTU en estudio.
Los posibles valores que ese carácter pueda presentar se
los considera sus estados (Sneath y Sokal, 1973).
 ELECCION DE UTOs

ELECCION DE CARACTERES

CONSTRUCCION DE UNA MATRIZ

BASICA DE DATOS

OBTENCION DE UN COEFICIENTE
DE SEMEJANZA

CONSTRUCCION DE UNA MATRIZ

DE SIMILITUD

CONFORMACION DE GRUPOS = ESTRUCTURA TAXONOMICA

PASOS ELEMENTALES DE LA TAXONOMIA NUMERICA

1. Elección de las unidades (UTO’s)

Seeligen los organismos a estudiar y se definen las unidades a

clasificar denominadas “Unidades TaxonómicasOperativas”.

2. Elección de los caracteres

Seeligen los caracteres que describan a los UTO’s y se registra

el estado de los caracteres presentes en ellas.
Caracter: propiedad que varía en las UTOs ( en A se tiene
hojas aserradas y en B hojas enteras => “margen de la hoja”
Un carácter como datos científicos: una observación debe ser
sistemática, detallada y variada.
3. Construcción de una matriz básica de datos

 Con la información obtenida en los pasos anteriores se

construye una matriz básica de datos (MBD) de UTO’s por
estados de los caracteres.

 Esnecesario estandarizar la matriz, y a partir de ello se buscan

las semejanzas.

 La matiz básica de datos va en una tabla, tanto para caracteres

cualitativos y cuantitativos. Ejemplo:

UTO’s columna
Caracteres filas
 Cuadro de Matriz básica de datos

UTOs
Colec. 1 Colec. 2 Colec. 3
Caracteres

C1 2 1 1 Filas
Columnas

C2 1 1 1
C3 2 2 1

 Los valores de semejanza se buscan en el cuadro de UTO’s.

 En el ejemplo, las tres colecciones son semejantes para la
característica C2.
4. Obtención de un coeficiente de semejanza para cada par
de UTO’s

 Utilizando un coeficiente adecuado a los datos que

contiene, se calcula la similitud para cada par posible de las
unidades taxonómicas.

5. Construcción de una matrizde similitud

 Con los valores de similitud calculados en el paso anterior

se construye una matriz de similitud UTO por UTO
(colección por colección).
 ANALISIS DEAGRUPAMIENTO
Los datos tomados en la caracterización morfológica o bioquímica son analizados a
través de la taxonomía numérica, para ello seutiliza el Programa NTSYSversión2.1.

Seconstruye una matriz de similitud (colecciones x caracteres).

Los datos son estandarizados para obtener la matriz de similitud, para cada par de
colecciones o unidades taxonómicas operativas (OTUs)de la matriz básica.

Al final se obtiene un dendrograma de agrupamiento en base al coeficiente de similitud,

esto de acuerdo al criterio del investigador.
 CARACTERES

 TIPOS DE
CARACTERES

Fisiológicos
 Morfológicos
- Químicos
- Etológicos
- Ecológicos
Externos - Hábitat
Internos (anatomía) - Parásitos
- Alimentos
Embriológicos - Variaciones estaciónales
Palinológicos - Geográficos
- Distribución
Citológicos
- Relación entre poblaciones
Ultraestructurales - Genéticos
En un trabajo de taxonomía numérica es aconsejable elegir todo tipo de carácter y de
todas las partes del ciclo vital.

Solamente deben excluirse los siguientes caracteres:

Caracteres sin sentido biológico

Consiste en evitar la utilización de aquellos caracteres que no tengan una relación
importante lo que se observa en los organismos propiamente dichos.

Caracteres correlacionadoslógicamente
Sedebe excluir como redundante toda propiedad que sea consecuencia lógica de otra
propiedad yautilizada.

Ejemplos de este tipo de carácterson:

Carácter 1: diámetro del tallo
Carácter 2: radiodel tallo
 LOSCARACTERESCOMO DATOSCIENTIFICOS

Los datos más significativos y precisos son los expresados

en forma cuantitativa.

No todos los datos miden relaciones cuantitativas en

sentido estricto, de ahí que algunos deben ser sometidos a
una actividad lógica, la codificación, para ser transformados
en datos cuantitativos.
DATOSDOBLE-ESTADOYSUCODIFICACION

Son los llamados datos binarios o predicados

dicotómicos, es decir aquellos que tienen sólo dos
estados. Pueden indicar presencia/ausencia y
estadosexcluyentes.

a. Datos doble-estado, presencia/ausencia.

Son también denominados datos “todo”
o “nada” y representan características que
están o no presentes.

Codificación de los datos doble-estado

presencia/ausencia.
Seexpresan numéricamente como 1 (presencia) y
0 (ausencia).

También podría expresarse como + (presencia) y -

(ausencia), o cualquier otraforma convencional.
b. Datos doble-estado, ambos excluyentes.
Representan caracteres cualitativos que tienen dos estadossolamente.

Codificaciónde los datos doble-estado, estados excluyentes:

En este caso, puede expresarse como 1 y 0, otorgándole 0 a cualquiera de los

estados, o utilizando como expresión numérica el 1 y el 2 (esto permite distinguir
este tipode datos de los anteriores).
DATOSMULTIESTADOSYSUCODIFICACION

• Son aquellos datos que poseen tres o más estados y pueden ser de dostipos:
cualitativos y cuantitativos.

Datos Multiestados Cualitativos

a. Datos multiestados cualitativos sin secuencia lógica o desordenados.

Son datos cualitativos que no pueden ser ordenados en una secuencia de

grados del atributo.

Por ejemplo, el carácter “tipo de superficie pilosa de la hoja” con los siguientes
estados: escabrosa, estrigosa, híspida, hirsuta, serícea, estrellada.

Codificación de los datos multiestados cualitativos sin secuencias lógicas o

desordenadas

• Es el tipo de dato más difícil de codificar, ya que por no presentar una

secuencia o grados es imposible representarlo bien con número.
• El problema podría resolverse transformando a cada uno de los estados en
datos presencia-ausencia.
• Ejemplo:
b. Datos multiestados cualitativos con
secuencia lógica.

En el caso de caracteres cualitativos que

pueden ser ordenados en una secuencia de
magnitud de la cualidadestudiada.

Codificación de los datos multiestados

cualitativos con secuencia lógica.
¿Puede expresarse de la forma cuantitativa el parecido entredos OTU?

 El parecido o similitud es cuantificable aplicando un coeficiente de

similitud.

 Con el uso de estos coeficientes en operaciones matemáticas pueden

calcularse las similitudes (o su complemento: las diferencias) respecto
a cada par posible de OTUde la matriz básica dedatos.

COEFICIENTES DEDISTANCIA
Se aplican sobre matrices básicas que presentan datos doble-estado o
multiestados, o en las que poseen ambos tipos de datos (datos mixtos).
El análisis de agrupamiento comprende técnicas que
forman grupos de OTU que se asocian por su grado de
similitud.

La estructura taxonómica obtenida de la matriz de

similitud con las técnicas de análisis de agrupamientos
puede representarse gráficamente de varias formas, pero
la más utilizada es elfenograma.

El FENOGRAMA es un diagrama arborescente que

muestra la relación en grado de similitud entre dos OTU o
grupos de OTU. Los valores de similitud se expresan en
una escala que suele encontrarse en su extremosuperior
•
NTSYS (Numerical Taxonomy System) versión 2.1