Patologia multifactoriala, epigenetica si mitocondriala
Clasificarea bolilor genetice Identificarea importantei factorilor genetici in etiologia bolilor umane a dus la clasificarea acestora in : I. Boli provocate exclusiv de factori de mediu, negenetice II.Boli multifactoriale III.Boli genetice (monogenice si cromozomiale, mitocondriale) si epigenetice Frecventa bolilor genetice Tip de afectiune Incidenta la Prevalenta la 25 Prevalenta in nastere/1000 ani/1000 populatia generala /1000
Boli cromozomiale 7 1,8 3,8
Boli monogenice 10 3,6 20
Boli multifactoriale ~50 ~50 ~600
Multifactorial 2 componente - genetica ( de regula poligenica) confera predispozitie/susceptibilitate catre o anumita afectiune - de mediu (interventia factorilor de mediu poate determina transformarea predispozitiei in boala
Interactiunea dintre genele implicate in stabilirea unui
caracter multifactorial se numeste EPISTAZIE Genes vs. Environment Percent Genetic Control 100
50
Eye Color Heart Disease Car Accident
Genes vs. Environment Percent Environmental Control 100
Fenotipul poligenic este determinat de expresia mai
multor gene (situate in loci diferiti) fiecare gena exercitand un efect aditiv (efectele genelor sunt cumulative), nu exista rapoarte de dominanta / recesivitate. Exemple de afectiuni multifactoriale : malformatii congenitale -Defecte de tub neural -Despicatura labiopalatina -Stenoza pilorica - Displazie congenitala de sold boli comune ale adultului -Astm -Schizofrenie -Diabet zaharat -Hipertensiunea arteriala -Boli cardiace comune -Obezitatea Heritabilitate Heritabilitatea unui caracter reprezinta proportia influentei factorilor genetici din determinantii caracterului respectiv Exemple Heritabilitate schizofrenie 85% astm 80% stenoza pilorica 75% BIC 65% HTAE 60% spina bifida 60% DZ 40% Obezitatea Afecteaza 5-15% din populatie, caracterizata prin cresterea masei de tesut adipos si un IMC (G/inaltime2)>30%. In aparitia obezitatii un rol major il are sistemul hipotalamus - leptina - melanocortina In formele comune de obezitate au fost identificate (prin studii genomice de tip GWAS - genome wide association study) peste 400 variante alelice a 127 gene implicate in producerea obezitatii. Dintre acestea 22 par a avea un rol important in etiologia afectiunii. Obezitatea Cele mai cunoscute gene implicate sunt gene care codifica pentru leptina, transportor de leptina, receptori de leptina, neuropeptidul Y, receptorul pentru melanocortina 4, ghrelina, gena FTO (fat mass and obesity, situata pe cromozomul 16q12.2, care controleaza expresia altor gene hipotalamice implicate in aportul alimentar). Cancer Etiologia bolii canceroase este multifactoriala, implicand factori de mediu/stil de viata (fumat, dieta, cancerigeni chimici, infectii virale etc) care produc mutatii somatice precum si factori genetici care determina predispozitia catre anumite forme de cancer. Peste 80% dintre formele de cancer se produc sporadic insa exista si o agregare familiala pentru anumite tipuri de cancer (de san, colon etc) in aceste familii riscul de recurenta fiind de 2-3 ori mai mare decat in populatia generala. Variante de gene implicate BRCA1, BRCA2, APC, AXIN2,TP53, STK11, PTEN, MLH, MSH2 etc Boala Alzheimer Cea mai frecventa forma de dementa la persoanele peste 70 de ani. Daca apare sub 60 de ani, reprezinta o forma precoce in care componenta genetica este forte importanta. 10% dintre forme au transmitere AD, 90% fiind multifactoriale. In familie creste riscul de recurenta daca exista 1 ruda de gradul 1 afectata. Boala Alzheimer Gene implicate : 2 care codifica pentru presenilina (PS1 si PS2) Mutatiile in PS1 si PS2 determina o clivare anormala a proteinei precursor beta amiloid, astfel incat amiloidul se depune la nivelul sistemului nervos APOE (codifica pentru apolipoproteina E, implicata in clearance-ul amiloidului din creier) APP, APOJ, MAPT (codifica pentru proteina Tau) Diabet Zaharat Reprezinta un grup heterogen de afectiuni caracterizate prin hiperglicemie cronica, afectand 6-7% din populatie. DZ are o etiologie complexa, multifactoriala implicand atat factori genetici cat si actiunea factorilor de mediu/ stil de viata. Mediu orice determina HTA, cresterea trigliceridelor, diabet gestational, consum de alcool/ grasimi, sedentarism, obezitate, varsta. 2 tipuri de DZ DZ tip 1 (insulino -dependent) - deficit complet de insulina, agregare familiala crescuta, avand astfel o componenta genetica certa - fiind identificati peste 20 de loci responsabil pentru predispozitie, dintre care 2 loci majori de susceptibilitate IDDM1 si IDDM2 DZ tip 2 (insulino-independent) afecteaza 11% din populatia tarilor dezvoltate este determinat de secretia inadecvata de insulina si de rezistenta la actiunea insulinei. Componenta genetica in DZ tip 2 este mai importanta decat in DZ tip 1. Exista forme rare, monogenice de DZ tip2 si forme multifactoriale. Gene implicate GCK(glucokinaza), HNF4A ( factor de transcriptie hepatica ce stimuleaza celulele beta pancreatice), PPAR- gamma, INS (gena pentru insulina) Malformatii congenitale afectiuni multifactoriale, avand in vedere agregarea familiala - Defecte de tub neural - Despicatura labiopalatina - Stenoza pilorica - Displazie congenitala de sold Defecte de tub neural sunt anomalii congenitale frecvente (1,5/1000 de nou nascuti). produse prin neinchiderea tubului neural in S3-S4 de gestatie. Cele mai frecvente forme sunt spina bifida (defect de fuziune al arcurilor vertebrale) si anencefalia (defect de inchidere al polului anterior al tubului neural). Majoritatea cazurilor sunt multifactoriale, un rol major avand deficitul matern de acid folic. Exista si alti teratogeni - anticonvulsivante, antimetaboliti, toxine diverse, obezitatea, diabetul matern in timpul sarcinii. Defecte de tub neural Despicaturile labiale si palatine
- Malformatii congenitale multifactoriale,
cu o incidenta de 1/700 nou nascuti. - Sunt produse in S4-S5 de gestatie prin defect de fuziune a mugurelui fronto-nazal cu mugurii maxilari. - Apar in numeroase sindroame monogenice, cromozomiale dar sunt determinate si de factori de mediu ca anticonvulsivante, vitamina A, alcool, fumat, nitrati etc). - Componenta genetica - mutatii in diferite gene ca TGF, MSX1, BMP4, IRF6 Patologia epigenetica epigenetica reprezinta studiul unor modificari potential ereditare in expresia genei FARA modificari in genotip (la nivelul ADN) Modificarile eigenetice sunt responsabile pentru multe dintre afectiunile umane (SPW, S.Angelman, cancere etc) Modificarile epigenetice pot fi influentate de varsta, mediu/stil de viata, boli etc Expunerea mamei la factori (dieta, toxine, hormoni etc.) implica expunerea concomitenta a trei generatii; modificarile epigenetice la nivelul gametilor mamei se vor transmite la fiica (prima generatie), iar fiica- prin celulele sale germinale primordiale, la a doua generatie. Memoria epigenetica se poate transmite pana la a patra generatie Sindromul Angelman
Este un sindrom genetic complex, care afecteaza primar
sistemul nervos. Are o incidenta de 1:20000 de nou- nascuti. A fost descris de pediatrul englez Henry Angelman, in 1965, observand cativa copii cu trasaturi asemanatoare. Initial a denumit afectiunea happy puppet syndrome inspirat fiind de o pictura a unui pictor italian Francesco Caroto Boy with a puppet Sindromul Angelman - manifestari clinice intarziere in dezvoltare dizabilitate intelectuala intarziere severa de limbaj ataxie crize convulsive microcefalie dismorfism facial caracteristic personalitate vesela,zambet frecvent (fara motiv), miscari repetitive, hiperactivitate, lipsa de atentie, fascinatie fata de apa. tulburari de somn Sindromul Angelman - modificari genetice 1.Mutatii in gena UBE3A. In mod normal, in anumite regiuni ale sistemului nervos, este activa doar copia materna a genei (imprinting) in 11% dintre cazuri 2.Deletii ale unui fragment de pe cromozomul 15 matern - 70% dintre cazuri 3.Disomie uniparentala - mostenirea ambilor cromozomi 15 de la tata Cele mai multe cazuri sunt de novo. Sindromul Prader - Willi Este un sindromgenetic determinat de absenta copiilor paterne ale genelor din regiunea amprentata (imprinting) 15q11.2-q13. Are o incidenta medie de 1: 20000 de nou nascuti. Sindrom Prader - Willi hipotonia este semnul clinic major in perioada prenatala si neonatala insa diminua ulterior ca severitate. dupa varsta de 1 an apare hiperfagia si cresterea rapida in greutate cu obezitate de tip central. statura mica acromicrie (maini si picioare mici) dificultati de invatare retard mental moderat cu tulburari comportamentale hipogonadism (hipoplazie genitala, deficit de sexualizare secundara postpubertar) Criterii majore de diagnostic SPW hipotonie neonatala si infantila dificultati de alimentare in perioada de sugar crestere rapida si excesiva a greutatii intre 1-6 ani dismorfism facial hipogonadism retard global al dezvoltarii hiperfagie Genetica in SPW
in regiunea amprentata de pe cromozomul 15 unele gene au
functionala doar copia prezenta de la tata. 70% dintre cazurile de SPW apar prin deletia unui segment de pe cromozomul 15 patern (copiile de pe cromozomul matern sunt inactive). 25% dintre cazuri au disomie uniparentala (ambii cromozomi 15 sunt de la mama) Trasaturile clinice ale SPW apar ca rezultat al pierderii functiei unor gene de pe cromozomul 15- unele dintre ele codificand pentru molecule mici de snoARN (small nucleolar ARN)- cu rol in reglarea expresiei altor gene. Cele mai multe cazuri apar de novo Sindrom Beckwith - Wiedemann Sindrom genetic caracterizat prin crestere exagerata, copiii cu SBW fiind macrosomi la nastere, pastrand o inaltime mai mare decat media pe toata perioada copilariei. Incidenta 1:13 700 Clinic Cresterea exagerata tinde ssa incetineasca in jurul varstei de 8 ani, astfel incat adultii cu Beckwith - Wiedemann nu sunt, de regula mai inalti decat media. Uneori se remarca o hemihipertrofie/ hemihiperplazie care devine mai putin aparenta pe masura ce inainteaza in varsta. Alte semne clinice: omfalocel, hernie ombilicala,macroglosie (care afecteaza respiratia, inghititul sau vorbitul) visceromegalie,hipoglicemie in copilarie, anomalii renale Complicatii - risc de dezvoltare a unor tumori maligne sau benigne, in mod particular tumora Wilms si hepatoblastom. Tumorile apar in copilarie la aproximativ 10% dintre cazurile de SBW. Speranta de viata e normala Anomalii de metilare (proces prin care se marcheaza copia materna sau paterna a unei gene in timpul gametogenezei). Se asociaza cu modificari in regiunea ADN a cromozomului 11 numita centru de imprinting (ICs) - care controleaza metilarea unor gene implicate in controlul cresterii - CDKN1C, H19, IGF2, KCNQ1OT1. Anomaliile de metilare ale acestor gene duc la cresterea exagerata caracteristica SBW. Sindromul Beckwith- Wiedemann - genetica 20% dintre cazurile de SBW sunt determinate de disomii uniparentale (UPD) - care apare precoce in dezvoltarea embrionara si afecteaza doar o parte dintre celule (mozaicism). Mai rar, SBW poate fi deterrminat de mutatii in gena CDKN1C. 1% dintre pacienti au rearanjamente cromozomiale (translocatii, duplicatii, deletii) care implica material genetic de pe cromozomul 11 producand modificari in reglarea genelor din regiunea specifica. 85% dintre cazuri sunt de novo si unice in familie. Parintii unui copil cu SBW au risc de recurenta in functie de cauza genetica care a dus la aparitia fenotipului BW. Sindrom Rubinstein - Taybi Este un sindrom genetic caracterizat prin statura mica, intarziere intelectuala moderata/ severa, dismorfism facial caracteristic, police si haluce latite. Incidenta 1:100000 Manifestari clinice aditionale - anomalii oculare, defecte cardiace si renale, anomalii ale dentitiei, obezitate. Pacientii au risc de a dezvolta tumori maligne sau benigne (in special tumori cerebrale) si leucemii. Mai rar, prezinta retard de crestere si infectii severe. Sindromul Rubinstein - Taybi Manifestarile fenotipice sunt determinate de mutatii in gena CREBBP care este implicata in controlul transcriptiei altor gene si care este esentiala in timpul dezvoltarii embrionare si fetale. Un procent mai mic de cazuri este dat de mutatii in gena EP300 iar unele forme severe pot fi rezultatul unei deletii de pe bratul scurt al cromozomului 16. Un procent de ~ 50% dintre cazuri ramane cu etiologie neprecizata. Sindromul Rett Este un sindrom genetic cu evolutie progresiva care afecteaza primar dezvoltarea neurologica, afecteaza predominant fetele. Incidenta 1:8500 - 1:10000 de fete. Clinic Dezvoltarea psihomotorie este normala in primele 18 luni de viata, urmata de o scurta perioada de stagnare (I) apoi regresie rapida in limbaj si dezvoltarea motorie (II). Faza a III a este pseudostationara (ani, zeci de ani ca durata) si ultima faza IV - deteriorare motorie tardiva. In timpul fazei de regresie apar miscari repetitive, stereotipe ale mainii, inlocuind miscarile utile. Alte manifestari : plans necontrolat, tulburari din spectru autist, bruxism, apnee/hiperpnee, ataxie, tremor, microcefalie dobandita. Sindromul Rett Manifestarile fenotipice sunt determinate de mutatii in gena MECP2 (aflata pe cromozomul Xq28), care codifica pentru proteina MeCP2 cu rol critic in functionarea normala a creierului- mentinerea sinapselor interneuronale. MeCp2 pare sa inhibe activitatea unor gene care nu sunt necesare in celulele neuronale. Cele mai multe cazuri de sindrom Rett sunt de novo. Transmiterea este X linkata dominanta. Atunci cand se diagnosticheaza un copil cu sindrom Rett, mama trebuie testata pentru a identifica statusul de purtator asimptomatic Riscul de recurenta este foarte mic sindromul Silver - Russell Este un sindrom genetic caracterizat printr-o tulburare de crestere - retard de crestere cu debut prenatal. Incidenta: 1:100.000 Copiii afectati au greutate mica la nastere si falimentul cresterii in evolutia ulterioara. Alte manifestari : apetit modificat, hipoglicemie, dificultati de alimentatie, statura mica Adultii cu sindrom Silver - Russell au inaltime mica (barbatii ~ 150 cm si femeile ~140 cm). Dismorfism facial caracteristic : facies mic, triunghiular, frunte proeminenta, comisurile bucale orientate in jos si in afara. Alte semne : clinodactilie, asimetrie corporala, anomalii ale sistemului digestiv. Sindrom Silver- Russell - genetica
Cauzele genetice ale sindromului Silver - Russell sunt complexe, cele
mai multe fiind modificari ale genelor care controleaza cresterea. Gene implicate in aparitia fenotipului Silver - Russell au fost gasite pe cromozomul 7 si 11, gene care sunt cu imprinting genetic prin metilare in timpul gametogenezei, in 1/3 dintre cazurile de SSR. Genele H19 si IGF2 - pe cromozomul 11 si disomie uniparentala a cromozomului 7 in 7-10% dintre cazurile de Silver - Russell. In 40 % cauza este necunoscuta. Cele mai multe cazuri sunt sporadice, insa in unele familiii este recurent, avand pattern de transmitere A.D si A.R. Epigenetica cancerului Mecanismele epigenetice Modificarile epigenetice au actioneaza prin rol atat cauzativ in cancer accesibilizarea regiunilor cat si implicatii terapeutice. cromatinice pentru Au fost dezvoltate molecule reglatorii transcriptionali. care actioneaza tintit asupra Metilarea ADN, modificarea reglatorilor cromatinei, 3 histonelor, remodelarea dintre ele (tintind DNMTs, nucleosomilor si HDACs si JAK2) au primit moleculele de ARN aprobarea FDA. netranslatat care regleaza numeroase procese biologice fundamentale pentru oncogeneza. Modificari epigenetice in cancer Metilarea reziduurilor Metilarea insulelor CpG are citozinice din dinucleotidele un rol important in reglarea CpG este cea mai cunoscuta transcriptionala si este modificare a cromatinei. alterata in timpul procesului Hipometilarea globala este de transformare maligna. comun observata in celulele Hipermetilarea maligne, cea mai studiata promotorilor genelor modificare epigenetica in influenteaza nu doar cancer este metilarea care expresia genelor respective apare la nivelul insulelor ci si expresia a variate tipuri CpG (prezente la 60-70% de ARN noncodant cu rol in dintre promotorii genelor transformarea maligna. umane). Modificari histonice in cancere Histonele care intra in Exista interactiuni intre aparatul de componenta nucleozomului metilare a ADN si enzimele implicate in contin un domeniu C- terminal si modificarea histonelor, evidentiind un capat N- terminal. astfel complexitatea reglarii Acest capat N - terminal poate epigenetice a activitatii genice care suferi numeroase determina si mentin identitatea modificari(metilare, acetilare, celulara si functiile acestora. ubiquitinare, sumoilare, Metilarea ADN care determina fosforilare etc), modificari ce silentierea genelor supresor tumoral in regleaza ciclul celular, cancer implica modificari specifice in transcriptia, replicarea, procese de reparare. pozitionarea nucleozomilor. Spre deosebire de metilarea Reactivarea acestor gene silentiate in ADN, modificarile histonice pot mod aberant in cancere prin folosirea produce activarea sau unor inhibitori de ADN metil reprimarea expresiei genice in transferaza se insoteste de eliberarea functie de tipul modificarii si de zonelor promotor din nucleozom. reziduul modificat. Modificari ale miARN in cancer miARN regleaza activitatea genelor Multe tipuri de miARN care au ca implicate in controlul transcriptional, tinta gene care stimuleaza cresterea proliferarea celulara si apoptoza. si proliferarea celulara au expresie miARN poate functiona atat ca scazuta in cancere. supresor tumoral cat si ca oncogena, De exemplu, miARN-15 si 16, care depinzand de gena a carei activitate au ca tinta gena BCL2, cu rol o regleaza. antiapoptotic, au expresie scazuta in leucemia limfatica cronica, in timp Modificarile in expresia miARN pot miARN let7 care are ca tinta aparea prin mecanisme diverse oncogena RAS este reprimat in precum anomalii cromozomiale, cancerul pulmonar. anomalii ale factorilor de transcriptie etc Avand in vedere ca inhibarea miARN cu functie de represor tumoral este reversibila- aceste tipuri de miARN pot fi tinta unor agenti terapeutici specifici. Terapia epigenetica in cancer urmareste restaurarea epigenomului normal. Au fost descoperite numeroase terapii epigenetice care pot modifica metilarea ADN si alterarilor histonelor aparute in cancer. Inhibitorii metilarii ADN au fost primii propusi Acesti analogi nucleotidici se incorporeaza in catena ADN a celulelor tumorale cu inmultire rapida si blocheaza metilarea. Terapia epigenetica in cancer Determina astfel inhibarea cresterii si proliferarii celulare tumorale prin activarea genelor supresor tumoral (aberant silentiate in cancer). Aceasta silentiere aberanta se asociaza concomitent cu dezacetilarea histonelor. Restabilirea pattern-ului normal de acetilare prin tratament cu inhibitori ai dezacetilazelor - are efect antitumorigen prin blocarea cresterii si proliferarii celulare, declansarea apoptozei. Au fost introduse molecule de miARN de sinteza cu efect de supresor tumoral care duc la represia selectiva a unor oncogene in anumite tipuri tumorale. Patologia mitocondriala
Pentru confectionarea unei mitocondrii sunt necesare
aproximativ 300 gene ADN mitocondrial contine doar 37 dintre acestea, restul fiind continute in ADN nuclear, proteinele rezultate fiind transportate catre mitocondrii. Doar 3% (100 din 3000) dintre genele care codifica pentru mitocondrii sunt responsabile pentru producerea de ATP (energie), restul fiind implicate in alte functii celulare dependente de specializarea celulei in care se afla. Patologia mitocondriala Bolile mitocondriale sunt rezultatul unor mutatii spontane sau dobandite din ADNmt sau ADN nuclear care determina alterarea diferitelor functii mitocondriale in diferite tesuturi (apar astfel sute de boli diferite ca si manifestari clinice). Fiecare afectiune determina un spectru de manifestari clinice extrem de heterogene. O caracteristica a bolilor mitocondriale este aceea ca mutatii identice in ADNmt pot sa produca manifestari diferite. Patologia mitocondriala Genocopiile sunt afectiuni care sunt determinate de aceeasi mutatie dar sunt diferite din punct de vedere al manifestarilor fenotipice.
Fenocopiile - diferite mutatii in ADNmt pot duce la
manifestari clinice similare.
Bolile mitocondriale au o incidenta cumulata de 1:4000 de
indivizi. Patologia mitocondriala - manifestari clinice crestere deficitara intarziere in dezvoltare slabiciune musculara tulburari de invatare tulburari neurologice afectare multiorganica crize convulsive (ficat, rinichi, cord etc) tulburari din spectru diabet zaharat autist risc crescut de infectii tulburari vizuale, auditive disfunctii tiroidiene Bolile mitocondriale Bolile mitocondriale sunt determinate de mutatii in ADNmt sau ADN nuclear. Mutatiile in ADN nuclear pot fi transmise in maniera autozomal dominanta sau recesiva, in timp ce mutatiile mitocondriale se transmit exclusiv pe cale materna Diagnosticul bolilor mitocondriale se realizeaza prin : examen fizic istoric familial (mod de transmitere) teste biochimice si histologice (biopsii musculare) teste moleculare pentru identificarea mutatiilor Exemple boli mitocondriale Sindromul Leigh - Sindromul MERRF - caracterizat prin anomalii caracterizat prin mioclonus, structurale cerebrale, crize convulsive, ataxie cerebelare si la nivelul cerebelara, miopatie, ganglionilor bazali atrofie optica, surditate simetrice, bilaterale ; nivel bilaterala, neuropatie de acid lactic crescut; periferica poate fi cauzat de mutatii Este determinat de mutatii NARP, mutatii care in genele mitocondriale MT- determina deficit de TK (in peste 80% dintre complex 1, deficit de cazuri), MT-TL1, MT-TH, citocrom oxidaza, deficit de MT-TS1. piruvat dehidrogenaza