DNA: Cromosomas y Genes

DEFINICIÓN DE GEN
 Unidad funcional de información genética

 Es una secuencia de DNA que contiene la

información suficiente para fabricar una molécula
funcional específica (un polipéptido o un RNA
funcional)

El estudio de la estructura y función de los genes es

el objeto de la Genética y todas sus disciplinas
derivadas, como la Ingeniería Genética
 DEFINICIÓN DE GEN
 Es una secuencia de DNA que contiene la información suficiente
para fabricar una molécula de proteína.

 ORGANIZACIÓN.

 La mayor diferencia entre los genes estructurales eucariontes y

procariontes es que la secuencias de la mayoría de los genes
eucariontes, combinan secuencias de expresión con secuencias
de no expresión.
MECANISMO DE LA TRANSMISION GENETICA
El proceso transcurre en tres fases:

 Duplicación
 del ADN (Replicación)
 Transcripción de la información del ADN al
mARN.
 Traducción de la información del mARN en
una secuencia de aminoácidos, en el
ribosoma.

«Dogma central de la biología molecular.»

Dogma central de la biología molecular.

genotipo fenotipo
 ETAPAS DE LA EXPRESIÓN GÉNICA
Bacterias Eucariontes
DNA DNA

TRANSCRIPCIÓN

pre-tRNA pre-rRNA pre-mRNA pre-tRNA pre-rRNA

PROCESAMIENTO
DE RNAs
mRNA tRNA rRNA mRNA tRNA rRNA

TRADUCCIÓN

Polipéptido Polipéptido
DOGMA DE LA BIOLOGIA MOLECULAR
 LOS LENGUAJES UNIVERSALES DE LA EXPRESIÓN GÉNICA

REPLICACION
5’ATG CAA CAC CGT TGT CCC ACC AAA TGA3’
3’TAC GTT GTG GCA ACA GGG TGG TTT ACT5’

Transcripción

5’AUG CAA CAC CGU UGU CCC ACC AAA UGA3’

Traducción

NH2Met Gln His Arg Cys Pro Thr Lys STOPCOOH

DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR

PROCARIOTA

EUCARIOTA
 LA REPLICACIÓN DEL ADN
 Es el proceso mediante el cual la molécula de ADN hace copias de
sí misma (y, por tanto del cromosoma).
 En el núcleo hay muchos nucleótidos libres que son los bloques de
construcción del nuevo ADN .
 REPLICACIÓN DEL DNA
 Watson y Crick propusieron que
la duplicación se hace de manera
semiconservativa.
 Las moléculas finales contienen
una hebra nueva, recién
sintetizada, y la complementaria,
hebra antigua, que sirvió de
molde.
 Se demostró por Neselson y
Stahl en E. coli.
 Sucede cuando la célula requiere
dividirse, es decir generar dos
células hijas idénticas (división
mitótica).
LA REPLICACIÓN DEL DNA ES SEMICONSERVATIVA
LA REPLICACIÓN SE LLEVA A CABO BIDIRECCIONALMENTE A PARTIR DEL
ORIGEN DE REPLICACIÓN

Origen de
Horquillas
replicación
 REPLICACIÓN BIDIRECCIONAL
El proceso es bidireccional, es decir, hay una helicasa trabajando
en un sentido y otra trabajando en sentido opuesto. Se forman
pues las llamadas burbujas u ojos de replicación.
REPLICACIÓN DEL CROMOSOMA PROCARIÓTICO
Un solo origen de replicación
REPLICACIÓN DE UN CROMOSOMA EUCARIÓTICO

Múltiples orígenes de replicación

EL ORIGEN DE REPLICACIÓN CONTIENE LAS
SEÑALES SUFICIENTES PARA LA REPLICACIÓN
ori Cualquier
ori
aislado
+ DNA

Molécula
de DNA
replicativa
Nueva
molécula
replicativa

Es posible propagar cualquier secuencia de DNA en un organismo

hospedador si se le proporciona un origen de replicación adecuado
 FASES DE LA REPLICACIÓN.

 Desenrrollamiento del ADN.(topoisomerasas, y

helicasas)
 Formación de un partidor o “primer”. (primasa)
 Formación del nuevo ADN. (DNA polimerasa)
 Eliminación del partidor.
 Unión de fragmentos de Okasaki
 ENZIMAS DE LA REPLICACIÓN
Topoisomerasas:
Rompen una hebra y la tensión del enrrollamiento de la hélice se
relaja
Helicasas
Rompe los puentes de hidrógenos y separan las dos hebras del
ADN, para que cada una actué como molde

Proteínas SSB
Se unen a las hebras para mantenerlas separadas mientras tiene
lugar la replicación. Actúan en conjunto con las helicasas
Girasas
Desenrollan la molécula de ADN y evitan que esta se enrolle
mientras acontece la duplicación

Primasas
Sintetizan el ARN cebador usado como molde una hebra de ADN
ADN pol. I
 Corta el ARN cebador
 Repara errores de la síntesis de ADN
 Rellena con desoxirribonucleótidos el hueco
resultante al eliminarse el ARN cebador
ADN pol. II
 Repara pequeñas roturas en las hebras de ADN
(corrigiendo estos errores)
ADN pol. III
 Interviene directamente en la polimerización del
ADN (seleccionando el nucleótido adecuado)
Nucleasas
 Rompen los enlaces fosfodiéster entre nucleótidos,
dando lugar al punto de origen

Ligasas
 Unen los fragmentos adyacentes mediante enlaces
fosfodiéster
PROCESO GENERAL
SÍNTESIS DEL PRIMER DE ARN POR UNA PRIMASA
 LAS DNA POLIMERASAS
 Enzimas responsables de la síntesis del DNA
 Múltiples DNA polimerasas en todos los organismos
 Implicadas en replicación y en reparación del DNA
 Todas presentan actividad DNA polimerasa 5’-3’
dCTP
5’ P-GT-OH 3’ 5’ P-GTC-OH 3’
3’OH-CAGCGT-P 5’ 3’OH-CAGCGT-P 5’
PP
 Las ADN polimerasas requieren como sustrato la punta 3’ hidroxilo libre de una base
apareada para catalizar la unión de otro nucleótido.
 El OH libre se une al 5’a-fosfórico del deoxinucleósido 5’ trifosfato, liberándose un
pirofosfato inorgánico
 Algunas presentan otras actividades:
 Exonucleasa 3’-5’
 Exonucleasa 5’-3’
INICIACIÓN
La enzima ADN Pol III necesita de un
extremo 3'-OH libre, por lo que es
necesario que una ARN primasa
catalice la formación de un fragmento
corto específico de ARN llamado
cebador, partidor o “primer”, que
determinará el punto por donde la
ADN polimerasa comienza a añadir
nucleótidos.
En partidor, es una cadena de unos
20 nucleótidos que sirve como punto
de partida para la replicación del ADN.
Un partidor, cebador, iniciador o p
rimer es una secuencia corta
de ácido nucleico , sirve como
punto de partida para la replicación
del ADN.
LA REPLICACIÓN DEL DNA SE INICIA CON LA SÍNTESIS DE CEBADORES
DE RNA

Las DNA polimerasas no son

capaces de iniciar la síntesis de
novo

Una RNA polimerasa (primasa)

sintetiza un pequeño RNA que sirve
como cebador, proporcionando un
extremo 3’ a la DNA polimerasa
UNA DE LAS CADENAS DEL DNA SE REPLICA DE
FORMA DISCONTINUA
5’

3’ Fragmentos de Okazaki

Hebra retrasada
5’
3’
Progreso de la horquilla
3’
5’
5’
3’
La enzima ADN polimerasa añade los
nuevos nucleótidos en dirección 5' 3'
Hebra adelantada pero ambas cadenas son anti paralelas.
La síntesis se da bidireccionalmente
5’
desde cada origen, con dos horquillas
3’
de replicación que avanzan en sentido
opuesto.
 Fragmentos de Okazaki
En una de las cadenas la enzima actúa a medida que se abre la
horquilla (cadena continua), sin embargo en la otra cadena (cadena
discontinua) la adición de los nuevos nucleótidos no puede llevarse
a cabo de forma continua ya que tiene el sentido 3' 5'.
Se conocen como fragmentos de Okazaki a las cadenas cortas de
ADN recién sintetizadas en la hebra discontinua.
Están formados por 1000 a 2000 nucleótidos en Escherichia coli y
entre 100 y 200 nucleótidos en eucariotas.
Están separados por cebadores de ARN de aproximadamente 10
nucleótidos de longitud.
Éstos se sintetizan en dirección 5´-> 3´ a partir de cebadores de
ARN que después son eliminados.
Los fragmentos de Okazaki se unen entre sí mediante la ADN ligasa
completando la nueva cadena.
A medida que la helicasa abre la doble hélice original, debe
agregarse un cebador
 LA DNA LIGASA UNE LOS FRAGMENTOS SINTETIZADOS

La ligasa acopla la hidrólisis de un ATP para hacer más favorable la reacción

de unión entre el fosfato y el hidroxilo libre, liberando al final un AMP
 Mecanismo de replicación del DNA
DNA polimerasa III
Primasa

5’ 5’

5’
5’ 3’

3’ 5’
5’

5’ 5’

SSB
Helicasa
Ligasa
DNA polimerasa I
 Las DNA polimerasas
Las ADN polimerasas son enzimas polimerasas que llevan a cabo la
síntesis de la nueva cadena de ADN emparejando los
desoxirribonucleótidos trifosfato (dNTP) con los desoxirribonucleótidos
complementarios correspondientes del ADN molde.
Los dNTP que se usan en la replicación del ADN contienen tres fosfatos
unidos al grupo hidroxilo 5' de la desoxirribosa y dependiendo de la base
nitrogenada serán dATP, dTTP, dCTP o dGTP.
La reacción fundamental es una transferencia de un grupo fosfato en la
que el grupo 3'-OH actúa como nucleófilo en el extremo 3' de la cadena
que está en crecimiento.
 A diferencia de la mayoría de procesos biológicos que ocurren en la
célula en los que sólo se separa un grupo fosfato (Pi), durante la
replicación se separan los dos últimos grupos fosfato, en forma de grupo
pirofosfato (PPi)...
Este proceso se puede resumir en una ecuación química:
(DNA)n + dNTP ↔ (DNA)n+1 + PPi
 La DNA polimerasa corrige sus propios errores
La unión correcta de los pares de bases A:T, C:G es posible basándose en la
geometría de éstos: si la unión es incorrecta se produce un desplazamiento del
fosfato α haciendo más difícil su unión al extremo 3'-OH y ralentizando así el ritmo
de catálisis, lo que da lugar a que la ADN polimerasa añada preferentemente las
bases correctas.
 PROCESO DE LA REPLICACIÓN

Topoisomerasas
 Hebra molde

Hebra líder

Hebra retardada
 Fragmentos de okazaki

En las bacterias, los fragmentos de Okazaki miden de 1000 a

2000 nucleótidos.
En eucariotas los fragmentos de Okazaki solo miden de 100 a
200 nucleótidos.

La velocidad de replicación es unas 10 veces mayor en los

PROCARIOTAS (2 um/minuto, 500 nucleótidos por segundo) que
en los EUCARIOTAS (0.2 um/minuto, 50 nucleótidos por
segundo)
 LA TRANSCRIPCIÓN
La sucesión de bases en las moléculas de ADN es un código
químico para la sucesión de aminoácidos en las proteínas.

 Durante la transcripción genética, las secuencias de ADN son

copiadas a ARN mediante una enzima llamada ARN polimerasa que
sintetiza un ARN mensajero que mantiene la información de la
secuencia del ADN.
La RNA polimerasa empieza a copiar cuando encuentra una
secuencia de DNA denominada promotor, y termina cuando
encuentra una secuencia de DNA denominada serie de
terminación.

La velocidad de la transcripción es de unos 30 nucleótidos por

segundo.
LA TRANSCRIPCIÓN
 TRANSCRIPCIÓN
Síntesis de ARN partir de ADN, en el núcleo de la célula.

Actúan ARN polimerasas, leyendo el ADN en sentido

3’→5’ y sintetizando ARN en sentido 5’→3’.

Se distinguen 3 fases:

 Iniciación

 Elongación

 Maduración
 TRANSCRIPCIÓN EN PROCARIONTES.
Podemos distinguir las siguientes fases:
a) Iniciación: la ARN polimerasa se une a un cofactor que
permite su unión a una región del ADN llamada promotor, la
cual posee una secuenciación TATAAT ó TTGACA.
b) Elongación: la ARN polimerasa recorre la hebra de ADN
sintetizando una hebra de ARNm en dirección 5´-3´
c) Finalización: presenta dos variantes. En una interviene un
cofactor "p" y en otra no interviene dicho cofactor. El proceso
finaliza al llegar a una secuencia rica en G y C (zona llamada
operador). El ADN vuelve a su forma normal y el ARNm queda
libre.
d) Maduración: si lo que se forma es un ARNm no hay
maduración, pero si se trata de un ARNt o ARNr hay procesos
de corte y empalme.
 TRANSCRIPCIÓN EN EUCARIOTAS
 La porción del ADN que contiene el código para la proteína que se
necesita, se desdobla y se separa. El resultado es que se exponen
las bases.
 Los nucleótidos de ARN libres que están en el núcleo, se aparean
con las bases expuestas del ADN. Que sean complementarias.
 Uracilo en lugar de Timina
 PASOS DE LA TRANSCRIPCIÓN
 La molécula de ARNm se completa por la formación de enlaces
entre los nucleótidos del ARN.
 La molécula de ARNm se separa de la molécula de ADN.
TRANSCRIPCIÓN: MADURACIÓN
LA MOLECULA DE ARNM VIAJA HACIA LOS RIBOSOMAS
 TRADUCCION
Etapa en que la información contenida en el mARN se
convierte en molde para la síntesis de una proteína.

Comprende el cambio del “lenguaje” de ácidos

nucleicos (sucesión de bases) al lenguaje de proteínas
(sucesión de aminoácidos).

 Sucede en los RIBOSOMAS.

Están compuestos de dos sub-unidades
Unidad ribosomal menor. En E. coli 30 S.

Unidad ribososmal mayor. En E. coli 50 S.

 TRANSCRIPCIÓN - TRADUCCIÓN
En el citoplasma, el ARNm se mueve hacia los ribosomas. Los
aminoácidos que se necesitan están dispersos por el citoplasma.
 CODIGO GENETICO
 Estando demostrado que un gen es un segmento de ADN,
que define una proteína.
 Falta dilucidar como una secuencia de bases del ADN se
traduce en una secuencia de aminoácidos de una
proteína.
Consideraciones matemáticas:
 1 nucleótido = 1 aminoácido (habrían 4 aminoácidos)
 2 nucleótidos= 1 aminoácido (4^2 = 16 AA)
 3 nucleótidos = 1 AA. (4^3 = 64 AA posibles)
 Se aisló un mARN de 1200 nucleótidos y se vio que
producía la síntesis de 400 AA.
 1AA = 3 nucleótidos ( triplete o codón)
 Solo hay 20 AA.
 Sobran 44 tripletes.
 Se sintetizó con mRNA con solo UUU y dio Fen.
 Se sintetizan nuevos mARN
 EL CÓDIGO GENÉTICO
 Existen 20 aminoácidos diferentes y sólo 4 nucleótidos en el
mRNA. Se pueden construir 64 tripletes mediante combinaciones
con repetición de los 4 nucleótidos tomados de tres en tres. A
cada triplete se le llama CODÓN
 Es universal, pues lo utilizan casi todos los seres vivos conocidos.
Solo existen algunas excepciones en unos pocos tripletes en
bacterias.
 No es ambiguo, pues cada triplete tiene su propio significado
 Todos los tripletes tienen sentido, bien codifican un aminoácido
o bien indican terminación de lectura.
 Está degenerado, pues hay varios tripletes para un mismo
aminoácido, es decir hay codones sinónimos.
 Carece de solapamiento, es decir los tripletes no comparten
bases nitrogenadas.
 Es unidireccional, pues los tripletes se leen en el sentido 5´-3´.
 EL CÓDIGO GENÉTICO
Segundo Lugar en el Codón Alanina Ala A
T C A G Arginina Arg R
Asparagina Asn N
TTT Phe [F] TCT Ser [S] TAT Tyr [Y] TGT Cys [C] T
Aspártico Asp D
TTC Phe [F] TCC Ser [S] TAC Tyr [Y] TGC Cys [C] C
T Cisteina Cys C
TTA Leu [L] TCA Ser [S] TAA Ter [end] TGA Ter [end] A
Fenilalanina Phe F
TTG Leu [L] TCG Ser [S] TAG Ter [end] TGG Trp [W] G
P T Glicina Gly G
r CTT Leu [L] CCT Pro [P] CAT His [H] CGT Arg [R] T e Glutámico Glu E
i r
CTC Leu [L] CCC Pro [P] CAC His [H] CGC Arg [R] C Glutamina Gln Q
m C c
e CTA Leu [L] CCA Pro [P] CAA Gln [Q] CGA Arg [R] A e Histidina His H
r CTG Leu [L] CCG Pro [P] CAG Gln [Q] CGG Arg [R] G r Isoleucina Ile I
L ATT Ile [I] ACT Thr [T] AAT Asn [N] AGT Ser [S] T L
Leucina Leu L
u ATC Ile [I] ACC Thr [T] AAC Asn [N] AGC Ser [S] C u Lisina Lys K
g A g Metionina Met M
a ATA Ile [I] ACA Thr [T] AAA Lys [K] AGA Arg [R] A a
r ATG Met [M] ACG Thr [T] AAG Lys [K] AGG Arg [R] G r Prolina Pro P
Tirosina Tyr Y
GTT Val [V] GCT Ala [A] GAT Asp [D] GGT Gly [G] T Treonina Thr T
GTC Val [V] GCC Ala [A] GAC Asp [D] GGC Gly [G] C Triptófano Trp W
G
GTA Val [V] GCA Ala [A] GAA Glu [E] GGA Gly [G] A Serina Ser S
GTG Val [V] GCG Ala [A] GAG Glu [E] GGG Gly [G] G Valina Val V
CODIGO GENETICO
ARNm
tRNA: EL ADAPTADOR DE LA TRADUCCIÓN
3’ C Aminoácido
C
A
5’
Brazo aceptor

Brazo D
Brazo TC

Brazo extra

Brazo del anticodón

ANTICODÓN
EL RIBOSOMA: LA FÁBRICA DE PROTEÍNAS
Sitio P Sitio A

aa2

aa1 aa3
 PROCESO DE TRADUCCIÓN
Se sabe que el primer a.a. que se anexa a la cadena es la
METIONINA por su codón que es AUG (en células
eucarióticas).
PROCESO DE TRADUCCIÓN
LENGUAJES UNIVERSALES DE LA EXPRESIÓN GÉNICA

5’ATG CAA CAC CGT TGT CCC ACC AAA TGA3’

3’TAC GTT GTG GCA ACA GGG TGG TTT ACT5’

Transcripción

5’AUG CAA CAC CGU UGU CCC ACC AAA UGA3’

Traducción

NH2Met Gln His Arg Cys Pro Thr Lys STOPCOOH

La velocidad en la formación de polipéptidos varía en organismos
procariontes y eucariontes. En las bacterias se añaden 2 a.a. por
segundo; en células eucarióticas se añaden 20 a.a. por segundo por
lo que la síntesis de un polipéptido puede durar entre 20 y 60
segundos.