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CAPITULO 2
ESTRUCTURA DE LAS
PROTEINAS
I.- BIOMOLÉCULAS
•Son moléculas orgánicas producidas por organismos vivos,
como proteínas, carbohidratos, lípidos, y ácidos
nucleicos.
•Los organismos vivos las utilizan para formar sus
estructuras y como fuente de energía.
H CH 3 CH CH 3
O O O
H2N CH C OH H2N CH C OH C OH
CH 2 CH CH 3
HN
CH CH 3 CH 2
CH 3 CH 3
LEUCINA ISOLEUCINA PROLINA
Leu Ile
8 Pro
No polares aromáticos (hidrófobos)
O
O
O
H2N CH C OH
H2N CH C OH
H2N CH C OH
CH 2
CH 2
CH 2
HN
FENILALANINA
Phe OH
TRIPTOFANO
TIROSINA Trp
Tyr
9
Polares sin carga
O O O
CH 2 CH OH CH 2
OH CH 3 SH
SERINA TREONINA CISTEÍNA
Ser Tre Cys
O O
O
H2N CH C OH H2N CH C OH
H2N CH C OH
CH 2 CH 2
CH 2
CH 2 CH 2
C O
METIONINA ASPARRAGINA
S C O
Met NH 2 Asn
GLUTAMINA
CH 3 NH 2 Gln
O O O
H2N CH C OH H2N CH C OH O
H2N CH C OH O
CH 2 CH 2 CH 2 H2N CH C OH H2N CH C OH
CH 2 CH 2
CH 2 CH 2
N
CH 2 CH 2
C O CH 2
NH
CH 2 NH
OH C O
NH 2 C NH HISTIDINA
Hys
ACIDO GLUTÁMICO
OH
NH 2 Glu
LISINA ÁCIDO ASPÁRTICO
Lis ARGININA Asp
Arg
11
b.- Según su obtención
•Aminoácidos esenciales
•Aquellos que no pueden ser sintetizados dentro del
organismo, y deben ser ingeridos.
•Para humanos, los aminoácidos esenciales son:
•Valina (Val)
•Leucina (Leu)
•Treonina (Thr)
•Lisina (Lys)
•Triptófano (Trp)
•Histidina (His)
•Fenilalanina (Phe)
•Isoleucina (Ile)
•Metionina (Met)
•Los aminoácidos no esenciales, son aquellos que el
cuerpo humano los puede sintetizar, y no necesitan ser
ingeridos en una dieta.
Valor biológico de las proteínas
DOPA
RICINA. Proteína toxica.
•La ricina es una fitotoxina de las
semillas del ricino (Ricinus
communis), con actividad
citotóxica.
•Tiene dos cadenas polipeptídicas:
una lectina que le permite fijarse a
la membrana celular, y otra capaz
de inhibir la síntesis de proteínas
en los ribosomas.
•Antiguamente usada como
laxante para humanos.
•Según la vía de exposición, la
ricina puede causar hemorragia
intestinal, seguida de diarrea a
veces sanguinolenta, vómitos,
dolor abdominal, deshidratación e
hipotensión (Pita et al, 2004).
III. PROPIEDADES DE
AMINOACIDOS
•Iónicas.
–Cualquier aminoácido puede comportarse como ácido y
como base, se denominan sustancias anfóteras.
•Ópticas.
–Todos los aminoácidos excepto la glicina, tienen el
carbono alfa asimétrico lo que les confiere actividad
óptica.
•Químicas.
–Las que afectan al grupo carboxilo (descarboxilación).
–Las que afectan al grupo amino (desaminación).
–Las que afectan al grupo R.
3.1.- Propiedades iónicas
El pH isoeléctrico es 6.0.
•Formación de Sales.
•La reacción del grupo carboxilo con bases o acidos, forma
sales.
c. Reacciones del grupo R.
•Reacciones específicas:
•Reacción de Millon.(mercurio en acido nítrico fumante)
Tirosina- rosado
•Reacción de Sullivan.(cianuro sódico al 5%). Cisteína- rojo
•Reacción de Folin.(1,2-naftoquinon-4-sulfonato sódico al
0,2%, hidróxido sódico al 10%). Metionina. Rojo.
•Reacción de Sakaguchi: (arginina). El grupo guanidino de
arginina se condensa con el alfa-naftol del reactivo, y luego
forma un complejo coloreado con el hipoclorito de sodio
•Reacción de aminoácidos azufrados. Se basa en la
separación mediante un álcali, del azufre de los
aminoácidos, el cual al reaccionar con una solución de
acetato de plomo, forma precipitado de sulfuro de plomo
(negro).
d. Estereoismerismo de aminoácidos
•Isómeros: dos o mas compuestos que tienen el mismo
numero, clase de átomos y PM.
•Estereoisomería (espacial):
–Isómeros geométricos. Cis- trans.
–Enantiomeros. Isómeros ópticos. L y D
Cromatografía:
•Las moléculas se separan por afinidad a una fase
estacionaria y otra fase móvil.
•La separación depende de la tendencia relativa de las
moléculas en la mezcla, para asociarse con más fuerza a
una o a otra fase.
•Según la fase estacionaria se distingue: cromatografía en
capa fina, o cromatografía en columna.
Cromatografía en papel
•Las muestras se aplican en un punto
marcado a 1 cm del extremo inferior del
papel filtro, y éste se suspende en un
recipiente con el solvente móvil (mezcla
de agua y fenol).
•La fase móvil asciende por capilaridad,
arrastrando aminoácidos, según su
afinidad con cada solvente y el papel.
•Los solventes apolares avanzan mas
que los polares.
Una mejora
moderna de
ésta técnica es
la
cromatografía
líquida de alta
resolución
(HPLC).
Electroforesis
•Cuando una mezcla de
moléculas ionizadas y con
carga neta son colocadas en
un gel sometido a campo
eléctrico, estas son atraidas
hacia el polo de carga opuesta.
•Las moléculas cargadas
positivamente se desplazaran
hacia el cátodo (el polo
negativo) y las cargadas
negativamente se desplazan
hacia el ánodo (el polo
positivo).
•También se puede hacer
electroforesis en papel o
en acetato de celulosa.
V.- ESTRUCTURA DE LAS POLIPETIDOS
•Los polipéptidos pueden ser: proteínas y péptidos.
•LAS PROTEINAS son polímeros con mas de 50 aminoácidos.
•El aminoácido de la izquierda (con un grupo NH2 libre) es el
aminoácido N-terminal, y el aminoácido de la derecha, con un
grupo COOH libre es el aminoácido C-terminal.
-hélice
lámina plegada
Giros beta
Son elementos de conexión entre hélices alfa y láminas
beta.
• Determinan un cambio de dirección de las cadenas
polipeptidicas.
• Se forma un puente de hidrógeno entre un residuo (n) y el
situado tres aminoácidos después (n+3).
• La prolina y la glicina abundan en los giros beta
LA ESTRUCTURA TERCIARIA
•Es la forma espacial de una proteína: globular, o fibrosa.
•Proteínas Globulares: Tienden a ser más solubles en agua.
•Se pueden clasificar según su solubilidad:
–Albúminas: Solubles en agua, que precipitan con el calor y con
soluciones salinas saturadas. Ejplo, Lactoalbúmina, ovoalbúmina,
y seroalbumina.
–Globulinas: poco solubles en agua pura, pero solubles en
soluciones salinas diluidas. Ejplo: inmunoglobulinas, etc.
–Glutelinas: Solubles en ácidos y bases diluidos, insolubles en
solventes neutros. Ejemplo: La Glutenina del trigo.
–Prolaminas: Solubles en alcohol de 70 a 80%, insolubles en
agua, y solventes neutros. Ejplos: zeína del maíz y gliadina del
trigo.
.Proteínas fibrosas: Están organizadas de manera paralela a un
solo eje. Son insolubles en agua y funcionan como proteínas
estructurales o de soporte.
Ej: Elastina, Colágeno, Queratina.
Fuerzas dan la estructura terciaria
•Interacciones hidrófobas: Los residuos hidrófobos producen
interacciones, de modo que los aminoácidos apolares se
sitúan hacia el interior de la proteína y los polares hacia el
exterior interactuando con el agua circundante.
Fuerzas que conforman a las proteínas
Enlace peptídico: Esta es una unión covalente fuerte, entre
aminoácidos, resistente al calor, a detergentes, y a pH
extremos, con una energía de enlace de 380 KJ/mol.
Enlaces de hidrógeno: Se producen entre H del enlace
peptídico y grupos polares cercanos, donde un átomo de
hidrógeno es compartido por dos átomos electronegativos.
•Tienen una energía de enlace de 20 KJ/mol.
Unión de
moléculas de
tropocolágeno
por enlaces
covalentes
forman las
fibras de
colágeno.
Fibras de seda.
•Puede ser de gusano o de araña.
•La seda de gusanos consta de
hebras de fibroina (proteína fibrosa),
recubiertos con una capa de
sericina.
•La sericina es globular, se desecha
en textiles pero posee funciones
biológicas de resistencia a la
oxidación, actividad antimicrobiana,
protección a la radiación UV,
anticoagulante, y promueve el
crecimiento celular.
•La fibroína tiene capas de láminas
beta antiparalelas, y su estructura
primaria contiene principalmente la
secuencia Gly-Ser-Gly-Ala-Gly-Ala.
Producción de seda de gusano (sericicultura)
•Los tejidos de seda fueron elaborados
en la China, desde 3000 a. c.
•Se crían los gusanos durante unos 35
días hasta que las orugas empiezan a
producir unos 1000-1500 m de hilo para
su capullos durante dos o tres días.
•Los capullos con las orugas se
introducen en agua jabonosa hirviendo
para ahogar las orugas, y remover la
sericina.
•La seda se utilizó en la fabricación
de paracaídas y neumáticos de
bicicleta, hasta la aparición del nylon.
•Los primeros chalecos antibalas
(actualmente de Kevlar) fueron fabricados
con seda en la primera Guerra Mundial
Usos en la medicina (biomateriales)
• En Medicina Regenerativa e Ingeniería de Tejidos.
•Para restaurar, mantener o mejorar los tejidos dañados u
órganos completos.
•El proceso comienza con la construcción de un andamio o
scaffold, donde se pueden introducir células con un “coctel”
de aditivos que favorecen su diferenciación a los tejidos
específicos, por “autoensamble” (Instituto Nacional de
Bioingeniería e Imágenes Biomédicas).
•Los materiales de andamio, pueden ser sintéticos
(biopolímeros, cerámicas, biovidrio, etc.) o de origen
natural (colágeno, alginatos, seda, etc.).
•El material de andamio debe ser; biocompatible, poroso,
resistente, biodegradable y capaz de facilitar la adhesión
de las células.
puentes disulfuro
•Ejplo. la clara de huevo precipita al desnaturalizarse la
ovoalbúmina por efecto del calor.
•La leche coagula a pH bajo como consecuencia de la
desnaturalización de la caseína.
•Las enzimas, pierden su actividad catalítica.
Caso: clara de huevo
•Composición: 88% agua, 11% proteínas, 1% carbohidratos y
0.5% minerales. Las proteínas presentes son:
•OVOALBÚMINA: Es la principal, y se desnaturaliza por calor.
Tiene tres fracciones, A1, A2 y A3, en una proporción de
85:12:3, con diferente contenido en fósforo. Es rica en cisteína y
metionina.
•CONALBÚMINA: representa el 14% del total y también coagula
por calor. Es no fosforilada, es rica en enlaces disulfuro y puede
quelar metales, en especial hierro.
•OVOMUCOIDE: representa el 12% del total y no coagula con
calor. Es una glucoproteína rica en glucosamina (14%) y
aminoácidos azufrados (12%).
•LISOZIMA: Hay un 7 % de globulinas, incluyendo la lisozima,
enzima que disuelve las paredes celulares de bacterias, Gram +
•OTRAS: ovomucina, avidina, etc.
Batido de clara de huevo
•El batido introduce aire y produce un flujo en la matriz acuosa que
desenrolla los ovillos de proteína.
•Las proteínas desnaturalizadas en la interfaz agua-aire orientan sus
zonas apolares hacia el interior de la burbuja y sus zonas polares hacia la
matriz acuosa; esto reduce la tensión superficial de la burbuja.
•Al inicio del batido se forma una espuma de grandes burbujas y poco
estable, por acción de las ovomucinas, que se desnaturalizan fácil. Si el
batido prosigue, las ovoglobulinas y ovotransferrinas, hacen las burbujas
menores y aumenta la extensión total de interfaz.
•Al perder las proteínas su estructura globular, muchos de sus
enlaces débiles quedan libres y tienden a rehacerse, y al
encontrar otras moléculas protéicas entremezcladas en la capa
surfactante, muchos de estos enlaces se rehacen uniéndolas en
una red proteica continua que estabiliza la espuma.
•La conalbúmina no es surfactante, pero al oxidarse con el
oxígeno se asocia con las proteínas surfactantes conectando
burbujas vecinas y fortaleciendo la red.
•Si continúa el batido durante mucho tiempo o con mayor
potencia, la apertura de enlaces prosigue; las proteínas
vecinas comienzan a asociarse tan estrechamente que
expulsan el agua que embebe la red y la espuma queda
seca y poco flexible, haciendo difícil su mezcla con otros
componentes como azúcar.
•Si prosigue el batido, aparecen gránulos proteínicos
rígidos que supuran líquido.
•El pH original de la clara de huevo es levemente alcalino, que
facilita la formación de enlaces disulfuro por unión de grupos
sulfuro de diferentes proteínas, reforzando la red.
• Los puentes disulfuro son los que mantienen la estructura
globular, y en caso de sobrebatido, este tipo de enlaces provocan
una excesiva rigidez de la espuma y aparición de grumos.
•En batido por medios mecánicos, se acidifica la clara, para que los
grupos sulfuro se saturen con protones tomando la forma de –SH,
y no formen puentes disulfuro. Esto origina que la espuma quede
más suave y es más fácil de mezclar con otros ingredientes.
Adición de sal. Los iones de la sal, en la
matriz acuosa bloquean la formación de
enlaces intermoleculares, e impiden la
consolidación de la red proteínica
disminuyendo la espumabilidad y la
persistencia. Por esto, no se recomienda
añadir sal durante la formación de
espuma.
Adición de azúcar.
El fenómeno es similar al de la sal pero
en menor intensidad.
•Las proteínas globulares de la clara de huevo, por acción
del calor se desenrollan y forman enlaces que unen unas
cadenas con otras.
•Este cambio de estructura o desnaturalización, da a la
clara de huevo la consistencia de dureza.
6.3. Salting-In, y Salting-out
•Es el efecto del salado de soluciones de proteínas.
•Efecto salting in, o solubilizacion por salado. En un medio poco
salino, la solubilidad de las proteínas aumenta con la concentración
de sales.
•Se debe a que los iones salinos recubren los grupos R de las
moléculas proteicas, incrementando la solubilidad de las proteínas
•Salting out. Insolubilización por salado. Con altas
concentraciones salinas, las proteínas precipitan, debido a
la competencia por moléculas de agua de solvatación entre
los iones salinos y las moléculas proteicas.
•Pelambre.
•Se eleva la alcalinidad de la
piel hasta pH cercano a 12.
•La cal abre las fibras de
colágeno en fibrillas, con
hinchamiento de la piel, y
apertura de los folículos
pilosos que libera el pelo.
•Al mismo tiempo el sulfuro de
sodio rompe los enlaces
disulfuro de la queratina de la
epidermis y del pelo,
provocando el
desprendimiento de la
epidermis y la ruptura del
pelo.
•Desencalado.
•En medio alcalino las sales de cromo pueden reaccionar
rápidamente con el colágeno, produciendo sobrecurtición en las
capas externas dificultando la difusión a las capas internas.
•Se baja el pH con cloruro, o sulfato de amonio según la reacción:
•2 NH4Cl + Ca(OH)2------ CaCl2 + 2 NH4OH
•El cloruro o sulfato de amonio, sólo pueden combinarse con la cal
disuelta entre fibras; pero no desplazan el calcio de sus
combinaciones con colágeno.
•También se usa el bisulfito de sodio que bajar el pH según la
siguiente reacción: