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FLUJO DE

INFORMACIÓN
Ana Catalina Barón García
Semetre VI
Medicina
UdeA
CONTENIDO

 ÁCIDOS NUCLEÍCOS
 DUPLICACIÓN DEL ADN
 DEL ADN A LAS PROTEÍNAS
CONCEPTOS
GENERALES
ADN
Azúcar, una pentosa.
Bases nitrogenadas: púricas y
pirimidínicas.
Ácido fosfórico.
BASES NITROGENADAS

• Las bases nitrogenadas que forman parte de los ácidos


nucleicos son de dos tipos, púricas y pirimidínicas. Las bases
púricas derivadas de la purina (fusión de un anillo pirimidínico y
uno de imidazol) son la Adenina (6-aminopurina) y la Guanina
(2-amino-6-hidroxipurina).
• Las bases pirimidínicas (derivadas de la pirimidina) son la
Timina (2,6-dihidroxi-5-metilpirimidina o también llamada 5-
metiluracilo), Citosina (2-hidroxi-6-aminopirimidina) y Uracilo
(2,6-dihidroxipirimidina).
• Las bases nitrogenadas que forman normalmente parte del
ADN son: Adenina (A), Guanina (G), Citosina y Timina (T).
• La Timina es específica del ADN y el Uracilo es específico del
ARN.
• Nucleósido = Pentosa + Base nitrogenada.
• Nucleótido = Pentosa + Base nitrogenada + Ácido
fosfórico.
• Polinucleóotido = Nucleótido + Nucleótido +
Nucleótido + ....
MODELO DE LA DOBLE
HÉLICE
• El ADN es una doble hélice enrollada helicoidalmente “a derechas”
(sentido dextrorso).

• Enrollamiento de tipo plectonémico: para separar las dos hélices es


necesario girarlas como si fuera un sacacorchos.

• Cada hélice es una serie de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiéster


en los que un grupo fosfato forma un puente entre grupos OH de dos
azúcares sucesivos (posiciones 3’ de un azúcar y 5’ del siguiente).

• Las dos hélices se mantienen unidas mediante puentes o enlaces de


hidrogeno producidos entre las bases nitrogenadas de cada hélice.

• Una hélice lleva la secuencia 5’P → 3’ OH , mientras que la hélice


complementaria sigue la secuencia de átomos 3’OH → 5’P.
• El diámetro de la doble hélice es de 20 Å.
• Las bases nitrogenadas son estructuras planas perpendiculares al eje de la
doble hélice y están apiladas unas sobre otras a una distancia de 3,4 Å. Cada
10 bases, cada 34 Å se produce una vuelta completa de la doble hélice (360º).
• Las bases se encuentran en sus configuraciones cetónicas, cumpliendo así las
reglas de apareamiento A-T y G-C.
• La secuencia de bases nitrogenadas puede ser cualquiera, no existe ninguna
restricción.
• Las reglas de complementaridad de las bases nitrogenadas A-T y G-C
sugieren un forma sencilla de replicación del material hereditario. Esta forma
sencilla de replicación se denomina método Semiconservativo.
• La mutación a nivel molecular consistiría en un cambio en la secuencia de
bases
• nitrogenadas del ADN.
• Al no existir ninguna restricción en la secuencia de bases nitrogenadas, el ADN
poseía la suficiente variabilidad como para ser el material hereditario.
• Además, esta estructura sugería la existencia de algún código que permitiera
pasar de la secuencia lineal de bases nitrogenadas en el ADN a la secuencia
lineal de aminoácidos en
• las proteínas.
ADN-B: ADN en
disolución, 92% de
humedad relativa, se
encuentra en
soluciones con baja
fuerza iónica se
corresponde con el
modelo de la Doble
Hélice.
ADN-A: ADN con 75% de
humedad, requiere Na, K o Cs
como contraiones, presenta 11
pares de bases por giro completo
y 23 Å de diámetro. Es
interesante por presentar una
estructura parecida a la de los
híbridos ADN-ARN y a las regiones
de autoapareamiento
ARN-ARN.
ADN-C: ADN con 66% de humedad, se obtiene
en presencia de iones Li, muestra 9+1/3 pares
de bases por giro completo y 19 Å de diámetro.
ADN-Z: doble hélice sinistrorsa
(enrollamiento a izquierdas), 12 pares de
bases por giro completo, 18 Å de
diámetro, se observa en segmentos de
ADN con secuencia alternante de bases
púricas y pirimidínicas (GCGCGC), debido
a la conformación alternante de los
residuos azúcar-fosfato sigue un curso en
zig-zag. Requiere una concentración de
cationes superior a la del ADN-B, y
teniendo en cuenta que las proteínas
que interaccionan con el ADN tienen
gran cantidad de residuos básicos sería
posible que algunas convirtieran
segmentos de ADN-B en ADN-Z. Las
posiciones N7 y C8 de la Guanina son
más accesibles.
ADN con enrollamiento paranémico: Las dos
hélices se pueden separar por traslación, cada
hélice tiene segmentos alternantes dextrorsos y
sinistrorsos de unas cinco bases. Uno de los
principales problemas del modelo de la doble
hélice (ADN-B) es el enrollamiento plectonémico,
para separar las dos hélices es necesario girarlas
como un sacacorchos, siendo necesario un gran
aporte energético.
ADN triple hélice o ADN-H: "In vitro" es posible obtener
tramos de triple hélice intercalando oligonucleótidos cortos
constituidos solamente por pirimidinas (timinas y citosinas)
en el surco mayor de una doble hélice. Este oligonucleótido
se une a pares de bases A-T y G-C mediante enlaces de
hidrógeno tipo Hoogsteen que se establecen entre la T o la C
del oligonucleótido y los pares A-T y G-C de la doble hélice.
No se sabe la función biológica del ADN-H aunque se ha
detectado en cromosomas eucarióticos.
Palíndromos: plegamiento o apareamiento de una
hélice consigo misma. El palíndromo también es una
figura gramatical que se lee igual en los dos sentidos,
por ejemplo: DABALE ARROZ A LA ZORRA EL ABAD.
Existe ADN palindrómico de hélice sencilla y de hélice
doble. En el palíndromo de doble cadena la secuencia
de bases se lee igual en dirección 5’ P→ 3’OH en
ambas cadenas.
REPLICACIÓN DEL
ADN
EXISTEN TRES POSIBLES MODELOS DE REPLICACIÓN

Semiconservativa (modelo correcto). En cada una de las


moléculas hijas se conserva una de las cadenas
originales.

Conservativa. Se sintetiza una molécula totalmente


nueva, copia de la original.

Dispersora, o dispersante. Las cadenas hijas constan de


fragmentos de la cadena antigua y fragmentos de la
nueva.
El proceso de replicación de DNA es el mecanismo que
permite al DNA duplicarse (es decir, sintetizar una copia
idéntica).

Esta duplicación del material genético se produce de acuerdo


con un mecanismo semiconservativo, lo que indica que las
dos cadenas complementarias del DNA original, al separarse,
sirven de molde cada una para la síntesis de una nueva
cadena complementaria de la cadena molde, de forma que
cada nueva doble hélice contiene una de las cadenas del DNA
original.
• El DNA se
replica
desenrollando
la hélice y
rompiendo los
puentes de
hidrógeno
entre las
hebras
complementari
as.
ORIGEN DE REPLICACIÓN.

La replicación comienza en sitios específicos conocidos


como “origen de replicación”.

Los orígenes de replicación son los puntos fijos que están


a partir de los cuales se lleva cabo la replicación, que
avanza de forma secuencial formando estructuras con
forma de horquilla.

 Procariontes: Un origen de replicación.

 Eucariontes: Múltiples orígenes de replicación.


BIDIRECCIONALIDAD.
A partir de cada origen se sintetizan las dos
cadenas en ambos sentidos. Esto ocurre en la
mayoría de los organismos, pero se dan
excepciones en algunos procariontes debido a que
los mecanismos de replicación que tienen lugar
dependen de la propia estructura de su material
hereditario (si el DNA es circular, lineal,
bicatenario o monocatenario).

Replicación bidireccional en bacteria con DNA circular.


DNA Polimerasas.

Dichas enzimas catalizan la síntesis de las nuevas cadenas


añadiendo nucleótidos sobre la cadena molde. La enzima
copia la cadena de nucleótidos de forma complementaria
para dar a cada célula hija una copia del ADN durante la
replicación.
Modo en que operan:

En cada horquilla de replicación, la ADN polimerasa y otras


enzimas sintetizan dos nuevas cadenas de DNA que son
complementarias respecto a las 2 cadenas originales. De
esta forma, la ADN polimerasa sintetiza el esqueleto de
azúcar-fosfato de la cadena hija.
• Además de participar en la elongación, desempeñan una
función correctora y reparadora gracias a su actividad
exonucleasa 3', que les confiere la capacidad de
degradar el ADN partiendo de un extremo de éste.
INICIACIÓN.
Para que pueda formarse la horquilla de replicación es
necesario que las dos cadenas se separen para sintetizar
el cebador y el DNA de la cadena de nueva síntesis.

Para ello el ADN debe desenrollarse y el punto de partida


viene determinado por una secuencia específica de
nucleótidos conocida como origen de replicación en la
que hay gran cantidad de T y A.
Esta secuencia es reconocida por proteínas iniciadoras
que controlan este proceso y enzimas conocidas como
helicasas, que rompen los puentes de hidrógeno de
forma que una vez unidas las proteínas iniciadoras al
DNA provocan el desenrollamiento de estas regiones.
• Para iniciar la
replicación se
requieren las
helicasas y es
así como tas
contribuyen a
la formación
del origen de
replicación.
Una vez abierta la cadena de DNA se unen otras
proteínas y enzimas adicionales:

• Proteínas SSB: encargadas de la estabilización del ADN


monocatenario, impiden que el ADN se renaturalice o
forme de nuevo la doble hélice, de manera que pueda
servir de molde.
Las topoisomerasas
evitan que se
retuerzan y formen
superenrrollamientos
cortando una o
ambas cadenas de
DNA reponiéndolos.
ELONGACIÓN.
• En el siguiente paso, la holoenzima DNA Pol III cataliza
la síntesis de las nuevas cadenas añadiendo nucleótidos
sobre el molde.

• La DNA polimerasa sintetiza las nuevas cadenas,


complementarias a cada una de las cadenas primitivas.

• Esta síntesis se da bidireccionalmente desde cada


origen, con dos horquillas de replicación que avanzan en
sentido opuesto.
• Se sintetiza el DNA en sentido 5’→ 3’ partiendo de un
ARN cebador – molécula formada por nucleótidos de
ARN catalizados por ARN primasas que contiene un
grupo 3'hidroxilo libre que forma pares de bases con una
hebra molde complementaria y actúa como punto de
inicio para la adición de nucleótidos con el fin de copiar la
hebra molde.
TERMINACIÓN.
oCuando una DNA polimerasa hace contacto con el
extremo de otro fragmento de Okazaki contiguo , el ARN
cebador de este es eliminado y otra enzima, la DNA
ligasa conecta los dos fragmentos de Okazaki de DNA
recién sintetizado.

o Una vez que se han juntado todos se completa la doble


hélice de ADN.
Enzimas que intervienen en la Replicación.
Enzima Acción Función en la célula.

DNA Polimerasa I Añade nucleótidos a la Llena huecos en el DNA,


molécula de DNA en para reparación. Remueve
formación. Remueve los cebadores de RNA.
cebadores de RNA.
DNA Polimerasa III Añade nucleótidos a la Replica DNA.
molécula de DNA en
formación. Revisa y corrige
la secuencia.

DNA girasa (topoisomerasa Promueve el Mantiene la compactación


II) superenrrollamiento. del DNA.

DNA helicasa Se une al DNA cerca de la Promueve la separación de


horquilla de replicación. las hebras de DNA.
Topoisomerasa I Relaja el DNA Mantiene el nivel adecuado
superenrrollado. de enrollamiento.

Primasa Hace cadenas pequeñas Necesaria para que la DNA


de RNA usando DNA como polimerasa replique la
molde. hebra “retrasada”.
¿Por qué no hay una enzima que
polimerice en la dirección 3´-> 5?

No funcionaría la corrección de errores por falta


de un trifosfato que suministre la energía de
enlace covalente azúcar-fosfato
Adición 5’3’
OH OH

5’
P P
P P

P P
P P

3’
P P
P P

PP
P P
P + H2O P
OH
P
P P
OH

P P

P P

P P

P P
Adición
3’5’
(hipotética)
OH OH

3’
P P
P P
P P
P P
P P
5’
P P
P P
P P
P P
P

P P

P P

P P

P P
OH OH
Corrección de errores
OH OH

5’
P P
P
P P
P P

3’
P P
P P
PP
P P
P
+ H 2O

P
P
P P
OH

P P

P P

P P

P P
P
P
P
P
P
P
P
P
P
OH
P

P P P
P
P

OH
RESUMEN.
• La replicación es el proceso mediante el cual, a partir de una
molécula de DNA progenitora, se sintetiza una nueva,
originándose así dos moléculas de DNA hijas, de secuencia
idéntica a la del DNA original.
• Esta constituida por tres pasos:
• Iniciación:
-DNA doble cadena debe abrirse.
-Ocurre desenrollamiento.
• Elongación:
-Copia simultánea de ambas cadenas.
- Replicación en dirección 5’ → 3’.
• Terminación:
-Se completa la doble hélice de DNA y se da una pausa en la
replicación.
¿Por qué el cebador es RNA?

El cebador es más proclive al error, por lo


que debería eliminarse y el RNA puede
detectarse y eliminarse fácilmente por la
DNApol I

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