ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DE LOS ACIDOS NUCLEICOS

Rocio Inga Pea, MSc.

Niveles de compactacin del DNA eucariote

Cada cromosoma es 1 sola molcula de DNA

Bases nitrogenadas presentes en los cidos nucleicos

NUMERACIN DE CARBONOS DE LA PENTOSA

Ribosa

Desoxirribosa (no tiene OH en C-2)

Pueden tener 1, 2 3 grupos fosfato (mono-, di- o tri- fosfato)

Nomenclatura abreviada :
Ribonucletidos trifosfato: ATP, CTP, GTP, UTP

Desoxirribonucletidos trifosfato: dATP, dCTP, dGTP, dTTP

El esqueleto del DNA consiste en la unin de un azcar pentosa y grupos fosfatos alternados

LAS SECUENCIAS DE BASES SE ESCRIBEN DE 5 3

ESTRUCTURA PRIMARIA DEL DNA vs. RNA

Es la secuencia de nucleotidos unidos por enlaces covalentes de tipo fosfodiester Enlace fosfodiester

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL DNA

Dos cadenas antiparalelas forman una doble hlice de giro hacia la derecha, girando una vuelta completa cada 10 pares de bases.

MODELO DE DNA WATSON & CRICK (1953) 1. Dos cadenas antiparalelas 2. Fosfatos hacia fuera 3. Bases hacia adentro 4. Bases complementarias: Purina - Pirimidina Adenina - Timina Guanina - Citosina 5. Fuerzas estabilizadoras: Puentes de hidrgeno especficas Fuerzas hidrofbicas inespecficas Apilamiento de bases 6. Una vuelta completa cada 10 bases

Base Nitrogenada Fosfato

? ??

Animacin: Doble hlice de DNA

http://www.sumanasinc.com/webcontent/ anisamples/molecularbiology/DNA_stru cture.html

Forma-A

Forma-B

Forma-Z

Giro derecho

Giro izquierdo

Los cidos nucleicos de simple cadena pueden formar estructuras secundarias parciales en regiones complementarias

Los cidos nucleicos de simple cadena pueden formar estructuras secundarias parciales

Estructuras secundarias entre dos hebras de DNA o RNA con secuencias parcialmente complementarias : La presencia de loops y bases no apareadas disminuyen la estabilidad de dichas estructuras.

Algunos RNAs tambin pueden presentar estructuras secundarias

Los RNA ribosomales presentan mltiples regiones que forman estructuras secundarias.

Puede darse la formacin de pares G-U en los RNAs

RNA de transferencia

PROPIEDADES DE LOS ACIDOS NUCLEICOS

- VISCOSIDAD (se observar durante la Prct. De

Laboratorio)
- ABSORBANCIA DE LUZ UV (260 nm) por bases nitrogenadas.

-DENATURACION Y RENATURACION (PROCESO REVERSIBLE)

altas temperaturas

Denaturacin

ADN de doble cadena Renaturacin ADN parcialmente denaturado

(90-100

oC)

o pH > 12
Separacin de hebras

Reasociacin por apareamiento de bases

Hebras de ADN separadas (ADN denaturado)

Las altas temperaturas rompen los puentes de hidrgeno entre las bases, denaturando al DNA

Si luego se baja la temperatura, las cadenas pueden reasociarse: complementariedad de bases

 Efecto hipercrmico :
40% incremento de absorbancia de luz UV en un rango de temperatura angosto Efecto de Cooperatividad

Curva de denaturacin (melting curve)

Valor de Tm Tm = Temperatura media de fusin
(temperatura a la cual el 50% de las cadenas de DNA se encuentra como hebra simple (denaturado) y el 50% se encuentra como hebra doble).

Hebra Simple

Hebra Doble

El valor de Tm depende del % GC presente en el DNA

REFERENCIA : LEHNINGER Principles of Biochemistry Chapter 8: Nucleotides and Nucleic Acids