Universidad del Zulia

Facultad de Medicina
Escuela de Medicina - Ctedra de Bioqumica
Centro de Investigaciones Endocrino - Metablicas

ENZIMAS
BASES MOLECULARES DE SU
MECANISMO DE ACCIN

Dr. Valmore Bermdez Pirela, MD, MgSc, MPH, PhD

Algo de Historia sobre las Enzimas
 Queso, Pan y Vino
Que tienen en comn?

lustracin sobre el queso Escenas de elaboracin de Elaboracin del vino en el

en Tacuinum Sanitatis, pan en la Tumba de Antiguo Egipto. Tumba de
libro rabe del siglo XI que Ramss III. Valle de los Najt, en el Valle de los
describe los beneficios de Reyes. Egipto. nobles.
hierbas y alimentos
Aspectos histricos
Estudios de Ren-Antoine Ferchault de Raumur sobre la actividad de
los jugos digestivos
El fsico francs Ren-Antoine Ferchault de Raumur tena curiosidad
por lo que ocurra con los alimentos cuando descendan por el tubo
digestivo. Para saberlo, aliment a un cuervo con trozos de comida en
una cpsula de metal pinchada y cerrada. Como el ave excret una
cpsula vaca, Raumur se dio cuenta que el alimento en el tubo
digestivo no se procesa mecnicamente, sino que es disuelto por una
determinada sustancia.

Lzzaro Spallanzani Investig el proceso de digestin mediante

experimentos realizados en su propio cuerpo que casi le cuestan la
vida.
Basndose en los resultados obtenidos con animales, del francs
Raumur, Spallanzani ingiri esponjas y pequeas bolsitas de tela
rellenas de pan o carne. Al cabo de una horas vomit y analiz el
contenido del estmago: los alimentos se haban disgregado a pesar
de no haber estado en contacto con las paredes del estmago. dedujo
que la sustancia digestiva en la digestin era el jugo gstrico.
Utilizando el recogido por las esponjas, demostr que el alimento se
desintegra de la misma manera fuera del cuerpo.
 Qu es una enzima?
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Las enzimas son compuestos qumicos orgnicos

de naturaleza proteica que aceleran la velocidad
de una reaccin qumica termodinmicamente
posible.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

 Qu significa este concepto?
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Las enzimas aceleran la velocidad de una

reaccin qumica por que se comportan como
catalizadores orgnicos (biocatalizadores). La
catlisis es el proceso mediante el cual se acelera
la velocidad de una reaccin qumica.

Cuando se hace referencia a que la reaccin debe

ser termodinmicamente posible, se destaca el
hecho que en el sistema donde ocurre la reaccin
qumica existe suficiente energa til (energa de
activacin) para realizar el trabajo que implica
convertir el sustrato en producto.
Dr. Valmore Bermdez Pirela
 Qu es la termodinmica?
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

La termodinmica es la rama de la fsica que

estudia los fenmenos energticos y los
intercambios de energa entre la materia.

La termodinmica naci como consecuencia del

estudio de las mquinas de vapor, pero durante el
siglo 20 se observ que poda aplicarse a los
sistemas orgnicos.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

 Qu significa energa til suficiente
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

dentro del sistema para realizar un

trabajo?
Si dejamos caer una bola,
evidentemente ir hacia abajo sin
S Estado inicial ninguna ayuda. El trabajo en este
sistema, est representado por el
movimiento que hace la bola desde el
estado inicial (S) hasta el estado final
(P). Para realizar este trabajo, hace
falta cierta cantidad de energa til
dentro del sistema. Ntese que en ste
sistema hay suficiente energa til que
permite la caida de la bola.
La energa til en este sistema est
P Estado final representada por la energa gravitatoria
que ejerce una atraccin de la bola
hacia abajo.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN
Qu pasara si saliramos al espacio,
fuera de la atraccin gravitatoria de la
tierra?

S P

Estado inicial Estado final

Evidentemente, la bola no caera.No existe suficiente energa til en

el sistema en forma de energa gravitatoria para realizar el trabajo, es
decir, que la bola caiga hacia la tierra (la bola esta fuera del campo
gravitarorio de la tierra).

Dr. Valmore Bermdez Pirela

 Si hay suficiente
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN
sistema.
S Estado inicial
Caida espontnea
P Estado final
energa en el
Se dice que la reaccin acontecer de
forma espontnea.
Es decir, que S se convertir en P sin
ninguna otra ayuda que la energa til
del sistema.
Dr. Valmore Bermdez Pirela
 Consideremos ahora el caso inverso
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Habr energa suficiente en el sistema

Para que se realice el trabajo que se
S Estado final plantea en la grfica?
Es decir, que la bola suba
espontneamente hacia la mano?

Evidentemente, NO
No hay energa libre suficiente, en forma
de energa ANTI-gravitatoria para hacer
que la bola suba hasta la mano
espontneamente.
P Estado inicial Esto quiere decir, que esta reaccin en
este sistema, es una reaccin irreversible.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN En conclusin:
Una reaccin es termodinmicamente posible cuando
hay suficiente energa libre ( til) para realizarla.

Cuando la reaccin es termodinmicamente posible, est

implcito el hecho que esta reaccin ser espontnea.

Si en el sistema no hay suficiente energa til despus de

la conversin del sustrato a producto, la reaccin ser
irreversible.
S P
Si en el sistema hay suficiente energa til, la reaccin
puede ser reversible, es decir, que el producto puede
volverse a convertir en sustrato.
S P
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN Volvamos a la termodinmica:
Las leyes.
Primera ley de la termodinmica o ley de la
conservacin de la energa:

La energa no se crea ni se destruye solo se transforma

(de una forma de energa a otra)

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN Primera ley de la termodinmica o ley de la
conservacin de la energa:

La energa no se crea ni se destruye solo se transforma

(de una forma de energa a otra)

Esta ley presenta de forma implcita dos ideas:

1. Si la energa nunca se cre y no puede ni destruirse ni acabarse, se
deduce que la cantidad de energa total del universo es constante.
Esto quiere decir, que el contenido energtico del universo no ha
cambiado desde que fue creado (desde el Big Bang) hasta nuestros
das, esto es, desde hace unos 15.000.000.000 de aos.
2. A pesar que el contenido energtico del universo es constante, entre
un momento y otro acontecen transformaciones de una forma de
energa a otra. Para mantener estable la energa total, es de prever
que durante las transformaciones de una forma a otra de energa,
algunas aumentarn, lo que ser compensado con la disminucin
de otras formas de energa.
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN La energa no se crea ni se destruye(siempre ha sido y
ser la misma cantidad)
Esquemticamente este proceso puede representarse de la siguiente manera:

Obsrvese que la cantidad de energa total

en el universo antes y despus de mucho tiempo, es la misma

15.000.000.000 de aos

Contenido energtico Contenido energtico

total del universo total del universo
en el momento de en la actualidad
su creacin
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN Solo se transforma.en otras formas energticas
manteniendo el contenido total inalterable..
Esquemticamente este proceso puede representarse de la siguiente manera:

Obsrvese que la cantidad de energa total

en el universo antes y despus de mucho tiempo, es la misma

25 %
potencial

50 % 25 %
lumnica cintica
15.000.000.000 de aos
20 %
lumnica

50 % 20 %
calrica otras
20 %
calrica

Durante los primeros instantes En la actualidad la distribucin y tipos de

del universo, todo era luz y calor.. energa son diferentes ( y ms diversos) a
en esencia, solo energa calrica y lumnica las observadas al inicio de la creacin del
universo

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN
Segunda ley de la termodinmica.
La entropa de todos los procesos del universo (y del
universo mismo) tiende siempre a incrementarse hasta
alcanzar el equilibrio, el cual representa el estado de
mximo desorden.
Esto quiere decir que cualquier sistema dentro del universo, e incluso, todo el
universo tiende a desordenarse espontneamente, buscando as el equilibrio.
El desorden se va incrementando en la medida que la energa til (que se
encarga de mantener organizado un sistema) va disminuyendo.
La cada de la energa til, tal como lo expresa la primera ley de termodinmica
es seguida por el incremento de otras formas energticas que no son tiles
para realizar un trabajo determinado en el sistema.
Si consideramos que el sistema usa la energa til para mantenerse
organizado, la disminucin de sta ocasionar desorden..Cuando el
desorden sea mximo se habr establecido el equlibrio. Por lo tanto, los
sistemas orgnicos estn adaptados para mantener la energa til en niveles
ptimos para mantenerse ORGANIZADOS
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN Segunda ley de la termodinmica.
La lucha del orden contra el desorden(donde
inevitablemente siempre gana el desorden)

El orden, implica alto grado de energa tilpero esta energa se utiliza para
mantenernos organizados. De esta forma, como la energa til tiende a
disminuir cuando se realiza el trabajo llamado organizarnos debemos
producir todos los das ms energa til para reponer la invertida.

Y as, la vida de cualquier ser vivo transcurre en una lucha contra la segunda
ley de termodinmica..Nos alimentamos para extraer de los alimentos la
energa potencial presente en los enlaces qumicos y guiarla hacia los enlaces
de alta energa del ATP.

Luego, al hidrolizar los enlaces de alta energa del ATP se liberan cantidades
inmensas de energa libre que pueden utilizarse para realizar un trabajo,
representado por las innumerables reacciones qumicas que requieren esa
energa para poder llevarse a cabo.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN
Segunda ley de la termodinmica.
La lucha del orden contra el desorden(donde
inevitablemente siempre gana el desorden, que en
nosotros recibe el nombre de muerte)
Lamentablemente, despus de algn tiempo de luchar contra la segunda ley,
todos los seres vivos experimentan la llamada muerte.
Todas las clulas se desorganizan: las membranas se rompen, las
mitocondrias y otros organelos se disgregan y todo el contenido celular se
combina con el entornoLos lpidos se peroxidan, las protenas se
hidrolizan a sus aminocidos y los carbohidratos se oxidan.se establece un
equlibrio entre el interior de la clula y su exterior. Este hecho es
extremadamente anmalo, pues lo que abunda dentro de la clula usualmente
es escaso en el medio ambiente.
La salud implica alto grado de orden y un gran desequilibrio con el medio
externo.
La muerte implica un alto grado de desorden y un equilibrio perfecto con el
medio. Ya no existe suficiente energa libre para mantener un alto grado de
organizacin.
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN La vida y la muerte..Segn la termodinmica
Este proceso puede representarse esquemticamente de la siguiente manera:

Bajo alto
grado grado
de de
energa energa
no utilizable no utilizable

Niez 30 - 40
aos

60
aos

Alto 70 80
grado aos
de
energa
til Muerte

La vida, implica un alto grado de orden La muerte implica el desorden mximo. El

que solo puede lograrse con altas dosis
de energa til. Esta energa til debe
mantenerse estable en el tiempo. De esta
forma estamos adaptados para tener un
Metabolismo que genere altas cantidades
de energa til en forma de ATP.
individuo no puede transformar de forma
eficiente la energa que le ofrece Su entorno,
as que progresivamente acumula menos
energa til hasta un punto en el que no
puede mantenerse ordenado.
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN Bases termodinmicas del mecanismo de accin
de las enzimas

Para que un sustrato A se transforme en el producto B debe existir cierta

cantidad de energa libre (til) en el sistema que se pueda realizar este trabajo
qumico:

A B
Alta cantidad Baja cantidad
de energa de energa
libre libre

y todos los procesos qumicos transcurren desde un punto de alta energa libre
hasta uno de baja energa libre. Obsrvese como la flecha, que indica el
sentido de la reaccin, tiene un solo sentidoEsto es, que la reaccin es
irreversible. El compuesto B no puede tranformarse en el compuesto A porque
hay muy poca energa libre para realizar este trabajo.
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN
Bases termodinmicas del mecanismo de accin
de las enzimas
Ntese tambin que la conversin de A en B es un proceso espontneo,
debido a que la cantidad de energa libre es suficiente para realizar los
cambios qumicos que caracterizan la reaccin. Al final puede apreciarse una
cada en la energa libre. Como la energa libre no se pierde, es obvio que se
ha transformado en otras formas energticas, quiz potencial dentro de la
molcula B
A B
100 A
Alta cantidad
de energa
libre Baja cantidad
de energa
libre
0
No hace falta aadir calor al sistema, ni ninguna otra forma de energa
Pero el hecho de que ocurra la reaccin, no nos da informacin alguna de la
velocidad con la que sta acontece.
En los seres vivos es importante que muchas reacciones ocurran
adecuadamente..pero tambin es importante que ocurran rpidamente.
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN Cmo podemos aumentar la velocidad de una
reaccin qumica?
En lneas generales se puede aumentar la velocidad de la reaccin de dos
maneras:

1. Incrementando la cantidad de energa libre para realizar el trabajo, hecho

que incrementa la pendiente entre el estado inicial y el final. Esto puede
hacerse con calor.

A B
500 A

Incremento en Mayor velocidad

la cantidad por incremento de
de energa la pendiente (vase la pendiente
libre en la diapositiva anterior)

Baja cantidad
de energa
libre
0
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN Cmo podemos aumentar la velocidad de una
reaccin qumica?
En lneas generales se puede aumentar la velocidad de la reaccin de dos
maneras:

2. Manteniendo la cantidad de energa til constante, la nica manera de

aumentar la velocidad de la reaccin es utilizando de forma ms eficiente la
energa til del sistema. Esto puede hacerse gracias al uso de una ENZIMA

A B
100 A

ENZIMA
Alta cantidad Baja cantidad
de energa de energa
libre libre
0

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN Cmo una enzima puede optimizar el uso de la energa
libre en el sistema para as aumentar la velocidad de una
reaccin?.... Considere estos dos sistemas

Cantidad de Cantidad de
Energa til: 100 Kcal Energa til: 100 Kcal

A A
Sistema 1 Sistema 2

B B
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo
es la misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1
emplear menos energa que el individuo del sistema 2 para realizar el
trabajo.
Cantidad de Cantidad de
Energa til: 100 Kcal Energa til: 100 Kcal
Energa utilizada para realizar Energa utilizada para realizar
el trabajo: slo 10 Kcal. el trabajo: 100 Kcal

A A
Sistema 1 Sistema 2

B B
Dr. Valmore Bermdez Pirela
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo
es la misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1
emplear menos energa que el individuo del sistema 2 para realizar el
trabajo.
Cantidad de
Energa Energa til: 100 Kcal
til: 100 Kcal 100 Energa utilizada para realizar
Energa
utilizada: 100 Kcal
100 el trabajo: 100 Kcal

0
Total
A
Conclusin: solo se puede Sistema 2
Tirar una piedra con la
cantidad de energa
disponible

B
Dr. Valmore Bermdez Pirela
 En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo es la
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN
misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1 emplear menos
energa que el individuo del sistema 2 para realizar el trabajo.
Cantidad de
Energa til: 100 Kcal
Energa utilizada para realizar
el trabajo: 10 Kcal Energa
til: 100 Kcal 100
Energa
utilizada: 10 Kcal
10
A Total 90
Conclusin: se pueden tirar nueve piedras
ms con la cantidad de energa sobrante

La palanca en este sistema

es equivalente a la enzima
en un sistema qumico. Un
elemento que permite el
ahorro energtico y el uso
del excedente para realizar
B B B B
B B B B B
Ms trabajo

Sistema 1
Dr. Valmore Bermdez Pirela
 Cuales son las principales
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

caractersticas de una enzima?

1. Son compuestos termolbiles.

2. Son reciclables, por lo que..

3. Se necesitan en baja cantidad.

4. Su actividad, es decir, la velocidad de la

catlisis puede regularse.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

 Cuales son las principales
ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

caractersticas de una enzima?

5. Tienen una gran afinidad por un solo sustrato o

por un grupo de sustratos emparentados
estructuralmente.

6. Tienen una gran especificidad por un solo

sustrato o por un grupo de sustratos
emparentados estructuralmente.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

E+S

Complejo ES

E+P
Cual es la principal
caracterstica de las
enzimas?
 Indudablemente
La Regulabilidad de
su actividad
 Que es regulabilidad?
La velocidad de una reaccin catalizada
por una enzima puede incrementarse o
disminuirse gracias a:
Alteracin tridimensional del sitio cataltico
Aumentando o disminuyendo la cantidad de
enzima
 Regulacin de la catlisis
enzimtica
Disminucin/incremento
de la eficacia
Estos mecanismos implican el
cambio de la CONFORMACIN
TRIDIMENSIONAL del sitio
cataltico, haciendo que este
permita o no la entrada del
sustrato.
Son mecanismos de regulacin
RPIDA, porque operan sobre la
enzima que ya ha sido sintetizada
Aumento/disminucin
De la concentracin
Estos mecanismos implican el
aumento o la disminucin en la
velocidad de sntesis de una
enzima.
Son mecanismos de regulacin
LENTOS, ya que dependen de la
SNTESIS DE NUEVA PROTEINA:
ADN ARNm Ribosoma
Sntesis Proteica.
 Regulacin de la catlisis
enzimtica

Disminucin/incremento Aumento/disminucin
de la eficacia De la concentracin
Alosterismo Induccin y Represin
Modificacin Covalente
Feed Back Negativo
Zimgenos
Complejos
multienzimticos
Compartamentalizacin
 Alosterismo
Sitio cataltico Cambio
Con Conformacional 3D
Modulador conformacin 3D Favorable
Alostrico desfavorable Del sitio cataltico
Positivo

Enzima Enzima Enzima-sustrato

OFF ON
 Modificacin covalente

Sustrato Sustrato

Enzima Enzima
Off On
 +NH3 Sustrato

PO4
Enzima off
 Sustrato

+NH3
PO4
Enzima On
 Modificacin covalente
ATP ADP

PO4
Cinasa Cinasa
PO4

Sustrato Sustrato

Enzima Enzima
Sistema de
encendido

Sistema de
Apagado
 Feedback Negativo
Es un mecanismo de regulacin enzimtica en
la cual el PRODUCTO inhibe la actividad
enzimtica
Complejos multienzimticos
Complejos multienzimticos
Zimgenos
Alimento: Glucosa Lactosa
Alimento: Lactosa (Glucosa-Galactosa)
Glu Glu Gal

Permeasa

Glu Gal
Glu Beta-galactosidasa
Glu Gal
Degradacin

Degradacin
Energa
Energa

Opern Lac Inactivo Opern Lac Activo

(Repremido) (Inducido)
Induccin y represin, El opern Lac
Induccin y represin del Opern Lac en
Condiciones de glucosa abundante
Induccin del opern Lac en condiciones
De Abundancia de Lactosa
 Cintica enzimtica
Es la rama de la enzimologa que estudia la
velocidad de las reacciones catalizadas por las
enzimas as como los factores (externos) que
influyen sobre dicha velocidad

La velocidad de una reaccin es la cantidad de

sustrato transformado en producto por unidad
de tiempo
 Cintica enzimtica

Los factores MAS ESTUDIADOS que modifican la

velocidad de una reaccin catalizada por
enzimas son:
1. La concentracin de la Enzima
2. La temperatura
3. El pH
4. El aumento progresivo de la concentracin
del sustrato
5. La presencia o no de inhibidores
Cintica enzimtica: temperatura

Actividad
Mxima

Temperatura
ptima
Cintica enzimtica: Efecto del pH
 Cintica enzimtica:
Aumento de la concentracin del sustrato
Cintica enzimtica:
Presencia de inhibidores
Cintica enzimtica:
Presencia de inhibidores
Cintica enzimtica:
Presencia de inhibidores
cantinflear.
1. intr. Cuba y Mx. Hablar de forma
disparatada e incongruente y sin decir
nada.

Gracias por vuestra atencin