Soil organisms are involved in

nearly every aspect of soil

quality
Structure/Aggregation

Organic
matter

Humification
Soil
Community

Nitrate
Leaching

Decomposition
Nutrient cycling

Inordertounderstandhowbiology
affectsoursoilsweneedto
understandalittleaboutthe
organismswholivethere

QuickTime and a
TIFF (LZW) decompressor
are needed to see this picture.

ORGANISMETANAH

FAUNAFLORA

MAKROMIKROMIKRO

SERANGGANEMATODABAKTERI
RAYAPROFIFERAAKTINOMISETES
BEKICOTPROTOZOACENDAWAN
CACINGGANGGANG/ALGAE

Soilisahabitat

Soil particles

Plant roots

Water

Soilisalive
Forexample,in1gofsoil:
>100,000,000bacterialcells
>11,000speciesofbacteria
Alsofungiandlargeranimals

POPULASI (M O) DALAM TANAH YANG SUBUR

Flora dan Fauna Mikro
Bakteri
Aktinimesetes
Cendawan
Ganggang
Protozoa (mikro fauna)

Juta/gram
1 100
0,1 1
0,01 1
0,01 0,1
0,01 0.1

Fauna Tanah
Cacing tanah
gastropoda
Kaki Seribu (melipede)
Kaki Seratus (centipede)
Kutu (mite)

Juta/ha
1,8
1,0
1,8
0,8
44,1

Whosthere?

Macrofauna:
SoilEngineers

Pseudoscorpion

Soil Animals
Termite

Earthworm

Centipede

Snail
Vole

Soilanimalsareimportantfor
1. Decomposition
(shreddingresidues)
2. Mixingsoil(aeration)

Decomposition rate of blue grama (Bouteloua gracilis)

Whosthere?
Mesofauna:
Soilpredators,
pathogens,
herbivores

Soilmesofauna

Nematodes

Mites

Protozoa

QuickTime and a
TIFF (LZW) decompressor
are needed to see this picture.

Soilmesofauna

Nematodes

Soilmesofaunaareimportantfor
1. Residuedecomposition
1. Predation

Protozoa

1. Pathogenesis

QuickTime and a
TIFF (LZW) decompressor
are needed to see this picture.

Mites

Microorganisms:
Soilprocess
controllers

Soilmicroorganisms
Fungi

Bacteria

Fungi

Fungi
Filamentousgrowth
QuickTime and a
TIFF (LZW) decompres sor
are needed to see this picture.

Whataretheadvantagesof
filamentoushabit?

Fungi
Filamentousgrowth
Functionallycritical!
Wooddegrading
Mycorrhizalassociation
myco(fungus)+
rhiza(root)
(Symbioticstructure
formedbyafungus
plusaplant)

QuickTime and a
TIFF (LZW) decompress or
are needed to see this picture.

Rootswithoutmycorrhizae

Source: Harrison et al 1999

Rootswithmycorrhizae
Source: Harrison et al 1999

Bacteria
Small,singlecelled
~2m

Whatistheimportanceofsmallsize?

Bacteria
Small,singlecelled
Abundant
Conventional
tillage

Prairie

Bacteria
Notill

Fungi
Forest

Bacteria
Small,singlecelled
Abundant
Diverse
taxonomicallyand
functionally!

Diversityinsoilisimportantfor
nitrogencycling.

Relationshiptosoilquality?

Diversitymaybeimportantinresponsetomanagement

PorosityandPermeability
Theavailabilityofwaterinasoiliscriticalfor
agriculture.Withoutit,nothinggrows.
Therearemanywaystomeasurehowsoils
interactwithwater.
Porositymeasureshowmuchspacethereis
betweensoilparticlesforwaterandair.
Permeabilitymeasureshoweasilywaterflows
downwardthroughasoiltoreachplantroots.
Waterholdingcapacitymeasureshowmuchwater
isretainedinsoilafteritdrains.

PERANANORGANISMETANAH(Dalamtanah)

MIKROFLORA
A.BAKTERI

Palingbanyakdijumpaidalamtanah,sifatHeterotrofatauautotrof,panjang13umdengandiameter0,51um.
*).Heterotrop(contoh:Arthrobakter)
MenggunakanBOsebagaisumberenergi(populasimeningkatdenganpenambahanBO),adayangaerobdan
anaerob,suhuoptimum20oC,pH7(410),memerlukanharaanorganik.
*).Autotropik(contoh:Nitrosomonas,Nitrobakter)
MenggunakanCO2sebagaisumberenergidanmengoksidasisenyawaanorganik.

Beberapakelompokbakterilain:
^Streptomyces:penghasilantibiotik(streptomycin),anticendawan,
antivirus
^Pseudomonas:beberapaspesies,sebagaipenyebabpenyakit
^Bacillus:FiksasiN
PERANAN:
Dekomposisibahanorganic(BO)
FiksasiNnonsimbiotik(Azotobacter,Clostridium,Bacillus)
FiksasiNsimbiotik(Rhizobium)
Nitrifikasi(Nitrosomonas,Nitrobakter)
OksidasiSulfur(Thiobacillus)
Patogentanaman(PseudomonaspenyakitAkarlunak)

B.Actinomycetes
Kebanyakanaerob,pH5ataulebih,sebagianbesarpsichrophiles,kebutuhanNrendah.
PERANAN:
Perombakanbahanorganik(ppkkandang,sisatanaman)
Pembentukanhumus,penghancurselulosa
C.Fungi
Banyakdidekatpermukaan,Heterotrop,aerob,toleranterhadapgenangan,toleranterhadapkemasaman/pH
rendah.

PERANAN:Penghancurselulosadanlignin

D.Algae

Adadipermukaan,mengandungkhlorofil,Autotrop,toleranterhadapkemasamandangenangan.

PERANAN:
Pentingdalamkolonisasi,membantuprosespembentukantanah
PenambatN2padapadisawah(contoh:Nostoc,Anabaena)

E.KelompokGANGGANGtanah
G.hijau(Chlorophyta).Contoh:Chlorella
G.hijaubiru(CyanophytadanCyanobakteria)
Diatoms(Bacillariophyta)
G.hijaukuning(Xanthophyta)
PERANAN:Urutankepentinganperanannyadalamtanah:
G.hijau>Diatomae>G.hijaubiru>G.hijaukuning

MAKROFAUNA

A.Oligochaete(Contoh:Cacingtanah,hiduppadapHsekitar7)

PERANAN:DekomposisiBO(melumatkandanmencampursisatanaman),aerasitanah,
penetrasitanah,agegasitanah

B.Molusca(contoh:Siput,jumlahnyasangatkecil)

PERANAN:Mempunyaienzimselulase(>>>),merusakdaun

C.Nematoada(contoh:Cacingtidakbersegmen,panjang+/1mm,diameter<50um),aerob
oblogat,hiduppadatanahkasardanlembab)Pemakan:protoplasmatanaman,ganggang,dan
mikrobiaheterotrof.
PERANAN:Kurangpentingdalampembentukanhumus.

D.Arthropoda(Kakiseribu/millipededankakiseratus/centipede)
Saprofit(pemakantanamandanfaunayangmati),jumlahnyadalamtanah

sedikit.

DEKOMPOSISI/MINERALISASI

Perubahansenyawaorganikmenjadisenyawaanorganiksederhana.
DekomposisiNOrganik:
Aminisasi:Perubahanproteinmenjadiamine
Proteinpeptideasamamino.
Mikrobiayangberperan:Bakteriheterotrof.

Amonifikasi:Perubahanas,aminodanaminemenjadiamonium
H
RCCOOHRCOOH+CO 2+NH4+

NH2H2O
Mikrobiayangberperan:Bakteriheterotrof.
Faktor2yangmempengaruhiamonifikasi:
Suhu,populasimikororganisme,BO,air,Aerasi,pH,pengolahantanah.
NH4+yangterbentuk,akanmengalamiproses:
1).Diseraptanaman,2).Dimakanbakteriuntukdekomposisi,
3).Diubahmenjadinitritdannitrat,4).Dijerapolehmineral2:1

Nitrifikasi:Perubahanamoniummenjadinitrat.
Nitritasi:amoniummenjadinitrit
2NH4++3O22NO 2+4H++2H2O
nitrosomonas
Nitratasi:Perubahannitritmenjadinitrat
2NO2+O22NO 3+E
nitrobakter
Faktor2yangmempengaruhi:PersediaanO2.,populasiorganisme.,pH.,suhu.,kelembaban.

Perananlaindarimikroorganisme.

1.Denitrifikasi:Perubahannitratnitrogenoksida(N2O)N2Padatanahtergenang,
prosesanaerob.

2.FiksasiN
a.Nonsimbiotik=pengikatanbebas,organismetanahmemperolehNdariudaradan
menggunakanBOsebagaisumberenergi.
Azofikasi;pengikatanNdariudaraolehAzotobacter.

b.Simbiotik=simbiosisantaramikroorganismedanlegume
FiksasiNmelaluibintilakarlegumolehbakteriRhizobium

3.Pelarutsenyawa2FosfatyangtidaklarutolehBakteriPelarutFosfat.

4.Penhasilmetabolit
Zatpengaturtumbuh(ZPT)antarlain:Gibberilin,Auxin.

5.Dekomposisi/PerombakanBahanOrganik

Tahap-tahap Mineralisasi
1. Aminisasi
Mikroirganisme heterotrop (perlu senyawa C organk)
2. Amonifikasi
3. Nitrifikasi bakteri autotrop
Energi < oksidasi garam anorganik
C < CO2 atmosfer
Aminisasi
Fungsi dari aktif organik heterotrop
Perubahan protein asam amino & amine
Mikroorganisme heterotrop (bakteri pH netral, fungi pH masam)
Amonifikasi
perubahan asam amino/amine amonium
mikroorganisme heterotrop
- bakteri, fungi, aktinomicetes
- aerob, anaerob

Jenis-jenis bakteri fiksasi N

Mikrooganisme

Sifat

Penggunaan

Azotobacter

Aerab, hidup bebas dalam Hormon pada akar &

tanah air, rhizosfer,
pertumbuhan tanaman
permukaan daun

Azospirillum

Mikroaerob,
bebas/asosiasi dengan
akar rumput

Hormon pada akar &

pertumbuhan tanaman,
meningkatkan hasil rumput

Rhizobium

Simbiosis legum

Inokulasi dapat
menguntungkan tanaman
legum

Actinomicetes

Simbiosis non legum

Produksi kayu

Blue-green algae Hidup di air/daratan,

mengandung klorofil

Meningkatkan padi tanah

sawah

Blue-green Algae Anabaena azolla

Azolla

Perlu air, cahaya, N2, CO2, garam dengan

hara mineral banyak pada padi sawah

simbiosis
Pupuk
hijau