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ESPECIE

Unidad taxonmica bsica


Cepa: poblacin de organismos que desciende de un nico organismo

Grupo de cepas que tiene un alto grado de similitud en sus propiedades y que difieren en forma significativa de otros grupos de cepas

Ernst Mayr (1940)

TAXONOMA
del griego , taxis, "ordenamiento", y , nomos, "norma" o "regla

Clasificacin
estructura los organismos en grupos (taxones) en base a su similitud

Nomenclatura
asigna nombres a los taxones

Identificacin
determina a que taxones pertenece un organismo que se
aisla

Una comparacin de los sistemas de clasificacin

Haeckel (1894) Tres reinos

Whittaker (1969) Cinco reinos

Woese (1977) seis reinos

Woese (1990) Tres dominios

Protista

Monera Protista Fungi

Eubacteria
Archeabacteria

Bacteria Archea

Plantae
Animalia

Protista

Eukarya

Fungi
Plantae

Plantae Animalia Animalia

Taxonoma Actual

Dominio
Actualmente considerado el nivel taxonmico ms alto (super-reinos). 3 dominos: Bacteria, Archaea, Eukarya

Sistema de Woese (1990)

Clasificacin de los microorganismos


Acelulares

Virus
Bacteria Arqueas Plantas Animal

Procariotes
Eucariote

Dominio Archaea
Dominio Bacteria
T4 de E. coli FH de hiperhalilas Mosaico del tabaco Virus del Edola

Dominio Eukarya

Viriones Priones
Bacteria Animal Hombre

Virioides PSTV

cepas 263K

Creutzfeldt-Jacob

Rangos taxonmicos en clasificacin bacteriana


Taxones: (unidad taxonmica , grupo de organismos con caracteriticas comunes)
Taxones Dominio Phylum Clase Orden Familia Gnero Especie Sub-especie

importancia en estudios clnicos y ecolgicos

Dominio Phylum Clase Orden Familia Genero Especie Bacteria Proteobacteria Gamma Proteobacteria Zymobacteria Enterobacteriales Enterobacteriaceae Escherichia Escherichia coli

Categoras de clasificacin a nivel de sub-especie (tipificacin)


Variedades o tipos Serovariedad o serotipo (antgenos distintos)
Fagovariedad (tipificacin por fagos) Biovariedad (diferencias bioqumicas y fisiolgicas)

Patovariedad (patogenicidad)
Morfovariedad (diferencias morfolgicas) Genomovariedad (grupos con ADN similares)

Dominio: Archaea

Procariotas:Dominio Archaea
Crenarchaeota
Hipertermofilas Mesofilas

Euryarchaeota
Metanogenas Hiperhalofila

Pyrodictium

Cenarchaecotum

Methanobacterium

Halocccus

Dominio: Bacteria

Procariotas: Dominio Bacterias


Phylum: Gram () Proteobacterias Clase: -proteobacteria -proteobacteria

Caulobacter

Rhizobium

Neisseria

Nitrosomonas

Procariotas: Dominio Bacterias


Phylum: Gram () Proteobacterias Clase: -proteobacteria

Legionella

Pseudomonas

Escherichia

Vibrio

Procariotas: Dominio Bacterias


Phylum: Gram () Proteobacterias

Clase: -proteobacteria

-proteobacteria

Myxococcus

Desulfovibrio Camphylobacter

Helicobacter

Procariotas: Dominio Bacterias


Phylum: Gram (-) No proteobacterias
Cyanobacterias Prochlorales Spirochetes Chamydiales

Nostoc

Prochloron

Treponema

Chlamydia

Procariotas: Dominio Bacterias


Phylum: Gram (+) con bajo porcentaje de G+C Esporulados No Esporulados

Bacillus

Clostridium

Streptococcus

Mycoplasma

Procariotas: Dominio Bacterias


Phylum: Gram (+) con alto porcentaje de G+C No Filamentosos Filamentosos

Mycobacterium

Corynebacterium

Streptomyces

Frankia

Taxonoma bacteriana
CLSICA
Caracteres fenotpicos (morfologa, nutricin, etc.) Algunos genotpicos: % G+C, hibridacin ADNADN

Ponderacin de caracteres (llaves dicotmicas)

Taxonoma polifsica
DNA
Total

Informacin Genotpica RNA


Perfiles LMW RNA Secuenciacin RNA

Porcentaje de G +C Tamao del genoma Patrones de restriccin Hibridacin del DNA Parcial Secuencin del DNA Sonda de DNA Perfiles basado en PCR

Informacin Fenotpica Marcadores qumicos Caracteres Expresados


cidos grasos celulares cido miclicos Lpidos polares Componentes de la pared celular Polisacridos Perfiles de protenas totales Morfologa Fisiologa (Api 20, 50 Biolog) Enzimologa (APIZYM) Serologa

(Vandamme et al., 1996)

Caractersticas fenotpicas clsicas de valor taxonmico

Morfologa: Forma, tamao y tincin Nutricin y fisiologa: Fottrofo, quimitrofo, aerobio


o anaerobio, temperatura y pH ptimos, fuentes alternativas de C, N y S

Movilidad: Tipo y disposicin de flagelos

Otros: Pigmentos, inclusiones celulares, sensibilidad a


antibiticos, patogenicidad

Los Hongos

Amanita muscaria

Unicelulares o pluricelulares

Cul es su habitat?
Suelo, agua, entre 4 y 60 C Desde el nivel del mar hasta 4000 msnm Algunos son endmicos Cosmopolitas

Pared celular formada por

Componentes
Celulosa - glicogeno Celulosa glucanos Celulosa quitina Quitosina quitina Quitina glucanos Quitina glucanos Quitina glucanos Quitina glucanos Mananos glucanos Mananos quitina

Grupo taxonmico
Acrasiales Oomycetes Hyfocritidiomicetes Zygomycetes Critidiomycetes Ascomicetes Basidiomicetes Deuteromicetes Saccharomycetaceae Sporobolomicetaceae

Caractersticas
Pseudoplasmodios Zoosporas biflageladas Zoosporas uniflageladas Zygosporas Zoosporas uniflageladas Ascosporas Basidiosporas Conidiosporas Ascosporas Levaduras con pigmentos

Poligalactosamina galactano

Trichomycetes

Parsitos de artrpodos

Cuerpo o talo

Hifa

Son hetertrofos Utilizan sus hifas para poder nutrirse Absorcin Tienen una gran cantidad de enzimas Usan tres vas

Formas de vida

Saprobios
Esencialmente son descomponedores Utilizan materia orgnicas en descomposicin

Parsitos

Simbiontes

Estructuras fngicas vegetativas

Herrera y Ulloa, 1998

Somticas
Esporas Esporas

Clamidosporas Teliosporas

Estructuras fngicas

Herrera y Ulloa, 1998

Ecolgica
Nematodos Luz Espacio

Insectos

pH

Hongos
Temperatura

Bacterias

Protozoarios nutrientes Agua

Hongos

Agronmica

Alernaria solani

Alternaria citri

Cladosporium sp.

Bioherbicidas

Castt (Alternaria cassiae) Collego (C. gloeosporioides)

Biofungicida Trichoderma harzianum Bioinsecticida (Beauveria bassiana) Betel Melocont


O N O O

O CH 3 OH O OH OH
O

Oosporeina
O

O HO O CH 3

Beauvericina

Melolontha melolontha

Farmacutica

Penicillium notatum

Aspergillus terreus
H HO O
H

40 % de los antibiticos conocidos han sido producidos por hongos filamentosos

O H3C H H3C H H

CH 3 H

Bills y cols., 2000. Symposium on Tropical mycology. Dreyfus y Chapela, 1994 y Herrera y Ulloa, 1998.

Metabolitos fngicos con aplicacin farmacutica


Metabolito
Fumagilina

Fuente
Aspergillus fumigatus

Actividad
Antifngico

Presentacin Comercial
FumidilB

Compaa Comercial
J. Webster Labs MID-CON

Referencia
Molina, et al., 2002

Lovastatina Cefditoreno de pivoxilo

Aspergillus terreus Cephalosporium acremonium Helminthosporium siccans Micromonospora Echinospora spp. Penicillium brevicompactum P. critrinum Penicillium brevicompactum P. critrinum Tolypocladium inflatum

Hipolipemiante Antibacteriano amplio espectro

Mevacor Spectracef

Merck Pharmaceutical Products TAP,

Shu, 1998 Patchett, 2002

Darkes y Plosker, 2003

Sicanina

Antidermatofitico

Siccanin

Sankyo Co., Ltd Wyeth-Ayerst,

Bellotti, 1985

Gemtuzumab ozogamicina Rosuvastatina

anticancergeno

Mylotarg

Lee, et al. 1987 Giles, et al., 2003 Carswell, et al., 2002

Anticolesteremico

Crestor

Astra-Zenical

Acido Micofenlico

Antiviral y Antitumoral

Myfortic

Norvatis

Williams, 1968 Bentley, 2000

Ciclosporina

Inmunosupresor

Sandimmune

Sandoz

Borel, 1976

Biorremediacin

Raghukumar y cols., 2000. Mycol. Res. y Wase y Forster, 1997.

Alimenticia

Mdica

Trichiphyton rubrum

Mucor sp.