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JEFERSON 2011
Enzimas - Histrico
Histria da Bioqumica comea com pesquisas sobre enzimas. Catlise biolgica incio sc.XIX.
estmago - digesto da carne saliva - digesto do amido
Dcada de 30
1830 - amilase ou ptialina 1836 - pepsina e tripsina
Pasteur ( 1850) fermentos eram inseparveis das clulas Eduard Buchner (1897) Extratos de levedo (livre de clulas)
AUCAR
fermentao
LCOOL
Incio do Sculo XX
75 enzimas isoladas e cristalizadas
ficou evidenciado carter protico
James Sumner (1926): isolou e cristalizou a urease; Sumner demonstrou que tais cristais eram protenas e postulou que todas as enzimas eram protenas;
John Northrop e cols.(dcada de 30): cristalizaram a pepsina e a tripsina bovinas e concluram que tambm eram protenas.
Atualmente + de 2000 enzimas so conhecidas
Enzimas
Com exceo de um pequeno grupo de molculas de RNA que possuem atividade enzimtica e so chamadas de RIBOZIMAS, todas as enzimas so PROTENAS.
Enzimas
Protenas especializadas
Enzimas
Catalisadores de reaes nos sistemas biolgicos; Grande eficincia cataltica; Alto grau de especificidade por seus substratos; Funcionam
em solues aquosas em pH e temperaturas fisiolgicas
Algumas protenas, enzimas em especial, contm em sua molcula uma poro no protica, que essencial para atividade biolgica.
Estrutura Enzimtica
Holoenzima
Protena
Ribozimas Apoenzima
Cofator
Pode ser: on inorgnico molcula orgnica
RNA
Cofatores
Cofator um composto qumico, a parte noprotica ligada a uma enzima e necessria para a catlise
cofator
COENZIMAS
so pequenas molculas orgnicas, no- proticas que transportam grupos qumicos entre enzimas. algumas vezes so chamadas de co-substratos.
Enzimas - Nomenclatura
No sculo XIX - poucas enzimas identificadas Adicionava-se sufixo ASE ao nome do substrato enzima que hidrolisam
gorduras (lipo - grego) - LIPASE amido (amylon - grego) - AMILASE protenas - PROTEASE
Nomes arbitrrios
Tripsina e pepsina - proteases Catalase - H2O2
No sculo XX - quantidade de enzimas descritas Nomenclatura existente se tornou ineficaz Dcada de 60 - IUB - Unio Internacional de Bioqumica adotou um novo sistema de nomenclatura e classificao
mais
Sistema Oficial IUB Cada enzima - no de cdigo (E.C.- Enzyme Comission) com 4 dgitos que caracterizam o tipo de reao
1o 2o
Enzimas
Nomenclatura e Classificao ATP + D-Glicose ADP + D-Glicose-6-fosfato
E.C. 2.7.1.1
2 - classe - transferase 7 - sub-classe - fosfotransferase 1 - sub-subclasse - fosfotransferase que utiliza grupo hidroxila como receptor 1 - indica ser a D-glicose o aceptor do grupo fosfato
Hexoquinase
Enzimas = Catalisadores
Propriedades
Aceleram as reaes No so consumidas na reao Atuam em pequenas concentraes No alteram o equilbrio das reaes
E+S
ES
E+P
Stio ativo da enzima Enolase. Estabilizao do estado de transio e catlise por ons metlicos.
O stio ativo constitui uma cavidade com forma definida, formado por resduos de aminocidos, trazidos proximidade uns dos outros pelos dobramentos da cadeia polipeptdica que definem a estrutura terciria da protena e que permite enzima reconhecer seu substrato.
INTERAO ENZIMA-SUBSTRATO
enzima
Composto B (produto)
Reao catalisada pela enzima
Composto A (substrato)
Centro ativo ou stio cataltico de uma enzima a poro da molcula onde ocorre a atividade cataltica
Hexoquinase
Hexoquinase + D-glicose
As molculas precisam superar esta barreira energtica e serem elevadas a um nvel superior de energia :estado de transio;
A diferena entre o estado basal e o estado de transio chamada de energia de ativao; A velocidade de uma reao reflete sua energia de ativao.
Teoria da catlise
Energia
Energia de ativao
Reao no catalisada
quantidade de energia que preciso fornercer aos reagentes para a reao ocorrer
Substrato (S)
Progresso da reao
Um Catalisador diminui a barreira energtica criando percursos alternativos da reao para formao do estado de transio.
A energia de ligao a maior fonte de energia livre usada pelas enzimas para baixar a energia de ativao
H dois princpios fundamentais que explicam a ao das enzimas:
1- a fora cataltica das enzimas derivada da energia livre liberada durante a formao do complexo ES;
2- As interaes fracas atingem o estado timo no estado de transio das reaes que elas catalisam.
Modelo chave-fechadura
Modelo chave-fechadura?
protica
pH temperatura
a enzima o substrato
3. Presena de inibidores
Fatores que controlam a atividade enzimtica: 1. Fatores que afetam a estabilidade proteica das enzimas Variaes de pH: pH timo
O pH timo de uma enzima reflete variaes no estado de ionizao de resduos de aminocidos do stio ativo. A enzima est pelo menos parcialmente desnaturada em pHs afastados do pH timo. Quando o substrato uma molcula ionizvel, o pH timo da enzima tambm reflete o seu estado de ionizao .
pH timo=1,5 pH timo=6,8 pH timo=9,9
Ativao trmica
Desnaturao trmica
[E]
[S]
CONCENTRAO DOS SUBSTRATOS [S] varia durante o curso da reao medida que S convertido em P. Medir Vo = velocidade inicial da reao.
[E] = cte. vo [S] pequenas Vo linearmente. [S] maiores Vo por incrementos cada vez menores. Vmax [S] Vo insignificantes. Vmax atingida E estiverem na forma ES e a [E] livre insignificante, ento, E saturada com o S e V no com de [S].
Vmax
[S]
PRESENA DE INIBIDORES
Inibidor qualquer substncia que reduz a velocidade de uma reao enzimtica.
INIBIDORES
REVERSVEIS
IRREVERSVEIS
COMPETITIVOS
NO COMPETITIVOS
INCOMPETITIVOS
E+S
K2
ES
K3
E +P
K4
K= constante de velocidade=
[produto] [substrato]
Cintica enzimtica
Km= [S] Numericamente, Km pode ser expresso como a [substrato] necessria para que a velocidade da reao seja metade da velocidade mxima
Km
Concluses sobre Km Pequena [substrato] necessria para a reao atingir metade da V mxima
Km
Cintica Enzimtica
Devido ascenso gradual da curva hiperblica difcil determinar quando foi atingida a Vmx
[S]
INIBIDORES
INIBIDORES
Inibidor qualquer substncia que reduz a velocidade de uma reao enzimtica.
INIBIDORES
REVERSVEIS
IRREVERSVEIS
COMPETITIVOS
NO COMPETITIVOS
INCOMPETITIVOS
E + I EI
O tipo de inibio reversvel precisamente identificada pela cintica da reao catalisada em presena do inibidor.
Neste tipo de inibio o inibidor liga-se a outro stio somente no complexo ES.
INIBIDORES IRREVERSVEIS
inibidor se combina com um grupo funcional (stio ativo) da enzima inibidor se liga enzima formando um complexo ESTVEL forma-se uma ligao COVALENTE entre o inibidor e a enzima
REGULAO ENZIMTICA
ENZIMAS ALOSTRICAS
STIO ALOSTRICO STIO CATALTICO
Enzima Ativa
Enzima Inativa
O percentual de enzima que se encontrar na forma ativa ou inativa depende da concentrao do Efetuador Alostrico. A presena de stios distintos para efetores positivos ou negativos permite o ajuste da velocidade em uma ampla faixa de substrato.
Efetores negativos
Efetores positivos
As enzimas alostricas: So encontradas em todas vias metablicas (fator de economia celular e etapa limitante); Tem Atividade aumentada ou diminuda em funo de sinais Catalisam reaes irreversveis (incio da via); So oligomricas com pelo menos dois stios distintos; Tem curva sigmide e efeito de cooperatividade.
Este tipo de inibio chamada de retroalimentao. O aumento da concentrao do produto final da via faz com que ela sofra uma desacelerao.
REGULAO ENZIMTICA MODIFICAO COVALENTE Ao contrrio da alosteria, em que os efetores ligam-se enzima apenas por ligaes fracas, na modulao covalente a enzima modificada covalentemente por duas outras enzimas: uma quinase fosforila a enzima s custas de ATP, e uma fosfatase remove o grupo fosfato da enzima fosforilada. A modulao covalente energeticamente cara, pois necessita duas outras protenas e ATP para regular a atividade de uma enzima. Ao contrrio, na alosteria a enzima controlada pelas concentraes relativas de seus efetores e a afinidade da enzima por estes.
Ativao de zimognios um caso especfico de modulao covalente exclusivo de alguns tipos de enzimas proteolticas.
zimognios: as proteases so sintetizadas numa forma inativa por estar em uma conformao desfavorvel, com bloqueio ou desalinhamento dos resduos do stio cataltico.
conformao desfavorvel resulta de pores adicionais da cadeia poli-peptdica, que devem ser retirados para que a protena assuma a forma ativa.
podem acontecer duas situaes, combinadas ou no: - zimognio tem uma extenso N-terminal (prosegmento) que precisa ser retirada. Pro-segmentos podem ter de 2 a 150 resduos a.a. - zimognio tem cadeia polipeptdica nica, que precisa ser clivada (protelise limitada) para formar duas ou mais subunidades. converso do zimognio protease ativa pode resultar da ao proteoltica de outra protease, ou de alterao do pH ou temperatura do meio, ou ainda, da adsoro do zimognio uma superfcie negativa. Esses eventos determinam mudana conformacional e/ou auto-hidrlise pela prpria protease. ativao irreversvel, e por isso, energeticamente cara para o organismo.
REGULAO ENZIMTICA-ZIMOGNIOS