FACULTAD DE CIENCIAS QUMICAS

Tema: Sntesis de Protenas

ALUMNAS:

19/03/2013

ANALY MORALES RAMREZ ESMERALDA ROBLES ROMERO LOURDES VSQUEZ JUREZ

Qu son las protenas?

Las protenas son biomolculas formadas bsicamente por carbono, hidrgeno, oxgeno y nitrgeno. Pueden adems contener azufre y en algunos tipos de protenas, fsforo, hierro, magnesio y cobre entre otros elementos. Pueden considerarse polmeros de unas pequeas molculas que reciben el nombre de aminocidos y seran, por tanto, los monmeros unidad. Los aminocidos estn unidos mediante enlaces peptdicos.

 Por tanto las protenas son cadenas de aminocidos que se pliegan adquiriendo una estructura tridimensional que les permite llevar a cabo miles de funciones. Las protenas estn codificadas en el material gentico de cada organismo, donde se especifica su secuencia de aminocidos, y luego son sintetizadas por los ribosomas.

Sntesis de protenas o traduccin

Proceso llamado traduccin Etapa final de la expresin gentica Tiene lugar en los ribosomas del citoplasma. Se maneja un cdigo gentico Tres tipos de RNA desempean papel importante:
o mRNA: transportador de la informacin o rRNA: con asociacin de protenas forma el ribosoma o tRN: molcula adaptadora, portador de Aa. Y lector de mensaje

CODIGO GENETICO
Diccionario molecular.. Cdigo mediante el cual una secuencia de nucletidos de una molcula de RNA o DNA especifica la secuencia de Aa. De un polipptido Esta formado por codones que especifica un determinado Aa. O indica al ribosoma que detenga la transcripcin y libere al polipptido Los datos sobre la naturaleza general de este se obtuvieron mediante experimentos, entre los cuales fueron experimentos genticos sobre efectos de mutaciones por insercin y delacin

Codn: (triplete) secuencia de tres bases necesaria para especificar un amino cido Marco de lectura: secuencia de codones, determinado por un primer codn especifico

 Propiedades:
En tripletes (a) Sin solapamiento (b) Sin puntuacin o continuo: no existen bases que intervienen (intrones) entre los codones. Degenerado: ms de un triplete puede codificar para un aminocido. Universal: mismo para todos los organismos. Excepciones: mitocondria, algunos organismos.

Cdigo de los aminocidos en los mRNA

Los codones estn escritos en direccin 5 -> 3. 3 codones de terminacin (color rosa) y el codn de inicio (color verde) Todos los Aa. Excepto metionina y triptfano tienen mas de un codon En la mayora de los casos los codones q especifican el mismo aminocido difieren en la 3 base

RNA de transferencia
Molcula adaptadora que se une a un codon especifico y transporta en el un aminocido para incorporarlo a la cadena polipeptdica
Las molculas ARNt son ms cortas que las de ARNm y tienen forma de trbol. Contiene una regin terminal en 3 CCA, que forma parte de una regin llamada tallo aceptor (lugar de union del aminoacido) El extremo 5 esta fosforilado En uno de los extremos de la molcula ARNt, hay un conjunto de bases llamada anticodn. El lado opuesto del ARNt transporta un aminocido. Las bases de los anticodones del ARNt son complementarias a las bases de los codones del ARNm.

Modelo abierto en forma de hoja de trbol, mostrando la complementariedad de la bases

Forma plegada de la molcula (forma de L)

Modelo tridimensional

Unin del aminocido al ARNt En la primera reaccin, el aminocido se une al AMP y se forma un intermediario aminocil AMP. En la segunda reaccin se produce la transferencia del aminocido al extremo CCA 3' del ARNt aceptor, liberndose el AMP. Las dos reacciones son catalizadas por la aminocil ARNt sintetasa.

 Lugar donde se sintetizan las protenas tanto en procariontes como en eucariontes

RIBOSOMA

El RNA repesenta casi las 2/3 partes de la masa de complejo 70S El anlisis estructural se puede realizar mediante cristalografa de rayos x Caracterstica importante: se pueden crear por autoensamblaje de sus ARNr y protenas, demostrado por primera vez por Masayasu Nomura, en 1968

Caractersticas de mRNA
La traduccin no empieza simplemente en el extremo 5 terminal, si no que tienen un sitio de iniciacin especifico Inician con la regin 5 terminal de los mRNAs con secuencias no codificadas (5 no codificantes) y terminan con las regiones 3 no codificante Los mRNA de eucariotas normalmente codifican solo una nica cadena polipeptidica, en cambio la mayora de los mRNA procariotas codifican para mltiples polipeptidos Policistronicos: mRNA que codifican varios polipeptidos Monocistronicos: mRNA que codifican un nico polipeptidos

Traduccin
El ensamblaje de una molcula de protena de acuerdo con el cdigo de una molcula de ARNm, se conoce como traduccin. Se denomina traduccin porque comprende el cambio del lenguaje de cidos nucleicos (sucesin de nucletidos) al lenguaje de las protenas (sucesin de aminocidos). En el citoplasma, el ARNm se mueve hacia los ribosomas. Para que se pueda sintetizar una molcula de protena deben llegar los aminocidos a los ribosomas. Los aminocidos que se necesitan estn dispersos en el citoplasma. Se encuentran los aminocidos correctos y llegan al ARNm por el ARN de transferencia (ARNt).

Caractersticas de la traduccin
Consiste en la sntesis de protenas mediante la unin de Aa. Segn el orden establecido por la secuencia de bases del mRNA y el cdigo gentico Las macromolculas que intervienen son: tRNA de iniciacin 31 tipos de tRNAs transportadores de Aa. Ribosomas (20,000) mRNA Factores proteicos

Fases de la traduccin
FASE PREVIA: activacin de los aminocidos en forma de aminoacil-tRNA. FASE 1: iniciacin Fase 2: elongacin Fase 3: terminacin Plegamiento y modificacin postraduccin Cada paso requiere la participacin de protenas especificas que interaccionan con los participantes principales:
Factores de Iniciacin (IF) Factores de Elongacin (EF) Factores de Liberacin (RF)

Fase previa: activacin de aminoacidos

Las molculas de ARNt que estn en el citoplasma recogen ciertos aminocidos. Con los aminocidos pegados, las molculas de ARNt se mueven hacia el punto donde el ARNm est pegado al ribosoma.

Fase previa: activacin de aminocidos

Los aminocidos se activan al comienzo por una adenilacion; las especificas (tambin conocidas como enzimas de activacin) catalizan la reaccin de activacin

AMINOACIL tRNA SINTETASA: nicas molculas biolgicas que conocen el cdigo gentico Existe almenos una aminoacil-tRNA sintetasa para cada aminoacido Se dividen en dos clases (cada una con enzimas especificas para 10 de los 20 Aa.):
Clase I: Tiene un dominio de activacin en plegamiento Rossmann, tiene conformacion de horquilla y la mayor parte de sus enzimas son monomericos Clase II: Tiene un dominio de activacin consiste principalmente en hebras , el brazo CCA esta en conformacion helicoidal y la mayor parte de sus enzimas son dimericos

Fase 1: Iniciacin
Un extremo del ARNm se pega al ribosoma. Requerimientos:
mRNA tRNA met Codon de iniciacin 2 subunidades ribosomales Factores de iniciacin (IF-1, IF2, IF-3)

GTP, Mg 2+

**Seales de inicio de traduccin: el lugar de iniciacin de los mRNA de procariotas es una secuencia llamada Shine-Delgarmo que precede al codon de iniciacin AUG. La complementariedad de bases de la secuencia Shine-Delgarno y la secuencia del rRNA 16S cerca del extremo 3 alinea el mRNA con el ribosoma, entonces el ribosoma se desplaza por el mRNA hasta encontrar un codon de iniciacin AUG

Formacin complejo iniciacin

3 factores de activacin (IF-1, IF-2, IF-3) se unen a la subunidad 30S. Seguida de la unin de mRNA y el N-formilmetionil tRNA iniciador (fMet), que es reconocido por IF-2 unido a GTP El factor IF-3 se libera, uniendose la subunidad 50S al complejo Esto permite la hidrolisis del GTP unido, seguido por la liberacin de IF-! E IF-2 unido GDP

Fase 2: Elongacin

Agregado secuencial de Aa. Por una actividad peptidil transferasa

Requerimientos:
o o o o Ribosoma completo (complejo de iniciacin) Aa-tRNAs especificados por cada codon Factores de elongacion (EF-Tu, EF-Ts, EF-G) Actividad peptidil-transferasa (23s)

o GTP, Mg 2+

Fase 2: Elongacin
El ribosoma tiene 3 sitios de unin A (aminoacil), P (peptidil) y E (liberacin). El N-formilmetionil tRNA iniciador se sita en el sitio , dejando un sitio A libre, el segundo aminoacil tRNA es dirigido hacia el sitio A por EF-Tu (unido a GTP). Tras la hidrolisis de GTP, EF-Tu (unido a GDP) sale del ribosoma dejando al alanil tRNA situado en el sitio A

 Se forma el enlace peptdico y se transfiere la metionina al aminoacil tRNA en el sitio A El ribosoma desplaza 3 nucletidos a lo largo del mRNA, movimiento que transloca el peptidil (Met-Ala) tRNA al sitio P y al tRNA libre al sitio E dejndolo salir La translocacin es mediada por EF-G acoplada a la hidrolisis de GTP

Regeneracin de EF-Tu/GTP
Proceso en el participa otro factor, el factor EF-Ts, facilitando la sustitucin de GDP por un GTP libre y poder llevar a cabo la translocacin a EF-Tu/GTP y as dirigir un nuevo tRNA al ribosoma

 A medida que el ARNm se mueve a lo largo del ribosoma, el siguiente codn hace contacto con el ribosoma. El siguiente ARNt se mueve a su posicin con su aminocido. Los aminocidos adyacentes se enlazan por medio de un enlace peptdico.

TERMINACIN
Las clulas no contienen ARNt con anticodones complementarios de los tripletes de terminacin, pero s tienen factores de liberacin que los reconocen y terminan la sntesis de protenas

Terminacin
Depende de factores que reconocen codon stop de hidrolisi de peptidil-tRNA Requerimientos:
Codon de terminacin: Codones de terminacin: UAA, UAG, UGA. Factores de liberacion (RF-1, RF2, RF-3) ATP

Por lo que
Como una protena es una cadena de aminocidos, se construido entonces una protena. En resumen, el ADN codifica para ARN mensajero, el ARN mensajero lleva la informacin necesaria para la sntesis de la protena a los ribosomas, donde se hace la protena.

Bibliografa
La celula, de Coopers, capitulo 7: Sintesis de protenas, procesamiento y regulacion Principios de Bioquimica de Lenhinger, 4 edicion, Capitulo 27: Metabolismo de las Protenas Biochemistry 6th Edition Campbell and Farrell, CAPITULO 12, 1Sntesis de protenas: traduccin del mensaje gentico http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/ content/translation.html