INGENIERIA DE

BIOPROCESOS
PROF. EVELYN GUTIÉRREZ OPPE
 BIOTECNOLOGIA

Usa o desarrolla métodos de manipulación directa genética para alcanzar

una meta deseable socialmente. Ejm: mejores plantas, semillas, terapia de
genes, degradación de residuos.
 BIOINGENIERÍA

Trabaja sobre sistemas médicos y agricultura.

• Ing. Biológica: enfatiza en plantas y animales
• Ing. Bioquímica: enfatiza en transformaciones químicas deseadas
• Ing. Biomédica: enfatiza en sistemas médicos
• Ing. De Bioprocesos: incluye trabajo de ingenieros mecánicos, eléctricos e industriales.
La fortaleza esta en el desarrollo de técnicas experimentales, probar hipótesis, diseño
de experimentos e interpretación de datos de sistemas complejos.
Base: microbiología, bioquímica y biología celular.
 HISTORIA DE LA PENICILINA
Desde 1939 el rendimiento pasó de 0.001 g/L a 50 g/L de
caldo de fermentación, motivado por la necesidad durante
la 2da Guerra Mundial. Se necesitó COMPRENDER:
- La fisiología del moho
- Las vías metabólicas
- La estructura de la penicilina
- Métodos de mutación y selección genética del moho
- Control de proceso
- Diseño de reactor
PROCESO DE PRODUCCIÓN DE LA
PENICILINA
 FUNDAMENTOS BIOLÓGICOS
• Los factores que condicionan la vida de un microorganismo son pH, temperatura,
humedad. Menor a 20ºC son psychrophiles, 20 a 50ªC son mesófilos, mayor a 50ªC
son termófilos.
• Algunos requieren oxígeno (aeróbicos) otros lo contrario (anaeróbicos), otros cambian
su vía metabólica para crecer bajo cualquier circunstancia.
• A menudos los organismos crecen sin ninguna fuente obvia de nutrientes. Ejm:
Cianobacterias convierten C02 a compuestos para la vida, N2 a NH3.
• Los organismos de estos ambientes extremos proporcionan herramientas importantes
para procesos de productos químicos y medicinales como: mantenimiento de ciclos
naturales, recuperación de metales de minerales de baja ley, desulfuración de
carbón u otros combustibles.
• Los organismos tienen una variedad de hábitats, tamaño y formas. Algunos cambian
de forma de acuerdo a su entorno.
 TAXONOMÍA DE LAS CÉLULAS

La taxonomía es dual. Primero, género,

grupo de especies relacionadas. Luego,
especie, organismos sustancialmente iguales.
Ejemplo:
Escherichia Coli o E. Coli
Además el tipo puede variar de un
laboratorio a otro, no es lo mismo E. Coli B/r
y E. ColiK12
DIVISION DE LAS CELULAS PRIMARIAS
Eubacterias

Procariotas

Arqueobacterias

Hongos (levaduras,
mohos)
Células primarias

Algas

Eucariotas Protozoos

Células animales

Células vegetales

Fuera de esta clasificación se encuentran los VIRUS

COMPARACIÓN DE PROCARIOTAS CON
EUCARIOTAS
SUBDIVISIÓN PRIMARIA DE
ORGANISMOS CELULARES
 VIRUS
CARACTERISTICAS
- Son muy pequeños: 30 a 200 nm
- Considerados parásitos obligados de otras células como
células bacterianas, levaduras, vegetales y animales.
- No capturan ni almacenan energía libre
- Inactivos, excepto cuando están dentro de las células
anfitrionas.
- Tienen ADN y ARN. Protegidos por una cápside y otros
por una capa de lipoproteína.
- Los virus devoran son bacteriófagos, mediante un ciclo
lítico o lisogénico.

APLICACIONES
- Modificando virus de animales se producen proteínas a
partir de ADN recombinante.
- Virus muertos o envolturas vacías se usan como vacuna.
CICLO DE UN BACTERIÓFAGO
 PROCARIOTAS
Características:
- Miden de 0.5 a 3 micrómetros
- Depende de la forma: coccus (Staphylococci), cilíndrico (E.coli), espiral
(Rhodospirillum)
- Crecen muy rápido, hasta en 1 ½ horas. Utilizan nutrientes como fuentes
de carbono, carbohidratos, hidrocarburos, proteínas y CO2.
- Se dividen en Eubacterias y arqueobacterias.
EUBACTERIA
• Se visualizan mediante fijación por calentamiento, colorante yodo, y etanol. Gram + -> moradas,
Gram - -> incoloras. Luego se tiñen con safranina. Gram + -> purpura, Gram - -> rojas.
 Gram – (Ejemplo: E. coli): rodeada de peptidoglucano, complejo con aminoácidos, la segunda membrana
contiene 50% proteína, 30% lípidos, 20% carbohidratos. Hay una membrana que la protege y se encarga
de transporte de alimentos,
 Gram + (Ejemplo: Bacillus subtilis): no tiene membrana externa, pero posee una capa gruesa y rígida con
múltiples capas de peptidoglicano,

• Otras ni gram + ni gram – como mycoplasma causan la neumonía atípica primaria, contaminan
medios utilizados industrialmente para el cultivo de células animales.

• Los actinomicetos parecidos a los mohos, no tienen membrana nuclear, proveen antibióticos. Algunos
de ellos poseen enzimas amilolíticas y celulolíticas son eficaces en la hidrólisis enzimática de
almidón y celulosa.

• Las cianobacterias utilizan la clorofila y el CO2 para convertirla en azucares, llamadas

bacterioclorofila.

• Las procariotas tienen ribosomas, algunas gránulos de almacenamiento, espora y volútinos.

• Las procariotas se protegen de altas temperaturas, radiación y productos químicos tóxicos

mediante las endosperas, una espora por célula de un mm.

• Ciertas bacterias tienen un revestimiento o una pared celular externa de polisacáridos o

polipéptidos.
ARQUEOBACTERIAS

1. No tienen peptidoglucano
2. Las secuencias de nucleótidos en el ARN ribosómico
son similares dentro de las arqueobacterias pero
diferentes de las eubacterias
3. La composición lipídica es muy diferente de las
eubacterias
Viven en ambientes extremos y poseen un inusual
metabolismo.
Por ejemplo las metanogeno producen metano a partir
de hidrogeno y CO2, las termoacidofilas (soportan altas
temperaturas y bajos pH), las halobacterias (soportan
altas concentraciones de sal).
Son fuentes importantes de proteínas activas
catalíticamente (enzimas) con nuevas propiedades.
 EUCARIOTAS
• Pertenecen hongos (levaduras, mohos), algas, protozoos, células animales y
vegetales. 5 a 10 veces mas grandes que las procariotas. Levaduras: 5 mm,
células animales (10 mm), plantas (20 mm).
• Pared celular: similar a las procariotas, además poseen esteroles que fortalecen
la estructura y la hacen menos flexibles, otras ricas en polisacáridos y celulosa
(algas). La pared celular posee fibras de celulosa incrustadas en pectina que
ofrecen resistencia. Las células animales solo poseen membrana citoplasmática,
son frágiles y sensibles a la fricción.
• El núcleo de las eucariotas tiene cromosomas, el nucléolo ribosomas.
• La división celular (asexual) consiste en la síntesis de ADN, división nuclear,
división celular y separación celular. La reproducción sexual tiene gametos, unión
de dos gametos es el cigoto. Los gametos son haploides tienen 23 cromosomas, y
los cigotos son diploides con 46 cromosomas.
HONGOS

Son heterótrofos, sus células son mas grandes que las bacterias, el núcleo y
las vacuolas se ven fácilmente.
Pertenecen levaduras y mohos.
 Levaduras
• Son de 5 a 10 mm, hay
circulares, cilíndricas y ovoides.
Se reproducen de forma sexual
y asexual (gemación o fisión)
• La mas usada es la
Sacharomyces Cerevisiae con la
cual se producen vino, cerveza,
whisky) o para producir
levadura de panadería.
REPRODUCCIÓN POR GEMACIÓN
 Mohos
• Tienen una estructura micelial. El micelio es un sistema de tubos
muy ramificados que contienen citoplasma y muchos nucleos.
Algunas ramas crecen en el aire y se forman esporas asexuadas
llamadas conidias que resisten calor, secado por congelación y
agentes quimicos.
• Los mohos crecen sobre superficies de nutrientes solidos y humedos.
• Se dividen en:
- Ficomicetos, parecidos a las algas, no poseen clorofila y no pueden
fotosintetizar, ejemplos: mohos acuáticos y terrestres.
- Ascomicetos; forman esporas sexuales. Ejemplo: neurospora y
aspergillius.
- Basidiomicetos, tienen basidiosperas llamados basidios. Ejemplo: Los
hongos de comer pertenecen a este grupo.
- Deuteromicetos, no son sexuales, Ejemplo: el hongo de pie, el
trichophyton.

Algunas aplicaciones son la obtención del acido cítrico por el

Aspergillius Niger, la penicilina por el Penicillium Chrysigenum). Las
fermentaciones de moho constituyen una gran parte de la industria de
la fermentación.
ALGAS

Organismos unicelulares, algunas multicelulares,

fotosintéticas y contienen cloroplastos de 10 a 30 mm,
algunas contienen sílice o CaCO3 en la pared celular.
Las diatomeas que contienen sílice se usan como filtros.
Las chlorella, scenedesmus, spirulina, dunaliella se usan
en tratamiento de aguas residuales produciendo
proteínas de células individuales. El agar y el acido
alginico se obtienen de algas marinas.
Algunas son marrones o rojas porque poseen otros
pigmentos
PROTOZOOS

• Ingieren bacterias u otras partículas de

alimentos.
• Los protozoos son unicelulares, se reproducen
por medios sexuales o asexuales.
• Se clasifican en función de su movimiento:
amebas, flagelates, ciliados.
• Causan enfermedades en humanos como
malaria, disentería, pero también pueden
eliminar bacterias del agua residual.
 CONSTRUCCION DE LAS CELULAS
• Las células vivas están compuestas de compuestos poliméricos de alto peso
molecular como proteínas, ácidos nucleicos, polisacáridos, lípidos y otros
materiales de almacenamiento (grasas, polihidroxibutirato, glucógeno).
• Además de estos biopolímeros, las células contienen otros metabolitos en
forma de sales inorgánicas (por ejemplo, NH+4, PO34, K+, Ca2+, Na+, SO24),
intermedios metabólicos (por ejemplo, piruvato, acetato) y vitaminas.
• La composición elemental de una célula bacteriana típica es 50% de
carbono, 20% de oxígeno, 14% de nitrógeno, 8% de hidrógeno, 3% de
fósforo y 1% de azufre, con pequeñas cantidades de K+, Ca2+, Na+, Mg2+,
Cl- y vitaminas.
 NIVELES DE COMPRENSION DE
SISTEMAS BIOLOGICOS
• Nivel molecular (biología molecular, bioquímica);
• Nivel celular (biología celular, microbiología);
• Nivel de población (microbiología, ecología); y
• Nivel de producción (ingeniería de bioprocesos).
 AMINOACIDOS Y PROTEINAS
• La secuencia de aminoácidos determina la estructura
primaria, secundaria o terciaria de la proteína por las
interacciones débiles de varios grupos laterales.
• Los dos mayores tipos son: proteínas fibrosas y
proteínas globulares.
• Según sus funciones son:
1. Proteínas estructurales: glicoproteínas, colágeno,
queratina
2. Proteínas catalíticas: enzimas
3. Proteínas de transporte: hemoglobina, albúmina
sérica
4. Proteínas reguladoras: hormonas (insulina, hormona
del crecimiento)
5. Proteínas protectoras: anticuerpos, trombina
ESTRUCTURA DE 21 AMINOÁCIDOS
 CARBOHIDRATOS: MONO Y
POLISACARIDOS
Los carbohidratos desempeñan papeles clave como compuestos
estructurales y de almacenamiento en las células. También
parecen jugar papeles críticos en la modulación de algunos
aspectos de la señalización química en animales y plantas. Los
carbohidratos están representados por la fórmula general
(CH2O) n, donde n ≥ 3, y se sintetizan a través de la fotosíntesis.
Los gases CO2 y H2O se convierten a través de la fotosíntesis en
azúcares en presencia de luz solar y luego se polimerizan para
producir polisacáridos, como celulosa o almidón. Los
monosacáridos son los carbohidratos más pequeños y contienen
de tres a nueve átomos de carbono. Los monosacáridos comunes
son aldehídos o cetonas.
Por ejemplo, la glucosa es una aldohexosa. La glucosa puede
estar presente en forma de una estructura lineal o de anillo. En
solución, D-glucosa está en forma de una estructura de anillo
(piranosa). La forma L juega un papel menor en los sistemas
biológicos.
Otros: Amilosa, amilopectina, glicógeno, celulosa
 LIPIDOS, GRASAS Y ESTEROIDES

Los lípidos son compuestos biológicos hidrófobos que son insolubles en agua, pero solubles en solventes no
polares tales como benceno, cloroformo y éter.
Presentes en las fases biológicas no acuosas, como las membranas plasmáticas. Las grasas son lípidos que
pueden servir como moléculas biológicas de almacenamiento de combustible.
Las lipoproteínas y los lipopolisacáridos son otros tipos de lípidos que aparecen en las membranas
biológicas de las células.
Las células pueden alterar la mezcla de lípidos en sus membranas para compensar (al menos
parcialmente) los cambios de temperatura o aumentar su tolerancia a la presencia de agentes químicos
como el etanol.
El componente principal en la mayoría de los lípidos son los ácidos grasos, que están formados por una
cadena lineal de grupos hidrocarbonados (hidrófobos), con un grupo carboxilo (hidrófilo) al final.
• n va de 12 a 20

• Las grasas son esteres de ácidos grasos y

glicerol
• Los esteroides naturales son hormonas que
son reguladores importantes del
desarrollo y metabolismo de los animales
en concentraciones muy bajas. Ejm:
colesterol, testosterona, progesterona
 ACIDOS NUCLEICOS, RNA, Y DNA

Los ácidos nucleicos desempeñan un papel

central en la reproducción de las células
vivas. El ácido desoxirribonucleico (ADN)
almacena y preserva la información
genética. El ácido ribonucleico (ARN) juega
un papel central en la síntesis de proteínas.
Tanto el ADN como el ARN son polímeros
grandes hechos de sus correspondientes
nucleótidos.
 CELULAS NUTRIENTES
• Todos los organismos, excepto los
virus, contienen grandes cantidades
de agua (alrededor del 80%).
• Alrededor del 50% del peso seco de
las células es proteína, y las proteínas
son en gran parte enzimas.
• El contenido de ácido nucleico de las
células varía del 10% al 20% del
peso seco. Sin embargo, los virus
pueden contener ácidos nucleicos
hasta en un 50% de su peso seco.
• El contenido de lípidos de la mayoría
de las células varía entre 5% y 15%
del peso seco.
La mayoría de los productos formados por organismos se producen como resultado de
su respuesta a las condiciones ambientales, como nutrientes, hormonas de crecimiento e
iones.
Los nutrientes requeridos por las células se pueden clasificar en dos categorías:
1. Se necesitan macronutrientes en concentraciones superiores a 10-4 M. El carbono,
el nitrógeno, el oxígeno, el hidrógeno, el azufre, el fósforo, el Mg2+ y el K+ son
macronutrientes principales.
2. Se necesitan micronutrientes en concentraciones de menos de 10-4 M. Los elementos
traza tales como Mo2+, Zn2+, Cu2+, Mn2+, Ca2+, Na+, vitaminas, hormonas de
crecimiento y precursores metabólicos son micronutrientes.
 MACRONUTRIENTES
CARBONO:
Los microorganismos se clasifican en dos categorías en función de su fuente de carbono:
(1) los heterótrofos utilizan compuestos orgánicos como carbohidratos, lípidos e hidrocarburos como fuente de carbono y energía.
(2) los autótrofos usan dióxido de carbono como fuente de carbono.

Los autótrofos facultativos normalmente crecen en condiciones autotróficas; sin embargo, pueden crecer en condiciones heterotróficas en
ausencia de CO2 y fuentes de energía inorgánica. Los quimioautótrofos utilizan CO2 como fuente de carbono y obtienen energía de la
oxidación de compuestos inorgánicos. Los fotoautótrofos usan CO2 como fuente de carbono y utilizan la luz como fuente de energía.

• Industrial: son la melaza (sacarosa), el almidón (glucosa, dextrina), el jarabe de maíz y el licor residual de sulfito (glucosa).
• Laboratorio: la glucosa, la sacarosa y la fructosa son las fuentes de carbono más comunes. El metanol, el etanol y el metano.

Fermentaciones aeróbicas, 50% del carbono a masa celular y 50% fuente de energía.
Fermentaciones anaeróbicas, menos del 30% a masa celular.

NITROGENO: son el amoníaco o las sales de amonio [NH4Cl, (NH4) 2SO4, NH4NO3], proteínas, péptidos y aminoácidos. El nitrógeno
se incorpora a la masa celular en forma de proteínas y ácidos nucleicos. Algunos organismos como azotobacter sp. y las cianobacterias
fijan nitrógeno de la atmósfera para formar amonio. La urea también puede ser utilizada como fuente de nitrógeno por algunos
organismos. Las fuentes de nitrógeno orgánico como el extracto de levadura y la peptona son costosas en comparación con las sales de
amonio.

OXÍGENO:
El oxígeno está presente en todos los componentes celulares orgánicos y en el agua celular y constituye aproximadamente el 20% del
peso seco de las células. Se requiere oxígeno molecular como aceptor de electrones terminal en el metabolismo aeróbico de los
compuestos de carbono. El oxígeno gaseoso se introduce en los medios de crecimiento burbujeando aire o mediante aireación de la
superficie
Hidrógeno (8% del peso seco de las células) se deriva principalmente de compuestos
de carbono. Algunas bacterias como los metanógenos pueden utilizar hidrógeno como
fuente de energía.
Fósforo (3% del peso seco de las células) está presente en los ácidos nucleicos y en la
pared celular de algunas bacterias Gram + tales como los ácidos teicoicos, sales de
fosfato inorgánicas y glicerofosfatos. El fósforo es un elemento clave en la regulación
del metabolismo celular.
Azufre (1% del peso seco de las células) está presente en las proteínas y algunas
coenzimas, sales de sulfato como (NH4) 2SO4, aminoácidos que contienen azufre.
Ciertos autótrofos utilizan S2 + y S0 como fuentes de energía.
Potasio es un cofactor de algunas enzimas y se requiere en el metabolismo de los
carbohidratos.
Magnesio es un cofactor de algunas enzimas y está presente en las paredes celulares
y las membranas.
 MICRONUTRIENTES
1. Los oligoelementos que más se necesitan son Fe, Zn y Mn. El hierro desempeña un papel regulador en algunos procesos de
fermentación (por ejemplo, se requiere deficiencia de hierro para la excreción de riboflavina por ashbya gosypii y la
concentración de hierro regula la producción de penicilina por penicillium chrysogenum). El zinc (zn) es un cofactor de algunas
enzimas y también regula algunas fermentaciones como la fermentación de la penicilina. El manganeso (Mn) también es un
cofactor enzimático y desempeña un papel en la regulación del metabolismo secundario y la excreción de metabolitos
primarios.

2. Los elementos de rastreo necesarios en condiciones de crecimiento específicas son Cu, Co, Mo, Ca, Na, Cl, Ni y Se. La
deficiencia de cobre estimula la producción de penicilina y ácido cítrico. El cobalto (Co) está presente en compuestos corrinoides
como la vitamina B12. El molibdeno (Mo) es un cofactor de la nitrato reductasa y la nitrogenasa y se requiere para el
crecimiento en NO3 y N2 como única fuente de nitrógeno. El calcio (Ca) es un cofactor de las amilasas y algunas proteasas y
también está presente en algunas esporas bacterianas y en las paredes celulares de algunas células, como las células
vegetales. El sodio es importante en el transporte de especies cargadas en células eucariotas. Cloruro (Cl-) es necesario para
algunas halobacterias y microbios marinos. El níquel (ni) como cofactor y se requiere selenio (Se) en el metabolismo del formiato
de algunos organismos.

3. Los elementos de trazado que raramente se requieren son B, Al, Si, Cr, V, Sn, Be, Ti, Ga, Ge, Br, Zr, Li. Estos elementos se
requieren en concentraciones de menos de 10-6 M y son tóxicos a altas concentraciones, como 10-4 M.

Algunas vitaminas comúnmente requeridas son la tiamina (B1), riboflavina (B2), piridoxina (B6), biotina, cianocobalamina (B12), ácido
fólico, ácido lipoico, ácido p-amino benzoico y vitamina K. Algunos ácidos grasos, como el ácido oleico y los esteroles, también son
necesarios en pequeñas cantidades. Las formas de vida más elevadas requieren hormonas para regular su metabolismo.
 MEDIOS DE CRECIMIENTO
• Medios definidos: contienen cantidades específicas de compuestos químicos puros con
composiciones químicas conocidas, ejemplo: contiene glucosa, (NH4) 2SO4, KH2PO4 y
MgCl2.
• Medios complejos: contienen compuestos naturales cuya composición química no se conoce
exactamente, ejemplo: extractos de levadura, peptona, melaza o licor de macerado de
maíz es un medio complejo.
DIFERENCIAS
 Rendimientos celulares: Un medio complejo por lo general puede proporcionar los factores de
crecimiento necesarios, vitaminas, hormonas y oligoelementos con rendimientos mas altos.
 Costo: los complejos son menos costosos que los medios definidos.
 Reproductibilidad: los medios definidos son más reproducibles y el operador tiene un mejor
control de la fermentación.
 Recuperación y purificación de producto: es más fácil y económica en medios definidos.