En la zona de El Bajo, comenzaron a organizar una conjura en San Miguel el Grande los capitanes Ignacio Allende y Mariano Abasolo,

quienes haban tenido contacto, el ao anterior, con los conspiradores de Valladolid Jos Mariano Michelena y Jos Mara Garca Obeso.1 Las reuniones se trasladaron a la ciudad de Quertaro, en donde se sumaron un grupo de letrados, pequeos comerciantes y ms militares del ejrcito colonial. Este grupo celebraba juntas disfrazadas de "academia literaria". Entre sus miembros se encontraban el cura Miguel Hidalgo y Costilla, el pequeo industrial Juan Aldama, el corregidor de la ciudad Jos Miguel Domnguez con su esposa Josefa Ortiz de Domnguez, el presbtero Jos Mara Snchez, los abogados Parra, Laso y Juan Nepomuceno Mier y Altamirano, Francisco Araujo, Antonio Tllez, Ignacio Gutirrez, los comerciantes Epigmenio y Emeterio Gonzlez, el regidor Jos Ignacio de Villaseor y Cervantes,2 el capitn Joaqun Arias, el teniente Francisco Lanzagorta y el teniente Baca.1 La organizacin de los conspiradores prevea en el mando a Ignacio Allende como general, Aldama como segundo e Hidalgo al frente del movimiento popular. Sus primeros pasos seran la destitucin de todos los espaoles en los puestos de gobierno, apoyados por un levantamiento que se llevara a cabo el 1 de octubre,3 para lo cual se prepararon lanzas, espadas y municiones que almacenaron en San Miguel el Grande, Dolores y Quertaro.4

Pero la conspiracin de Quertaro fue denunciada, el 9 de septiembre, por el empleado de correos Jos Mariano Galvn. Al da siguiente, el propio capitn Joaqun Arias, al creer que todo estaba perdido, se autodenunci ante el alcalde Juan Ochoa.5 Otras denuncias llegaron a odos del comandante Ignacio Garca Rebolledo y se presion al corregidor Domnguez para catear la casa de los hermanos Gonzlez.6 En lugar se encontr armamento almacenado, en consecuencia Epigmenio y Emeterio fueron aprehendidos. Josefa Ortiz tuvo tiempo de enviar como mensajero al alcalde Ignacio Prez para poner en sobre aviso a los conspiradores que se encontraban en San Miguel el Alto.7 Mientras en Quertaro se hicieron prisioneros a ms conspiradores, incluyendo a los corregidores.8 Prez cabalg la noche del 15 de septiembre hasta San Miguel logrando contactar a Juan Aldama, quien de inmediato se traslad a Dolores, lugar al que lleg en la madrugada del 16 de septiembre para informar las malas noticias a Allende e Hidalgo. Despus de un intercambio de opiniones, el cura exclam:
"Si, lo he pensado bien, y veo que estamos perdidos y que no queda ms recurso que ir a coger gachupines".9

Con ayuda de ochenta presos que liberaron de la crcel, capturaron al delegado Rincn, se dirigieron al atrio de la iglesia, tocaron las campanas, Hidalgo pronunci un discurso explicando que el movimiento al que incitaba era para derribar al mal gobierno, quitando del poder a los espaoles que trataban de entregar el reino a los franceses. Le ofreci a la poblacin que se dejaran de pagar tributos, y un peso diario a quienes participaran si llevaban caballo y la mitad a los de a pie. Acto seguido se aprehendi a diecinueve espaoles.10 Se juntaron ms de seiscientos hombres, a quienes se les repartieron lanzas y machetes, Hidalgo areng a la poblacin, las palabras exactas que pronunci, tal vez nunca se sepan, las versiones probables y ms antiguas son:11 {{cita|Manuel Abad y Queipo (1810):12