UNIVERSIDAD NACIONAL SAN CRISTBAL DE HUAMANGA

ESCUELA DE POSGRADO
MAESTRA EN INGENIERA AMBIENTAL

METABOLMICA

Expositores:
Ing. Mauro AQUINO ALVARADO Ing. Alfredo PERALTA TORRES Blgo. Juan CISNEROS DE LA CRUZ Fis. Manuel SANCHEZ CANDIOTTI

Ayacucho Per 2013

*
La metabolmica es una disciplina cientfica encargada de estudiar los metabolitos. En la presente revisin bibliogrfica desarrollamos los fundamentos bsicos, las herramientas, avances en plantas y microorganismos, y las aplicaciones actuales en el rea ambiental.

METABOLOMICA
Entendida como el conjunto de ciencias integradas dirigidos al estudio de los metabolitos de un sistema biolgico, se ha convertido en una herramienta importante en muchas areas de investigacin, entre ellos el anlisis de plantas, el desarrollo de frmacos, nutricin, entre otras.

METABOLITOS
Pequeas molculas orgnicas, son importantes moduladores, sustratos, subproductos y bloques de construccin de muchos procesos biolgicos diferentes. La acumulacin de un metabolito especfico puede indicar un defecto en una ruta, la activacin de una ruta de respuesta de seal o la optimizacin de una ruta biosinttica.

METABOLISMO
El Metabolismo es el conjunto de reacciones bioqumicas y procesos fsico-qumicos que ocurren en una clula y en el organismo. Estos complejos procesos interrelacionados son la base de la vida a escala molecular, y permiten las diversas actividades de las clulas: crecer, reproducirse, mantener sus estructuras, responder a estmulos.

VENTAJAS DE LA METABOLOMICA
Permite conocer el estado metablico de un organismo. La metabolmica constituye la herramienta ms informativa a nivel funcional entre todas las tecnologas omicas. Tambin tiene un enorme potencial en la monitorizacin de intervenciones nutricionales

La metabolmica se ha revelado tambin muy eficaz en la monitorizacin de los transplantes de rganos.

LIMITACIONES

- Tcnicas

- Complejidad qumica del metabolismo

- Variabilidad de los organismo.

* Los metabolitos

* El primer perfil metablico fue

realizado en la dcada del 70 (GCMS) utilizarse otras metodologas (RMN, HPLC)

* Durante los 80 comenzaron a

* Fines de los 80-90 el estudio

metablico alcanz un estado estacionario (10-15 publicaciones x ao)IR Espectroscopa Infrarroja

*HARDWARE Y SOFTWARE
* IR Espectroscopia Infrarroja * FTIR Espectroscopia Infrarroja con Transformacin de Fourier * NMR Resonancia Magntica Nuclear * EC Electroforesis Capilar * TLC Cromatografa en capa delgada * GC Cromatografa Gaseosa (volatiliza) * HPLC Cromatografa Lquida de Alta Resolucin * Cromatografas acopladas a Espectrometra de Masa (CG-MS, LC-MS, UPLCMS)

* Cromatografas acopladas a Espectrometra en Tndem (LC/MS/MS)

* IR Espectroscopia Infrarroja * NMR Resonancia Magntica Nuclear

*RMN

* Los

metabolitos de las plantas son importantes para muchas de las respuestas de resistencia al ataque de patgenos, en condiciones de estrs y contribuyen al color, sabor y olor de flores y frutos. fenotipo bioqumico de una planta es el resultado de la interaccin entre el genotipo y el entorno. Por tanto, se necesita identificar y cuantificar los metabolitos para estudiar la dinmica del metaboloma y analizar los flujos metablicos. reto de la metabolmica reside en encontrar cambios en las cantidades de metabolitos que se puedan correlacionar con el estado fisiolgico y de desarrollo de una clula, de un tejido o de un organismo.

* El

* El

RESISTENCIA - SUSCEPTIBILIDAD
Los estudios de los fenmenos de resistenciasusceptibilidad de las hierbas, lo que ha posibilitado su aplicacin a hierbas como la Digitaria insularis, Mucuna pruriens y Clitoria ternantea, entre otras, sometidas a la accin del glifosato, y el estudio de los mecanismos por los que tienen lugar la tolerancia o resistencia al herbicida. Arabidopsis thaliana es la primera planta cuyo genoma (130 Mb) se ha secunciado completamente.

Aplicaciones de la metablica en plantas

Plantas (ej cereales) --- Potencialmente utilizables como material de partida para:

* Productos industriales (almidn, otros polmeros, fibras, aceites

industriales, material de packaging)

* Biocombustibles (biodiesel, bioetanol, hidrgeno, metano) * Estudio de la interaccin planta patgeno * Ensayos de toxicidad (residuos de plaguicidas, insecticidas, etc) * Dilucidacin de la funcin de genes (junto con genmica y
protemica) calidad

* Nutricin humana (conocer la calidad de un alimento, mejorar la

* biodisponibilidad y eficacia de micronutrientes

* En el monitoreo ambiental utilizando a las llamadas especies

centinela de animales vertebrados e invertebrados.

Por ejemplo, dentro del Reino Unido, el Programa Nacional de Monitoreo Marino recolecta varias especies de peces con el fin de medir los efectos de las enfermedades, contaminantes y otros estresores, tales como el cambio climtico, en las reservas de peces comerciales y en la biodiversidad del medio ambiente acutico.

* En

la determinacin del riesgo qumico de productos farmacuticos, pesticidas y otros qumicos de uso casero e industrial. Antes de comenzar a utilizar cualquier qumico nuevo en la sociedad, la compaa que ha desarrollado y manufacturado a este qumico debe medir el riesgo que ste posa a la vida silvestre y al medio ambiente.

Por ejemplo, la empresa vasca Biobide ha desarrollado varios ensayos de toxicidad y eficacia de frmacos a travs del modelo animal del pez cebra, que presentan la ventaja de ser rpidos, coste-efectivos y con menos impedimentos ticos que otros modelos animales.

* En el mantenimiento de cepas y reservas de

animales en la industria de la acuicultura, incluyendo a los peces y a los invertebrados.

El trabajo desarrollado por investigadores del Cicese, el nico de Mxico que trabaja con recursos genticos acuticos, permitir que este centro, forme parte de un banco de germoplasma del Instituto Nacional de Pesca (INAPESCA

* Identificacin de cncer en peces suela marinos

La metabolmica y la protemica, es decir, el estudio simultneo de miles de protenas, han sido usadas para estudiar al cncer del hgado en una especie de lenguado marino llamado platija (Limanda limanda). Los cientficos han notado altos niveles de tumores en hasta un 14% de los peces recolectados en el mar abierto y en los estuarios cerca del Reino Unido.

* Medicin
tierra

del riesgo qumico en peces, mamferos y lombrices de

* Muchos

qumicos en el medio ambiente pueden ser monitoreados simultneamente.

- Se han llevado a cabo estudios en la medaka japonesa (Oryzias latipes), una especie de pez que es utilizada ampliamente en las pruebas de toxicidad para investigar los efectos del tricloroetileno, un contaminante ambiental, y el pesticida dinoseb en el desarrollo de los embriones de peces. - Otros estudios usando metabolmica han identificado patrones de biomarcadores en lombrices de tierra (Eisenia veneta) luego de ser expuestas a contaminantes tales como nitrofenol y anilinas fluorinadas. - Los efectos del arsnico, un contaminante ambiental comn, en el metabolismo de los riones del topillo rojo (Clethrionomys glareolus) tambin han sido investigados utilizando metabolmica basada en RMN.

* Monitoreo

del sndrome de atrofia en el abuln rojo de California, Una infeccin bacterial ha estado diezmando poblaciones del abaln rojo. El abuln rojo (Haliotis rufescens), una especia importante de molusco que vive en las costas del Ocano Pacfico de los Estados Unidos, es susceptible a una enfermedad llamada sndrome de deterioro (tambin conocido como sndrome de deshidratacin o atrofia.) Esta enfermedad letal es causada por una infeccin bacteriana y se sabe que ha diezmado a ms del 90% de las poblaciones de abuln negro (Haliotis cracherodii) en el sur de California.