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Enzimas y Coenzimas
Prof Milagro Len
Ctedra de Bioqumica
Facultad de Ciencias Veterinarias
Universidad Central de Venezuela
Objetivos Especficos
1. Describir las caractersticas estructurales y funcionales de las enzimas.
Caractersticas generales de las enzimas. Nomenclatura.
Clasificacin de acuerdo a la Unin Internacional de Bioqumica (UIB).
Mecanismos de accin. Catlisis enzimtica.
Cintica enzimtica. Cintica de Michaelis-Menten. Cintica de la inhibicin reversible.
Enzimas regulatorias: caractersticas generales y cintica.
Enzimas
Definicin:
Son catalizadores producidos por los clulas y cuya
funcin es incrementar la velocidad de las reacciones
que catalizan sin alterar las constantes de equilibrio.
Definicin:
Protena: Hemoglobina
HOLOENZIMAS:
Una parte proteica (Apoenzima)
Una parte no proteica :
Grupo prosttico:
La porcin no proteica
se
encuentra
unido
covalentemente a la
enzima
Cofactor:
La porcin no proteica
se encuentra dbilmente
unido a la enzima
Sitios de la Enzima
SITIO DE UNIN AL SUSTRATO:
Contiene los grupos qumicos (cadenas laterales de aminocidos o
nucletidos) que fijan al sustrato formando el Complejo Enzima
Sustrato. La unin es reversible y se establece mediante enlaces dbiles
(electrostticos o salinos, puentes de hidrgeno, fuerzas hidrofbicas y
fuerzas de Van der Waals).
SITIO ACTIVO:
Contiene los grupos qumicos especficos implicados en la catlisis
(cadenas laterales de aminocidos o nucletidos), pudiendo estar
cercanos o alejados en su estructura primaria. Puede integrar o no al
sitio de unin al sustrato.
SITIO ALOSTRICO:
Contenido en los enzimas regulatorios, en donde se fijan efectores o
inhibidores alostricos, que provocan un cambio conformacional en el
sitio de unin al sustrato o en el sitio cataltico, regulando la actividad
enzimtica.
Modelo molecular de la
Catalasa
Modelo esquemtico
de una enzima
Especificidad enzimtica
Especificidad de sustrato
Absoluta
Relativa
Especificidad de accin
Absoluta
Especificidad de Sustrato
Cuando estn presentes diferentes molculas de sustrato,
nicamente aquella que tenga la forma especfica y
complementaria al sitio activo de la enzima ser capaz de
ocupar el sitio activo.
Sustrato
Sitio
Activo
Especificidad Absoluta
DE GRUPO: alcohol, enlace peptdico, enlace ster.
PTICA: D, L (D-monosacridos; L-aminocidos)
(b) Modelo del ajuste inducido, propuesto por Daniel Koshland Jr. en 1968
Conformacin del
estado de transicin
Especificidad de accin
(absoluta)
1. XIDOREDUCTASAS
2. TRANSFERASAS
3. HIDROLASAS
4. LIASAS
5. ISOMERASAS
6. LIGASAS
NAD+
NADH
H+
O
CH3 CH CH2 C OH
OH
O
CH3 C CH2 C OH
O
COOH
COOH
NH2 CH
COOH
O=C
CH3
CH2
CH2
O=C
COOH
NH2 CH
CH3
COOH
CH2
CH2
COOH
COOH
COOH
NH2 CH
CH2
CH2
O = C NH2
HOH
NH2 CH
CH2
CH2
COOH
H NH2
COOH
O=C
CH3
H
O=C
CO2
CH3
Clase V. Isomerasas:
Catalizan varios tipos de reacciones en las que hay un
reordenamiento intramolecular.
C OH
HO C
CH
HC
HC
HC
C OH
C OH
ATP
H O
ADP Pi
H O
H O
H2N C C OH + H2N C C OH
H
H O
H2N C C N C C OH
CH3
H
HOH
CH3
Nomenclatura
Las enzimas se identifican con un c digo de cuatro dgitos, as como
un nombre sistemtico que consta del nombre de los sustratos,
seguido por el tipo de reaccin que cataliza, terminado en asa.
Ejemplo:
El nombre formal de la enzima que cataliza la reaccin de transferencia de un
grupo fosfato del ATP a la glucosa
ATP + D-Glucosa
Clase II, Transferasa.
Nmero de la enzima
Catlisis cido-bsica
Los grupos qumicos pueden hacerse ms reactivos
aadiendo o eliminando un protn. Los grupos qumicos de
las cadenas laterales presentes en el sitio activo pueden
actuar como donadores o aceptores de protones que ayudan
a estabilizar la carga del estado de transicin.
Catlisis covalente
Un grupo qumico ubicado en el sitio activo de la enzima
ataca al sustrato formando un intermediario covalente
inestable, el cual es una forma transitoria muy reactiva que
evoluciona rpidamente hasta producto, liberando la forma
inicial de la enzima
CMO LO HACEN?
A travs de la formacin del
Complejo Enzima -Sustrato
Energa libre, G
Sin cat.
Cat
2.
3.
4.
5.
Catlisis covalente:
Ocurre en aquellas reacciones en donde el sustrato o parte de l forma
un enlace covalente con la enzima. La reaccin se ejecuta en dos
etapas:
El sustrato o parte de l se une a la enzima formando un
intermediario unido covalentemente a la enzima.
E + A-X
E-X + A
B-X + E
Cintica Enzimtica
Velocidad de una reaccin
Es el cambio de la concentracin de un reactante o producto por
unidad de tiempo
Cintica enzimtica:
Es el estudio cuantitativo de la catlisis enzimtica, proporciona
informacin sobre las velocidades de reaccin y la afinidad de las
enzimas por los sustratos e inhibidores.
Entre las aplicaciones prcticas de este estudio, estn la mejor
comprensin de las fuerzas que regulan las rutas metablicas y el
diseo de tratamientos mas adecuados.
Katal:
Moles de sustrato transformado por segundo
Actividad Especfica:
Micromoles de sustrato transformado por minuto por
miligramo de protena
UI/miligramo de protena (medida de la pureza de la enzima)
Velocidad, V
Velocidad, V
Vmx
10
20
30
40
50
Temp. ptima
Temp. C
Velocidad, V
Vmx
Enzima:
Pepsina
Quimotripsina
2
pH ptimo
8
pH ptimo
10
12
pH
Sustrato
Enzima
MES
EMS
E
S
Funcin:
1.
2.
3.
ENZIMA
FUNCIN
Fe
Citocromo oxidasa
Oxidacin-reduccin
Cu
Oxidacin-reduccin
Zn
Alcohol deshidrogenasa
Mn
Co
Glutamato mutasa
Ni
Ureasa
Lugar cataltico
Mo
Xantina oxidasa
Oxidacin-reduccin?
Mg
Estabilizador de la reaccin
Se
Glutatin peroxidasa
2.
3.
4.
Pendiente
Competitivos:
Poseen una estructura semejante a la del sustrato, siendo
reconocidos por el centro activo de la enzima. Su efecto
puede ser contrarrestado al incrementar la concentracin del
sustrato.
b)
No competitivos:
Se unen a la enzima por un sitio diferente al que lo hace el
sustrato, por lo que puede unirse tanto a la enzima libre,
como al complejo E-S. No afecta la afinidad de la enzima por
el sustrato.
c)
Acompetitivos:
Se unen al complejo E-S formando un complejo ternario ESI
catalticamente inactivo. Aumentan la afinidad de la enzima
por el sustrato.
Inhibidor competitivo
Sitio activo de la
enzima
Sustrato
Inhibidor
Sustrato e inhibidor
pueden unirse al
lugar activo
Inhibidor impide la
unin del sustrato
Productos
Inhibidor competitivo
E+S
+
I
ES
EI
P+E
1/V
V
Vmax
Sin inhibidor
Con inhibidor
competitivo
Con inhibidor
competitivo
Sin inhibidor
Vmax/2
1/Vmax
Km Kmi
S (mM)
-1/Km -1/Kmi
1/S (1/mM)
Inhibidor no competitivo
Sitio activo de
la enzima
Sitio alostrico
de la enzima
Sustrato
Inhibidor
Productos
Sustrato unido
lugar activo
En ausencia del
inhibidor se forman
los productos
al
El Inhibidor no
impide la unin
del sustrato
Inhibidor no competitivo
E+S
+
I
ES
+
I
EI + S
EIS
P+E
1/V
Vmax
Con inhibidor
no competitivo
Sin inhibidor
Vmaxi
Sin inhibidor
Con inhibidor
no competitivo
Vmax/2
1/Vmaxi
Vmaxi /2
Km
1/Vmax
S (mM)
-1/Km
1/S (1/mM)
Inhibidor acompetitivo
ES
+
I
E+S
P+E
EIS
1/V
V
Vmax
Con inhibidor
acompetitivo
Sin inhibidor
Vmaxi
Vmax/2
Con inhibidor
acompetitivo
Vmaxi /2
Sin inhibidor
1/Vmaxi
1/Vmax
Kmi Km
S (mM)
-1/Kmi -1/Km
1/S (1/mM)
Estado T
Estado R
b) Modelo secuencial
Estado T
Estado R
Control enzimtico
Los seres vivos han producido mecanismos sofisticados para regular
las rutas bioqumicas a travs del control enzimtico.
No existe un mecanismo nico de control, pero la regulacin enzimtica
desempea un papel fundamental en el control de todos los procesos
metablicos.
2.
Conservacin de la energa:
Las reacciones que generan energa solo son activadas para
satisfacer los requerimientos energticos de las clulas.
Control enzimtico
A. Regulando el nmero de molculas de enzimas
1. Induccin - Represin de la sntesis enzimtica.
2. Degradacin de las enzimas.
2. Regulacin alostrica.
- Homoalosterismo.
- Heteroalosterismo.
3. Modificacin covalente.
- Zimgenos o proenzimas
- Fosforilacin y desfosforilacin
2.
ENZIMA
Sntesis
Degradacin
Precursores
(aminocidos)
1.
Asociaciones multienzimticas:
Son organizaciones de varias enzimas que participan en una misma va
metablica en asociaciones que pueden ser de naturaleza diversa, con
el fin de lograr sistemas de mximo rendimiento energtico. Los tipos
de asociaciones son:
a.
b.
c.
2.
Regulacin Alostrica:
Control por efectores alost
alostricos:
ricos: Las enzimas alost
alostricas son
invariablemente prote
protenas, con m
mltiples lugares activos, presentan
cooperatividad de uni
unin de sustrato (homoalosterismo
(homoalosterismo)) y una
regulaci
regulacin de su actividad por otras mol
molculas efectoras
(heteroalosterismo)
heteroalosterismo)
El homoalosterismo permite un control m
ms estricto a nivel del
sustrato, ya que la uni
unin de una mol
molcula de sustrato a uno de
los sitios catal
catalticos modifica la estructura de la enzima,
aumentando la afinidad de los otros sitios por el sustrato
En el heteroalosterismo los efectores pueden ser inhibidores o
activadores, ya sea que produzcan una disminucin o aumento
en la afinidad de la enzima por su sustrato, respectivamente
Control por retroaccin o retroalimentacin: un incremento de la
concentracin del producto final de una ruta conduce al descenso
en la velocidad de reaccin al inhibir el primer paso de la ruta o un
paso temprano dentro de la va en cuestin.
3.
Modificacin covalente:
Zimgenos o proenzimas: Algunas enzimas se sintetizan en una
forma catalticamente inactiva, llamada proenzima o zimgeno.
Para pasar a la forma activa la proenzima debe sufrir una
protelisis parcial, en la que pierde un fragmento de su molcula y
vara su conformacin, de tal manera que se organiza su sitio
cataltico.
Modificaci
Modificacin covalente reversible:
reversible: algunas enzimas se regulan por
la interconversi
interconversin reversible entre sus formas activa e inactiva.
Estos cambios son producidos por diversas modificaciones
covalentes. La actividad de estas enzimas puede ser controlada
por la uni
unin reversible de grupos fosforilo (en mam
mamferos) o de
nucle
nucletidos (en bacterias) en residuos espec
especficos de serina y
treonina.
treonina.
Enzimas denominadas quinasas catalizan la inserci
insercin de los
grupos fosfato, mientras que las fosfatasas su separaci
separacin por
hidr
hidrlisis. Proporciona una regulaci
regulacin a corto plazo del flujo de
metabolitos en respuestas a se
seales fisiol
fisiolgicas espec
especficas, y
est
est sujeta a un control directo hormonal y neurol
neurolgico.
Marcadores pancreticos
Amilasa Su concentracin en suero aumenta en la pancreatitis aguda, en
pacientes con insuficiencia renal.
Lipasa Su concentracin en suero aumenta en la pancreatitis aguda, tambin
en pacientes con insuficiencia renal, o con trastornos inflamatorios biliares.
Tripsina Se detectan altas concentraciones en suero en la pancreatitis aguda, y
en el 50 % de los casos de carcinoma pancretico.
Marcadores cardacos
Creatinfosfocinasa (CK-MB) muy especfica para el diagnstico de dao al
miocardio.
Deshidrogenasa lctica (LDH) se encuentra en hgado, msculo esqueltico,
msculo cardaco, eritrocitos, suero, rin y cerebro, se emplea en el
diagnstico de dao al miocardio y meningitis.
Marcadores musculares
Creatinfosfocinasa (CK-MM) Su concentracin en suero aumenta en la
poliomielitis, distrofias musculares, y algunos trastornos metablicos
(hipotiroidismo, acromegalia, miopata relacionada con alcoholismo e
hipertermia maligna.
Aldolasa (ALS) se distribuye en orden decreciente de frecuencia, en msculo
esqueltico, hgado y cerebro.
Marcadores diversos
Fosfatasa alcalina (ALP) Su concentracin en suero aumenta en la
osteoporsis, raquitismo y osteomalacia por deficiencia de vit D y en la
mesttasis sea por cncer de prstata, pulmonar o glndula mamaria, tambin
se encuentra elevada en las fracturas .
Fosfatasa cida (ACP) Se distribuye en prstata, plaquetas, eritrocitos, hgado,
bazo, rin y mdula sea. Su concentracin en suero aumenta en los estadios
finales de cncer prstatico metatastsico.
Enzima Especfica de la prstata (PSA) Su concentracin en suero aumenta en
la hipertrofia prosttica y en el adenocarcinoma de prstata.