Part 2

Information Gathering, Information 
Sources, Publishing, and Journals
Primary and Secondary Literature

1
 Chemical Information Sources
The Gathering of Information and Classification:
 a. The experiment …. the calculation … the measurements …
     ⇒  Discovery
     by definition, a discovery represents original information, i.e., information
      that has not previously been published. 

  b. The discovery is described by the discoverer
     (supervisor/student at university; director/research personnel/technician
      working with a company, etc.)

     . by writing up as a manuscript and publishing as a journal paper
      . by presenting at a conference and publishing as a conference paper
      . if the discovery has commercial value, the discoverer may disclose
2
 Chemical Information Sources (cont.)
The details of the discovery (the original information) appear 
in the journal, conference paper, patent, or dissertation 
The information is in the Public Domain – the  information is 
‘public’ – it has been ‘published’!

Primary Literature 
is any vehicle – journal, conference paper, patent, or 
dissertation – which is used for publication of original 
information (that is, is the first to disclose the details 
of the discovery, calculation, measurement, etc.)

3
 Chemical Information Sources (cont.)

Secondary Literature
is any vehicle – review journal, monograph (book by a single 
author), multigraph (book by multiple authors), treatise 
(advanced treatment of a specialized topic), encyclopedia, 
dictionary, textbook, handbook (of spectra, physical data, 
etc.), bibliographies, indexing and abstracting services (e.g. 
Chemical Abstracts) – for providing information which by 
definition is not original.  

• The objective of secondary literature is to repackage and  reorganize 
  the original information reported by researchers in the primary literature
• Information in secondary literature is convenient to access, but may be
  ‘out of date’!  
4
 PRIMARY LITERATURE

‘Full MS’ ­ Abstract, Introduction, Results and Discussion, and 
Conclusion, full details of Experimental work, and References to 
related work; MS may be very long – sometimes over 60 A4 
typewritten pages!

Supervisor and you decide to publish the work as soon as 
possible; write MS giving a preliminary account of the work:

‘Preliminary MS’ ­ abbreviated Abstract, Introduction, 
Discussion, Conclusion, minimal details of Experimental work, 
some References to related work (usually 3–5 A4 pages).

5
 Patents

What is a patent?
an arrangement between the inventor and the 
state such that the inventor receives a limited­time monopoly to 
exploit the invention.

Patents are the most important form of publication of industrial research.

In Chemistry
processes, new chemical substance, or known chemical substances 
including a new use, may be patented

6
 Dissertations (or Thesis)

Research results written into M.Sc., M.Phil. or Ph.D. thesis
deposited in library
At HKUST, Ph.D. thesis forwarded to University Microfilms
International (UMI) for microfilming.
Access online through Dissertation for abstracts, citations 
from theses in US, Canada, Europe, other pats of the world.

Dissertations are a major form of academic publications
contain information, especially experimental detail not 
reported elsewhere, or published in a journal, much later.

7
 Technical Reports and Conference Papers
Technical Reports
• Usually from government or industry­funded research
• often contain information before it is published in a journal 
– 
but not reviewed by referees (i.e. not ‘peer reviewed’).
• some agencies (NASA, DOE) may place reports on the web. 
• Abstracted by Chemical Abstracts.
Conference Papers
• Papers presented at a conference may be ‘published’ 
intact
• usually no experimental details
• usually not peer­reviewed
• abstracted by Chemical Abstracts 
8
 SECONDARY LITERATURE

Part of an article which includes similar or related areas 
from other journal papers in a
• Review journal
• Monograph (book by a single author)
• Multigraph (book by multiple authors)
• Treatise (advanced treatment of a specialized topic)
• Encyclopedia
• And so on …

9
 Reviews
Valuable source of  information
• Enhance knowledge of own area of research, 
  provides perspective, save time
• Acquire familiarity with a new area of research

Reviews in
­ journals (‘review journals’)
­ journals which also publish primary articles
­ monographs, multigraphs  

10
 Other Sources
Data Collections
• Secondary literature containing data on specific topics arranged 
for easy access 
• Data may be evaluated by editor before entry – ‘added value’ 
Examples
• Dictionaries and Handbooks: classical lists of definitions, 
alphabetical list of compounds with data
• Encyclopedias: relevant topics in alphabetical order, may be 
too elementary for expert
• Physical data collections: spectra, m.p., b.p., thermodynamic 
   parameters, etc. 
• Reactions and syntheses guides
• Analytical methods
• Comprehensive treatises on specialist topics
11
 Chemical Abstracts: http://www.cas.org/

Represents the most effective means of accessing and organizing 
data – by providing abstracts of primary and secondary literature 
papers – world’s largest collection of chemical information!

12
EXAMPLES (FYI only; not to be taught in the class)
Dictionaries, Catalogues, Encyclopedias, and Handbooks
• Compendium of Chemical Terminology 1997
IUPAC recommended definitions and names
ii. Hawley's Condensed Chemical Dictionary  1997
properties, containment, properties (incl. hazards), uses of inorganic, organic compounds
iii. Concise Chemical and Technical Dictionary 1986
properties of compounds
• Combined Chemical Dictionary (CD ROM)
over 456,000 compounds covering all areas of chemistry
• Merck Index 1998  (2 vols)
primarily organic compounds, mainly drugs
vi. Kirk­Othmer Encyclopedia of Chemical Technology 1990 
chemical processes; industrially­important chemicals
vii. Ullmann’s Encyclopedia of Industrial Chemistry Index 1995 
English ed.; comprehensive information on industrial chemicals, safety, processes, etc.
viii. Encyclopedia of Analytical Science 1995 (10 vols)
all aspects of analytical chemistry
ix. Encyclopedia of Polymer Science and Engineering 1990
Polymer Encyclopedia 1990: CD version of ix 1990
preparation, properties of polymers and applications
x. ‘Landolt­Bornstein’: Numerical Data and Functional 
Relationships in Science and Technology 1987  13
physicochemical data in nuclear, atomic physics, crystal and solid state physics
Handbook:  tabulated data and property sets

• CRC Handbook of Physical Properties of Organic Chemicals 1997 
physical properties 
ii. CRC Handbook of Chemical Synonyms and Trade Names 
iii. CRC Handbook of Chemistry and Physics
tables of physical and chemical data 
iv. CRC Handbook of Laboratory Safety
vi. CRC Handbook of Laser Science and Technology
data on optical properties of materials, laser properties
viii. CRC Handbook of Organic Analytical Reagents
chemical tests, analysis and reagents

…and many others in Library!
14
 Comprehensive Chemistry Series
Pergamon (now Elsevier): multivolume series
i. Comprehensive Coordination Chemistry
the synthesis, reactions, properties and applications of coordination compounds
iii. Comprehensive Heterocyclic Chemistry
the structure, reactions, synthesis, and uses of heterocyclic compounds 
v. Comprehensive Medicinal Chemistry
rational design, mechanistic study, and therapeutic applications of chemical 
compounds 
vii. Comprehensive Organic Chemistry
synthesis and reactions of organic compounds
ix. Comprehensive Organic Synthesis
selectivity, strategy and efficiency in organic chemistry
xi. Comprehensive Organometallic Chemistry
synthesis, reactions, and structures of organometallic compounds 
xiii. Comprehensive Polymer Science
the synthesis, characterization, reactions and applications of polymers
Rodd's Chemistry of Carbon Compounds: a Modern Comprehensive Treatise
reviews of classes of organic compounds; good on reactions and biochemicals
15
 Reactions and Syntheses Guides

i. Organic Reactions
annual publication with comprehensive critical reviews on 
important synthetic methods; includes actual experimental 
examples 
• Organic Synthesis and Inorganic Syntheses
annual publication with independently tested procedures 
(two laboratories) for synthesis of organic, organometallic, 
and inorganic compounds
v. Fieser and Fiesers’ Reagents for Organic Synthesis
alphabetical presentation of reagents
vii. Compendium of Organic Synthetic Methods
organic functional group transformations; synthetic 
methods in form of reactions 
Journal: Methods in Organic Synthesis 16