SINTESIS DE PROTEINAS

EUCARIONTES
CONTROL NEGATIVO

DEGRADACIÓN POR MEDIO

DEL PROTEASOMA
 UBIQUITINA
• ETIQUETA PARA
DEGRADACIÓN:
UBIQUITINA
• Ub es una proteína
pequeña compuesta por
76 aminoácidos.
• Se ha encontrado sólo en •Ub es una proteína
eucariontes estable cuya estructura
• Es altamente conservada
(su secuencia de secundaria es globular
aminoácidos no cambia •Se puede encontrar
mucho entre distintos
organismos) en toda la célula y
puede estar de manera
libre o unida a
proteínas
ETIQUETADO (“kiss of death”)

http://nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/2004/animation.html

•Ocurre en el citosol
•Es ATP dependiente
•La ubiquitina se liga a la terminal C de las proteínas
blanco específicamente mediante enlaces covalentes
ENZIMAS INVOLUCRADAS
• E1 activa la molécula de ubiquitina. Esta reacción
requiere energía en la forma de ATP
• La molécula de ubiquitina se transfiere a otra
enzima, la E2
• E3 es la que reconoce la proteína blanco que va a
ser destruída. El complejo de E2-ubiquitina se une
tan cerca de la proteína, que la etiqueta de
ubiquitina puede ser transferida desde la E2 hasta
la proteína blanco.
• La enzima E3 entonces, libera la proteína ya
etiquetada
• Esto se repite hasta que la proteína tiene una
cadena corta de ubiquitinas añadidas
• Esta cadena de ubiquitinas es reconocida por el
proteasoma. Ahí la etiqueta de ubiquitina es
removida y la proteína entra al complejo del
proteasoma y se corta en péptidos pequeños
 ¿Qué regula cuáles proteínas
deben ser etiquetadas?
• Hasta ahora se han encontrado sólo ciertas
características de las proteínas que se saben
son etiquetadas. Obviamente falta mucho por
saber. Por lo general, las proteínas que son
marcadas son:
1. Ricas en residuos de Prolina (P), Ácido
Glutámico (E), Serina (S) y Treonina (T). Les
llaman “residuos PEST”
2. Contienen secuencias muy conservadas a las
cuales se les llaman “cajas de destrucción”
3. Tienen una región N-terminal muy hidrofóbica
con residuos básicos y acídicos
 PROTEASOMA
• El proteasoma remueve
proteolíticamente a la
cadena de ubiquitinas de
la proteína etiquetada en
un proceso que requiere
ATP
• Luego degrada la
proteína en péptidos de
7-8 residuos
• Y la ubiquitina que se
libera puede ser utilizada
otra vez
 MODELO DEL PROTEASOMA
• Las cubiertas (cap), son
estructuras que se
encargan de seleccionar a
las proteínas ubiquitinadas
para su degradación
• La degradación sucede en
el centro de la estructura,
específicamente en las
paredes interiores
• Degrada proteínas
citosólicas cuyo ciclo de
vida es estrictamente
regulado y también
proteínas que se plegaron
mal durante su síntesis en
el retículo endoplásmico
The hierarchical structure of the ubiquitin system. The simplified view of the hierarchical structure of the ubiquitin
conjugation machineryis that a single E1 (red) activates ubiquitin for all conjugation reactions. E1 interacts with
all E2s (yellow). Typically, each E2, exemplified by E2E,interacts with several E3s (E3E, E3F, and E3G; blue).
Each E3 targets several substrates (green). The interactions of the conjugating enzymes among themselves and
with many of the target substrates may differ from this “classical” cascade. For example, a single E3 can interact
with 2 distinct E2s (E3E, for example, interacts with E2D and E2E). Also, a single E3 (E3B, for example) can
have several distinct recognition sites targeting different classes of substrates (SD,E,F, SG,H,I, SJ,K,L, and
SM,N,O). Finally, some substrates can be targeted by different E3s, recognizing different motifs (SM,N,O and
SP,Q,R). It should be noted that not all recognition cascades have been demonstrated experimentally, and some
are still putative. Also, because of the complexity of the scheme and space constraints, only a few examples
could be brought, and we could not assign distinct enzymes to defined substrates. Thus the ligase (E3C) that
ubiquitinates lysozyme (SM,N,O. . . ) is not necessarily the same ligase that ubiquitinates, in the cell, p105
(SP,Q,R. . . ), as one may conclude from the scheme
Formas de reconocimiento de sustratos
para proteólisis por las ligasas E3. (Las
ligasas están en rojo y los substratos en
azul)

A: Reconocmiento del sustrato via su residuo terminal

NH2 (N-end rule pathway).

B: Activación alostérica de Ubr1 inducida por un

péptido.

C: Reconocimiento del sustrato fosforilado

D: La E3 se requiere fosforilar para activarse

E: La ligasa Y el sustrato se requieren activar para la

que suceda la ubiquitinación

F:Reconocimiento vía trans por otra proteína

G: El sistema de ubiquitina degrada selectivamente

proteínas anormales/mutadas/mal plegadas,
incluyendo también productos ribosomales
defectuosos (DRiPs), que son las cadenas que van
saliendo del ribosoma y son degradadas al mismo
tiempo que la traducción está pasando.
 ENZIMAS QUE QUITAN LA
UBIQUITINA
• ¿Por qué serían necesarias?
Funciones de “edición” de las enzimas desubiquitinizadoras
Estas enzimas podrían regular negativamente la proteólisis u otras
funciones de la señalización de ubiquitina como la internalización de la
proteína o la función proteica alterada por medio de la remoción de la
cadena de ubiquitina de las proteínas blanco
REGULACIÓN DE PROCESOS CELULARES
POR MEDIO DE DEGRADACIÓN POR
PROTEASOMA

• CICLO CELULAR. Los factores Cdc de

regulación del ciclo celular, son en realidad E2.
Para que las células terminen la mitosis, se
necesita que se degraden las ciclinas por medio
de proteólisis por etiquetado de ubiquitina.
• La separación de los cromosomas durante la
mitosis está regulada en parte por el complejo
promotor de anafase, el cual tiene actividad de
E3 (ubiquitina ligasa). Cuando los cromosomas
no se separan bien, ocurre una alteración en su
número, generando en humanos abortos
espontáneos o Síndrome de Down (trisomía 21)
 REPARACIÓN DE ADN
La proteína p53 es muy importante para suprimir la
formación de tumores. Sus niveles están regulados por
su síntesis y degradación contínuas. La degradación
está regulada por proteólisis mediada por ubiquitina
Cuando el ADN se daña, la p53 se fosforila y ya no se
etiqueta con Ub y sus niveles incrementan
P53 es un factor de transcripción que se une a secuencias
específicas en los promotores de genes que regulan el
arresto del ciclo celular, reparación de ADN y la muerte
celular programada (apoptosis)
La proteína p53 es llamada “el guardián del genoma”
debido a todo lo anterior
 RESPUESTAS INMUNES E
INFLAMATORIAS
• El factor de transcripción llamado NF-κB regula
muchos genes que son importantes en las
respuestas inmunes e inflamatorias
• El NF-κB existe de forma inactiva por formar un
complejo inactivo con un inhibidor (IκB) en el
citoplasma. Cuando las células son expuestas a
bacterias patógenas, el IκB se fosforila y ésta es
la señal para que éste se etiquete con
ubiquitinas y se degrade.
• Cuando el IκB es degradado, el NF-κB se
transloca al núcleo donde activa la expresión de
genes
 FIBROSIS CÍSTICA
• Esta enfermedad hereditaria es causada por la
falta de función de un canal de cloro de la
membrana llamado CFTR (cystic fibrosis
trasmembrane conductance regulator)
• En la mayoría de los casos, éste canal tiene una
lesión genética que causa una deleción de
fenilalanina (ΔF508) en la proteína CFTR. Esta
mutación causa que la proteína no se pliegue
bien y se dirija del retículo endoplásmico al
citosol donde se degrada rápidamente por
proteólisis mediada por ubiquitina