La Comunidad

Microbiana del Suelo

Microbiología del suelo

Durante años, los microbiólogos de los suelos

y los ecólogos microbianos han tendido a
diferenciar a los microorganismos que habitan
en los suelos
Microorganismos benéficos
Microorganismos dañinos
• Según sus funciones
• Según como ellos afectan la calidad de la tierra, el
crecimiento, el rendimiento y la salud de las plantas
 Microorganismos Benéficos

Son aquellos que tiene la capacidad de . . .

Fijar el nitrógeno atmosférico
Descomponer los residuos orgánicos
Degradar los pesticidas
Suprimir las enfermedades de las plantas y los
patógenos generados en los suelos
Reforzar el ciclo de los nutrientes
Producir compuestos bioactivos como las vitaminas,
hormonas y enzimas que estimulan el crecimiento de
las plantas.
Microorganismos Dañinos
Aquellos que . . .
Podrían inducir enfermedades en las plantas,
Estimular el crecimiento de los patógenos en los
suelos,
Inmovilizar nutrientes y producir sustancias toxicas y
putrescentes que afecten negativamente el
crecimiento y la salud de las plantas
Organismos que habitan el suelo
Macrofauna: Hormigas, lombrices de tierra y otras
criaturas
Mesofauna: Nemátodos
Microfauna: Protozoarios
Microorganismos:
Algas
Hongos
Actinomicetos
Bacterias
Virus
 Tabla 3.1.1. Pirámide de los organismos del suelo basada en la longitud y en la población a
Longitud Individuos por
Organismo
aproximada (mm) millares de cm3a
0,02 a 0,2 Protozoos 1.000.000.000 (1 x 109)
0,2 a 2,0 Nemátodos 30.000 (3 x 104)
0,2 a 2,5 Acáridos (Acarina) 2.000 (2 x 103)
0,2 a 10,0 Celémbolos 1.000 (1 x 103)
0,2 a 1,0 Rotíferos 500 (5 x 102)
1,0 a 30,0 Artrópodos (Insectos, milpiés y 100 (1 x 102)
arañas)
1,0 a 60,0 Gusanos enquitraeidos 50
15,0 a 85,0 Lombrices de tierra 2
a Mar Coyne (2000)
b Un millar de centímetros cúbicos (cm3) tiene el mismo volumen que un cubo de tierra de 10 cm por

cada lado
La macrofauna:
hormigas, lombrices de tierra
y otras criaturas
 Macrofauna

Afecta la . . .
Depredación de los microbios
Estructura del suelo
Descomposición de la materia orgánica
Macrofauna: contribución a la biomasa

Cuanto mayor es su tamaño más escaso es su

número
El tamaño no guarda relación con la biomasa,
tampoco la densidad de su población y su
participación en la actividad biológica del suelo

Dos lombrices pueden tener un efecto mayor que mil

millones de protozoarios
El papel de la Macrofauna
Acelera la descomposición de la materia
orgánica*
Mezcla la materia orgánica con la tierra
Escarabajo pelotero entierra 78% de heces de vaca
en varias semanas = añadir 175 kg de N/Hectárea
Mejora las propiedades del suelo
Formación de agregados
Aumenta la ventilación mediante la excavación de
galerías
Escarabajo pelotero entierra el estiércol de 30 a 150
cm de profundidad
El papel de la Macrofauna
Muele y macera la materia orgánica,
aumentando su superficie
Incrementa su nivel de
descomposición
La materia orgánica es más propensa
al ataque microbiano
El papel de la Macrofauna
Relevancia como depredador microbiano

Aumentando la actividad biológica;

Así como la respiración en general

Clasificación de la Macrofauna
Longitud (10 – 100 mm)
Forma de desplazarse
Cavan sus canales o utilizan los ya existentes
Tiempo de permanencia en el suelo
Preferencia de hábitat
Superficie
Poros: ventilados o llenos de agua
Clasificación de la Macrofauna
Por su alimentación
Macrofauna biófaga (materia viva)
• Carnívora
• Herbívora
• Microbívora
• Omnívora
Macrofauna saprófaga (materia muerta o en
descomposición)
• Detritívoros
• Cadaverícolas
• Coprófagos
Tipos de Macrofauna
Artrópodos: predominan en diversidad y numero
pero no en biomasa (10%)
Los más comunes
• Arácnidos (ácaros)
• Miriápodos (ciempiés y milpiés)
• Colémbolos
• Isópteros: (termitas)
• Moluscos (Caracoles y babosas)
• Gusanos enquitraeidos
Tipos de Macrofauna
Arácnidos (ácaros)
Se alimentan de nemátodos , gusanos enquitraeidos, insectos
y otros ácaros
Son saprofagos, micófagos y coprófagos
Los micófagos decrecen cuando se usan fungicidas
Son abundantes cerca de residuos enterrados
Sensibles a la sequedad
Aunque fragmentan hojarasca contribuyen poco a la
descomposición de plantas
Transportan esporas de hongos
Mueven la materia orgánica
Sus heces constituyen un hábitat de los microbios
Tipos de Macrofauna
Miriápodos (ciempiés y milpiés)
Papel importante como depredadores y carnívoros
(algunos se alimentan de materia vegetal en
descomposición)
Numerosos en suelos de bosques húmedos
Importantes en la fragmentación de hojarasca
Tipos de Macrofauna
Colémbolos
Insectos primitivos y pequeños (< 1mm)
Son los artrópodos más abundantes y más ampliamente
distribuidos (hasta 10.000/m2)
Contribuyen muy escasamente a la biomasa
Habitan en la superficie o son excavadores
Se alimentan de bacterias, hongos y esporas, materia orgánica en
descomposición, heces plantas vivas y animales; además de
detritus
Participan en la fragmentación de la hojarasca
Tipos de Macrofauna
Isópteros (termitas)
Importantes en el trópico y subtrópico,
Se alimentan de madera (celulosa) la degradan sus
protozoarios intestinales
Otras especies viven en el humus y hojarasca en
descomposición. Consumen un hongo cultivado
Transportan materia orgánica hacía sus nidos
Tipos de Macrofauna
Moluscos (caracoles y babosas)
Son omnívoros (materia viva, muerta y en
descomposición)
Sensibles a los cambios de humedad y temperatura,
no están uniformemente distribuidos
Varían de 10 – 25/m2 y hasta 50/m2
Algunos producen celulasa o tienen productores de
celulasa
Segregan mucoproteínas que contribuyen a formar
agregados de tierra hidroestables
Tipos de Macrofauna
Gusanos enquitraeidos
Son más pequeños que las lombrices de tierra
(50mm x 0.2 – 0.8 mm)
Son sensibles a sequedad
Su distribución no es uniforme (hasta 100.000/m2 de
suelo húmedo)
Se alimentan de microorganismos y cierta materia
orgánica disuelta
No digieren polisacáridos complejos
Tipos de Macrofauna
Lombrices de tierra

Aproximadamente 8,000 especies

Entre los géneros más comunes: Allobophora,
Apporectodea, Dendrobaena, Diplocardia, Eisenia y
Lumbricus
En prados y bosques del hemisferio Norte
> 1,000/m2 (a 15 cm superiores del suelo)
En suelos agrícolas de 100 a 200 o menos
No son tan numerosas en los trópicos
Tipos de Macrofauna
Lombrices de tierra
Papel importante en la descomposición de la materia
orgánica
Solo actúan en presencia del agua
• Segrega mucosidad que facilita el movimiento
• Cuerpo turgente para desplazarse
• Piel húmeda para la respiración
Población mayor en primavera y otoño
En verano se desplazan a lugares frescos y húmedos
Algunas como Lumbricus rubellus y Eisenia fetida forma
capullos
En invierno pueden cavar por debajo del límite de
congelación
Tipos de Macrofauna
Lombrices de tierra
Cuando aumenta el carbono orgánico las
poblaciones de lombrices también lo hacen
La tierra no cultivada tiene más población que la
cultivada
El cieno (limo) alberga una cantidad más elevada
(carbono orgánico y mayor capacidad de retención
de agua)
Predominan en la biomasa de la macrofauna
En peso seco superan 100 g/m2
Tipos de Macrofauna
Lombrices de tierra
Existen dos grupos
• Las que viven en horizontes orgánicos
• Aquellas que viven en suelos minerales
Cavan profundidades de varios metros a unos
cuantos centímetros por debajo de la superficie
La mayoría no emergen a la superficie excepto
Lumbricus terrestris
Tipos de Macrofauna
Lombrices de tierra
Descomposición de hojarasca y la introducen a la
tierra
Mejoran la estructura del suelo (segregan mucosidad
en los canales)
El material mineral que pasa por su intestino
• Ambiente favorable para los microorganismos
• Rico en NH4+ y materia orgánica parcialmente digerida
• Degradan celulosa y quitina
La mesofauna:
Nemátodos
 Introducción General

Mesofauna: conjunto de animales del suelo

cuya longitud queda comprendida entre
100µ y 2 mm

Nemátodos:
Grupo mas representativo y de mayor importancia
ecológica
 Introducción General

Gusanos redondos no segmentados. Aspecto

circular, así como filiforme, fusiforme y algunos
ovalados

La mayor parte son microscópicos y traslucidos

Anchura < 50 µm y una longitud de 2.000 µm

Algunos llegan a medir hasta 7 mm
 Introducción General

Grupo animal más numeroso del suelo

después de los protozoos, si bien no
contribuyen significativamente a la
biomasa del suelo
 Introducción General

10.000 especies de nemátodos en total

En el suelo solo existen 1.000 especies

10 a 25 especies en una muestra de tierra

 Introducción General

Cabe encontrarlos en el suelo en forma de

gusanos vivos o muertos, huevos o quistes

Las poblaciones son mayores en ambientes

orgánicos con un pH neutro
Numerosas cerca de las raíces de las plantas
 Introducción General

Altos niveles reproductivos con cinco y seis

generaciones anuales. Depositan miles de
huevos, formando “paquetes”

Son parasitados, a su vez, por otros

organismos del suelo y son consumidos como
parte de la cadena alimenticia del suelo,
regulando estas poblaciones
 Introducción General
Nematodos parásitos
Son importantes agentes patógenos de plantas
Tejidos y sustancias disueltas

Nodulos de Melodoigyne sp en Lechuga

 Introducción General
Existen también especies no patógenas que
habitan el suelo y la rizosfera y regulan las
poblaciones microbianas

Consumen hasta 5.000 células por minuto

Nematodos terrestres
Son depredadores, se alimentan de rotíferos y
protozoos
 Introducción General

Nematodos de vida libre

90% habitan en los 15 cm superiores del
contorno del suelo

Son saprofitos, se alimentan de

microorganismos
 Clasificación

Se agrupan en cinco categorías basadas en sus fuentes

alimenticias y en hábitos alimenticios selectivos

Patógenas,
Herbívoras,
Microbívoras (microorganismos),
Omnívoras (plantas vivas y muertas, así como tejido animal),
Carnívoras
 Ecología

Poblaciones variantes

Suelen ser inferiores en invierno y a principios

de primavera en climas templados,

Así como en verano y en otoño en climas

calidos
 Ecología

Regulan las poblaciones microbianas mediante

la depredación, al tiempo que actúan como
parásitos de las plantas

Reflejan la disponibilidad de materia orgánica

en al que habitan
 Tabla 3.2.1. Densidad y biomasa de las poblaciones de nemátodos en ambientes seleccionadosa
Población Biomasa
Ambiente
(millones/m2) (peso fresco en gramos/m2)

Desierto (Estados Unidos) 0,4 0,1

Bosque de haya, Inglaterra 1,4 0,4
Bosque tropical, África 1,7 --
Pastizal, Polonia 3,5 2,2
Tundra, Suecia 4,1 1,1
Bosque de pino, Suecia 4,1 0,6
Cultivo de patata, Polonia 5,5 0,7
Cultivo de centeno, Polonia 8,6 1,1
Bosque mixto, Polonia 7,0 0,7
Prado, Dinamarca 10,0 14,0
a Mar Coyne (2000)
 Ecología

“Una escasa población puede indicar

simplemente que los nemátodos se han
internado más profundamente en el suelo
para escapar de las inclemencias de
éste”
La microfauna
Protozoos y arquezoos
 Introducción
¿Qué son los protozoos?
Animales unicelulares que disponen de núcleo celular y
mitocondrias, son fagotróficos

Los arquezoos carecen de mitocondrias, por lo que son

más primitivos
 Introducción
No suelen realizar la fotosíntesis, no contiene quitina en
sus paredes celulares y no presentan un crecimiento
filamentoso

Son los animales más simples y los invertebrados más

abundantes

30.000 especies con un tamaño entre 10 y 100 µm

 Introducción
Están presentes en la tierra cultivable

Son depredadores importantes de las bacterias y las

algas que habitan el suelo

Cryptosporidium (un protozoo) y Giardia (arquezoo),

son agentes patógenos muy extendidos e importantes
contaminantes del agua potable
 Tabla 3.3.1. Número de protozoos en el sueloa

Ecosistema Flagelados Amebas Ciliados

Promedio de células por gramo de suelo seco
Agrícola
Suelo sin cultivar 7.000 30.000 155
Maíz sin fertilizar 833.000 1.295 2.230
Maíz abonado 740.000 144.690 11.265
Prado
Prado alto (Minnesota) 400.000 80.000 150
Llanura semiárida 8.000 5.000 80
Pradera de montaña 28.000 24.000 138
Bosque
Pinos del oeste norteamericano 30.000 25.000 225
Abetos Douglas 25.532 3.018 74
a Mar Coyne (2000)
 Crecimiento
Las condiciones ambientales favorables, como el abono,
rica fuente de materia orgánica, promueven el
crecimiento de los protozoos

Prosperan también cuando el suelo esta bien ventilado y

su pH se sitúa entre 6 y 8

Suelen ser mesófilos y requieren de capas de agua cerca

Formas flageladas resistentes a la sequedad
 Alimentación
Son saprofitos, se alimentan de sustancias inorgánicas y
orgánicas disueltas, a la vez que son fagotróficos
Depredación

El alimento ingerido es rodeado por una vacuola en la que

tiene lugar la digestión
 Alimentación
Los ciliados y los flagelados consumen bacterias,
levaduras, otros protozoarios y rotíferos

Las amebas se alimentan de bacterias, protozoos,

levaduras, esporas y algas
Los cromistas:
Las algas
 ¿Qué son los cromistas?

Introducción

El reino Chromista (Cavalier-Smith, 1981) incluye

organismos que fueron caracterizados anteriormente
como protozoos, hongos y plantas

Características comunes de los cromistas:

 Eucariotas
 Cloroplastos asociados al retículo endoplasmático
 Uno o más flagelos
 ¿Qué son los cromistas?

Introducción
Los oomicetos antes eran considerados hongos
Pythium: enfermedad de podredumbre de las plantas
Phytophthora infestans: enfermedad de la patata

Los organismos que llamamos algas son

fotosintetizadoras en su totalidad y algunas tienen
zoosporas flageladas

La adopción del reino Chromista no es, de alguna

manera, aceptado o aplicado universalmente
 ¿Qué son las algas?

Introducción

Organismos fotosintetizadores que fabrican oxigeno y

disponen de clorofila similar a la de las plantas y
pigmentos fotosintéticos

Tamaño variable: de 40 metros de longitud a especies

microscópicas
 Chlorella con un diámetro de 2 a 3 mm
 ¿Qué son las algas?

Introducción
Las algas son las plantas más comunes y extendidas,
principalmente acuáticas, habitan en todos los
ambientes terrestres
 Suelos que disponen de luz y agua

 Causaron un cambio geoquímico sustancial en

la Tierra transformando la atmósfera del planeta
durante la fotosíntesis:
 Eliminación de CO2 → CaCO3
 Generación de materia orgánica
 ¿Qué son las algas?

Introducción

Las algas se asocian a los hongos para formar líquenes

 Mejora biológica de los silicatos mediante la excreción de
ácidos orgánicos

Se sitúan casi al comienzo de la cadena alimenticia

 Son consumidas por los protozoos, los nematodos, los
ácaros y las lombrices de tierra
 Pesticidas e insecticidas estimulan el florecimiento al
eliminar los insectos y la macrofauna depredadora
 Grupos de Importancia en el Suelo

Existen tres grupos principales de algas:

 Algas verdes (clorofitas)

 Diatomeas
 Algas verde-amarillentas (xantofitas)
 Grupos de Importancia en el Suelo

Algas verdes

 Unicelulares, formando colonias de múltiples

células o bien formar largos filamentos de células

 Reproducción
♦ Sexual por fusión y
♦ Asexual por división (fisión), formación de
zoosporas o fragmentación
 Grupos de Importancia en el Suelo

Algas verdes
 Contiene clorofila a y b

 Pared de celulosa que también contiene otros

polisacáridos como el acido algínico

 Almacenan sus productos fotosintéticos en

forma de almidón
Mayor diferencia entre las algas verdes y las
diatomeas o las algas-verde amarillentas
clasificadas en el reino de los cromistas
 Grupos de Importancia en el Suelo

Diatomeas

 Contiene pigmentos fotosintéticos como las

clorofilas, los carotenos y los xantófilos

 Aspecto color marrón

 Producto de la fotosíntesis almacenado en

forma de aceite
 Grupos de Importancia en el Suelo

Diatomeas

 Reproducción
♦ Sexual por fusión y
♦ Asexual por fisión y formación de zoosporas

 Exoesqueleto de sílice y pectina que resiste a

la degradación

 No modifican significativamente las

propiedades del suelo o a la productividad
 Grupos de Importancia en el Suelo

Diatomeas: la tierra diatomácea

Al morir las diatomeas sus paredes celulares
permanecen relativamente intactas y pueden
acumularse con el tiempo formando las tierras
diatomáceas

Utilidad comercial
♦ Material de filtración
♦ Aislante
♦ Material pulimentador
♦ Insecticida no químico
 Grupos de Importancia en el Suelo

Algas verde-amarillentas

 Contienen xantófilos, carotenos y clorofila

 Pared celular formada por quitina y/o sílice

 Organismos unicelulares o formando filamentos

 Grupos de Importancia en el Suelo

Algas verde-amarillentas

 Reproducción
♦ Sexual por fusión y
♦ Asexual por fisión, formación de zoosporas o
simplemente por fragmentación

 Producto de la fotosíntesis almacenado en

forma de aceite
 Poblaciones

 Son más numerosas que los protozoos y la

macrofauna
♦ 109 y 1010 ufc por metro cuadrado de suelo, o bien
♦ 103 y 106 ufc por gramo de suelo

 Aportan entre 7 y 300 kg a la biomasa por hectárea

 En los suelos templados,

♦ algas verdes > diatomeas > algas verde-amarillentas
 Poblaciones

 Algas verdes predominantes en suelos ácidos

 Diatomeas crecen mejor en suelos neutros

 Se encuentran en las capas superiores del suelo

provistas de agua y luz, inclusive donde no hay luz

 Endolíticas
 Efectos ambientales
 Temperatura, factor determinante

 Agua, factor regulador (lluvia)

 Sales

 Fertilidad del agua

♦ Nitrógeno, fósforo y potasio
♦ Herbicidas
 Eutroficación

 Sobreenriquecimiento de nutrientes que tiene lugar

en el agua

 Las aguas eutróficas son ricas en nutrientes, plantas

y algas crecen en ellas en forma descontrolada

 Las plantas mueren y se descomponen, el agua

pierde oxigeno por la acción microbiana
 Eutroficación

 Un ambiente eutrófico se identifica por estar lleno de

plantas, infestado de cadáveres de animales
acuáticos, despidiendo al mismo tiempo un olor
característico (H2S)

 Proceso natural que tiene lugar a medida que los

lagos envejecen
 Eutroficación

 Los nutrientes que provocan la Eutroficación suelen

proceder del desbordamiento superficial del suelo, uso
descontrolado de fertilizantes, o bien de desechos
domésticos e industriales descargados en ríos y lagos
 Fósforo y nitrógeno
 Eutroficación

Medidas preventivas

 Prohibición de los vertidos de fosfatos contenidos en

los detergentes de ropa
 Practica s de conservación para reducir la erosión
 Restricción al uso de fósforo aplicado en áreas
sensibles
Los hongos
 Introducción
¿Por qué son los hongos importantes?

Las levaduras levantan la masa del pan,

fermentación del vino y la cerveza

Hidrolizan y proporcionan sabor a la leche para

fabricar quesos como el Brie, Camembert,
Limburger, Roquefort, Gorgonzola y quesos
azules
 Introducción
¿Por qué son los hongos importantes?

Fermentan productos vegetales para fabricar

saborizantes como el de la salsa de soya

Causan mal olor y la perdida de las cosechas

La mayor parte de los patógenos de las plantas son

hongos
 Caracterización
Son eucariotas

Compuestos de finos filamentos llamados hifas con

un diámetro de 3 a 8 mm
 Septadas o no septadas (cenocíticas)
 Vegetativas o fértiles
 Colectivamente las hifas componen el micelio

Reproducción por esporas sexuadas, esporas

asexuadas y por fragmentación
 Tipos de hongos
 Mixomicetos
Se encuentran debajo de la materia orgánica en
descomposición
Organismos multinucleados ameboides
Forman estructuras complejas carnosas

 Oomicetos
Pythium: enfermedad de podredumbre de las plantas
Phytophthora infestans: enfermedad de la patata
 Tipos de hongos
 Zigomicetos
Rhizopus nigricans: el moho del pan

 Hongos más complejos

Ascomicetos
30.000 especies (levaduras, mirillas y las trufas)
Basidiomicetos
Agaricus, urenidales, micorrizas y hongos causantes de la
putrefacción de la madera
 Tipos de hongos
 Hongos imperfectos
Deuteromicetos: Penicillium

 Micelios estériles
Reproducción exclusiva por fragmentación de hifas
Los nuevos fragmentos forman nuevos micelios
Pueden reclasificarse como ascomicetos
 Hábitats e influencias ambientales
Constituyen la fracción más grande de la biomasa
microbiana

Existen entre 2 x 104 a 1 x 106 propágulos fúngicos por

gramo de suelo
Propágulo: cualquier parte de un hongo, espora o hifa
capaz de formar una nueva colonia de hongos

Existen probablemente menos hongos que bacterias o

actinomicetos
 Hábitats e influencias ambientales
Resulta imposible obtener una estimación precisa de
las poblaciones de los hongos, ya que el organismo
original se ha multiplicado a través de progenies
diversas

La distribución esta determinada por la disponibilidad

de carbono orgánico

Organismos saprofitos, crecen en tejidos muertos y en

descomposición
 Hábitats e influencias ambientales
Un escaso número de hongos parasitan animales
vivos, mientras que los hongos patógenos de las
plantas parasitan plantas vivas

Por lo general los hongos se encuentran en la capa

superior del suelo (de 0 a 15 cm)

La vegetación afecta la distribución

 Hábitats e influencias ambientales
Subsisten en un amplio rango de pH, son más
tolerantes a suelos ácidos que otros
microorganismos

Son mesófilos, proliferan en temperaturas

comprendidas entre 6 y 50° C

Precisan de agua para su actividad metabólica

Subsisten en climas semiáridos en estado de reposo , o
bien depositando esporas
 Hábitats e influencias ambientales

En suelos humedos disminuyen las poblaciones

Requieren de oxigeno
Algunos hongos, principalmente las levaduras,
sobreviven en ambientes anaerobios mediante la
fermentación de azúcares para formar alcohol
 Hábitats e influencias ambientales

Hongos endofiticos
Festuca arundaceae, proporciona a la hierba una
resistencia adicional a la sequedad y a la depredación por
parte de los insectos
Micorrizas
Asociaciones simbióticas con las raíces de las plantas y
árboles
 Función de los hongos

 Principales agentes de la descomposición de la

materia orgánica
 Celulosa
 Hemicelulosa
 Pectinas
 Almidón
 Ligninas
 Compuestos resistentes
 Función de los hongos
 Constituyen un deposito de nutrientes (crecimiento
potencial de microorganismos), forman el grueso de la
biomasa microbiana

 Ayudan a formar los agregados del suelo

 Ponen a disposición los nutrientes mediante la

descomposición de la materia orgánica

 Agentes patógenos de animales y plantas

Crecimiento saprofítico competitivo
 Características fisiológicas que permiten la
colonización y el metabolismos de la materia
orgánica

 Rápido nivel de crecimiento

 Enzimas diversas que permiten el crecimiento en
diversos sustratos
 Capacidad de producción de compuesto inhibidores
tóxicos
 Supervivencia y propagación
 Subsisten en el suelo gracias a una serie de
mecanismos, entre los que destacan las esporas y
estructuras en reposo. Las esporas son de clases
muy diversas y se dispersan por varios mecanismo

 Unos cuantos hongos son adaptados a una

alimentación a base de nemátodos, mientras que
otros son cosechados o cultivados por el hombre
para su consumo
 Tabla 3.5.2. Contribución relativa de los organismos del suelo a la
biomasa del suelo de un prado de clima templadoa
Organismo Biomasa (kg por hectárea)

Raíces de las plantas 20.000 a 90.000

Hongos 2.500
Bacterias 1.000 a 2.000
Actinomicetos 0 a 2.000
Protozoos 0 a 500
Nemátodos 0 a 200
Lombrices de tierra 0 a 2.500
a Mar Coyne (2000)
Procariotas filamentosos:

Actinomicetos
Características de los actinomicetos
Procariotas

Aspecto similar al de los hongos

Clasificados anteriormente como hongos

(morfología)

Crecen en forma de micelios filamentosos

delgados, ramificados y forman esporas
Características de los actinomicetos

Características que distinguen a los actinomicetos

de los hongos

 No tienen núcleo celular

 Forman hifas con un diámetro de 0,5 a 1 µm

Características de los actinomicetos

No son fotosintetizadores

Son saprofitos, materia orgánica en

descomposición

Patógenos humanos, de animales y plantas

Mycobacterium leprae
Mycobacterium tuberculosis
Características de los actinomicetos

Suelen ser inofensivos para el suelo

Algunos particularmente beneficiosos

Frankia, asociaciones con arbustos y
árboles leñosos, fijando el nitrógeno
 Ambientes y poblaciones
Constituyen de un 10 a un 50% de la población
microbiana total del suelo
Tierra
Compost
Sedimentos

Poblaciones que van de 105 a 108 propágulos

por gramo
 Ambientes y poblaciones
Poblaciones mayores en prados que en suelos
cultivados y mayores en estos últimos que en
terrenos baldíos

Su población puede depender de la materia

orgánica disponible

Pueden subsistir en profundidades más bajas

 Ambientes y poblaciones
Aerobios
No crecen adecuadamente en suelo húmedos

No toleran el desecamiento
Después de una sequía la población microbiana
recuperada puede consistir entre un 30 y un 90%
de actinomicetos

Temperatura óptima para el crecimiento entre

28 y 37º C
 Ambientes y poblaciones
Soportan condiciones alcalinas
95% de los grupos microbianas en un suelo alcalino

No toleran ambientes ácidos

pH inferior a 5, conforman menos de un 1% de la
población microbiana
Control de algunos actinomicetos patógenos de las
plantas
 Ambientes y poblaciones
La población de actinomicetos crece a medida
que aumenta la materia orgánica
Proliferan hasta las fases finales de la materia
orgánica

No son buenos competidores en el consumo de

sustratos fácilmente degradables
Usan celulosa y quitina
 Clasificación

Los actinomicetos se clasifican con arreglo a

aspectos tales como:
La química de la pared celular
La composición de los azúcares de la célula
completa
La hibridación del ADN o el ARN
 Clasificación
Géneros de actinomicetos:
Micromonospora
Nocardia
Streptomyces
Streptosporangium
Thermoactinomyces

Streptomyces > Nocardia > Micromonospora

Streptomyces 90% (5-20%)
 Antibióticos
80 géneros de actinomicetos (1940, solo cinco)

Son la fuente natural de antibióticos mas conocida

Moléculas orgánicas con propiedades
antimicrobianas
PM inferior a 100 y superior 12.000
Conformados por metabolitos intermedios
Rutas biosintéticas de pasos múltiples
Biosíntesis de estreptomicina implica 30 pasos
 Antibióticos
5.000 antibióticos identificados
300 nuevos por cada año

Obtenidos de hongos y procariotas

75% aislados de los actinomicetos
 Antibióticos
75% de los antibióticos identificados proceden de
miembros del género Streptomyces

1. Estreptomicina: Streptomyces griseus

2. Cloranfenicol: Streptomyces venezuela
3. Aureomicina, tetraciclina: Streptomyces aureofaciens
 Tabla 3.6.2. Número relativo de antibióticos producidos por distintos grupos microbianosa

Grupo microbiano Numero de antibióticos producidos

Hongos

Ficomicetos 14
Ascomicetos 299
Penicillium 123
Aspergillus 115
Basidiomicetos 140
Hongos imperfectos 315

Bacterias

Especies de Pseudomonas 171

Enterobacterias 36
Micrococos 16
Lactobacilos 28
Bacilos 338
Bacterias diversas 274
Actinomicetos
Especies de Mycobacterium 4
Especies de Actinoplanes 18
Especies de Streptomyces 3.872
Especies de Micromonospora 41
Especies de Thermoactinomyces 17
Especies de Nocardia 48
Otras especies de actinomicetos 2.078
a Mar Coyne (2000)
El resto del mundo procariota

Bacterias
 Taxonomia
Dentro de los cinco reinos se encuentran:

Animalia contiene animales multicelulares con células eucariotas desprovistas

de pared y nutrición ingestiva.

Plantae se compone de plantas multicelulares con células eucariotas con

pared y nutrición fotoautotrófica.

Monera o Procaryota contiene todos los organismos procariotas.

Protista es el más homogéneo, eucariotas con organismos unicelulares;

nutrición ingestiva, absortiva o fotoautotrófica, están algas, protozoos y hongos
sencillos.

Fungi contiene organismo eucariotas multinucleados, con núcleos dispersos

en un micelio con pared y tabicado, nutrición absortiva.
 Taxonomia

Nuevos métodos taxonómicos bacterianos

clasifican las bacterias

Comparación de secuencias de ARN

Dos grupos distintos de procariotas

 Taxonomia
Grupos básicos de procariotas
Procariotas Eucariotas
Bacterias Arqueos
Termotogas Metanógenos Animales
Flavobacterias Halófilos extremos Plantas
Cianobacterias Termófilos extremos Ciliados
Bacterias violeta Acidófilos Flagelados
Bacterias Gram–negativas Hongos
Bacterias verdes no sulfurosas Microsporidios
Bacterias Gram-positivas
Bacterias fotosintetizadoras

Woese, 1987; Pace, 1996

¿Por qué son pequeñas las bacterias?
Supervivencia
Diámetro de 0.15 a 4.0 µm
Longitud 0.2 a 50 µm
Volumen 0.1 a 5.0 µm3
Fase de crecimiento
Metabolismo (inversamente proporcional
al tamaño)
Relación elevada de superficie/volumen
Comparación de tamaños de las bacterias
Staphylococcus aureus
Cocos
Sarcina

Vibrio
Anchura Espirilos
Selenomonas ruminantium
(µm)
Spirillum volutans
Escherichia coli
Bacilos
Bacillus megaterium

Chromatium weissli

4 8 12 16 20 24 28 32 36 40
Longitud
(µm) Doetsch y Cook, 1973
 Microbiología del suelo

Durante años, los microbiólogos de los suelos y

los ecólogos microbianos han tendido a
diferenciar a los microorganismos que habitan en
los suelos
Microorganismos benéficos
Microorganismos dañinos
Según sus funciones
Según como ellos afectan la calidad de la tierra, el
crecimiento, el rendimiento y la salud de las plantas
Microorganismos benéficos
Son aquellos que tiene la capacidad de . . .
Fijar el nitrógeno atmosférico
Descomponer los residuos orgánicos
Degradar los pesticidas
Suprimir las enfermedades de las plantas y los
patógenos generados en los suelos
Reforzar el ciclo de los nutrientes
Producir compuestos bioactivos como las vitaminas,
hormonas y enzimas que estimulan el crecimiento de
las plantas
Microorganismos dañinos

Aquellos que . . .
Podrían inducir enfermedades en las plantas,
Estimular el crecimiento de los patógenos en los
suelos,
Inmovilizar nutrientes y producir sustancias toxicas y
putrescentes que afecten negativamente el
crecimiento y la salud de las plantas
Importantes bacterias del suelo

Arthrobacter

Bacillus

Pseudomonas

Son tres de las bacterias del suelo con mayor

frecuencia
 Arthrobacter
Clasificación: Actinomicetos
Morfología: Pleomórfica
Crecimiento: Lento
Movilidad: Ligeramente móvil
Fácilmente recuperable del suelo
“crece en diversos sustratos”
 Bacillus
Representan entre el 7 y el 67% de los grupos
aislados del suelo
Formadores de esporas
Supervivencia: pH de 2 a 8 con una
temperatura de -5º y 75º C
Algunas son fijadoras del nitrógeno
Metabolismo distinto “degradar compuestos
químicos orgánicos”
 Pseudomonas

Algunas especies son patógenas

Micoplasmas, virus, viroides y priones:

El resto de los microbiotas

 Introducción
Los micoplasmas, los virus, los viroides y los
priones; son tan pequeños que tiene un efecto
ralamente escaso sobre los procesos biológicos
del suelo

Afectan significativamente a los organismos con

los que están asociados
 Micoplasmas
Organismos procariotas de muy pequeño
tamaño (comparable incluso al de algunos virus)
capaces de realizar una replicación
independiente

Pleomórficos

Tamaño de 0,1 a 0,3 µm de diámetro

 Micoplasmas
Aerobios y anaerobios

Responsables de algunas enfermedades de las

plantas

Cabe encontrarlos en el suelo, en los desagües,

en insectos, en animales y en la especie
humana
 Generalidades
Los virus
Ivanovski en Rusia (1892) Y Beijerinck en Delft (1898)
observaron que la planta de tabaco resultaba afectada
por la enfermedad conocida como mosaico del tabaco
 Fisiología y Morfología
Los virus
 Fisiología y Morfología
Los virus
 Fisiología y Morfología
Los virus
 Fisiología y Morfología
Los virus

Virus del tabaco

 Ecología
Los virus
Los virus son capaces de sobrevivir en el suelo en
forma de partículas latentes que conservan su cualidad
parasitaria

Los virus de las plantas rara vez sobreviven en el suelo,

mientras que algunos virus específicos de los insectos
conservan su capacidad infecciosa durante años
 Ecología
Los virus
Tabla 3.8.1. Presencia en varios suelos del bacteriófago que infecta al Rhizobium meliloti,
la especie de rizobio que infecta la alfalfaa
Edad del campo Presencia
Suelo pH
(años) del bacteriófago
Suelo forestal 4,9 NE -
Suelo forestal 5,0 NE -
Prado 5,3 NE -
Campo de alfalfa 5,3 6 +
Campo de alfalfa 5,9 3 +
Campo de alfalfa 6,1 8 +
Campo de trigo 6,1 NE +
Prado 6,2 NE -
Campo de alfalfa 7,4 1 +
NE: No especificado
a Mar Coyne (2000)
 Viroides
Los viroides son agentes infecciosos que, al igual que los
virus, tienen un ciclo extracelular que se caracteriza por la
inactividad metabólica y un ciclo intracelular en el que
causan infección al huésped susceptible

A diferencia de los virus, los viroides no poseen proteínas ni

lípidos y están constituidos por una cadena corta de ARN
(que no codifica proteínas) autorreplicante de bajo peso
molecular. En sí constituyen una etapa primitiva de los virus
 Viroides
Son en si simplemente moléculas de RNA monocatenario
circular y constituyen la norma patógena más pequeña
conocida

Al menos doce enfermedades de las plantas han sido

relacionadas con los viroides

No se tiene la seguridad de que cumplen una función

conocida en el suelo, bien como participante activo en la
biología del suelo, o bien como una amenaza latente para el
hombre
 Los priones
Partículas infecciosas de naturaleza proteica
autorreplicantes que no parecen estar asociados a ácidos
nucleicos

Tienen las propiedades físicas y químicas de las proteínas

Son resistentes a la mayoría de los procesos físicos y

químicos que inactivan ácidos nucleicos

No producen respuesta inmune o inflamatoria en el

hospedero
 Los priones
Los priones solo se transmiten a través del tejido infectado
consumido o bien transplantado

Afectan al procesamiento de los alimentos

¿Cuánto tiempo subsisten los priones en el suelo antes

de descomponerse?
¿Acaso la macrofauna que consume tejidos animales
infectados puede llegar a transmitir estos priones al
resto de los miembros de la cadena alimenticia?