Metabolismo m

Temas a Revisar: Introduccin al metabolismo Rutas metablicas Metabolismo lipdico Fotosntesis Ciclo del Nitrgeno

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Autor: Maestro en Ciencias Bioqumicas Genaro Matus Ortega genaromatus@excite.com, genaro_matus@hotmail.com

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Qu es el metabolismo?

Es el conjunto global de las reacciones qumicas que ocurren en los seres vivos debido al uso y transferencia de materia y energa.
Puede dividirse en dos categoras: Catabolismo. Donde se incluyen todas las reacciones comprendidas en la degradacin de sustancias y la generacin de energa. Anabolismo. Donde se incluyen todos los procesos relacionados con la sntesis de molculas orgnicas complejas (polmeros de las 4 biomolculas).

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Qu es la energa en Biologa?
La energa se puede definir en biologa como la capacidad para realizar un desplazamiento (principio interno de la masa).

Grosso modo existen dos tipos de energa:

-Energa cintica abarca tanto a la energa Energa trmica como a la radiante y elctrica, debido a que involucran el movimiento de molculas. Ec = 1/2 m v2

- Energa potencial almacenada e implica la energa almacenada en enlaces qumicos y en gradientes qumicos. Ep = m g h

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Concepto de Potencial y cintico

De manera semejante en los alimentos existe energa potencial (qumica) que puede ser liberada. Los alimentos tienen molculas reducidas que pueden ser oxidadas y liberar parcialmente su energa en el catabolismo.

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La mxima oxidacin de los carbonos ocurre en la mitocondria.

Generacin de Energa

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Los alimentos estn hechos de las 4 biomolculas fundamentales. Durante su catabolismo puede formarse ATP u otro metabolito energtico.

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Integracin parcial

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Segn la fuente de extraccin de energa se reconocen diversos organismos:

Tipo de Fuente organismos carbono

Fotoauttrofos

de Fuente energa
Luz

de Donador electrones

Dixido de carbono

Fotohetertrofos

Compuestos orgnicos

Luz

Quimioauttrofos

Dixido de carbono

Qumiohetertrofos

Compuestos orgnicos

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de Ejemplos
Plantas verdes, bacterias fotosintticas Bacterias prpura no dependiente de azufre Bacterias dependientes azufre y fierro Animales

H2O, H2S, azufre, compuestos inorgnicos Compuestos orgnicos

Reacciones de oxido-reduccin

Compuestos inorgnicos como: H2, H2S, NH4+, Fe2+ Compuestos orgnicos

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Reacciones de oxido-reduccin

La Termodinmica

La termodinmica es la disciplina que estudia las relaciones entre la energa y la materia desde un punto de vista macroscpico.
Sirve para predecir los procesos fsicos y qumicos que experimentan las molculas por el intercambio de energa con otras molculas o tomos. Describe de manera mecnica estos procesos y utiliza modelos para explicar cmo se interrelacionan la materia y la energa a partir de leyes fundamentales.

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Ley de conservacin de la energa

1) La energa no se crea ni se destruye, slo se transforma (se transfiere). Primera ley de la Termodinmica U = U final U inicial = q w

Donde: U = energa; q = calor; w = trabajo

Frecuentemente las reacciones biolgicas liberan calor, la medida de este intercambio de calor, liberado o absorbido con el ambiente, se llama entalpa (H): H = qp (2)
donde qp representa el calor a presin constante.

Una reaccin favorecida entlpicamente libera calor y se denomina exotrmica, si no es favorecida entlpicamente requiere calor para ocurrir y se llama endotrmica; si el balance neto de intercambio de calor con el medio es igual a cero se dice que es isotrmica. (exo= fuera; endo= dentro; iso= igual)

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(1)

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La segunda ley de la termodinmica

La segunda ley de la termodinmica dice que el Universo tiende hacia el

mximo desorden.

Esta ley provee un criterio para determinar si un proceso es espontneo.

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Entalpa (calor) y Entropa (desorden)

Los cambios en la Entalpa y la Entropa determinan la espontaneidad

de una reaccin.

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La energa Libre de Willard Gibbs

J.W. Gibbs postul que de acuerdo a los procesos que involucran un cambio de energa y donde la energa libre tiende al mnimo:

G=H - TS G=

Entonces pueden ser de tres tipos: -

Exergnica (G < 0): El sistema libera energa, entonces los productos tienen menos energa libre que los reactivos - Endergnica (G > 0): El sistema requiere energa, por lo que los productos cuentan con ms energa que los reactivos -Isoergnica (G = 0): Prevalecen condiciones de equilibrio.
-La Energa libre de Gibbs representa la mxima cantidad de energa disponible para realizar un trabajo.

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Reacciones endergnicas vs exergnicas

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CINTICA ENZIMTICA

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Las enzimas

Las enzimas son catalizadores biolgicos, sus principales caractersticas son su poder cataltico y su especificidad. Su actividad est regulada por varios factores. Casi todas las enzimas son protenas, con la excepcin de algunos RNAs.

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Caractersticas de las enzimas:

Presentan velocidades de reaccin elevadas. Tpicamente incrementan de 102 a 106 la velocidad de reaccin. Actan en condiciones de reaccin suaves. Temperaturas medias, valores cercanos a la presin atmosfrica y unidades de pH casi neutros o cercanos a la neutralidad. Exhiben un grado de especificidad muy alto (alta eficiencia). Las enzimas son altamente selectivas en la catlisis de sustratos y en la generacin de productos. Tienen capacidad de regulacin. Esto se consigue a travs de procesos que incluyen el control alostrico reversible, la modificacin covalente y la variacin de las cantidades de enzima que se sintetizan y degradan.

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Las enzimas disminuyen la DG de activacin de los sustratos

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Algunas enzimas requieren cofactores

Las vitaminas son precursores de cofactores de enzimas (coenzimas).

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Caractersticas del centro activo de las enzimas:

1.- El centro activo supone una porcin relativamente pequea del volumen total de la enzima, donde se encuentra el cofactor o coenzima. 2.- El centro activo es una entidad tridimensional formada por grupos que proceden de distintas partes de una secuencia lineal de aminocidos. 3.- Los sustratos se unen a las enzimas por numerosas fuerzas dbiles.

4.- Los centros activos son hendiduras donde las molculas de sustrato quedan ligadas y el agua queda normalmente excluida, adems la hendidura crea un microambiente en el cual los residuos de aminocidos, los cofactores o las coenzimas llevan a cabo su funcin cataltica. 5.- La especificidad del enlace depende de la disposicin exactamente definida de los tomos del centro activo.

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Catlisis enzimtica
De manera cuantitativa la actividad enzimtica se puede estudiar por 2 parmetros: Km: mide la afinidad de la enzima por el sustrato, representa una concentracin de sustrato con la que se alcanza la mitad de la Velocidad mxima. Vmax: Representa la mxima velocidad de aparicin del producto de la reaccin. S P (Sustrato) (Producto)

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Modelos de actuacin de enzimas

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Regulacin de la actividad cataltica

Disponibilidad de la enzima- De acuerdo a la velocidad de sntesis y degradacin de enzimas en la clula. Actividad de la enzima- Debido a alteraciones en la estructura o conformacin de la enzima, la temperatura y pH del medio. Concentracin de sustratos y productos.

Presencia de inhibidores o activadores especficos. Los ligandos alostricos se unen a las enzimas en sitios distintos al sustrato y funcionan como intermediarios metablicos que actan sobre las enzimas modificando su actividad y regulan el flujo metablico de las vas.

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Regulacin alostrica (alos, diferente a)

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Inhibidores competitivos vs no competitivos

Complejo enzima-sustrato

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Un inhibidor competitivo se une al sitio activo y evita la unin del sustrato

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Un inhibidor no competitivo no evita la unin del sustrato.

Mapa conceptual:
Metabolismo
Todas las reacciones qumicas que ocurren dentro de las clulas.

Clasificacin

Termodinmica

Anabolia (Biosntesis)

Catabolia (Extraccin de energa y Materiales)

Energa libre de Gibbs (disponible para trabajo)

Entropa (desorden)

Espontaneidad de reacciones y reacciones acopladas

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Entropa Flujos de alor

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Catalizadores biolgicos regulables e inducibles Centro activo de catlisis Cofactores

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Cintica Enzimtica
Parmetros cinticos: Km (afinidad por sutrato) Vmax (velocidad mxima Reguladores alostricos: Activadores e inhibidores

Competitivos y no competitivos