ADN COMPOSICIÓN Y ESTRUCTURA

I. DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR

ADN  ARN  PROTEÍNA
Replicación Transcripción Traducción

 El ADN tiene la capacidad de almacenar gran cantidad

de información genética.
 Una célula humana tiene la capacidad de sintetizar
50,000 a 100,000 proteínas.

II.COMPONENTES ESTRUCTURALES DE LOS

ÁCIDOS NUCLEICOS
1. Bases nitrogenadas
 Purinas: Adenina – Guanina.
 Pirimidinas: Citosina – Timina – Uracilo
  Azúcar
 Ribosa
2. Desoxirribosa
3. Ácido Fosfórico
PURINAS
III. NUCLEOSIDOS:BASE NITROGENADA MÁS AZUCAR
1. RIBONUCLEOSIDOS
2. DESOXIRRIBONUCLEOSIDOS
IV. NUCLEÓTIDOS
B B B B
l l l l
. . . P — S — P — S — P — S — P — S . . . .
Unidades
1 
enlace Éster
Monoméricas
de nucleótidos Enlace fosfodiéster

Están formados por:

 Fosfato inorgánico (phosphate = P)
 Azúcar (Sugar = S)
 Base nitrogenada = B
Los ácidos nucleicos (ADN y ARN) están formados
por unidades monoméricas llamados nucleótidos
(polinucleótidos).
 BASES SINTÉTICAS MODIFICADAS
Análogos de purinas y pirimidinas
 6 Mercapto Purina  Agente Antitumural
 5 Bromo uracilo  Gente mutágeno
 5 Flurouracilo  Tratamiento de cáncer
 9 2- hidroximetoxi- metil guanina aciclovir
 agente antiviral.
Actúa sobre el herpes genital
 Celular infectadas por virus del Herpes se
encuentra la enzima cinasa de la timina y la enzima
produce.

Produce
Aciclovir Aciclovir fosforilado Dos Replicación
Cinasa de Enzimas Inhibe Viral
La Timina
 V. NUCLEÓTIDOS CÍCLICOS
O
ADENOSIN ıı
5´ MONOFOSFATO –O –P –
(AMP) l
O-
O O
ADENOSIN ıı ıı
5´DIFOSFATO –O – P – O – P –
ADP ı ı
O O-

O O O
ıı ıı ıı
O – P – O– P – O – P
ı ı ı
ATP O O O
VI. ESTRUCTURA DEL ADN
 Oligonucleótidos  50 nucleótidos
 Polinucleótidos  nucleótidos
 Enlace fosfodiéster 3´ OH y 5´ OH
 Los polinucleótidos: inician con 5´ OH libre y la
cadena complementaria se iniciará con 3´ OH libre y
termina en 5´ OH libre (antiparalelas).

VII.CONFORMACIÓN DE LOS POLINUCLEÓTIDOS

 Los bordes de las bases contienen átomos de
nitrógeno y oxígeno (NH2,–N – y o = o) interaccionan
con grupos polares o con el agua del medio.
 El apilamiento de bases reduce la superficie
hidrofóbica.
 El apilamiento de bases está estabilizada por las
fuerzas de Van der Waals y fuerzas de London.
 ESTRUCTURA DE UN SEGMENTO DE POLINUCLEÓTIDO
DE DNA

M.V. CESAR A. PISCOYA VARGAS

LOS PARES DE BASES DE WATSON Y CRICK

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FORMACION DE PUENTES DE HIDROGENO ENTRE BASES
COMPLEMENTARIAS EN EL DNA DE DOBLE HEBRA

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  El Mg++ también permite estabilizar la cadena
reduciendo la repulsión electrostática en el enlace
fosfodiéster.
 El ADN es muy estable frente a la hidrólisis.
 Existen enzimas exonucleasas que hidrolizan los
enlaces 5´–O–3´ de un polinucleótido en sus
extremos.
 Endonucleasas cortan el enlace fosfodiéster al
interior del polinucleótido.

VIII. CARACTERÍSTICAS DE LA DOBLE HÉLICE DEL

ADN
 1953 Watson y Crica propuso la estructura de la
doble hélice.
 El enrollamiento de dos hebras polinucleótidos
dextrógiras una en torno a la otra alrededor de un
eje común.
MODELO DE WATSON Y CRICK DEL DNA

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 Existen pares de bases unidas por puentes de
hidrógeno; los grupos N-H son dadores de puentes
de H y los grupos C=O y –N- son buenos aceptores
de puentes de H.
 Pares de bases adenina = TIMINA y citosina 
GUANOSINA (complementariedad),
 Existe un alineamiento antiparalelo las dos hebras si
timina y citosina están en dirección 5´3´ sus
bases complementarias adenina y guanina estarán
unidas en la dirección 3´ 5´,
 Existen surcos mayor y menor resultan de la
geometría de pares de bases.
IX. DESNATURALIZACIÓN Y RENATURALIZACION
 La temperatura origina separación de las hebras del
ADN desaparecen unos cuantos pares de bases
formando una o varias burbujas; estas burbujas se
separan en la unión de bases Adenina-TIMINA.
 El pH 11,3 origina desprotonación de los grupos N-H,
 Las hebras separadas pueden reformar una doble
hélice (renaturalización).

X. HIBRIDACIÓN
 La autoasociacion de las hebras desnaturalizadas ha
desarrollado la técnica de hibridación.
 Esta hibridación puede ser de cadenas de ADN-
ADN ó ADN-ARN.
ESPECIFICIDAD DE LAS NUCLEASAS

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MIGRACIÓN DE BURBUJAS A LO LARGO DE LA DOBLE
HELICE DEL DNA

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DESNATURALIZACIÓN DEL DNA

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 ESQUEMA GENERAL DE LOS EXPERIMENTOS
DE HIBRIDACIÓN

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M.V. CESAR A. PISCOYA VARGAS
 La Hibridación sirve:
a) Determinar si unen cierta secuencia de ADN esta
representada más de una vez en un organismo
particular .
b) Demostrar la existencia de relación genética o
evolutiva entre organismo s diferentes.
c) Determinar el número de genes transcriptos en un
ARNm.
d) Determinar la localización de una secuencia de
ADN determinada por hibridación con un
polinucleótido complementario llamado sonda.
XI. CONFORMACIÓN DEL ADN DE CADENA DOBLE
 Se han descrito once conformaciones de ADN:
 ADN A.- Se encontró en condiciones de baja
humedad. Relativa y elevada concentración salina.
  ADN Z.- De hélice levógira.
XII. ESTRUCTURA NO CANÓNICA DEL ADN
 El ADN forma estructuras poco visuales cuando
interaccionan con proteínas como crucíferos ADN
de cadena triple codos.
 ADN CURVADO.- La secuencia de ADN con
segmentos de 4 a 6 adeninas separadas a cada 10
pares de bases.
 También se forma ADN curvado cuando
interaccionan con histonas o enzimas.
 ADN CRUCIFORME.- Son repeticiones invertidas
se observa en el genoma humano y se encuentran
cerca de zonas de replicación de ADN.
 Actúan como interruptores para la replicación y
transcripción.
Esta estructura se forma por ruptura de puentes
de H intercatenarias y la formación de puentes
intracatenarias
 ADN de triple hebra.
Triple hebra de Hoogston se forma entre una
cadena de homopurina de un doble hélice y una
cadena paralela de homopirimidina TAT y
CGC GGC AAT
 ADN H.- Se forma una triple hebra intramolecular.
 Puede controlar la transcripción.
 ADN DE HEBRA CUADRUPLE.- Ricos en G forman
el cuarteto G.. Estas hebras son estabilizadas por
iones de Na+ Li+ Cs+
TRIPLE HÉLICE DE HOOGSTEEN INVERTIDA

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  Los polinucleótidos G juegan un papel importante en
la formación de TELÓMEROS.

XIII. ESTRUCTURA DE ORDEN SUPERIOR DEL ADN

1. Hélices lineales de doble cadena..
 Estas se producen por roturas de la cadena
sencilla de origen natural, estas roturas
provienen del enlace fosfodiéster.

Ejm. El ADN lineal que contiene los hembras

largas de doble hélice cada uno de los
cromosomas de una de los cromosomas de
una célula diploide humana (46 cromosomas).
DNA SUPERHELICOIDAL NEGATIVO

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M.V. CESAR A. PISCOYA VARGAS

ACCIÓN DE LA TOPOISOMERASA I

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MECANISMOS DE ACCIÓN DE LA TOPOISOMERASA II

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2. ADN circular: Resulta de enlaces fosfodiéster
entre los extremos 3´ y 5 de los polinucleótidos
lineales..
La enzima ADN ligasa produce un circulo cerrado
covalentemente. Este ADN es longevo debido a la
resistencia o la exonucleasas.
• El ADN bacteriano es circular. Los plásmidios
circulares los contienen las levaduras.
• Los mitocondrias y cloroplastos contienen ADN
circular.
3. ADN Superhelicoidal. Es un ADN circular de
doble cadena y se forma por la unión de extremos
libres de un ADN lineal.
XIV. LAS TOPOISOMERASAS I y II
Son enzimas que regulan la formación superhélices.
Estas enzimas actúan cortando y uniendo las hebras
del ADN, produciendo un ADN más o menos
superhelicoidal. La Topoisomerasa I actúa cortando
una hebra del ADN, de un dúplex de ADN
superenrollado.
La Topoisomerasa I actúa cortando una hebra del
ADN, de un dúplex de ADN superenrollado.
La topoisomerasa II. -actúa originando un bucle
suprenrollado y luego corta ambas hebras.
Un subgrupo de topoisomerasas tipo II, las girasas
propia de las bacterias y originan vueltos negativos en
el ADN relajado. La regulación de la superhelicoidales
en la célula requiere de la topoisomerasa II/girasa,
  La inhibición de la ADN girasa y topoisomerasas son
producidas por antibióticos (quinolonas) y
antitumorales.
XV. EMPAQUETAMIENTO DEL ADN PROCARIÓTICO
 El ADN forma un solo cromosoma circular
superespiralado.
 El ADN es 80 veces más largo que el diámetro de la
célula por lo tanto el ADN debe estar bien
empaquetado.
 Los cromosomas bacterianos están en estructuras
compuestas llamadas nucleoides, resultantes de la
interacción de las proteínas HU y H-NS (con la
espermina, espermidina, potrescina y la cadaverina)
ARN y proteínas no histonas.
  El ADN de E. coli organizado en nucleoide consiste
en una unión molécula superespiralada organizado en
40 lazos unido en proteínas y ARN.
XVI. ORGANIZACIÓN EN EUCARIOTAS
 El ADN se encuentra interaccionado con varias
proteínas para formar la cromatina, esta cromatina
se organiza en estructuras compactas llamadas
cromosomas. Cada cromosoma posee encentrómen
que constituye un lugar de anclaje para las
proteínas que une a los cromosomas al huso
mitótico.
 Los telómeros son los extremos de los cromosomas
lineales. Los cromosomas contienen el origen de la
replicación. El número de cromosomas es
característico para cada espacio humano 23 fases
de cromosomas es de 5 m.
 LOS CROMOSOMAS BACTERIANOS ESTÁN
EMPAQUETADOS EN NUCLEOIDES

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 33

M.V. CESAR A. PISCOYA VARGAS

 La primera fase de organización es la formación de la
estructura en «collares de cuentas» que consiste en
la unión de ADN a los histones y son 5 (H4 y H3 H1 y
H5 Y LA H 2AY H2B).
 Los collares d cuenta se llaman polinucleosoma y la
unidad es el nucleosoma y está constituida por ADN
y un núcleo octamero de histones (H2A, H2B H3 y
H4) cada agregado de histones es un tetrámero (H3)2
Y (H4)2
El nucleosoma explica que en las células eucariótica
carecen de topoisomerasas porque los nucleosomas
tienen enrollamiento negativo.
El empaquetamiento de los polinucleosomas en
estructuras de orden superior como los cromosomas
plumoladas (oocitos de vertebrados y cromosomas
politénicas (células secretoras de la mosca del
vinagre).
ENDONUCLEADAS DE RESTRICCIÓN Y POLINDROMAS
 Las Endonucleasas de restricción.- Son enzimas que
cortan el ADN de doble cadena en una secuencia
específica mediante dos cortes uno en cada cadena.
La metilación de las cadenas sobre todo en la posición
5 de la citosina y el grupo 6-NH2 de la adenina
impiden el corte por las endonucleasas.
 Para el corte se necesita el reconocimiento de 8
nucleótidos estas repeticiones invertidas de
nucleótidos se llaman políndromas.
 Las endonucleasas de restricción se agrupan en tres
categorías.
 Enzimas tipo I cortan en sitios alejados del sitio
Enzimas tipo III de reconocimiento.
 Enzimas de tipo II Cortan el ADN en el sitio de
reconocimiento.
XVI. GENES FUNCIONALES SOLAMENTE REPRESENTAN UNA
PEQUEÑA PARTE DEL ADN EUCARIÓTICO.
 Intrones.- Son secuencias de nucleótidos no
codificadores.
 Exones.- Secuencia de nucleótidos del gen que se
expresa como ARN (ARN maduro) o como proteínas.
Los intrones son eliminados durante la modificación
del transcrito de ARN y los exones restantes son
empalmados originando «corte y empalme»
(Splicing), Los intrones son 5 veces más grandes
que los exones.
REPRESENTACIÓN ESQUEMÁTICA DE UN GEN
EUCARIÓTICO

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